Pedoman Tikusfinal 4 Maret 20171
Pedoman Tikusfinal 4 Maret 20171
PENGUMPULAN DATA
RESERVOIR (TIKUS)
DI LAPANGAN
RISET KHUSUS
VEKTOR DAN RESERVOIR PENYAKIT
ISBN 978-602-373-012-4
Pedoman Pengumpulan Data Reserrvoir (tikus) di Lapangan
Ukuran 210 x 297 mm, 122 hal
Diterbitkan oleh:
Lembaga Penerbit Badan Penelitan dan Pengembangan Kesehatan
Kementerian Kesehatan RI
Anggota IKAPI No. 468/DKXI/2013
Jl. Percetakan Negara No. 29, Jakarta 10560 Kotak Pos 1226
Telp: 021 4261008 ext. 223; Fax. 021 4243933
Email: LPB@litbang.depkes.go.id; Website: www.litbang.depkes.go.id
Didistribusikan oleh:
Badan Penelitian dan Pengembangan Kesehatan
Copyright @ 2015 pada Lembaga Penerbit Balitbangkes, Jakarta
ii
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
TIM PENYUSUN
Pengarah:
Kepala Badan Penelitian dan Pengembangan Kesehatan
Penanggung jawab:
Kepala Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Vektor dan Reservoir Penyakit
Kontributor:
drh. Anang S. Achmadi, M.Sc
Dr. drh. Joko Pamungkas, M.Sc
M. H Sinaga, S. Si
iii
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
iv
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
KATA PENGANTAR
Riset khusus vektor dan reservoir penyakit (Rikhus Vektora) merupakan bagian dari Riset
Kesehatan Nasional (Riskesnas) dengan tujuan untuk pemutakhiran data dasar vektor dan
reservoir penyakit sebagai dasar pengendalian penyakit tular vektor dan reservoir, baik yang
baru ataupun muncul kembali, di Indonesia. Langkah utama penelitian adalah pengumpulan
data dan spesimen di lapangan secara teliti, akurat, valid dan reliabel, serta pengelolaan
spesimen koleksi dengan standar baku.
Pengumpulan spesimen vektor dan reservoir penyakit merupakan representasi dari jenis vektor
dan reservoir penyakit yang terdapat di wilayah Indonesia. Diharapkan data spesimen hasil riset
dapat berguna untuk pemutakhiran kajian taksonomi, zoogeografi, evolusi dan filogenetik, serta
ekologi dan genetiknya. Selain itu dapat pula digunakan untuk memahami biologi serangga
vektor dan hewan reservoir penyakit yang bermanfaat dalam pencegahan penularan penyakit
bersumber binatang (zoonosis). Oleh karena itu diperlukan buku pedoman kerja untuk
memberikan gambaran tentang teknik pelaksanaan pengumpulan data dan spesimen vektor
dan reservoir penyakit di lapangan.
Dalam rangka pelaksanaan Rikhus Vektora, maka telah disusun buku pedoman teknis untuk
koleksi data dan spesimen vektor dan reservoir di lapangan. Pedoman ini dimaksudkan untuk
dapat digunakan oleh para tenaga pengumpul data agar memperoleh hasil sesuai yang
diharapkan.
Buku pedoman bertujuan agar pengumpulan data serta spesimen vektor dan reservoir penyakit
dilakukan secara baik dan benar sesuai standar baku sehingga dapat menjadi informasi yang
bermanfaat dan dapat dipertanggungjawwabkan secara ilmiah.
v
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
vi
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
DAFTAR ISI
TIM PENYUSUN ........................................................................................................................ iii
DAFTAR TABEL........................................................................................................................ ix
vii
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
viii
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
DAFTAR TABEL
Tabel 1. Rangkuman kegiatan pengumpulan data tikus ............................................................ 33
Tabel 2. Alat dan bahan yang digunakan dalam pengumpulan data tikus ................................. 37
ix
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
DAFTAR GAMBAR
Gambar 1. Kelengkapan perangkat GPS .................................................................................. 14
Gambar 2. Bagian : GPS ........................................................................................................... 14
Gambar 3. Jenis baterai ............................................................................................................ 15
Gambar 4. Bagian penutup baterai ............................................................................................ 15
Gambar 5. Bagian penutup baterai ............................................................................................ 15
Gambar 6. Pengoperasian GPS ................................................................................................ 16
Gambar 7. Pengaturan GPS ..................................................................................................... 16
Gambar 8. Pengoperasian pengaturan GPS ............................................................................. 17
Gambar 9. Deteksi sinyal satelit ................................................................................................ 18
Gambar 10. Proses mark waypoint............................................................................................ 19
Gambar 11. Menyimpan koordinat dan dokumentasi foto pada GPS......................................... 21
Gambar 12. Form TK.02............................................................................................................ 22
Gambar 13. Tampilan software basecamp ................................................................................ 23
Gambar 14. Tampilan menu receive from device ...................................................................... 23
Gambar 15. Tampilan select device montera ........................................................................... 24
Gambar 16. Tampilan titik koordinat GPS di basecamp............................................................. 24
Gambar 17. Tampilan export data di basecamp ........................................................................ 24
Gambar 18. Tampilan penyimpanan data GPS ......................................................................... 25
Gambar 19. Alur pengumpulan data tikus ................................................................................. 28
Gambar 20. Bagan penataan nampan di meja pada laboratorium lapangan ............................. 59
Gambar 21. Cara menutup syringe yang telah digunakan ......................................................... 62
Gambar 22. Pemasangan perangkap di dalam dan luar rumah ................................................. 70
Gambar 23. Proses memasukkan tikus ke dalam kantung ........................................................ 71
Gambar 24. Cara Anestesi Tikus ............................................................................................... 78
Gambar 25. Pengambilan darah................................................................................................ 80
Gambar 26. Proses koleksi serum ............................................................................................. 81
Gambar 27. Koleksi ektoparasit pada tikus................................................................................ 84
Gambar 28. Dokumentasi spesimen tikus ................................................................................. 86
Gambar 29. Contoh dokumentasi habitat tikus .......................................................................... 87
Gambar 30. Skematis Tikus ...................................................................................................... 89
Gambar 31. Perbedaan warna dan tektur rambut pada tikus ..................................................... 90
Gambar 32. Pengukuran morfometrik untuk identifikasi tikus .................................................... 90
Gambar 33. Rumus putting susu ............................................................................................... 91
x
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
xi
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran 1. Form Ekosistem ................................................................................................... 139
Lampiran 2. Form Koordinat GPS Perangkap ......................................................................... 140
Lampiran 3. Form Lokasi Penangkapan tikus .......................................................................... 141
Lampiran 4. Form Koleksi tikus ............................................................................................... 142
Lampiran 5. Form Pengiriman specimen ................................................................................. 144
Lampiran 6. Form Check list Kegiatan ..................................................................................... 145
Lampiran 7. Form Check list Alat dan Bahan........................................................................... 146
Lampiran 8. Form Berita Serah Terima Limbah ....................................................................... 150
Lampiran 9. Form Berita Acara Pemusnahan Limbah ............................................................. 151
Lampiran 10. Form Berita Acara Serah Terima Spesimen ....................................................... 152
Lampiran 11. Form Spesimen ................................................................................................. 153
xii
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
BAB I. PENDAHULUAN
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit (Rikhus Vektora) merupakan salah satu
riset nasional yang diselenggarakan oleh Badan Penelitian dan Pengembangan Kementerian
Kesehatan dengan tanggung jawab pelaksana oleh Unit Pelaksana Teknis (UPT) Badan
Litbangkes di Salatiga, yaitu Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Vektor dan Reservoir
Penyakit (B2P2VRP).
Rikhus Vektora adalah suatu kegiatan riset yang diarahkan untuk mengetahui gambaran
vektor dan reservoir penyakit, termasuk di dalamnya adalah data nyamuk, tikus dan kelelawar
dengan menggunakan hasil observasi bionomik, uji identifikasi dan pemeriksaan laboratorium.
1. Latar belakang:
a. Ancaman risiko penyakit tular vektor dan reservoir secara global dan nasional sangat
tinggi;
b. Data bio-diversitas fauna di Indonesia yang kompleks akibat kondisi bio-geografis
(pertemuan wilayah Oriental dan Australia) belum terbaharukan dengan baik;
c. Data penelitian terkait vektor dan reservoir penyakit belum terwakili secara nasional;
d. Data model penanggulangan secara lokal spesifik belum lengkap
Rikhus Vektora dilaksanakan di sejumlah wilayah kabupaten/kota di Indonesia
secara berkesinambungan yang dirancang untuk dilaksanakan selama tiga tahun, mulai
tahun 2015 sampai dengan 2017.
2. Tujuan Umum riset khusus vektor dan reservoir penyakit adalah:
melakukan pemuktahiran data vektor dan reservoir penyakit secara nasional
sebagai dasar pengendalian penyakit tular vektor dan reservoir (baik jenis penyakit infeksi
baru maupun yang muncul kembali) di Indonesia
3. Tujuan khusus riset adalah:
a. Inkriminasi (penentuan vektor) dan konfirmasi spesies vektor dan reservoir penyakit;
b. Memperoleh peta sebaran vektor dan reservoir penyakit;
c. Mencari kemungkinan munculnya vektor dan reservoir penyakit baru/belum terlaporkan
yang berasal dari hasil koleksi sampel nyamuk, tikus dan kelelawar;
d. Mencari kemungkinan munculnya patogen penyakit tular vektor dan reservoir
baru/belum terlaporkan;
e. Mengembangkan spesimen koleksi referensi vektor dan reservoir penyakit;
1
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
reservoir (tikus). Data reservoir yang akan dikumpulkan ini sangat penting karena
merupakan pemuktahiran data yang sahih untuk dikaitkan dengan data penanggulangan
penyakit tular reservoir (tikus) di masyarakat yang akan diperoleh dengan metode
observasional diskriptif menggunakan rancangan studi potong lintang (cross sectional
study).
