Laporan Praktikum Genetika

PENGAMATAN KROMOSOM POLITEN Drosophila melanogaster

Nafa Febrianti Mutia Dewi*, A.S. Nariswari, D. Sioe, J. Liadi, L. Djamilah, M.N. Latifa, Yosafat, A. A.
Gigantia

Universitas Indonesia
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam
Departemen Biologi
Oktober 2019

Abstrak

Drosophila melanogaster memiliki sel yang mengandung kromosom yang berperan penting dalam kemunculan
fenotip dan proses tumbuh kembang. Kromosom adalah struktur yang terdiri dari rantai DNA dan gen-gen yang bekerja
secara fungsional pada DNA. Kelenjar saliva Drosophila melanogaster ditemukan kromosom yang berukuran lebih besar
dan memiliki lengan-lengan kromosom yang lebih panjang dibanding kromosom lainnya, kromosom ini disebut kromosom
politen. Kromosom politen terbentuk karena adanya proses endoreduplikasi, dimana sintesis DNA berulang melalui tahap
G1 dan S tanpa melalui proses G2 dan pembelahan sel. Tujuan praktikum adalah untuk mengamati dan mengetahui
pengertian, fungsi dan proses terbentuknya kromosom politen, serta mengetahui cara isolasi kelenjar saliva larva instar III
Drosophila melanogaster. Metode pengamatan dimulai dari pengisolasian kelenjar saliva dengan menarik bagian mulut
dan badan dengan jarum sonde ke arah berlawanan. Kromosom politen berhasil ditemukan melalui mikroskop tetapi,
struktur seperti band, interband, kromosenter, dan puff kromosom politen tidak teramati dengan jelas.

Kata kunci: endoreduplikasi; kelenjar saliva; kromosom politen; larva instar III Drosophila melanogaster

1. Pendahuluan
Dalam tubuh suatu makhluk hidup sel dan jaringan
tertentu dapat diamati struktur kromosomnya. Kromosom
merupakan bentuk pemadatan benang kromatin yang
terdiri atas DNA dan protein. Kromosom terdiri atas dua
sister chromatids identik yang bergabung di sepanjang
strukturnya karena adanya kohesi. Bagian terpadat yang
menjadi tempat melekatnya benang-benang spindel pada

