DOMAIN BACTERIA

ADA 23 phylum

Bacteria 1
 Keanekaragaman Mikrobia (Filum)

Bacteria 2
 Keanekaragaman Mikrobia

A. Domain Archaea : 2 phylum

B. Domain Bacteria : 23 phylum
C. Domain Eukarya:
1. Dunia Fungi
2. Dunia Protista:
a. Protozoa
b. Algae
c. Slime molds
d. Water molds
Bacteria 3
 Keanekaragaman Mikrobia

UPDATE.

Pada literatur tahun 2019 menyebutkan →

berdasarkan sampel 16S rRNA dari lingkungan
terdapat lebih 80 filum bakteri yang ditemukan.

Namun, hanya terdapat 29 filum yang paling banyak

dipelajari dan paling sedikit memiliki 1 anggota
yang dapat dikultur dan dimurnikan.

Bacteria 4
 Bentuk sel bakteri

Baketria: koloni

Bacteria 5
Beberapa bentuk sel bakteri & Cyanobacteria

Bacillus antharcis Salmonella sp. Borellia sp.

Cyanobacteria

Bacteria 6
 Struktur sel bacteria

Bacteria 7
 Sistem Klasifikasi Bacteria

Phenetic Classification:
Bergeys Manual of Determinative Bacteriology (9th
Edition; 1994):

Dibagi 4 Division yaitu:

1.Division I : Gracilicutes (gram negatif)
2.Division II : Firmicutes (gram positif)
3.Division III : Tenericutes (tanpa dinding sel →
Mycoplasma)
4.Division IV : Mendosicutes (Archaea →sudah
di bahas)
Bacteria 8
 Keanekaragaman Bacteria

Domain bacteria
↓
Kingdom bacteria
↓
23 Phylum

Bacteria 9
 Phylum Bacteria
1. Phylum Aquificae 14. Phylum Actinobacteria
2. Phylum Thermotogae (Actinomycetes)
3. Phylum Thermodesulfobacteria 15. Phylum Planctomycetes
4. Phylum Deinococcus-Thermus 16. Phylum Chlamydiae
5. Phylum Chrysiogenetes 17. Phylum Spirochaetes
6. Phylum Chloroflexi 18. Phylum Fibrobacteres
7. Phylum Thermomicrobia 19. Phylum Acidobacteria
8. Phylum Nitrospira 20. Phylum Bacteroidetes
9. Phylum Deferribacteres 21. Phylum Fusobacteria
10. Phylum Cyanobacteria 22. Phylum Verrucomicrobia
11. Phylum Chlorobi 23. Phylum Dictyoglomi
12. Phylum Proteobacteria
Bacteria 10
1. Aquificae
• Aquifex
• Calderobacterium
• Hydrogenobacter
• Thermocrinis
• Hydrogenothermus
• Persephonella
• Sulfurihydrogenibium
• Balnearium (incertae sedis)
• Desulfurobacterium
(Incertae sedis)
• Thermovibrio
Bacteria
2. Thermotogae
• Thermotoga
• Fervidobacterium
• Geotoga
• Marinitoga
• Petrotoga
• Thermosipho
3. Thermodesulfobacteria
• Thermodesulfobacterium
• Thermodesulfatator
Dapat menghasilkan energi
dari reduksi sulfat dan hidup
pada daerah bersuhu tinggi
11
4. Deinococcus-Thermus 6. Chloroflexi → fotosintetik
• Deinococcus non-sulfur (green nonsulfur
bacteria) - fotosintesis
• Thermus anaerobic
• Marinithermus
• Meiothermus
• Chloroflexus
• Oceanithermus • Chloronema
• Vulcanithermus • Heliothrix
• Roseiflexus
5. Chrysiogenetes • Oscillochloris
• Chrysiogenes arsenatis • Herpetosiphon
• Anaerolinea
7. Thermomicrobia • Caldilinea
• Thermomicrobium roseum
• Thermomicrobium fosteri
Bacteria 12
8. Nitrospira 9. Deferribacteres
• Nitrospira • Deferribacterium
• Leptospirillum • Denitrovibrio
• Magnetobacterium • Flexistipes
• Thermodesulfovibrio • Geovibrio
• Synergistes (Incertae sedis)
• Caldithrix (Incertae sedis)

Bacteria 13
10.
Cyanobacteria Subsection I
– Chamaesiphon
– Gloeocapsa
– Gloeothece Subsection II
– Microcystis – Cyanocystis
– Prochlorococcus – Dermocarpella
– Prochloron – Stanieria
– Synechococcus – Xenococcus
– Synechocystis – Chroococcidiopsis
– Chroococcus – Myxosarcina
– Cyanobacterium – Pleurocapsa
– Cyanobium
– Cyanothece
– Dactylococcopsis
Bacteria
– Gloeobacter 14
Subsection III