Berdasarkan hal tersebut di atas maka sangat perlu disusun Pedoman dengan
tujuan membantu tenaga pengumpul data memahami:
a. Mekanisme pengambilan sampel tikus sesuai Pedoman Operasional Baku (POB) /
Standard Operational Procedure (SOP) yang telah ditetapkan;
b. Mekanisme identifikasi sampel tikus sesuai Pedoman Operasional Baku (POB) /
Standard Operational Procedure (SOP) yang telah ditetapkan;
c. Mekanisme pengambilan spesimen serum, ginjal, paru (RNA later), punch telinga,
serta pemilihan spesimen untuk pembuatan awetan basah tikus sesuai Pedoman
Operasional Baku (POB) / Standard Operational Procedure (SOP) yang telah
ditetapkan;
d. Cara-cara penyimpanan spesimen serum, ginjal, paru (RNA later), punch telinga, serta
pemilihan spesimen untuk pembuatan awetan basah tikus sesuai Pedoman
Operasional Baku (POB) / Standard Operational Procedure (SOP) yang telah
ditetapkan;
e. Cara-cara pengemasan sampel dan spesimen tikus sesuai POB yang telah
ditetapkan;
f. Cara-cara pengiriman sampel dan spesimen tikus sesuai POB yang telah ditetapkan.
Jenis sampel dan spesimen untuk data tikus pada Rikhus Vektora 2015-2018
berupa: serum, ginjal, paru (RNA later), ektoparasit, punch telinga, serta pemilihan
spesimen untuk pembuatan awetan basah tikus.
Identifikasi sampel dan pemeriksaan spesimen dilaksanakan di laboratorium
lapangan di daerah, yaitu sarana dan prasarana yang memungkinkan untuk dijadikan
laboratorium lapangan di Pusat Kesehatan Masyarakat (Puskesmas), desa atau wilayah
dusun setempat.
Pemeriksaan pada tahun 2015-2018 yang langsung dilaksanakan di laboratorium
lapangan adalah identifikasi spesimen tikus. Pemeriksaan di laboratorium B2P2VRP,
Badan Litbangkes, pada tahun berjalan adalah pemeriksaan leptospirosis dan
3
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Hantavirus. Sementara untuk pemeriksaan analisis lanjut akan dilaksanakan pada tahun
selanjutnya setelah pelaksanaan riset di suatu provinsi selesai dilaksanakan.
Secara lebih rinci, metode koleksi dan jenis pemeriksaan laboratorium untuk
sampel tikus yang dilakukan di laboratorium lapangan meliputi:
a. Koleksi tikus menurut CDC (1995)1;
b. Identifikasi spesies tikus secara morfologis;
c. Pembuatan spesimen tikus untuk koleksi referensi reservoir penyakit
4
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
A. Tim survei
Tim survei terdiri atas:
1. Koordinator Provinsi
Koordinator provinsi adalah Kepala Dinas Kesehatan di provinsi setempat.
2. Koordinator Lapangan Provinsi
Koordinator lapangan provinsi adalah Kepala Balai/Loka Litbangkes.
3. Penanggung Jawab Operasional Kabupaten
Penanggung jawab operasional (PJO) Kabupaten adalah petugas yang ditunjuk oleh
Kepala Dinas Kesehatan Kab/Kota yang menangani bidang pencegahan dan
pengendalian penyakit.
B. Tim koleksi data reservoir
1. Tim koleksi data reservoir terdiri dari :
a. Koordinator teknis : 1 orang senior mamalogis/B2P2VRP/Balai/Loka Litbangkes
b. Satu (1) orang staf teknis dari B2P2VRP/Balai/Loka Litbangkes
c. Satu (1) orang staf teknis Bidang Pengendalian Penyakit Dinkes setempat
d. Lima (5) orang tenaga pengumpul data lainnya (S1 dokter hewan/S1 biologi/S1
Kesling/S1 Kesmas/S1 Kehutanan/S1 Peternakan/DIII Kesehatan Lingkungan/DIII
Kesehatan Hewan dan memiliki kemampuan di bidang survei tikus dan kelelawar)
e. Enam (6) orang terdiri dari 5 tenaga lokal penangkap tikus dan kelelawar, dan 1
orang dari puskesmas.
5
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
2. Tugas dan tanggung jawab dari masing-masing anggota adalah sebagai berikut :
a. Koordinator teknis
Tugas koordinator teknis adalah mengkoordinir seluruh anggota tim dalam
melakukan koleksi tikus dan kelelawar, pengambilan spesimen, handling spesimen
dari lapangan ke B2P2VRP, serta berkoordinasi dengan PJO untuk pemusnahan
limbah. Koordinator teknis dipilih dari tenaga mamalogis yang berasal dari
Balai/Loka Litbangkes maupun tenaga independen yang telah berpengalaman dan
menguasai survei tikus dan kelelawar. Koordinator teknis juga diharapkan telah
berpengalaman di dalam penanganan sampel dan spesimen serta analisis habitat.
b. Tenaga teknis dari Balai/Loka Litbangkes
Tenaga teknis dari Balai/Loka Litbangkes bertugas untuk mendukung
tugas koordinator teknis dalam pelaksanaan survei tikus dan kelelawar,
pengambilan spesimen dan analisis habitat. Tenaga teknis adalah seseorang
yang telah menguasai survei tikus dan kelelawar, pengambilan spesimen dan
manajemen rantai dingin.
c. Tenaga teknis dari Bidang Pengendalian Penyakit Dinkes Kabupaten/Kota
Tugas dari tenaga teknis Bidang Pengendalian Penyakit Dinkes
Kabupaten/Kota adalah membantu tim reservoir dalam melakukan seluruh
kegiatan teknis di lapangan dan sebagai tenaga daerah yang membantu perijinan
dan pendekatan ke masyarakat di lokasi studi.
d. Lima (5) orang tenaga pengumpul data lainnya (S1 dokter hewan/S1 biologi/S1
Kesling/S1 Kesmas/S1 Kehutanan/S1 Peternakan/DIII Kesehatan Lingkungan/DIII
Kesehatan Hewan dan memiliki kemampuan di bidang survei tikus dan kelelawar)
Tugas dan tanggung jawabnya adalah bertugas secara penuh dalam
koleksi tikus dan kelelawar, pengambilan spesimen, manajemen rantai dingin, dan
identifikasi. Tenaga pengumpul data adalah tenaga yang direkrut dari mahasiswa
tingkat akhir atau baru lulus berasal dari bidang ilmu Biologi, Kedokteran Hewan,
Kesehatan Lingkungan. Tenaga pengumpul data dapat juga berasal dari bidang
ilmu lain yang memiliki kemampuan di bidang mamalogi.
e. Lima (5) orang tenaga penangkap tikus dan kelelawar
Tugas dan tanggung jawabnya adalah membantu pemasangan perangkap
dan pemanenan tikus maupun kelelawar.
6
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
7
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
8
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Penentuan lokasi pengumpulan data merupakan salah satu bagian penting dalam
Rikhus Vektora. Keberhasilan penentuan lokasi untuk survei nyamuk, tikus dan kelelawar akan
sangat mempengaruhi hasil pengumpulan data secara keseluruhan. Pemahaman definisi
operasional ekologi, ekosistem dan habitat, definisi operasional dan kriteria dari hutan, non
hutan serta pantai dengan baik mendukung dalam menentukan habitat ekosistem terpilih yang
mempunyai kemelimpahan nyamuk, tikus dan kelelawar, baik jenis maupun jumlahnya.
Selain faktor bio-ekologis yang mendukung keberadaan nyamuk, tikus dan kelelawar,
faktor aksesibilitas, keberadaan penyakit tular vektor dan reservoir di kawasan tersebut,
keamanan dan resiko lain yang dapat muncul di luar kepentingan riset menjadi pertimbangan
penting dalam menentukan lokasi pengumpulan data.
A. Tujuan
a. Tujuan Umum
Untuk dapat memahami definisi operasional lokasi, kriteria dan cara penentuan titik
pengumpulan data di lapangan
b. Tujuan Khusus
1. Untuk dapat memahami definisi operasional ekologi, ekosistem dan habitat
2. Untuk dapat memahami definisi operasional dan kriteria ekosistem hutan, non-hutan
dan pantai yang dipergunakan dalam rikhus vektora
3. Untuk dapat mengetahui cara penentuan titik pengumpulan data
9
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
(http://databasin.org/datasets/eb74fe29b6fb49d0a6831498b0121c99).
5. Hutan merupakan: (1) suatu kesatuan ekosistem berupa hamparan lahan berisi sumber
daya alam hayati didominasi pepohonan, persekutuan alam lingkungan satu dengan
lainnya tidak dapat dipisahkan19; (2) Luas lebih dari 0,5 hektar dengan pepohonan tinggi
lebih dari 5 meter dan tutupan tajuk lebih dari 10 persen, atau pohon dapat mencapai
ambang batas ini di lapangan. Tidak termasuk lahan yang sebagian besar digunakan
untuk pertanian atau pemukiman20.
10
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
3. Ekosistem pantai/pesisir
Ekosistem pantai atau pesisir merupakan ekosistem yang ada di wilayah
perbatasan antara air laut dan daratan.Ekosistem ini memiliki dua macam komponen,
yaitu komponen biotik dan abiotik. Komponen biotik pantai terdiri dari tumbuhan dan
hewan yang hidup di daerah pantai, sedangkan komponen abiotik pantai terdiri dari
gelombang, arus, angin, pasir, batuan dan komponen selain makhluk hidup lainnya.
Salah satu contoh ekosistem ini adalah hutan bakau (mangrove) dengan berbagai
macam hewan yang hidup di dalamnya.
Apabila tidak memungkinkan melakukan pengumpulan data di salah satu
ekosistem, maka dapat digantikan oleh ekosistem lain yang mewakili keberadaan
penyakit tular vektor/reservoir. Seperti hanya ekosistem hutan dan non-hutan, di wilayah
ekosistem pantai penduduk di wilayah tersebut membuat pemukiman di pinggir atau di
sekitar pantai. Namun demikian ada pula wilayah yang jarang di akses oleh manusia,
ditunjukkan oleh posisinya yang jauh dari pemukiman. Kawasan pantai jauh pemukiman
ini menjadi salah satu kriteria pula dalam rikhus vektora 2016. Dalam riset ini, kriteria
pantai jauh pemukiman apabila berjarak 3-5 km dari pemukiman.
3. Lokasi relatif mudah diakses dan terdapat cukup fasilitas yang dibutuhkan
4. Lokasi harus dapat dikunjungi dan tidak memiliki risiko tinggi di luar kepentingan
riset (bencana, keamanan, dsb)
12
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
GPS (Global Positioning System) merupakan alat survei yang dapat digunakan dalam berbagai
bidang termasuk bidang kesehatan. Pada riset khusus vektora ini dilakukan pemetaan
persebaran vektor dan reservoir daerah penelitian. Pengambilan koordinat dilakukan pada
habitat sampel vektor dan reservoir diambil. GPS yang digunakan adalah Garmin Monterra.
