Dalam edisi Journal ini, Abuabara et al1 mengevaluasi sebagai asosiasi ras/etnis yang

diidentifikasi sendiri, ukuran genetik

Keturunan Afrika, ukuran pigmen kulit, dan risiko poligenik
skor pada hasil dermatitis atopik (AD) dalam 2 kohort independen: Pediatric Eczema Elective
Registry (PEER) dan Genetic Epidemiology Research on Adult Health and Aging
(GERA) kelompok. Hingga 10% dari populasi Amerika memiliki
AD, dan subjek Afrika-Amerika memiliki peningkatan 1,7 kali lipat
risiko AD.2 Memahami dasar genetik apa pun untuk
disparitas dalam AD sangat penting mengingat perkiraan heritabilitas
sekitar 84%. Studi ini merupakan studi genetik terbesar dari
AD dalam mata pelajaran Afrika Amerika. Meskipun penulis
mengkonfirmasi penelitian sebelumnya yang menemukan AD keduanya lebih umum
dan lebih parah pada subjek Afrika-Amerika daripada kulit putih mereka
rekan-rekan,2 mereka tidak menemukan hubungan hasil AD dengan
ukuran genetik keturunan Afrika dan tidak ada hubungan dengan
skor risiko poligenik. Di sini kita membahas kurangnya hubungan genetik yang teridentifikasi
dengan skor risiko poligenik, yang memiliki keterbatasan
generalisasi untuk mata pelajaran non-Eropa,3 dan kemudian membahas
pertanyaan yang lebih spesifik tentang kurangnya hubungan dengan Afrika global
keturunan.

Meskipun perkiraan heritabilitas tinggi, peran faktor genetik dalam

Hasil AD dalam populasi Afrika Amerika telah
relatif kurang dipelajari. Sebuah studi asosiasi genom-lebar sebelumnya
(GWAS) dari 5843 peserta dengan keturunan Afrika dan AD
diidentifikasi dengan menggunakan sistem fenotip rekaman elektronik
menemukan bahwa tidak ada varian yang diidentifikasi memenuhi seluruh genom
signifikansi meskipun signifikansi nominal 9 dari 136 lokus yang
sebelumnya dilaporkan pada populasi Eropa.4 Hasil yang rendah
dari GWAS sebelumnya dan kurangnya asosiasi untuk saat ini
skor risiko poligenik studi mungkin karena sejumlah faktor,
termasuk kesalahan klasifikasi penyakit, frekuensi faktor risiko genetik yang relevan pada
populasi asal Afrika (varian langka),
kurangnya representasi populasi ini dalam studi GWAS sebelumnya
digunakan untuk menginformasikan skor risiko poligenik, dan kurangnya representasi varian
risiko spesifik populasi pada chip gen yang digunakan untuk belajar
populasi ini.

Ada perbedaan frekuensi alel spesifik ras dalam

faktor risiko genetik yang diketahui untuk AD. Sesuai dengan studi menggunakan
metode genotipe yang kurang intensif, dalam studi sekuensing
mengevaluasi varian filaggrin (FLG) dalam kohort PEER, the
kemungkinan memiliki varian kehilangan fungsi FLG adalah 2,44 kali lipat
lebih besar pada anak-anak kulit putih dibandingkan dengan anak-anak Afrika-Amerika.5
Dalam penelitian ini, 4 varian risiko yang terdokumentasi dengan baik ditangkap
92,6% variasi pada subjek kulit putih tetapi hanya menangkap 36%
variasi dalam mata pelajaran Afrika Amerika. Dalam studi lain
oleh kelompok yang sama, 9 varian langka yang unik diidentifikasi pada subjek Afri can
American, dan varian ini memiliki efek risiko yang serupa
untuk alel hilangnya fungsi yang dijelaskan sebelumnya pada populasi kulit putih.
Khususnya, karena varian ini jarang, secara statistik menjadi lebih sulit untuk
mengidentifikasi efek ini dalam sampel yang lebih kecil
ukuran

Selain itu, penghalang kulit lainnya (yaitu, FLG2) dan gen imunomodulator, seperti
limfopoietin stroma timus (TSLP), memiliki
telah diidentifikasi sebagai faktor risiko potensial untuk persistensi AD
dalam studi Afrika-Amerika.6,7 FLG2 dapat meningkatkan risiko
AD persisten pada subjek Afrika-Amerika sebesar 50%6 tetapi memiliki
tidak dikaitkan dengan risiko AD pada populasi Eropa
Varian TSLP memodifikasi efek varian FLG di Afrika
mata pelajaran Amerika.7 Ini mungkin sangat relevan karena
Subjek Afrika-Amerika memiliki lebih banyak endotipe TH2
Secara kolektif, temuan ini menunjukkan bahwa varian langka yang diketahui
gen (FLG) dan faktor risiko genetik spesifik populasi lainnya
perlu dinilai dalam skor risiko poligenik di Afrika-Amerika
populasi

