Agung Rahmadani
DEFINITION AND PROPERTIES OF A DRUG MOLECULE
Pharmacokinetic Phase
(Fase Farmakokinetik)
Setelah molekul obat dilepaskan dari formulasinya, ia memasuki
fase farmakokinetik. Fase ini mulai dari penyerapan obat ke dalam
tubuh melalui dinding usus hingga mencapai lingkungan mikro dari
situs reseptor.
Selama fase farmakokinetik, obat ini diangkut ke organ target dan
organ lain dalam tubuh. Bahkan, setelah diserap ke dalam aliran
darah, obat ini cepat diangkut ke seluruh tubuh dan akan mencapai
setiap organ dalam tubuh dalam waktu empat menit.
Karena obat ini secara luas didistribusikan ke seluruh tubuh, maka
hanya sebagian sangat kecil dari senyawa yang diberikan yang
akhirnya mencapai organ target yang diinginkan, ini merupakan
masalah yang signifikan bagi para desainer obat. sebagai contoh
untuk molekul obat dengan berat molekul sekitar 200, masing-
masing molekul eksogen tunggal obat yang diberikan akan
berhadapan dengan 106 molekul endogen sebagai situs reseptor
yang tersedia ("satu kesempatan dalam satu juta.)
Fase Farmakokinetik
Selama fase farmakokinetik molekul obat mengalami berbagai serangan
dan terjadi ketidakseimbangan (prosentase molekul tidak sama).
Sementara obat diangkut dalam darah, molekul obat dapat terikat pada
protein darah. Jenis ikatan protein darah sangat bervariasi.
Obat yang sangat lipofilik tidak larut dengan baik dalam serum berair
sehingga akan sangat mengikat protein untuk keperluan transportasi. Jika
seseorang mengambil lebih dari satu obat, maka berbagai obat tersebut
dapat bersaing satu sama lain untuk situs pada protein serum. Albumin
serum manusia (HSA) adalah salah satu protein yang sering terlibat dalam
transportasi obat.
Bagian-bagian lain dari molekul obat yang bukan bagian dari pharmacophore adalah
merupakan bagasi molekuler. Peran bagasi molekuler ini adalah untuk memegang gugus
fungsional dari pharmacophore dalam susunan geometris tetap (dengan fleksibilitas
konformasi minimal) untuk memungkinkan interaksi reseptor khusus, sedangkan masalah
yang terkait dengan fase farmakokinetik adalah meminimalkan interaksi dengan toksisitas
mediasi reseptor dan metabolisme (melalui hati) dan ekskresi cepat (melalui ginjal)
.
Dua fragmen lain dari molekul obat yang
jarang dibahas adalah toxicophore dan
metabophore . Secara konseptual, kedua jenis
fragmen tersebut analog dengan
pharmacophore. (Secara kolektif,
pharmacophores, toxicophores, dan
metabophores dapat disebut sebagai
biophores.)
Toxicophore adalah susunan tiga dimensi dari atom dalam
molekul obat yang bertanggung jawab untuk interaksi yang
memunculkan toksisitas. Jika molekul obat memiliki beberapa
toksisitas yang timbul dari interaksi yang tidak diinginkan ,
maka mungkin mereka memiliki lebih dari satu toxicophore.
Dari perspektif desain obat, jika sebuah toxicophore tidak
tumpang tindih dengan pharmacophore dalam molekul obat
yang diberikan, maka dimungkinkan untuk merancang ulang
molekul untuk menghilangkan racun. Namun, jika
pharmacophore dan toxicophore adalah fragmen molekul
kongruen, maka racun tidak terlepas dari sifat farmakologis
yang diinginkan.
Metabophore adalah susunan tiga dimensi atom dalam
molekul obat yang bertanggung jawab untuk
metabolisme. Gugus fungsional bertanggung jawab
tidak hanya untuk interaksi obat-reseptor tetapi juga
untuk sifat metabolik, maka metabophore dan
pharmacophore cenderung akan terkait tumpang
tindih. Namun demikian, dari sudut pandang desain
obat, kadang-kadang mungkin untuk memanipulasi
struktur baik pharmacophore maupun bagian-bagian
bagasi molekul obat untuk mencapai metabophore
yang mengatasi masalah dengan efek saluran pertama
hati atau mempercepat atau penundaan ekskresi ginjal
(lihat gambar 1.4).
Structural Fragments of Drug Molecules:
Interchangeable Bioisosteres
Sebuah molekul obat dapat dikonseptualisasikan sebagai kumpulan
fragmen molekul atau bangunan blok. Fragmen yang paling penting adalah
pharmacophore, dengan gugus fungsional pharmacophore yang
ditampilkan pada kerangka molekul terdiri dari unit struktur metabolik
inert dan konformasi terbatas. Struktur ini merupakan rantai alkil, cincin
aromatik, atau bagian dari tulang punggung rantai peptida. Ketika
merancang atau membangun sebuah molekul obat, yang dengan demikian
dapat mengejar fragmen- demi fragment pendekatan membangun blok.