✓ Arthrospira ✓Oscillatoria
✓ Borzia ✓Planktothrix
✓ Crinalium ✓Prochlorothrix
✓ Geitlerinema ✓Pseudanabaena
✓ Halospirulina ✓Spirulina
✓ Leptolyngbya ✓Starria
✓ Limnothrix ✓Symploca
✓ Lyngbya ✓Trichodesmium
✓ Microcoleus ✓Tychonema

Bacteria 15
Subsection IV
Subsection V
– Anabaena
– Aphanizomenon • Chlorogloeopsis
– Cyanospira • Fischerella
– Nostoc • Geitleria
– Scytonema • Iyengariella
– Anabaenopsis • Nostochopsis
– Calothrix • Stigonema
– Cylindrospermopsis
– Cylindrospermum (Klasifikasi setelah
– Nodularia Castenholz, 2001.)
– Rivularia
– Tolypothrix
Bacteria 16
11. Chlorobi → bakteri sulfur fotosintetik (green
sulfur bacteria) → fotosintesis aerobik

• Chlorobium
• Ancalochloris
• Chlorobaculum
• Chloroherpeton
• Pelodictyon
• Prosthecochloris

Bacteria 17
 PROTEOBACTERIA

Bacteria 18
 12. Proteobacteria
a. Alpha Proteobacteria
– Rhodospirillales
– Rickettsiales
– Rhodobacterales
– Sphingomonadales
– Caulobacterales
– Rhizobiales
– Parvularcula bermudensis
– Kordiimonas gwangyangensis

Bacteria 19
Alpha-proteobacteria
- Kelas terbesar kedua
dalam filum
proteobacteria
- Umumnya bersifat
aerob obligat dan
terkadang anaerob
fakultatif
- Oligotrof

Bacteria 20
Alpha-proteobacteria

Bacteria 21
 12. Proteobacteria

b. Beta Proteobacteria
– Ordo Neisseriales
– Burkholderiales
– Nitrosomonadales
– Hydrogenophilales

Bacteria 22
Bacteria 23
 12. Proteobacteria

c. Gamma Proteobacteria (Bakteri sulfur ungu):

❖Kelas terbesar dalam filum Proeobacteria

– Thiotricales
– Methylococcales
– Pseudomonadales
– Vibrionales
– Enterobacteriales
– Pasteurellales
Bacteria 24
Bacteria 25
Fermentasi pada Gamma-proteobacteria ada 2 tipe:

Bacteria 26
 12. Proteobacteria
d. Delta Proteobacteria
– Desulfarculus baarsii
– Desulfovibrionales
– Desulfobacterales
– Desulfurellales
– Desulfuromonales
– Syntrophobacterales
– Bdellovibrionales (bakteri predator/pemakan
bakteri)
– Myxococcales
Bacteria 27
 12. Proteobacteria
e. Epsilon Proteobacteria

Familia :
• Campylobacteraceae
– Campylobacter
• Helicobacteraceae
– Helicobacter
– Campylobacter jejuni
– Helicobacter pylori

Bacteria 28
Delta-Epsilon
Proteobacteria

Bacteria 29
 Karakteristik Epsilon Proteobacteria

Bacteria 30
13. Firmicutes

Ordo dari bakteri

Gram Positif

Bacteria 31
 13. Firmicutes
Ordo: Clostridiales :
• Clostridiaceae: Clostridium
• Lachnospiraceae: Lachnobacterium
• Peptostreptococcaceae:Peptostretpcoccus
• Eubacteriaceae: Eubacterium
• Peptococcaceae : Peptococcus
• Heliobacteriaceae :Heliobacterium
• Acidaminococcaceae: Acidminococcus
• Syntrophomonadaceae: Syntrophomonas

Bacteria 32
Macam-macam letak endospore pada Clostridium
• Terminal : C. cadaveris
• Subterminal : C. sporogenesis
• Sentral : C. bifermentans

Bacteria 33
Ordo: Thermoanaerobacteriales
- Ammonifex - Caldanaerobacter
- Carboxydobrachium - Coprothermobacter
- Gelria - Moorella
- Sporotomaculum - Thermacetogenium
- Thermanaeromonas - Thermoanaerobacter
- Thermoanaerobium - Thermovenabulum
- Thermodesulfobium - Thermoanaerobacterium

Bacteria 34
Ordo: Haloanaerobiales
• Acetohalobium
• Halanaerobacter
• Halanaerobium
• Halonatronum
• Halobacteroides
• Halocella
• Halothermothrix
• Natroniella
• Orenia
• Selenihalanaerobacter
• Sporohalobacter

Bacteria 35
Ordo: Mollicutes

• Acholeplasma - Erysipelotrichaceae
• Anaeroplasma (incertae sedis)
• Asteroleplasma - Bulleidia Spiroplasma
- Ureaplasma
• Entomoplasma - Erysipelothrix
• Eperythrozoon - Holdemania
• Haemobartonella - Solobacterium
• Mesoplasma
• Mycoplasma
• Phytoplasma

