Medical Microbiology and Infection at a

Glance
Stephen H.
Kathleen B. Bamford
Pestariati
1.Konsep mikroorganisme
2. Jenis mikroorganisme
3. Siklus hidup organisme
4. Cara berkembang biak mikroorganisme
5. Cara penularan
 Jenis mikroorganisme
• Bakteri
• Virus
• Jamur
• Protozoa
• Helminths
Sources and transmission of infection
Pathogenicity and pathogenesis of
infectious disease
Structure and classification of bacteria
Innate immunity and normal flora
Infection in the hospital environment
 Konsep mikroorganisme
BACTERIA
1 Bacterial structure
2 Oxygen requirements
3 Bacterial classification and identification
4 Toxins
5 Gram-positive bacteria identification flowchart
6 Gram-positive bacteria
7 Gram-negative bacteria identification flowchart
8 Gram-negative bacteria
9 Poor/non-Gram-staining bacteria identification flowchart
10 Poor/non-Gram-staining bacteria
Siklus hidup organisme
 Kapsul

• Lapisan terluar dari bakteri.

• Memberikan perlindungan dengan mencegah
fagositosis.
• Tidak ditemukan pada semua bakteri.
 DINDING SEL

 Bagian luar yang kuat, memelihara bentuk

bakteri dan melindungi terhadap tekanan
osmotik.
 Variasi dinding sel, ada struktur Gram-positif
dan Gram-negatif (dengan metode pewarnaan
untuk mengklasifikasikan dan mengidentifikasi
bakteri):
Gram positif
• lapisan peptidoglikan tebal (ikatan silang
berulang sub unit gula dengan rantai peptida)
di dalam dinding sel.
• Gram negatif
• Lapisan peptidoglikan tipis dan tambahan
outer membran yang mengandung
lipopolisakarida (juga disebut endotoksin)
Dinding gram positif dan membran
sitoplasma
Dinding gram negatif dan membran
sitoplasma
 membran sitoplasma
• Fosfolipid lapis rangkap dengan protein
• Mengelilingi sitoplasma.
• Sebuah membran semipermeabel yang
mengatur pergerakan zat dalam
dan luar bakteri.
 Flagela

Filamen yang memungkinkan gerakan Spiral

berbentuk.
• Dibentuk oleh beberapa subunit dari flagellin
(protein).
 Fimbriae / PILI

• Lebih pendek dari flagela.

• Berasal dari membran sitoplasma.
• Dibentuk oleh banyak subunit dari pilin
(protein).
• untuk melekat bakteri pada permukaan sel
dan pertukaran plasmid (mengandung materi
genetik) dengan bakteri lainnya.
 ASAM DEOKSIRIBONUKLEAT
(DNA).
• Untai melingkar tunggal, untai ganda DNA
• Tidak ada membran nuklir
• bebas dalam sitoplasma.
• Ribosom :
tempat sintesis protein dalam sitoplasma.
• plasmid
= Dua untai molekul DNA sirkular yang ditemukan
di beberapa bakteri.
= Gen dalam plasmid dapat menguntungkan
bakteri seperti resistensi antibiotik/ eksotoksin.
= Bisa ditransfer antara bakteri.
 OXYGEN REQUIREMENTS
Bakteri memiliki berbagai kebutuhan oksigen.
• Aerob
= obligat aerob: memerlukan oksigen untuk tumbuh
(misalnya Mycobacterium tuberculosis).
= Mikroaerofilik: pertumbuhan optimal dalam konsentrasi
oksigen rendah (misalnya Campylobacter spp. 5% O2).
• Anaerob
= obligat anaerob: untuk tumbuh bebas oksigen (misalnya
Clostridium spp.).
= Anaerob fakultatif: dapat tumbuh dalam kondisi aerobik/
anaerobik (misalnya Bacillus spp.).
 BACTERIAL SHAPES
• Cocci (spheres).
• Bacilli (rods).
• Vibrio (curved rod).
• Spirochaete (spiral rod).
 Patogenisitas bakteri
•
Patogenisitas berarti kemampuan untuk memulai
penyakit. Ini akan membutuhkan sifat-sifat
transmisibilitas antara host, hidup dalam host baru,
infektivitas dan virulensi.
Patogenisitas dan status kekebalan dari tuan rumah
bersama-sama menentukan hasil dari penyakit.
 Jenis bakteri patogen
• Bakteri 'utama', mampu menyebabkan
penyakit pada individu imunokompeten,
• 'oportunistik', menyebabkan penyakit
terutama dalam immuno-dikompromikan
 transmisi
• Banyak patogen oportunistik (bagian flora
normal manusia.
• Patogen primer ditularkan antara host melalui
rute, termasuk pernapasan, pencernaan,
saluran kemih atau genital. Beberapa
diinokulasi ke dalam jaringan tubuh melalui
gigitan serangga atau trauma kecelakaan atau
bedah.
 kolonisasi
• Ialah Pembentukan populasi stabil bakteri
dalam host
• Kolonisasi diprakarsai oleh bakteri 'adhesins'
yang membantu tempelkan organisme untuk
menjadi tuan rumah reseptor sel.
 Invasi
Invasi adalah penetrasi sel inang dan jaringan,
dan dimediasi oleh i 'invasins'. bisa dalam
bentuk:
• permukaan bakteri
• disekresikan protein yang menargetkan
molekul sel inang (reseptor).
 virulensi

