MIKROBIOLOGI

SISTEM RESPIRASI

INFEKSI SALURAN NAFAS ATAS (ISPA)

ADALAH INFEKSI-INFEKSI YANG
DISEBABKAN OLEH MIKROORGANISME
TERBATAS PADA RONGGA HIDUNG,
FARING DAN LARING.

SALURAN NAFAS ATAS BAGIAN YANG

SELALU KONTAK DENGAN LINGKUNGAN
TETAPI, INFEKSI JARANG TERJADI &
BERKEMBANG PADA ISN (INFEKSI
SALURAN NAFAS) BAWAH (BRONKHUS &
ALVEOLUS)
REFLEKS BATUK
SILIA
SISTEM IMUN

INFEKSI SALURAN PERNAFASAN ATAS

COMMON COLD (MASUK ANGIN /
RHINITIS / CORYZA)

SINUSITIS

FARINGITIS (SORE THROAT /

RADANG TENGGOROKAN)

LARINGITIS

EPIGLOTITIS

INFLUENZA TANPA KOMPLIKASI

MIKROORGANISME PENYEBAB :
VIRUS UTAMA (80%)
BAKTERI SERINGKALI BERSIFAT

SEKUNDER

GEJALA KLINIK :
SEMUA JENIS INFEKSI MENGAKTIFKAN

RESPONS IMUN DAN PERADANGAN

PEMBENGKAKKAN DAN EDEMA JARINGAN
YANG TERINFEKSI
REAKSI PERADANGAN PENINGKATAN
PEMBENTUKAN MUKUS YANG BERPERAN
MENIMBULKAN GEJALA-GEJALA INFEKSI
SALURAN NAFAS ( HIDUNG TERSUMBAT,
SPUTUM BERLEBIHAN, PILEK, NYERI
KEPALA, DEMAM RINGAN DAN MALASE)

INFEKSI SALURAN PERNAFASAN BAWAH

PNEUMONIA
BRONKHITIS
EMPYEMA

PNEUMONIA
PERADANGAN AKUT DARI PARENKIM PARU-

PARU YANG BIASANYA MERUPAKAN INFEKSI

INFLUENZA YANG DISEBABKAN OLEH VIRUS,
BAKTERI ATAU KEDUANYA.

SEBAGAIAN BESAR OLEH BAKTERI YG TIMBUL

SECARA PRIMER ATAU SKUNDER SETELAH

INFEKSI VIRUS.PENINGKATAN SEKRESI
MUKOSA MEMBANTU UNTUK MEMBAWA KUMAN
KE DALAM SALURAN PERNAFASAN
BAWAH.INFEKSI INI TERJADI PADA SAAT DAYA
TAHAN TUBUH SEDANG MENURUN.DISAMPING
PADA BAYI DAN USIA LANJUT.

 KERUSAKAN JARINGAN PARU SETELAH

KOLONISASI MIKROORGANISME DI PARU

BANYAK DISEBABKAN OLEH REAKSI IMUN
DAN PERADANGAN YANG DILAKUKAN OLEH
INANG.
TOKSIN-TOKSIN YANG DIKELUARKAN OLEH
BAKTERI PADA PNEUMONIA BAKTERIALIS
DAPAT SECARA LANGSUNG MERUSAK SEL
SEL SISTEM PERNAFASAN BAWAH.
PNEUMONIA BAKTERIALIS MENIMBULKAN
RESPON IMUN DAN PERADANGAN YANG
PALING MENCOLOK PNEUMONIA
PNEUMOKOKUS.

GEJALA KLINIK :
DEMAM DAN MENGGIIL (AKIBAT PERADANGAN)
NYERI DADA (PLEURA PERADANGAN DAN EDEMA)
BATUK PRODUKTIF (PURULEN)
SPUTUM MERAH KARAT (Streptococcus pneumonia)
MERAH MUDA (Staphylococcus aureus)
KEHIJAUAN DENGAN BAU KHAS (Pseudomonas
aeruginosa)
KREKEL (BUNYI PARU TAMBAHAN)
RASA LELAH AKIBAT REAKSI PERADANGAN DAN
HIPOKSIA AKIBAT INFEKSINYA SERIUS
HEMOPTISIS, BATUK DARAH DAPAT TERJADI AKIBAT
CEDERA TOKSIN LANGSUNG PADA KAPILER, ATAU
AKIBAT REAKSI PERADANGAN YANG MENYEBABKAN
KERUSAKAN KAPILER.

