Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.

com
Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

BIOENERGI
 Jurusan
Hasil belajar Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

Mahasiswa mampu Pokok bahasan Sub-Pokoknya bahasan

 Menjelaskan kerangka 1. Bioenergi
umum metabolisme dan
senyawa berenergi
tinggi
 Menggunakan konsep
redoks pada reaksi-
reaksi metabolisme
1.1 Jalur-jalur metabolisme
1.2 Senyawa sumber energi pada
sel biologis
1.3Reaksi-reaksi jalur
metabolisme
1.4Bentuk-bentuk energi dan
reaksinya
 Jurusan
Metabolisme Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

• Jumlah perubahan kimia yang mengubah nutrisi

menjadienergidan produk sel yang secara
kimiawi kompleks
• Ratusan reaksi enzim disusun menjadi
diskritjalur
• Substrat diubah menjadi produk melaluibanyak
perantara tertentu
• Peta metabolisme menggambarkanreaksinya
Biokimia, Garrett & Grisham, Brooks/Cole,keterlibatanSedang belajar
 Jurusan
…Metabolisme Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

• Metabolisme terdiri
darikatabolismeDananabolisme
• Katabolisme:bersifat degradasijalur, biasanya
menghasilkan energi!
• Anabolisme:jalur biosintetik, membutuhkan
energi!
Dua Jenis Reaksi Kimia Dasar yang Jurusan
Kimia
ditemukan dalam Sistem Biologi Dr. rer. nat. Syafrizayanti

Lehninger, Prinsip Biokimia, LW. H. Freeman dan Perusahaan

 Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
Jalur metabolisme
• Ini adalah peta kompleks lalu lintas
molekul dalam sel
• Kuncinya bukan menghafal jalurnya, tapi
harus memikirkannya secara logis
• Memahami struktur molekul penyusunnya
yang lebih sederhana
• Memahami logika di balik mengapa suatu
reaksi harus terjadi dalam konteks siklus
biokimia
• Memiliki pemahaman dasar tentang kimia
organik sangat berharga
• Mulailah dengan gambaran besarnya, lalu
masuk ke detailnya
 Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

Sekilas tentang
metabolisme

Mathews, Biokimia, Addison-

Wesley Publication, Co,
 Jurusan
Seperangkat Jalur yang Umum Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

• Organisme menunjukkan kesamaan yang mencolok

dalam jalur metabolisme utamanya
• Bukti bahwa semua kehidupan berasal dari satu
bentuk nenek moyang yang sama
• Ada juga keragaman yang signifikan

• Autotrofmenggunakan CO2;Heterotrofmenggunakan
karbon organik;Fototrofgunakan
cahaya;KemotrofmenggunakanGlc, anorganik & S
 Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
 Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
 Jurusan
Fungsi metabolisme organel sel Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
 Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

Dasar-dasar Biokimia.Suara&Suara, John Wiley & Putra,Inc

 Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
 Jurusan
Oksidoreduktase Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

• Oksidoreduktasemengkatalisisreaksi oksidasi atau reduksi, dimana elektron

berpindah dari satu molekul (reduktor) ke molekul lain (oksidan).
• Proses ini seringkali memerlukan faktor pendamping seperti NAD(P)H.

fastbleep.com/biology-notes/40/116/1159
 Jurusan
TRANSFERASE Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

Transferaseadalah enzim itumengkatalisisperpindahan gugus fungsi dari satu molekul

ke molekul lainnya. Gugus fungsi yang sangat beragam ini dapat meliputi fosfat, metil
danglikosilkelompok.

Reaksi dasarnya dapat ditunjukkan sebagai:

Kapak + BA+BX
Dimana A= donor, B= akseptor dan X= gugus fungsi.

Kinase
Enzim kinase terlibat dalamkatalistransfer gugus fosfat
dalam proses yang disebut fosforilasi
Deaminase
deaminase, yangmengkatalisistransfer gugus amina.
fastbleep.com/biology-notes/40/116/1159
 Jurusan
HIDROLASE Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
Enzim hidrolase secara sederhanamengkatalisishidrolisis;
pemutusan ikatan tunggal melalui penambahan air.

