PRINSIP DAN MEKANISME MIKROORGANISME PEMROSES

PRODUKSI BERBAGAI METABOLIT SEKUNDER (ANTIBIOTIK)

MAKALAH

Untuk Memenuhi Tugas Mata Kuliah Mikrobiologi Industri

yang Dibimbing oleh Dr. Endang Suarsini, M.Ked

Oleh:
Kelompok 4
1. Arrum Larasati R. (150342605291)
2. Clara Kartika A.P. (150342606501)
3. Dinda Aprilia (150342602371)
4. I Kade Karisma (150342601699)
5. Marelda Ariyadhiny (150342602118)
Offering GHI-K 2015

The Learning University

UNIVERSITAS NEGERI MALANG

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
JURUSAN BIOLOGI
Februari 2018
 KATA PENGANTAR

Puji syukur kami panjatkan kehadirat Allah SWT, yang senantiasa

memberikan rahmat, taufiq, serta hidayah-Nya, sehingga kami dapat menyelesaikan
makalah Mikrobiologi Industri yang berjudul “Prinsip dan Mekanisme
Mikroorganisme Pemroses Produksi Berbagai Metabolit Sekunder (Antibiotik)”
dengan tepat waktu, guna melengkapi tugas akhir mata kuliah Mikrobiologi
Industri.
Dalam pembuatan makalah ini, tentunya kami mendapat bantuan dari
berbagai pihak baik secara langsung maupun tidak langsung. Oleh karena itu,
dengan segala kerendahan hati, kami ucapkan terima kasih kepada :
1. Allah SWT yang telah memberikan rahmat dan hidayahnya dalam pembuatan
makalah ini.
2. Dosen pembimbing yang senantiasa memberikan tambahan ilmu dan dukungan
sehingga pembuatan makalah ini dapat berjalan dengan lancar.
3. Orang tua kami yang senantiasa memberikan dukungan dan doa.
4. Teman-teman sekalian yang telah menemani dalam suka dan duka selama
pembuatan makalah ini.
Semoga dengan adanya makalah ini dapat memberikan manfaat bagi
pembaca untuk menambah wawasan dan pengetahuan.

