Mikrobiologi Industri

Pengembangan Strain dan Produknya

JUDUL

DISUSUN OLEH

KELOMPOK 3

Febby Athiyah Khairunnisa ( 19032125)

Novia Annisa (19032085)

Yolla Fristia (19032108)

Yurico Utami (19032163)

DOSEN PENGAMPU:

1. Dr. Irawan Sugoro

2. Dr.Irdawati,S.Si,M.Si.
3. Dr. Megga Ratnasari Pikoli

JURUSAN BIOLOGI

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS NEGERI PADANG

2020

1
 KATA PENGANTAR

Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah memberikan rahmat dan hidayah-Nya sehingga
kami dapat menyelesaikan tugas makalah yang berjudul “Pengembangan Strain dan Produknya”.

Adapun tujuan dari penulisan dari makalah ini adalah untuk memenuhi tugas dari bapak Dr.
Irawan Sugoro, ibu Dr.Irdawati,S.Si,M.Si.,dan ibu Dr. Megga Ratnasari Pikolipada bidang studi
mikrobiologi Industri. Kami mengucapkan terima kasih kepada selaku bapak Dr. Irawan Sugoro,
ibu Dr.Irdawati,S.Si,M.Si.,dan ibu Dr. Megga Ratnasari Pikolipada dosen mata kuliah
mikrobiologi Industri yang telah memberikan tugas ini sehingga dapat menambah pengetahuan
dan wawasan sesuai dengan bidang studi yang di tekuni.

Kami juga mengucapkan terima kasih kepada semua pihak yang telah membagi sebagian
pengetahuannya sehingga kami dapat menyelesaikan makalah ini.

Kami menyadari, makalah yang saya tulis ini masih jauh dari kata sempurna. Oleh karena itu,
kritik dan saran yang membangun akan kami nantikan demi kesempurnaan makalah ini.

Lintau, Oktober 2021

Penyusun

2
 DAFTAR ISI

JUDUL .......................................................................................................................................1
DAFTAR ISI ..............................................................................................................................3
BAB I .........................................................................................................................................4
A. Latar Belakang .................................................................................................................4
B. Rumusan Masalah ............................................................................................................5
C. Tujuan Penulisan ..............................................................................................................5
BAB II ........................................................................................................................................6
A. Mutasi ..............................................................................................................................6
B. Overproduksi.................................................................................................................. 11
C. Rekayasa Genetika ......................................................................................................... 12
BAB III ..................................................................................................................................... 15
Kesimpulan ........................................................................................................................... 15
DAFTAR PUSTAKA ............................................................................................................... 16

3
 BAB I

PENDAHULUAN

A. Latar Belakang

Ilmu pengetahuan dan teknologi untuk merancang, membiakkan, memanipulasi, dan terus
meningkatkan kinerja galur mikroba untuk aplikasi bioteknologi disebut sebagai starin. Ilmu di
balik pengembangan kultur yang ditingkatkan baru-baru ini telah ditingkatkan dengan
pemahaman yang lebih besar tentang biokimia dan fisiologi mikroba, ditambah dengan kemajuan
dalam teknologi reaktor fermentasi dan rekayasa genetika. Selain itu, ketersediaan dan penerapan
peralatan analisis yang mudah digunakan seperti kromatografi cair bertekanan tinggi (HPLC)
dan spektroskopi massa, yang meningkatkan batas deteksi metabolit, juga memainkan peran
penting dalam menyaring galur yang ditingkatkan.

Sumber utama semua strain mikroorganisme industri adalah lingkungan alaminya. Tetapi
setelah beberapa tahun, sebagai proses mikrobiologi berskala-besar maka strain dapat menjadi
sempurna, sejumlah strain industri disimpan pada koleksi biakan.