GPS Monterra merupakan bagian dari pengembangan GPS Montana dan Sistem Operasi
perangkat mobile Android. Monterra dapat digunakan sebagai GPS navigator maupun sebagai
GPS survei lapangan untuk plot waypoint maupun tracking. Memiliki desain kokoh dan tahan
cuaca (weather sealed) serta didukung fitur beragam membuat GPS ini sangat cocok untuk
untuk kegiatan lapangan di negara tropis seperti Indonesia. Fitur Garmin Monterra antara lain
Penggabungan Pemetaan 3D, kamera digital 8 megapixel autofocus, sistem baterai ganda
state-of-the-art, kompas elektronik built-in 3-axis accelerometer dan dengan gyro, sensor UV
built-in, Wi-Fi, Bluetooth dan NFC, Memuat peta dan jutaan geocaches, Radio dan lain-lain.
Seluruh fitur dikemas dalam sistem operasi android versi 4.0.4 yang universal untuk digunakan
oleh pemula maupun surveior berpengalaman. Berdasarkan penilaian tersebut, GPS ini sangat
tepat digunakan untuk rikhus vektora.
Metode dalam pemetaan ini adalah metode Stop and Go, pengambilan koordinat dilakukan
dengan cara pengambil koordinat berhenti sejenak di lokasi survei kemudian menunggu GPS
mendapatkan sinyal stabil. Koordinat dapat disimpan di GPS ataupun ditulis dalam form GPS.
Setelah pencatatan koordinat selesai kemudian dilanjutkan untuk lokasi berikutnya.
Semoga pedoman singkat ini bermanfaat bagi kita semua
13
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
PENJELASAN UMUM
14
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
3. Baterai
GPS Garmin Monterra memiliki sistem baterai ganda state-of-the-art. GPS ini dapat
menggunakan baterai rechargable lithium-ion atau menggunakan baterai AA.
A B
15
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
3. Langkah Pengoperasian
Setelah selesai memasang baterai maka kita dapat mengoperasikan GPS. Langkah
mengoperasikan GPS Garmin Monterra adalah sebagai berikut:
a. Tekan tombol power.
b. Tunggu beberapa saat sampai GPS stabil.
c. Gerakkan jari di layar sentuh untuk menggeser atau
menutup tampilan.
d. Memperbesar atau memperkecil tampilan dengan
menggunakan kedua jari tangan.
e. Sentuh icon untuk kembali kehalaman sebelumnya.
f. Sentuh icon untuk kembali ke layar awal.
g. Sentuh icon untuk mengatur sistem.
Gambar 6. Pengoperasian GPS
4. Langkah pengaturan pada GPS (Langkah ini HARUS dilakukan pertama kali
sebelum GPS dioperasikan dan hanya dilakukan SATU KALI saja dalam
penggunaan GPS)
a. Nyalakan GPS dengan menekan tombol power pada bagian samping kanan atas
(lihat gambar 7).
b. Pilih icon setting aplikasi, kemudian pilih more (gambar 7)
16
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
b. Pilih Heading.
c. Pada menu Compass Mode pilih on untuk mengaktifkan menu heading.
d. Pilih Calibrate compass, kemudian klik. start.
e. Gerakkan GPS sesuai dengan gerakkan di layar GPS.
f. GPS akan memberikan respon apakah kalibrasi berhasil atau tidak. Jika tidak
anda perlu mengulangi putaran dengan sedikit lebih pelan lagi.
17
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
3. Jika dilakukan pemindahan perangkap karena sesuatu hal: misal umpan dikerubuti
semut maka dilakukan pengambilan koordinat lagi dan jaraknya lebih dari sepuluh (10)
meter.
4. Jumlah titik koordinat lebih banyak dari jumlah perangkap, KARENA ada proses
pemindahan perangkap.
5. Titik koordinat lama TIDAK DIHAPUS, KARENA menggambarkan persebaran
perangkap
18
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
2. GPS dinyalakan pada saat akan berangkat ke lokasi pemasangan perangkap tikus.
GPS dimatikan setelah pengambilan koordinat selesai.
3. Ambil koordinat tempat pemasangan perangkap tikus dengan cara sentuh icon
mark waypoint pada GPS.
19
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
b. Nama yang ada di GPS dengan nomro perangkap tikus ( contoh : HDP-001/(D01/L00),
arti kode:
HDP = Hutan Dekat Pemukiman (kode ini menyesuaikan site misalnya HDP, HJP,
NHDP, dll),
001 = Perangkap nomor 001 yang tertulis di pita pada perangkap
D 01 = di dalam rumah nomor stiker 01,
L 00 = Luar rumah atau lingkungan,
20
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
5. Ambil foto perangkap tikus dengan cara menyentuh icon gambar foto
6. Sebelum titik koordinat disimpan pada GPS, JANGAN LUPA mencatat nomor
perangkap, titik koordinat dan nilai elevasi (ketinggian) pada form TK.02 GPS.
7. Kemudian pilih DONE.
8. Pengambilan foto diharuskan tidak hanya lewat mark waypoint saja. Namun, juga
melalui menu Camera pada GPS dengan Icon
a. Untuk mengambil gambar pilih menu camera pada aplikasi
b. Pilih Icon
c. Kemudian pilih icon untuk mulai mengambil gambar
Catatan:
1. Pengambilan foto dilakukan di setiap rumah dipasangi perangkap
2. Pengambilan foto perangkap di luar rumah dilakukan per habitat berdasar jenis
vegetasi tempat pemasangan perangkap
3. Pengambilan foto dilakukan dalam kondisi GPS menangkap setidaknya 5 satelit
untuk mendapatkan akurasi letak pengambilan foto (geo tagging)
9. Setelah titik koordinat diambil kemudian dilakukan pengambilan video pada lokasi
pemasangan perangkap tikus. Langkah pengambilan video adalah sebagai berikut:
a. Pilih menu camera pada aplikasi
b. Pilih icon.
c. Kemudian pilih icon untuk memulai merekam.
d. Jika sudah selesai maka pilih icon.
21
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
10. Setelah hasil penangkapan selesai diidentikasi, kemudian pada form TK.02 diisi kode
spesimen pada kolom KODE SPESIMEN, contoh 33161T005. Keterangan 33161
merupakan keterangan tempat pengambilan sampel yang terdiri dari kode Provinsi,
kode Kabupaten, dan kode ekosistem, untuk T005 merupakan nomor urut spesimen.
Contoh pengisian form sebagai berikut :
KETERANGAN TAMBAHAN
1. Apabila ingin mencari waypoint yang sudah dibuat maka dapat dilakukan langkah
sebagai berikut:
a. Pilih waypoint manager.
b. Pilih icon untuk mencari nama waypoint.
c. Pilih all kemudian pilih type symbol untuk mencari symbol yang akan digunakan
untuk waypoint.
d. Pilih icon search near untuk lokasi atau titik koordinat yang ada pada peta.
e. Pilih titik koordinat yang ada pada daftar.
2. Cara memperbaiki informasi (edit) waypoint
a. Pilih waypoint manager
b. Pilih titik waypoint yang akan diperbaiki.
c. Perbaiki informasi dengan menekan informasi yang diperbaiki.
d. Tekan DONE.
3. Langkah untuk menghapus waypoint
a. Pilih waypoint manager.
b. Pilih dan tekan waypoint sampai muncul icon.
c. Tekan icon untuk hapus data.
22
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
23
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
24
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
25
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
26
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Pengumpulan data dilaksanakan selama ± 30 hari dengan rincian: 5 hari pengumpulan data
pada tiap ekosistem. Jadwal pengumpulan data pada masing masing ekosistem terbagi menjadi
koleksi pengumpulan data tikus pada hari 1 sampai 3 diteruskan pengumpulan data kelelawar
pada hari 3 – 4 dan diteruskan penyelesaian administrasi serta persiapan pindah lokasi.
Pengorganisasian tim menjadi sangat penting dalam memanajemen semua kegiatan
pengumpulan data yang dilaksanakan selama 30 hari di 6 titik terpilih pada ekosistem hutan,
non hutan dan pantai.
27
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
28
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Pengumpulan data (puldat) oleh tim dilaksanakan selama ± 30 hari dengan rincian: 5
hari puldat pada tiap ekosistem. Pengumpulan data diutamakan mulai pada ekosistem hutan
dekat pemukiman (5 hari), kemudian berturut-turut dilanjutkan pada ekosistem hutan jauh
pemukiman, non-hutan dekat pemukiman, non-hutan jauh pemukiman, pantai dekat
pemukiman, dan pantai jauh pemukiman. Rincian kegiatan pada masing-masing ekosistem
dijelaskan sebagai berikut:
Hari ke-1
a. Koordinasi Lapangan dengan perangkat desa untuk administrasi lapangan, survei lokasi,
penentuan tenaga lokal, laboratorium lapangan sesuai kriteria dan pembekuan gel pack di
lokasi setempat.
b. Ketua tim melakukan koordinasi dan pembekalan teknis kepada tenaga lokal
c. Persiapan alat dan bahan survei tikus (persiapan: umpan, perangkap, label perangkap,
label rumah, GPS dan formulir)
d. Pukul 15.00 (waktu setempat) ketua tim dan 1 orang anggota bersama seluruh tenaga lokal
melakukan pemasangan perangkap tikus sesuai Prosedur Penangkapan Tikus (Form
TK.01)
e. Dua orang anggota tim lain melakukan pengambilan titik koordinat pemasangan perangkap
sesuai Prosedur Penggunaan GPS (Form TK.02)
f. Dua orang anggota tim lainnya melakukan pengambilan/pengukuran data lingkungan sesuai
Prosedur Pengambilan Parameter Lingkungan (Form T.03)
Hari ke-2
1. Pengambilan tikus
a. Pukul 06.00-08.00 (waktu setempat) dua orang anggota tim dibantu seluruh tenaga lokal
mengambil tikus yang tertangkap sesuai Prosedur Penangkapan Tikus dan membawa
ke laboratorium lapangan. Perangkap negatif (tidak berisi tikus) yang dipasang di
pemukiman, apabila umpan disemuti dapat dipindah ke ruangan lain.
b. Anggota tim lainnya mempersiapkan laboratorium lapangan sesuai Prosedur Persiapan
Laboratorium Lapangan.
