get press
MIKROBIOLOGI
Penulis:
Siti Nur Aisyah Jamil
Ayu Wijaya
Eny Sendra
Indas Wari Rahman
Royani Chairiyah
Almira Ulimaz
Tri Putri Wahyuni
Inherni Marti Abna
Raida Amelia Ifadah
Lindawati
ISBN: 978-623-5383-61-3
Website: Www.Globaleksekutifteknologi.co.id
Email: Globaleksekutifteknologi@Gmail.Com
i
DAFTAR ISI
KATA PENGANTAR ................................................................................................................... i
DAFTAR ISI.................................................................................................................................... ii
DAFTAR GAMBAR ..................................................................................................................... v
BAB 1 KONSEP DASAR MIKROBIOLOGI DAN
PARASITOLOGI .............................................................................................1
1.1 Mikrobiologi ..................................................................................................1
1.1.1 Sejarah Mikrobiologi .......................................................................2
1.1.2 Struktur Mikroorganisme dan Ukuran ................................4
1.1.3 Pertumbuhan Mikroorganisme ................................................5
1.2 Parasitologi ....................................................................................................8
1.2.1 Parasitologi Medis ............................................................................11
BAB 2 BAKTERIOLOGI DASAR ..............................................................16
2.1 Pendahuluan .................................................................................................16
2.2 Taksonomi dan Klasifikasi Bakteri...................................................16
2.3 Morfologi dan Struktur Bakteri ............................................23
2.4 Penggolongan Bakteri Berdasarkan Struktur Dinding
Sel.........................................................................................................................34
2.5 Fisiologi dan Metabolisme Bakteri................................................35
BAB 3 KONSEP DASAR PENCEGAHAN DAN
PENGENDALIAN INFEKSI ..........................................................42
3.1 Pendahuluan .................................................................................................42
3.1.1 Definisi Infeksi ....................................................................................43
BAB 4 FLORA NORMAL DAN MIKROORGANISME ......................59
4.1 Pendahuluan .................................................................................................59
4.2 Asal Usul Flora Normal ...........................................................................60
4.3 Sifat Flora Normal ......................................................................................61
4.4 Peran Flora Normal...................................................................................64
4.5 Flora Normal pada Bagian Tubuh.....................................................65
4.5.1 Mikrobiota Normal pada Kulit ..................................................67
4.5.2 Mikrobiota Normal pada Saluran Pernapasan ................67
4.5.3 Mikrobiota Normal pada Saluran Usus ................................68
4.5.4 Mikrobiota Normal pada Saluran Genitourinari.............70
BAB 5 PENYAKIT PARASIT DALAM KEBIDANAN .......................73
5.1 Pendahuluan .................................................................................................73
5.2 Nematoda Usus...........................................................................................73
ii
5.2.1 Non STH Dan Nematoda Darah ................................................79
5.2.2 Protozoa Usus dan Trichomonas Vaginalis ........................79
2.2.3 Cestoda dan Trematoda ................................................................82
5.2.4 Ascaris lumbricoides (Cacing gelang) .....................................84
5.2.5 Trichuris trichiura (Cacing cambuk) ......................................85
5.2.6 Malaria ....................................................................................................86
5.2.7 Toxoplasma ..........................................................................................87
5.2.8 Trypanosoma, Leishmania ..........................................................88
5.2.9 Arthropoda ...........................................................................................89
BAB 6 DASAR VIROLOGI DAN MIKOLOGI .......................................93
6.1 Pendahuluan .................................................................................................93
6.2 Dasar Virologi ...............................................................................................94
6.2.1 Sejarah Penemuan Virus...............................................................95
6.2.2 Karakteristik Virus ...........................................................................95
6.2.3 Struktur Tubuh Virus .....................................................................96
6.2.4 Reproduksi Virus ..............................................................................98
6.2.5 Kurva Pertumbuhan Satu Langkah ........................................100
6.3 Dasar Mikologi .............................................................................................101
6.3.1 Definisi Fungi.......................................................................................101
6.3.2 Struktur Tubuh Fungi.....................................................................102
6.3.3 Reproduksi Fungi..............................................................................105
6.3.4 Manfaat Fungi .....................................................................................110
6.3.4 Dampak Negatif Fungi....................................................................111
BAB 7 METABOLISME MIKROORGANISME....................................116
7.1 Pendahuluan .................................................................................................116
2.2 Anabolisme dan Katabolisme..............................................................116
7.2.1 Anabolisme ...........................................................................................116
7.2.2 Katabolisme .........................................................................................117
7.3 Produksi Energi Oleh Mikroorganisme .........................................118
7.3.1 Respirasi.................................................................................................118
7.3.2 Fotosintesis ..........................................................................................120
BAB 8 NUTRISI PERTUMBUHAN MIKROBA ..................................125
8.1 Pendahuluan .................................................................................................125
8.2 Faktor-Faktor Yang Mempengaruhi Pertumbuhan
Mikroba ............................................................................................................126
8.3 Media Pertumbuhan Mikroba.............................................................130
8.4 Bahan Pembuatan Media .......................................................................131
iii
8.5 Macam-Macam Media..............................................................................132
8.6 Jenis-Jenis Media .........................................................................................134
BAB 9 PERTUMBUHAN MIKROORGANISME .................................141
9.1 Pendahuluan .................................................................................................141
9.2 Fase Pertumbuhan Mikroorganisme ..............................................141
9.2.1 Fase Lag (Adaptasi) .........................................................................142
9.2.2 Fase Log (Eksponensial) ...............................................................143
9.2.3 Fase Stasioner (Statis)...................................................................143
9.2.4 Fase Death (Kematian) .................................................................143
9.3 Kecepatan Pertumbuhan dan Waktu Generasi.........................144
9.4.1 Perhitungan Kecepatan Pertunbuhan .................................144
9.4.2 Perhitungan Waktu Generasi.....................................................144
9.5 Pengukuran Pertumbuhan Mikroorganisme.............................145
9.5.1 Pengukuran Pertumbuhan Mikroorganisme secara
Langsung................................................................................................146
9.5.2 Pengukuran Pertumbuhan Mikroorganisme secara
Tidak Langsung..................................................................................148
9.6 Faktor-Faktor Pertumbuhan Mikroorganisme.........................149
9.6.1 Faktor Kimia Pertumbuhan Mikroorganisme..................149
9.6.2 Faktor Fisik Pertumbuhan Mikroorganisme ....................151
BAB 10 ANALISA PEMERIKSAAN MIKROBIOLOGI .....................157
10.1. Latar Belakang .........................................................................................157
10.2 Pemeriksaan Mikroba di Udara ......................................................158
10.3 Analisis Most Probable Number (MPN) Coliform...................161
10.4 Pemeriksaan Angka Lempeng Total Bakteri .........................167
BIODATA PENULIS
iv
DAFTAR GAMBAR
v
BAB 1
KONSEP DASAR MIKROBIOLOGI DAN
PARASITOLOGI
Oleh Siti Nur Aisyah Jamil
1.1 Mikrobiologi
Mikroorganisme atau yang lebih dikenal dengan istilah
mikroba merupakan organisme hidup yang berukuran sangat kecil
(diameter kurang dari 0,1 mm) dan hanya dapat diamati dengan
menggunakan mikroskop. Berdasarkan susunan selnya,
mikroorganisme ada yang tersusun atas satu sel disebut uniseluler
dan tersusun beberapa sel disebut multisesluler. Mikroorganisme
terdiri dari bakteri, virus, jamur, dan protozoa (Rizqah,
Setyaningsih and Mayarni, 2019).
Mikrobiologi berasal dari kata dalam Bahasa Yunani yaitu
mikros yang berarti kecil, bios berarti hidup, dan logos berarti ilmu
sehingga mikrobiologi merupakan suatu ilmu tentang organisme
hidup yang berukuran mikroskopis. Mikrobiologi mempelajari
berbagai segi dari mikroba mulai dari di mana keberadaannya, ciri-
cirinya, pertumbuhannya, perkembangbiakannya, kekerabatan
antara sesamanya maupun organisme lain, pengendaliannya, dan
peranannya dalam kehidupan manusia (Putri, Sukini and Yodong,
2017).
Mikrobiologi dimulai sejak ditemukannya mikroskop dan
berkembang menjadi ilmu yang multidisipliner. Dalam
penerapannya di masa kini, mikrobiologi tidak dapat dipisahkan
dengan ilmu lain dalam aplikasinya di bidang farmasi, kedokteran,
teknik kimia, arkeologi, pertanian, gizi dan kesehatan, dan pangan.
Mikrobiologi erat kaitannya dengan kehidupan manusia, sebagian
bermanfaat dan menunjang kehidupan dan yang lain dapat
menyebabkan penyakit (Fibriana, 2016).
1
1.1.1 Sejarah Mikrobiologi
Sejarah mikroorganisme telah ada di bumi selama 4000 juta
tahun yang lalu. Dimulai ketika Antoni van Leeuwenhoek (1632-
1723) menemukan adanya kehidupan pada setetes air danau yang
diamati menggunakan lensa gelas. Antoni van Leewenhoek
merupakan orang pertama yang melaporkan pengamatannya
dengan keterangan dan gambar yang teliti. Pengamatan dilakukan
dengan mikroskop dan lensa yang dibuatnya dengan pembesaran
tertinggi hanya 200 sampai 300 kali (S. Hogg, 2005).
Pada tahun 1683 Antoni mengirimkan gambar pertamanya
tentang bakteri, organisme ini didapat dalam suspensi yang diambil
dari sela-sela giginya. Antoni membuat sketsa bakteri dengan
bentuk seperti bola atau kini disebut kokus, silindris atau batang
(saat ini disebut basilus), dan spiral (spirilum). Walaupun sejak
masa Antoni telah terjadi banyak perubahan dalam mikroskopi,
sampai saat ini kita masih mengenal ketiga bentuk umum yang
sama pada bakteri (Putri, Sukini and Yodong, 2017).
Bertahun-tahun setelah pengamatan Antoni van
Leeuwenhoek, banyak observasi lain yang menegaskan hasil
pengamatan van Leeuwenhoek, tetapi peningkatan tentang
pemahaman sifat dan keuntungan mikroorganisme berjalan sangat
lambat sampai 150 tahun berikutnya. Perkembangan mikroskop
berkembang pesat pada abad ke-19, keingintahuan manusia akan
mikroorganisme mulailah berkembang. Hingga pertengahan abad
ke-19 banyak ilmuwan dan filosuf percaya bahwa makhluk hidup
muncul secara spontan dari benda tak hidup. Para ilmuwan dan
filosuf tersebut meyakini bahwa belatung dapat muncul dari
material busuk, ular dan tikus dapat lahir dari tanah lembab, dan
lalat dapat timbul dari pupuk. Namun, teori generatio spontania
terbantahkan setelah seorang ilmuwan Italian, Fransisco Redi
(1626-1697) mendemonstrasikan penemuannya bahwa belatung
bukan berasal dari daging busuk. Hasil penemuan Redi
menunjukkan bahwa daging busuk pada tabung yang tidak tertutup
terdapat belatung, sedangkan pada tabung yang tertutup tidak
ditemukan belatung (S. Hogg, 2005).
Teori biogenesis dikemukakan oleh seorang ilmuwan
Jerman Rudolf Virchow yang menyatakan bahwa semua sel hidup
2
berasal dari sel hidup yang ada sebelumnya. Louis Pasteur ilmuwan
Perancis mendukung teori ini pada tahun 1861. Louis Pasteur
menjelaskan bahwa mikroorganisme ada di udara dan dapat
mengkontaminasi larutan steril, tetapi udara itu sendiri tidak dapat
menciptakan mikroorganisme. Dalam percobaannya, Pasteur
mengisi beberapa botol berleher pendek dengan kaldu sapi dan
kemudian mendidihkannya. Beberapa botol dibiarkan terbuka dan
kaldu dibiarkan dingin. Sementara beberapa botol lainnya ditutup
saat kaldu mendidih. Setelah dibiarkan beberapa hari, pada botol
yang terbuka ditemukan banyak kontaminan mikroorganisme,
sedangkan pada botol yang tertutup tidak ditemukan
mikroorganisme. Dengan ini, Pasteur menunjukkan bahwa
mikroorganisme terdapat pada benda tak hidup, benda padat,
benda cair, maupun udara. Selain itu, Pasteur juga
mendemonstrasikan bagaimana mikroorganisme dapat
dimusnahkan oleh pemanasan. Metode pemanasan dapat
dirancang untuk memblok mikroorganisme terhadap lingkungan
yang mengandung nutrisi. Penemuan ini menjadi dasar teknik
aseptik yaitu metode pencegahan terhadap kontaminasi
mikroorganisme yang tidak dikehendaki (Ezemba and E.Ezeuko,
2012).
Seorang dokter berkebangsaan Jerman (1842-1910) Robert
Koch menemukan bakteri berbentuk Bacillus anthracis dalam
darah sapi yang mati karena penyakit anthraks. Kemudian, Koch
melakukan percobaan dengan menumbuhkan bakteri tersebut
pada media bernutrisi dan menyuntikkan bakteri tersebut pada
sapi yang sehat. Sapi menjadi sakit dan mati. Selanjutnya, Koch
mengisolasi bakteri darah sapi dan membandingkannya dengan
kultur bakteri yang sudah diisolasi lebih awal. Penemuan ini
membuktikan bahwa bakteri penyebab penyakit. Berdasarkan
penemuannya, Koch menjadi orang pertama yang menemukan
konsep hubungan antara penyakit menular dan mikroorganisme
yang dikenal dengan Postulat Koch. Menyusul penemuan ini, pada
tahun 1900-an, berbagai jenis kuman penyebab penyakit
penting telah dapat diketahui seperti Bacillus antracis,
Corynebacterium diptheriae, Salmonella thyposa, Neisseria
gonorrhoeae, Clostridium perfringens, Clostridium tetani, Sigela
3
dysentriae, Treponema pallidum, dan lain-lain (Putri, Sukini and
Yodong, 2017).
4
Ukuran mikroorganisme tergantung jenis dan fase pertumbuhan,
dan pengukurannya dilakukan dengan okuler mikrometer dan
obyek mikrometer sehingga setiap mikroorganisme memiliki
ukuran yang berbeda (Putri, Sukini and Yodong, 2017).
7
f. Fase menuju kematian
Pada fase ini sel bakteri mulai mengalami kematian
disebabkan karena nutrisi habis, energi cadangan di
dalam sel habis, dan zat racun semakin banyak.
g. Fase kematian
Pada fase ini sel akan mengalami kematian dipercepat
karena nutrisi sudah habis, energi cadangan di dalam sel
sudah habis, terjadi peningkatan zat racun yang akan
meracuni sel-sel bakteri.
1.2 Parasitologi
Parasitologi adalah bidang ilmu yang sangat berhubungan
dengan fenomena-fenomena ketergantungan satu organisme
dengan organisme lainnya. Ada pula yang menjelaskan bahwa
parasitologi merupakan ilmu yang mempelajari organisme yang
hidup untuk sementara atau menetap di dalam atau permukaan
organisme lain dengan maksud mengambil sebagian atau seluruh
kebutuhan makanannya serta mendapatkan perlindungan dari
organisme tersebut. Parasit adalah organisme yang hidupnya
mengambil makanan dan kebutuhan lainnya dari makhluk hidup
lain. Organisme yang mendukung parasit disebut host atau inang.
Hubungan timbal balik antara satu organisme dengan organisme
lain untuk kelangsungan hidupnya dengan merugikan salah satu
organisme disebut parasitisme. Tergantung dari garapannya,
parasitologi dibagi ke dalam beberapa bidang, meliputi bidang
parasitologi medik yang menggarap parasitologi di dunia
kedokteran; parasitologi veteriner di dunia kedokteran hewan;
parasitologi pertanian di dunia pertanian. Dalam buku ini diuraikan
parasitologi medik (Natadisastra 2005).
Berdasarkan tempat hidup parasit pada host, ada 2 macam
parasit yaitu ektoparasit, hidupnya pada permukaan kulit host,
sedangkan endoparasit hidup di dalam tubuh host. Menurut
tingkat ketergantungannya, parasit dibedakan menjadi obligat
parasit dan fakultatif parasit.
1. Obligat parasit adalah parasit yang tidak bisa hidup bila
tidak menumpang pada host, misalnya Plasmodium spp.
8
2. Fakultatif parasit adalah parasit yang dalam keadaan
tertentu dapat hidup sendiri di alam, tidak menumpang
pada host, misalnya Strongyloides stercoralis.
3. Parasit tidak permanen adalah parasit yang hidupnya
berpindah-pindah dalam satu tuan rumah ke tuan rumah
yang lain. Contoh: nyamuk, kutu busuk.
Menurut derajat parasitisme, parasit dibagi menjadi:
1. Komensalisme adalah hubungan di mana suatu
organisme mendapat keuntungan dari jasad lain akan
tetapi organisme tersebut tidak dirugikan.
2. Mutualisme adalah hubungan dua jenis organisme yang
keduanya mendapat keuntungan.
3. Simbiosis adalah hubungan permanen antara dua
organisme dan tidak dapat hidup terpisah.
4. Pemangsa (predator) adalah parasit yang membunuh
terlebih dahulu mangsanya dan kemudian memakannya.
9
2. Host perantara adalah tempat parasit tumbuh menjadi
bentuk infektif yang siap ditukarkan kepada host
(manusia).
3. Host reservoir adalah hewan yang mengandung parasit
yang menjadi sumber infeksi bagi manusia.
4. Host paratenik adalah hewan yang mengandung stadium
infektif parasit, dan stadium infektif ini dapat ditularkan
menjadi dewasa pada host definitif.
10
b. Tusukan kulit oleh serkaria pada Schistosoma
japonicum, S. Mansoni, dan S. haematobium yang
kontak dengan air yang terinfeksi. Bagian kulit yang
dipenetrasi adalah bagian kulit yang tipis, misalnya: di
daerah jari jemari, kulit perianal, dan kulit perineum.
3) Inokulasi vektor arthropoda
Infeksi juga dapat ditularkan dengan inokulasi ke dalam
darah melalui nyamuk, seperti pada penyakit malaria
dan filariasis.
4) Kontak seksual
Trichomoniais dapat ditularkan melalui kontak seksual.
Entamoebiasis dapat ditularkan melalui kontak seksual
anal oral, seperti pada kalangan homoseksual.
11
Ancylostoma caninum membutuhkan anjing sebagai
host.
2) Kebiasaan makan, misalnya konsumsi daging
mentah atau kurang matang atau sayuran
predisposisi Taeniasis.
3) Kemudahan parasit melarikan diri dari host, parasit
yang dilepaskan dari tubuh bersama dengan feses
dan urin lebih cepat terdistribusi dibandingkan
parasit memerlukan vektor atau kontak cairan tubuh
langsung untuk transmisi.
4) Kondisi lingkungan yang mendukung kelangsungan
hidup di luar tubuh host, yaitu suhu, keberadaan air,
kelembaban, dan sebagainya.