Ada berbagai macam enzim hidrolase. Misalnya enzim pencernaan

yang diklasifikasikan berdasarkan targetnya:

• protease/peptidase memecah ikatan peptida antara asam amino

untuk memecah protein
• lipase memecah lipid menjadi asam lemak dan gliserol dengan
memutus ikatan ester
• nukleasi membelahfosfodiesterikatan antar subunit nukleotida dalam
asam nukleat

Mereka disebuteksoatauendotergantung di mana mereka

memotongnya. Enzim endo dipotong pada bagian tengah rantai,
sedangkaneksoenzim dipotong di ujung rantai untuk melepaskan
fastbleep.com/biology-notes/40/116/1159
monomer individu.

LYAS
Lyase mengkatalisisreaksi lisis yang
menghasilkan ikatan rangkap.
Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
• Ini adalah jenis reaksi eliminasi tetapi
tidak bersifat hidrolitik atau oksidatif.
• Reaksi sebaliknyamengkatalisisreaksi
adisi, dimana substrat ditambahkan ke
ikatan rangkap.
• Ini sering disebut sebagai enzim
sintase.
Sebuah contohliasereaksinya adalah:
ATP<-->kamp+PPi
Umumnya satu substrat diperlukan dalam
arah maju, sedangkan dua substrat
diperlukan untuk reaksi mundur.
fastbleep.com/biology-notes/40/116/1159
 Jurusan
Isomerase Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

• Isomerase adalah enzim yang

bisamengkatalisisperubahan struktural
dalam suatu molekul.
• Hanya ada satu substrat dan satu
produk yang tidak ada untung atau
ruginya, sehingga hanya mewakili
perubahan bentuk.

fastbleep.com/biology-notes/40/116/1159
 Jurusan
Ligase Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

• Ligase bertanggung jawab atas katalisis ligasi;

penggabungan dua substrat.
• Biasanya diperlukan energi potensial kimia, sehingga
reaksinya dibarengi dengan hidrolisis adifosfatikatan
dalam nukleotida trifosfat seperti ATP.
 Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
Termodinamika menentukan arah jalur Jurusan
Kimia
metabolisme Dr. rer. nat. Syafrizayanti

ΔG = perubahan energi bebas,

ΔG°' = perubahan energi bebas standar (dengan
reaktan dan produk 1 M, pada pH 7),
R = konstanta gas, T = suhu mutlak.

• Perubahan energi bebas (ΔG) suatu reaksi menentukan spontanitasnya.

• Suatu reaksi dikatakan spontan jika ΔG negatif
• Jika energi bebas produk lebih kecil dari energi bebas reaktan.
• Catatanbahwa perubahan energi bebas standar (ΔG Hai') suatu reaksi
mungkin positif, tetapi perubahan energi bebas sebenarnya (ΔG) negatif,
bergantung pada konsentrasi sel reaktan dan produk.
 Jurusan
Banyak reaksi yang menyebabkannyaΔG°' Kimia
positifadalahspontankarena reaksi lainmenyebabkan Dr. rer. nat. Syafrizayanti

penipisan produk atau pemeliharaan konsentrasi

substrat yang tinggi.

Pada kesetimbangan, ΔG sama dengan

nol. Menyelesaikan ΔG°' menghasilkan
hubungan di sebelah kiri.

Keq, rasio [C][D]/[A][B] pada

kesetimbangan disebut konstanta
kesetimbangan.

Konstanta kesetimbangan yang lebih besar

dari satu (lebih banyak produk daripada
reaktan pada kesetimbangan)
menunjukkan

reaksi spontan (ΔG°' negatif).