*) kelompok 5B 1
kromosom disebut sentromer (Campbell et al., 2014:
249).
Setiap kromosom memiliki dua lengan, yang
disatukan sentromer. Kedua lengan tersebut adalah,
lengan kromosom yang lebih pendek disebut p (petite)
arm dan yang lebih panjang disebut q arm. Bagian-bagian
tertentu pada kromosom memiliki struktur sangat padat
pada tahap interfase yang disebut heterokromatin.
Heterokromatin dapat menyerap zat pewarna yang
membuat kromosom terlihat dalam jumlah banyak.
Bagian selain heterokromatin adalah eurokromatin yang
akan terlihat dengan baik setelah kromosom memadat.
DNA pada heterokromatin memiliki variasi gen yang
sangat sedikit daripada eurokromatin. Bagian eukromatin
yang terdapat banyak gen akan berwarna lebih terang,
sedangkan bagian heterokromatin akan berwarna gelap
hal ini karena pada heterokromatin terdapat lebih sedikit
gen sehingga DNA terkondensasi dan lebih padat
daripada eukromatin. Heterokromatin (lengan kromosom
gelap) adalah bagian dari kromosom yang mengandung
DNA dan aktif dalam meregulasi gen namun inaktif
mengkode asam amino. Eukromatin (lengan kromosom
terang) merupakan tempat terjadinya proses trankripsi
yang menghasilkan asam amino yang dikode oleh DNA
yang terdapat pada lengan eukromatin (Suryo 2005: 9—
19).
Terdapat jenis kromosom yang berbeda dari
kromosom pada umumnya karena memiliki ukuran yang
lebih besar, kromosom ini disebut kromosom politen.
Kromosom politen merupakan kromsosom raksasa yang
terdiri dari sekitar 1000 molekul DNA, yang dapat
ditemukan di kelenjar ludah dan beberapa jaringan
lainnya. Kromosom politen memiliki struktur yang terdiri
dari lima lengan kromosom diantaranya, dua kromosom
nomor 2, dua kromosom nomor 3, dan sebuah kromosom
2
X. Terdapat kromosom kecil nomor 4, namun sangat
pendek dan sulit dibedakan dengan kromosenter.
Kromosom-kromosom politen bersatu pada struktur yang
disebut kromosenter. Selain itu, terdapat band, interband
dan puff pada kromosom politen. Band atau yang disebut
pita gelap merupakan bagian kromosom yang lebih padat
dan memuat sekitar 95% DNA kromosom politen
sementara 5% lainnya ada pada pita terang (interband).
Pita gelap tersusun atas sekitar 200.000 pasang basa
nukelotida sementara pita terang sekitar 3.000 basa
nukleotida. Puff merupakan bagian dari kromosom
politen yang menggembung akibat dekondensasi band
tertentu puff ini muncul ketika gen akan diekspresikan
(Alberts 2008: 236—239).
Kromosom politen terbentuk sebagai hasil dari
endoreduplikasi, yaitu replikasi kromosom di dalam
nukleus secara sukses tanpa adanya segregasi sister
chromatids. Replikasi DNA terus diinisiasi hingga
kromosom melewati tahap G1 dan kembali melalui
proses endocycle, namun kesalahan terjadi pada akhir
tahap S dimana sel tidak mengalami tahap mitotik atau
pembelahan lalu hasil endoreduplikasi tersebut saling
bergabung hingga menjadi kromosom yang besar
(Alberts 2008: 236). Kromosom politen berkembang baik
pada jaringan sekretori, seperti tubulus malphigi,
rektum, usus, dan kelenjar ludah pada ordo diptera.
Drosophila melanogaster merupakan salah satu anggota
dari ordo diptera yang memiliki kromosom politen
(Griffiths dkk. 2005: 23).
Kromosom politen berukuran besar dan kaya akan
DNA karena banyaknya jumlah salinan DNA berbanding
lurus dengan banyaknya jumlah protein yang dihasilkan.
Kromosom politen sangat berguna untuk proses in situ
hibridisasi asam nukleat. Pada proses hibridisasi in situ,
kromosom politen memipih dan DNA kromosomal
terdenaturasi. Drosophila melanogaster memiliki
kromosom politen karena spesies ini membutuhkan
sejumlah DNA dalam jumlah besar untuk melanjutkan
siklus hidupnya dari larva instar III menjadi pupa dan
