Abstrak
Fondasi bioteknologi farmasi terutama terletak pada kemampuan tumbuhan, mikroorganisme dan
hewan untuk menghasilkan senyawa dengan berat molekul rendah dan tinggi yang berguna sebagai
terapi. Meskipun molekul dari tumbuhan dan mikroorganisme lebih disukai ekstraksi dari biomassa
tumbuhan membutuhkan proses hilir yang membosankan sementara dalam kasus mikroorganisme,
mudah dengan jumlah kotoran yang lebih sedikit. Bioteknologi farmasi siap berkembang selama 4-6
dekade terakhir dengan munculnya teknologi DNA rekombinan dan rekayasa metabolik yang
didukung oleh teknologi bioproses yang berkembang dengan baik. Produksi skala besar dan
efektivitas biaya serta keterjangkauan dapat dicapai dengan cara mensinergikan semua teknologi ini.
Dalam tinjauan saat ini pentingnya mikroorganisme dalam hubungannya dengan teknologi DNA
rekombinan dibahas untuk produksi biofarmasi dan pengembangan aplikasi terapeutik
menggunakan metode molekuler yang dikembangkan baru-baru ini dan mekanisme perkembangan
penyakit. Enzim bakteri digunakan dalam aplikasi dari modifikasi obat hingga penggunaan
terapeutik.
Pendahuluan
Produk tumbuhan dan mikroba berupa pengawet alami telah dikenal sejak berabad-abad lamanya
untuk pengawetan buah-buahan, sayur mayur dan susu berupa roti, yoghurt, bir, wine, cuka, keju,
acar dan bahan fermentasi lainnya. Setelah penemuan tak sengaja molekul antibiotik penisilin pada
tahun 1929 oleh Alexander Fleming, kepentingan ekonomi mikroorganisme menjadi penting dan
bioproses seperti fermentasi, biokonversi dan biotransformasi enzimatik untuk produksi berbagai
produk berharga dari mikroorganisme dieksplorasi [1]. Produk tersebut antara lain antibiotik, asam
amino, enzim, inhibitor enzim, nukleotida, vitamin, asam organik, vaksin dan polisakarida dengan
aplikasi di bidang kedokteran untuk meningkatkan kesehatan manusia. Tumbuhan dan
mikroorganisme, khususnya bakteri, fungi, ragi dan mikroalga merupakan sumber biofarmasi yang
besar dan dapat diproduksi dengan menggunakan proses fermentasi atau ekstraksi langsung dari
biomassa tumbuhan. Metabolit sekunder dari mikroorganisme dilaporkan penting untuk aplikasi
farmasi. Metabolisme sekunder terdiri dari sintesis metabolit khusus yang memiliki struktur kimia
yang tidak biasa dan tidak penting untuk pertumbuhan dan perkembangan organisme penghasil.
Inisiasi metabolit sekunder dan biosintesis kemungkinan disebabkan oleh defisiensi komponen
pembatas pertumbuhan nutrisi. Actinomycetes, mycobacteria, eubacteria, algae, fungi dilaporkan
menghasilkan repertoar besar bioaktif yang menunjukkan sifat terapeutik. Dalam 4-5 dekade
terakhir banyak perhatian telah diberikan untuk isolasi dan karakterisasi obat-obatan dari
mikroorganisme endosimbiotik yang tumbuh subur di jaringan tumbuhan, spons, dan hewan.
Ekosistem laut telah dikreditkan sebagai sumber mikroorganisme yang menghasilkan molekul yang
tidak ada habisnya dan berharga untuk aplikasi sebagai obat-obatan. Area tersebut bahkan
berkembang menggunakan pengetahuan mikrobiologi, teknologi DNA rekombinan, rekayasa
1
metabolik yang dikombinasikan dengan teknologi kimia sintetis (Skema 1). Bahkan, beberapa
biomolekul kompleks dapat disintesis menggunakan metode kimiawi; namun, mereka menderita
dengan kekurangan yang melekat seperti kemurnian, mengandung bentuk isomer dan pemurnian
produk.