5) Adanya host yang sesuai, parasit yang tidak
memerlukan host perantara (vektor) untuk
penularan lebih luas didistribusikan daripada
parasit yang membutuhkan vektor.
c. Siklus hidup parasit
Siklus hidup adalah rute yang dilalui oleh parasit
dari saat masuk ke host di dalam host sampai ke luar dari
host dan masuk kembali. Suatu parasit dapat melibatkan
satu host atau lebih, melibatkan satu atau lebih sebagai
perantara (intermediate host). Siklus hidup parasit terdiri
dari dua fase utama, fase di dalam tubuh dan fase di luar
tubuh manusia. Siklus hidup parasit di dalam tubuh
memberikan informasi tentang gejala dan kelainan akibat
infeksi parasit, serta metode diagnosis dan pemilihan obat
yang tepat. Siklus parasit di luar tubuh, memberikan
informasi penting yang berkaitan dengan epidemiologi,
pencegahan, dan pengendalian.
d. Hubungan host-parasit
Infeksi parasit adalah masuknya dan perkembangan
suatu parasit dalam tubuh. Setelah parasit penyebab
infeksi masuk ke dalam tubuh host, parasit bereaksi
dengan cara yang berbeda dan bisa mengakibatkan,
antara lain:
12
1) Status carrier-hubungan host-parasit yang sempurna
di mana kerusakan jaringan oleh parasit
diseimbangkan dengan perbaikan jaringan host. Pada
titik ini parasit dan host hidup harmonis, yaitu
mereka pada kesetimbangan, host sebagai pembawa
parasit.
2) Keadaan penyakit-penyakit terjadi akibat resistensi
host yang rendah atau patogenisitas parasit yang
tinggi.
3) Penghancuran parasit-terjadi ketika resistensi host
yang tinggi.
e. Pemeriksaan laboratorium
Pemeriksaan laboratorium parasitologi dilaksana-
kan untuk penegakan diagnosis. Spesimen yang dipilih
untuk diagnosis laboratorium antara lain dapat berupa
darah (hapusan darah), feses, urin, sputum, biopsi, cairan
urethra atau vagina tergantung pada parasit penyebab.
f. Pencegahan (preventif)
Beberapa tindakan preventif dapat diambil untuk
melawan setiap parasit penginfeksi manusia. Tindakan ini
dirancang untuk memutus rantai siklus penularan dan
merupakan hal yang sangat penting untuk keberhasilan
pemberantasan penyakit oleh parasit. Langkah-langkah
tersebut meliputi:
1) Pengurangan sumber infeksi. Diagnosis dan
pengobatan penyakit parasit merupakan komponen
penting dalam pencegahan terhadap penyebaran agen
penginfeksi.
2) Kontrol sanitasi air minuman dan makanan.
3) Pembuangan limbah yang tepat.
4) Penggunaan insektisida dan bahan kimia lain yang
digunakan untuk mengendalikan populasi vektor.
5) Pakaian pelindung yang mencegah vektor hinggap di
permukaan tubuh dan memasukkan patogen selama
menghisap darah.
6) Kebersihan pribadi yang baik.
13
7) Menghindari praktek seksual yang tidak aman.
14
DAFTAR PUSTAKA
15
BAB 2
BAKTERIOLOGI DASAR
Oleh Ayu Wijaya
2.1 Pendahuluan
Mikroorganisme merupakan suatu kelompok
organisme yang tidak dapat dilihat dengan menggunakan
mata telanjang, sehingga diperlukan alat bantu untuk dapat
melihatnya seperti mikroskop, lup dan lain-lain. Cakupan
dunia mikroorganisme sangat luas, terdiri dari berbagai
kelompok dan jenis, sehingga diperlukan suatu cara
pengelompokan atau pengklasifikasian.
16
Tabel 1.1 Dua golongan utama sel organisme
Klasifikasi Bakteri
Bakteri umumnya berbentuk 1-sel atau sel tunggal
atau uniseluler, tidak mempunyai klorofil berkembangbiak
dengan pembelahan sel atau biner. Karena tidak
mempunyai klorofil, bakteri hidup sebagai jasad yang
saprofitik ataupun sebagai jasad yang parasitik. Tempat
hidupnya tersebar di mana-mana, yaitu di udara, di dalam
tanah, didalam air, pada bahan-bahan, pada tanaman
ataupun pada tubuh manusia atau hewan.
Klasifikasi bakteri dapat didasarkan pada beberapa
jenis penggolongan, misalnya :
1. Nomenklatur Bakteri
Seperti halnya tanaman, bakteri juga menggunakan
2 nama yaitu nama binomial (binomial name), yang
diajukan oleh Linnaeus pada tahun 1753 untuk penamaan
tanaman. Kaidah penulisan nama bakteri pada tingkat
spesies ditulis dengan cara nama genus mendahului nama
spesiesnya. Huruf awal nama Genus ditulis dengan huruf
besar dan nama spesies ditulis dengan huruf kecil.
Keseluruhan nama ditulis dengan dicetak miring.
Contohnya : Staphylococcus aureus.
Penamaan bakteri pada jenjang taksonominya dapat
terlihat pada tabel dibawah ini.
19
2. Sel Prokariotik dan Sel Eukariotik
Sel organisme terdiri atas dua golongan utama, yaitu
sel prokariotik dan sel eukariotik. Kedua tipe sel secara
kimiawi adalah serupa, yakni sama-sama memiliki asam
nukleat, protein, lipid, dan karbohidrat. Kedua tipe sel
tersebut juga menggunakan reaksi kimia yang sama untuk
memetabolisme makanan, membentuk protein, dan
menyimpan energi. Perbedaan sel prokariotik dari sel
eukariotik adalah struktur dinding sel, membran sel, serta
tidak adanya organel, yaitu struktur seluler yang
terspesialisasi yang memiliki fungsi-fungsi spesifik.
a. Sel Prokariotik
Sel prokariotik secara struktural lebih sederhana dan
hanya ditemukan pada organisme bersel satu dan
berkoloni, yaitu bakteri dan archaea. Dapat dikatakan sel
prokariotik sebagai suatu molekul yang dikelilingi oleh
membran dan dinding sel karena tidak mempunyai organel
sel, tetapi mempunyai sistem membran dalam dinding
selnya.
Suatu sel prokariotik terdiri atas DNA, sitoplasma,
dan suatu struktur permukaan termasuk membran plasma
dan komponen dinding sel, kapsul, dan lapisan lendir
(slime layer).
b. Sel Eukariotik
Sel eukariotik mengandung organel seperti nukleus,
mitokondria, kloroplas, retikulum endoplasma (RE), badan
golgi, lisosom, vakuola, peroksisom, dan lain-lain. Organel
dan komponen lain berada pada sitosol, yang bersama
dengan nukleus disebut protoplasma.
21
Tabel 2.2 Perbedaan Sel Prokariotik dan Eukariotik
22
2.3 Morfologi dan Struktur Bakteri
1. Morfologi Bakteri
Arti kata morfologi adalah pengetahuan tentang
bentuk (morphos). Morfologi dalam cabang ilmu biologi
adalah ilmu tentang bentuk organisme, terutama hewan
dan tumbuhan dan mencakup bagian-bagiannya. Morfologi
bakteri dapat dibedakan menjadi dua yaitu morfologi
makroskopik (morfologi koloni) dan morfologi
mikroskopik (morfologi seluler).
a. Morfologi makroskopis
Morfologi makroskopis yaitu bentuk bakteri
dengan mengamati karakteristik koloninya pada
lempeng agar. Karakteristik koloni dibedakan atas
dasar bentuk koloni, ukuran koloni, pinggiran (margin
koloni), peninggian (elevasi), warna koloni, permukaan
koloni,konsistensi dan pigmen yang dihasilkan koloni.
Populasi bakteri tumbuh sangat cepat ketika mereka
ditambahkan dan disesuaikan dengan gizi dan kondisi
lingkungan yang memungkinkan mereka untuk
berkembang. Melalui pertumbuhan ini, berbagai jenis
bakteri kadang memberi penampilan yang khas.
b. Morfologi Mikroskopis
Morfologi mikroskopik adalah karakteristik
bakteri yang dilihat melalui pengamatan dibawah
mikroskop. Bentuk bakteri sangat bervariasi, tetapi
secara umum ada 3 tipe, yaitu : bentuk bulat/kokus,
bentuk batang/basil dan bentuk spiral/spirilium.
Bentuk bulat
Bentuk kokus (coccus = sferis / tidak bulat betul) dapat
di bedakan lagi menjadi beberapaformasi, yaitu :
1. Micrococcus : berbentuk bulat, satu-satu. Contohnya
Monococcus gonorrhoe.
2. Diplococcus :berbentuk bulat, bergandengan dua-
dua. Contohnya Diplococcus
3. Staphylococcus : berbentuk bulat, tersusun seperti
untaian buah anggur. ContohnyaStaphylococcus
23
aureus, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus
saprofiticus.
4. Streptococccus : berbentuk bulat, bergandengan
seperti rantai, sebagai hasil
pembelahan sel kesatu atau dua arah dalam satu
garis. Contohnya Streptococcus
faecalis, Streptococcus lactis, dan lain-lain.
5. Sarcina : berbentuk bulat, terdiri dari 8 sel yang
tersusun dalam bentuk kubus sebagaihasil
pembelahan sel ke 3 arah. Contohnya : Thiosarcina
rosea
6. Tetracoccus / gaffkya : berbentuk bulat tersusun
dari 4 sel berbentuk bujur sangkar,sebagai hasil
pembelahan sel kedua arah. Contohnya Pediococcus
Bentuk Batang
Bakteri bentuk batang dapat dibedakan ke dalam bentuk
batang panjang dan batang pendek, dengan ujung datar
atau lengkung. Bentuk batang dapat dibedakan lagi atas
bentuk batang yang mempunyai garis tengah sama atau
tidak sama di seluruh bagian panjangnya. Bakteri bentuk
batang dapat membentuk formasi :
24
1. Sel tunggal (monobasil), contohnya : Escherichia coli
2. Bergandengan dua-dua (diplobacil), contohnya:
Diplococcus pneumonia
3. Rantai (streptobacil), atau sebagai jaringan tiang
(palisade), contohnya: Bacillusanthraxis
2. Struktur Bakteri
Struktur bakteri terbagi menjadi dua yaitu struktur
dasar dan struktur tambahan. Struktur dasar dimiliki oleh
hampir semua jenis bakteri, meliputi dinding sel, membran
plasma, sitoplasma, ribosom, DNA, dan granula
penyimpanan. Sedangkan struktur tambahan hanya
dimiliki oleh jenis bakteri tertentu. Struktur ini meliputi:
kapsul, flagellum, pili, fimbria, kromosom, vakuola gas dan
endospore. Untuk dapat memahami struktur bakteri, dapat
dipelajari gambar 1.18 di bawah ini.
3. Struktur dasar
Dinding sel
Kebanyakan bakteri mempunyai dinding sel.
Dinding sel tersebut terdiri dari berbagai bentuk dan
ukuran tertentu pada sel bakteri. Dinding sel bersifat
elastik dan terletak diantara kapsula dan membran
sitoplasma. Susunan kimia dinding sel sangat kompleks
dan dapat terdiri dari beberapa macam bentuk seperti
selulosa, hemiselulose, khitin (karbohidrat, protein,
lemak yang mengandung unsur N) tergantung dari
spesies bakteri. Dinding sel ditemukan pada semua
26
bakteri hidup bebas kecuali pada Mycoplasma.
Fungsi dinding sel adalah :
1) Memberi perlindungan terhadap protoplasma
2) Berperan penting dalam perkembangbiakan sel
3) Mengatur pertukaran zat dari luar sel dan oleh
karena itu dinding sel mempengaruhi kegiatan
metabolisme dan melindungi protoplasma dari
pengaruhzat-zat racun
4) Sebagai pertahanan bakteri agar dapat bertahan
hidup dalam lingkungannya
5) Mempertahankan tekanan osmotik bakteri.
Tekanan osmotik di dalam bakteri berkisar antara
5-20 atmosfir.
Membran Plasma
Membran sel merupakan bungkus dari
protoplasma. Membran sel terletak didalam dinding sel
dan tidak terikat dengan dinding sel. Berdasarkan
pengujian sitokimia, membrane sel menunjukkan
27
adanya protein lipida dan asam-asam nukleat.
Membran sel menyerap cat-cat basa lebih kuat dari
pada sitoplasma. Membran yang menyelubungi
sitoplasma ini tersusun atas lapisan fosfolipid dan
protein.
Fungsi membran sel antara lain :
a. Transpor bahan makanan secara selektif.
b. Pada spesies aerob merupakan tempat transport
elektron dan oksidasi-fosforlasi.
c. Tempat ekspresi bagi eksoenzim yang hidrolitik.
d. Mengandung enzim dan molekul-molekul yang
berfungsi pada biosintesa DNA.
e. Mengandung reseptor protein untuk system
kemotaktik
f. Mengatur keluar masuknya zat-zat
g. Berperan dalam proses pembelahan sitoplasma
menjadi 2 bagian, diikuti dengan
h. pembentukan dinding pemisah.
Sitoplasma
Merupakan isi sel yang berupa cairan, disebut
juga dengan protoplasma. Protoplasma merupakan
koloid yang mengandung karbohidrat, protein, enzim-
enzim, belerang, kalsium karbonat dan volutin.
Komponen-komponen sitoplasma terdiri dari :
1) Inti
Adanya inti pada bakteri dapat dilihat
dengan mikroskop electron, ini merupakan daerah
yang tidak tembus cahaya elektron dan di
dalamnya terkandung asam deoksiribonukleat
(ADN). Inti bakteri tidak memiliki membrane
sehingga termasuk dalam organisme prokariotik.
2) Ribosom
Ribosom merupakan suatu partikel sitoplasma.
Kumpulan polyribosom merupakan rantai ribosom
yang menempel pada m RNA. Jumlah ribosom
28
bervariasi sesuai dengan kondisi pertumbuhan, sel
tumbuh cepat dalam medium yang sesuai,
mengandung lebih banyak ribosom dibandingkan
dengan sel tumbuh lambat dalam medium yang
kurang memadai. Ribosom bakteri terletak
menyebar di sitoplasma. Hal ini terjadi karena
bakteri tidak mempunyai membrane inti. Organel
ini berfungsi sebagai tempat sintesis protein.
4) Plasmid
Kebanyakan bakteri memiliki plasmid.
Plasmid dapat dengan mudah didapat oleh
bakteri. Namun, bakteri juga mudah untuk
menghilangkannya. Plasmid dapat diberikan
kepada bakteri lainnya dalam bentuk transfer gen
horizontal.
29
4. Struktur Tambahan
Struktur tambahan hanya dimiliki oleh jenis
bakteri tertentu. Yang termasuk kedalam struktur
tambahan adalah kapsul, flagelum, pilus/pili, klorosom,
vakuola gas dan endospora.
b. Flagel
Flagel atau bulu cambuk adalah suatu benang
30
halus yang keluar dari sitoplasma dan menembus
dinding sel yang digunakan bakteri sebagai alat
pergerakan. Banyak spesies bakteri yang bergerak
menggunakan flagel. Hampir semua bakteri yang
berbentuk lengkung dan sebagian yang berbentuk
batang ditemukan adanya flagel. Sedangkan
bakteri kokus jarang sekali memiliki flagel. Ukuran
flagel bakteri sangat kecil, tebalnya 0,02 – 0,1
mikron, dan panjangnya melebihi panjang sel
bakteri. Flagella dilekatkan pada tubuh sel bakteri
oleh struktur kompleks yang mengandung kait dan
badan basal. Kait ini berupa struktur pendek yang
melengkung yang berfungsi sebagai sendi antara
motor pada struktur basal dengan flagella.
Berdasarkan letak dan jumlah flagelnya bakteri
dapat dibagi menjadi 5 golongan, yaitu:
1) Bakteri atrich, yaitu bakteri yang tidak
mepunyai flagel, contohnya : Klebsiella spdan
Shigella sp.
2) Bakteri monotrich yaitu bakteri yang memiliki
flagel tunggal pada salah satuujungnya. Contoh:
Vibrio cholerae
3) Bakteri lofotrich yaitu bakteri yang mempunyai
seberkas flagel yang terletakpada salah satu
ujungnya. Contoh: Rhodospirillum rubrum.
4) Bakteri amfitrik yaitu bakteri yang mempunyai
masing-masing seberkas flagella atau satu flagel
yang terletak pada kedua ujungnya. Contoh:
Pseudomonas aeruginosa
5) Bakteri peritrich yaitu bakteri yang mempunyai
flagel yang terletak diseluruh permukaan sel.
Contoh : Salmonella thyposa
c. Pili
Pili adalah benang-benang halus yang
menonjol keluar dari dinding sel. Pili mirip dengan
flagel tetapi lebih pendek, kaku dan berdiameter
31
lebih kecil dan tersusun dari protein. Kebanyakan
terdapat pada bakteri gram negative. Panjang pili
sekitar 0.5-20 mikron. Pili tersusun melingkari sel,
dan mempunyai jumlah kurang lebih 150 buah tiap
sel. Seperti flagel, pili juga berpangkal pada
protoplasma Pili mengandung protein yang disebut
pillin. Pada garis besarnya pili merupakan alat
untuk melekat, misalnya dengan adanya pili sel-sel
beberapa bakteri dapat melekat dekat dengan
permukaan medium cair dimana kadar oksigennya
lebih baik. Pili juga dapat melekatkan sel satu
dengan sel lainnya. Fungsi pelekatan sel ini penting
pada peristiwa konjugasi. Konjugasi adalah
peristiwa penggabungan sel-sel jantan dengan
betina. Sel-sel bakteri jantan dilengkapi dengan Pili
khusus yang disebut Pili sex.
Gambar 2.4 Flagel sebagai alat gerak dan pili sebagai alat
perlekatan
Sumber : http://mentarib1ru.blogspot.co.id/pili-
bakteri.html, diunduh 7 Agustus 2017
d. Klorosom
Klorosom adalah struktur yang berada tepat
dibawah membran plasma dan mengandung
pigmen klorofil dan pigmen lainnya untuk proses
fotosintesis. Klorosom hanya terdapat pada
bakteri yang melakukan fotosintesis.
32
e. Vakuola gas
Vakuola gas terdapat pada bakteri yang hidup
di air dan berfotosintesis. Dengan mengatur jumlah
gas dalam vakuola gasnya, bakteri dapat
meningkatkan atau mengurangi kepadatan sel
mereka secara keseluruhan dan bergerak ke atas
atau bawah dalam air.
f. Spora (Endospora)
Beberapa bakteri dapat membentuk endospora
(spora). Endospora yaitu struktur berbentuk bulat
atau bulat lonjong, bersifat Sangat membias cahaya,
sukar dicat dan sangat resisten terhadap faktor-
faktor luar yang buruk. Fungsi spora pada bakteri
bukan sebagai alat reproduksi seperti halnya pada
fungi. Spora bakteri mempunyai arti lain yaitu
bentuk bakteri yang sedang dalam usaha
mengamankan diri terhadap pengaruh buruk dari
luar. Endospora mengandung sedikit sitoplasma,
materi genetik, dan ribosom. Dinding endospora
yang tebal tersusun atas protein dan menyebabkan
endospora tahan terhadap kekeringan, radiasi
cahaya, suhu tinggi dan zat kimia. Jadi, jika kondisi
lingkungan tidak menguntungkan, maka bakteri
pembentuk spora akan mengubah bentuk
vegetatifnya menjadi spora. Kondisi tersebut
dinamakan fase sporulasi.
Sebaliknya jika kondisi lingkungan
menguntungkan maka spora akan tumbuh menjadi
sel bakteri baru (sel vegetatif). Kondisi ini
dinamakan fase germinasi. Bakteri yang
membentuk spora adalah genus Bacillus sp dan
Clostridium sp selain itu juga ada beberapa spesies
dari Sarcina sp. dan Vibrio sp.