Dalam pendekatan konseptualisasi ini, orang melihat bahwa beberapa
fragmen molekul, meskipun secara struktural berbeda satu sama lain,
namun dapat berperilaku identik dalam lingkungan biologis dari
lingkungan mikro reseptor.
Struktural berbeda namun biofunctionally fragmen molekul setara
disebut sebagai bioisosteres. (Sebuah obat bioisosteric adalah molekul
obat yang muncul dari penggantian baik atom
atau gugus atom dengan atom biologis setara atau kelompok atom untuk
membuat molekul yang baru dengan sifat farmakologis yang sama dengan
molekul induk.)
Interchangeable Bioisosteres
Ada banyak contoh substitusi bioisosteric. Misalnya, obat yang
mengandung gugus fungsional sulfonat (SO3-) Dalam pharmacophore yang
dapat berinteraksi dengan reseptor melalui interaksi elektrostatik, dimana
gugus sulfonat bermuatan negatif berinteraksi dengan amonium
bermuatan positif dalam reseptor. Dalam merancang analog dari obat ini,
akan ada kemungkinan untuk mengganti sulfonat dengan bioisosterically
setara kelompok karboksilat. Kelompok karboksilat akan dapat
berinteraksi elektrostatis dengan kelompok amonium fungsional dalam
mode analog dengan bagian sulfonat. Substitusi bioisosteric ini akan
membawa keuntungan tambahan seperti memperpanjang waktu paruh
molekul obat sejak karboksilat yang kurang polar ditukar dengan sulfonat
dan dengan demikian kurang rentan terhadap ekskresi cepat ginjal . Ada
banyak contoh lain substitusi bioisosteric. Misalnya, H-mungkin akan
digantikan oleh F-, sebuah karbonil kelompok (C = O) dapat digantikan
oleh sekelompok tiokarbonil (C = S); sebuah sulfonat mungkin akan
digantikan dengan sebuah fosfonat.
Interchangeable Bioisosteres
Substitusi Bioisosteric dapat dikategorikan sebagai klasik atau non-klasik.
Bioisosteres klasik adalah gugus fungsional yang memiliki konfigurasi
elektron valensi yang sama. Sebagai contoh, oksigen dan sulfur baik
dalam golongan VI dari tabel periodik, dengan demikian, sebuah tio-eter
(-C-S-C-) adalah gugus fungsional substitusi bioisosteric klasik untuk eter (-
C-O-C-) .
Bioisosteres Non-klasik adalah gugus fungsional dengan konfigurasi
elektron valensi berbeda, misalnya, sebuah bagian tetrazole dapat
digunakan untuk mengganti karboksilat karena sistem biologi banyak tidak
dapat membedakan antara dua gugus fungsional struktural yang sangat
khas (lihat gambar 1.5). Sebuah pertimbangan bioisosteris penting dalam
desain obat. Sebuah eksplorasi sistematis dari bioisosteres ketika
membangun molekul obat sebagai koleksi fragmen molekul
memungkinkan pertimbangan ketat struktural pharmacophores
bervariasi dan sifat mereka selama fase farmasetika, farmakokinetik, dan
farmakodinamik kerja obat.
Structural Properties of Drug Molecules
1. fisikokimia
2. Bentuk (geometris, sterik, konformasi, topologi) properti
3. stereokimia
4. elektronik
Sifat fisikokimia sangat penting bagi kerja obat pada fase farmasetika dan
farmakokinetik; tiga sifat lainnya merupakan dasar bagi farmakodinamik
interaksi obat dengan reseptor.
Sifat fisikokimia mencerminkan karakteristik kelarutan dan penyerapan
obat dan kemampuannya untuk menyeberangi hambatan, seperti
penghalang darah-otak, dalam perjalanan menuju reseptor.
Geometris, sterik, dan topologi dan sifat stereokimia menggambarkan
susunan struktural dari atom dalam molekul obat
dan pendekatan pengaruh geometri sebagai molekul obat memasuki
dunia reseptor.
Sifat elektronik mencerminkan distribusi elektron dalam molekul obat dan
menentukan sifat interaksi antara obat dan reseptor. Dari perspektif
desainer obat, sifat elektronik adalah yang paling sulit untuk diprediksi .
Dengan demikian, penguasaan mekanika kuantum adalah merupakan
kekuatan dalam kimia medisinal.
Figure 1.5 Bioisosteres. These are biologically equivalent molecular fragments
that can be used to