kemudian menjadi Drosophila melanogaster dewasa
(Hartl & Jones 2006: 234−235).
Tujuan dari praktikum pengamatan kromosom
politen, yaitu memahami tentang kromosom politen D.
melanogaster, mengetahui struktur dari kromosom
politen, dan mengetahui cara mengisolasi kelenjar ludah
pada larva instar III Drosophila melanogaster.
2. Metodologi
Alat yang digunakan pada praktikum pengamatan
kromosom politen Drosophila melanogaster, diantaranya
adalah mikroskop stereo, mikroskop cahaya, object
glass, cover glass, jarum sonde, pinset, botol spesimen,
dan pipet. Bahan yang digunakan, yaitu larutan ringer,
asetokarmin, dietil eter, larva instar III Drosophila
melanogaster dan kertas tissue.
Cara kerja yang dilakukan pada praktikum kromosom
politen ya ng pertama adalah disiapkannya alat dan bahan
yang akan digunakan seperti larva instar III diambil dari
medium pembiakkan menggunakan pinset dan diletakkan
di atas kaca objek yang telah diberikan larutan ringer.
Kedua, kaca objek tersebut diletakkan di bawah
mikroskop stereo agar dapat dilihat struktur tubuhnya,
untuk dibedakan bagian kepala dan abdomen. Ketiga,
bagian badan dan kepala larva ditusuk dengan jarum
sonde lalu ditarik ke arah yang berlawanan. Keempat,
kelenjar saliva larva instar III diisolasi dan dibersihkan
dari lemak dan kotoran lain yang tersisa.
Kelima, kelenjar saliva diberikan pewarna
asetokarmin dan didiamkan selama 10-15 menit.
Keenam, kaca objek ditutup menggunakan cover glass.
3
Ketujuh, cover glass diberi tekanan (squashing) dengan
ibu jari agar kelenjar saliva hancur dan sel-selnya tersebar
merata. Kedelapan, sisa asetokarmin dibersihkan dengan
kertas tissue lalu kromosom politen kelenjar ludah
diamati di bawah mikroskop cahaya.
3. Hasil dan Pembahasan
Gambar 1:
Kromosom politen
Perbesaran 10x40
[Sumber: Dokumentasi kelompok]
Penggunaan larva instar III Drosophila melanogaster
dalam pengamatan kromosom politen ini memiliki
beberapa keunggulan seperti, larva instar III Drosophila
melanogaster sudah memiliki organ pembantu
pencernaan yang lengkap seperti kelenjar saliva yang
mengandung enzim dan pada fase ini larva mengalami
banyak penimbunan energi untuk mempersiapkan
metamorfosis ke bentuk pupa, sehingga larva instar III
Drosophila melanogaster memiliki banyak kromosom
politen selain itu larva instar III Drosophila melanogaster
memiliki tubuh yang relatif besar juga lunak sehingga
mudah untuk diisolasi (Hartl&Jones 2006: 234).
Kromosom politen berkembang baik pada jaringan
sekretori, seperti tubulus malphigi, rektum, usus, dan
kelenjar ludah (Griffiths dkk. 2005: 23). Kelenjar saliva
Drosophila melanogaster diamati karena pada fase ini
larva memiliki cukup banyak enzim yang membuat massa
dan volume sel bertambah, selain itu pada tahap ini juga
sel sedang aktif melakukan metabolisme, dan memiliki
kromosom politen yang berukuran besar dan terlihat jelas
sehingga mudah untuk diamati, selain itu, kelenjar ludah
memiliki kromosom yang lebih tebal dari tubulus
malphigi, rektum, dan usus (Henderson 2004: 252).
Alat dan bahan yang digunakan dalam pengamatan
memiliki tujuan dan alasan tersendiri dibalik
penggunaannya. Mikroskop cahaya digunakan untuk
mengamati kromosom politen pada kelenjar saliva
sementara mikroskop stereo memudahkan isolasi kelenjar
saliva karena mikroskop stereo memiliki medan kerja
yang lebih besar dibandingkan mikroskop cahaya.
Penggunaan larutan ringer saat larva instar III pertama
kali dipindahkan dari medium karena larutan ringer
merupakan larutan yang bersifat isotonik terhadap
permukaan tubuh larva instar, sehingga dapat dikatakan
larutan ringer ini berfungsi sebagai larutan fisiologis bagi
larva instar III Drosophila melanogaster yang membuat
