FARMAKOGENETIK
DEFINISI
Farmakogenetik didefinisikan sebagai ilmu yang mempelajari berbagai
kemampuan dalam respon obat sebagai akibat dari faktor keturunan.1 Farmakogenetik
adalah variabilitas respon obat karena karakteristik yang diturunkan pada individu.
Enzim pemetabolisme obat telah dipelajari selama beberapa dekade, pertama sebagai
reaksi kimia dan, baru-baru ini, sebagai polimorfisme spesifik dari molekul yang
diketahui. Dengan ketersediaan peta polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) genom
utuh, profil SNP akan segera dibuat untuk pasien yang mengalami efek samping (AE)
atau yang merespons secara klinis terhadap obat (khasiat). Eksperimen bukti prinsip
telah menunjukkan bahwa peta SNP kepadatan tinggi di daerah kromosom dari
hubungan genetik memfasilitasi identifikasi gen penyakit kerentanan.2
Nilai pemahaman farmakogenetik bagi klinisi adalah memungkinkan
kemanjuran terapeutik yang optimal, untuk menghindari toksisitas obat-obatan yang
metabolismenya dikatalisis oleh isoenzim polimorfik, dan untuk berkontribusi pada
desain rasional obat baru. Farmakogenetika dan farmakogenomik tidak dapat dipahami
tanpa pemahaman genetika medis dasar
GENOTIPE/FENOTIPE
Satu pertanyaan mendasar dalam biologi adalah untuk memahami apa yang
membuat individu, populasi, dan spesies berbeda satu sama lain. Konsep fenotipe, yang
sesuai dengan atribut yang dapat diamati dari seorang individu, diciptakan sebagai
lawan dari genotip, materi warisan yang ditularkan oleh gamet.3
Sebuah gen saja tidak dapat menyebabkan sifat fenotipik yang dapat diamati,
juga tidak dapat diperlukan dan cukup untuk munculnya karakteristik yang dapat
diamati. Gen membutuhkan lingkungan seluler, aksi gabungan dari beberapa gen lain,
serta kondisi fisika-kimia tertentu untuk memiliki efek yang dapat diamati pada
organisme. Misalnya, pigmentasi rambut coklat pada satu manusia bukan hanya produk
dari gen yang mengkode enzim penyintesis pigmen tetapi juga adanya sel yang
menghasilkan pigmen dari molekul substrat yang relevan (seperti tirosin untuk
melanin), dan dari jumlah yang diterima. sinar matahari. Dengan demikian, pendekatan
reduksionis genetik, yang hanya mengeksplorasi beberapa parameter genetik di antara
berbagai faktor penyebab, sia-sia untuk sepenuhnya menjawab pertanyaan luas tentang
apa yang membuat rambut menjadi cokelat, tentang apa yang memunculkan struktur
biologis tertentu, atau proses secara keseluruhan. Namun demikian, reduksionisme
genetik dapat menjadi sangat tepat untuk mengidentifikasi lokus genetik di mana
perubahan menyebabkan perbedaan fenotipik. Sebuah perbedaan Warna rambut antara
dua individu dapat disebabkan dalam beberapa kasus oleh perbedaan genetik mereka.
Dijelaskan bahwa tidak semua perubahan fenotipik dapat dikaitkan dengan perubahan
genetik. Perbedaan warna rambut juga bisa disebabkan oleh faktor non-genetik seperti
usia, intensitas radiasi matahari atau pewarnaan rambut, atau kombinasi dari perbedaan
genetik dan non-genetik.3
Pasangan fenotipik dari hubungan genotip dan fenotip mengacu pada jenis
variasi (warna rambut, tingkat resistensi toksin, dll.) Daripada keadaan (rambut pirang,
pengecap feniltiokarbamid, dll). Fenotipe yang terkait dengan perubahan genetik tidak
selalu terbatas pada organisme yang menjadi tempat terjadinya mutasi genetik.
Misalnya, perbedaan antara cangkang melingkar kiri dan kanan pada keong Lymnaea
peregra ditentukan oleh lokus genetik tunggal dengan pengaruh keibuan: genotipe ibu,
tetapi bukan individu itu sendiri, yang bertanggung jawab atas arah gulungan cangkang.
Dalam kasus lain, perubahan genetik kausal terletak pada bakteri simbion: toleransi
termal kutu dapat bervariasi antar individu karena mutasi titik pada simbion bakteri
mereka. Efek fenotipik tertentu juga dapat muncul pada tingkat yang lebih tinggi
daripada organisme yang menyimpan perubahan genetik, salah satu contoh kasus adalah
organisasi sosial koloni semut.3
POLIMORFISME
Gen diturunkan dari orang tua ke anak-anak, dan mereka menentukan genotipe
dan fenotipe seorang anak. Masing-masing dari kita memiliki dua salinan dari setiap
gen, satu diwarisi dari setiap orang tua. Gen terdiri dari DNA dan menginstruksikan sel
untuk membuat protein. Ukuran gen manusia bervariasi dari beberapa ratus basis DNA
hingga lebih dari 2 juta basis. Gen manusia terkecil adalah yang mengkodekan tRNA
dengan 74-93 nukleotida hanya panjang. Gen manusia terbesar adalah titin, yang terlibat
dalam ultrastruktur otot dan elastisitas dan kode untuk protein 3-megadalton.4
Perbedaan genetik antar individu muncul ketika terjadi perubahan urutan DNA.
Variasi gen ini disebut alel. Kadang-kadang alel bisa memiliki SNP, yang dapat
mengakibatkan, atau tidak, dalam perubahan regulasi, ekspresi, atau aktivitas protein.
SNP adalah mutasi yang biasanya terjadi pada frekuensi 1% atau lebih tinggi. SNP
dapat terjadi setiap 100-300 pasangan basa dan encakup sekitar 90% dari semua
perbedaan dalam DNA manusia. Beberapa mutasi mempengaruhi ekspresi dan fungsi
protein yang dapat dianggap sebagai perolehan fungsi atau hilangnya fungsi tergantung
pada efek spesifik yang dimilikinya dalam jalur metabolisme di mana protein terlibat.
Genotipe ini akan mempengaruhi kemampuan individu untuk memetabolisme obat
tertentu.4