Farmakogenomik

PS Farmasi

MUTASI DAN POLIMORFISME

I Ketut Junitha

Laboratorium Genetika Program Studi Biologi

Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam
Universitas Udayana
2021
MUTASI
 MUTASI GEN
Dasar Molekular mutasi gen

Mutasi Spontan
Terjadi satu kali tiap satu juta sampai satu milyar
pembelahan, terjadi pada saat replikasi dari proses
pembelahan sel

Mutasi yang terinduksi → akibat:

* mutagen kimia/karsinogen
* sinar ultraviolet dll
Mutagen Kimia
 Kasus mutasi yang terinduksi pada manusia

Bom atom (nuklir) Nagasaki dan Hirosima menyebabkan

meningkatnya kasus leukemi menjadi 10 per seribu
dibandingkan 0,05 perseribu leukemi karena mutasi spontan

Demikian juga tingkat leukemi karena terpapar sinar X untuk

aethritis spinal menjadi 20 kali lebih tinggi dibandingkan
dengan mutasi spontan.

Pada saat Bom Nagasaki dan Hirosima korban yang terkena

radiasi lebih dari 100 rad pada uterus menunjukkan
peningkatan aberasi kromosom yang sangat signifikan
 Mutasi gen berdasar :
• 1. Substitusi:
• Transisi
• Transversi

• 2. Non Substitusi :
• Delesi transisi
• Insersi purine → purine, pyrimidine → pyrimidine
transversi
• Inversi purine → pyrimidine, pyrimidine → purine
• Translokasi
• Nick
 Point Mutasi

ATGCCCGAAGTG
TACGGGCTTCAC
transisi transversi
purine → purine purine → pyrimidine
pyrimidine → pyrimidine

ATGCCCAAAGTG ATGCCCTAAGTG
TACGGGTTTCAC TACGGGATCAC
Insersi

Delesi
 Sense Mutation
Results in a new codon which still codes for the same amino acid.

Nonsense Mutation
Results in a "stop" codon and premature termination of the protein.
 Missense Mutation
Results in one wrong codon and one wrong amino acid.

Frameshift mutation
 Inversi

AGTATACCGCTACAAATATTTGGG AGTATACATCGCCAAATATTTGGG
TTCAATGGCGATGTTTATAAACCC TCATATGTAGCGGTTTATAAACCC

AGUAUACCGCUACAAAUAUUUGGG AGUAUACAUCGCCAAAUAUUUGGG

ser-Ile-pro-Leu-gluN-Tir-phe-gli ser-Ile-His-Arg-gluN-Tir-phe-gli

Translokasi
AGTATACCGCTACAAATATTTGGG AGTATACCAAATATTTGGGCGCTA
TTCAATGGCGATGTTTATAAACCC TTCAATGGTTTATAAACCCGCGAT

AGUAUACCGCUACAAAUAUUUGGG AGUAUACCAAAUAUUUGGGCGCUA

ser-Ile-pro-Leu-gluN-Tir-phe-gli Ser-Ile-pro-AspN-Ile-Tri-Ala-Leu
 AKIBAT MUTASI

- Akibat molekular:
Silent = sense (asam amino sama, sinonim )
Missense (asam amino yang berbeda, salah)
Nonsense (menghasilkan kodon terminasi, stop)
Frameshift (pergeseran bacaan, merubah sekuen asam amino)

- Akibat biokimia/fisiologis/klinis
Tetap dalam fungsi normal
Ada ganggguan masih dalam fungsi
Fatal/lethal menyebabkan kelainan, penyakit , kematian
Mutasi Virus RNA

2013
Virus Flu Burung
H5N1

2014

H7N9
 Virus SARSCov-2 (Covid19):
Tipe A
Tipe B
Tipe C

Mutasi berkali-kali protein/ susunan asam amino menghasilkan varian-varian SAR-

CoV-2 yang ditemukan di Inggris yaitu:
(deletion 69-70, deletion 144, N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H)
B.1.1.7 Inggris, B256 USA, Le-Variant Prancis
Prader Willi Sindrome (PWS),
Hilang gen proksimal kromosom 15,
1/25000 anak, ciri: Obesitas, mental
retardasi, tangan dan kaki pendek, otot
lemah, hipogonadism
 PERBAIKAN KERUSAKAN DNA

BER (base excision repair),

perbaikan dengan
menghilangkan basa yang salah
pasangan

Glycoslyase menghilangkan
basa yang salah, Pol I
menghilangkan deoksi riborase
fosfat (5’-dRP) dan dNMPs
membuat untai baru ini pada
prokariot. Sedangkan pada
Eukariot satu nukleotide
diinsersikan oleh Pol ß sebelum
disambung oleh enzim ligase Perbaikan dengan mekanisme
penghilangan nukleotida NER
(nucleitide excisison repair),
melibatkan DNA polimerasi I, Pol
I, setelah itu enzim ligase akan
menyambungkan hasil
perbaikan nukleotida
 POLIMORFISME NUKLEODTIDA PADA 11 GEN ALKOHOL
DEHIDROGENASI PADA DROSOPHILA

Polimorfisme berdasarkan genetika populasi adalah bila dalam satu lokus terdapat lebih
dari satu alel dan tidak ada alel yang memiliki frekuensi lebih dari 99%.
Secara klinis bila terdapat lebih dari satu alel (varian ) sudah dapat dikatakan polimorfis.
Single Nucleotide Polimorphism
(SNP)
KROMATOGRAM

Normal alel G

Mutan, alel A
Sotos Syndrome
Disertasi , Arimbawa, 2019 . Polimorfisme Promotor Gen CETP 629 C/A