Malang, 5 Februari 2018

Penulis
 BAB I
PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Metabolit diklasifikasikan menjadi dua, yaitu metabolit primer dan metabolit
sekunder. Metabolit primer yang dibentuk dalam jumlah terbatas adalah penting
untuk pertumbuhan dan kehidupan mahluk hidup. Metabolit sekunder tidak
digunakan untuk pertumbuhan dan dibentuk dari metabolit primer pada kondisi
stress. Contoh metabolit sekunder adalah antibiotik, pigmen, toksin, efektor
kompetisi ekologi dan simbiosis, feromon, inhibitor enzim, agen immunomodulasi,
reseptor antagonis dan agonis, pestisida, agen antitumor, dan promotor
pertumbuhan binatang dan tumbuhan (Nofiani, 2008).
Seleksi dan produksi senyawa antibiotik baru penghambat/pembunuh mikrobia
eukariot patogen. Selain sulitnya menemukan antibiotik baru juga sulit
memproduksinya (Kauffman dan Carver, 1997). Beberapa medium dan kondisi
optimal yang cocok perlu dicoba untuk penghasilan antibiotik. Beberapa faktor
substrat (prekusor) berpengaruh terhadap mekanisme biosintesis antibiotik yang
bersangkutan, misalnya sumber carbon (C), nitrogen (N) dan beberapa vitamin
(Franklin & Snow, 1989).
Penggunaan antibiotik dunia lebih dari 40.000 ton/ tahun dalam industri pangan,
pakan, pertanian, kesehatan, biokimia, genetika, dan biologi molekuler serta ada
kecenderungan meningkat. Ragam antibiotik cukup banyak namun sifat intrisiknya
dapat menimbulkan resistensi terhadap mikrobia target sehingga senyawa ini tidak
lagi dapat diaplikasikan (Neu, 1992). Oleh karena itu, langkah-langkah
mendapatkan jenis antibiotik baru masih sangat diperlukan baik lewat sintesis
kimia, biokimia baru atau penemuan isolat mikrobia baru (Tscherter & Dreyfus,
1992). Jasad endofit merupakan salah satu sumber utama mikrobia penghasil
antibiotik baru, salah satunya adalah jenis jamur (Kauffman dan Carver, 1997).
Brunner dan Petrini (1992) melakukan skrining terhadap lebih dari 80 spora jamur,
didapatkan bahwa 79% jamur yang mampu menghasilkan antibiotik adalah
kelompok endofit. Selain itu, Tscherter dan Dreyfuss (1992) meneliti beberapa
jamur endofit dan mendapatkan Cryptosporiosis spp. mampu menghasilkan
metabolit sekunder dengan spektrum patogenisitas lebar, dan beberapa peneliti lain
memulai memanfaatkan mikrobia endofit sebagai sumber antibiotik baru (Carrol,
1988).
Antibiotik sebenarnya merupakan suatu zat kimia hasil dari mikroorganisme
yang dapat menghambat pertumbuhan atau mematikan mikroorganisme lainnya.
Pembuatan antibiotik ini harus dalam lingkungan steril agar terhindar dari
kontaminasi yang mungkin terjadi, sehingga pertumbuhan mikroorganisme yang
diinginkan dapat optimal dan menghasilkan produk yang optimal juga. Antibiotik
ini pertama kali ditemukan oleh Alexander Fleming yang diberi nama Penisilin
yang dihasilkan oleh Penicillium. Jamur ini hidup dengan menyerap makanan dari
lingkungan yang digunakan untuk metabolisme, bahkan dapat menghasilkan zat
yang disekresikan ke lingkungannya dan dapat membunuh mikroorganisme lain
(Janitra, 2015).
Berdasarkan latar belakang diatas maka disusunlah makalah ini dengan
judul “Prinsip dan Mekanisme Mikroorganisme Pemroses Produksi Berbagai
Metabolit Sekunder (Antibiotik)”.

1.2 Rumusan Masalah

Rumusan masalah dalam makalah ini dijabarkan sebagai berikut.
1. Bagaimana prinsip dan mekanisme pemrosesan produksi bakteri dan jamur
sebagai metabolit sekunder (antibiotik)?
2. Bagaimana pengaruh berbagai faktor pertumbuhan bakteri dan jamur dalam
mikrobiologi industri?
3. Bagaimana proses produksi antibiotik bakteri dan jamur dalam mikrobiologi
industri?

1.3 Tujuan
Tujuan dalam makalah ini dijabarkan sebagai berikut.
1. Untuk mengetahui prinsip dan mekanisme pemrosesan produksi bakteri dan
jamur sebagai metabolit sekunder (antibiotik)
2. Untuk mengetahui pengaruh berbagai faktor pertumbuhan bakteri dan jamur
dalam mikrobiologi industri
3. Untuk mengetahui proses produksi antibiotik bakteri dan jamur dalam
mikrobiologi industri
 BAB II
PEMBAHSAN

2.1 Bakteri
2.1.3 Proses Produksi Antibiotik Dalam Mikrobiologi Industri
a. Aktinomisin
1) Biosintesis Aktinomisin pada Streptomyces antibioticus

