REGULASI EKSPRESI GEN PADA PROKARIOT

Mekanisme regulasi transkripsi pada prokariot terbagi ke dalam dua kategori umum:

1. Mekanisme yang melibatkan laju turn-on dan turn-off ekspresi gen sebagai respon pada
perubahan lingkungan. Mekanisme pengaturan ini penting pada mikroorganisme karena
organisme ini sering terpapar perubahan lingkungan yang mendadak. Hal itu memberikan
mikroorganisme cukup banyak "Plastisitas atau kemampuan untuk menyesuaikan proses
metabolisme mereka dengan cepat agar mencapai pertumbuhan maksimal dan reproduksi di
bawah berbagai lingkungan kondisi.

2. Mekanisme yang disebut sirkuit terprogram ekspresi gen. Dalam kasus ini, beberapa peristiwa
memicu ekspresi satu set gen. Produk dari satu atau lebih fungsi gen ini dengan mematikan
transkripsi dari rangkaian gen pertama atau menyalakan transkripsi Gen pada set kedua.
Kemudian, satu atau lebih produk dari set kedua bertindak dengan menyalakan transkripsi pada
set ketiga, dan seterusnya. Dalam kasus ini, ekspresi sekuensial gen adalah diprogram secara
genetis, dan gen biasanya tidak dapat dinyalakan di luar sekuens.

Induksi dan represi pada prokariot

Gen yang menentukan produk dari jenis ini terus-menerus diekspresikan di kebanyakan sel. Gen
tersebut dinyatakan diekspresikan secara konstitutif dan disebut sebagai gen konstitutif. Produk
gen lainnya dibutuhkan untuk pertumbuhan sel hanya pada kondisi lingkungan tertentu.

Escherichia coli dan bakteri lainnya mampu tumbuh menggunakan salah satu dari beberapa
karbohidrat - misalnya glukosa, sukrosa, galaktosa, arabinosa, dan laktosa - sebagai sumber
energi. Jika glukosa hadir di lingkungan, maka akan secara istimewa dimetabolisme oleh sel E.
coli. Namun, sel E. coli bisa tumbuh dengan baik pada karbohidrat lain, contohnya laktosa
dengan mensintesis dua enzim, -galactosidase dan -galactoside permease, yang secara unik
dibutuhkan untuk katabolisme laktosa. Sintesis kedua enzim ini membutuhkan Energi yang
cukup besar (dalam bentuk ATP dan GTP). Dengan demikian, sel E. coli telah mengembangkan
mekanisme regulasi yang mana sintesis dari katabolisme enzim laktosa, dinyalaka ketika
tersedia laktosa, dan dimatikan ketika lakosa tidak ada.

Jika sel tumbuh pada karbohidrat selain laktosa dipindahkan ke media yang mengandung laktosa
sebagai satu-satunya sumber karbon, mereka dengan cepat mulai mensintesis enzim yang
dibutuhkan untuk pemanfaatan laktosa (Gambar 18.2a). Proses ini mengubah ekspresi gen
sebagai respons terhadap zat di lingkungan disebut induksi. Gen yang ekspresinya diatur dengan
cara ini disebut inducible Gen; Produk mereka, jika enzim, disebut inducible enzymes.
Substansi atau molekul yang responsible terhadap induksi disebut inducers. Enzim yang terlibat
dalam jalur katabolik (degradatif) seperti penggunaan laktosa, galaktosa, atau arabinosa, bersifat
khas Inducible. Induksi mengubah laju sintesis enzim, bukan aktivitas molekul enzim yang ada.
Induksi tidak terganggu dengan aktivasi enzim, yang mana pengikatan molekul kecil ke enzim
 meningkatkan aktivitas enzim, namun tidak mempengaruhi laju
sintesisnya.

