Selain kelebihan yang ada pasti ada kelemahan yang ada dalam nalar Mu’tazilah ini.
Mereka yang berpikir sangat Rasional menjadikan dirinya lupa bahwa ada beberapa hal yang
tidak bisa dipahami dengan nalar akal. Mereka yang menganggap Al-Qur an sebagai makhluk
jelas menyalahi kebenaran yang ada.
Mereka juga menempatkan orang yang berdosa bukan di neraka dan bukan juga di
surga. Padahal orang yang berlaku dosa besar jelas akan dimasukan kedalam neraka. Karena
mereka telah memilih hal yang mejadi ujian bagi dirinaya. Karena Al-Quran hanya
menjajinkan dua hal bagi orang yang ppernah beriman yaitu antar surga dan neraka.