29
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
31
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
h. Semua tikus belum teridentifikasi dibuat awetan basah tanpa dipilih sesuai Prosedur
Pembuatan Awetan Basah (Form T.04 Bagian Koleksi spesimen II) serta (Form TK.11).
i. Ketua tim mengkoordinasikan penyimpanan kotak serum tikus yang terkumpul dihari ke
dua ke fasilitas kesehatan terdekat yang memiliki lemari es.
j. Dua orang anggota Tim melakukan entry data seluruh hasil yang diperoleh dihari
pertama dan kedua (Form TK.01-Form T.04).
k. Ketua dan anggota tim tersisa memeriksa check list kegiatan pada Form TK.06 (validasi
internal) dan checklist alat dan bahan (Form TK.07).
l. Tenaga lokal melakukan pengepakan alat dan bahan survei tikus.
3. Pengelolaan limbah
a. Dua orang anggota tim dan tenaga lokal mengelola limbah non karkas dan limbah cair
yang dikemas sesuai Prosedur Pengolahan Limbah (Form. TK.08 Serah Terima
Limbah) dan diserahkan ke PJO untuk dimusnahkan.
b. Satu orang anggota tim dan tenaga lokal mengubur karkas tikus sesuai Prosedur
Penanganan Limbah (Form. TK.09 Pemusnahan Limbah).
Hari keempat
Hari Kelima
32
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
C. RANGKUMAN KEGIATAN
33
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
34
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
35
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
36
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Tabel 2. Alat dan bahan yang digunakan dalam pengumpulan data tikus
37
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
38
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Digunakan untuk
menampung plastik berisi
14 Ember plastik (20 lt)
rendaman awetan tikus
dalam formalin
39
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
40
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Digunakan sebagai
pembungkus awetan basah
28 Kain kasa
tikus ketika akan dikirim
menggunakan canoe drum.
Kardus packing
Kardus yang digunakan untuk
bersekat (untuk ginjal,
32 pengepakan ektoparasit,
ektoparasit, dan punch
ginjal, dan punch telinga.
telinga)
41
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Digunakan untuk
memperbaiki/ menutup
33 Kawat lubang pada perangkap tikus
apabila terdapat lubang pada
perangkap tikus
Untuk pengambilan
36 Kuas halus
ektoparasit pada tikus
42
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
43
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
44
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Bahan untuk
melapisi/menyegel vial tube
51 Parafilm
spesimen (ginjal, serum,
ektoparasit, dan punch)
45
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
46
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
47
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
48
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
49
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Kardus stirofom +
Kardus untuk mengirim
83 kardus untuk kotak
sampel serum (cold chain)
serum
50
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
51
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
52
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
53
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
54
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
55
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
56
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
57
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
58
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
59
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
60
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
61
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
A B C
k. Jangan menyentuh wajah dengan tangan pada saat bekerja dengan hewan, sampel
atau sumber patogen.
l. Jangan makan minum di area pengambilan sampel
m. Jaga kebersihan area dari barang yang tidak terpakai.
62
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Setelah selesai:
1. Disinfeksi area kerja menggunakan alkohol 70% dan detergent dengan cara:
a. Tuang alkohol 70%, pada towel tissue
b. Usap meja kerja menggunakan towel tissue yang sudah dituangi alkohol
c. Cuci dengan air detergen menggunakan spon
d. Bilas dengan air
e. Keringkan
2. Bersihkan tangan dengan alkohol 70% sebelum melepaskan sarung tangan. Lepaskan
sarung tangan dan buang di platik biohazard
3. Cuci tangan dan pergelangan tangan dengan sabun dan bilas dengan air mengalir
4. Lepas baju khusus lapangan. Jangan dibawa keluar area kerja.
3. Keselamatan hayati penanganan limbah
a. Kenakan baju laboratorium
b. Kenakan alas kaki tertutup
c. Cuci tangan dan pergelangan tangan dengan sabun dan bilas dengan air mengalir
d. Kenakan masker
e. Kenakan sarung tangan nitril
f. Ikat erat katong biohazard menggunakan tali dan amankan menggunakan isolasi
g. Disinfeksi bagian luar kantong biohazard menggunakan alkohol 70%
h. Kumpulkan limbah biohazard di tempat aman sebelum dimusnahkan.
i. Selanjutnya lihat prosedur penanganan limbah.
4. Tanggap darurat pada pengumpulan data :3,4
1. Tanggap darurat jika anda terkena gigitan & cakaran hewan, luka goresan/ tusukan dari
benda-benda yang kontak dengan hewan (kandang, jarum bekas, dsb):
2. Jika luka sangat serius :
a. Hentikan perdarahan, kontak penanggung lapangan/pimpinan/dokter yang
bertugas,
b. Berobat ke klinik terdekat dan ceritakan tentang semua yang terjadi kepada dokter
bertugas
3. Jika perdarahan tidak serius:
a. 1-3 menit pertama, cuci luka secepatnya dengan air mengalir.
b. Gosok luka dengan busa penggosok yang dibubuhi sabun betadine selama 15
menit (pov. Iodine).
c. Tekan luka sedemikian rupa untuk mengeluarkan darah pada waktu penggosokan.
63
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
4) Ikat bagian lengan (kaki) yang dekat dengan luka, ikat lengan bagian antara
luka dengan badan korban sampai pendarahan berhenti
5) Segera bawa ke fasilitas kesehatan terdekat
c. Apabila pendarahan pada bagian kepala:
1) Tekan luka dengan menggunakan kain kasa sampai pendarahan berhenti.
2) Apabila kain kasa terlalu basah, tambah dengan kain kasa baru diatas kain kasa
lama sambil terus ditekan
3) Segera bawa ke fasilitas kesehatan terdekat
65
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
66
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
B. Penentuan Lokasi
Tikus termasuk hewan kosmopolitan artinya menempati hampir di semua habitat.
Guna mendapatkan hasil penangkapan yang diharapkan maka dalam pemasangan
perangkap perlu memperhatikan beberapa hal berikut: adanya jejak tikus seperti sisa atau
seresah makanan (buah jatuh), bekas keratan, jejak kotoran (feces) dan run way.5
Perangkap juga dapat dipasang pada sekitar tanaman dan pepohonan. Informasi
masyarakat tentang keberadaan tikus juga sangat berguna dalam menentukan
keberhasilan penangkapan (trap success).5
Setelah lokasi ditentukan, pemasangan perangkap diikuti dengan pengisian Form
TK.01 dan Form TK.02. Pemasangan perangkap dilakukan mulai pukul 14.00 waktu
setempat (didahulukan pemasang di luar rumah). Dalam satu ekosistem, dapat ditemui
beberapa lokasi penangkapan, sehingga jumlah perangkap dipasang pada tiap lokasi
disesuaikan. Pengisian Formulir T.03 mengikuti jumlah lokasi penangkapan.
67
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
68
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
69
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
A B
@.Yuli @.Anggi
C D
E F
70
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Hari 2:
1. Pengambilan tikus, dilakukan pada jam 06.00 pagi
Perangkap berisi tikus, diambil tikusnya dengan cara menempatkan kantong kain
(blacu) pada mulut perangkap rapat di keempat sisinya, setelah itu perangkap diangkat
dibalik lalu tutup perangkap dibuka dan tikus dimasukkan ke dalam kantong kain.
Kantong diikat dan diberi label lapangan (Gambar 23)
Perangkap dengan umpan dikerubuti semut diganti umpan baru dan dipindahkan ke
ruangan lain (misalnya dipindah dari dapur ke ruang makan,dsb), sedangkan untuk
perangkap yang dipasang di luar rumah tidak boleh dipindahkan, kecuali dengan
alasan umpan dikerubuti semut atau perangkap dimasuki hewan lain.
2. Pemberian label lapangan.
Label lapangan berupa kertas manila berlubang di ujungnya untuk mengikatkan tali
pada kantong kain, dituliskan lokasi pemasangan perangkap (rumah, kebun) dan
nomor urut perangkap dan no sesuai stiker rumah.
3. Pemeriksaan dan penggantian umpan.
Perangkap dengan umpan dikerumuni semut, diganti dan dipindahkan ke lokasi tidak
bersemut
A B
@.Yuli
B @.Yuli
C D
@.Yuli
@.Yuli
4. Perangkap yang sudah pernah berisi tikus dicuci dengan air cucian beras sebelum
digunakan kembali.
5. Semua perangkap dipasang kembali
6. Tikus tertangkap (dalam kantong kain berlabel lapangan) dibawa ke laboratorium
lapangan, dipisah sesuai asal habitat (rumah, kebun dll) untuk pemprosesan diawali
tikus tertangkap dari habitat rumah.
Hari 3:
1. Pengambilan tikus dilakukan pada jam 06.00 pagi
2. Perangkap berisi tikus, diambil tikusnya dan seterusnya dilakukan prosedur yang sama
dengan hari kedua.
3. Semua perangkap dibersihkan dari sisa umpan, dicuci dengan air cucian beras dan
dilipat menggunakan tali rafia per 10 perangkap.
4. Penangkapan tikus dalam 1 titik lokasi berakhir pada hari ketiga
72
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Parameter lingkungan dalam penangkapan tikus meliputi suhu dan kelembaban udara,
pH tanah, salinitas air, serta pengamatan faktor biotik. Pengukuran parameter lingkungan
dilakukan pada tempat pemasangan perangkap menggunakan peralatan yang telah disediakan
berupa thermo-hygrometer, pH meter dan salinometer. Pengamatan faktor biotik meliputi jenis
vegetasi, predator dan penggunaan lahan. Hasil pengamatan dicatat pada Form. T03 di bagian
catatan.
Pengukuran pH tanah
1. Alat dan bahan
a. pH meter tanah digital
b. Formulir lokasi penangkapan tikus (Form T.03)
c. Alat tulis
73
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
2. Cara kerja
a. Siapkan formulir lokasi penangkapan tikus (Form T.03).
b. Buka bagian belakang alat sebagai tempat untuk memasukkan baterai.
c. Nyalakan alat dengan menekan tombol ON.
d. Sesuaikan posisi saklar yang berada di bagian belakang alat (di atas kotak baterai),
atur saklar di posisi PH.
e. Sebelum ditancapkan ke tanah pastikan batang “Probe” dalam keadaan bersih dan
buka tutup/pelindung Probe (warna putih).
f. Lokasi pengukuran pH tanah adalah di sekitar tempat pemasangan perangkap. Cari
tanah yang lunak/gembur.
g. Tanamkan pH meter pada tanah diukur sampai kedalaman setengah batang Probe.