AGEN PENYEBAB:
BAKTERI
Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus
aureus, Haemophillus influenzae, Neisseria
meningitides, Mycoplasma pneumoniae,
Chlamydia trachomatis, Chlamydophilla
pneumoniae, C. psiittaci, Klebsiella pneumoniae,
Psudomonas aeruginosa, Leigonella, Francesella
tularensis, Bacteroides fragillis, Nocardia,
Rhodococcus, Mycobacterium tuberculosis,
Coxiella burnetii, Ricketsia ricketsii DAN
KELOMPOK ENTEROBACTERIACEAE

VIRUS
PARAINFLUENZAE VIRUS, INFLUENZA
VIRUS, ADENOVIRUS,VARICELLA ZOSTER
VIRUS, CYTOMEGALO VIRUS, MEASLES
JAMUR
Coccidiodes immitis, Pneumocystis carinii

PENATALAKSANAAN :
BERGANTUNG PADA PENYEBAB YANG
DITEGAKKAN DARI HASIL PEMERIKSAAN SPUTUM
ANTIBIOTIK, PNEUMONIA BAKTERIALIS
ISTIRAHAT
HIDRASI UNTUK MEMBANTU PENGENCERKAN
SEKRESI
TEKNIK-TEKNIK BERNAFAS DALAM UNTUK
MENINGKATKAN VENTILASI ALVEOLUS DAN
MENGURANGI RESIKO ATELEKTASIS
DIBERIKAN OBAT-OBAT LAIN YANG SPESIFIK
UNTUK MIKROORGANISME YANG
DIIDENTIFIKASI DARI BIAKAN SPUTUM.

BRONCHITIS
PENYAKIT SALURAN NAFAS YANG DIAKIBATKAN

OLEH REAKSI PERADANGAN BRONKHUS YANG

BERLANGSUNG LAMA DAN SELANJUTNYA AKAN
BERKEMBANG MENJADI PENYAKIT PARU.
KELAINAN YANG ADA DI SELAPUT LENDIR AKAN
MENIMBULKAN GEJALA BERUPA PENYUMBATAN
SUKAR DISEMBUHKAN.
SELAIN OLEH VIRUS DAN BAKTERI DAPAT PULA
DISEBABKAN OLEH ASAP ROKOK DAN ZAT-ZAT
KIMIA YANG TERDAPAT DALAM POLUSI UDARA

GEJALA KLINIS :
DITANDAI ADANYA PEMBENTUKAN MUKUS
YANG BERLEBIHAN DALAM BRONKUS DAN
BERMANIFESTASI SEBAGAI BATUK KRONIK
(3 BULAN) DAN PEMBENTUKAN SPUTUM.
(MUKOID ATAU MUKOPURULEN).
NAFAS PENDEK.
MUKUS YANG BERLEBIHAN TERJADI AKIBAT
DISPLASIA SEL-SEL PENGHASIL MUKUS DI
BRONKHUS, SILIA YANG MELAPISI BRONKHUS
MENGALAMI KELUMPUHAN ATAU
DISFUNGSIONAL SEKRETA
METAPLASIA.
RESIKO UTAMA TIMBULNYA BRONKHITIS
KRONIK ADALAH MEROKOK.

MIKROORGANISME PENYEBAB :
BAKTERI
Bordetella pertusis,Mycoplasma pneumoniae,
C. pneumoniae, Moraxella catarrhalis, H. influenzae,
S. pneumoniae.
VIRUS
Parainfluenzae virus 1, Parainfluenzae virus 2,
Adenovirus, Virus Ebstein Barr
JAMUR
Blastomyces dermatitidis

PENATALAKSANAAN :
PASIEN MENGHINDARI KONTAK IRITAN LEBIH

LANJUT, CONTOH ASAP ROKOK

TERAPI ANTIBIOTIK PROFILAKTIK, TERUTAMA
MUSIM DINGIN UNTUK MENGURANGI INSIDENS
INFEKSI SALURAN NAFAS BAWAH, KARENA
SETIAP INFEKSI AKAN SEMAKIN
MENINGKATKAN PEMBENTUKAN MUKUS DAN
PEMBENGKAKKAN.
SERING DIBERIKAN BRONKODILATOR
EKSPEKTORAN DAN PENINGKATAN ASUPAN
CAIRAN UNTUK MENGENCERKAN MUKUS
BILA PERLU TERAPI OKSIGEN

EMPYEMA
PERLUASAN INFEKSI DARI STRUKTUR YANG

BERDEKATAN DAN DAPAT MERUPAKAN

KOMPLIKASI DARI PNEUMONIA, ABSES PARUPARU ATAU PERFORASI KARSINOMA KE DALAM
RONGGA PLEURA.
EMPYEMA YANG MERUPAKAN NANAH DALAM
RONGGA PLEURA, ADALAH KOMPLIKASI
TERSERING, MEMERLUKAN ASPIRASI DAN
DRAINASE.

