TUGAS BIOLOGI SEL DAN MOLEKULER III

REVIEW JURNAL

Disusun Oleh :
Tazqiya Arsy Qurroti Nur Ainina (P27834021046)

Dosen Pembimbing :
Anita Dwi A,S.ST,M.SI

POLITEKNIK KESEHATAN KEMENKES SURABAYA

DIPLOMA III TEKNOLOGI LABORATORIUM MEDIS
TAHUN AKADEMIK 2023/2024
Judul Deteksi Cepat Gen InvA pada Salmonella spp.
Dengan Metode PCRm
Jurnal Jurnal Sains Farmasi & Klinis
Volume dan Halaman Vol. 5 No. 3 Halaman 191-200
Tahun 2018
Penulis Soni Muhsinin, Maria Martina Sulastri, dan
Dadih Supriadi
Reviewer Tazqiya Arsy Qurroti Nur Ainina
Tanggal 12 Mei 2023
Tujuan Penelitian Untuk pengembangan metode deteksi cepat
Gen InvA pada Salmonella spp. Dengan
metode PCR.
Subjek Penelitian Kultur Salmonella ATCC didapatkan dari
Politeknik Kesehatan Bandung.
Metode Penelitian Hasil amplifikasi DNA (amplicon) dianalisis
menggunakan elektroforesis gel agarosa
produk PCR.
Hasil Penelitian Berdasarkan hasil pengukuran diperoleh
kemurnian DNA 1,66 yang menunjukan
adanya sedikit kandungan protein, sehingga
masih dapat digunakan untuk proses
amplifikasi. Berdasarkan hasil pengukuran
konsentrasi DNA yang didapat yaitu 4,5 ng/µl.
Primer yang digunakan pada penelitian ini
berdasarkan literatur jurnal dengan gen target
InvA yaitu InvA-F: 5’
TCGTCATTCCATTACCTACC 3’dan InvA-
R:5’ AAACGTTGAAAAACTGAGGA 3’
yang menghasilkan panjang produk 119 bp.
Tahap selajutnya dilakukan karakterisasi
primer untuk melihat kualitas primer dengan
pengujian bioinformatika menggunakan
software BLAST. Hasil analisis BLAST
menunjukan bahwa urutan primer yang
digunakan spesifik hanya terdapat pada
Salmonella. Tahap selanjutnya dilakukan
dilakukan uji primer untuk melihat kualitas
primer dan panjang produk PCR yang
dihasilkan. Berdasarkan hasil dari BLAST
Primer NCBI, panjang produk yang dihasilkan
dari amplifikasi PCR yaitu 119 bp dengan GC
% dari primer forward 45% dan reverse 35 %.
 Hasil penelitian menunjukan konsentrasi
komponen PCR yang optimal ditunjukan pada
Tabel 1 dengan kondisi amplifikasi
berdasarkan literatur jurnal penelitian yaitu
suhu denaturasi 950C, annealing 500C dan
extension 720C dengan jumlah siklus 35 siklus.
Kekuatan Penelitian Kekuatan penelitian ini adalah memuat semua
identitas peneliti, urutan penulisan tersusun
rapi, dan menggunaka bahasa yang lugas.
Kelemahan Penelitian Kelemahan penelitian ini adalah tidak
mendorong adanya penelitian lanjutan.

Judul Real-Time PCR Method for Detection of

Salmonellaspp. in Environmental Sample
Jurnal Mikrobiologi Terapan dan Lingkungan
Volume dan Halaman Vol.83 Halaman 1-12
Tahun 2017
Penulis Kuppuswamy N. Kasturi, Tomas Drgon
Reviewer Tazqiya Arsy Qurroti Nur Ainina
Tanggal 12 Mei 2023
Tujuan Penelitian Untuk mendeteksi Salmonella di lingkungan
sampel membutuhkan 2 hari untuk mendapatkan
hasil dan memiliki sesitivitas terbatas.
Subjek Penelitian Sampel makanan yang terkontaminasi secara
alami atau buatan dan sampel tinja.
Metode Penelitian Multiplex real-time PCR
Hasil Penelitian Hasil PCR untuk 329 isolat Salmonella dan 22
organisme lingkungan non- Salmonella
mengkonfirmasi spesifisitas set probe primer invA,
prt, tyv, dan 5df-1 yang digunakan dalam
pengujian. Reagen invA mendeteksi semua 6
subspesies Salmonella enterica Sebagian besar
Salmonella spp. diisolasi dari sampel lingkungan
termasuk subspesies enterica, dan hanya beberapa
isolat yang berasal dari 5 subspesies 5. enterica
lainnya. Reagen khusus target hewan peliharaan
dan tyv mendeteksi semua 57 isolat kelompok D-
positif (12 serovar berbeda) yang berbagi faktor
antigenik 0-9, sedangkan 272 isolat lainnya dari
114 serovar dari 32 kelompok O negatif, sehingga
mengkonfirmasikan tidak adanya faktor antigenik
bersama 0-9 pada isolat tersebut.
Kekuatan Penelitian Kekuatan pada jurnal ini adalah metode dan
desain penelitian yang lengkap serta dijelaskan
 secara detail serta memuat identitas peneliti
secara lengkap.
Kelemahan Penelitian Kelemahan pada jurnal ini adalah susunan format
yang tidak biasa menyebabkan pembaca kesulitan
menemukan beberapa data.

Judul ISOLATION OF Salmonella typoid 16s sRNA GENE

FRAGMENT BASED ON POLYMERASE CHAIN
REACTION (PCR)
Jurnal Ilmiah Biologi Eksperimen dan Keanekaragaman
Hayati
Volume dan Halaman Vol.7 Hal.53-58
Tahun 2020
Penulis Salman Farisi, Wawan A. Setiawan, Suratman
Reviewer Tazqiya Arsy Qurroti Nur Ainina
Tanggal 12 Mei 2023
Tujuan Penelitian Untuk pengembangan diagnosis demam tifoid.
Subjek Penelitian Isolat bakteri Salmonella tifoid dari sampel yang
terindikasi demam tifoid di Bandar Lampung.
Metode Penelitian PCR Elektroforesis
Hasil Penelitian Melalui visualisasi hasil PCR dengan
elektroforesis diketahui bahwa dihasilkan pita
tunggal hasil PCR dengan primer 16s-rRNA.
Pasangan primer ini mampu mengamplifikasi gen
16S rRNA dengan ukuran sekitar 1400 pasang
basa. Ini menandakan bahwa hasil amplifikasi
tersebut dapat dilanjutkan untuk dilakukan
sekuensing
Kekuatan Penelitian Kekuatan pada jurnal ini adalah pembahasan
detail dan terperinci mulai dari pembahasan yang
detail, menyajikan abstrak dan kesimpulan serta
memuat identitas peneliti.
Kelemahan Penelitian Kelemahan penelitian ini adalah ada beberapa
singkatan yang tidak memiliki penjelasan sehingga
pembaca kesulitan mengartikan singkatan
tersebut.