Mikroorganisme memiliki karakteristik unik yang menjadikannya inang yang tak tergantikan dan
ramah industri, karena mereka adalah pekerja nyata untuk produksi skala besar dari serangkaian
metabolit yang berguna. Mikroorganisme memiliki rasio luas permukaan terhadap volume yang
tinggi, yang memfasilitasi penyerapan cepat nutrisi yang dibutuhkan untuk mendukung tingkat
metabolisme yang tinggi dan biosintesis yang sesuai untuk berbagai reaksi (Tabel 1).
Mikroorganisme dapat diisolasi dari berbagai relung ekologi yang memungkinkan mereka untuk
dipindahkan dari alam ke labu laboratorium dan akhirnya ke fermentor skala produksi, di mana ia
mampu tumbuh pada sumber karbon dan nitrogen yang tidak mahal dan menghasilkan senyawa
yang berharga. Dengan perkembangan teknologi DNA rekombinan, mikroorganisme dapat dengan
mudah dimanipulasi secara genetik, untuk meningkatkan produksi produk. Meskipun mikroba
sangat unggul dalam memberi kita rangkaian produk berharga yang menakjubkan, mereka biasanya
hanya memproduksinya dalam jumlah kecil. Untuk mengatasi hambatan ini, pada awal tahun 1970-
an mikrobiologi industri tradisional yang dikombinasikan dengan biologi molekuler, strain mikroba
yang dibuat khusus telah dikembangkan untuk produksi skala besar. Industri bioteknologi modern
telah memberikan pengaruh besar dalam dunia bisnis; biofarmasi (obat protein rekombinan, vaksin
dan antibodi monoklonal) memiliki pasar sekitar 15 miliar dolar. Sebagai hasil dari peningkatan
teknologi dalam program penyaringan, pemisahan dan teknik pemurnian produk, jumlah senyawa
alami yang ditemukan sejauh ini diperkirakan lebih dari satu juta. Dari 22.500 senyawa aktif biologis
yang telah diperoleh sejauh ini dari mikroba, 45% dihasilkan oleh Actinomycetes, 38% oleh fungi dan
17% oleh bakteri uniseluler, terlihat jelas bahwa sebagian besar produk mikroba dibuat dengan
2
teknologi fermentasi. Terlepas dari efisiensi jalur kimiawi untuk sintesis riboflavin, banyak produksi
senyawa ini saat ini dilakukan dengan fermentasi. Sebagian besar produk alami begitu kompleks dan
mengandung begitu banyak pusat asimetri sehingga mungkin tidak akan pernah dibuat secara
komersial dengan sintesis kimia [2,3]. Beberapa biofarmasi diproduksi dengan menggunakan
teknologi DNA rekombinan karena lebih aman dan efektif daripada molekul yang diproduksi secara
konvensional dan juga membuatnya hemat biaya. Misalnya insulin terbukti efektif dan lebih aman
dibandingkan dengan insulin yang diperoleh dari sumber hewani. Biofarmasi yang diperoleh melalui
teknologi DNA rekombinan termasuk insulin rekombinan, interferon, vaksin hepatitis B,
somotrophin, dll., Sejumlah besar biofarmasi diproduksi dan dipasarkan oleh perusahaan
bioteknologi yang termasuk dalam salah satu kategori yang disebutkan di bawah.
3
Polisakarida bakteri sebagai obat-obatan
Exopolysaccharides (EPS) mikroba adalah biopolimer yang disintesis oleh beberapa mikroorganisme
yang meliputi beberapa marga bakteri, kapang dan khamir. EPS ini adalah getah seperti polimer yang
disintesis oleh organisme ini dan dilepaskan ke lingkungan sekitarnya. EPS terutama melindungi
mikroorganisme dari lingkungan sekitar dan juga bertindak sebagai bahan makanan cadangan, dan
organisme penghasil dapat menggunakan ini sebagai sumber karbon utama. Berdasarkan komposisi
gula, EPS diklasifikasikan sebagai homopolimer (dengan satu jenis gula, glukosa, atau xilosa,) dan
heteropolimer (dengan lebih dari satu jenis gugus gula, glukosa, rhamnose, mannose, dll.,).