33
2.4 Penggolongan Bakteri Berdasarkan Struktur
Dinding Sel
Pewarnaan Gram atau metode Gram adalah salah satu
teknik pewarnaan yang paling penting dan luas yang digunakan
untuk mengidentifikasi bakteri. Dalam proses ini, olesan bakteri
yang sudah terfiksasi dikenai larutan-larutan berikut : zat
pewarna kristal violet, larutan yodium, larutan alkohol (bahan
pemucat), dan zat pewarna tandingannya berupa zat warna
safranin atau air fuchsin. Metode ini diberi nama
berdasarkan penemunya, ilmuwan Denmark Hans Christian
Gram (1853–1938) yang mengembangkan teknik ini pada
tahun 1884 untuk membedakan antara Pneumokokus dan
bakteri Klebsiella pneumoniae. Bakteri yang terwarnai dengan
metode ini dibagi menjadi dua kelompok, yaitu bakteri Gram
Positif dan Bakteri Gram Negatif.
Bakteri Gram positif akan mempertahankan zat pewarna
kristal violet dan karenanya akan tampak berwarna ungu tua
di bawah mikroskop. Adapun bakteri gram negatif akan
kehilangan zat pewarna kristal violet setelah dicuci dengan
alkohol, dan sewaktu diberi zat pewarna tandingannya yaitu
dengan zat pewarna air fuchsin atau safranin akan tampak
berwarna merah. Perbedaan warna ini disebabkan oleh
perbedaan dalam struktur kimiawi dinding selnya.
1. Pertumbuhan
Bakteri, seperti halnya semua mahluk hidup,
membutuhkan makanan untuk dapat bermetabolisme dan
untuk dapat melakukan pembelahan sel, dan tumbuh
secara optimal dilingkungan yang menyediakan
kebutuhan-kebutuhannya. Secara kimiawi, bakteri
terbentuk oleh unsur-unsur polisakarida, protein, lipid,
asam nukleat dan peptidoglikan, yang keseluruhannya
harus dibentuk untuk mencapai pertumbuhan yang baik.
Karbon
Karbon diperoleh bakteri dengan dua cara yaitu :
Bakteri autotroph, bakteri yang hidup bebas dan tidak
bersifat parasite, menggunakan Karbondioksida sebagai
sumber karbon-nya. Bakteri heterotroph, yang merupakan
bakteri parasite, menggunakan substansi organic
kompleks, seperti sukrosa sebagai sumber karbondiokasida
dan sumber energinya.
Ion-ion Anorganik
Nitrogen, Sulfur, Fosfat, Magnesium, Kalium dan
sejumlah trace elemen diperlukan untuk pertumbuhan
bakteri.
35
Nutrien Organik
Nutrien organik sangat diperlukan dalam jumlah yang
berbeda-beda, tergantung spesies bakteri. Karbohidrat
digunakan sebagai sumber energy dan sebagai bahan
awal untuk proses biosintesis beberapa substansi. Asam
amino sangat penting untuk pertumbuhan beberapa bakteri
Vitamin, purin dan Pyrimidin dalam jumlah sedikit
diperlukan untuk pertumbuhan bakteri.
2. Reproduksi
Bakteri melakukan reproduksi melalui suatu proses
yang disebut pembelahan biner, dimana sel induk
membelah menjadi dua sel dan seterusnya. Hal ini
menyebabkan laju pertumbuhan bakteri mengikuti
pertumbuhan logaritme, yaitu satu bakteri akan
menghasilkan 16 bakteri dalam 4 generasi. Rata-rata
waktu pembelahan bakteri bisa sangat bervariasi
(misalnya: 20 menit untuk Eschericia coli, 24 jam untuk
Mycobacterium tuberculosis), makin pendek waktu
pembelahan, makin cepat laju multiplikasinya. Faktor lain
yang mempengaruhi waktu pembelahan antara lain:
jumlah nutrient, suhu dan pHlingkungan.
37
pada rentang suhu yang sangat lebar. Berdasarkan
kemampuan tumbuh pada suhu lingkungan, bakteri
dapat diklasifikasikan sebagai :
Bakteri Mesofil, yaitu bakteri yang dapat tumbuh
baik pada suhu 250 – 400C. Termasuk dalam
golongan ini adalah bakteri-bakteri yang penting
secara medis (yang tumbuh baik pada temperatur
badan)
Bakteri Thermofil, bakteri yang dapat tumbuh
baik pada suhu 550 – 800C (Thermus aquaticus
misalnya, tumbuh pada daerah bersuhu tinggi,
dan enzimnya seperti Taq-polimerase, adalah
enzim yang tahan panas).
Bakteri Psikrofil, yang tumbuh pada suhu
dibawah 200C
38
Dan enzim kedua adalah katalase, yang mengubah
hydrogen peroksida menjadi air danoksigen :
2 H2O2 2 H2O + O2
Bakteri diklasifikasikan menurut kemampuannya untuk
hidup di lingkungan dengan oksigen yang sedikit ataupun
dengan oksigen bebas (Lihat gambar 1.24 dan tabel 1.5.
Hal ini akan berdampak praktek penting, karena specimen
klinik harus diinkubasikan di laboratorium pada kondisi
keberadaan gas yang tepat bagi pertumbuhan bakteri
patogen. Dengan demikian, bakteri diklasifikasikan sebagai
berikut :
Bakteri obligat aerob (mutlak aerob), yang
memerlukan oksigen untuk pertumbuhannya karena
system pembangkit ATP-nya sangat bergantung pada
Oksigen sebagai akseptor hydrogen (misalnya :
Mycobacterium tuberculosis)
Bakteri fakultatif anaerob, yang jika ada oksigen
mereka menggunakan oksigen untuk membentuk
energy, tetapi jika tidak tersedia cukup oksigen,
mereka menggunakan jalur fermentasi untuk
mensintesa ATP (misalnya : bakteri-bakteri rongga
mulut seperti Streptococcus mutans, Eschericia coli).
Bakteri obligat anaerob, yaitu bakteri yang tidak
dapat tumbuh jika ada oksigen karena bakteri
tersebut tidak mempunyai enzim superoksida
dismutase atau katalase atau keduanya (misalnya
Porphyromonas gingivalis)
Microaerophilic , yaitu bakteri yang tumbuh dengan
baik pada lingkungan dengan sedikit oksigen
(misalnya Campylobacter fetus).
39
Gambar 2.7 Kebutuhan atmosferik bakteri,seperti digambarkan
pada perbenihan agar : 1) Obligat aerob, 2) Obligat anaerob, 3)
Fakultatif anaerob, 4) Microaerofilic; 5) mikroorganisme
Capnofilic (tumbuh pada lingkungan yang diperkaya dengan
karbondioksida).
Sumber : https://lordbroken.wordpress.com, diunduh tanggal 7 Agustus
2017
40
DAFTAR PUSTAKA
Ani, M., Astuti, E. D., Nardina, E. A., Azizah, N., Hutabarat, J.,
Sebtalesy, C. Y., ... & Mahmud, A. (2021). Biologi Reproduksi
dan Mikrobiologi. Yayasan Kita Menulis.
Boleng, D. T. (2015). Konsep-konsep Dasar Bakteriologi. UMM
pressUniversitas Muhammadiyah Malang.
Fifendy, M. (2017). Mikrobiologi. Kencana.
Ihsan, B., & Pi, S. (2021). Dasar-dasar mikrobiologi. Insan Cendekia
Mandiri.
Rahayu, W. P., & Nurwitri, C. C. (2019). Mikrobiologi pangan. PT
Penerbit IPB Press.
Rini, C. S., & Rohmah, J. (2020). Buku Ajar Mata Kuliah Bakteriologi
Dasar. Umsida Press, 1-108.
Sumampouw, O. J. (2019). Mikrobiologi Kesehatan. Deepublish.
Saputro, B. (2017). Pengantar Bakteriologi Dasar.
Har, A. S., & Si, M. (2015). Mikrobiologi kesehatan: peran
mikrobiologi dalam bidang kesehatan. Penerbit Andi.
Lestari, P. B., & Hartati, T. W. (2017). Mikrobiologi Berbasis Inkuiry.
Penerbit Gunung Samudera [Grup Penerbit PT Book Mart
Indonesia].
Murwani, S. (2015). Dasar-dasar Mikrobiologi veteriner. Universitas
Brawijaya Press.
Syauqi, A. (2017). Mikrobiologi lingkungan peranan mikroorganisme
dan kehidupan. Penerbit Andi.
Tanah Boleng, D. (2015). Bakteriologi Konsep-Konsep Dasar.
41
BAB 3
KONSEP DASAR PENCEGAHAN
DAN PENGENDALIAN INFEKSI
Oleh Eny Sendra
3.1 Pendahuluan
Pemberian terapi antimikroba dilakukan untuk preventif dan
mengendalikan infeksi mikroba, menggunakan suatu program
praktik dan dianggap aman. Nakes, klien, pengunjung serta pegawai
diwilayah pelayanan kesehatan memiliki resiko terpapar infeksi,
sehingga sangat penting diperhatikan saat memberikan pelayanan
adalah pengetahuan dan kecakapan yang mencukupi agar dapat
melayani secara adekuat dan optimal. RS sebagai fasyankes
dituntut untuk dapat melakukan kegiatan jasa sesuai standar mutu.
Dalam penerapan manajemen K3 terdapat rangkaian yang
merupakan bentuk usaha terciptanya wilayah kerja yang sehat,
terbebas dari polusi lingkungan serta aman, antara lain
terbentuknya organisasi , melakukan perancangan , pembagian
tugas dan tanggung jawab, menyusun terlaksananya rencana sesuai
prosedur dan kesesuaian sumber daya yang dibutuhkan dalam
rangka mengembangkan, menerapkan, mencapai tujuan, mengkaji,
dan menetapkan kebijakan K3 dalam rangka pengendalian risiko
kegiatan kerja.Terdapat beberapa faktor yang sangat potensial
menjadikan RS sebagai area berbahaya antara lain biologi, kimia,
ergonomik, fisik, fisiko sosial (hubungan sesama pekerja) dapat
berdampak terhadap timbulnya penyakit dan kecelakaan kerja.
Masalah penyakit menular saat ini masih menjadi masalah
dunia dan negara Indonesia khususnya. Jika ditelusuri maka
kejadian infeksi bermula dari Hospital acquired infection lebih
lazim dengan infeksi nosokomial, sehingga sangat penting untuk
memberi perlindungan bagi Nakes, klien, tenaga non kesehatan dan
masyarakat sekitar dari paparan infeksi dengan menerapkan
pencegahan dan DALIN. Sarana Yankes harus memberikan jaminan
42
atas keamanan akan bahaya penularan / paparan infeksi, dengan
menyediakan protap kesehatan terstandar.
Tindakan perawatan yang diberikan oleh Nakes bertujuan
untuk penyembuhan klien, bila dilakukan tidak sesuai SOP memiliki
potensi terjadinya penularan penyakit, baik bagi klien lain atau
pada Nakes. Penyebab pasti infeksi tidak dapat ditentukan, infeksi
nosokomial identik dengan Healthcare Associated Infection (HAIs)
Terdapat risiko infeksi nosokomial sekitar 20% bagi masyarakat
penerima yankes, nakes dan pengunjung yang berada di RS . Cara
mengatasi adanya penularan karena kunjungan ke yankes ini dapat
dilakukan dengan mempelajari perilaku pencegahan infeksi, karena
dengan mengetahui perilaku klien atau nakes akan di dapat cara
memutus rantai melalui kewaspadaan standar dan berdasarkan
cara transmisi.
1. Rantai Penularan
Pelaksanaan pencegahan dan DALIN memerlukan
pemahaman rantai penularan dimana bila mata rantai
penularan diputus infeksi nosokomial dapat dikendalikan.
Bagian dalam proses infeksi meliputi :
a. Infectious Agent merupakan kuman pathogen meliputi
bakteri, virus, jamur dan parasit. Ada 3 faktor penyebab
infeksi seperti : patogenesis, virulensi serta jumlah
mikroorganisme.
43
b. Reservoir merupakan tempat agen hidup, siap
menularkan kepada orang lain. Agen hidup seperti
manusia, hewan, tumbuhan, tanah, air dan sampel
organik.
c. Portal of Exit merupakan agen reservoir, contohnya
seperti sistem respirasi, sistem pencernaan, urinary
tract, genitalia, kulit, darah, urine, keringat dst.
d. Portal of Entry merupakan pimtu masuk kuman
pathogen ke dalam host. Infeksi bisa melalui traktus
respiratorius, digestivus, genito urinarius, mukosa,
serta dermis.
e. Host merupakan pejamu yang daya imummya rendah
dalam melawan kuman pathogen. Beberapa hal yang
dapat mempengaruhi host seperti usia, kondisi gizi,
kelengkapan vaksinasi, penyakit menahun, combustio,
cedera pasca operasi, pengobatan dengan
kortikosteroid, dan penyakit degeneratif. Ada faktor-
faktor lain seperti sex, ras, kesejahteraan ekonomi, life
style, mata pencaharian dan keturunan.
44
Penularan penyakit infeksi dapat dicegah dengan
melaksanakan prosedur standar, dan akan sangat
bergantung pada kedisiplinan Nakes atau petugas
lainnya.Tindakan pencegahan dibuat dalam bentuk
“Isolation Precautions” dengan dua pilar meliputi
“Standard Precautions” serta “Transmission Based
Precautions”.
d. Standar Pencegahan
Diterapkan dalam tindakan merawat klien di beberapa
tingkat fasyankes, terlepas dari ada / tidak serta
timbulnya infeksi, tindakan preventif ini merupakan
strategi terpenting. Ketetapan dalam mencegah infeksi
berdasarkan prinsip bahwa seluruh cairan tubuh,
darah, keringat klien, mengandung bahan infeksius.
Beberapa cara pencegahan yang dilakukan seperti :
1) Higiene Lingkungan
Lingkungan di RS harus meminimalkan infeksi.
Ketika ada wabah/ kejadian luar biasa perlu
dilakukan peningkatan kebersihan. Cara untuk
membersihkan penyebab infeksi berdasarkan faktor
penyebab. Fasyankes wajib menerapkan beberapa
kebijakan dan standar operasional prosedur dalam
hygiene lingkungan. Sterilisasi pada peralatan,
perangkat dan instrumen medis harus ketat
sesuai SOP.
Pengamanan lingkungan kerja diatur dengan
tahap prosedural yang dianjurkan dengan tujuan
menurunkan risiko penularan penyakit. Dibutuhkan
adanya suatu kebijakan dan dukungan
penanggungjawab institusi dalam hal kesiapan
perangkat, diklat nakes, dan penyuluhan pada klien
serta orang yang berkunjung ke fasyankes.
2) Peralatan Medis
45
Peralatan yang diberi label “sekali pakai” dari
penghasil barang dimaksudkan agar peralatan tidak
dapat dipakai kembali setelah penggunaan pertama,
karena ada resiko penularan penyakit.
3) Kebersihan Tangan
Individu yang bertugas di fasyankes (Rumah
Sakit, Klinik) perlu memperhatikan kebersihan
tangan.Tindakan mencucu tangan adalah bentuk
intervensi penting sehingga setiap Nakes dapat
mencegah terjadinya infeksi. Pemberian desinfektan
adalah salah satu cara kimia yang dapat digunakan
sebagai pencegahan infeksi. Pemberian antiseptik
dapat menghambat pertumbuhan bakteri, dsb pada
jaringan hidup , lantai, ruangan, peralatan dan
pakaian.
Tujuan cuci tangan adalah mencegah
perbanyakan mikroorganisme patogen dan infeksi
pada klien, nakes, serta pencemaran lingkungan.
Dengan mencuci tangan, instrumen dapat
menghilangkan kotoran, menghilangkan bau,
mencegah penyebaran infeksi, membuat tangan
steril, perasaan bersih dan segar.Indikasi cuci tangan
ada di setiap kontak atau transfer mikroorganisme
ke kulit atau permukaan benda mati ke benda lain.
Badan Kesehatan Dunia membuat prototipe My
5 Moments for Hand Hygiene. Model ini antara lain
pra kontak dengan klien, pra tindakan aseptik, pasca
terpapar cairan infeksius, pasca menyentuh klien,
pasca di lingkungan klien.
4) Penggunaan APD (Alat Pelindung Diri)
Penggunaan gown, handscoon, apron, kaca
mata google, sepatu booth dan masker, didasarkan
pada status risiko penularan jasad pathogen dari
klien ke nakes dan sebaliknya.
a) Sarung tangan
46
Handscoen / sarung tangan saat ini berfungsi sebagai
alat yang digunakan dalam lahan praktik serta
sebagai bagian pencegahan penyakit / transmisi.
Jenis handscoon ; pemeriksaan sekali pakai; utilitas;
dan penanganan medis. Penggunaan handscoon
harus tepat sehingga akan mempertahankan
kebersihan tangan. handscoonn harus diganti ketika
memeriksa klien berisiko infeksi tinggi atau harus
memeriksa klien yang berbeda-beda.
Pakai handscoon jika terpapar cairan tubuh,
menyentuh membran mukosa, luka terbuka dan
penggantian handscoon selesai tindakan awal ke
tindakan akhir yang beresiko infeksius. Ganti
handscoon pasca menyentuh benda, alat dan
permukaan yang terpapar, pra kontak klien
berikutnya. Desinfeksi pasca pelepasan handscoon.
b) Baju dan Masker Wajah.
Pemakaian APD berupa pakaian dan penutup wajah
merupakan perilaku preventif terhadap penularan
penyakit. Baju mencegah kontaminasi pakaian inti
dengan bahan infeksius
Petunjuk pada yankes dalam pemakaian alat
pelindung diri (APD) menunjukkan bahwa
profesional harus menerapkan sebagai berikut:
i. Memakai pelindung pakaian plastik sekali
pakai saat terdapat resiko terpapar / kontak
dengan klien, bahan atau instrument.
ii. Membuang pelindung pakaian plastik setelah
tindakan merawat klien.
iii. Memakai APD yang pada seluruh tubuh.
Dalam situasi dimana terkena darah atau
cairan infeksius seperti di ruang bersalin,
nakes wajib mengenakan pelindung kaki yang
tertutup
47
iv. Masker penutup seluruh muka dipakai bila
ada risiko cairan tubuh, terpapar ke muka
dan mata.
5) Cara Kebersihan Pernapasan dan Etika Saat
Batuk
a) Menutup hidung dan mulut dengan lembaran
tissu :
i. Jika batuk, segera menutup hidung dan mulut.
ii. Tisu yang telah digunakan langsung dibuang
ke wadah pembuangan tertutup, agar tidak
tersentuh atau dipakai orang lain.
iii. Batuk adalah refleks tubuh yang sulit
dikontrol. Ada saatnya ingin batuk tetapi
tidak sempat menggunakan tissu dan tutup
mulut atau hidung, maka yang harus
dilakukan adalah batuk dan tutup dibagian
lengan dalam bagian atas , tidak ditelapak
tangan.
iv. Lengan bagian dalam sebelah atas adalah
bagian yang jarang kontak atau tersentuh.
b) Menjaga jarak :
i. Ketika batuk, jauhkan muka anda dari orang
yang di sekitar anda.
ii. Ada etika sa’at batuk, dipastikan tidak ada
percikan ludah mengenai tubuh atau muka
orang disekitar kita.
6) Mencuci tangan menggunakan sabun
Disiplin dalam cuci tangan setelah batuk, sangat
dianjurkan, karena sebagian besar penyakit pernapasan
berbahaya ditransmisikan lewat kontak tangan / fisik
yang terkontaminasi patogen ke bagian muka.
a) Lakukan pembersihan tangan secara tepat dan
memakai hand soup pada air mengalir.
b) Cairan pembersih / desinfektan dapat
digunakan dengan syarat kandungan alkohol
kepekatan : 70-95 %.
