BAB I

PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Protein merupakan rangkaian asam amino dengan ikatan peptida. Tiga per

empat zat padat tubuh terdiri dari protein (otot, enzim, protein plasma,

antibodi, hormon). Banyak protein terdiri ikatan komplek dengan fibril atau

disebut protein fibrosa. Macam protein fibrosa yaitu, kolagen (tendon,

kartilago, tulang), elastin (arteri), keratin (rambut, kuku) dan aktinmiosin

(Suprayitno dan Titik, 2017).

Seperti halnya dengan karbohidrat dan protein. Lemak merupakan sumber

¼
energi bagi tubuh. Bobot energi yang dihasilkan per gram lemak adalah 2

kali lebih besar daripada karbohidrat dan protein, 1 gram lemak menghasilkan

9 kalori sedangkan 1 gram karbohidrat dan protein hanya menghasilkan 4

kalori (Suhardjo dan Clara, 1992).

Interaksi protein dan lipid adalah pengaruh protein membran pada keadaan

fisik lipid atau sebaliknya. Interaksi protein lipid ini bergantung pada

sejumlah domain protein modular (misalnya C2, FYVE, PH, PX dan ENTH)

yang mengikat lipid membran spesifik seperti diacylgycerol (DAG) dan

berbagai phosphoinositides.

1.2 Tujuan Penulisan

Mengetahui interaksi protein dengan lemak.

1
 BAB II

TINJAUAN PUSTAKA

2.1 Interaksi Protein dengan Lemak

2.2.1 Lipoprotein

Menurut Youngson (2005), lipoprotein sendiri tidak bisa menembus

jaringan yang utuh. Cara kerjanya adalah dibawa kesuatu tempat dimana

kebutuhan pembuluh darah akan bahan ini bergitu lecil sehingga LDL bisa

berkontak langsung dengan sel targetnya. Lipoprotein merupakan senyawa

biokimiawi yang mengandung protein dan lemak. Lemak atau produk

turunannya dapat terikat secara kovalen maupun non kovalen dengan

protein. Lipoprotein dapat berbentuk enzim, transporter, protein struktural,

antigen, adesin, toksin, high density lipoprotein dan low density lipoprotein

yang memungkinkan lemak terusung di dalam darah, dan protein

transmembran yang terdapat pada mitokondria (terdapat juga pada kloroplas

tanaman), serta lipoprotein bakterial. Lipoprotein (LP) berbeda dalam

ukuran, densitas, komposisi lemak dan komposisi Apo. Perbedaan tersebut

membuat terdapat beberapa jenis LP yaitu HDL, LDL, IDL, VLDL,

kilomikron. Lipid plasma utama terdiri atas kolesterol, trigliserida,

fosfolipid dan free fatty acid. Namun karena lipid plasma bersifat hidrofobik

maka sirkulasinya di darah adalah dalam bentuk kompleks lipid-protein atau

lipoprotein. Plasma lipoprotein sendiri, berdasarkan densitasnya, terdiri atas:

kilomikron, VLDL, LDL dan HDL. Komposisi dan fungsi dari tiap

lipoprotein ini berbeda-beda. Kandungan terbanyak dari LDL, misalnya,

2
 adalah kolesterol (50%) dan phospolipid (25%), sedangkan kandungan

terbanyak dari HDL adalah protein (50%). Lipoprotein adalah kolesterol,

trigliserida, fospolipid, dan Apoprotein.

2.2.2 Interkaksi Protein Lipid

Salah satu sifat penting dari banyak protein pensinyalan yaitu mereka

memiliki domain transduksi sinyal yang memungkinkan mereka untuk

berinteraksi dengan komponen lain untuk mengatur jalur

pensinyalan. Domain-domain ini terlibat baik dalam interaksi protein-

protein atau dalam interaksi protein-lipid. Interaksi protein-

protein bergantung pada domain protein modular (misalnya SH2, SH3,

PTB, 14-3-3, PDZ, WW, SAM, FERM, ITAM, CH dan LIM) yang

mengikat urutan spesifik pada protein target mereka.

Ada dua pendekatan yang digunakan untuk mengukur afinitas relatif

dari pengikatan lipid dengan protein membran tertentu. Ini melibatkan

penggunaan analog lipid dalam vesikel fosfolipid yang dilarutkan yang

mengandung protein yang menarik:

1. fosfolipid berlabel spin secara gerak dibatasi ketika berdekatan dengan

protein membran. Hasilnya adalah komponen dalam spektrum ESR yang

diperluas. Spektrum eksperimental dapat dianalisis sebagai jumlah dari

dua komponen, spesies yang jatuh dengan cepat dalam fase lipid

"massal" dengan spektrum yang tajam, dan komponen yang dibatasi

secara gerak berdekatan dengan protein. Denaturasi protein membran

menyebabkan perluasan spektrum label spin ESR lebih lanjut dan

memberikan lebih banyak interaksi pada protein lipid-membran

3
2. Turunan-turunan lipid berlabel spin dan berlabel mampu memadamkan

fluoresensi tryptophan intrinsik intrinsik dari protein membran. Efisiensi

pendinginan tergantung pada jarak antara turunan lipid dan triptofan

fluoresen.