• Virulensi adalah kemampuan untuk

menyebabkan kerusakan pada sel inang dan
jaringan.
• Bakteri patogen menghasilkan sejumlah besar-
virulensi terkait molekul (faktor virulensi)
seperti racun.
 toksin
• Bakteri patogen menghasilkan molekul protein beracun, bernama
racun, yang merusak sel inang langsung atau tidak langsung.
• Dua jenis utama dari racun : endotoksin dan eksotoksin.
• Sebelumnya (juga disebut LPS, lipopolisakarida) adalah
komponen dari membran luar bakteri Gr-negatif dan juga
dilepaskan dari permukaan bakteri melalui blebs atau mengikuti
lisis bakteri.
• Eksotoksin adalah protein diffusible disekresi ke dalam media
eksternal oleh patogen. Ini memfasilitasi adhesi, invasi atau host
kerusakan sel. Banyak bakteri juga mengeluarkan aggressins
ekstraseluler lainnya termasuk enzim seperti urease dan
Metallo protease.
TOXINS
Staphylococcus
 Streptococcus pneumoniae,
other Gram-positive cocci and
the alpha-haemolytic streptococci
Diphtheria, tetanus and pertussis
Clostridium
Neisseria and Moraxella
Enterobacteriaceae clinical syndromes
Vibrio, Campylobacterand Helicobacter
 2. VIRUSES

VIRUSES
2.1 Viral structure
2.2 Viral infection and replication
2.3 Diagnosis of viral infections
2.4 Virus identification flowchart
2.5 DNA viruses
2.6 RNA viruses
 PATOGENESIS VIRUS
Infeksi cyctolitic akut
infeksi virus menyebabkan kematian sel yang terinfeksi karena
penghambatan virus yang disebabkan: sintesis protein sel inang
gangguan arsitektur sel.
• Hasil kematian sel dalam peluncuran partikel virus baru, yang
dapat menginfeksi sel-sel berdekatan, dapat dibunuh Sistem
kekebalan tubuh inang
• Hasil akhir untuk pasien akan bervariasi
- mulai tidak ada penyakit melalui kegagalan organ dan kematian,
- luasnya kematian sel secara viral-diinduksi dan host respon
inflamasi terhadap infeksi. tergantung pada organ dan jaringan
yang terinfeksi,
infeksi kronis
• virus bereplikasi dalam sel tanpa membunuh
• Produksi virus terus dalam sel normal. Pasien menjadi
pembawa virus kronis.
• Penyakit timbul :
- melalui kemenangan sel yang terinfeksi oleh sistem
kekebalan tubuh inang, mengakibatkan peradangan
kronis,
- melalui gangguan virus-diinduksi dengan fungsi khusus
dari sel.
• infeksi laten
- virus ada dalam sel, tetapi tidak replikasi genom
virus, sangat sedikit/ tidak ada produksi protein
virus.
- Infeksi laten tidak merusak sel, tapi virus dapat
diaktifkan dari latensi, mulai bereplikasi,menyebabkan
penyakit. Setelah terinfeksi virus laten, tuan rumah
dapat membawa virus seumur hidupnya.
(Semua virus herpes menunjukkan latency.)
• Transformasi-
- Infeksi virus dari sel mengakibatkan proliferasi
yang tidak terkendali dari sel, proses disebut
transformasi.
- Ada banyak virus mengubah, infeksi virus
menjadi penyebab utama penyakit ganas pada
manusia.
Replikasi virus
Viruses as a cause of human cancer
Virus structure, classification and
antiviral therapy
Herpesviruses I
Herpesviruses II
Measles, mumps and rubella
Hepatitis viruses
HIV infection and AIDS
 3. FUNGI
FUNGI
3.1 Fungi classification
3.2 Diagnosis of fungal infections
3.3 Yeasts
3.4 Filamentous fungi
3.5 Atypical fungi
Yeast infections
Filamentous fungi
 4.PROTOZOA
PROTOZOA
4.1 Protozoal classification
4.2 Amoeba
4.3 Coccidia (sporozoa)
4.4 Flagellates
Intestinal protozoa
Malaria, Leishmaniasis and trypanosomiasis
 5. Helminths