48
c) Saat cuci tangan, yakinkan telah melakukan
pada permukaan tangan, seluruh bagian telapak
tangan, pembersihan dengan cara di gosok
antara jari di air mengalir sekitar 20-40 detik.
Bersihkan tangan setelah batuk memakai sabun
dan air mengalir karena dengan aliran air, jasad
pathogen seperti bakteri akan hilang.
7) Gunakan penutup hidung dan mulut jika tidak
sehat
a) Pergunakan penutup wajah dan hidung jika
saudara tidak sehat.
b) Pemakaian penutup wajah dan hidung sebaik-
nya digunakan secara tepat, mengganti setelah
beberapa waktu atau mencucinya dengan sabun
antiseptik
c) Penutup wajah dan hidung yang sudah terpakai
dihindari digunakan kembali karena dapat
menjadi sumber penularan penyakit serta
tempat kondusif bagi jasad pathogen
berkembang.
d) Jauhkan diri saat ada orang lain batuk walaupun
telah memakai masker sehingga mengurangi
penyebaran kuman.
49
d) Lakukan pembuangan terhadap alat sekali pakai
pada tempat yang tepat.
9) Penggunaan Prosedur Sterilisasi yang Efektif
a) Instrumen yang terkena cairan tubuh, harus
lakukan dekontaminasi sedemikian rupa
sehingga penularan ke klien lain dan lingkungan
bisa dikendalikan.
b) Lakukan pembersihan, desinfeksi, sterilisasi
peralatan dipakai dengan seksama dan
terstandar, untuk dapat digunakan Kembali
pada klien lain.
c) Bahan kain (linen, logam, karet dll) : lakukan
pembersihan dan sterilisasi untuk dapat
Kembali digunakan dengan aman .
e. Mematuhi Prosedur Pencegahan dan Kontrol
Infeksi
1) DALIN Mikroorganisme
Melakukan jasad pathogen terhadap mikroba dapat
mencegah penyebaran penyakit dan infeksi
.Pemusnahan jasad pathogen pada host akan
mengurangi adanya kerusakan pada bahan,
menghambat pertumbuhan jasad pathogen dan
mencegah paparan kuman yang ada pada media.
2) Metoda pengendalian Mikroba
Ada 2 (dua) hal yg utama dalam metode pengendalian
pertumbuhan mikroorganisme penyebab penyakit
yaitu: 1) membunuh, 2) menghambat pertumbuhan
dan DALIN jasad pathogen.
a) Cara mengendalikan mikroba :
vii. Cleaning
Cleaning merupakan cara menurunkan
perkembangan bakteri dengan prinsip
menciptakan lingkungan tidak kondusif bagi
mikroba dengan tujuan membunuh mikroba
(jumlah besar).
50
viii. Desinfeksi
proses pemberian bahan kimia yang berperan
desinfektan terhadap alat-alat, lantai, dinding agar
sel vegetatif mikrobial,mati tetapi spora masih
ada.
ix. Antiseptik
Beberapa jenis bahan kimia bersifat antiseptik
pada tubuh manusia yang terkena infeksi dengan
cara menghancurkan mikroba.
x. Sterilisasi
Suatu Tindakan menghilangkan bentuk
kehidupan jasad pathogen sehingga steril.
Sterilisasi dapat menggunakan uap panas dll.
xi. DALIN kuman pathogen menggunakan bahan
kimia
Bahan kimia untuk membunuh Jasad
pathogen akan rusak termasuk virus dan jamur
kecuali bakteri yang memiliki endospora. Maka
disimpulkan tidak ada bahan kimia yang cocok
dipakai dalam semua jenis keperluan
Beberapa hal tentang senyawa kimia dengan
peruntukannya yaitu :
a) Prosedur menghancurkan mikroba dalam
kadar rendah pada spektrum luas.
b) Kepekatan, artinya bisa dilarutkan dalam air
atau pelarut lain, hingga sesuai standar
diinginkan.
c) Tetap stabil, adalah kondisi tetap jika dalam
waktu lama serta harus tetap dengan
sifatnya sebagai antimikroba.
d) Tidak memiliki sifat toksik bagi manusia /
hewan , yaitu bersifat mematikan pada
bakteri pathogen kecuali manusia dan
hewan.
e) Sifat bahan yang homogen, mendesinfeksi
instrumen dapat dipakai untuk
mendesinfeksi kulit manusia.
51
f) Tipe mikroorganisme, artinya untuk
membasmi mikroorganisme harus dipilih
jenis mikrobiostatik/ mikrobiosida yang
dipakai.
53
d) Pemanasan menggunakan api pijar
dilakukan dalam proses melakukan proses
mensterilkan alat sederhana.
viii. DALIN bakteri pathogen menggunakan sinar
UV dan sinar ionisasi
a) Sinar Ultra Violet : Paparan sinar Ultra Violet
akan mematikan bakteri di udara /
dipermukaan suatu benda.
b) Sinar yang mengandung partikel bermuatan
seperti elektron : menggunakan sinar radiasi,
sinar α, sinar β dan sinar Ω. Sterilisasi dengan
sinar ionisasi diperlukan dana besar, hanya
dipakai dilingkungan industri farmasi dan
kedokteran.
X ray : memiliki penetrasi kuat tetapi
membutuhkan daya lebih.
Sinar α: mempunyai sifat membunuh
bakteri dan tidak mempunyai daya
tembus
Sinar β : memiliki kekuatan menembus
sedikit besar dari pada X ray.
Sinar Ω : memiliki potensi radiasi lebih,
pada proses mematikan kuman pathogen
pada bahan makanan
ix. Mengendalikan bakteri pathogen dengan
penyaringan 2 filter :
a) Penyaringan udara dengan efisiensi tinggi
guna menyaring udara / HEPA.
b) Filter bakteriologis dipakai dalam sterilisasi
bahan rentan terhadap panas seperti serum
dll
x. Mendorong pihak lain untuk berpartisipasi
dalam mengontrol infeksi.
Untuk membuat pihak lain berpartisipasi dalam
pengendalian infeksi maka diterbitkan Permenkes RI No 27
Th 2017 Bahwa Pedoman DALIN di fasyankes, dalam
54
Permenkes tersebut terdapat beberapa klausul yang
mengatur hal tersebut antara lain :
1. Bahwa dalam yankes yang berkualitas dan
profesional dalam upaya pencegahan DALIN
fasyankes dibutuhkan penanganan sesuai pedoman.
2. Bahwa Kepmenkes No 270 /Menkes/SK/III/2007
tentang Pedoman Managemen DALIN di RS,
FASYANKES Lain.
55
4) Penerapan PPI sebagaimana dimaksud dilakukan
terhadap infeksi di pelayanan HAIs juga infeksi
bersumber dari masyarakat.
5) Pada PPI di Fasyankes harus melakukan
surveilans dan pendidikan atau pelatihan.
3. Isolation precaution :
Cuci tangan, APD, managemen instrumentir dan
perawatan klien, DALIN sekitar klien dan linen,
sterilisasi dan perlindungan kesehatan bagi naker dan
nakes, pemosisian klien, pembersihan saluran
pernafasan / cara membatuk, praktik injeksi, praktik
lumbal punksi
4. Terdapat kebijakan peningkatan kualitas SDM dalam
DALIN infeksi.
5. Terdapat keputusan penyediaan bahan dan alat
yang berhubungan dengan DALIN.
6. Terdapat kebijakan pemakaian antibiotika secara
bijak.
7. Terdapat kebijakan pelaksanaan survei oleh petugas.
8. Mengikiut sertakan tim DALIN.
9. Terdapat kebijakan kesejahteraan naker.
10. Terdapat kebijakan tindakan Kejadian Luar Biasa.
11. Terdapat kebijakan penempatan klien.
12. Terdapat kebijakan DALIN.
13. Terdapat SOP isolation precaution : seperti
kebersihan tangan, SOP APD, penggunaan peralatan
perawatan pasien, SOP pengendalian lingkungan,
SOP pemrosesan instrumen klien, sterilisasi linen,
SOP kesehatan naker / perlindungan nakes, SOP
penempatan klien, SOP pembersihan saluran
pernafasan / cara membatuk, SOP praktik injeksi,
SOP praktik pengambilan cairan tulang belakang
56
57
DAFTAR PUSTAKA
58
BAB 4
FLORA NORMAL
DAN MIKROORGANISME
Oleh Indas Wari Rahman
4.1 Pendahuluan
Flora normal adalah istilah untuk mendeskripsikan berbagai
macam bakteri dan jamur yang merupakan penghuni tetap tertentu
di bagian tubuh, terutama pada kulit, orofaring, usus besar dan
vagina. Mikroorganisme ini secara alamiah berada di dalam atau
permukaan tubuh manusia. Sementara Virus dan Parasit (Protozoa
dan Cacing), yang merupakan kelompok utama lainnya dari
mikroorganisme biasanya tidak dianggap sebagai bagian dari flora
normal, walaupun terkadang mereka hadir tanpa gelaja pada
individu. Flora normal sering disebut sebagai komensal, karena
mikroorganisme ini memperoleh manfaat dari pejamu (tubuh) tapi
tidak merusak pejamu tersebut. Dan sekarang istilah ’mikrobiota
normal’ atau ’human microbiome’ sering digunakan untuk
mendeskripsikan flora normal.
Flora normal berbeda dengan istilah pembawa (carrier).
Mikrobiota ada dalam setiap tubuh manusia yang telah terbawa
sejak lahir yang sifatnya tidak berbahaya bagi tubuh, sementara
untuk manusia yang statusnya carrier, mereka membawa
mikroorganisme potensial yang dapat menjadi penyebab infeksi
pada orang lain. Pembawa atau carrier merujuk pada seseorang
yang terinfeksi mikroorganisme tanpa gejala atau seseorang yang
telah sembuh dari suatu penyakit tetapi terus membawa
mikroorganisme dan dapat melepaskannya untuk waktu yang
lama. Terdapat juga perbedaan antara flora normal sebagai
penghuni tetap (permanent resident) dan proses kolonisasi oleh
mikroorganisme baru. Kolonisasi yang terjadi ini adalah
mikroorganisme baru yang masuk ke tubuh dan melakukan proses
kolonisasi. Setelah terjadi kolonisasi mikroorganisme tersebut
59
(menempel dan berkembangbiak yang biasanya terjadi pada
membran mukosa), dapat menyebabkan terjadinya penyakit
menular atau mungkin dapat dieleminasi oleh sistem pertahanan
tubuh dari pejamu (inang). Kemudian pejamu yang terinfeksi
mikroorganisme baru tersebut dapat menularkannya ke orang lain.
62
Tabel 4.1 Anggota Flora Normal yang Penting Secara Medis
Bagian Mikroorganisme Mikroorganisme yang
Tubuh yang penting1 kurang penting2
Kulit Staphylococcus Staphylococcus aureus,
epidermidis Corynebacterium
(dipteri), berbagai
streptokok,
Pseudomonas
aeruginosa, anaerob
(misalnya
Propionibacterium),
Jamur (misalnya
Candida albicans)
Hidung Staphylococcus Staphylococcus
aureus 3 epidermis,
Corynebacterium
(dipteri), berbagai
streptokok
Mulut Streptokok grup Berbagai streptokok,
Viridans Eikenella corrodens
Plak Gigi Streptococcus Prevotella intermedia,
mutans Porphyromonas
gingivalis
Celah Gusi Jenis anaerob Berbagai streptokok
(misalnya (termasuk
Bacteriodes, Streptococcus pyogenes
Fusobacterium, dan Streptococcus
streptococci, pneumonia), spesies
Actinomyces) Neisseria, Haemophilus
influenzae, S. epidermis
Tenggorokan Streptokok grup Berbagai streptokok
Viridans (termasuk
Streptococcus pyogenes
dan Streptococcus
63
Bagian Mikroorganisme Mikroorganisme yang
Tubuh yang penting1 kurang penting2
pneumonia), spesies
Neisseria, Haemophilus
influenzae, S. epidermis
Usus Bacteroides fragilis, Bifidobacterium,
Escherichia coli Eubacterium,
Fusobacterium,
Lactobacillus, berbagai
batang gram-negatif
aerobik, Enterococcus
faecalis dan
streptococci lainnya,
Clostridium
Vagina Lactobacillus, E. Berbagai streptokok,
coli3, berbagai batang gram-
Streptococci grup negatif, B. fragilis,
B3 Corynebacterium
(dipteri), C. albicans
Saluran S. epidermis,
Kemih Corynebacterium
(dipteri), berbagai
streptokok, berbagai
batang gram-negatif
(misalnya E.coli)3
1Mikroorganisme yang penting secara medis atau ada dalam jumlah
yang besar
2Mikroorganisme yang kurang penting secara medis atau ada
64
badan (obesitas), inflamasi panyakit usus, respon imun, dan
pertahanan terhadap penyakit menular. Anggota flora normal
berperan dalam pemeliharaan kesehatan dan disisi lain dapat
menjadi penyebab penyakit, yang dapat terjadi melalui tiga cara
penting, yaitu :
1. Mikrobiota normal dapat menyebabkan penyakit, terutama
pada individu dengan kelemahan dan gangguan kekebalan
tubuh. Meskipun mikroorganisme ini tidak patogen pada
habitatnya namun dapat menjadi patogen pada bagian lain
dari tubuh
2. Mikrobiota normal merupakan mekanisme pertahanan
tubuh inang. Bakteri tetap (resident) yang tidak patogen
menempati bagian perlekatan pada kulit dan mukosa
(lapisan lendir), yang dapat menghalangi kolonisasi bakteri
patogen. Kemampuan anggota flora normal dalam
membatasi pertumbuhan patogen disebut dengan
“Pertahanan Kolonisasi“ atau Colonization Resistance. Jika
flora normal ditekan, patogen kemungkinan akan tumbuh
dan menyebabkan penyakit. Contoh, antibiotik dapat
mengurangi jumlah koloni normal mikrobiota tetap, dan
memungkinkan jenis Clostridium difficile, yang resisten
terhadap antibiotik akan tumbuh dengan cepat dan
menyebabkan terjadinya pseudomembranous colitis
(kelainan pada usus atau diare parah)
3. Mikrobiota normal menyediakan nutrisi yang fungsional.
Bakteri pada usus memproduksi vitamin B dan K. Orang
dengan gizi buruk yang diobati dengan antibiotik oral dapat
kekurangan vitamin sebagai akibat berkurangnya
mikrobiota normal.
Flora normal (resident) mempunyai peran penting yang jelas
dalam mempertahankan kesehatan dan fungsi normal pada bagian
tubuh tertentu.
69
Pseudomonas aeruginosa juga ada di feses yang normal sekitar 10%
serta di tanah dan air.
Tabel 4.2 Bakteri Utama pada Usus Besar
Jumlah/g Patogen
Bakteri pada Penting
Feses
Bacteriodes, khususnya B. fragilis 1010 – Ya
10 11
70
sampai 20% wanita usia subur membawa streptokokus grup B di
dalam vagina. Bakteri ini merupakan penyebab penting sepsis dan
meningitis pada bayi yang baru lahir yang diperoleh atau
didapatkan pada jalan lahir selama proses persalinan. Sekitar 5%
dari wanita, terjadi kolonisasi Staphylococcus aureus pada vagina
yang membuat mereka rentan terhadap Toxic Shock Syndrome
(TTS).
71
DAFTAR PUSTAKA
Brooks, G.F., & Carroll, K.C., (2013 'Jawetz, Melnick, & Adelberg's
Medical Microbiology, McGraw Hill. pp (165-173)
Gillespie, S.H, & Bamford, K.B, (2012 'Medical Microbiology and
Infection, at a Glance, Fourth Edition. Wiley-Blackwell. pp (10-
11)
Microbiology, Twenty-Sixth Edition. A Lange Medical Book. The
McGraw-Hill Companies. The United State of America. pdf, pp
(165-172).
Kuswiyanto. (2015 ’Bakteriologi 1, Buku Ajar Analis Kesehatan.
Penerbit Buku Kedokteran EGC. Jakarta. pp (105-115).
Levinson, W. (2016 ‘Review of Medical Microbiology and Imunology,
Fourteenth Edition. A Lange Medical Book. McGraw-Hill
Education. United State of America. Pdf, pp. 26-29.
Ryan, K.J., & Ray, C.G. (2004 ‘Sherris Medical Microbiology, An
Introduction to Infection Disease, 4th Edition. The McGraw-Hill
Companies, United State of America. Pdf, pp. 141-148. Doi:
10.1036/0838585299
Ryan, K.J., et al. (2018 ‘Sherris Medical Microbiology, Seventh Edition.
The McGraw-Hill Companies, United State of America. Pdf, pp.
8-12.
Schwiertz, A., & Rusch, V. (2016 ‘Microbiota of The Human Body,
Implication in Health and Disease. Springer International
Publishing. Switzerland. Pdf. DOI 10.1007/978-3-319-
31248-4
Tortora, G.J., Funke, B.R., & Case, C.L. (2016 ‘Microbiology An
Introduction, Twelfth Edition. Pearson Education. United State
of America. Pdf, pp (15-18). www.pearsonhighered.com
Virgin, H.W., (2014 'The Virome in Mammalian Physiology and
Disease. doi: 10.1016/j.cell.2014.02.032
72
BAB 5
PENYAKIT PARASIT
DALAM KEBIDANAN
Oleh Royani Chairiyah
5.1 Pendahuluan
Di Indonesia, penyakit parasit sangat sering terjadi, terutama
di daerah pedesaan, pinggiran kota, dan daerah kumuh di kota-kota
besar. Di Indonesia tercatat lebih dari 22 spesies protozoa dan 32
spesies cacing telah menginfeksi populasi manusia. Sembilan dari
16 spesies protozoa usus secara konsisten diamati dalam survei
tinja (kusumasari, 2019). Ada berbagai penyakit parasit yang
berdampak signifikan pada kebidanan. Parasit dapat masuk ke
dalam tubuh melalui makanan atau minuman yang terkontaminasi,
kontak langsung dengan korban, atau gigitan serangga.
Parasit adalah mikroorganisme yang hidup dan berkembang
biak pada makhluk lain. Meskipun beberapa parasit tidak
berbahaya, yang lain dapat hidup dan berkembang dalam tubuh
manusia, dapat menyebabkan infeksi. Ada infeksi parasit yang bisa
sembuh dengan sendirinya. Namun, jika seseorang telah menderita
penyakit parasit ini, mereka harus mengunjungi dokter untuk
menghindari penyebaran virus ke orang lain.
76
B. Patogenis
Perubahan patologis pada penderita disebabkan oleh
cacing dewasa di usus dan larva cacing yang beredar di
sirkulasi. Demam, batuk, sesak napas, dan dahak berdarah
semuanya bisa menjadi Ascaris pneumonia indikasi larva cacing
bermigrasi ke paru-paru, menyebabkan pneumonia. Urtikaria
juga sering terjadi, dan hingga 20% pasien mengalami ruam
eosinofilik. Sindrom Loeffler, sering dikenal sebagai, adalah
pneumonia yang disertai dengan gejala alergi. Masalah
pencernaan dan penyerapan protein dapat muncul sebagai
akibat dari infeksi berat (hiperinfeksi), terutama pada anak-
anak, yang mengakibatkan kekurangan gizi dan masalah
pertumbuhan.