Berdasarkan ada atau tidaknya asam uron, EPS masing-masing dikategorikan sebagai EPS asam atau
netral. Beberapa EPS ini dapat membentuk film, beberapa bentuk gel, beberapa lagi dapat
meningkatkan viskositas larutan. Karena sifat fungsionalnya yang bervariasi, EPS mikroba dapat
digunakan di berbagai bidang seperti pertanian, kosmetik, makanan, pemulihan minyak,
pengemasan, tekstil, pengolahan air limbah, farmasi, obat-obatan, dan dalam bentuk membran.
Beberapa manfaat kesehatan seperti aktivitas antitumor, efek anti-aterosklerotik, aktivitas
imunomodulasi, dan efek prebiotik dari bakteri asam laktat dan EPS mikroba lainnya ditinjau baru-
baru ini [4,5]. Bakteri Antartika Pseudoalteromonas sp. S-5 menghasilkan EPS, menunjukkan aktivitas
antikanker, baru-baru ini dilaporkan [6]. Gellan menemukan berbagai aplikasi sebagai bahan
formulasi oral, oftalmik, dan hidung, rekayasa jaringan, dan bahan pembalut [7]. Aplikasi permen
karet xanthan telah ditinjau dalam penghantaran obat, karena potensinya dalam memperlambat
pelepasan obat, dalam bentuk liposom, hidrogel, niosom, nanopartikel, sistem matriks, atau
mikrosfer [8]. Baru-baru ini, gel mikro curdlan terfosforilasi disiapkan untuk pelepasan obat in vitro,
dan gel mikro ini ditemukan menunjukkan biokompatibilitas yang sangat baik [9]. Produksi dan
aplikasi selulosa mikroba di bidang medis dan farmasi telah ditinjau [10]. Selulosa bakteri dianggap
sebagai alternatif terbaik untuk bahan pembalut luka karena kapasitas menahan air, porositas, dan
sifat penghalang yang efisien serta bahan serat nano. Beberapa penelitian telah dilaporkan pada
penerapan selulosa bakteri sebagai kulit atau membran buatan atau sebagai bahan pembalut luka
pada luka bakar. Beberapa penelitian telah dilakukan untuk menggunakan selulosa bakteri sebagai
eksipien dan menggunakannya sebagai bahan pelepasan obat yang lambat di bidang bioteknologi
farmasi. Para penulis telah melakukan penelitian ekstensif tentang produksi selulosa bakteri yang
diproduksi oleh Gluconacetobacter xylinus untuk berbagai aplikasi (Gambar 1). Derivatisasi
meningkatkan fungsionalitas levan dalam hal peningkatan daya reduksi, aktivitas pemulungan,
antioksidan, dan aktivitas antikanker [11]. Pada konsentrasi 0,1 hingga 1,0%, levan adalah
imunostimulan yang sangat baik pada ikan [12]. Fruktooligosakarida yang berasal dari hidrolisis asam
levan dianggap sebagai agen prebiotik [13]. Levan memiliki beberapa aplikasi medis seperti faktor
anticlotting dalam operasi jantung, penyembuhan luka, agen anti-AIDS setelah angioplasti, dan
pengisian gigi subkutan [14].
4
Gambar 1. Produksi selulosa bakteri oleh Gluconacetobacter xylinum
Mikroalga menghasilkan berbagai senyawa untuk adaptasi dan kelangsungan hidup pada kondisi
lingkungan yang berbeda. Banyak strain mikroalga laut menghasilkan persentase tinggi dari total
lipid (hingga 30-70% dari berat kering) [24]. Akumulasi asam lemak terkait erat dengan tahap
pertumbuhan mikroalga, berfungsi sebagai timbunan energi selama kondisi yang tidak
5
menguntungkan atau pembelahan sel. Asam lemak omega-3 terakumulasi karena kandungan
energinya yang tinggi, serta sifat aliran yang baik yang penting untuk fungsi seluler [25,26]. Sampai
saat ini, kandungan asam lemak ω-3 dari berbagai strain mikroalga telah dipelajari. Strain dari
genera Phaeodactylum, Nannochloropsis, Thraustochytrium dan Schizochytrium telah menunjukkan
akumulasi asam Eicosapentaenoic (EPA) dan/atau Decosahexaenoic acid (DHA) yang tinggi.