Banyak protein membran perifer mengikat membran terutama melalui

interaksi dengan protein membran integral . Tetapi ada beragam kelompok

protein yang berinteraksi langsung dengan permukaan lapisan ganda lipid .

Beberapa, seperti protein dasar mielin , dan spektrin terutama memiliki

peran struktural. Sejumlah protein yang larut dalam air dapat mengikat

permukaan bilayer secara sementara atau dalam kondisi tertentu. Proses

pemuas, biasanya memperlihatkan daerah hidrofobik protein, sering

dikaitkan dengan pengikatan pada membran lipid dan agregasi berikutnya,

misalnya, selama gangguan neurodegeneratif, stres neuronal, dan apoptosis.

Domain untuk interaksi protein lipid:

1. BAR domain

Dalam biologi molekuler, domain BAR adalah domain dimerisasi

protein yang sangat terkonservasi yang terjadi pada banyak protein

yang terlibat dalam dinamika membran dalam sel. Domain BAR

berbentuk pisang dan berikatan dengan membran melalui wajahnya

yang cekung.Ia mampu merasakan kelengkungan membran dengan

mengikat secara istimewa pada membran melengkung. Domain BAR

diberi nama setelah tiga protein yang mereka temukan. Banyak protein

keluarga BAR mengandung domain spesifisitas lipid alternatif yang

membantu menargetkan protein ini ke kompartemen membran

4
 tertentu. Beberapa juga memiliki domain SH3 yang berikatan dengan

dinamin sehingga protein seperti amphiphysin dan endophilin terlibat

dalam orkestrasi pemotongan vesikel.

2. C2 domain

Domain C2 adalah modul penargetan membran yang bergantung pada

Ca 2+ yang ditemukan pada banyak protein seluler yang terlibat dalam

transduksi sinyal atau perdagangan membran. Domain C2 unik di

antara domain penargetan membran karena domain ini menunjukkan

berbagai selektivitas lipid untuk komponen utama membran sel,

termasuk fosfatidilserin dan fosfatidilkolin. Domain C2 ini adalah

sekitar 116 residu asam amino dan terletak di antara dua salinan domain

C1 dalam Protein Kinase C dan domain katalitik protein kinase.

Domain C2 adalah domain struktural protein yang terlibat dalam

penargetan protein ke membran sel . Versi khas (PKC-C2)

memiliki sandwich beta yang terdiri dari 8 β-untai yang

mengoordinasikan dua atau tiga ion kalsium , yang mengikat dalam

rongga yang dibentuk oleh loop pertama dan terakhir dari domain, pada

permukaan yang mengikat membran. . Banyak keluarga domain C2

lainnya tidak memiliki aktivitas mengikat kalsium.

3. ENTH domain

Domain epsin N-terminal homology (ENTH) adalah domain

struktural yang ditemukan dalam protein yang terlibat

dalam endositosis dan mesin sitoskeletal . Domain ini panjangnya

sekitar 150 asam amino dan selalu ditemukan terletak di N-termini

5
protein. Domain membentuk struktur globular yang kompak, terdiri dari

sembilan heliks alfa yang dihubungkan oleh loop dengan panjang yang

berbeda-beda. Topologi umum ditentukan oleh tiga jepit heliks yang

ditumpuk secara berurutan dengan putaran tangan kanan. Heliks N-

terminal terlipat ke belakang, membentuk alur dasar yang dalam yang

membentuk kantung pengikat untuk ligan Ins P3. Ligan lipid

dikoordinasikan oleh residu dari alfa-heliks di sekitarnya dan ketiga

fosfat terkoordinasi secara berlipat ganda. Protein yang mengandung

domain ini telah ditemukan untuk mengikat PtdIns P2 dan Ins

P3 menunjukkan bahwa domain adalah modul yang berinteraksi

membran. Fungsi utama protein yang mengandung domain ini

tampaknya bertindak sebagai adapter aksesori clathrin dalam

endositosis, epsin mampu merekrut dan mempromosikan polimerisasi

clathrin pada lipid monolayer, tetapi mungkin memiliki peran tambahan

dalam pensinyalan dan regulasi aktin. Epsin menyebabkan tingkat

kelengkungan dan tubulasi membran yang kuat, bahkan fragmentasi

selaput dengan kandungan P2PsIns P2 yang tinggi. Ikatan Epsin ke

membran memfasilitasi deformasi mereka dengan memasukkan heliks

N-terminal ke dalam leaflet bagian dalam bilayer, mendorong

kelompok kepala terpisah. Ini akan mengurangi energi yang dibutuhkan

untuk melengkung membran menjadi vesikel, sehingga memudahkan

kandang clathrin untuk memperbaiki dan menstabilkan membran

melengkung. Ini menunjuk pada peran perintis untuk epsin dalam

pertumbuhan vesikel, karena memberikan kekuatan pendorong dan

6
 hubungan antara invaginasi membran dan polimerisasi clathrin. Secara

khusus, epsin-1 menunjukkan spesifisitas untuk membran

glikofosfolipid fosfatidylinositol-4,5-bifosfat , namun tidak semua

domain ENTH mengikat molekul ini.Binding menyebabkan

tubulasi liposom dan in vivo fungsi pengikat membran ini biasanya

dikoordinasikan dengan polimerisasi clathrin . Alfa-heliks N-terminal

dari domain ini bersifat hidrofobik dan menyisipkan ke dalam membran

seperti irisan dan membantu mendorong kelengkungan membran.