Seperti kita ketahui, bahwa sumber asal mikroorganisme industri adalah lingkungan
alaminya, tetapi isolat asal tersebut akan dimodifikasi secara besarbesaran di laboratorium.
Sebagai akibat modifikasi tersebut, dapat diharapkan penambahan perbaikan dalam
menghasilkan suatu produk. Peningkatan perbaikan yang paling dramatik, contohnya terjadi pada
penisilin, antibiotik yang dihasilkan oleh fungi Penicillium chrysogenum. Pertamakali dihasilkan
pada skala besar, penisilin diperoleh sebanyak 1-10 µg/ml. Setelah beberapa tahun, sebagai hasil
perbaikan strain dengan merubah kondisi pertumbuhan dan medium, hasilnya meningkat
menjadi 50.000 µg/ml. Yang menarik ialah, peningkatan hasil sampai 50.000 kali-lipat diperoleh
melalui mutasi dan seleksi; tidak melibatkan manipulasi rekayasa genetika. Selanjutnya
diperkenalkan teknik genetika baru, walaupun lebih sederhana, hasilnya meningkat.

Untuk mencapai spesialisasi metabolik tinggi tersebut, strain industri dirubah secara
genetika melalui mutasi atau rekombinasi. Jalur metabolik minor biasanya ditekan atau
dihilangkan. Sering terdapat ketidak-seimbangan metabolik, misalnya kemampuan
pertumbuhannya yang rendah, kehilangan kemampuan untuk membentuk spora, dan mengalami
perubahan pada komponen biokimia dan selnya. Meskipun strain industri dapat tumbuh dengan
sangat memuaskan di bawah kondisi fermentor industri yang sangat terspesialisasi, strain
tersebut dapat memperlihatkan kemampuan pertumbuhan dalam lingkungan yang kompetitif di
alam.

4
B. Rumusan Masalah
1. Bagaimana metode pengembangan strain dengan cara mutasi
2. Bagaimana metode pengembangan strain dengan cara overproduksi
3. Bagaimana metode pengembanagn strain dengan cara rekayasa genetika

C. Tujuan Penulisan
1. Mengetahui cara pengembangan strain metode mutasi
2. Mengetahui cara pengembangan strain metode overproduksi
3. Mengetahui cara pengembangan strain mmetode rekayasa genetika

5
 BAB II

PEMBAHASAN

A. Mutasi

DNA mikroba mengandung basa purin dan pirimidin. Urutan keduanya

sangatmenentukan ciri tertentu pada mikroba. Urutan ini sangat mudah berubah oleh
berbagaifaktor dan apabila terjadi perubahan dalam urutan ini maka akan terjadi
perubahan padaurutan asam amino yang disandi oleh gen. Akibatnya terjadi perubahan
fenotif padamikroba.Perubahan dalam urutan basa nukleotida ini disebut mutasi. Mutasi
banyak terjadi pada waktu proses sintesa DNA terutama pada waktu penempatan basa
purin dan pirimidin yang mengalami “kesalahan”.

Bila mutasi ini terjadi pada enzim polymerase yang berhubungan dengan DNA,
maka mutasi akan berlangsungdengan frekuensi yang relatif tinggi. Hal ini dikarenakan
tidak ada lagi kemampuan darienzim itu untuk bertugas mengatur penempatan basa purin
dan pirimidin.Mutasi juga dapat terjadi karena hilangnya pasangan basa purin atau
pirimidin.Bahkan karena adanya penambahan pasangan basapun dapat juga terjadi
mutasi. Sebabhilangnya atau penambahan tersebut justru akan berakibat terjadi
“kesalahan” dalam pembacaan sandi pada saat terjadi transkripsi ke mRNA.

Mutasi mudah terjadi pada mikroba terutama karena ciri dan karakter dari
mikrobiatersebut sangat dipengaruhi oleh urutan dari basa purin dan pirimidin di dalam
meteri genetikmikrobia tersebut. Perubahan urutan nukleotida paling sering terjadi karena
kesalahan selamareplikasi DNA dan kerusakan DNA, baik kerusakan DNA karena
mekanisme delesi atauinsersi pada kerangka DNA tersebut. Perubahan urutan nukleotida
akan berdampak padafenotip dari sel tersebut. Perubahan fisiologis sel, misalnya adanya
beberapa enzim yangtidak terbentuk pada mutan tertentu, kemudian perubahan
morfologi, dan terjadinya resistensiterhadap zat dan kondisi lingkungan tertentu .