5. Helminths
5.1 Helminth classification
5.2 Trematodes (flukes)
5.3 Nematodes (roundworms)
5.4 Cestodes (tapeworms)
Gut helminths
Tissue helminths
Congenital and perinatal infections
Pyrexia of unknown origin and septicaemia
 Fungi/ jamur
organisme eukariotik
 YEASTS

Candida spp (juga mampu menghasilkan

pseudohyphae, sering disebut sebagai ragi ).
Cryptococcus spp.
- Struktur: bulat tunggal atau sel oval.
- Reproduksi: aseksual melalui budding untuk
menghasilkan blastospores
- konidia
 FILAMENTOUS FUNGI (MOULDS)

Key examples:
• Aspergillus spp .; dermatofit (juga cincin istilah kolektif cacing jamur
untuk berbagai jamur yang menyebabkan infeksi kulit superfisial).
• Struktur: tumbuh dengan memproduksi hifa, sel filamen panjang
yang membentuk struktur jaringan disebut miselium.
• Reproduksi: aseksual melalui tunas untuk menghasilkan spora
(konidia).
ATYPICAL FUNGI
• Key examples:
• Pneumocystis spp.;
• Histoplasma spp.
 YEASTS (CANDIDA SPP)
Candida albicans

• Lokasi: flora normal orofaring, vagina dan

saluran pencernaan.
• transmisi: infeksi terjadi ketika bakteri flora
normal terganggu (misalnya penggunaan
antibiotik, imunosupresi dan kehamilan) atau
ketika kekebalan diubah.
 Diseases

kulit: kandidiasis kulit, paronychia Candida dan ruam popok.

Oral: kandidiasis oral (umumnya terkait dengan kortikosteroid
inhalasi).
Alat kelamin: vulvitis kandida dan kandidiasis vagina (kandidiasis)
Saluran kemih: infeksi saluran kemih (berkolonisasi kateter)
Gastrointestinal: esofagitis candida (terutama pada pasien
immunocompromised).
Prostesis: infeksi saluran intravena.
Sistemik: penyebaran organ multiple, terutama di negara-negara
immunocompromised.
 Diagnosis:
• koloni krim, Gram positif, pipa germ di 378C
(hifa yang timbul dari putaran sel ragi) dan
PCR diagnosis.
 Anti-mikroba:
= Skin: - Cutaneous kandidiasis: clotrimazole (topikal).
= Oral: - Kandidiasis Oral: nistatin (mouth wash)/
amfoterisin (lozenges) / fluconazole (tablet).
= Alat kelamin:
- Candida vulvitis: clotrimazole (topikal).
- Kandidiasis vagina: clotrimazole (alat pencegah
kehamilan atau krim) atau fluconazole atau itraconazole.
= Kandidiasis invasif: flukonazol atau vorikonazol /
capsofungin (tahan flukonazol).
Endocarditis, myocarditis and pericarditis
Infections of the central nervous system
Respiratory tract infections
Urinary and genital infections
Infections of the bones and joints
Bacterial diarrhoeal disease
Zoonoses
Infections in immunocompromised patients
Ocular infections
Infections of the skin and soft tissue