GEJALA KLINIK :
TERGANTUNG OLEH BANYAKNYA EFUSI.
UMUMNYA; BATUK DYSPNEA,PERASAAN

PENUH DI DALAM DADA, NYERI DADA.

PADA PEMERIKSAAN TERJADI HILANGNYA
SUARA NAFAS DAN PERKUSI REDUP.

MIKROORGANISME PENYEBAB :
BAKTERI
S. aureus, S. pneumoniae, Streptococcus Grup A.,
Bacteroides fragillis, K. pneumoniae, berbagai
Enterobacteriaceae
VIRUS
Parainfluenzae virus dan Influenzae virus
JAMUR
Coccidiodes immitis, H. capsulatum dan
B. dermatidis

TUBERKULOSIS
CONTOH LAIN DARI ISN (Infeksi Saluran Nafas)
BAWAH M. tuberculosis DITULARKAN MELALUI :
INHALASI PERCIKAN LUDAH (DROPLET) ORANG

KE ORANG, KEMUDIAN MENGKOLONISASI

BRONKHIOLUS ATAU ALVEOLUS.
SALURAN CERNA, INGESTI SUSU TERCEMAR
YANG TIDAK DIPASTEURISASI
MELALUI LESI KULIT.

 BILA BAKTERI TUBERKULIN BERHASIL

MENEMBUS MEKANISME PERTAHANAN SISTEM

PERNAFASAN (DOSIS INFEKTIF) BERHASIL
MENEMPATI SALURAN NAFAS BAWAH INANG
AKAN MELAKUKAN RESPON IMUN DAN
PERADANGAN YANG KUAT ( DIPERANTARAI
OLEH SEL T) 5% YANG MENDERITA
TUBERKULOSIS AKTIF.
PENULAR PENGIDAP INFEKSI
TUBERKULOSIS AKTIF, PADA MASA INFEKSI
AKTIF

ORANG YANG BERESIKO TERINFEKSI :

ORANG YANG BERDEKATAN DENGAN

PENDERITA INFEKSI AKTIF (PADAT PENGHUNI)

PARA PEKERJA KESEHATAN, LABORATORIUM,
RUMAH SAKIT YG MENANGANI
TUBERKULOSIS, DLL
YANG SISTEM IMUNNYA TIDAK ADEKUAT;
LANSIA, BAYI, PASIEN IMUNOSUPRESAN,
PENGIDAP HIV, KEKURANGAN GIZI.

Pemeriksaan Laboratorium
Cara Pengambilan :
Sputum adalah sekret dari paru-paru
bukan ludah. Dikenal ada 3 jenis sputum :
a.Sputum pagi : sputum yang
dikeluarkan pada saat pagi bangun tidur
b.Spot sputum : sputum yang dikeluarkan
pada saat itu
c.Collection sputum : sputum yang keluar
dan ditampung selama 24 jam
Sputum yang keluar ditampung dalam pot /
botol bersih dan steril

Jumlah Sputum
Sputum diambil 1- 2 ml dimasukkan ke dalam pot
atau botol steril.

Penyimpanan Sputum
Pemeriksaan sputum sebaikanya dilakukan langsung
pada saat sputum diambil
Apabila tidak, bisa disimpan dalam almari es selama
satu (1) minggu dan apabila di simpan dalam media
transport bisa sampai dua (2) minggu

Pemeriksaan Sputum Ziehl Nelson

Buat preparat ulas dari sputum Mycobacterium
tuberculosis
a. Objeck glass dibersihkan dengan alkohol sampai kotoran
yang melekat hilang, kemudian objeck glass dipanaskan
di atas api bunsen dan diolesi sputum TBC
b. Objeck glass dibersihkan dengan alkohol sampai kotoran
yang melekat hilang, kemudian objeck glass diolesi
sputum TBC dibarkan kering di suhu ruang

Lakukan fiksasi dengan cara melewatkan preparat

(objeck glass) di atas api bunsen.

a. Teteskan karbol fukhsin di atas apusan

sputum TBC dan panaskan dengan api
bunsen
sampai 5 menit dan diusakan zat
warna tidak
sampai mendidih
b. Teteskan karbol fukhsin di atas apusan
sputum TBC dan panaskan di atas air
mendidih sampai 5 menit dan diusakan zat
warna tidak sampai kering
Cuci dengan air mengalir dan dikeringanginkan
Tetesi dengan zat peluntur warna (peluntur
asam) : 20% H2SO4 atau campuran alkohol 95%
dengan 2,5% HNO3, biarkan selama 10-30 detik
sampai warna merah hilang

Cuci dengan air mengalir dan dikeringanginkan

Tetesi dengan metiline blue sebagai zat warna
penutup dan dibiarkan selama 10 30 detik.
Cuci dengan air mengalir dan dikeringanginkan
Amati dibawah mikroskop menggunkan minyak
imersi