Bila sel E. coli berada di lingkungan yang cukup mengandung

tryptophan untuk mendukung pertumbuhan optimal, dilanjutkan
sintesis biosintesis triptofan enzim akan membuang energi.
Dengan demikian, mekanisme regulasi telah berkembang pada E. coli
yang mana sintesis biosintesis enzim triptofan dimatikan bila triptofan
tersedia di lingkungan eksternal. Proses turning off (mematikan) ekspresi tersebut
disebut represi. Gen yang ekspresinya dimatikan dapat dikatakan
represses (ditekan), bila ekspresi gen ini dinyalakan, dikatakan
sebagai derepressed. Enzim yang merupakan komponen jalur
anabolik (biosintesis) seringkali dapat ditekan. Represi, seperti
induksi, terjadi pada tingkat transkripsi. Represi tidak terganggu
Gambar 18.2. dengan penghambatan umpan balik, yang terjadi bila produk
jalur biosintesis mengikat dan menghambat aktivitas enzim di
jalur pertama, Namun tidak mempengaruhi sintesis enzim.

Model Operon

Jacob dan Monod mengusulkan Bahwa transkripsi dari satu set gen struktural
bersebelahan diatur oleh dua pengendalian elemen (Gambar
18.4a). Salah satu elemen, gen represor, mengkodekan Represor,
yang (dalam kondisi yang sesuai) mengikat elemen kedua,
operator. Wilayah operator sering berada diantara promotor
dan gen struktural yang mereka regulasi. Unit bersebelahan
lengkap, termasuk gen struktural, operator, dan promotor, disebut Operon.

1. Dalam kasus operon yang ddiinduksi, represor bebas yang

berikatan dengan operator, akan menyebabkan transkripsi terhenti turn off . Ketika molekul
efektor (inducer) hadir dan berikatan dengan repressor, akan melepaskan repressor dari operator
sebab kompleks ikatan repressor-inducer tidak dapat mengikat operator. Jadi, penambahan
inducer menyalakan atau menginduksi transkripsi gen structural pada operon.

2. Dalam kasus operon yang dapat ditekan, situasinya terbalik. Represor bebas tidak bisa
mengikat operator, hanya molekul represor / efektor (ko-represor) kompleks yang dapat
mengikat mengikat operator. Jadi transkripsi dari gen structural pada operon dinyalakan ketika
tidak ada molekul efektor (co-repressor), dan akan dimatikan ketika terdapat molekul efektor
(co-repressor).

lac Operon, operon penginduksi

lac-operon merupakan operon terinduksi yang dikontrol secara negatif. Gen lacZ, lacill, dan lacA
diekspresikan hanya dengan adanya laktosa. Gen regulator lac, yang menunjuk gen I,
mengkodekan repressor yaitu 360 asam amino lama. Dengan tidak adanya inducer, repressor
berikatan dengan operator lac, yang pada akhirnya dapat mencegah RNA polymerase
mengkatalis transkripsi tiga gen structural.

Gen lacl, lac operator O1, dan lac promoter diidentifikasi decara genetis dengan mengisolasi
strain mutan yang mnejunjukkan ekspresi gen lac operon yang berubah. Mutasi pada gen I dan
operator sering menghasilkan sintesis konstitutif dari produk gen lac.mutasi operatos konstitutif
(Oc) hanya berlaku di cis, artinya mutasi Oc mempengaruhi ekspresi gen structural yang berada
pada kromosom yang sama. Operon menjadi tidak dapat diinduksi pada strain yang membawa
mutasi Is (s untuk superrepressed), gen structural lac biasanya dapat diinduksi sampai pada
konsentrasi inducer yang tinggi, namun tidak diinduksi pada tingkat inducer normal. Mutannya
merupakan polipeptida yang membentuk tetramer yang mengikat pada lac operator DNA. Mutasi
promotor tidak mengubah induksibilitas lac operon. Sebagai gantinya, mutasi itu membuat
tingkat ekspresi gen dalam keadaan terinduksi dan tidak diinduksi dengan mengubah frekuensi
transkripsi lac operon- yaitu efisiensi pengikatan RNA polymerase. Promotor lac sebenarnya
mengandung dua komponen yang terpisah, yaitu: (1) struktur pengikatan RNA polimerase dan
(2) tempat pengikatan protein lain yang disebut protein aktivator katabolit (CAP) yang mencegah
lac operon diinduksi dengan adanya glukosa.

trp, operon penekan

Operasi trp ini mengendalikan sintesis enzim yang mengkatalis biosintesis asam amino triptofan.
Ekspresi operon trp diatur dalam dua tingkat yaitu represi yang mengendalikan inisiasi
transkripsi, dan atenuasi (penghentian prematur). Represi operon trp E.coli adalah operon
represitif yang negatif.