Mutasi dapat dikaitkan dengan perubahan nukleotida tunggal, melalui substitusi

satu purin dengan purin lain atau substitusi satu pirimidin dengan pirimidin lain (transisi),
atau melalui substitusi satu purin dengan pirimidin atau sebaliknya (transversi). Mutasi
juga dapat terjadi akibat penghapusan satu atau lebih pasangan basa, penyisipan pasangan
basa, atau penataan ulang pasangan basa kromosom karena kerusakan dan penyatuan
kembali DNA yang salah. Perubahan susunan pasangan basa ini dapat mengubah 'bingkai
pembacaan' gen (mutasi frameshift), dan selama proses transkripsi dan translasi juga
mengubah urutan asam amino pada protein yang dihasilkan. Sebagian besar mutasi
terjadi pada struktur kromosom di lokasi atau lokus tertentu (mutasi gen).

6
 Mutasi genetik memang terjadi secara spontan, pada frekuensi rendah pada setiap
titik di sepanjang gen (10^-5 – 10^-10 per generasi). Beberapa mutasi adalah hasil dari
integrasi atau eksisi elemen urutan penyisipan dan menghasilkan modifikasi halus dari
urutan genetik. Dalam banyak kasus mutasi berbahaya, tetapi mutasi tertentu terjadi yang
membuat organisme lebih beradaptasi dengan lingkungannya dan meningkatkan
kinerjanya. Potensi mikroba untuk bermutasi adalah sifat penting DNA karena
menciptakan variasi baru dalam kumpulan gen.

Berdasarkan metode penyaringan dan seleksi yang dipilih, pada dasarnya ada dua
metode untuk meningkatkan strain mikroba melalui mutasi acak: (1) seleksi acak dan (2)
seleksi rasional.

1. Seleksi acak
Mutagenesis dan seleksi acak juga disebut sebagai pendekatan klasik atau
prosedur perbaikan regangan nonrekombinan. Mutan yang ditingkatkan biasanya
diidentifikasi dengan menyaring populasi besar organisme yang bermutasi, karena
fenotipe mutan tidak mudah dikenali dengan latar belakang yang luas. Setelah
menginduksi mutasi, organisme yang selamat dari populasi dipilih secara acak dan diuji
kemampuannya untuk menghasilkan metabolit yang diinginkan. Pendekatan ini memiliki
keuntungan karena sederhana dan dapat diandalkan. Salah satu kelemahan pendekatan
seleksi acak adalah bahwa hal itu bergantung pada mutasi gen nonspesifik yang tidak
ditargetkan, sehingga banyak strain perlu disaring untuk mengisolasi mutan yang
ditingkatkan dalam populasi campuran. Selain itu, ketika kultur mengalami mutagenisasi,
beberapa mutasi dapat terjadi pada starin. Hal ini dapat mengakibatkan melemahnya
organisme yang tidak memiliki sifat-sifat yang diinginkan.

a. Proses perbaikan galur ini melibatkan penerapan berulang dari tiga prinsip dasar:
mutagenesis populasi untuk menginduksi variabilitas genetik,
b. Seleksi dan penyaringan acak dari populasi galur yang diperbaiki yang bertahan
hidup dengan fermentasi model skala kecil, dan
c. Pengujian kaldu/agar fermentasi untuk produk dan penilaian untuk galur yang
lebih baik.

Harus ditekankan bahwa aksi agen mutagenik pada DNA tidak hanya dapat
menyebabkan perubahan genetik tetapi juga dapat menyebabkan kematian sel, karena
kerusakan permanen pada DNA atau pembentukan mutasi yang mematikan. Oleh karena
itu, setelah pengobatan mutagenik, mutan dicari di antara populasi yang masih hidup
dengan antisipasi bahwa masing-masing sel yang masih hidup menyimpan satu atau
beberapa mutasi. Setiap kali galur yang ditingkatkan diturunkan melalui mutasi, galur
tersebut digunakan lagi sebagai galur induk dalam siklus mutasi baru, penyaringan
dengan fermentasi (cair atau padat), dan pengujian.