4. Pleckstrin hormology (PH) domain

Domain homologi Pleckstrin ( domain PH ) adalah domain protein dari

sekitar 120 asam amino yang terjadi dalam berbagai protein yang

terlibat dalam pensinyalan intraseluler atau sebagai

konstituen sitoskeleton . Domain ini dapat mengikat

lipid fosfatidylinositol dalam membran biologis dan protein seperti β-

subunit dari proteinG heterotrimerik, dan protein kinase C. Melalui

interaksi ini, domain PH berperan dalam merekrut protein ke membran

yang berbeda, sehingga menargetkannya ke kompartemen seluler

yang sesuai atau memungkinkannya untuk berinteraksi dengan

komponen lain dari jalur transduksi sinyal. Masing-masing domain PH

memiliki kekhususan untuk fosfoinositida yang difosforilasi di berbagai

lokasi dalam cincin inositol , sementara yang lain mungkin memiliki

afinitas yang diperlukan. Dengan demikian, enzim tersebut

mengerahkan sebagian efeknya pada fungsi sel dengan memodulasi

7
 lokalisasi protein pensinyalan hilir yang memiliki domain PH yang

mampu mengikat produk fosfolipid mereka.

5. Phox hormology (PX) domain

Domain PX adalah domain strukturalyang mengikat fosfoinositida yang

terlibat dalam penargetan protein ke membran sel. Domain ini pertama

kali ditemukan di domain P40phox dan p47phox dari NADPH

oxidase(phox adalah singkatan dari phagocytic oxidase). Itu juga

diidentifikasi dalam banyak protein lain yang terlibat dalam

perdagangan membran, termasuk nexins, Phospholipase D , dan

phosphoinositide-3-kinases. Domain PX secara struktural dilestarikan

dalam eukariota , meskipun sekuens asam amino menunjukkan sedikit

kesamaan. PX domain berinteraksi terutama dengan PtdIns Plipid.

Namun beberapa dari mereka mengikat asam fosfatidat , PtdIns

P2 , PtdIns P2 , PtdIns P2 , dan PtdIns P3 . PX-domain juga dapat

berinteraksi dengan domain dan protein lain.

6. FYVE domain

Dalam biologi molekuler, domain jari seng FYVE dinamai sesuai

dengan empat protein kaya sistein yaitu F ab1 (ragi ologolog

PIKfyve ), Y OTB, V ac1 (vesikel transport protein), dan E EA1.

Domain FYVE mengikat Phosphatidylinositol 3-phosphate, dengan

cara bergantung pada koordinasi ion logam dan asam amino

basa. Domain FYVE memasukkan ke dalam membran sel dengan cara

yang bergantung pada pH. Domain FYVE telah terhubung ke fungsi

penyortiran protein vakuolar dan endosom. Domain FYVE terdiri dari

8
dua jepit rambut beta kecil (atau buku jari seng) diikuti oleh alfa helix.

Jari FYVE mengikat dua ion seng . Jari FYVE memiliki delapan posisi

potensial sistein yang mengoordinasikan seng dan ditandai dengan

memiliki asam amino basa di sekitar sistein.

9
 BAB III

PENUTUP

3.1 Kesimpulan

Interaksi protein dan lipid adalah pengaruh protein membran pada

keadaan fisik lipid atau sebaliknya. Interaksi protein lipid ini bergantung pada

sejumlah domain protein modular (misalnya C2, FYVE, PH, PX dan ENTH)

yang mengikat lipid membran spesifik seperti diacylgycerol (DAG) dan

berbagai phosphoinositides.

Banyak protein membran perifer mengikat membran terutama melalui

interaksi dengan protein membran integral . Tetapi ada beragam kelompok

protein yang berinteraksi langsung dengan permukaan lapisan ganda lipid .

Beberapa, seperti protein dasar mielin , dan spektrin terutama memiliki peran

struktural. Sejumlah protein yang larut dalam air dapat mengikat permukaan

bilayer secara sementara atau dalam kondisi tertentu. Proses pemuas,

biasanya memperlihatkan daerah hidrofobik protein, sering dikaitkan dengan

pengikatan pada membran lipid dan agregasi berikutnya,

10
 DAFTAR PUSTAKA

Suhardjo dan clara, M., K. 1992. Prinsip-Prinsip Ilmu Gizi. Yogyakarta: Kanisius.

Suprayitno, E., dan Titik, D., S. 2017. Metabolisme Protein.malang: UB Press.

Youngson, Robert. 2005. Antioksidan: Manfaat Vitamin C dan E Bagi Kesehatan.

Jakarta: Arcan.

11