C. Pencegahan
Karena Ascaris lumbricoides dapat ditularkan secara oral,
hindari menyentuh wajah dengan tangan kotor untuk
menghindari kontaminasi telur nematoda usus, dan biasakan
mencuci tangan sebelum makan. Hindari makan sayuran
mentah yang belum disiapkan sebelumnya, dan jangan
tinggalkan makanan di tempat terbuka sehingga debu
beterbangan dapat mencemarinya atau serangga dapat
mengakses telur. Untuk mencegah tanah terkontaminasi telur,
lakukan distribusi pembuangan kotoran secara teratur sesuai
dengan aturan kesehatan dan tidak boleh mencemari air
permukaan. Ascaris lumbricoides adalah cacing parasit. Karena
tingginya frekuensi cacing Ascaris lumbricoides di kalangan
anak-anak, sangat penting untuk memberikan pendidikan
cacing Ascaris lumbricoides di sekolah-sekolah. Ada baiknya
juga membiasakan diri untuk mencuci tangan sebelum makan,
membersihkan dan merebus makanan secara menyeluruh,
serta memakai sepatu, terutama di luar rumah.
D. Diagnosis
Karena tidak ada gejala klinis yang sebenarnya pada orang
dengan strongyloidiasis, diagnosis klinis sulit. Kehadiran larva
77
rhabditiform dalam tinja segar, kultur, atau aspirasi duodenum
diperlukan untuk diagnosis definitif. Larva Strongyloides
stercoralis filariform dan cacing dewasa yang hidup bebas
diproduksi setelah setidaknya dua kali kultur 24 jam (Sutanto,
2008).
E. Pencegahan
Pencegahan Strongyloidiasis lebih sulit daripada
pencegahan infeksi cacing tambang. Karena hewan berfungsi
sebagai inang reservoir, hal ini terjadi. Selanjutnya, autoinfeksi
di usus dan siklus hidup bebas parasit di dalam tanah
membuatnya sulit dihilangkan (Soedarto, 2008).
F. Kontaminasi parasite
Segala sesuatu atau zat yang tidak lagi dimanfaatkan oleh
tubuh dan harus dibuang di dalam tubuh disebut sebagai
kotoran manusia. Akibat dari proses respirasi tersebut, zat-zat
yang harus dikeluarkan oleh tubuh berupa feses (feses), urin
(urine), dan CO2. Karena kotoran manusia (feses) merupakan
sumber penyebaran penyakit multikompleks, maka masalah
pembuangan kotoran manusia harus segera diatasi dengan
peningkatan jumlah penduduk yang tidak sebanding dengan
pemukiman. Penyakit yang berawal dari feses dapat menyebar
melalui berbagai cara, dapat mengkontaminasi makanan,
minuman, sayuran dan buah-buahan, serangga (lalat, kecoa),
air, tanah, dan pasir secara langsung melalui beberapa media
tersebut di atas, serta bagian-bagian dari tinja. tubuh kita
(Haqqi, 2009). Benda atau bahan yang terkontaminasi oleh
kotoran seseorang yang sedang menderita suatu penyakit
merupakan sumber penyakit bagi orang lain. Kurangnya
perhatian terhadap feses dan pengelolaan sampah, ditambah
dengan pertambahan penduduk yang tinggi akan
mempercepat penyebaran penyakit yang ditularkan melalui
feses (Haqqi, 2009). Mikroorganisme dapat menguraikan atau
mendegradasi sampah organik. Produk limbah jenis ini tidak
boleh dibuang ke air permukaan karena dapat meningkatkan
78
populasi mikroorganisme di dalam air. Kotoran, kotoran
unggas, sisa tanaman dan daun jatuh, dan bangkai tikus
hanyalah beberapa contohnya. Ketika penduduk menggunakan
toilet darurat, kotoran mereka segera dibuang ke saluran air,
menghasilkan kotoran. Kotoran ayam berasal dari peternakan
di sepanjang pantai yang memelihara ayam dan bebek.
Tumbuhan yang mati di pantai telah meninggalkan sisa-
sisanya. Melimpahnya bangkai tikus karena banyaknya
populasi tikus di sekitar pemukiman penduduk, mendorong
penduduk setempat untuk meracuni tikus dan membuang
tubuhnya ke sungai (Tosepu, 2016).
80
untuk parasit ini, kebersihan mulut dasar dapat membantu
membasminya.
2. Trichomonas Hominis
Panjangnya 8-12 m, berbentuk piriformis, dengan 5
flagela anterior dan membran bergelombang (membran
bergelombang) sepanjang tubuhnya. Merupakan parasit
oportunistik yang sangat berbahaya yang berada di sekum.
Jalur fekaloral digunakan untuk transmisi. Penularan Trofozoit
T. vaginalis tidak dapat bertahan hidup di luar inang dan harus
berpindah dari satu inang ke inang lainnya (orang ke orang).
Bentuk penularan yang paling umum adalah kontak seksual,
dan dapat terjadi bersamaan dengan penyakit menular seksual
lainnya seperti gonore, sifilis, atau Human Immunodeficiency
Virus (HIV). Infeksi dapat ditularkan ke bayi melalui persalinan
pervaginam. T. vaginalis hanya memiliki satu bentuk trofozoit
dan menyelesaikan siklus hidupnya dalam satu inang jantan
atau betina (parasit monoksena). Trophozoites membelah
melalui proses yang dikenal sebagai pembelahan biner
longitudinal. Karena T. vaginalis tidak memiliki mitokondria, ia
harus bergantung pada enzim dan sitokrom untuk
menyelesaikan proses fosforilasi oksidatif. Nutrisi yang
diturunkan dari pejamu dikirim langsung melalui membran
atau melalui proses fagositosis. Meskipun tidak memiliki kista,
parasit ini dapat bertahan hingga 24 jam dalam urin, sperma,
dan air.
Gejala dan patogenesis Setelah infeksi, ada masa inkubasi
4-28 hari (rata-rata 10 hari). T. vaginalis akan menempel pada
sel epitel skuamosa jika menembus kanalis urogenital. Waktu,
suhu, dan pH semuanya berdampak pada kemampuan adhesi
(Arroyo R, 1992). Spektrum klinis trikomoniasis pada wanita
berkisar dari pembawa asimtomatik hingga gejala vaginitis
parah. Keputihan, gatal, nyeri buang air kecil, dan nyeri di
daerah suprapubik adalah gejala T. vaginalis yang paling umum
pada wanita. Sekret vagina sering purulen, putih kehijauan,
berbusa, dan memiliki bau yang kuat. Serviks stroberi, yang
ditandai dengan lesi hemoragik belang-belang akibat
81
peradangan, dapat diamati pada 20% kasus (Petrin D, 1998).T.
Infeksi vaginalis pada laki-laki biasanya asimtomatik, tetapi
dapat menyebabkan ketidaknyamanan kandung kemih sedang,
uretritis, epididimitis, dan prostatitis (Wahyuni, 2011).
2.2.3 Cestoda dan Trematoda
82
3. Penyakit kecacingan disebarkan oleh tinja yang
mengandung telur cacing yang mencemari lingkungan.
Menelan kotoran yang terkontaminasi telur cacing atau
kontak dengan tangan yang terkontaminasi telur cacing
adalah dua cara umum bagi anak-anak untuk terinfeksi.
Karena air sungai sering digunakan untuk berbagai
keperluan sehari-hari, transmisi melalui air sungai juga
dimungkinkan. Ngemil merupakan kebiasaan anak yang
umum di tempat-tempat yang kebersihannya tidak dapat
dikelola oleh orang tua, lingkungan yang tidak terjaga, dan
tempat debu dan kotoran yang membawa telur cacing
dapat merusak lingkungan. Hal ini dapat menjadi sumber
penularan infeksi cacing pada anak-anak. Selain melalui
tangan, telur cacing juga dapat ditularkan melalui makanan
dan minuman, terutama jajanan yang tidak dikemas dan
dibungkus rapat. Telur cacing di tanah/debu akan
mencapai makanan jika diterbangkan oleh angin, atau oleh
lalat yang sebelumnya pernah mendarat di tanah/selokan
dan membawa telur cacing dengan kakinya, terutama pada
gigitan yang tidak terlindungi.
4. Gejala Kecacingan terlihat pada anak adalah :
a. Badan lemah, neusea, sakit perut, lemas, anemia, berat
badan berkurang dan berpotensi diare dengan tinja
berwarna hitam.
b. Jika infeksi ringan, terjadigangguan Gastro Intestinal
ringan.
c. penderita mengalami anemia.
d. Pada infeksi berat meyebabkan mual, anoreksia,
muntah bahkan ileus.
e. Menimbulkan penyakit ”Ground itch” (cotaneous larva
migrans) dengan gejala: gatal-gatal, erythema, papula,
erupsi dan vesicula pada kulit.
84
Epidemiologi
Cacing betina dapat bertelur antara 100.000 hingga
200.000 telur setiap hari, baik yang dibuahi maupun yang tidak
dibuahi. Telur yang dibuahi akan berkembang menjadi bentuk
infektif dalam waktu sekitar 3 minggu di lingkungan yang
menguntungkan. Spesies ini dapat ditemukan hampir di mana saja
di planet ini, tetapi tumbuh subur di iklim tropis dengan suhu tinggi
dan sanitasi yang tidak memadai. Cacing jenis ini dapat menginfeksi
orang dari segala usia. Karena telur cacing matang di dalam tanah,
anak kecil yang sering berinteraksi dengan tanah memiliki risiko
yang signifikan untuk terkontaminasi olehnya. Oleh karena itu,
kebersihan diri dan sanitasi lingkungan di sekitar taman bermain
anak harus diprioritaskan.
Epidemiologi
Parasit ini dapat ditemukan di seluruh dunia, tetapi tumbuh subur
di lingkungan yang panas dan lembab. Seiring dengan cacing Ascaris
lumbricoides, menyebar. Di lokasi yang banyak hujan, frekuensinya
85
paling tinggi. Karena hujan lebat membuat tanah lembab, sangat
ideal untuk pematangan telur cacing. Kotoran manusia biasa
digunakan untuk menyemprot tanaman di areal pertanian dengan
tanaman sayuran, sehingga membersihkan sayuran sebelum
dikonsumsi sangat penting (Yakub dan Herman, 2011).
5.2.6 Malaria
Malaria merupakan penyakit menular yang terus menjadi
masalah kesehatan masyarakat. Parasit malaria (bernama
Plasmodium) dan nyamuk Anopheles betina adalah dua jenis
hewan yang berperan penting dalam penyebaran penyakit malaria.
Plasmodium dikategorikan ke dalam empat kategori spesies yang
dapat menginfeksi sel darah merah manusia di seluruh dunia.
Pengobatan tersebut meliputi pengobatan malaria secara drastis
yang membunuh semua stadium parasit dalam tubuh manusia,
dengan tujuan mencapai kesembuhan klinis dan parasitologis serta
memutus rantai penularan. 2018 Fitriani). Kemoprofilaksis
berupaya menurunkan risiko terinfeksi malaria sehingga gejala
klinis tidak separah jika Anda terinfeksi. Ketepatan dan kecepatan
diagnosis malaria berat, serta ketepatan dan kecepatan
pengobatannya, menentukan prognosis (Julia Fitriani, 2018)
Malaria merupakan sumber utama morbiditas dan mortalitas
di seluruh dunia. Menurut statistik, 3,2 miliar orang di seluruh
dunia berisiko terkena parasit malaria. Lebih dari 70% infeksi
malaria ditemukan di Afrika, dan situasinya memburuk karena
penyakit itu menyebar ke daerah-daerah yang sebelumnya tidak
endemik. Malaria terkonsentrasi di tujuh negara: Afrika, India,
Brasil, Sri Lanka, Afghanistan, Vietnam, dan Kolombia,
menyumbang 30% dari semua kasus. Penularan kasus malaria
tidak hanya melalui nyamuk Anopheles sp, tetapi juga melalui
transfusi darah, jarum suntik, dan penularan dari ibu hamil ke
janinnya.
Malaria tetap menjadi masalah klinis di negara-negara miskin,
terutama yang beriklim tropis. Malaria masih merupakan penyakit
menular yang paling umum di Indonesia. Penyakit ini merupakan
salah satu masalah kesehatan masyarakat Indonesia yang
86
mempengaruhi morbiditas dan mortalitas bayi baru lahir, balita,
dan ibu hamil.
Menurut Survei Kesehatan Rumah Tangga (SKRT), lebih dari
15 juta orang di Indonesia terjangkit malaria klinis setiap tahun,
yang mengakibatkan 30.000 kematian. Menurut statistik dari
program Riset Kesehatan Dasar (RisKesDas) tahun 2007, hampir
setiap provinsi di Indonesia endemis pertumbuhan vektor malaria.
Papua Barat memiliki pangsa daerah endemis perkembangbiakan
vektor malaria tertinggi di antara 33 provinsi, disusul Kalimantan
dan Nusa Tenggara Timur. Di lokasi endemis malaria, malaria pada
kehamilan merupakan komplikasi yang sering terjadi, terutama
pada primigravida. Ibu hamil di daerah terjangkit malaria memiliki
risiko kematian 2-10 kali lebih besar dibandingkan dengan ibu yang
tidak hamil; Sebagian besar kasus malaria pada kehamilan
disebabkan oleh infeksi Plasmodium falciparum. Setiap tahun,
diperkirakan 10.000 ibu dan 200.000 bayi meninggal akibat infeksi
malaria selama kehamilan di antara 50 juta ibu hamil di dunia yang
tinggal di daerah endemis malaria. Malaria paling banyak
menyerang ibu hamil dan bayi baru lahir, karena kedua kelompok
ini paling rentan terhadap infeksi. 2017 (Rahma)
5.2.7 Toxoplasma
Toksoplasmosis adalah penyakit zoonosis yang disebabkan
oleh Toxoplasma gondii, parasit protozoa. Ini adalah parasit yang
sangat umum yang menginfeksi manusia dan hewan berdarah
panas lainnya, dengan perkiraan sepertiga dari populasi manusia di
dunia terinfeksi. Toksoplasmosis dapat asimtomatik (tidak ada
tanda-tanda klinis) dapat memiliki dampak yang lebih serius pada
orang dengan sistem kekebalan tubuh yang lemah, seperti kelainan
bawaan lahir, penyakit mata, atau kemungkinan ensefalitis
toksoplasma yang mematikan. Toksoplasmosis dapat bersifat akut
atau kronis. Toksoplasmosis diklasifikasikan menjadi lima jenis:
toksoplasmosis imunokompeten, toksoplasmosis selama
kehamilan, toksoplasmosis kongenital, toksoplasmosis
immunocompromised, dan toksoplasmosis okular. Gejala klinis
toksoplasmosis umumnya tidak spesifik pada setiap kelompok.
Setiap kategori memiliki metode diagnostik dan interpretasinya
87
sendiri. Toksoplasma dapat didiagnosis menggunakan berbagai tes,
termasuk serologi, PCR, histologi parasit, dan isolasi parasit. Kondisi
ini membutuhkan waktu lama untuk diobati. Metode pengobatan,
serta terapi respons individu, tergantung pada jenis infeksi. Obat
pilihan untuk pengobatan toksoplasma adalah pirimetamin plus
sulfadiazin.(2018, Febrina Halimatunisa).
5.2.9 Arthropoda
Arthropoda memiliki eksoskeleton yang khas dan tubuh yang
terdiri dari banyak segmen. Arthropoda dibagi menjadi empat
kelompok: Chilopoda, Diplopoda, Insecta, dan Arachnida. Insecta
dan Arachnida adalah dua kelas arthropoda yang memiliki dampak
terbesar pada manusia. Berikut ini adalah anggota dari masing-
masing kelas arthropoda: Chilopoda: 1) kelabang, Diplopoda: kaki
seribu. 2) Insecta: Hymenoptera (lebah, tawon, semut api), lalat,
nyamuk, bedbugs, pinjal, kutu, kissing bugs. 3) Arachnids: laba-laba,
kalajengking, tungau, dan caplak.
Berikut ini adalah penyakit yang disebabkan atau
ditransmisikan oleh artropoda:
Caplak (ticks): Lyme disease, Rocky Mountain spotted fever,
relapsing fever, anaplasmosis, babesiosis, tularemia
Lalat: Tularemia, Leishmaniasis, African trypanosomiasis,
bartonellosis, Loiasis
Pinjal (fleas): Pes, Tularemia, Murine Typhus
Chigger mites: Scrub Typhus
Kutu badan: Epidemic typhus, Relapsing fever
Kissing bugs: penyakit Chagas
Nyamuk: malaria, Yellow fever, dengue, West Nile virus,
Japanese encephalitis, chikungunya, Zika virus.
89
90
DAFTAR PUSTAKA
91
Rahmah, Z. (2017) ‘Malaria Pada Kehamilan Dan Konsekuensinya
Pada Ibu Dan Janin’, Journal of Islamic Medicine, 1(1), pp. 30–
43. doi: 10.18860/jim.v1i1.4120.
Setiawan, J. and Fujianor, M. (2019) ‘Keanekaragaman Jenis
Arthropoda Permukaan Tanah Di Desa Banua Rantau
Kecamatan Banua Lawas’, Jurnal Pendidikan Hayati, 53(9), pp.
1689–1699.
Triana, A. (2015) ‘Faktor Determinan Toksoplasmosis Pada Ibu
Hamil’, Jurnal Kesehatan Masyarakat, 11(1), p. 25. doi:
10.15294/kemas.v11i1.3459.
Wahyuni, S. (2011) ‘dr . Sitti Wahyuni , PhD , Dipl . Trop Epid .
Departemen Parasitologi Fakultas Kedokteran Universitas
Hasanuddin Trichomonas vaginalis’, pp. 1–12.
Yakub dan Herman (2011) ‘Tinjauan Pustaka Tinjauan Pustaka’,
Convention Center Di Kota Tegal, 4(80), p. 4.
92
BAB 6
DASAR VIROLOGI DAN MIKOLOGI
Oleh Almira Ulimaz
6.1 Pendahuluan
Seperti yang sudah diketahui bahwasanya Mikrobiologi
merupakan salah satu cabang dari ilmu biologi yang mempelajari
tentang mikroba dalam hal ini mikroorganisme, maka Mikrobiologi
yang merupakan cabang besar dari Biologi ini memiliki cabang lagi
yakni Virologi dan Mikologi. Mikroba sendiri merupakan semua
makhluk hidup yang berukuran sangat kecil yang struktur
organisasi sel nya pada umumnya terdiri dari satu sel (uniseluler)
atau banyak sel (multiseluler). Selama ini, yang sering dikenal
dalam kajian pendidikan maupun penelitian di ranah Mikrobiologi
hanyalah bakteri (Anggraini, dkk. 2020). Padahal di dalam kajian
Mikrobiologi sendiri ada mikroba lain selain bakteri, yaitu virus dan
jamur. Tetapi perlu disadari bahwa virus sendiri bukan termasuk
dalam makhluk hidup atau tidak masuk dalam salah satu dari lima
kerajaan besar makhluk hidup karena dia memang bukan makhluk
hidup sampai dia masuk ke dalam tubuh inang (host).
Fungi dalam hal ini sering disebut secara awam sebagai
jamur, beberapa jenis diantara mereka masuk ke dalam kategori
sebagai mikroba meskipun juga ada sebagian besarnya yang
berukuran besar dan struktur organisasi selnya sudah multiseluler.
Virus dan Fungi ini sebenarnya juga merupakan kajian yang
terdapat di dalam Biologi yang tentunya memiliki nama tersendiri
di dalam ranah ilmu pengetahuan eksakta. Oleh sebab itu di dalam
bab ini nanti akan dibahas tentang ilmu yang mempelajari tentang
virus (ranah ilmu pengetahuan alam atau IPA) dan ilmu yang
mempelajari tentang fungi atau jamur.
