CONTOH NESTED DESIGN

Dalam penelitian u/ pendugaan nilai h2

suatu sifat ternak
Bila penelitian di laboratorium, dengan
keterbatasan waktu biasa dilakukan
pada hewan percobaan (burung puyuh)

Untuk penelitian di lapang, dapat

menggunakan data sekunder (selama
ada rekording yg jelas, misalnya pada
ternak sapi perah, kambing, domba)

Teladan:
Mengestimasi nilai h2 BB2Mgg puyuh
Puyuh (Coturnix coturnix japonica):
siklus hidup relatif pendek, pertumbuhan & perkembangan cepat, pengeraman telur 16-17 hr, bobot tetas
7g/ekor, DK 42 hr, prod telur 250 bt/th
Reproduksi (1J : 2B) = fertilitas 80% &
daya tetas 85%
Lama simpan telur 3-8 hr (Ok)

 40J & 80B (dr peternakan berbeda)

Setiap B dlm sangkar baterai, 1J mengawini 2B (bergilir 2 hr 1x)

Tiap puyuh & telur diidentifikasi
Koleksi telur/simpan 5 hr ditetaskan
(periode penetasan)

Metode pendugaan:

Paternal half-sib correlation

dlm model

Three-way nested unequal sub-class

numbers

 Model statistika:
Yhijk = + Hh + Shi + Dhij + Ehijk ,
Yhijk = Nilai pengamatan anak ke-k, dr induk ke-j
yg dikawin pejantan ke-i dlm periode penetasan ke-h

= Nilai tengan umum

Hh = Pengaruh periode penetasan ke-h
Shi = Pengaruh pejantan ke-i dlm periode penetasan
ke-h
Dhij = Pengaruh induk ke-j yg dikawin pejantan ke-i

dlm periode penetasan ke-h

Ehijk = Pengaruh lingkungan yg tdk terkontrol (genetik individu)

Periode Penetasan
Pe-J Induk
1
2
.........
6
nhij dan Yhij.
________________________________
Jml dr setiap induk
n1ij
Y1ij.
n2ij Y2ij. ........
n6ij Y6ij.
______________________________________________________________
I
1
1
20,45
2 35,55
2
1
18,50
1
27,35
3 79,20
II
3
1
29,90
4
2
51,80
2
41,55
.
.
.
.
XL
79
2
50,35
1
29,70
80
1
26,30
2 41,50
2
46,45

I
II
.
XL

n1i.
2
2
1

Jml dr setiap pe-J

Y1i..
n2i. Y2i..
.......
38,95
1 27,35
51,80
3 71,45

n6i.
5
-

26,30

91,85

Y6i..
114,75
76,15

Periode Penetasan
Pe-J Induk
1
2
.........
6
nhij dan Yhij.
________________________________
Jml dr setiap induk
n1ij
Y1ij.
n2ij Y2ij. ........
n6ij Y6ij.
______________________________________________________________

n1..
139

Jml dr setiap periode penetasan

Y1...
N2.. Y2...
....... N6..
3144,70
149 3489,95
159

Y6...
3692,70

Jumlah total
n...
Y....
785
17388,05
_______________________________________________________________

Perhitungan:
FK = Y....2/n = 17388,052/785 = 385151,9526

JK-induk belum terkoreksi (D):

D = Yhij.2/nhij = 20,452/1 + 18,502/1 + ... + 46,452/2 = 395059,9943
hij

JK-peJ belum terkoreksi (S):

S = Yhi..2/nhi. = 38,952/2 + 51,802/2 + ... + 76,152/3 = 391407,2030

hi

JK-periode penetasan belum terkoreksi (H):

H = Yh...2/nh.. = 3144,702/139 + 3489,952/149 + ... + 3692,702/159 =

h
=387030,8670

Lanjutan:
JK-total belum terkoreksi (T):
T = Yhijk2j = 20,452 + 18,502 + ... + 14,70452 = 402647,0775

hijk

Dhi: N = 785; h = 6; s = 210; d = 362

Koef komponen ragam:

k1 = 1/(d-s) [N (n2hij/nhi.)]

h i j
k2 = 1/(s-h) [ (n2hij/nhi.) ( nhij2/nh..)]
h i j

h i j

k3 = 1/(s-h) [N (n2hi./nh..)]
h i

Lanjutan:
Koef komponen ragam:
k4 = 1/(h-1) [ ( n2hij/nh..) ( nhij2/N)]
h i j

h i j

k5 = 1/(h-1) [ (n2hi./nh..) ( nhi.2/N)]

h i

hi

k6 = 1/(h-1) [N (n2h../n)]
h

Perhitungan:
Koef komponen ragam:
k1 = 1/(362-210) [785 483,68095)] = 1,98236
k2 = 1/(210-6) [483,68095 15,75562] = 2,29375
k3 = 1/(210-6) [785 26,80650] = 3,71663
k4 = 1/(6-1) [15,75562 2,65860] = 2,61940
k5 = 1/(6-1) [26,80650 4,54395] = 4,45251
k6 = 1/(6-1) [785 134,45223] = 130,10955

Perhitungan:
Koef komponen ragam:
k1 = 1/(362-210) [785 483,68095)] = 1,98236
k2 = 1/(210-6) [483,68095 15,75562] = 2,29375
k3 = 1/(210-6) [785 26,80650] = 3,71663
k4 = 1/(6-1) [15,75562 2,65860] = 2,61940
k5 = 1/(6-1) [26,80650 4,54395] = 4,45251
k6 = 1/(6-1) [785 134,45223] = 130,10955

Tabel Analisis Ragam:

SK
Simbol db
JK
KT
KTH
________________________________________________________________
Antar H
H-FK 5 1878,9144 375,78288 GE2+2,6194GD2+4,45251GS2
+130,10955GH2
Antar S/H

S-H

204 4376,3360

Antar D/S/H D-S 152 3652,7913

21,45263 GE2+2,29375GD2+3,71663GS2
24,03152 GE2+1,98236GD2

Antar anak T-D 423 7587,0832

17,93637 GE2
________________________________________________________________
Komponen ragam: GE2 = 17,93637
GD2 = 3,07469
GS2 = -0,95148
GH2 = 2,72101

Pendugaan nilai h2:

hS2 = 4 GS2 / (GS2 + GD2 + GE2) = -3,80592/20,05958 = -0,18973
hD2 = 4 GD2 / (GS2 + GD2 + GE2) = 12,29876/20,05958 = 0,61311

hS+D2 = 2 (GS2 + GD2) / (GS2 + GD2 + GE2) = 4,24642/20,05958 = 0,21169