Gambar 01. Biosintesis Aktinomisin pada Streptomyces antibioticus (Adzitey,

2015)
Daktinomisin, juga dikenal sebagai actinomycin D, adalah obat
kemoterapi yang digunakan untuk mengobati sejumlah jenis kanker.
Ini termasuk tumor Wilms, rhabdomyosarcoma, sarkoma Ewing,
neoplasma trofoblastik, kanker testis, dan beberapa jenis kanker
ovarium. Hal ini diberikan dengan suntikan ke pembuluh darah
(Turan, 2006). Menurut Turan (2006), kebanyakan orang mengalami
efek samping. Efek samping yang umum termasuk penekanan
sumsum tulang, muntah, bisul mulut, rambut rontok, masalah hati,
infeksi, dan nyeri otot. Efek samping serius lainnya termasuk kanker
di masa depan, reaksi alergi, dan kematian jaringan di tempat
suntikan. Penggunaan pada kehamilan dapat membahayakan bayi.
Daktinomisin ada dalam keluarga obat antibiotik sitotoksik. Hal ini
 diyakini bekerja dengan menghalangi penciptaan RNA (Sobell, 1985).
Dalam biologi sel, actinomycin D terbukti memiliki kemampuan
untuk menghambat transkripsi. Actinomycin D melakukan ini dengan
mengikat DNA pada kompleks inisiasi transkripsi dan mencegah
perpanjangan rantai RNA oleh RNA polimerase (Sobell, 1985).
2) Metode Produksi
Medium V6 (5 ml.) Ditambahkan ke lereng agar-agar kultur dan
suspensi spora digunakan untuk menginokulasi 100 ml. Dari media
yang sama di 500 ml. Labu erlenmeyer. Kultur diinkubasi pada 28
'secara timbal balik shaker selama 24 jam Miselium dipulihkan
dengan sentrifugasi, dicuci dua kali dengan media fermentasi minimal
dan akhirnya resuspended dalam 100 ml. Dari medium serupa; 5 ml
Suspensi tersebut digunakan sebagai inokulum untuk masing-masing
100 ml. Media fermentasi secara tepat dilengkapi dengan nutrisi yang
dibutuhkan. Labu fermentasi diinkubasi selama 72 jam pada kondisi
yang diberikan di atas untuk pertumbuhan inokulum. Semua
percobaan dilakukan secara rangkap tiga (Polsinelli, 1965).
b. Streptomisin
1) Biosintesis Streptomisin pada Streptomyces griseus

Gambar 02. Biosintesis Streptomisin pada Streptomyces griseus (Adzitey, 2015)