Tunggu hingga menunjukkan angka stabil.
h. Jika sudah stabil, catat nilai pH tanah di formulir lokasi penangkapan tikus (Form T.03).
i. Matikan alat jika sudah selesai menggunakan dengan menekan tombol OFF.
j. Bersihkan batang probe alat dengan air kemudian dikeringkan dengan tisu.
74
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
g. Sebelum pengukuran, arahkan alat ke sumber cahaya yang cukup agar dapat melihat
dengan jelas skala penunjuknya.
k. Baca skala penunjuknya dengan cara meneropong pada alat. Pembacaan ditunjukkan
oleh batas tertinggi warna biru muda yang terdapat di skala metrik. Catat nilai
salinitasnya di formulir lokasi penangkapan tikus (Form T.03).
l. Setelah pemakaian, bersihkan alat dengan tisu kering.
75
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
76
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
B. Cara Kerja
1. Timbang berat badan tikus
2. Buka ikatan kantong kain
3. Salah satu pengumpul data melakukan penanganan tikus memakai sarung tangan.
Buka ikatan kantong kain, kemudian palpasi kantong berisi tikus untuk menentukan letak
kepala tikus. (gambar 24A).
4. Pegang tengkuk tikus bagian belakang dengan keempat jari, sedangkan ibu jari
diletakkan di bawah mandibula agar tikus tidak menggigit (tangan kanan).
5. Buka kantong kain sampai separuh badan tikus bagian belakang terlihat (Gambar 24B).
6. Kedua kaki belakang tikus dipegang dengan tangan kiri.
7. Pengumpul data yang lain menyiapkan syringe 3 ml untuk anastesi, ambil ketamin
sebanyak 1 ml dan xylazine 0.75 ml (dalam satu syringe). Dosis ketamin 70-100 mg/kg
BB, dosis xylazine 2 mg/kg BB11 (Gambar 24D).
77
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
A B C
D E
@ Yuli
@ Yuli
8. Usap salah satu kaki belakang/paha tikus dengan kapas alkohol (Gambar 24C).
9. Suntikkan campuran ketamin dan xylazine di salah satu kaki belakang/paha tikus
(Gambar 24E).
10. Tikus dibiarkan selama ± 5-10 menit, agar efek obat bekerja.
11. Tikus siap diproses untuk prosedur selanjutnya (pengambilan darah dan serum,
Prosedur Pengambilan Darah dan Koleksi Serum).
78
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
B. Cara kerja
1. Siapkan alat dan bahan pengambilan darah dan serum serta Formulir Koleksi Tikus
(Form T.04 dan TK.11).
2. Tikus pertama kali diambil darah diberi label pita Dimo berisi Kode Wilayah dan
Nomor Urut Tikus (misal: 33 (Jawa Tengah) 26 (Pekalongan) 1 (titik pengambilan
pertama) (TK. 01). Tikus pertama diberi nomor urut spesimen 1, dan seterusnya. Label
diikatkan pada kaki kanan tikus.
3. Catat nomor perangkap dilabel lapangan pada kolom catatan Formulir Koleksi Tikus.
4. Bersihkan bagian dada tikus menggunakan kapas yang sudah dibasahi alkohol 70%
searah badan (Gambar 25A).
79
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
5. Menggunakan syringe 1 ml atau 3 ml, tusukkan dibawah tulang rusuk sampai masuk
lebih kurang 50-75% panjang jarum. Posisi jarum membentuk sudut 45 terhadap
badan tikus yang dipegang tegak lurus, setelah posisi jarum tepat mengenai jantung,11
secara hati-hati darah dihisap, usahakan syringe terisi penuh (Gambar 25B).
Catatan : Pengambilan darah bisa diulang maksimal 2 kali jika terjadi kegagalan.
A B
@ Yuli @ Yuli
6. Siapkan vacutainer, pegang vacutainer miring membentuk sudut 45° kemudian tusukan
ujung syiringe ke tutup vacutainer, posisikan ujung jarum menempel pada dinding
vacutainer dan biarkan darah mengalir masuk vacutainer sampai habis. (Gambar 26A).
7. Pada kondisi darah sudah mengental lepas jarum dari syringe dengan penutup jarum
dipasang dan diputar berlawanan arah jarum jam. Setelah jarum terlepas tempelkan
syringe pada mulut vacutainer.12
8. Darah dialirkan ke dinding vacutainer secara perlahan agar tidak hemolisis12 (Gambar
26B).
9. Untuk darah yang diencerkan dengan menggunakan PBS 1 dalam 10 (satu bagian
darah ditambah sembilan bagian PBS), diberikan tanda huruf “D” di vacutainer,
cryotube, form TK 05, dan form TK 11 (contoh : 63011 T.001 D)
10. Beri label dan centrifuge dengan kecepatan 5000 rpm, selama 5 menit.
11. Ambil serum menggunakan mikropipet secara perlahan sehingga gumpalan darah tidak
terambil (Gambar 26C).
12. Masukkan serum ke dalam cryotube 2 ml,
13. Lakukan pengulangan sampai serum terambil seluruhnya, kemudian seal dengan
parafilm (Gambar 26D).
80
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
A B C
D E
14. Tempel stiker Kode Wilayah dan label Nomor Urut Tikus pada dinding vial. (Gambar
26E) kemudian seal dengan parafilm.
15. Isi kolom spesimen serum pada formulir koleksi tikus setelah serum berhasil dikoleksi.
16. Simpan sementara serum pada kardus styrofom yang sudah diisi gel pack.
17. Setelah proses laboratorium lapangan selesai, serum dipindahkan pada kulkas 4°C
menunggu penjemputan dari tim kabupaten (lihat Prosedur Pengepakan dan
Pengiriman).
18. Lanjutkan proses selanjutnya yaitu koleksi ektoparasit (lihat Prosedur Koleksi
Ektoparasit).
81
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
82
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
2. Cara kerja
1. Siapkan alat dan bahan koleksi ektoparasit serta Formulir Koleksi Tikus.
2. Tikus baik hidup maupun mati disisir dengan sikat sepatu berlawanan dengan arah
rambut (Gambar 27A). Setelah itu disisir dengan sisir serit searah dengan rambut.
3. Ektoparasit yang jatuh di baki dan menempel di sisir serit diambil menggunakan pinset
atau nippel dan dimasukkan kedalam vial kaca ulir berisi alkohol 70%. Jumlah alkohol
dalam vial kaca ulir sebanyak 2/3 volume vial11 (Gambar 27B).
4. Periksa dan ambil ektoparasit pada bagian telinga (Gambar 27C).
5. Satu vial berisi semua ektoparasit dari 1 tikus (Gambar 27D).
6. Beri label kertas berisi kode spesimen menggunakan pensil, masukkan dalam vial, isi
label sama dengan nomor pita dimo pada sampel tikus (Gambar 27E).
7. Tempelkan stiker label Kode Wilayah dan label nomor urut tikus pada dinding luar vial,
kemudian seal dengan parafilm.
8. Catat di Formulir Koleksi Tikus pada bagian koleksi ektoparasit setelah ektoparasit
berhasil dikoleksi.
83
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
A B C
D E
@ Yuli @ Yuli
84
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Dokumentasi foto dilakukan sebagai salah satu sarana dan alat bantu proses
identifikasi morfologi dari koleksi sampel tikus. Identifikasi dilakukan berdasarkan ukuran tubuh,
warna dan jenis rambut tikus. Penggunaan formalin dalam pembuatan awetan membuat warna
rambut berubah sehingga pengambilan dokumentasi koleksi sampel tertangkap sangat penting.
Dokumentasi foto, digunakan juga sebagai database yang dihasilkan Riset Khusus Vektor dan
Reservoir Penyakit. Dokumentasi foto dilakukan pada semua sampel tertangkap.
1. Dokumentasi Tikus
Dokumentasi sampel tikus diperlukan untuk mengkonfirmasi identifikasi spesies oleh tim
teknis pusat (B2P2VRP) setelah spesimen diterima di laboratorium. Dokumentasi diambil
setelah prosedur koleksi ektoparasit selesai
A. Alat dan bahan
1) Kamera digital resolusi minimal 12 Megapiksel (MP).
2) Pengggaris
3) Sarung tangan nitril
4) Form T.04 (Koleksi Tikus)
5) Form TK.11 (Sampel)
B. Cara kerja
1) Siapkan kamera, Formulir Koleksi Tikus, dan label.
2) Seting kamera pada mode full auto
3) Letakkan spesimen diatas meja beralas perlak putih.
4) Bentangkan kaki depan dan kaki belakang ke samping.
5) Penajaman obyek: usahakan obyek difoto harus fokus, tidak kabur.
6) Letakkan penggaris di samping objek sehingga dapat dilihat ukuran objek.
7) Atur posisi sehingga label pita Dimo terfoto dengan jelas.
85
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
8) Pengambilan dokumentasi dilakukan pada bagian dorsal, ventral, lateral dan ekor
tikus. Hasil foto dicatat dalam Formulir Koleksi Tikus.
9) Pengambilan dokumentasi ekor dilakukan dengan posisi tikus miring.
10) Sesudah difoto dilanjutkan dengan prosedur identifikasi.
Dorsal Ventral
@ Yuli @ Yuli
Lateral Ekor
@ Yuli
@ Yuli
2. Dokumentasi Habitat
Dokumentasi habitat tempat pemasangan perangkap dilakukan dalam 2 mode, format
gambar (*.jpg) dan video (*.mov). Dokumentasi habitat dilakukan pada saat pemasangan
perangkap dan atau pemeriksaan serta pengambilan perangkap positif tikus pada semua
ekosistem. Hal utama yang harus diperhatikan dalam foto habitat adalah adanya objek di
dalam foto sebagai pembanding, agar mengetahui skala dari foto. Objek pembanding
tersebut bisa menggunakan objek manusia. Foto disimpan di dalam folder yang telah
ditentukan. Dokumentasi habitat dilakukan secara sampling dengan menggunakan patokan
vegetasi.
