Genetika

Mikroba
Sub Pokok Bahasan:
•DNA-materi genetik
•Regulasi dan ekspresi genetik
•Mutasi dan mutan
•Transfer genetik
Asam Nukleat
DNA vs RNA
 Gula: deoksiribosa  Gula: pentosa
 Basa: AGCT  Basa: AGCU
 Untai ganda  Untai tunggal
 Prokariot:  Prokariot:
sitoplasma sitoplasma
 Eukariot: inti  Eukariot: inti dan
 Penyimpan sitoplasma
informasi  Hasil transkripsi
 Struktur DNA

Images: Model of DNA Molecule, Field Museum, Chicago, T. Port; DNA

From the Virtual Microbiology Classroom on ScienceProfOnline.com Detail Diagram: Madprime; DNA & RNA Diagrams, BiologyCorner
DNA prokariot: Kromosom vs Plasmid
Istilah
 5’ vs 3’
 upstream dan downstream
The Central Dogma of Molecular Biology
Sintesis Protein
Sintesis Protein
Mutasi dan Mutagenesis
Definisi
 Mutan
 Wild type
 Varian/ Galur
 Fenotipe
 Genotipe
 Alel
Fenotipe pada genetika bakteri
 Mutan auxotrophic
 Prototrophic
 Conditional lethal mutant:
- Temperature sensitive mutant
- Cold sensitive mutant
- Non-sense mutation
 Mutan resisten
Leaky dan reversi
 Leaky: mutasi tetap terjadi, tetapi produk gen
tetap memiliki aktivitas
 Reversi: urutan yang termutasi telah kembali
ke urutan awal (urutan alami, wild type).
Perubahan • Silent mutation
• Mutasi missense
pasangan • Mutasi M
nonsense
basa • Leaky & reversi U
T
A
Perubahan • Slipped DNA
ketika replikasi S
kerangka • Tidak leaky &
dapat reversi I
baca
Perubahan Pasangan Basa

Kesalahan Deaminasi Oksidasi

pasangan basa basa

Mutasi Mutasi
missense nonsense
Perubahan Pasangan Basa
DEAMINASI BASA
Oksidasi Basa
Konsekuensi Perubahan Pasangan Basa

 Silent mutation
 Mutasi missense
 Mutasi nonsense
Silent Mutation
Mutasi missense
Mutasi Nonsense
Perubahan Kerangka Baca
Transfer Materi Genetik

•Konjugasi
•Transformasi
•Transduksi
Transfer Materi Genetik
Konjugasi
 Kemampuan suatu plasmid untuk melakukan
transfer sendiri
Konjugasi
 Merupakan transfer langsung materi genetik antara
dua sel bakteri (reproduksi seksual bakteri).
 Transfer DNA satu arah :
 Satu sel sebagai donatur gen /DNA ( jantan)
 Satu sel sebagai penerima gen/DNA ( betina)
 Jantan akan menggunakan pili seks untuk menempel
pada resipien ( betina)
 Kemudian akan terbentuk jembatan sitoplasmik semen
tara diantara kedua sel.
 Kegiatan donor dan penggunaan pili seks disebabkan
adanya pengaruh sepotong DNA khusus yang disebut
faktor F (Fertilitas).
Transformasi
 Pengambilan DNA telanjang oleh sel
 Yang secara alami dapat melakukan
transformasi: Gram positif and Gram negatif
– Bacillus subtilis, Haemophilus influenzae,
Neisseria gonorrhoea, Streptococcus
pneumoniae
 Kompetensi alami
Transformasi
Transformasi
Transduksi
 Adalah proses membawa gen bakteri dari satu sel inang
kepada sel inang lainnya.
 Ada 2 tipe transduksi
 Transduksi umum
 Transduksi khusus
Keduanya berasal dari penyimpangan pada siklus
reproduksi
faga( virus yang menginfeksi bakteri ).

 Transduksi umum
 Faga akan menginfeksi sel bakteri kemudian masuk
kedalam sel inang. Molekul asam nukleat virus akan
terbungkusdidalam kapsid dan pada saat sel inang
lisis maka faga lengkap akan dilepaskan.
 Kadangkala sebagian kecil DNA sel inang ikut
terdegradasi dan terbungkus dalam kapsid faga
menggantikan genom faga. Virus ini cacat
(nongenetik),
 Tetapi bila faga ini kemudian menempel pada
bakteri lain dan menginjeksikan bagian DNA bakteri
yang didapat dari sel pertama
 Beberapa DNA ini kemudian dapat menggantikan
daerah homolog dari dua sel. Rekombinasi genetik
telah terjadi.
 Jenis transduksi ini disebut dengan transduksi
umum karena gen gen bakteri ditransfer secara
acak.
 Transduksi khusus
 Bentuk transduksi ini memerlukan infeksi oleh faga
temperat.
 Genom faga temperat berintegrasi sebagai profaga kedalam
kromosom bakteri inang, biasanya disuatu tempat yang
spesifik .
 Ketika genom faga dipisahkan dari kromosom yang
kadangkala membawa DNA dari bakteri yang berdampingan
dengan profaga.
 Ketika suatu virus yang membawa DNA bakteri seperti ini
menginfeksi sel inang lain, gen gen bakteri ikut terinjeksi
bersama sama dengan genom faga.
 Transduksi khusus hanya mentransfer gen-gen yang berada
didekat tempat profaga pada kromosom tersebut.
Transduksi Umum
Transduksi Khusus