7
 Prosedur acak pemilihan mutan ini dilanjutkan sampai strain diturunkan yang
secara statistik unggul dalam kinerja strain kontrol sebelum pengobatan mutagenik.
Tujuan mutagenesis adalah untuk memaksimalkan frekuensi mutasi yang diinginkan
dalam suatu populasi sambil meminimalkan kematian pengobatan. Untuk tujuan ini,
nitrosoguanidine (NTG) telah menjadi mutagen pilihan karena menawarkan
kemungkinan frekuensi mutan tertinggi per penyintas. Efisiensi proses seleksi acak
tergantung pada beberapa faktor: jenis kultur yang digunakan (seperti spora atau konidia),
dosis mutagen dan waktu pemaparan, jenis dan kerusakan DNA, kondisi pengobatan dan
pasca pengobatan, frekuensi pengobatan mutagen, dan tingkat peningkatan hasil yang
dapat dideteksi. Selain kondisi mutasi, tes atau prosedur skrining kuantitatif dan analitis
yang digunakan (bioassay, radioimmunoassay, kromatografi, HPLC) juga memainkan
peran penting dalam keberhasilan isolasi mutan unggul. Kemampuan untuk mendeteksi
kembali mutan di antara mutan yang dipilih secara acak sangat dipengaruhi oleh proses
serta variabilitas dalam proses dan perbedaan titer aktual antara galur yang ditingkatkan
dan kontrol. Oleh karena itu, prosedur penyaringan biasanya dirancang untuk
memaksimalkan presisi dan selektivitas kultur yang ditingkatkan (gain per sampel yang
diuji) dan untuk meminimalkan variabilitas (diukur sebagai koefisien variasi) ketika
merawat sampel kontrol dan referensi yang tidak dimutagenkan. Semua galur yang diuji,
termasuk kontrol, biasanya dikerjakan secara langsung dari tahap klon sel awal hingga
tahap penyaringan akhir. Ini pada dasarnya adalah tes signifikansi. Dengan demikian, jika
semua kondisi perlakuan sama, tes yang berhasil harus menunjukkan perbedaan statistik
antara cara kontrol dan kultur yang ditingkatkan.

2. Seleksi yang dirasionalisasi

Seleksi rasional untuk perbaikan strain umumnya tidak memerlukan pemahaman
yang canggih tentang biologi molekuler untuk memanipulasi kondisi lingkungan atau
budaya. Prosedur ini berguna dalam memilih strain yang memproduksi metabolit secara
berlebihan, molekul sederhana, asam amino, atau enzim secara berlebihan. Beberapa
mutan yang diturunkan melalui seleksi rasional dijelaskan di bawah ini.

a. Mutan auksotrofik
Banyak proses metabolisme memiliki jalur bercabang, dan
mengisolasi mutan yang tersumbat di satu cabang jalur metabolisme dapat
menyebabkan akumulasi produk sederhana seperti asam amino,
nukleotida, dan vitamin yang dibuat oleh cabang lain. Strain auksotrofik
diblokir di beberapa titik di jalur penting untuk pertumbuhan, dan kecuali
nutrisi atau produk spesifik dari jalur dipasok di media, auksotrof tidak
bertahan. Auxotrof terutama diisolasi dengan melapisi populasi mutagen
pada media lengkap yang memiliki semua nutrisi yang dibutuhkan untuk
pertumbuhan. Klon-klon tersebut kemudian dilapisi replika ke media

