EKSPRESI GEN DAN

REGULASINYA
Dr. Adam Saepudin, Ir., M.Si
Visi Tinta Manik, S.Si., M.Si
The Central Dogma
The flow of genetic information based on Francis Crick
(1953)

Ekspresi gen, dari gen ke protein :

1. Transkripsi
2. Translasi -> produk berupa protein dan enzim
1. Transkripsi
Transkripsi : proses penyalinan kode2 genetic yang ada pada urutan
DNA menajdi molekul RNA (sintesis RNA)
transkripsi berlangsung di: nukleus
Produk transkripsi : mRNA, tRNA, rRNA

Komponen Utama yang terlibat dalam proses transkripsi

1. DNA template -> DNA antisense/untai negatif (DNA arah 3’->5’)
2. Enzim RNA Polimerase (prokariot 1 macam, eukariot 3 macam)
3. Faktor-factor transkripsi
Tahapan proses transkripsi
Tahapan trasnkripsi
a) Faktor yang mengendalikan transkripsi
menempel pada bagian promoter
menyebabkan terbentuknya kompleks
promoter yang terbuka (open promoter
complex), RNA polymerase berikatan dengan
promoter dan mulai membaca template
(Inisiasi)
b) RNA polymerase bergerak dengan arah 5’-> 3’
dan melakukan Proses pemanjangan untai RNA
(elongasi)
c) Pengakhiran proses transkripsi yang ditandai
dengan pelepasan RNA polymerase dari DNA
a Inisiasi transkripsi
Prokariot -> lokasi tertentu (sekuen -35……-10 ) dikenali secara spesifik
oleh RNA polymerase, kemudian RNA berikatan di lokasi tersebut

Eukariot ->protein2 factor (TF) transkripsi memediasi pengikatan

RNA polymerase dan proses inisiasi. RNA polymerase II tidak akan
berikatan dengan promoter sebelum TF berikatan setalah mengenali
lokasiTATA box promoter
SP1 TFIID
Proses Inisiasi transkripsi pada
eukariot
b. Elongasi
transkripsi
c. Terminasi Transkripsi
Prokariot : Terminator transkripsi (sekuen RNA) berfungsi sebagai
sinyal terminator menyebabkan RNA polymerase lepas dari DNA
template dan melepaskan produk transkripsi tanpa ada modifikasi
sebelum translasi

Eukariot : RNA polymerase mentrasnkripsi poliadenilase signal sequence

(AAUAAA) -> berikatan dengan protein tertentu -> pada sekuens 10-35
dari AAUAA protein tersebut memutus RNA (pre-mRNA) sehingga
terlepas dr RNA polymerase -> Pre-mRNA mengalami RNA prosesing
RNA Prosesing
Split Gene and RNA Splicing

Proses RNA splicing ->

dibantu oleh slicesosome
(komplek protein dan unit
kecil RNA)
Perbedaan proses transkripsi pada prokariot dan
eukariot
2. Translasi
• Translasi : penerjemahan kode2 genetic (kodon) yang ada
pada molekul mRNA menjadi urutan asam-asam amino
• Translasi berlangsung didalam ribosom

• Prokario; -> translasi sudah dimulai sebelum proses

transkripsi selesai

• Eukariot : translasi dimulai setelah transkripsi selesai

Komponen trasnlasi
a) mRNA
b) Ribosom
c) tRNA
Tahapan Proses Translasi :
a. Inisiasi
b. Elongasi
c. Terminasi

a. Inisiasi
Dimulai ketika subunit kecil
ribosom berikatan ke molekul
mRNA diikuti dengan
berikatannya antikodon tRNA
yang membawa metionin
dengan start kodon mRNA
(AUG),
-> subunit besar ribosom
berikatan -> kompleks inisiasi
translasi
b. elongasi
c. Terminasi

Stop kodon (UAG,UAA, UGA) tidak mengkode asam amino, tapi berperan sebagai sinyal
untuk menghentikan proses translasi
Completing and Trageting the functional protein
• Protein Folding
Pada Saat sintesis, rantai polipeptida -> mulai memilin dan
melipat -> protein spesifik tiga dimensi (struktur sekunder
dan tersier)

• Modifikasi post-translasi
- penambahan gula, lipid, phosphate group, atau yang lainnya
- Enzyme menghapus satu atau lebih AA pada ujung rantai polipeptida
- Rantai polipeptida dipotong secara enzimatis membentuk beberapa
rantai
- Penggabungan dua atau lebih rantai polipeptida yang disintesis
secara terpisah
 Perbedaan ekspresi gen prokariot dan eukariot
Pembeda Prokariot Eukariot