Virus sendiri memiliki makna ganda dalam kehidupan. Bisa
diterjemahkan sebagai virus yang sering menyerang tubuh
makhluk hidup atau virus yang menyerang sistem dalam komputer.
93
Tentu saja di dalam bab ini yang akan dipelajari adalan virus dalam
ranah kajian ilmu pengetahuan alam (IPA) yang juga merupakan
cabang kecil dari Biologi (ilmu hayat). Istilah yang sering digunakan
dalam Biologi yakni Virologi atau ilmu yang mempelajari tentang
virus.
Posisi jamur atau fungi dalam kehidupan makhluk hidup juga
ada istilah khususnya dalam Biologi. Ilmu yang mempelajari
tentang fungi atau jamur disebut sebagai Mikologi. Posisi jamur
dalam rantai makanan memang tidak bisa disepelekan. Selain
memang karena Fungi merupakan nama salah satu kingdom dalam
sistem klasifikasi makhluk hidup. Peranan fungi memang tidak bisa
disepelekan dalam kahidupan sehari–hari manusia.
96
Kapsid adalah selubung yang secara struktu berupa
protein. Kapsid terdiri atas bagian–bagian yang
disebut sebagai kapsomer. Misalnya, kapsid pada TMV
atau Tobbaco Mozaic Virus dapat terdiri atas satu
rantai polipeptida yang tersusun dari 2.100 kapsomer.
Kapsid juga dapat terdiri dari banyak protein
monomer yang identik, yang mana masing–masingnya
terdiri dari rantai polipeptida.
3. Isi Tubuh
Isi tubuh virus yang kering disebut sebagai virion. Ini
merupakan bahan genetik yakni asam nukleat (DNA
atau RNA), contohnya sebagai berikut:
a. Virus yang isi tubuhnya RNA dan bentuknya
menyerupai kubus antara lain, virus polyomyelitis,
virus radang mulut dan kuku, dan virus influenza.
b. Virus yang isi tubuhnya RNA, protein, lipida, dan
polisakarida, contohnya paramixovirus.
c. Virus yang isi tubuhnya terdiri atas RNA, protein dan
banyak lipida, contohnya virus cacar.
4. Ekor
Ekor pada virus merupakan alat penancap ke tubuh
organisme yang diserangnya. Ekor virus terdiri atas
tabung bersumbat yang dilengkapi benang atau
serabut. Virus juga memiliki asam nukleat yang
diselubungi oleh kapsid. Selubung ini disebut sebagai
nukleokapsid dan berfungsi sebagai penginfeksi. Ada
dua macam jenis Nukleokapsid:
a. Nukleokapsid yang telanjang, misalnya pada TMV,
Adenovirus, dan virus kutil (warzer virus).
b. Nukleokapsid yang diselubungi oleh suatu
membran pembungkus, misalnya pada virus
influenza dan virus herpes.
Selubung ekor juga memiliki serabut yang berfungsi
sebagai penerima rangsang.
Adapun gambaran struktur tubuh virus secara umum beserta
keterangan yang mudah dipahami dan juga wujud virus yang
biasanya divisualisasikan (Ambil contoh kasus teraktual
97
pandemi COVID–19 varian baru yakni Omicron) adalah
sebagai berikut :
103
Gambar 6.4. Morfologi Fungi (Marcot, 2017)
108
hidup ganggang hijau-biru dan ganggang hijau bersel satu yang
kemudian membentuk lumut kerak.
Siklus hidup Ascomycotina dimulai dari askospora yang
tumbuh menjadi benang (hifa) yang bercabang–cabang.
Kemudian, salah satu dari beberapa sel pada ujung hifa
berdiferensiasi menjadi askogonium, yang ukurannya lebih lebar
dari hifa biasa sedangkan ujung hifa yang lainnya membentuk
Anteridium. Anteridium dan Askogonium tersebut letaknya
berdekatan dan memiliki sejumlah inti yang haploid. Berikut
adalah beberapa contoh jamur anggota dari Divisi
Ascomycotina:
a. Saccharomyces cerevisiae: Organisme ini merupakan jamur
mikroskopis, bersel tunggal dan tidak memiliki badan
buah, sering disebut sebagai ragi, khamir, atau yeast.
Dalam kehidupan manusia, S. cerevisiae dimanfaatkan
dalam pembuatan roti, tape, peuyeum, minuman anggur,
bir, dan sake. Proses yang terjadi dalam pembuatan
makanan tersebut bernama fermentasi.
b. Penicillium spp.: Organisme ini hidup sebagai saprofit pada
substrat yang banyak mengandung gula, seperti nasi, roti,
dan buah yang telah ranum. Pada substrat gula tersebut,
jamur ini tampak seperti noda biru atau kehijauan. Kedua
jenis jamur ini biasa dimanfaatkan dalam memberti cita
rasa atau mengharumkan keju.
3. Divisi Basidiomycota
Divisi Basidiomycota memiliki anggota sekitar 25.000
spesies didalamnya. Menurut Khosi’in (2021) jamur jenis ini
mudah dikenal karena umumnya memiliki tubuh buah dengan
bentuk seperti payung. Walaupun sebagian besar jamur dari
divisi ini dapat dikonsumsi, beberapa diantaranya ada juga yang
bersifat mematikan. Beberapa jenis Basidiomycota yang lainnya
juga dapat membahayakan tumbuhan, misalnya menyebabkan
kematian pada tanaman ladang. Adapun contoh organisme
jamur dari Divisi Basidiomycotina, adalah Volvariella volvacea,
Auricularia polytricha, Puccinia graminis, Amanita phalloides,
109
Agaricus campertis, Lycoperdon sp., Lentinus edodes, dan
Ezobasidium vexans
4. Divisi Deuteromycota
Siklus hidup organisme jamur yang masuk ke dalam divisi
deuteromycota, pada cara reproduksi aseksualnya adalah
dengan menghasilkan konidia atau menghasilkan hifa khusus
yang disebut sebagai konidiofor. Menurut Rumaini (2018),
jamur ini bersifat saprofit dibanyak jenis materi organik, juga
dikenal sebagai parasit pada tanaman tingkat tinggi dan perusak
tanaman budidaya serta perusak tanaman hias. Jamur ini juga
menyebabkan penyakit pada manusia, yaitu dermatokinosis
(kurap dan panu) dan menimbulkan pelapukan pada kayu.
Contoh organisme jamur yang berasal dari kelompok ini adalah
Monilia sitophila atau yang biasa disebut sebagai jamur oncom.
Jamur ini sering dimanfaatkan dalam proses pembuatan oncom
yang berasal dari bungkil kacang. Monilia sitophila juga dapat
tumbuh dari roti dan sisa–sisa makanan. Contoh organisme
jamur lainnya yang berasal dari Divisi Deuteromycota, adalah
a. Aspergillus sp.: Organisme ini merupakan jamur yang
hidup pada medium dengan derajat keasaman dan
kandungan gula yang tinggi.
b. Epidermophyton sp. dan Mycosporium sp.: Kedua jenis
jamur ini adalah parasit pada manusia. Epidermophyton sp.
menyebabkan penyakit kaki atlet sedangkan Mycosporium
sp. adalah penyebab penyakit kurap.
c. Fusarium sp., Verticellium sp., dan Cercos sp.: Ketiga
jenis jamur ini merupakan parasit pada tumbuhan.
Jamur ini jika tidak dibasmi dengan fungisida dapat
merugikan tumbuhan yang diserangnya.
6.3.4 Manfaat Fungi
Manusia sering memanfaatkan jamur sebagai organisme
untuk dikonsumsi. Studi literatur tentang dampak historis dan
sosiologis yang berasal dari jamur ini dikenal dengan istilah
ethnomycology (Yamin‐Pasternak dan Pasternak, 2018). Baru–
baru ini, metode tertentu telah dikembangkan untuk rekayasa
genetika jamur, yang memungkinkan terjadinya rekayasa
metabolik spesies fungi. Sebagai contoh, modifikasi genetik dari
110
spesies ragi yang mudah dan cepat tumbuh dalam proses
fermentasi besar. Berikut ini beberapa manfaat lain dari
beragam jenis jamur:
1. Spesies yang masuk dalam kelompok Zygomycetes berguna
dalam proses pembuatan makanan misalnya jenis Rhizopus
oligosporus. Beberapa contoh spesies yang menjadi anggota
dari Zygomycetes antara lain Rhizopus sp., Pliobolus sp. dan
Muncor sp.
2. Spesies yang masuk dalam kelompok Ascomycotina dalam
kehidupan manusia berperan dalam proses Fermentasi.
Misalnya:
a. Aspergillus oryzae = pembuatan tape.
b. Saccharomyces cereviceae = pembuatan roti.
c. Aspergillus wentii = pembuatan kecap.
d. Neurospora sithophila = pembuatan oncom.
e. Penicellium camemberti dan Penicellium requoforti =
pembuatan keju.
f. Saccharomyces ovale = pembuatan alkohol.
3. Manfaat pada bidang medis adalah penemuan penisilin.
Adapun manfaatnya terdapat pada zat antibiotik yang
dihasilkan oleh jamur jenis Penicillium notatum dan
Penicillium chrysogenum.
4. Peran dalam bidang pertanian adalah jamur yang merupakan
organisme saprofit sangat penting dalam membantu
mengembalikan kesuburan tanah. Jamur–jamur saprofit ini
dapat menghancurkan kayu, dedaunan kering sehingga bisa
menjadi mineral kembali.
5. Berbagai jenis jamur lainnya dapat dikonsumsi, salah satu
contohnya adalah jamur tiram yang menghasilkan laba atau
keuntungan yang cukup besar bagi para pengusaha yang
membudidayakannya (Kristiandi, dkk. 2021).
112
DAFTAR PUSTAKA
Achmad, I., Mugiono, S.P., Tias Arlianti, S.P. and Chotimatul Azmi,
S.P., 2011. Panduan Lengkap Jamur. Penebar Swadaya Grup.
Amri, I.A., Qosimah, D. and Nugroho, W., 2019. Pengantar Virologi
Veteriner. Universitas Brawijaya Press.
Anggraini, D.P., Sulistiana, D., Agustina, D.K. and Ulimaz, A., 2020.
Determination of Kinetic Parameters and The Effect of Ion
Mg2+ Inhibition Into Pectinase Activities. Jurnal Penelitian
dan Pengkajian Ilmu Pendidikan: e–Saintika, 4(2), pp.112–118.
ANGRAINI, L., 2016. Peningkatan Hasil Belajar Dengan
Menggunakan LKS Berbasis Problem Based Learning Pada
Konsep Jamur di Kelas X (Doctoral Dissertation, Fkip Unpas).
Ariyati, E. and Nurdini, A., 2013. Deskripsi Kesulitan Belajar Dan
Faktor Penyebabnya Pada Materi Fungi Di Sma Islam Bawari
Pontianak Dan Upaya Perbaikannya. Jurnal Pendidikan dan
Pembelajaran Khatulistiwa, 2(9).
Bardell, D., 1997. The tobacco mosaic virus. The Science
Teacher, 64(9), p.26.
BBC News Indonesia, 2022. Omicron, nama varian baru virus corona
di Afsel yang bermutasi sangat cepat.
Campbell, N.A., 2004. of Neil A. Campbell and Jane B. Reece’s
Biology.
Fifendy, M., 2017. Mikrobiologi. Kencana.
Gandjar, I., 2006. Mikologi dasar dan terapan. Yayasan Obor
Indonesia.
Gooding, G.V., 1986. Tobacco mosaic virus epidemiology and
control. In The plant viruses (pp. 133–152). Springer, Boston,
MA. https://www.bbc.com/indonesia/dunia-59426212.
Diakses pada 30 April 2022.
Ismail, S., 2019. Mikrobiologi–Parasitologi. Deepublish.
KHOERIAH, D., 2016. Meningkatkan Kreatifitas Siswa Dalam
Membuat Media Pembelajaran Berbasis Video Langsung Pada
Konsep Jamur (Doctoral dissertation, FKIP UNPAS).
Khosi'in, K.I., 2021. Buku Ajar Mata Kuliah Keanekaragaman
Makhluk Hidup (Kingdom Fungi) Berbasis Kearifan Lokal Di
Taman Nasional Bukit Barisan Selatan Bengkulu.
113
Kristiandi, K., Lusiana, S.A., Ayunin, N.A.Q., Ramdhini, R.N., Marzuki,
I., Rezeki, S., Erdiandini, I., Yunianto, A.E., Lestari, S.D., Ifadah,
R.A. and Kushargina, R., 2021. Teknologi Fermentasi. Yayasan
Kita Menulis.
Lianah, M.P., Dasar-Dasar Mikologi. Alinea Media Dipantara.
Lustig, A. and Levine, A.J., 1992. One hundred years of
virology. Journal of virology, 66(8), pp.4629–4631.
Luyunah, L. and Ami, M.S., 2021. Modul pembelajaran biologi
berbasis reading questioning & answer (RQA): materi jamur
(kingdom fungi) untuk peserta didik sma/ma/sederajat kelas X.
LPPM Universitas KH. A. Wahab Hasbullah.
Marcot, B.G., 2017. A review of the role of fungi in wood decay of
forest ecosystems. Res. Note. PNW–RN–575. Portland, OR: US
Department of Agriculture, Forest Service, Pacific Northwest
Research Station. 31 p., 575, pp.1–31.
Mardiana, V., 2016. Identifikasi Jamur Malassezia furfur PADA
PETANI (Studi di Dusun Bendung Rejo RT 11 RW 14
Kecamatan Jogoroto Kabupaten Jombang) (Doctoral
dissertation, STIKes Insan Cendekia Medika Jombang).
Novianti, N., 2020. Aktivitas Anti Jamur Dari Ekstrak Daun Ketepeng
Badak Cassia Alata (Doctoral dissertation, Universitas
Hasanuddin).
Pendidikan, G. 2014. Struktur Tubuh Virus–Pengertian, Ciri, Bentuk,
Parasitisme, Bagian, Ukuran, Proses, Reproduksi.
https://www.gurupendidikan.co.id/struktur-tubuh-virus/.
Diakses pada 30 April 2022.
Priastomo, Y., Supyani, S., A’yun, Q., Lestari, W., Arsi, A., Rini, I.A.,
Kasasiah, A., Hutabarat, M. and Argaheni, N.B., 2021. Virologi.
Yayasan Kita Menulis.
Pulungan, A.S.S., 2018. Tinjauan Ekologi Fungi Mikoriza
Arbuskula. Jurnal Biosains, 4(1), pp.17–22.
Puspita, N. 2022. Struktur Tubuh Jamur dari Divisi Zygomycota dan
Basidiomycota.
https://roboguru.ruangguru.com/question/gambarkan-
struktur-tubuh-jamur-dari-divisi-zygomycota-dan-
basidiomycota-_QU-S5FYZAFA. Diakses pada 30 April 2022.
114
Reece, J.B., Urry, L.A., Cain, M.L., Wasserman, S.A., Minorsky, P.V. and
Jackson, R.B., 2014. Campbell biology (Vol. 9). Boston: Pearson.
Roosheroe, I.G., Sjamsuridzal, W. and Oetari, A., 2014. Mikologi:
dasar dan terapan. Yayasan Pustaka Obor Indonesia.
Rosidah, A. and Amalia, D.I.R., 2018. perkembangan seksual dan
aseksual. Universitas Muhammadiyah Sidoarjo.
RUMAINI, O., 2018. Pengaruh Model Pembelajaran Contextual
Teaching and Learning (CTL) terhadap Kemampuan Berpikir
Kritis Siswa pada Materi Fungi di SMA Negeri 2 Muara Kuang
Kabupaten Ogan Ilir (Doctoral dissertation, UIN Raden Fatah
Palembang).
Suardana, I.B., 2017. Virologi Veteriner.
Suprobowati, O.D. and Kurniati, I., 2018. Bahan Ajar Teknologi
Laboratorium Medik (TLM) Virologi. Kementerian Kesehatan
Republik Indonesia, pp.3–5.
Swandi, W., Ilmi, N. and Rahim, I., 2018, July. Pertumbuhan Isolat
Jamur Tiram (Pleurotus Sp.) Pada Berbagai Media Tumbuh.
In Prosiding Seminar Nasional Sinergitas Multidisiplin Ilmu
Pengetahuan dan Teknologi (Vol. 1, pp. 240-246).
Yamin‐Pasternak, S. and Pasternak, I., 2018. Ethnomycology. The
international encyclopedia of anthropology, pp.1–2.
Yuliana, D., 2016. Perbandingan Multimedia Berbasis Project Based
Learning Dengan Power Point Berbasis Ceramah Terhadap
Hasil Belajar Siswa Pada Konsep Virus (Doctoral dissertation,
FKIP UNPAS).
Zaitlin, M., 1998. The discovery of the causal agent of the tobacco
mosaic disease. In Discoveries in Plant Biology: (Volume I) (pp.
105–110).
115
BAB 7
METABOLISME MIKROORGANISME
Oleh Tri Putri Wahyuni
7.1 Pendahuluan
Mikroorganisme selalu melakukan aktivitas metabolisme
dalam hidupnya. Metabolisme mikroorganisme merupakan proses-
proses kimia yang terjadi didalam tubuh mikroorganisme. (volk
dan Margaret (1993) mengatakan Metabolisme adalah istilah yang
mencakup semua proses kimia yang terjadi didalam sel .
Metabolisme disebut juga reaksi enzimatis, karena metabolisme
terjadi selalu menggunakan katalisator enzim. Dalam metabolisme
mikroorganisme, energi fisik atau kimiawi dikonversi menjadi nergi
melalui metabolisme mikroorganisme dan disimpan dalam bentuk
senyawa kimia yang disebut adenosine 5’-triphospate (ATP). (
Wahyuni dan Indri, 2000). Metabolisme pada mikroorganisme
mencakup proses-proses anabolisme dan katabolisme. Proses
katabolisme disebut juga bioenergy sedangkan proses anabolisme
disebut biosintesis.
7.2.2 Katabolisme
Katabolisme adalah suatu proses pembongkaran atau
perombakan molekul-molekul substrat yang bertebaga potensial
tinggi menjadi moleku-molekul anorganik yang lebih sederhana
dan membebaskan sejumlah energi. Dalam system kehidupan
energy dapat ditransfer dari suatu sumber energi ke sumber energi
lain dalam bentuk elektron-elektron. (Traigan, 1999). Fungsi energi
katabolisme adalah menyediakan energy dan komponen yang
dibutuhkan oleh reaksi anabolisme (waluyo L, 2007).
Reaksi katabolisme mengacu pada reaksi pemecahan molekul
organik kompleks menjadi molekul-molekul organik sederhana.
Reaksi ini membutuhkan molekul air unttuk memecah ikatan kimia
pada molekul kompleks. Reaksi ini melibatkan enzim yang
umumnya melepaskan energi. Contoh reaksi katabolisme adalah
reaksi pemecahan glukosa dalam sel menjadi karbondioksida dan
air. Energi yang dihasilkan dari reaksi katabolisme dugunakan
untuk menjalankan reaksi anabolisme, energi ini disimpan dalam
bentuk adenosin trifosfat (ATP).
117
7.3 Produksi Energi Oleh Mikroorganisme
Sel mikroorganisme mendapat energi dari metabolisme sel
dalam bentuk ATP. ATP merupakan senyawa berenergi tinggi dari
pemecahan nutrisi dan dilepaskan jika dibutuhkan oleh sel. Pada
reaksi katabolik molekul glukosa dipecah dan energi dilepaskan
dalam bentuk ATP yang kemudian dapat dimanfaatkan untuk
aktivitas reaksi anabolik.
