1. Mengapa kacang hijau digunakan dalam percobaan ini?

Apakah kacang hijau

merupakan sumber DNA terbaik? Jelaskan alasan anda!

Seperti yang kita ketahui DNA terdiri dari protein-protein. Kacang hijau tidak
memiliki kandungan protein yang terlalu banyak.

2. Apakah fungsi dan tujuan penambahan garam dan deterjen pada percobaan ini?

Dalam proses isolasi DNA, deterjen berfungsi menggantikan senyawa-senyawa

kimia tersebut di atas. Deterjen mengandung sodium dodesil sulfat (SDS) yang
dapat menyebabkan hilangnya molekul lipid pada membran sel sehingga struktur
membrane akan rusak dan melisiskan isi sel. Pada Pengisolasian DNA
menggunakan garam dapur dengan tujuan untuk memekatkan DNA. Hal ini dapat
terjadi karena ion Na+ yang dikandung oleh garam mampu membentuk ikatan
dengan kutub negative pada ikatan fosfat DNA. Saat ion Na+ garam berikatan
dengan fosfat, pada saat itulah DNA akan berkumpul. Penambahan deterjen
dalam isolasi DNA dapat dilakukan karena deterjen dapat menyebabkan rusaknya
mebran sel yang nantinya akan membantu dalam isolasi DNA, kemudian melalui
ikatan yang dibentuk melalui sisi hidrofobik deterjen dengan protein dan lemak
pada membran membentuk senyawa ”lipid protein-deterjen kompleks”. Senyawa
tersebut dapat terbentuk karena protein dan lipid memiliki ujung hidrofilik dan
hidrofobik, demikian juga dengan deterjen, sehingga dapat membentuk
suatu ikatan kimia (Machmud, 2001). Dalam proses ekstraksi DNA juga
digunakan air asin (garam), di mana air asin (yang mengandung garam) ini dapat
membantu endapan DNA (memadatkan dan tampak) ketika alkohol ditambahkan
ke dalam proses ekstraksi DNA.

3. Mengapa air dingin lebih baik dibandingkan dengan air hangat dalam
mengekstraksi DNA? Jelaskan!

Air dingin juga dapat membantu untuk menjaga keutuhan DNA selama proses
ekstraksi, karena air dingin ini dapat memperlambat reaksi enzim, dan dapat
melindungi DNA dari enzim yang akan menghancurkan DNA.

4. Bagaimanakah sel dinding dari sel tumbuhan dapat dicacah/ pecah?

5. Jenis enzim apakah yang ditemukan di dalam pelunak daging/ jus nanas/ larutan
pembersih lensa kontak?
 Bubuk pengempuk daging mengandung enzim protease yang berfungsi untuk
memecah protein yang ada dalam sel sehingga DNA dapat keluar.

6. Apakah yang dapat anda lakukan untuk meningkatkan hasil DNA dalam
percobaan ini?
7. Mengapa DNA menggumpal secara bersama-sama? Jelaskan!
8. Bagaimana anda dapat mengkonfirmasi bahwa gumpalan putih berserabut yang
menempel pada lidi/ batang kayu tersebut adalah DNA?
9. Apakah mungkin bahwa gumpalan putih berserabut tersebut adalah campuran
DNA dan RNA?
10. Berapa lama daya tahan DNA? Akankah kuantitas DNA menurun dan
menghilang? Jelaskan!
11. Dapatkah anda mengekstrak DNA manusia menggunakan prosedur percobaan
ini?
12. Dapatkah anda menggunakan mikroskop untuk melihat DNA yang anda ekstrak
dalam percobaan ini?

Machmud, Muhammmad. 2001. Teknik Penyimpanan dan Pemeliharaan Mikroba. Balai Penelitian
Bioteknologi Tanaman Pangan. Bogor

Miligan, B.G. 192. Plant DNA Isolation. In: A.R. Hoelzel (Ed). Molecular Genetic Analysis of
Populations. A Practical Aproach. Oxford University Pres. New York.

Williams, dkk. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic
markers. Nucleic Acids Res. 18: 6531-6535.