Phaeodactylum tricornutum dan Nannochloropsis sp. menunjukkan kandungan EPA hingga 39% dari
total asam lemak, sedangkan strain seperti Thraustochytrium dan Schizochytrium limacinum
mengandung persentase DHA 30-40% dari total asam lemak. Asam lemak omega-3 merupakan
komponen struktural penting dari membran sel manusia, terutama sel saraf [27-31]. Konsumsi
suplemen EPA dan DHA telah terbukti dapat mencegah penyakit kardiovaskular, sistem saraf, dan
peradangan. Konsumsi asam lemak ω-3 secara teratur mengurangi risiko hipertensi, trombosis,
infark miokard dan aritmia jantung karena peningkatan rasio lipoprotein densitas tinggi/lipoprotein
densitas rendah (HDL/LDL) dan menurunkan rasio kolesterol total/HDL [32]. Selain manfaat
kardiovaskular, asam lemak omega-3 juga menunjukkan efek positif pada fungsi otak dan sistem
saraf (Tabel 2). Pada wanita hamil, asupan EPA dan DHA yang cukup sangat penting untuk
perkembangan otak janin yang sehat [33,34]. Pada bayi, asam arakidonat (ARA), asam lemak omega-
6, dan DHA ditemukan penting untuk pertumbuhan normal dan perkembangan fungsional [35].
Peningkatan konsumsi DHA juga dapat mengurangi keparahan depresi [36]. Efek imunomodulator
telah diamati ketika asam lemak ω-3 digunakan dalam pengobatan kondisi inflamasi seperti
rheumatoid arthritis, penyakit Crohn, kolitis ulserativa, psoriasis, asma, lupus dan fibrosis kistik [37-
39]. Saat ini terdapat permintaan yang besar untuk mikroalga dalam industri nutraceutical dan
farmasi karena efeknya yang meningkatkan kesehatan. PUFA yang diturunkan secara makro, seperti
ARA dan DHA ditambahkan sebagai benteng pertahanan bagi susu formula bayi, sebuah industri
yang bernilai $ 10 miliar per tahun. Sampai saat ini, ekstrak mikroalga dapat ditemukan di banyak
produk perawatan wajah dan kulit, misalnya, krim anti penuaan, produk perawatan menyegarkan
atau regeneratif, krim matahari, emolien dan anti iritasi pada pengelupas [40]. Dermochlorella
diekstrak dari Chlorella vulgaris, yang dikenal untuk merangsang sintesis kolagen dalam regenerasi
jaringan pendukung kulit dan pengurangan kerutan [41]. Protuline adalah ekstrak kaya protein dari
Arthrospira (Spirulina), yang membantu memerangi penuaan kulit dini, memberikan efek
pengencangan dan mencegah pembentukan kerutan [42].
6
Eicosatetraenoic Porphyridium sp. Suplemen nutrisi, Anti-inflamasi,
acid (arachidonic formulasi anabolik otot.
acid, ARA)
7
ß-1,3-glukan Chlorella Stimulator kekebalan, antioksidan
dan pengurangan kolesterol darah
Alginat, selulosa, Kelompok Rhodophyta Beberapa aplikasi farmasi.
atau karagenan
Eksopolisakarida Efek sitotoksik terhadap garis sel
tersulfasi kanker manusia
Untuk penyebaran sebagai vaksin oral, beberapa alga diizinkan dan telah disertifikasi sebagai secara
umum diakui sebagai aman (GRAS) untuk konsumsi manusia oleh Food and Drug Administration.