Dokumentasi video, atur kamera dalam mode merekam video kemudian tekan tombol
movie dan arahkan kamera pada tempat pemasangan perangkap. Gerakkan kamera
86
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
secara vertikal atau horisontal secara perlahan, rekam habitat pemasangan perangkap
dengan durasi video lebih dari 15 detik. Durasi video setiap ekosistem selama 5 – 10 menit.
@ Yuli
@ Yuli
3. Dokumentasi Kegiatan
Dokumentasi kegiatan berisi semua kegiatan dari TC, pengumpulan data dari persiapan,
pemasangan dan pengambilan perangkap, pemrosesan tikus dari anastesi sampai koleksi
awetan basah. Foto tim lengkap minimal satu kali untuk dokumentasi rikhus vektora
4. Penyimpanan Data
1. Merubah nama file asli kamera dengan nama:
a. Foto dorsal : D.kode wilayah + no.urut tikus. Contoh: D.33261T001
b. Foto ventral: V. kode wilayah + no.urut tikus. Contoh: V.33261T001
c. Foto ekor : E. kode wilayah + no.urut tikus. Contoh: E.33261T001
d. Foto lateral : L. kode wilayah + no.urut tikus. Contoh: L.33261T001
Nama file foto a-d dituliskan dalam formulir koleksi bagian dokumentasi sampel,
sedangkan nama file foto habitat dituliskan dalam kolom catatan pada formulir
koleksi
2. Transfer file foto dan video dari memory card ke hard disk dengan cara cut file dan paste
ke media simpan
3. Foto dan video habitat disimpan dalam folder per ekosistem: H. kode wilayah. Contoh:
H.33261
4. Penyimpanan hasil foto dan video dalam satu folder dengan nama folder adalah kode
wilayah (contoh: 33261 untuk Provinsi Jawa Tengah, Kabupaten Pekalongan, Ekosistem
Hutan Dekat Pemukiman).
87
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
5. Jangan melakukan editing menggunakan aplikasi edit foto seperti photoshop, karena
akan merubah identitas foto.
6. Setelah seluruh pengumpulan data selesai, copy folder-folder (jumlah: 6 folder) dalam 1
hard disk untuk dikirimkan ke B2P2VRP Salatiga.
7. Semua dokumentasi kegiatan selama pengumpalan data (Foto dan video kegiatan, tim
puldat) diserahkan ke tim teknis B2P2VRP
5. Hal yang Perlu Diperhatikan
1. Hindari suhu ekstrim (ketahanan mmc)
2. Hindari debu saat membuka lensa
3. Selalu bersihkan dengan cleaning kit (terutama setelah digunakan pada daerah pantai
maupun berdebu)
4. Hindari jatuh
5. Setelah selesai dari lapangan keluarkan dari tas, simpan dalam dry kardus untuk
menghindari jamur
6. Selalu back-up data setelah dari lapangan
88
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
89
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
B. Cara kerja
1. Siapkan formulir koleksi tikus (Form T.04) dan (Form TK.11) untuk mencatat hasil
pengukuran dan identifikasi.
2. Timbang berat badan (Gambar 32A).
3. Ukur panjang total (ujung hidung sampai ujung ekor) (Gambar 32B).
4. Mengukur panjang ekor (anus sampai ujung ekor) (Gambar 32C).
5. Apabila ekor putus, penulisan panjang total dan panjang ekor diberi tanda kurung
A B C
D E F
90
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
6. Mengukur panjang telapak kaki belakang, tumit sampai ujung jari tanpa cakar
(Gambar 32D).
7. Mengukur panjang telinga, dari pangkal sampai ujung daun telinga (Gambar 32E).
8. Mengukur panjang tengkorak menggunakan digital caliper dari moncong sampai
tengkuk (Gambar 30F).
9. Mencatat jumlah puting susu tikus betina, jumlah puting susu di bagian dada dan perut
(Dada (D) + Perut (P)). Contoh 3 + 3 = 10 artinya 3 pasang di bagian dada dan 3
pasang di bagian perut sama dengan 12 buah.13,14
91
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
92
Riset Khusus Vektor dan Reservoir Penyakit – Badan Litbang Kesehatan
Peserta dapat melakukan pengambilan jaringan telinga pada tikus dengan benar
B. Cara Kerja7
1. Siapkan Formulir Koleksi Tikus (Form T.04) dan Form Sampel (Form TK.11)
2. Siapkan puncher steril.
3. Desinfeksi tray dengan kapas alkohol 70%.
4. Letakkan tikus di atas tray
5. Letakkan puncher pada telinga kanan
6. Tekan punch dan putar searah jarum jam.
7. Masukkan jaringan telinga terpotong kedalam vialtube yang sudah berisi ethanol
96% dengan menggunakan pinset steril.
93
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
@ Yuli
@ Yuli
94
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
Peserta dapat melakukan pembedahan dan pengambilan organ paru dan ginjal dengan benar
95
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
6. Potongan kulit dan otot-otot di atas diafragma ditarik untuk mengekspos rongga perut
sepenuhnya.
A B
@ Yuli
96
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
4. Tambahkan RNA later ± 550 µl sampai paru terendam semua, usahakan saat
penambahan RNA later pipet tip dalam kondisi steril dan tidak boleh menyentuh
dinding cryotube.
5. Beri stiker label (tersedia dengan cetakan kode), ditempelkan di dinding cryotube
6. Seal cryotube menggunakan parafilm
7. Simpan sementara paru tikus pada kardus styrofoam yang sudah diisi gel pack.
8. Setelah proses laboratorium lapangan selesai, paru tikus dipindahkan pada kulkas
4°C menunggu penjemputan dari tim kabupaten (lihat Prosedur Pengepakan dan
Pengiriman).
9. Sterilkan alat bedah dengan dicelup alkohol 70%, kemudian keringkan dengan tisu
bersih setiap selesai pemrosesan 1 ekor tikus sebelum digunakan kembali.
10. Dilanjutkan dengan koleksi ginjal.
A B
@ Yuli
@ Yuli @ Yuli
97
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
(sisa bangkai, kapas/tisu bekas terkena darah dll) dan non-infeksius ditangani
sesuai Prosedur Penanganan Limbah.
5. Setelah selesai pengambilan organ ginjal, isi kolom koleksi ginjal pada Formulir
Koleksi Tikus
6. Dilanjutkan dengan koleksi awetan basah (Prosedur Pembuatan Awetan Basah)
A B C
98
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
Pembuatan spesimen awetan basah pada tikus berguna untuk konfirmasi identifikasi
spesies. Tikus terpilih untuk spesimen awetan basah sejumlah dua pasang per spesies (2 ekor
jantan dan 2 ekor betina). Apabila dalam proses identifikasi masih sampai genus (Rattus sp)
atau konfirmasi (Rattus cf. tanezumi) juga dibuat awetan basah. Tikus terpilih tersebut harus
dalam kondisi utuh.
B. Cara kerja
b.1. Pengawetan8
1. Siapkan formulir koleksi kelelawar (form T.04) dan (form TK. 11)
2. Gunakan masker Masker 3M 7502 dan goggles
3. Siapkan formaldehyde ±10%, pengenceran dilakukan dengan mencampur formaldehyde
dan air dengan perbandingan 1 formaldehyde 37% : 3 air.
4. Pilih tikus untuk dijadikan awetan basah sesuai kriteria awetan basah (dua pasang per
spesies, spesies konfirmasi dan identifikasi masih sampai tingkat genus)
5. Masukkan kapas ke dalam mulut tikus untuk menjaga posisi mulut tetap terbuka.
99
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
1. Fiksasi Bagian-bagian tubuh tikus yang berotot tebal seperti otak, organ bagian
dalam/dada, lengan, paha, dan punggung dengan disuntik formaldehyde ±10%,
sampai jenuh.
@ Yuli @ Yuli
100
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
b.2. Pelabelan
Pelabelan pada spesimen awetan basah terdiri dari 2:
1. Mengikatkan label spesimen (kertas kalkir) Jika belum mengetahui spesies cukup
ditulis misalnya Rattus sp, Bunomys sp, dll.
2. Label dari pita dimo yang telah dicetak (menggunakan mesin pencetak pita dimo)
dan dipasang pada proses koleksi darah berisi kode wilayah dan no.urut tikus.
b3. Pengiriman
Pengiriman awetan basah dilakukan per sepuluh hari pengumpulan data, apabila ada
spesimen yang belum memenuhi persyaratan awetan basah dapat dikirimkan pada
pengiriman berikutnya
101
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
102
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
1. Jas laboratorium
2. Sarung tangan nitril
3. Masker
4. Sepatu boot
5. Tissue towel
6. Alkohol 70%
7. Kantong plastik hitam
8. Plastik biohazard
9. Sharp safety box
10. Form TK.08 (form berita acara serah terima limbah).
11. Form TK.09 (form berita acara pemusnahan limbah)
12. Selotip
13. Sekop
Cara Kerja
103
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
Gambar 40. Kantong plastik hitam, plastik biohazard, dan sharp safety box
3. Tempatkan 1 buah sharp safety box dekat dengan tempat pengambilan darah (nampan
1). Limbah benda tajam (syringe, needles, dimasukkan ke dalam sharps safety box).
Jika sudah terisi ¾ bagian, tutup sharp safety container dan ganti dengan yang baru.
4. Tempelkan masing – masing 1 buah plastik biohazard pada tepi meja pemrosesan (di
antara nampan 2 dan 3, di dekat nampan 4, dan di dekat nampan 5) untuk menampung
limbah infeksius non benda tajam (Contoh: sarung tangan, kapas, tisu, dan lain-lain) .
5. Ikat erat plastik biohazard jika sudah penuh dengan menggunakan tali dan amankan
dengan isolasi. Disinfeksi dengan menggunakan alkohol 70%.
6. Tempelkan 1 kantong plastik hitam di dekat tempat pengambilan organ ginjal (nampan
4) untuk menampung limbah organ dan karkas tikus.
7. Ikat erat kantong plastik hitam dengan isolasi jika sudah penuh dengan menggunakan
tali dan amankan dengan isolasi. Disinfeksi dengan menggunakan alkohol 70%.
8. Setelah selesai melakukan pemoresan spesimen, meja yang digunakan sebagai tempat
pengambilan spesimen dibersihkan terlebih dahulu dengan menggunakan towel tissue
104
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
yang sudah dibasahi alkohol 70% dan mengusap seluruh meja lalu biarkan sampai
kering.
9. Sebelum limbah diserahkan kepada PJO atau ditimbun, limbah ditempatkan pada
tempat yang aman, jauh dari jangkauan masyarakat ataupun hewan.