Promoter polisistronik monosistronik

DNA coding Tidak dijumoai intron Ada intron

region
RNA polimerase 1 macam 3 macam

Proses inisiase Hanya memerlukan RNA Membuutuhkan

polimerase protein/enzim lain
Post transkripsi Tidak ada ada

proses simultan Non-simultan

REGULASI EKSPRESI GEN
Anableps anableps as known as ‘quatro ojos (four eyes)
The cell of the two parts of the eyes express a slightly different set of
genes involved in vision, even though these two cell quite similar and contain
identical genome

How organism regulate expression of their genes

in respon to different environment condition ?
REGULASI EKSPRESI GEN PROKARIOT
Bacteria often respond to environmental change by
regulating transcription

Contoh mekanisme regulasi pada

bakteri adalah regulasi sintesis
triptofan

Jalur metabolism enzim dapat

dikontrol dengan 2 cara
1. Sel menyesuaikan aktifitas enzim
yang sudah ada
2. Sel dapat mengatur tingkat
produksi enzim tertentu
Konsep dasar operon pada prokariot
Operon merupakan sekelompok gen yang dikontrol oleh
promotor yang sama
Operon = single ‘on-off switch -> can control the whole cluster
of functionally related genes -> coordinately control

If the operator is operon’switch for controlling

transcription, how does this switch work ?
Regulasi Gen Negatif
Negative control gene -> the operons are switched off by
the active form of their respective repressor protein

Regulasi gen negative ada 2:

1. Represible operon : its transcription usually ‘ON’ but can
be inhibited (repressed) when a specific small molecule
bind allosterically to a regulatory protein -> ex: trp operon
2. Inducible operon : usually ‘OFF’ but can be stimulated
(induced) to be ON when a specific small molecule interact
with a different regulatory protein -> lac operon
Contoh Trp Operon

by itself, trp Operon is turn on -> repressible operon

trp repressor -> preventing transcription

 Mekanisme switch
off trp operon

Tryptophan function in this system as

a corepressor

Corepressor : small molecule

that cooperates with a
repressor protein to switch an
operon off
Lac operon
Dalam konteks regulasi gene, enzim yang berperan dalam
jalur/pathway laktosa disebut inducible enzymes -→
berfungsi pada proses katabolisme

Enzim pada sintesis triptopan disebut repersible enzyme →

berperan dalam proses anabolisme
Regulasi gen positif
Organisme prokariot dalam hal ini E. coli, ketika glukosa dan laktosa
tersedia, maka dia akan menggunakan glukosa sbg bahan energi untuk
dimetabolisme. Enzim utk glikolisis (breakdown) glukosa selalu ada.

How does the E. coli cell sense the glucose concentration and
relay this information to the lac operon?

• Gene regulation is said to be positive only when a regulatory protein

interacts directly with the genome to switch transcription on.
protein cyclic AMP (cAMP) jumlahnya banyak jika glukosa terbatas
cAMP receptor protein (CRP) -> activator protein
• Lac operon diatur oleh dua mekanisme kintrol:
1. Negatif control by lac repressor
2. Positif control by CRP
THE END OF THIS CHAPTER
Regulasi Gen Eukariot (tidak diberikan)
• A typical human cell might express about 20% of its protein coding
genes at any given time
• Almost all the cells in a multicellular organism contain an identical
genome.
• A subset of genes is expressed in each cell type; some of these are
“housekeeping” genes, expressed by many cell types, while others are
unique to that cell type.
• potential control point at which gene expression in eukaryot can be
turned on or off, accelerated, or slowed down.
• Regulasi ekspresi sangat penting untuk spesialisasi sel yang terdiri dari
berbagai tipe sel
• Perbedaan tipe sel pada organisme prokariot dikarenakan adanya
perpedaan ekspresi gen
• Kontrol ekspresi gen pada mahluk hidup terjadi pada proses transkripsi
• Regulasi ekspresi gen eukariot dilakukan pada tahap :
a. Regulasi struktur kromatin
b. Regulasi inisiasi transkripsi
c. Kombinasi kontrol aktivasi gen
d. Regulasi post-transkripsi
Regulasi Struktur Kromatin
1. modifikasi histon ->
asetilasi
2. Metilasi DNA
• Gen individu ketika tidak diekspresikan biasanya sangat
termetilasi,
• Eliminasi beberapa grup metil dapat mengaktifkan
transkripsi
Regulasi inisiasi Transkripsi

Untuk mengawali proses

transkripsi, RNA pol pada
eukariot membutuhkan
bantuan faktor transkripsi

Interaction of general
transcription factor and
RNA pol II with promoter
usualy lead to only a low
rate initiation
• Activator is a protein that binds to an enhancer and stimulate
transcription of gene
Kombinasi kontrol aktivasi gen
• A particular combination of control elements can activate
transcription only when the appropriate activator protein are present
Regulasi Post-transkripsi
• microRNA (miRNA) are small, single strand RNA molecules that can
bind to complementary mRNA sequence -> degrade mRNA or block its
translation

Small interfering RNA

(SiRNA) dapat menghambat
ekspresi gen -> RNA
interference (RNAi)
THANK YOU…….