Selain itu, penghalang kulit lainnya (yaitu, FLG2) dan gen imunomodulator, seperti
limfopoietin stroma timus (TSLP), memiliki
telah diidentifikasi sebagai faktor risiko potensial untuk persistensi AD
dalam studi Afrika-Amerika.6,7 FLG2 dapat meningkatkan risiko
AD persisten pada subjek Afrika-Amerika sebesar 50%6 tetapi memiliki
tidak suka dengan risiko AD pada populasi Eropa
Varian TSLP memodifikasi efek varian FLG di Afrika
mata pelajaran Amerika.7 Ini mungkin sangat relevan karena
Subjek Afrika-Amerika memiliki lebih banyak endotipe TH2
Secara kolektif, temuan ini menunjukkan bahwa varian langka yang diketahui
gen (FLG) dan faktor risiko genetik spesifik populasi lainnya
perlu dinilai dalam skor risiko poligenik di Afrika-Amerika
populasi Waltham, Mass) yang digunakan dalam penelitian ini adalah state of the art dan
seharusnya menangkap variasi genetik dalam populasi ini.
Namun, masih ada kemungkinan bahwa skor risiko poligenik diturunkan
dari GWAS secara intrinsik bias terhadap penemuan genetik
asosiasi dalam populasi non-Eropa.

Selain itu, mungkin ada perbedaan biologis dalam

endotipe penyakit yang spesifik populasi. Baru baru ini
studi tentang subjek Afrika-Amerika dan kulit putih dilakukan
pewarnaan imunohistokimia, sekuensing RNA, dan RT-PCR
konfirmasi pada kulit lesi dan nonlesi dari pasien
dengan AD dan subjek kontrol. Dalam analisis jalur studi ini
mengungkapkan lebih sedikit aktivasi kekebalan bawaan dan lebih sedikit TH1 dan TH17
aktivasi jalur pada peserta Afrika-Amerika dibandingkan
dengan peserta Eropa Amerika. Level TH2 dan TH22
aktivasi gen jalur serupa antar kelompok
Meskipun penelitian itu dibatasi oleh ukuran sampel yang kecil, agnostik
Pendekatan endotipe molekuler diperlukan untuk lebih memahami endotipe AD dan
frekuensinya dalam populasi yang berbeda karena mungkin ada perbedaan dalam asosiasi
genetik.
oleh endotipe.

Meskipun kurangnya hubungan yang signifikan dengan poligenik,

skor risiko dijelaskan seperti yang dirangkum dalam Gambar 1, kurangnya asosiasi dengan
perkiraan global keturunan Afrika menarik.
Para penulis menyarankan bahwa temuan ini mungkin menunjukkan bahwa sosial
dan faktor lingkungan yang terkait dengan keturunan Afrika adalah
lebih penting dalam disparitas AD daripada faktor genetik. Meskipun
ini mungkin, juga masuk akal bahwa keturunan genetik lokal atau varian langka mungkin
lebih relevan daripada global
keturunan. Memang, varian langka spesifik populasi kurang terwakili atau terlewatkan pada
platform GWAS standar dan karenanya tidak
tentu berkorelasi dengan nenek moyang global yang diperkirakan dengan menggunakan
platform ini. Dengan demikian, masih sangat mungkin bahwa beberapa dari
perbedaan ini disebabkan oleh faktor genetik lokal yang kurang teridentifikasi.

Selain masalah yang terkait dengan ketidakcukupan risiko poligenik

skor dan representasi varian langka yang buruk di GWAS
platform, ada batasan penting lainnya saat ini
studi, termasuk penggunaan Klasifikasi Penyakit Internasional,
Revisi Kesembilan, kode untuk kelompok GERA yang lebih besar. Eropa
Akademi Alergi dan Imunologi Klinis dan Dunia
Organisasi Alergi menerbitkan artikel dan ulasan strategis di
yang mereka tekankan bahwa penyakit hipersensitivitas buruk
dikodekan dalam Klasifikasi Penyakit Internasional,10 meningkatkan
pertanyaan tentang bias kesalahan klasifikasi penyakit
Terlepas dari keterbatasan, penulis harus bertepuk tangan
karena mereka telah melakukan studi genetik terbesar AD di
populasi keturunan Afrika, dan kurangnya hubungan penelitian dengan skor risiko poligenik
dan perkiraan global keturunan
mengungkapkan pentingnya studi sekuensing genetik pada populasi keturunan Afrika. Untuk
studi masa depan untuk menjelaskan lebih lanjut
dasar genetik dari perbedaan pada pasien dengan AD, itu tetap
sangat penting untuk melakukan penelitian besar dengan seluruh genom
pengurutan data dan fenotip presisi intensif secara global
populasi yang beragam yang kurang terwakili dalam penelitian meskipun
prevalensi penyakit yang lebih besar.