Penilaian tingkat infeksi TBC menurut IUAT

(International Union Against Tuberculosis)
* Disebutkan jumlah kumannya
1 9 sel BTA / 100 LP
* Positif 1 (+)
10 99 sel BTA / 100 LP
* Positif 2 (+ +)
1 10 sel BTA / 1 LP
* Positif 3 (+ + +)
lebih dari 10 sel BTA / 1 LP

: diketemukan
: diketemukan
: diketemukan
: diketemukan

VIRUS H5N1
AVIAN INFLUENZA / FLU BURUNG
Sejarah Perkembangan :
Tahun 1918 Pandemik influenzae Spanish

influenzae (tipe H1N1)

Tahun 1957 Pandemic Asian flu Tipe H2N2
Tahun 1968 Pandemic Hongkong Flu tipe H3N2
6 tahun terakhir diketahui yg mampu menyebar
dari unggas ke manusia adalah tipe H5, H7 dan H9

Mikroorganisme Penyebab :
Virus RNA berulir negative
Termasuk genus virus influenzae A,
Fam. Orthomyxoviridae
Jalur Infeksi :
melalui udara, makanan unggas, air,
peralatan dan pakaian yang tercemar oleh
unggas yang sakit ataupun kotorannya.

 Bila terjadi rekombinasi genetic (genetic

reassortment) antara virus influenza burung dan

virus influenza manusia. Dimana rekombinasi
genetic ini dapat terjadi melalui hewan perantara
seperti babi dan juga manusia, ketika terinfeksi oleh
keduanya pada saat bersamaan.
Akibat proses rekombinasi tersebut, muncul subtype
baru yang telah berubah sifat antigeniknya sehingga
mampu dengan mudah menginfeksi manusia.
Ketika virus flu burung ini telah mampu mengatasi
barier spesies mutasi selanjutnya mungkin terjadi
penyebaran virus dari manusia ke manusia.
Akibatnya pandemic dapat terjadi.

Dibandingkan dengan H5 & H7,H9 tidak begitu

berbahaya bagi unggas dan manusia. Tingkat
bahaya tergantung pada konstruksi genetic virus
dan tingkatan penyakit yang ditimbulkannya.
Masing-masing hemaglutinin dari ketiga jenis virus
tersebut secara teoritis mampu berpartner dengan
salah satu dari 9 neuramidase surface proteins yang
membentuk beragam virus (H5N1,H9N1, H5N2, dst)
Virus H5N1, yang telah mampu menembus barier
spesies kasus dibeberapa Negara termasuk di
Indonesia
Kucing yang diketahui sebagai binatang yang tahan
terhadap virus influenzae diketahui telah menjadi
inang yang efektif bagi penyebaran virus flue
burung. Mekanisme ?

 Virus flue burung H7N7 dari manusia ke

manusia, merupakan varian dari H5N1

Vietnam, Thailand. --> anak ke ibu, pasien ke

perawat

Langkah yang perlu dilakukan :

memusnahkan seluruh unggas di wilayah yg sudah

dipastikan terinfeksi oleh flue burung

penyuluhan dan pengembangan praktik peternakan ayam
serta unggas lain yang lebih higienis, serta mengurangi
kontak ternak dengan burung liar.
Karena H5N1 mudah mengalami rekombinan genetic
mengurangi penyebaran manusia ke manusia dengan cara
missal : etika batuk yang baik. Mendeteksi varian flue
burung dengan metode biologi molekuler
Vaksinasi, tidak selalu efektif bila kualitas vaksin tidak baik
hanya akan mencegah gejala tetapi virus tetap berkembang
biak dan menyebar, bahkan diduga memicu virus mutan
Program surveillance missal memusnahkan unggas di
daerah wabah.

 Kunyit (curcuma domestica) dan temulawak

(curcuma xanthorriza) diketahui mengandung

curcuma yang berfungsi sebagai antisitokin.
infeksi AI (avian Influenzae) menyebabkan sitokin
dalam tubuh naik. Naiknya sitokinberbahaya.
Sitokin dalam tubuh khususnya paru akan
menyebabkan perubahan Oksigen (O2) mjd
Peroksida (H2O2) meracuni paru-paru.
Peningkatan antisitokin maka jumlah sitokin ditekan
sehingga jumlah peroksida dapat ditekan, sehingga
kerusakan paru-paru dapat dicegah.
Obat Oseltamivir :

Mengatasi inveksi AI dini

Berfungsi sebagai inhibitor neuraminidase
Mencegah virus-virus yang sudah bereplikasi dalam sel
Lepas dan menempel ke sel-sel lain.