PEMBAHASAN Hasil validasi yang dilakukan dapat

dilihat pada kurva Receiver Operating

Pada praktikum kali ini dilakukan
Characteristic (ROC) dimana sumbu x
pemodelan farmakofor pada ligan asam galat
merupakan laju senyawa decoy dan sumbu y
yang tidak terikat dengan reseptornya.
adalah laju senyawa actives. Nilai AUC (Area
Pemilihan senyawa asam galat ini
Under Curves) dan EF (faktor pengayaan)
dikarenakan dari berbagai senyawa
yang didapatkan dari kurva menunjukkan
metabolit sekunder yang terdapat di daun
kemampuan tambatan untuk membedakan
salam (seperti kuersetin, asam galat, rutin,
ligan asli delam banyak senyawa umpan.
katekin dan eugenol), asam galat merupakan
Semakin tinggi nilai AUC dan EF maka
satu – satunya metabolit sekunder yang
semakin baik kinerja penyaringan virtual.
dapat hit dengan reseptor Angiotensin
Didapatkan hasil bahwa terdapat 444 hits
Converting Enzyme yang diunduh di DUD-E
(kumpulan ligan terbaik) dari total 500
(3bkl). Struktur ligan asam galat didapatkan
senyawa (100 aktif dan 400 decoy). Dengan
dari PubChem sedangkan reseptor
nilai faktor pengayaan (EF100%) adalah 1.1
Angiotensin Converting Enzyme 3bkl yang
dan AUC 100% 0.82. Hasil ini menunjukkan
digunakan didapatkan dari DUD-E (Directory
bahwa model fitur farmakofor yang diuji
of Useful Decoys Enhanced).
sangat efisien untuk proses penyaringan
Sebelum dilakukan pemodelan senyawa aktif.
farmakofor dilakukan proses validasi terlebih
dahulu untuk melihat model terbaik untuk
dilakukan skrining selanjutnya. Proses
validasi dilakukan pada decoys dan actives
yang diunduh dari DUD-E. Active set
merupakan kumpulan senyawa kimia atau
ligan yang aktif ketika ditambatkan ke
reseptor. Sedangkan, decoys set adalah
senyawa kimia atau ligan yang memiliki
kemiripan struktur dengan actives set namun
tidak aktif ketika ditambatkan ke reseptor.
Gambar 1. Hasil Validasi Model Farmakofor # #
# #
He Rot cL #
Ri Mol Do
avy . og Acce
ng Wt nor
Tabel 1. Nilai AUC dari Model Farmakofor Ato Bo P ptors
s s
ms nds
Karakteristik Nilai 12 5 0.2 1 170 5 3
AUC 1% 0.75 7 .12
AUC 5% 0.76
AUC 10% 0.85
AUC 100% 0.82 Hasil pemodelan farmakofor asam
galat menunjukkan bahwa asam galat
memenuhi syarat dari Lipinski’s Rule of Five
(tidak lebih dari 10 akseptor hydrogen, tidak
lebih dari 5 donor hydrogen, rotatable bond
kurang dari 15, log P kurang dari 5, dan berat
molekul kurang dari 500). Maka dari itu, tidak
perlu dilakukan banyak modifikasi
farmakofor pada senyawa asam galat
Gambar 2. Hasil Skrining Model tersebut.
Farmakofor dengan Asam Galat (3D)

Gambar 3. Hasil Skrining Model

Farmakofor dengan Asam Galat (2D)

Tabel 2. Karakteristik Pemodelan

Farmakofor Asam Galat dengan Reseptor
ACE