10. Saat penyerahan limbah infeksius benda tajam dan limbah non infeksius non benda
tajam kepada PJO Kabupaten, pengisian form TK.08 dan form TK.09 wajib dilakukan.
11. Lembar form TK.08 (form berita acara serah terima limbah) dan form TK.09 (form
pemusnahan limbah yang berwarna putih diserahkan kepada tim teknis yang
melakukan supervisi, warna hijau diserahkan kepada PJO kabupaten, dan warna merah
disimpan oleh Ketua Tim Pengumpul Data.
105
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
106
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
Spesimen Rikhus Reservoir 2017 berupa serum (tikus dan kelelawar), organ ginjal
(tikus), organ paru (tikus), swab trakhea (kelelawar), ektoparasit (tikus dan kelelawar), punch
jaringan (tikus dan kelelawar) dan awetan basah (tikus dan kelelawar). Masing-masing
spesimen tersebut memiliki metode penyimpanan dan pengepakan yang berbeda.
Spesimen serum dan swab trakhea kelelawar digunakan untuk deteksi agen penyakit
berupa virus. Oleh karena itu, untuk meminimalisir kerusakan antibodi pada serum serta
kerusakan RNA virus pada VTM, maka proses penyimpanan sementara serta metode
pengepakan spesimen ini harus mengikuti standar cold chain. Spesimen lainnya seperti
ektoparasit, punch jaringan dan spesimen awetan basah tidak memerlukan standard cold chain.
Semua spesimen dikirimkan ke Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Vektor dan
Reservoir Penyakit (B2P2VRP), Salatiga.
1. Proses Persiapan
a. Pembekuan Gel pack
Sebelum digunakan, semua gel pack harus dibekukan terlebih dahulu di freezer
minimal 12 jam. Semakin lama dibekukan, gel pack semakin baik dalam menyimpan
dingin. Pada saat proses di laboratorium lapangan, ambil 3-5 buah gel pack dan
masukkan dalam kardus styrofoam. Gunakan wadah ini sebagai penyimpanan
sementara serum selama di laboratorium lapangan. Sisanya digunakan untuk
mengganti gel pack yang mulai mencair apabila diperlukan.
b. Mengisi Formulir TK.05 (Form Pengiriman dan Penerimaan Spesimen) dan Formulir
TK.11 (Form spesimen).
Formulir TK.05 dan TK.11 dimasukkan ke dalam paket pengiriman.
107
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
Cara Kerja:
1) Personel pengepak spesimen menggunakan sarung tangan nitril
2) Cryotube serum tikus maupun kelelawar, tube swab trakea dan paru-paru dipastikan
telah dilabel dan disegel parafilm.
3) Cryotube serum dan tube paru-paru dimasukkan dalam cardboard cryobox, per box
untuk satu jenis spesimen per titik. Beri tulisan jenis spesimen dan kode wilayah
pada tutup cardboard cryobox. Masukkan cardboard cryobox dalam plastik klip
4) Untuk spesimen swab trachea, tube disatukan dengan diikat karet kemudian
dimasukkan plastik klip.
5) Susun cardboard cryobox (3 buah), swab trachea dan gel pack beku ke dalam
styrofoam box.
6) Masukkan termometer
7) Masukkan Form TK.05 dan Form TK.11 (lembar untuk tim teknis) yang telah
dimasukkan plastik ke dalam styrofoam box.
108
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
8) Tutup kardus styrofoam dengan benar. Tempel stiker penerima dan stiker pengirim
berisi alamat tujuan dan identitas pengirim (nama & alamat), dan identitas sampel
(provinsi, kabupaten, & ekosistem), lapisi dengan lakban bening. Tempel stiker logo
rikhus, stiker logo Kemenkes, stiker fragile, dan stiker jangan dibalik.
9) Paket diserahkan kepada PJO kabupaten untuk disimpan sementara di lemari
pendingin sebelum diambil oleh tim teknis pusat (B2P2VRP).
Catatan penting khusus spesimen yang mengikuti standard cold chain (serum tikus
dan kelelawar, Paru paru tikus dan, swab trakea):
109
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
Cara kerja:
a. Personel pengepak menggunakan sarung tangan nitril.
b. Spesimen ektoparasit dan ginjal: Pastikan telah dilabel dan disegel dengan
parafilm, kemudian dimasukkan dalam kardus packing bersekat per jenis spesimen
(ginjal tikus, ektoparasit tikus, ektoparasit kelelawar) dan per titik. Beri keterangan
jenis spesimen dan kode wilayah pada tutup kardus.
c. Spesimen punch jaringan: Pastikan telah dilabel dan disegel parafilm, kemudian
dimasukkan dalam cardboard cryobox (tikus & kelelawar bisa dijadikan satu per
titik). Beri keterangan jenis spesimen dan kode wilayah pada tutup kardus.
d. Susun semua spesimen dalam styrofoam box
e. Masukkan Form TK.05 dan TK.11 (lembar untuk tim teknis) dalam plastik,
kemudian sertakan ke dalam box.
110
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
f. Styrofoam box direkatkan dengan lakban coklat kemudian tulis kode wilayah,
tempel stiker penerima dan stiker pengirim, stiker logo rikhus, stiker logo
Kemenkes, stiker fragile, dan stiker jangan dibalik.
Cara kerja:
a. Personel pengepak menggunakan sarung tangan nitril, masker 7502, dan goggles.
b. Spesimen awetan basah yang telah ditiriskan dari formalin dan dibalut kain kasa
dimasukkan dalam plastik klip dan diikat. Perlakuan ini dilakukan pada tiap ekor
tikus maupun kelelawar.
c. Masukkan semua spesimen dalam drum plastik. Awetan basah tikus dan kelelawar
dipisah pada drum yang berbeda. Satu drum digunakan untuk 2 titik ekosistem.
d. Masukkan pula Form TK.05 dan Form TK.11 (lembar untuk tim teknis) yang telah
dimasukkan ke dalam plastik, lalu tutup erat.
111
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
e. Pada tutup canoe drum, beri keterangan jenis spesimen dan kode wilayah.
Tempelkan stiker penerima dan pengirim.
f. Pada dinding luar canoe drum, tempel stiker logo rikhus dan stiker logo Kemenkes,
stiker fragile, dan stiker jangan dibalik.
g. Spesimen dikirim setelah pengambilan sampel di dua titik dalam satu ekosistem
selesai.
5. Pengepakan formulir
a. Bahan dan alat
1) Form T.01 /K.01 (Formulir Ekosistem Tikus /Kelelawar)
2) Form TK.02 (Formulir Koordinat GPS)
3) Form T.03 /K.03 (Formulir Lokasi Penangkapan Tikus/Kelelawar)
4) Form K.04 /K.04 (Formulir Koleksi Tikus /Kelelawar)
5) Form TK.08 (Berita Acara Serah Terima Limbah)
6) Form TK.09 (Berita Acara Pemusnahan Limbah)
7) Form TK.10 (Berita Acara Serah Terima Spesimen)
8) Map plastik
9) Plastik tebal
10) Lakban
b. Cara kerja
1) Pastikan ketua tim telah melakukan verifikasi internal pada semua form.
2) Satukan formulir menurut jenisnya (dibedakan antara tikus /kelelawar) dalam map
plastik. Satu map plastik untuk semua form dalam satu titik ekosistem.
3) Tulis kode wilayah pada plastik.
4) Masukkan semua form (map) ke dalam plastik tebal.
5) Tempelkan stiker penerima dan pengirim. Tempel stiker logo Rikhus dan logo
Kemenkes.
6) Rekatkan dengan lakban bening
7) Paket siap dikirimkan. Semua formulir yang disebutkan dalam alat bahan dipak dan
dikirim satu kali setelah seluruh titik pengumpulan data berakhir.
112
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
6. Proses Pengiriman
Proses pengiriman dilakukan oleh personel penanggung jawab pengiriman
sampel, melalui agen ekspedisi dengan membawa svena keterangan dari pusat apabila
diperlukan.
1. Paket cold chain tidak dikirimkan, melainkan akan dijemput oleh tim teknis pusat.
Ketua tim berkoordinasi dengan Penanggung Jawab Operasional (PJO
kabupaten) untuk mengambil paket dari lokasi puldat ke penyimpanan
sementara di lemari pendingin propinsi.
2. Paket non-cold chain dikirimkan setiap selesai satu titik ekosistem. Paket diambil
bersamaan dengan pengambilan paket cold chain, kemudian PJO bertanggung
jawab mengirimkan paket menggunakan ekspedisi.
3. Paket C (spesimen awetan basah) dikirimkan selama tiga kali pengiriman (tiap 2
titik pengumpulan data).
4. Paket D (formulir) dikirimkan sekali pada akhir pengumpulan data.
Paket Semua spesimen Rikhus 2016 dikirimkan ke alamat kantor B2P2VRP Salatiga.
Alamat tujuan:
PAKET RESERVOIR
KEPADA YTH.
KEPALA BALAI BESAR PENELITIAN DAN PENGEMBANGAN
VEKTOR DAN RESERVOIR PENYAKIT (B2P2VRP)
Pengirim :
PENGIRIM
NAMA :
NO. TELP/ HP :
ALAMAT : PROVINSI .................... .......
KAB/KOTA............................
TIPE EKOSISTEM....................
113
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
114
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
115
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
I. PENGENALAN TEMPAT
1. Rincian Provinsi
Isi dengan kode provinsi, 2 digit angka.
2. Rincian Side
Lingkari nomor side kemudian isikan ke dalam kolom yang tersedia. Nomor “1” untuk
side A, nomor “2” untuk side B, atau nomor “3” untuk side C.
3. Rincian Kabupaten/Kota
Isi dengan kode kabupaten/kota, 2 digit angka.
4. Rincian Kecamatan
Isi dengan kode kecamatan, 3 digit angka.
5. Rincian Desa/Kelurahan
Isi dengan kode Desa/Kelurahan, 3 digit angka.
6. Rincian Klasifikasi Desa/Kelurahan
Lingkari urutan klasifikasi Desa/Kelurahan kemudian isikan di kolom sebelah
kanannya. Klasifikasi Perkotaan dengan kode “1” atau Pedesaan dengan kode “2”.