7.3.1 Respirasi
Respirasi adalah proses oksidasi biologis dengan O2 sebagai
aseptor elektronnya yang terakhir. Pada jasad eukariotik proses ini
terjadi di dalam mitokondria, sedang pada jasad prokariotik terjadi
di bawah membran plasma atau pada mesosom. Proses ini adalah
fase kedua yang aerob dari perombakan gula fase pertama yang
anaerob (glikolisis). Pada respirasi dihasilkan banyak energi yang
dapat digunakan untuk proses biosintesis.
A. Respirasi aerob
Pada respirasi aerob, oksigen berfungsi sebagai
penerima elektron terakhir. Respirasi aerob adalah
reaksi katabolisme yang memerlukan oksigen. Respirasi
aerob digambarkan dengan reaksi pemecahan 1 molekul
glukosa dan 6 molekul oksigen menjadi 6 molekul
karbondioksida, 6 molekul air dan 38 ATP melalui 4
tahapan. Respirasi aerob pada pada sel prokariot untuk
satu molekul glukosa menghasilkan 38 molekul ATP,
sedangkan pada sel eukariot mengahasilkan 36 molekul
ATP (Mawarti,. dkk, 2022). Berikut adalah detail hasil
dari tahapan glikolisis, dekarboksilasi oksidatif, siklus
krebs dan transport elektron.
1. Glikolisis: tahap pengubahan glukosa (C6) menjadi
asam piruvat (C3), tempat terjadinya reaksi:
sitoplasma, substrat: 1 molekul glukosa, hasil: 2
molekul asam piruvat, 2 molekul ATP dan 2 molekul
NADH.
2. Dekarboksilasi oksidatif: tahap pengubahan asam
piruvat (C3) menjadi 2 asetil koA, 2 NADH, dan 2
CO2, tempat terjadinya reaksi: matriks mitokondria,
118
substrat: 1 molekul glukosa, hasil: 2 molekul asetil
koA, 2 molekul karbondioksida dan 2 molekul
NADH.
3. Siklus krebs: tahap reaksi penyatuan asetil ko-A
dengan asam oksaloasetat menghasilkan Ko-A, 6
NADH, 2 FADH2, dan 4 CO2, Reaksi terjadi dimatriks
mitokondria, substrat: 2 molekul asetil Ko-A, hasil: 2
molekul ATP, 4 molekkul karbondioksida, 6 molekul
NADH dan 2 molekul 2 FADH2.
4. Transfer elektron: tahap reaksi reduksi atau oksidasi
NADH dan molekul FADH2 yang menghasilkan ATP
dan H2O, tempat terjadinya reaksi: krista
mitokondria, substrat: 10 molekul NADH, 2 molekul
FADH2, hasil: 34 ATP dan 6 molekul air/ H2O
(Sudariah, dkk. 2021).
B. Respirasi Anaerob
Respirasi anarob adalah respirasi yng tidak
memerlukan oksigen pada prosesnya. Tempat terjadinya
respirasi anaerob berada pada sitoplasma. Tujuan nya
adalah menguraikan senyawa organik. Pada respirasi
anaerob tidak memerlukan oksigen sama sekali untuk
pembentukan energi dama tubuh makhluk hidup. Proses
anaerob menghasilkan energi dalam jumlah kecil.
Mawarti, dkk (2022) mengatakan pada respirasi
anaerob penerima elektron terakhir diperoleh dari
molekul organik selain oksigen, yaitu NO3-, SO42-, dan
CO32-. Jumlah molekul ATP yang disahasilkan lebih
sedikit daripada respirasi aerob karena hanya sebagian
saja dari siklus krebs yang beroperasi dalam kondisi
anaerob.
1. fermentasi
fermentasi adalah proses terjadimya penguraian
senyawa-senyawa organik untuk menghasilkan
energi serta terjadi pengubahan substrat menjadi
produk yang baru oleh mikroba. Fermentasi
melepaskan energi dari molekul glukosa atau bahan
119
organik lainnya melalui oksidasi. Molekul oksigen
tidak diperlukan dalam fermentasi. Pada proses
fermentasi dua molekul ATP diproduksi oleh substrst
(fosforilasi). Selama fermentasi elektron transfer dari
koenzim tereduksi (NADH, DADPH) menjadi asam
piruvat atau turunannya. Mikroorganisme dapat
menfermentasi berbagai substrat, dengan produk
akhirnya tergantung pada mikroorganisme, substrat
dan enzim. Produk akhir ini berguna untuk
mengidentifikasi mikroorganisme. Dalam fermentasi
asam laktat, asam piiruvat diproduksi oleh NADH
menjadi asam laktat. Dalam fermentasi alkohol,
etanal direduksi oleh NADH menjadi etanol. Hasil
fermentasi bakteri dapat menghasilkan pangan
probiotik, seperti dadih, keju, bir, kimchi, dll.
(Mawarti dkk, 2022).
7.3.2 Fotosintesis
Proses metabolisme mikroorganisme dapat dibedakan
menjadi dua berdasarkan sumber energinya yaitu fototrof dan
kemotrof. Sedangkan apabila berdasarkan kemampuan
mendapat sumber karbonnya menjadi dua juga yaitu autotrof
dan heterotrof. Mikroorganisme fototrof adalah mikroorganisme
yang menggunakan cahaya sebagai sumber energi utamanya.
Fototrof dibagi menjadi dua yakni: fotoautotrof dan
fotoheterotrof.
1. Fotoautotrof
Organisme yang termasuk fotoautrotrof melakukan
fotosintesis. Sedangkan fotosintesis adalah proses
mensintesis senyawa organik kompleks dari unsur-unsur
anorganik dengan menggunakan energi cahaya matahari.
Fotosintesis tidak hanya dilakukan oleh tumbuhan namun
juga dilakukan oleh mikroba. Mikroba yang melakukan
fotosintesis seperti Cyanobacteria, serta beberapa jenis algae.
Pada Reaksi umum yang terjadi dpat dituliskan sebagai
berikut :
120
6H2O + 6CO2 + cahaya → C6H12O6 + 6O2
dalam fotosintesis terjadi dua tahapan reaksi terang dan
reaksi gelap. Reaksi terang atau fosforilasi reaksi ini terjadi di
tilakoid dan reaksi gelap terjadi di dalam stromokloroplas.
Reaksi terang merupakan pemecahan air menjadi
hidrogen dan oksigen yang disebut dengan fotolisis. Hidrogen
hasil fotolisis digabung dengan karbondioksida yang
ditangkap dari uadara bebas untuk membentuk glukosa. Pada
reaksi terang, atom hydrogen dari molekul H2O dipakai untuk
mereduksi NADP menjadi NADPH, dan O2 dilepaskan sebagai
hasil samping reaksi fotosintesis. Reaksi ini juga dirangkaikan
dengan reaksi endergonik pembentukan ATP dari ADP + Pi.
Dengan demikian tahap reaksi terang dapat dituliskan
dengan persamaan:
121
Gambar 7.1 Reaksi Gelap dan Terang
2. Fotoheterotrof
Fotoherotrof adalah kelompok kecil bakteri yang
menggunakan energi cahaya tapi membutuhkan zat organik
seperti alkohol, asam lemak, atau karbohidrat sebagai sumber
karbon. Organisme ini meliputi bakteri non-sulfur, bakteri
ungu, dan hijau.
Contoh :
Fotosintesis anoksigenik, yaitu proses fototrof mana energi
cahaya ditangkap dan diubah menjadi ATP, tanpa menghasil-
kan oksigen.
1. Fotosintesis bakteri ungu non belerang
CO2 + 2CH3CHOHCH3 → (CH2O) + H2O + 2CH3COCH3
2. Fotosintesis bakteri hijau belerang
CO2 + 2H2S → (CH2O) + H2O + 2S
1. Kemoautotrof
Kemoautotrof adalah organisme kemotrof yang
sumber karbonnya berasal dari CO2, hanya
memerlukan CO2 sebagai sumber karbon bukan
122
sebagai sumber energi. Bakteri ini memperoleh energi
dengan mengoksidasi bahan-bahan anorganik. Energi
kimia diekstraksi dari hidrogen sulfida (H2S), amonia
(NH3), ion fero (Fe2+), atau bahan kimia lainnya.
Contohnya adalah bakteri Sulfolobus sp. yang
mengoksidasi sulfur.
2. Kemoheterotrof
Kemoheterotrof adalah organisme kemotrof yang
sumber karbonnya dari senyawa-senyawa organik
(mengonsumsi molekul organik untuk sumber energi
dan karbon). Dibagi menjadi dua berdasarkan akseptor
elektron terakhirnya. Apabila akseptor terakhirnya
adalah O2 contohnya adalah hewan dan hampir semua
fungi, protozoa, serta bacteria. Apabila akseptor
terakhirnya bukan O2 adalah Streptococcus sp dan
Clostridium sp.
123
DAFTAR PUSTAKA
124
BAB 8
NUTRISI PERTUMBUHAN MIKROBA
Oleh Inherni Marti Abna
8.1 Pendahuluan
Nutrisi merupakan zat organik dan anorganik yang dapat
melintasi membran sitoplasma ketika dalam larutan. Sel harus
mampu terlebih dahulu mencerna makanan agar mendapatkan zat
nutrien dari makanan tersebut dengan mengubah molekul-molekul
yang komplek dan besar menjadi molekul-molekul yang lebih
sederhana dan kecil agar dapat larut dan memasuki sel (Bari and
Yeasmin, 2022).
Semua mikroorganisme membutuhkan nutrisi untuk
pertumbuhan dan perkembangannya. Jumlah dan jenis nutrisi yang
dibutuhkan beragam tergantung pada mikroorganisme. Nutrisi
tersebut antara lain air, sumber energi berupa karbon, nitrogen,
vitamin, dan mineral. Karbon dan nitrogen merupakan nutrisi
utama yang dibutuhkan mikroba yang diperoleh dari zat-zat seperti
protein, lemak dan karbohidrat. Nutrisi membantu memenuhi
kebutuhan energi sebagai bahan penyusun struktur sel dan
metabolisme sel. Ada berbagai jenis mikroorganisme, mereka
memiliki fungsi fisiologis tertentu, dan mereka juga membutuhkan
nutrisi tertentu pula. Nutrisi tersebut dapat diperoleh
mikroorganisme dari habitatnya baik media alami maupun buatan
(Uthayasooriyan et al., 2016).
Sebagian besar mikroorganisme memetabolisme gula
sederhana seperti glukosa, sementara yang lain dapat
memetabolisme karbohidrat yang lebih kompleks seperti pati atau
selulosa dari makanan nabati atau glikogen dari makanan hewani.
Beberapa mikroorganisme dapat menggunakan lemak sebagai
sumber energi. Asam amino menyediakan sumber energi dan
nitrogen bagi sebagian besar mikroorganisme. Beberapa
mikroorganisme dapat memetabolisme peptida dan kompleks
125
protein. Sumber nitrogen lain seperti urea, amonia, kreatinin dan
metilamin. Mineral seperti fosfor, besi, magnesium, belerang,
mangan, kalsium dan kalium diperlukan untuk pertumbuhan
mikroba dalam jumlah kecil, sehingga berbagai mineral dapat
berfungsi sebagai sumber nutrisi yang baik (Pelczar. J. Michael dan
Chan E.C.S., 2006).
128
1. Pengaruh Karbon
Karbon adalah komponen utama dari semua bahan
seluler organik, terhitung sekitar 50% dari berat kering sel.
Salah satu bentuk karbon yang mudah teroksidasi adalah CO2.
Mikroorganisme fotosintetik mereduksi CO2 menjadi
komponen seluler organik, sedangkan mikroorganisme non-
fotosintetik memperoleh kebutuhan karbonnya terutama dari
nutrisi organik yang mengandung senyawa karbon tereduksi.
Senyawa organik ini tidak hanya menyediakan karbon untuk
sintesis, tetapi juga memenuhi kebutuhan energi dengan
memasuki jalur penghasil energi dan akhirnya dioksidasi
menjadi CO2 (Mohamed Saad Abo-Elenain, 2017).
Beberapa mikroba memiliki kemampuan untuk
mensintesis semua komponen selulernya menggunakan satu
sumber karbon organik, sementara yang lain memerlukan
komponen karbon kompleks lainnya selain sumber karbon
utama yang tidak dapat mereka sintesis. Komponen ini disebut
faktor pertumbuhan dan termasuk vitamin. Beberapa mikroba
dapat menggunakan lebih dari satu senyawa karbon dan
digunakan untuk berbagai macam keperluan (Basu et al.,
2015).
2. Pengaruh Nitrogen
Mikroorganisme dapat menggunakan sumber nitrogen
anorganik dan organik. Sumber nitrogen anorganik adalah
NH3, NH4+, NO3–, dan NO2–. Sumber nitrogen organik seperti
ekstrak ragi, pepton, dan whey tidak hanya mengandung
nitrogen tetapi juga faktor pertumbuhan tertentu. Selain
melakukan fungsi nutrisi, sumber nitrogen seperti NO3– dan
NO2– juga dapat digunakan oleh organisme yang tumbuh
tanpa oksigen menggunakan respirasi anaerob. Misalnya
Bacillus subtilis yang diketahui menghasilkan biosurfaktan
dengan aktivitas antibakteri, menggunakan sumber nitrogen
NH4+ sebagai nutrisi dengan adanya oksigen, tetapi digunakan
untuk respirasi anaerobik tanpa adanya oksigen (Mohamed
Saad Abo-Elenain, 2017).
129
3. Pengaruh Sulfur
Mikroorganisme menggunakan belerang yang
terkandung dalam asam amino, tiamin, dan biotin. Beberapa
bakteri menggunakan SO4-2 atau H2S. Bakteri pengoksidasi
sulfur yang umum seperti Thiobacillus thiooxidans adalah
bakteri yang menggunakan tiosulfat dan sulfida sebagai
sumber energi untuk menghasilkan asam sulfat. Bakteri
belerang aerobik ini menarik energi dari oksidasi sulfida atau
unsur belerang menjadi sulfat (Wagner et al., 2019).
4. Pengaruh Posfor
Mikroba menggunakan Posfor yang terdapat di dalam
DNA, RNA, membran, dan ATP. Beberapa bakteri
menggunakan PO3- sebagai sumber posfor.
5. Pengaruh Unsur-Unsur Mikro
Mikroorganisme tidak hanya menggunakan unsur-unsur
makro (mayor), tetapi juga unsur-unsur lain yang diperlukan
untuk hampir semua mikroorganisme dalam fraksi residu,
seperti kobalt, tembaga, mangan, molibdenum, nikel, selenium,
tungsten, vanadium, dan seng. Unsur-unsur tersebut sering
disebut sebagai unsur mikro (trace element) (Egli, 2015).
131
b. Agar terbuat dari rumput laut yang berfungsi sebagai
pemadat media. Pemadat dibutuhkan untuk keperluan
pengamatan pertumbuhan koloni mikroba. Agar sulit
didegradasi oleh mikroorganisme pada umumnya dan
mencair pada suhu 45oC.
c. Gelatin juga memiliki fungsi yang sama seperti agar. Gelatin
adalah polimer asam amino yang diproduksi dari kolagen.
Kekurangannnya adalah lebih banyak jenis mikroba yang
mampu menguraikannya dibanding agar.
d. Silica gel, yaitu bahan yang mengandung natrium silikat.
Fungsinya juga sebagai pemadat media namun khusus
digunakan untuk memadatkan media bagi mikroorganisme
autotrof obligat (Difco and BBL Team, 2009).
132
Gambar 8.1 Pembuatan Medium Plate Count Agar (PCA) yang
berbentuk padat. Sumber: Dokumentasi Pribadi
b. Berdasarkan Komposisi/Susunannya
Berdasarkan komposisinya media dibagi atas:
1. Media alam/non sintetik adalah media yang tersusun dari
bahan alam yang komposisinya belum diketahui secara
pasti, seperti: ekstrak kentang, tepung, daging, telur, ikan,
sayuran dan lain-lain. Saat ini, media alami digunakan
secara luas dalam kultur jaringan tumbuhan dan hewan.
Media alam dapat digunakan untuk bakteri, kapang, khamir
dan virus. Contoh media alam lain yang lebih banyak
133
digunakan adalah telur untuk pertumbuhan dan
perkembangbiakan virus. (Atlas, 2010).
2. Media semi sintetik adalah media yang tersusun dari bahan
alam dan bahan sintetik. Contoh : Kaldu nutrisi terdiri dari :
Peptone 10,0 g, ekstrak daging 10,0 g, NaCl 5,0 g dan
Aquadest 1000 ml (Irianto, 2006).
3. Media sintetik, yaitu media yang dibuat dari senyawa kimia
yang jenis dan jumlahnya diketahui secara pasti. Komposisi
kimia dan konsentrasi semua media sintetik dikenal dalam
bentuk formula. Contohnya adalah media alkali yang
ditambahkan NH4Cl dengan sumber karbon berupa gas
CO2, yang dapat digunakan untuk menumbuhkan bakteri
Nitrosomonas ketika diinkubasi dalam gelap. Contoh lain
adalah media dengan komposisi formula tertentu yang
dibubuhi glukosa. Dalam kondisi aerobik, media ini
merupakan media untuk perbanyakan jamur dan bakteri
heterotrofik. Glukosa berfungsi sebagai sumber karbon dan
sumber energi. Dalam kondisi anaerobik, media ini dapat
digunakan untuk kultur anaerob fakultatif dan anaerob
obligat. (Chauhan and Jindal, 2020).
135
Gambar 8.3 Media SSA . Sumber: Microbiology Info.com
136
Gambar 8.4 Media PDA untuk menumbuhkan kapang
Sumber: (Abna, Bella Sylvia and Mellova Amir, 2021)
138
DAFTAR PUSTAKA
9.1 Pendahuluan
Pada suatu organisme, pertumbuhan adalah proses
bertambahnya ukuran atau subtansi atau masa zat misalnya untuk
makhluk makro dikatakan tumbuh ketika bertambah tinggi,
bertambah besar atau bertambah berat. Namun hal tersebut
berbeda pada organisme bersel satu (seperti bakteri ataupun
mikroorganisme lainnya) pertumbuhan mengacu pada pertumbu-
han koloni, yakni pertambahan jumlah koloni, ukuran koloni yang
semakin besar atau subtansi atau masssa mikroorganisme dalam
koloni tersebut semakin banyak. Terdapat dua macam tipe
pertumbuhan yakni pembelahan inti tanpa diikuti pembelahan sel
sehingga dihasilkan peningkatan ukuran sel dan pembelahan inti
yang diikuti pembelahan sel.
Ciri khas reproduksi mikroorganisme adalah pembelahan
biner, dimana dari satu sel mikroorganisme dapat dihasilkan dua
sel, apabila kita mulai dengan satu maka populasi mikroorganisme
bertambah secara geometrik (Pelczar, M. J. dan Chan, 2006):
1 -> 2 -> 22 -> 23 -> 24 -> 25 .…. 2n
Atau dengan perhitungan sederhana,
1 -> 2 -> 4 -> 8 -> 16 -> 32 ……
(2n merupakan singkatan aljabar yang menunjukkn jumlah akhir,
dalam hal ini adalah jumlah maksimum sel yang pada akhirnya
dicapai di dalam populasi)
141
3. Fase statisioner (statis)
4. Fase death (kematian)
142
Namun hal tersebut berbeda apabila nutrient yang tersedia
dan kondisi lingkungan yang baru dan berbeda dengan
sebelumnya, maka diperlukan waktu penyesuaian untuk
mensintesa enzim-enzim (Boleng, 2015).