 Jurusan
Senyawa Energi Tinggi Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

• ATP
• Fosfokreatin
• Fosfopiruvatasam,
• Koenzim A (disingkat CoA-SH)
• suksinilkoenzim A
ATP Menyediakan Energi melalui Transfer Jurusan
Kelompok, Kimia
Bukan dengan Hidrolisis Sederhana Dr. rer. nat. Syafrizayanti

Adenosin trifosfat

• Fosfoanhidridaikatan cenderung memiliki ΔG negatif yang besar dari ikatan

"energi tinggi" hidrolisis, -30,5 kJ/mol, Tetapirelatif stabil pada pH 7.
• Pembelahan yang cepatfosfoanhidridaikatan yang dikatalisis oleh
suatu enzim
• Energi ikatannya belum tentu tinggi, hanya energi bebas hidrolisis saja.
• Senyawa dengan ikatan “energi tinggi” dikatakan memilikipotensi transfer
kelompok yang tinggi
 Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
 Jurusan
Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
NAD+ (nikotinamidaAdenine Dinucleotide) berfungsi Jurusan
Kimia
sebagai akseptor elektron pada jalur katabolik Dr. rer. nat. Syafrizayanti
MODE(Flavin AmendefinisikanDinnukleotida) berfungsi Jurusan
Kimia
sebagai akseptor elektron.
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
 Jurusan
Thioesteradalah hubungan "energi tinggi". Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

Asetil koenzim A atau asetil-KoA

Itutiolkoenzim A dapat bereaksi

dengan gugus karboksil asam asetat
(menghasilkan asetil-KoA)
atau
asam lemak (menghasilkan asil
lemak-KoA)
 Jurusan
Pendekatan Eksperimental untuk Studi Metabolisme Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
Jalur metabolisme dapat dipahami pada beberapa tingkatan:
1. Dalam halurutan reaksidimana nutrisi tertentu diubah menjadi
produk akhir, dan energi konversinya.

2. Dari segimekanismenyadimana setiap perantara diubah menjadi

penerusnya. Analisis semacam itu memerlukan isolasi dan
karakterisasi enzim spesifik yang mengkatalisis setiap reaksi.

3. Dari segimekanisme kontrolyang mengatur aliran metabolit

melalui jalur tersebut. Mekanisme ini mencakup hubungan antar
organ yang menyesuaikan aktivitas metabolisme dengan
kebutuhan seluruh organisme.

Dr.rer. nat. Syafrizayanti

 Jurusan
Tugas Kelompok Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti

Metode:
Discovery Learning dan diskusi kelompok kecil
Topik Tugas1: :
 Membuat peta sederhana(ringkasan)jalur metabolisme
secara umum pada karton dan menjawab pertanyaan
tugasyangdiberikan secara berkelompok
 Daftar Periksa QA / Kuis

Sumber:
Periksa daftar referensi

Dr.rer. nat. Syafrizayanti

Bagaimana mempersiapkan tugas Jurusan
Kimia
Anda? Dr. rer. nat. Syafrizayanti

• Gambarlah gambaran
metabolisme dalam kertas
manila
• Tanyakan rekan Anda tentang
pengurangan, produk,
danbentuk energidari
 Jurusan
Tugas1:Ringkasan jalur metabolisme
Kimia
Akses peta metabolisme Dr. rer. nat. Syafrizayanti
Contoh:Capaian Hasil Tugas1
http://www.metabolic-pathway.com/fullMap.html
atau
http://www.metpath.teithe.gr

1. Buat skema garis besar(ringkasan)jalur

metabolisme pada kertas setiap
kelompok(digambar dengan tangan)
2. Tuliskan perubahan biomolekulnyamana
yangtermasuk anabolisme dan katabolisme
3. Serta,jelaskan perubahan anabolisme dan
katabolisme tersebut berdasarkan perubahan
Strukturnya
4. identitassenyawa2energi tinggiyangterlibat pada
jalur metabolisme
5. Apa perbedaan masing-masing seiyawa Masukan:
berenergi tinggi tersebut? QA/ Kuisdari materi Tugas1
 Jurusan
Pertanyaan Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti
 Jurusan
Pertanyaan Kimia
Dr. rer. nat. Syafrizayanti