 Streptomycin adalah inhibitor sintesis protein. Ini berikatan dengan
rRNA 16S kecil dari subunit 30S dari ribosom bakteri, mengganggu
pengikatan formil-metionil-tRNA ke subunit 30S (Sharma, 2007). Hal
ini menyebabkan kesalahan penulisan kodon, penghambatan akhirnya
sintesis protein dan akhirnya kematian sel mikroba melalui
mekanisme yang masih belum dipahami. Spekulasi pada mekanisme
ini menunjukkan bahwa pengikatan molekul ke subunit 30S
mengganggu asosiasi subunit 50S dengan untai mRNA. Ini
menghasilkan kompleks ribosomal-mRNA yang tidak stabil, yang
menyebabkan mutasi frameshift dan sintesis protein yang rusak;
menyebabkan kematian sel (Raymon, 2011). Manusia memiliki
ribosom yang secara struktural berbeda dengan bakteri, sehingga obat
ini tidak memiliki efek ini pada sel manusia. Namun pada konsentrasi
rendah, streptomisin hanya menghambat pertumbuhan bakteri dengan
mendorong ribosom prokariotik untuk salah membaca mRNA (Voet,
2004). Streptomisin adalah antibiotik yang menghambat bakteri Gram
positif dan Gram negatif, sehingga antibiotik spektrum luas berguna.
2) Metode Produksi
 Streptomycin Production
 Preparation of streptomycin
 Extraction and purification of streptomycin
 Stimulation of Streptomycin Production by a Series of Synthetic
Organic Compounds
 Nutritional requirements of streptomyces griseus for the formation
of streptomycin
c. Eritromisin
1) Biosintesis Eritromisin pada Streptomyces erythreus
Gambar 03. Biosintesis Eritromisin pada Streptomyces erythreus (Adzitey, 2015)
Erythromycin menunjukkan aktivitas bakteriostatik atau
menghambat pertumbuhan bakteri, terutama pada konsentrasi yang
lebih tinggi, namun mekanismenya tidak sepenuhnya dipahami.
Dengan mengikat subunit 50 dari kompleks rRNA bakteri, sintesis
protein dan proses struktur dan fungsi selanjutnya yang penting untuk
kehidupan atau replikasi dihambat. Erythromycin mengganggu
translokasi aminoasil, mencegah pengalihan tRNA yang terikat pada
lokasi kompleks rRNA ke situs P kompleks rRNA. Tanpa translokasi
ini, situs A tetap terisi, sehingga penambahan tRNA yang masuk dan
asam amino terlampir ke rantai polipeptida yang baru lahir dihambat.
Ini mengganggu produksi protein fungsional yang berguna, yang
merupakan dasar dari tindakan antimikroba ini (Pal, 2006).
Menurut Pal (2006), sebagian besar eritromisin dimetabolisme
dengan demetilasi di hati oleh enzim hati CYP3A4. Rute eliminasinya
yang utama adalah di empedu dengan sedikit ekskresi ginjal, 2% -15%
obat tidak berubah. Waktu paruh eliminasi eritromisin berkisar antara
 1,5 dan 2,0 jam dan antara 5 dan 6 jam pada pasien dengan penyakit
ginjal stadium akhir. Tingkat Eritromisin meningkat dalam serum 4
jam setelah pemberian dosis; puncak etilsuidin 0,5-2,5 jam setelah
pemberian dosis, namun bisa tertunda jika dicerna dengan makanan.
2) Metode Produksi
Selama tiga dekade setelah penemuan eritromisin A dan aktivitasnya
sebagai antimikroba, banyak usaha dilakukan untuk mensintesisnya di
laboratorium. Kehadiran 10 karbon stereospesifik dan beberapa titik
substitusi yang berbeda telah membuat sintesis total eritromisin A
merupakan tugas yang berat. Sintesis lengkap struktur dan prekursor
erythromycins terkait seperti 6-deoxyerythronolide B telah dilakukan,
memberikan kemungkinan kemungkinan terjadinya sintesis eritromisin
dan antimikroba makrolida lainnya. Woodward berhasil menyelesaikan
sintesis eritromisin A (Pal, 2006).
d. Klortetrasiklin
1) Biosintesis Klortetrasiklin pada Streptomyces aureofaciens

Gambar 04. Biosintesis Klortetrasiklin pada Streptomyces aureofaciens (Adzitey,

2015)
Tetrasiklin menghambat sintesis protein dengan menghalangi
pelekatan aminoasilel-tRNA bermuatan ke situs A pada ribosom.
 Tetracycline berikatan dengan subunit 30S ribosom mikroba. Dengan
demikian, ini mencegah pengenalan asam amino baru ke rantai
peptida yang baru lahir. Tindakan ini biasanya bersifat hambat dan
reversibel saat penarikan obat. Sel mamalia kurang rentan terhadap
efek tetrasiklin, terlepas dari kenyataan bahwa tetrasiklin berikatan
dengan subunit ribosom kecil dari prokariota dan eukariota (masing-
masing 30S dan 40S). Ini karena bakteri secara aktif memompa
tetrasiklin ke dalam sitoplasma mereka, bahkan melawan gradien
konsentrasi, sedangkan sel mamalia tidak melakukannya. Ini
menjelaskan efek tetrasiklin di sel yang relatif kecil pada sel manusia
(Kenneth, 2012).
2) Metode Produksi

Gambar 05. Metode Produksi Klortetrasiklin pada Streptomyces aureofaciens

(Adzitey, 2015)
e. Basitrasin
1) Biosintesis Basitrasin pada Bacillus licheniformis
 Bacitracin mengganggu defosforilasi C55-isoprenil pirofosfat, juga
dikenal sebagai bactoprenol, molekul pembawa membran yang
mengangkut blok bangunan dinding sel bakteri peptidoglikan di luar
membran dalam. Beberapa telah mengklaim bahwa bacitracin adalah
protein isomerase disulfida inhibitor, namun hal ini diperdebatkan
oleh penelitian in vitro. Bacitracin disintesis melalui apa yang disebut
sintase nukleotida nonribosomal (NRPSs), yang berarti bahwa
ribosom tidak terlibat langsung dalam sintesisnya (Karala, 2010).
2) Metode Produksi