Selain itu, vaksin alga menawarkan sejumlah keunggulan unik dibandingkan dengan terapi tanaman
konvensional, seperti pertumbuhan yang cepat (relatif terhadap tanaman terestrial), dampak
lingkungan minimal dari transfer gen lateral, dan persyaratan pemrosesan minimal [43]. Produksi
plastid alga dari antibodi manusia monoklonal yang aktif penuh pertama kali dilaporkan dalam
kloroplas C. reinhardtii [44]. Subunit besar RuBisCO (rbcL) dan promotor ATP sintase (atpA) plastidial
digunakan bersama dengan rangkaian rbcL 50 dan 30 UTR untuk konstruksi plasmid, menghasilkan
antibodi rantai tunggal yang menargetkan glikoprotein D dari virus herpes simpleks. Dalam
perkembangan lain, produksi protein chimeric yang terdiri dari mukosa adjuvan (CtxB) dan kandidat
vaksin penghambat transmisi malaria (Pfs25) ditunjukkan pada C. reinhardtii [45]. Vaksinasi oral
pada tikus ditemukan menghasilkan produksi antibodi IgG dan IgA. Tran dan rekannya baru-baru ini
mengembangkan penelitian ini untuk mengekspresikan antibodi rantai tunggal yang menargetkan
antigen permukaan sel B CD22 yang digabungkan dengan imunotoksin. Protein fusi menghasilkan
imunotoksin dimer yang mampu mengikat dan mengurangi viabilitas limfoma sel-B [46,47].
8
merasakan lingkungan mikro dengan oksigen rendah seperti yang ditemukan di jaringan tumor.
Hipoksia adalah isyarat pada strain E. coli ini untuk meningkatkan regulasi protein adhesin
pseudotuberculosis Yersinia (invasin) yang cukup untuk E. coli untuk menyerang sel mamalia. Karena
invasi hanya efisien dari kepadatan sel tertentu, laboratorium Voigt melengkapi E. coli ini dengan
sensor kedua termasuk sirkuit genetik lain yang merasakan kepadatan sel (sirkuit penginderaan
kuorum dari Vibrio fischeri) [56]. Dengan demikian, strain E. coli ini harus secara khusus menyerang
sel tumor dengan cara yang bergantung pada kepadatan populasi. Penulis telah melakukan
penelitian tentang produksi polihidroksibutirat (PHB) oleh B. mycoides yang berguna untuk aplikasi
biomedis seperti benang bedah, pelepasan lambat antibiotik, bahan medis sekali pakai dan sebagai
perancah dengan fungsi pelepasan obat yang lambat (Gambar 2-4).
9
Gambar 2. Butiran PHB setelah pewarnaan Nile Red pada Bacillus mycoides.
Gambar 3. Field Emission Scanning Electron Microscopy dari butiran PHB (10000X) setelah sel
hancur.
Kesimpulan
Tumbuhan, hewan, dan mikroorganisme telah menjadi sumber untuk produksi obat-obatan. Sumber
mikroba terkini, baik strain liar dikembangkan oleh teknologi DNA rekombinan, mutagenesis
konvensional atau rekayasa metabolik, sebagian besar lebih disukai untuk produksi biofarmasi dalam
berbagai kategori (Tabel 1). Untuk produksi antibodi monoklonal atau sejumlah besar biofarmasi dan
vaksin bernilai tinggi, lini sel hewan digunakan dalam fermentor skala produksi untuk mencapai
biaya yang efektif dan untuk mengatasi masalah keamanan. Teknologi biofarmasi merupakan bidang
yang sangat besar termasuk biofarmasi untuk menyembuhkan dan mencegah penyakit seperti
10
kanker, masalah kardiovaskular dan gangguan pertumbuhan pada anak, untuk mengobati infeksi
virus, bakteri dan mikotik. Repertoar molekul terapeutik semakin berkembang menggunakan
mikroorganisme, tumbuhan dan hewan dari laut dan sumber air tawar. Lebih lanjut, mikroorganisme
endosimbiotik dari tumbuhan, spons, dan hewan telah meningkatkan prospek untuk menemukan
sejumlah besar molekul bioaktif. Secara keseluruhan, platform produksi biofarmasi mencakup
mikroorganisme, jalur sel hewan, tumbuhan dan hewan. Dalam waktu dekat, rekayasa metabolik
dan biologi sintetik akan semakin meningkatkan penemuan obat dan produksi biofarmasi untuk
mengobati penyakit secara efektif.
11