2. Jumlah inokulum.
Jumlah awal sel yang tinggi akan dapat mempercepat fase
adaptasi.
143
9.3 Kecepatan Pertumbuhan dan Waktu Generasi
Kecepatan pertumbuhan mikroorganisme merupakan
bertambahnya jumlah mikroorganisme yang terhitung dalam
satuan waktu. Interval waktu yang dibutuhkan bagi sel untuk
membelah diri disebut sebagai waktu generasi. Sedangkan waktu
yang dibutuhkan untuk sejumlah sel/massa sel menjadi dua kali
lipat jumlah/massa sel disebut doubling time/waktu penggandaan
(Pelczar, M. J. dan Chan, 2006). Mayoritas bakteri memiliki waktu
generasi berkisar satu sampai tiga jam (Padali, 2016). Waktu
generasi ini sangat bergantung pada cukup tidaknya nutrisi di
dalam media pertumbuhan, kondisi fisik, serta laju pertumbuhan.
144
Dalam bentuk logaritma, rumus N = N02n menjadi: (
log N = log N0 + n log 2
log N – log N0 = n log 2
– –
n = =
Waktu generasi =
dimana,
t : waktu pertumbuhan
n : jumlah generasi
dimana,
G : waktu generasi
t : selang waktu antara prngukuran jumlah sel di dalam
populasi pada suatu saat dalam fase log (B) dan
kemudian pada satu titik waktu setelahnya (b)
B : populasi awal
b : populasi setelah waktu t
3,3 : faktor konfersi log2 menjadi log10
147
9.5.2 Pengukuran Pertumbuhan Mikroorganisme secara
Tidak Langsung
Pengukuran pertumbuhan mikroorganisme secara tidak
langsung dapat dilakukan dengan beberapa metode diantaranya:
1. Pengukuran berdasarkan kekeruhan
Pada metode ini pertumbuhan mikroorganisme diamati
berdasarkan turbiditas (kekeruhan) sel dalam bentuk suspensi
dalam meneruskan cahaya. Apabila suspensi sel semakin
keruh, intensitas cahaya yang diteruskan akan semakin kecil.
Hal ini menunjukkan terjadinya pertumbuhan. Untuk
menghitung jumlah sel dalam medium, suspensi akan dihitung
berdasarkan standar jenis mikroorganisme sama yang telah
diketahui jumlah tiap mililiternya (Kustyawati, 2020) . Alat
yang digunakan untuk menentukan kekeruhan diantaranya,
turbidimeter, spectrophotometer dan alat lainnya yang sejenis.
Pada metode ini, yang terhitung adalah jumlah sel yang hidup
maupun yang mati.
2. Berdasarkan analisis kimia
Kandungan atau komposisi kimia sel juga dapat digunkan
untuk adamya pertumbuhan mikroorganisme. Semakin besar
kandungan komposisi kimia sel, jumlah sel mikroorganisme
juga semakin banyak. Senyawa kimia yang dianalisis
diantaranya kandungan protein, asam nukleat (DNA dan RNA)
dan lain sebagainya (Kustyawati, 2020).
3. Berdasarkan berat kering
Kenaikan berat kering digunakan sebagai salah satu parameter
pertumbuhan karena terjadi kenaikan sintesis dan volume sel,
sehingga dapat digunakan untuk menentukan jumlah
mikroorganisme (Kustyawati, 2020). Untuk mengetahui berat
kering, sel, dilakuakan pemisahan pada suspensi
mikroorganisme menggunakan sentrifuge, endapan yang
terbentuk kemudian dikeringkan dan ditimbang. Pada metode
ini, tidak dapat dibedakan mikroorganisme yang hidup dan
yang mati (Prayitno & Ifadah, 2020).
148
9.6 Faktor-Faktor Pertumbuhan Mikroorganisme
Mikroorganisme memerlukan kondisi tertentu agar dapat
tumbuh dengan optimal. Pertumbuhan mikroorganisme
dipengaruhi oleh beberapa faktor yang dapat dikelompokkan
menjadi faktor kimia dan faktor fisik.
9.6.1 Faktor Kimia Pertumbuhan Mikroorganisme
Faktor kima pertumbuhan mikroorganisme meliputi
kandungan nutrisi dan media pertumbuhan
1. Kandungan nutrisi
Nutrisi adalah bahan yang diperlukan untuk mikroorganisme
dalam melakukan metabolisme dan pertumbuhannya.
Terdapat dua jenis nutrisi, yakni makrolemen dan
mikroelemen. Makroelemen merupakan elemen nutrisi yang
diperlukan dalam jumlah banyak meliputi karbon (C),
oksigen(O), hidrogen (H), nitrogen (N), sulfur (S), pospor (P),
kalsium (Ca), magnesium (Mg), kalium (K), dan besi (Fe). C, H,
O, N, dan P yang diperlukan untuk pembentukan karbohidrat,
lemak, protein, dan asam nukleat. Kalium (K) untuk
mensintesis protein, dan Ca+ yang berperan dalam resistensi
endospora mikroorganisme terhadap panas. Sedangkan
mikroelemen merupakan elemen nutrisi yang diperlukan
dalam jumlah sedikit meliputi mangan (Mn), zinc (Zn), kobalt
(Co), Nikel (Ni), dan tembaga (Cu). Mikroelemen juga
terkadang adalah bagian enzim atau kofaktor yang membantu
katalisis dan membentuk protein (Padali, 2016).
2. Media pertumbuhan
Media adalah bahan yang mengandung campuran zat nutrisi
yang dibutuhkan oleh mikrorganisme untuk pertumbuhannya.
Mikroorganisme memanfaatkan nutrisi pada media untuk
menyusun komponen sel. Media juga dapat dikelompokkan
berdasarkan fungsinya dalam proses analisis mikroorganisme,
diantarny adalah :
1) Media diperkaya (enrichment media), merupakan media
yang ditambahkan zat-zat tertentu seperti serum, darah
atau ekstrak tanaman untuk mendukung pertumbuhan
mikroorganisme heterotrof tertentu secara optimal.
149
Contoh media ini adalah Blood Agar yang digunakan untuk
kultivasi bakteri Streptococus sp. dan Staphylococcus sp.
2) Media selektif (selective media), merupakan media yang
digunakan untuk mengisolasi mikroorganisme tertentu.
media ini mengandung zat yang dapat menghambat
pertumbuhan mikroorganisme tertentu seperti pewarna,
antibiotik, garam atau lainnya. Contoh media ini adalah
Nutrient Agar yang ditambahkan penisilin dapat digunakan
untuk menghambat bakteri Gram negatif. Selain itu ada
Manitol Salt Agar (MSA) yang digunakan untuk mengisolasi
bakteri Staphylococcus aureus. S.aureus dapat
memfermentasi manitol dan menghasilkan asam yang
dapat mengubah media dari warna merah menjadi kuning.
Sedangkan pertumbuhan bakteri jenis lainnya terhambat.
3) Media diferensial, media ini digunakan untuk
membedakan mikroorganisme yang secara morfologi dan
biokimiawi memiliki hubungan yang erat seperti dalam
kelompok yang sama. media ini mengandung zat kimia
tertentu sehingga saat inokulasi dan inkubasi
menghasilkan perubahan yang khusus sehingga bisa
dibedakan koloni jenis bakteri satu dengan bakteri lainnya.
Contoh media ini adalah Eosin Methylen Blue Agar (EMBA)
yang digunakan untuk membedakan 2 jenis bakteri
koliform yakni bakteri fekal dan non fekal. Bakteri fekal
adalah bakteri yang umumnya terdapat pada pencernaan
manusia seperti E.coli, Salmonella sp.,dan Shigella sp..
Sedangkan bakteri non fekal adalah bakteri yang terdapat
di luar pencernaan manusia seperti Basillus sp.,
Streptococcus sp. dan Staphylococcus sp. Kandungan
metilen blue pada media bersifat sebagai penghambat
bakteri Gram positif. Kombinasi eosin dan metilen biru
dapat berfungsi untuk membedakan antara
mikroorganisme yang dapat memfermentasi laktosa dan
yang tidak. Kelompok bakteri fekal yang mampu
memfermentasi laktosa akan bewarna hijau metalik dan
ada titik hitam ditegahnya, sedangkan kelompok bakteri
150
nonfekal yang tidak dapat memfermentasi laktosa akan
bewarna merah muda
Selain media-media yang telah disebutkan terdapat pula
beberapa media yang sering digunakan dalam analisis
mikroorganisme. Berikut adalah beberapa media dan
mikroorganisme yang tumbuh pada media tersebut
diantaranya :
a. PCA (Plate Count Agar) : seluruh mikroorganisme
(mikroorganisme total)
b. MRSA (de Man Rogosa Sharpe Agar) : bakteri asam
laktat (BAL)
c. PDA (Potato Dextrose Agar) : kapang
d. PGYA (Peptone Glucose Yeast Extract Agar) :
yeast/khamir
e. VRBA (Violet Red Bile Agar) : enterobakteria
f. SSA (Salmonella Shigella Agar) : Salmonella sp. dan
Shigella sp.
g. LB (Lysogeny Broth) atau Luria-Bertani : bakteri
terutama E.coli
h. BSA (Bismuth Sulphite Agar) : Salmonella sp.
151
Kisaran nilai pH dari beberapa kontoh mikroorganisme dapat
dilihat pada Gambar 9.2
2. Suhu
Suhu dapat mempengaruhi aktifitas enzim oyang terlibat
dalam proses biokimia pada mikroorganisme. Peningkatan
suhu 10o C dapat meningkatkan aktifitas menjadi 2 kali lipat.
Pada suhu yang sangat tinggi akan dapat terjadi denaturasi
protein sedagkan pada suhu yang sangat rendah aktifitas
enzim akan berhenti. Setiap mikroorganisme memiliki kisaran
suhu yang berbeda untuk pertumbuhannya. Terdapat
mikroorganisme tertuama bakteri yang mampu hidup pada
suhu yang mendekati suhu pembekuan atau juga suhu yang
mendekati titik didih. Berdarkan tingkat toleransinya terhadap
suhu lingkungan, mikroorganisme dapat diklasifikasikan
menjadi kelompok berikut :
1) Psikrofil : mikroorganisme yang dapat tumbuh pada suhu 0
- 8oC, dengan suhu optimumnya adalah 10oC.
Contohnya bakteri Gallionella.
2) Psikrotrof : mikroorganisme yang dapat tumbuh pada
suhu 0 - 35oC, dengan suhu optimumnya adalah 21oC.
Contohnya L. monocytogenes
3) Mesofil : mikroorganisme yang dapat tumbuh pada suhu
20-45oC, dengan suhu optimumnya adalah 37oC.
Contohnya kapang, khamir, E. coli dan hampir mencakup
semua bakteri patogen pada manusia.
4) Termofil : mikroorganisme yang dapat tumbuh pada
suhu >35oC. Contohnya Bacillus, Clostridium, Sulfolobus,
dan bakteri pereduksi sulfat/sulfur.
152
Gambar 9.2 Kisaran pH beberapa jenis mikroorganisme
(Kustyawati, 2020)
4. Tekanan osmotis
Osmosis merupakan perpindahan air melewati membran
semipermeabel karena ketidakseimbangan material terlarut
dalam media. Mikroorganisme yang mampu tumbuh pada
lingkungan hipertonik dengan kadar natrium tinggi dikenal
dengan halofil, contohnya bakteri dalam laut, misalnya
Halobacterium halobium.
5. Kebutuhan oksigen
Oksigen tidak mutlak diperlukan mikroorganisme karena ada
juga kelompok yang tidak memerlukan oksigen bahkan
oksigen merupakan racun bagi pertumbuhan. Gambaran
kebutuhan oksigen pada pertumbuhan mikroorganisme dapat
dilihat pada Gambar 9.3.
Mikroorganisme terbagi atas empat kelompok berdasarkan
kebutuhan akan oksigen, yaitu (Open Stax Microbiology,
2018):
1) Obligat aerob : mikroorganisme yang sangat
membutuhkan oksigen dan tidak dapat tumbuh apabila
tidak ada pasokan oksigen. Contohnya Mycobacterium
tuberculosis.
2) Obligat anaerob : mikroorganisme yang tidak memerlukan
oksigen untuk perumbuhannya, bahkan kosigen bisa
154
menjadi toxin bagi mikroorganisme tersebut. Contohnya
Clostrodium sporogenes.
3) Fakultatif anaerob : Mikroorganisme yang tumbuh baik
dengan adanya oksigen namun tetap dapat tumbuh tanpa
adanya oksigen. Contohnya Staphylococcus sp.
4) Aerotolerant : mikroorganisme yang pertumbuhannya
tidak dipengaruhi ada atupun tidaknya oksigen. Contohnya
Cutibacterium acnes.
5) Mikroaerofil : mikroorganisme yang membutuhkan
oksigen yang minimum untuk pertumbuhan, tingkat
oksigennya harus tepat tidak terlalu banyak dan tidak
terlalu sedikit. Contohnya Listeria monocytogenes.
155
DAFTAR PUSTAKA
156
BAB 10
ANALISA PEMERIKSAAN
MIKROBIOLOGI
Oleh Lindawati
158
4. Gelas ukur
5. Pipet ukur
6. Erlenmeter
7. Neraca analitik
8. Water bath
9. Autoclave
10. Incubator
Prosedur :
1. Pembuatan media agar
- Timbang agar sesuai kebutuhan
- Media yang dipakai adalah Nutrien Agar (20 gr/L)
- Untuk ukuran ruangan 2 x 3 m, dibutuhkan 2 buah
petridish @ 15 ml
- Larutkan dengan aquades sebanyak 30 ml dan
masukkan ke dalam Erlenmeyer
- Panaskan dalam water bath sampai suhu 1000C
- Angkat dan tuangkan ke dalam petridish dengan
ketebalan 3 mm
2. Sterilisasi
Prinsip dasar dari pemeriksaan mikrobiologis adalah
semua alat dan bahan harus dalam keadaan steril.
Langkah-langkah sterilisasi sebagai berikut :
- Bungkus petrisish dengan menggunakan kertas
koran
- Lalu masukkan ke dalam autoclave lakukan
sterilisasi pada suhu 121 0 C selama 15 menit.
- Matikan autoclave dan keluarkan petridish yang
bersisi media tadi
159
- Letakkan petridish pada tempat yang datar dan
biarkan media agar sampai membeku (kondisi
petridish dalam keadaan tertutup)
3. Pengambilan Sampel dan penanaman sampel
- Setelah agar membeku, lakukan pengambilan sampel
pada lokasi yang sudah ditentukan sebelumnya.
- Tentukan titik pengambilan sampel
- Kemudian letakkan petridish pada titik pengambilan
sampel
- Buka tutup petridih dan biarkan selama 30 menit
- Tutup kembali petridish dan inkubasi dalam
incubator pada suhu 35-37 0 C selama 1-2 kali 24
jam
4. Penghitungan density atau kepadatan mikroba udara
- Keluarkan petridish dari incubator dan amati bentuk
koloni bakteri yang nampak
- Hitung jumlah koloni bakteri dengan mengunakan
koloni counter
- Hitung density bakteri dengan menggunakan rumus :
160
- Tetesi dengan larutan carbol fuchsin, lalu panaskan
kira-kira 5 menit atau sampai timbul uap tetapi
jangan sampai kering.
- Buang kertas tissue lalu bilas dengan aquadest
- Lunturkan dengan alkohol asam selama 20 detik
- Bilas dengan aquadest
- Kemudian tetesi dengan methylen blue 1-2 menit
- Bilas dengan aquadest dan keringkan dengan tissue
dengan cara ditepuk-tepuk
- Amati di bawah mikroskop mulai dari pembesaran
kecil (40x) sampai ke pembesaran 100x (memakai
minyak immersi)
- Gambar dengan sklal yang sesuai.
5. Pembacaan hasil
Bila ditemukan bakteri berwarna merah muda, berarti
termasuk bakteri than asam, dan bila ditemukan bakteri
berwarna biru berarti termasuk bakteri tidak tahan
asam.
161
dalam sampel air karena jumlah sampel sedikit, oleh karena itu
digunakanlah Coliform sebagai indicator dengan alasan :
- Selalu ada dalam tinja (flora normal usus vertebrata), jika
Coliform terdapat dalam air menunjukan adanya
pencemaran air oleh tinja yang identic dengan danya
bakteri pathogen.
- Bisa hidup di luar tubuh manusia
- Jumlahnya cukup banyak
- Mudah dibiakkan
- Mudah dikenali
1. Uji Penduga
2. Uji Penguat
3. Uji Pelengkap
165
- Masukkan tabung durham secara terbalik, bolak
balik tabung reaksi sampai tidak ada lagi rongga
udara di dalam tabung durham.
- Tutup test tube dengan kapas
- Sisa TSL sebanyak 45 ml, dijadikan SSL dengan
menambah aquadest sebanyak 90 ml
- Masukkan ke dalam 10 test tube, masing masing
berisi sebanyak 10 ml, lalu masukkn tabung durham
secara terbalik, bolak balik test tube sampai tidak
ada lagi rongga udara di dalam tabung durham
- Sterilkan di dalam autoclave pada suhu 1210 C
selama 15 menit.
2. BGLB
- Tumbang BGLB sesuai dengan kebutuhan
- Dibutuhkan BGLB sebanyak 30 tabung (40 gr/L)
- Isi 1 test tube adalah 10 ml, jadi total dibutuhkan 300
ml
- Larutkan dalam aquadest dan homogenkan
- Masukkan ke dalam masing-masing test tube,
masukkan juga tabung durham
- Tutup dengan kapas
- Sterilkan semua media dalam autoclave
Confirmated Test :
166
- Hasil positif presumptive dipindahkan ke test
penegasan (media BGLB)
- Pindahkan sampel dengan menggunakan ose, pada
semua tabung yang positif
- Lakukan inkubasi
Pembacaan hasil :
Hasil positif dari confermated test dibandingkan dengan table
MPN Index
168
A. ALAT DAN BAHAN
1. Alat
a. petri dish
b. tabung reaksi
c. pipet ukur
d. erlemeyer
Bahan
e. Pepton Dilution Fluid (PDF)
f. Plate Count Agar (PCA)
g. sample makanan, minuman, jamu
B. PROSEDUR KERJA
1. Lakukan pengenceran sampel dengan larutan PDF
2. Masukkan 1 ml sampel tiap pengenceran ke dalam
petridish steril (duplo)
3. Tuangkan PCA ke dalam petridish yang sudah berisi
sampel sebanyak 22 ml atau ketebalan lebih kurang 2
mm
4. Homogenkan dengan cara memutar petridish searah
dengan jarum jam sebanyak 3 kali, biarkan agar
membeku
5. Setelah membeku, lakukan inkubasi di dalam incubator
selama 24 – 48 jam pada suhu 37o C
6. Hitung jumlah koloni yang terbentuk atau angka
lempeng total bakteri
169
170
DAFTAR PUSTAKA
171
BIODATA PENULIS
172
BIODATA PENULIS
173
BIODATA PENULIS
174
BIODATA PENULIS
175
BIODATA PENULIS
Royani Chairiyah
Staf Dosen Kebidanan
177
PROFIL PENULIS
178
BIODATA PENULIS
179
BIODATA PENULIS
180
BIODATA PENULIS
181