Gambar 06. Metode Produksi Basitrasin pada Bacillus licheniformis (Adzitey,

2015)
Bacitracin diproduksi secara komersial dengan menumbuhkan
bakteri Bacillus subtilis var Tracy I dalam wadah media pertumbuhan
cair. Seiring waktu, bakteri mensintesis antibiotik dan mengeluarkan
antibiotik ke medium. Antibiotik ini kemudian diekstraksi dari media
dengan menggunakan proses kimia (Karala, 2010)
 BAB III
PENUTUP

5.1 Kesimpulan
Kesimpulan dalam makalah ini dijabarkan sebagai berikut.

5.2 Saran
DAFTAR PUSTAKA

Adzitey, F. 2015. Antibiotic classes and antibiotic susceptibility of bacterial isolates

from selected poultry; a mini review. World Vet J, Vol. 5, No. 3: pp. 36-41.
Carrol, G. C., 1988. Fungal Endophytes in Stems and Leaves from Latent Pathogens
to Mutualistic Symbions. Ecology, 69:2-9.
Franklin, T. J. & Snow, G. A. 1989. Biochemistry of antimicrobial action. London
: Chapman & Hall.
Janitra, M. 2015. Produksi Antibiotik. Kendari : Universitas Haluoleo Press.
Karala, A. R.; Ruddock, L. W. 2010. Bacitracin is not a specific inhibitor of protein
disulfide isomerase. FEBS Journal. 277 (11): 2454–2462.
Kauffman, C. A. dan Carver, P. L. 1997. Antifungal agents in the 1990s. Current
status and future developments (Review). Drugs. 53:539-549.
Kenneth Todar. 2012. Antimicrobial Agents in the Treatment of Infectious Disease.
Online Textbook of Bacteriology. 10-08.
Neu, C. H., 1992. The crisis in antibiotic resistence. Science, 257:1064-1073.
Nofiani, R. 2008. Urgensi dan Mekanisme Biosintesis Metabolit Sekunder Mikroba
Laut. Jurnal Natur Indonesia 10 (2) : 120-125.
Pal, S. 2006. A journey across the sequential development of macrolides and
ketolides related to erythromycin. Tetrahedron. 62(14): 3171–3200.
Petrini, O., Sieber, T. N., Toti, L. and Viret D. 1992. Ecology Metabilite Production
and Substrate Utilization in Endophytic Fungi. Natural Toxin,1:185-196.
Polsenelli. 1965. Relation of Biochemical Mutations to Actinomycin Synthesis in
Streptomyces antibioticus. J . gen. Microbial.39, 239-246.
Raymon, Lionel P. 2011. COMLEX Level 1 Pharmacology Lecture Notes. Miami,
FL: Kaplan, Inc. p. 181.
Sharma D, Cukras AR, Rogers EJ, Southworth DR, Green R. 2007. Mutational
analysis of S12 protein and implications for the accuracy of decoding by
the ribosome. Journal of Molecular Biology. 374 (4): 1065–76.
Sobell, H. 1985. Actinomycin and DNA transcription. Proceedings of the National
Academy of Sciences of the United States of America. 82 (16): 5328–31.
Tscherter, H. and Dreyfuss. 1992. New Metabolites, Processes for Their Production
and Uses. International Application Published Under The Patent
Cooperation Treaty (PCT). International Publication Number 38 : 28-45.
Turan T; Karacay O; Tulunay G; Boran N; Koc S; Bozok S; Kose M. 2006. Results
with EMA/CO (etoposide, methotrexate, actinomycin D,
cyclophosphamide, vincristine) chemotherapy in gestational trophoblastic
neoplasia. Int J Gynecol Cancer. 16 (3): 1432–8.
Voet, Donald & Voet, Judith G. 2004. Biochemistry (3rd ed.). John Wiley & Sons.
p. 1341.