Bacteria 36
Grup Bacilli
• Ordo Bacillales: Bacillus
• Ordo Lactobacillales:
Lactobacillus

Sayatan sel B. thuringiensis

menunjukkan adanya kristal yang Macam-macam bentuk sel
bersifat racun bagi serangga.
pada Lactobacillus
Bacteria 37
 14. Actinobacteria

Classis : Actinobacteria
1. Subclassis Acidimicrobidae
2. Subclassis Rubrobacteridae
3. Subclassis Coriobacteridae
4. Subclassis Sphaerobacteridae
5. Suclassis Actinobacteridae

Bacteria 38
 Subclassis: Actinobacteridae
A. Ordo Actinomycetales
1. Sub-ordo Actinomycineae
2. Sub-ordo Micrococcineae
3. Sub-ordo Corynebacterineae
4. Sub-ordo Micromonosporineae
5. Sub-ordo Propionibacterineae
6. Sub-ordo Pseudonocardineae
7. Sub-ordo Streptomycineae
8. Sub-ordo Streptosporangineae
9. Sub-ordo Frankineae
10. Sub-ordo Glycomycineae

B. Ordo Bifidobacteriales
Bacteria 39
Sekelompok sel Arthrobacter yang Arthrobacter yang sedang membelah
berbentuk V hasil dari pembelahannya menunjukkan adanya patahan
yang unik dinding sel dari sel induk

Tahapan pada siklus hidup Arthrobacter pada kultur

Bacteria 40
Mycobacterium

Karakteristik morfologi sel (b) dan koloni (a,c)

dari Mycobacterium

Struktur 6,6’-di-O-mycolyl
trehalose pada glikolipid
Susunan kimiawi dari asam mikolat dan Mycobacterium
fuchsin dari pewarna tahan asam. Fuchsin
Bacteria
akan terikat melalui ikatan ionic antara COO- 41

dan NH2
 Streptomyces dan
kerabat terdekatnya

Struktur pembawa spora pada Streptomyces

Macam-macam bentuk pembawa spora

yang dapat digunakan untuk identifikasi
Bacteria 42
spesies pada Streptomyces
Tahapan pembentukan spora pada Streptomyces

Tahap Ujung Ujung mulai Dinding Spora

pertumbuhan keriting dipisah-pisah menebal dan matang
menyempit

Bacteria 43
 Antibiotic yang diproduksi oleh anggota
species Streptomycetes

Bacteria 44
15. Planctomycetes
• Planctomyces
• Gemmata
• Isosphaera
• Pirellula

Planctomycetes

Struktur membrane inti yang

Struktur menyerupai tangkai (Stalk)
terdapat pada Gemmata
yang ditemukan pada Planctomyces
maris. Nampak juga sel juga dilapisi
Bacteria 45
oleh pilus.
 16. Chlamydiae

• Chlamydia
• Chlamydophila
• Neochlamydia
• Parachlamydia
• Rhabdochlamydia
• Simkania
• Waddlia

Bacteria 46
Chlamydia

Siklus infeksi pada Chlamydia dan infeksi Chlamydia pada sel manusia

Sayatan tipis badan retikulat Chlamydia pada kultur jaringan hewan tikus
Bacteria 47
 17. Spirochaetes
• Spirochaetes - Borrelia
• Brachyspira - Brevinema
• Clevelandina - Cristispira
• Diplocalyx - Hollandina
• Leptonema - Leptospira
• Pillotina - Serpulina
• Spirochaeta - Treponema

Bacteria 48
 18. Fibrobacteres
• Fibrobacter succinogenes
• F. elongatus
• F. intestinalis

19. Acidobacteria
• Acidobacterium capsulatum
• Geothrix fermentans
• Holophaga foetida

Bacteria 49
 20. Bacteroidetes
• Bacteroides: Bacteroides fragilis

Kotak berwarna
menunjukkan ordo-ordo
utama pada filum
Bacteriodetes.
Pohon filogenetik dibuat
berdasarkan sekuen 16S
rRNA dari genera-genera
yang representatif dari
ordo tersebut.

Bacteria 50
 21. Fusobacteria
• Fusobacterium nucleatum

22. Verrucomicrobia 23. Dictyoglomi

• Opitutus • Dictyoglomus
• Prosthecobacter thermophilum
• Verrucomicrobium • Dictyoglomus turgidum
• Victivallis
• Xiphinematobacter

Bacteria 51
 Verrucomicrobia

Penampakan sel Verrucomicrobia yang menunjukkan

adanya prosthecae. Kebanyakan Verrucomicrobia hidup
bersimbiosis dengan Protista.

Bacteria 52