II. KETERANGAN EKOSISTEM
1. Rincian Jenis Ekosistem
Lingkari urutan nomor klasifikasi ekosistem kemudian isikan pada kolom yang tersedia
di sebelah kanannya. Hutan dekat pemukiman dengan kode “1”, Hutan jauh
pemukiman dengan kode “2”, Non Hutan dekat pemukiman dengan kode “3”, Non
hutan jauh pemukiman dengan kode “4”, Pantai dekat pemukiman dengan kode “5",
atau Pantai jauh pemukiman dengan kode “6”.
2. Rincian Ketinggian
Isi ketinggian sesuai dengan hasil pengukuran altitude pada GPS (dpl), 4 digit angka.
3. Rincian Topografi
Lingkari urutan nomor klasifikasi topografi kemudian isikan pada kolom yang tersedia
di sebelah kanannya. Klasifikasi topografi Pegunungan/dataran tinggi dengan kode “1”
atau Lembah/dataran rendah dengan kode “2”.
a. Pegunungan/ datran tinggi merupakan bagian permukaan bumi yang mendatar dan
terletak pada ketinggian lebih dari 600 m di atas permukaan laut.
b. Lembah/ dataran rendah merupakan bagian permukaan bumi di daerah rendah
yang relatif rata dan biasanya berada di kaki gunung.
116
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
IV. CATATAN
Digunakan untuk memberikan keterangan tambahan terkait ekosistem atau hal-hal penting
di lokasi pengumpulan data.
I. PENGENALAN TEMPAT
Isikan dengan kode Provinsi (2 digit), kode Kabupaten/Kota (2 digit), dan kode jenis
Ekosistem (1 digit) sesuai dengan lokasi penangkapan.
II. KETERANGAN PENGUMPUL DATA
1. Rincian Nama Pengumpul Data
Isi dengan nama lengkap petugas pengumpul data yang melakukan pengambilan titik
koordinat.
117
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
118
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
d. S: seconds, isikan detik lokasi yang dimaksud sesuai dengan yang ditunjukkan
pada GPS.
Contohnya: 6° 10′ 12.9” Lintang Selatan (LS) atau 6° 10′ 12.9” South (S)
Membacanya: “Enam derajat, sepuluh menit, dua belas koma sembilan detik
Lintang Selatan.
3. Rincian Bujur/Longitude
e. W/E: Isikan “W” untuk posisi garis bujur barat, atau “E” untuk posisi garis bujur
timur.
f. D: Degree/derajat, isikan derajat lokasi yang dimaksud sesuai dengan yang
ditunjukkan pada GPS.
g. M: Minutes, isikan menit lokasi yang dimaksud sesuai dengan yang ditunjukkan
pada GPS.
h. S: seconds, isikan detik lokasi yang dimaksud sesuai dengan yang ditunjukkan
pada GPS.
Contohnya: 106° 49′ 27.0” Bujur Timur (BT) atau 106° 49′ 27.0” West (W)
Membacanya: “Seratus enam derajat, empat puluh sembilan menit, dua puluh
tujuh koma nol, Bujur Timur”
4. Rincian Elevasi
Menunjukkan tingkat elevasi/ ketinggian saat menggunakan GPS. Isikan ketinggian
lokasi sesuai yang ditunjukkan pada GPS.
5. Rincian Kode sampel
Isikan dengan kode sampel yang diperoleh, misalnya 33061T001.
IV. CATATAN
Digunakan untuk memberikan keterangan tambahan terkait hal-hal penting di lokasi
pengambilan titik koordinat.
119
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
122
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
IV. CATATAN
Digunakan untuk memberikan keterangan tambahan terkait hal-hal penting di lokasi
penangkapan.
Pengisian formulir koleksi tikus dilakukan pada saat pemrosesan tikus di laboratorium
lapangan. Data yang sudah ada pada formulir selanjutnya diinput ke dalam program entri.
I. PENGENALAN TEMPAT
Diisi sesuai kode wilayah Provinsi (2 digit), kode Kabupaten/Kota (2 digit), kode Ekosistem
(1 digit), kode Lokasi Penangkapan (2 digit), nomor perangkap dan nomor urut spesimen
diisi sesuai urutan spesimen yang didapat diawali huruf “T” untuk jenis spesimen tikus,
selanjutnya nomor urut spesimen (3 digit angka).
II. KOORDINAT PERANGKAP
Lingkari nomor “2” Bujur Timur, kemudian isikan koordinat lokasi perangkap dipasang
sesuai dengan titik GPS. Lingkari nomor “1” untuk koordinat Lintang Utara atau nomor “2”
untuk koordinat Lintang Selatan, kemudian isikan koordinat lokasi perangkap dipasang
sesuai dengan titik GPS.
Isikan waktu dimulainya proses ekstrasi kelelawar.
III. KOLEKSI
Rincian Stiker Nomor Koleksi Tikus
Tempel stiker nomor koleksi tikus pada kolom yang bertuliskan “tempel stiker di sini”.
A. Koleksi Spesimen 1
1. Koleksi spesimen serum
Lingkari angka “1” jika spesimen serum berhasil dilakukan, kemudian tuliskan pada
kotak, dan lingkari angka “2” jika spesimen serum tidak berhasil didapatkan dan
tuliskan angka pada kotak.
2. Koleksi spesimen ektoparasit
Lingkari angka “1” jika spesimen ektoparasit berhasil dilakukan, kemudian tuliskan
pada kotak. dan lingkari angka “2” jika spesimen ektoparasit tidak berhasil
didapatkan dan tuliskan angka pada kotak.
123
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
124
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
125
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
126
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
C. KOLEKSI SPESIMEN 2
1. Rincian Punch Telinga
Lingkari nomor “1” apabila spesimen punch telinga berhasil dikoleksi, atau nomor “2”
jika punch telinga tidak dikoleksi. Kemudian tuliskan nomor yang telah dilingkari pada
kolom isian.
2. Rincian Paru-paru (RNA later)
Lingkari nomor “1” apabila spesimen paru-paru dalam RNA later berhasil dikoleksi,
atau nomor “2” jika spesimen paru-paru dalam RNA later tidak dikoleksi. Kemudian
tuliskan nomor yang telah dilingkari pada kolom isian.
3. Rincian Ginjal
Lingkari nomor “1” apabila spesimen ginjal berhasil dikoleksi, atau nomor “2” jika
spesimen ginjal tidak dikoleksi. Kemudian tuliskan nomor yang telah dilingkari pada
kolom isian.
4. Rincian Awetan Basah
Lingkari nomor “1” apabila spesimen dijadikan awetan basah, atau nomor “2” jika
spesimen tidak dijadikan awetan basah. Kemudian tuliskan nomor yang telah
dilingkari pada kolom isian.
127
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
V. CATATAN
Diisi dengan keterangan singkat morfologi spesimen atau keterangan apabila spesimen
tidak berhasil dikumpulkan atau jumlahnya kurang.
129
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
130
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
131
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
7. Isikan nama petugas penanggung jawab operasional yang menerima limbah dari ketua
tim.
8. Isikan nama kabupaten dan propinsi tempat tim melakukan pengumpulan data.
9. Isikan hari, tanggal dilakukannya serah terima limbah.
10. Isikan jam (waktu) dilakukannya serah terima limbah.
11. Iskan tempat dilakukannnya serah terima limbah.
12. Isikan jenis dan jumlah limbah yang diserah terimakan.
13. Isikan nama terang dan tanda tangan dari ketua tim pengumpulan data serta
penanggung jawab operasional.
14. Isikan nama terang dan tanda tangan dari saksi-saksi serah terima limbah.
7. Isikan nama petugas penanggung jawab operasional yang menerima spesimen dari
ketua tim.
8. Isikan nama kabupaten dan propinsi tempat tim melakukan pengumpulan data.
9. Isikan hari, tanggal dilakukannya serah terima spesimen.
10. Isikan jam (waktu) dilakukannya serah terima spesimen.
11. Iskan tempat dilakukannnya serah terima spesimen.
12. Isikan jenis dan jumlah spesimen yang diserah terimakan.
13. Isikan nama terang dan tanda tangan dari ketua tim pengumpulan data serta
penanggung jawab operasional.
14. Isikan nama terang dan tanda tangan dari saksi-saksi serah terima spesimen.
I. Pengenalan Tempat
1. Rincian Kode Provinsi
Diisi kode Provinsi lokasi penangkapan (2 digit).
2. Rincian Kode Kabupaten
Diisi Kode Kabupaten lokasi penangkapan (2 digit).
3. Rincian Kode Jenis Ekosistem
Diisi sesuai dengan kode jenis ekosistem di lokasi penangkapan (1 digit).
4. Rincian Kode Sampel
Diisi sesuai dengan kode sampel yang ada (3 digit). Misal sampel serum tikus T001
atau serum kelelawar K001.
II. Keterangan Pengiriman Sampel
1. Rincian Nama Spesies
Diisi nama spesies sampel yang telah terkonfirmasi sesuai kunci identifikasi.
2. Rincian Jenis Sampel
Dilingkari salah satu nomor sesuai dengan jenis sampel yang akan dikirim, kemudian
isikan nomor sampel tersebut pada kolom yang tersedia. Untuk nomor jenis sampel
serum tikus yaitu “1”, “2” ektoparasit tikus, “3” paru paru tikus, “4” ginjal tikus, “5” awetan
basah tikus, “6” punch telinga tikus, “7” swab kelelawar, “8” serum kelelawar, “9”
ektoparasit kelelawar, “10” awetan basah kelelawar, atau “11” punch sayap kelelawar.
Catatan: untuk jenis sampel serum tikus dan kelelawar pengisian formulir lanjut ke
pertanyaan nomor 3. Jenis sampel non serum tidak perlu mengisi pertanyaan nomer 3.
133
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
134
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
Semua spesimen hasil pengumpulan data meliputi serum, ginjal, ektoparasit, punch
jaringan, dan awetan basah harus diberi kode (dengan stiker maupun manual). Setiap jenis
spesimen yang berasal dari satu individu memiliki nomor kode yang sama.
Kode spesimen diisi berdasarkan kode wilayah dan nomor koleksi. Pengkodean spesimen
dijabarkan sebagai berikut:
1 2 3 4 5
Keterangan:
135
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
136
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
DAFTAR PUSTAKA
137
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
138
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
139
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
140
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
141
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
142
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
143
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
144
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
145
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
146
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
147
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
148
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
149
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
150
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
151
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
152
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
153
Pedoman Koleksi Spesimen dan Data di Lapangan
Catatan.
154