tubuh larva istar tetap terjaga tidak mengalami kekeringan
ataupun dehidrasi (Mulholland dkk 2011: 168).
Pengisolasian kelenjar saliva menggunakan bantuan
pinset dan penusukan dua jarum sondet pada bagian
kepala dan badan yang kemudian ditarik kearah
berlawanan, tahapan ini dilakukan dibawah mikroskop
stereo. Pipet berfungsi untuk meneteskan larutan ringer
dan asetokarmin. Tujuan pewarnaan dengan asetokarmin
adalah sebagai pewarnaan bagian inti sel untuk menandai
kromosom agar dapat dibedakan dan diamati dengan baik
Kaca objek dan cover glass digunakan untuk membuat
preparat yang akan diamati dibawah mikroskop cahaya,
penempelan cover glass harus hati-hati dan ditekan
4
dengan perlahan menggunakan ibu jari atau benda tumpul
lainnya hal ini bertujuan agar sel menyebar merata dan
tidak terjadi penumpukan (Frankhauser, 2010: 1).
Pengamatan kromosom politen Drosophila
melanogaster kelompok 5B berhasil mendapatkan
kromosom politen pada percobaan terakhir. Struktur
kromosom politen ditemukan, namun bagian kromosom
politen seperti puff, band, dan interband tidak terlihat
dengan jelas. Kromosom politen berhasil diamati dengan
perbesaran 10 x 40 di bawah mikroskop cahaya. Hasil ini
sesuai dengan literatur yang menyatakan bahwa terdapat
banyak kromosom politen pada kelenjar saliva larva
instar III Drosophila melanogaster (Hartl&Jones 2006:
234). Analisis kesalahan yang menyebabkan beberapa
bagian kromosom politen seperti puff, band, dan
interband tidak terlihat dengan jelas dipercayai karena
penyerapan asetokarmin yang relatif singkat dan
membuat asetokarmin kurang menyerap sehingga bagian-
bagian kromoson politen tidak dapat dibedakan dengan
baik, selain itu proses squashing tidak dilakukan secara
merata pada pengamatan sehingga kromosom politen
kurang menyebar dan menumpuk (Tyagi 2009: 108—
109).
4. Kesimpulan
Kromosom politen merupakan kromosom yang
memiliki ukuran yang lebih besar dan memiliki
banyak lengan yang lebih panjang dibandingkan
dengan kromosom pada umumnya. Struktur bagian
yang terdapat dalam kromosom politen adalah band,
interband, kromosenter, dan puff. Fungsi kromosom
politen yaitu untuk proses pertumbuhan,
perkembangan dan penghasil protein dari proses
replikasi DNA. Kromosom politen terbentuk akibat
terjadinya sintesis DNA berulang melalui tahap G1
 dan S tanpa melalui proses G2 dan pembelahan sel. Suryo. 2005. Genetika manusia. Gadjah Mada University
Kelenjar ludah larva instar III Drosophila Press, Yogyakarta: xvi + 540 hlm.
melanogaster dapat diisolasi dengan menarik bagian Tyagi, R. 2009. Understand genetics. Covery Publishing
kepala dan tubuh larva instar III dengan menggunakan house PVT. LTD., New Delhi: 332 hlm.
jarum sonde kearah yang berlawanan.

5. Daftar Acuan
Alberts, B., A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts,
& P. Walter. 2008. Molecular Biology of The
Cell 5th ed. Garland Science, New York: xxxiii +
1601 hlm.
Campbell, N. A., J. B. Reece, L. A. Urry, M. L. Cain, S.
A. Wasserman, P. V. Minorsky, & R. B. Jackson.
2014. Biology 10th ed. Pearson Education, Inc.,
USA: xivii + 1488 hlm.
Frankhauser, D. B. 2010. Drosophila Salivary Gland
Chromosome. Lab genetics. 1 hlm.
Griffiths, Anthony J.F, dkk. 2005. An Introduction to
Genetic Analysis Eight Edition. W.H. Freeman and
Company. v + 706 hlm.
Hartl, D.L. dan Jones, E.W. 2006. Genetics: Principles
and Analysis, 4 th ed. Jones and Bartlett Publishers,
Sudbury, Massachusetts. xxiv + 829 hlm.
Henderson, D. S. 2004. Drosophila Cytogenetics
Protocols. Humana Press, USA: 468 hlm.
Mullholland, M. W., dkk. 2011. Complication in
surgery. Lippincott Williams & Wilkins,
Philadelphia: xi + 746 hlm.