8
 minimal yang kekurangan beberapa nutrisi spesifik, dan auksotrof yang
gagal tumbuh pada media minimal diidentifikasi. Kebanyakan strain
auxotrophic memberikan hasil antibiotik yang buruk; namun, beberapa
revertan prototrofik telah menunjukkan peningkatan produksi antibiotik
seperti dalam produksi tetrasiklin.
b. Mutan pengatur
Karena anabolisme dan katabolisme dalam organisme apa pun
diatur dengan ketat, seleksi dan penyaringan mikroba dengan regulasi
yang kurang efisien, dan kondisi kultur yang optimal, dapat menyebabkan
regulasi yang longgar dan produksi produk mikroba yang berlebihan.
Pemahaman yang luas tentang kemacetan jalur metabolisme diperlukan
untuk pendekatan rasional untuk mengembangkan mutan pengatur yang
lebih baik. Mengisolasi strain yang direlaksasi dalam regulasi biasanya
dapat dicapai dengan memilih strain yang tidak peka terhadap
penghambatan umpan balik (aktivitas enzim) atau represi umpan balik
(sintesis enzim) yang terlibat dalam jalur tersebut. Satu kesulitan dalam
menerapkan mutan resisten analog untuk perbaikan strain adalah bahwa
banyak analog dari metabolisme primer perlu diuji dan beberapa tidak
menghambat pertumbuhan atau menghambat pertumbuhan hanya pada
konsentrasi yang sangat tinggi.

Mutasi dapat terjadi karena beberapa sebab, misalnya:

a. Mutasi titik (point mutation)

Mutasi ini dapat terjadi pada satu tempat/titik pasangan basa.Padatempat atau
titik initerjadi perubahan pasangan basa. Misalnya terjadi perubahan pada basa timin
yang digantikanoleh basa sitosin, atau basa adenin digantikan oleh guanin. Mutasi ini
akan berakibat:
a) tidak terjadi pembentukan protein,
b) terjadi pembentukan protein akan tetapi tetap terjadi perubahan atau
mutasi yang tidak jelas. Mutasi ini disebut mutasi tidak nyata
(silentmutation) dan
c) terjadi penggantian asam amino. Contoh basa adenin yang digantikan o
lehguanin dan timin digantikan oleh sitosin.

b. Hilangnya pasangan basa

Mutasi ini terjadi disebabkan oleh hilangnya basa dalam jumlah yang lebih
dari satu.Kehilangan ini akan menyebabkan terjadinya pergeseran dalam hal
pembacaan sandi yang pada akhirnya akan menyebabkan perubahan urutan asam
amino. Akibat yang ditimbulkanoleh mutasi ini dapat menyebabkan protein yang

9
 terbentuk tidak berfungsi.

c. Mutasi supresor
Mutasi ini merupakan mutasi yang mengakibatkan mutasi yang terjadi
sebelumnyamenjadi “normal” kembali. Pada mutasi ini terjadi “penyusupan” basa
lain yangmenyebabkan kembalinya urutan susunan asam amino yang seolah-olah
susunan itu sepertimenjadi “normal” kembali. Walau demikian mutasi ini tetap
menghasilkan perubahan yangsecara fenotif dapat tampak atau terjadi mutasi
tidak nyata.

d. Mutasi spontan
Mutasi spontan awalnya tidak diketahui, sering disebut “ background
mutation”. Kontrol genetik mutabilitas beberapa gen yang diketahui dapat
disebabkan oleh “mutatorgen” lain. Mutasi spontan dapat dibedakan menjadi 1)
mutasi spesifik yang pengaruhnya terbatas pada satu lokus dan 2) mutasi
nonspesifik secara simultan mempengaruhi pada beberapalokus.

e. Mutasi terinduksi
Mutasi terinduksi dipengaruhi oleh keadaan lingkungan yang tidak normal,
misalnya: radiasi pengion (perubahan valensi senyawa kimia melalui penambahan
elektron yang dihasilkanoleh proton, neutron, atau oleh sinar X. Radiasi
nonpengion penambahan tingkat energi atom(eksitasi), yang membuatnya kurang
stabil (contoh: radiasi UV, panas) .
a) Mutasi dari Sudut Pandang Macam Sel
Ada mutasi somatik dan germinal. Mutasi germinal/ gametic
mutation/germ linemutation, adalah mutasi yang terjadi pada sel
germ, sedangkan mutasi somatik adalah yangterjadi pada sel somatik.
Akibat mutasi somatik pada hewan dan manusia tidak
dapatdiwariskan, namun pada tumbuhan bisa diwariskan melalui
reproduksi seksual atau aseksual.Pada mutasi germinal, akibat mutasi
yang dominan segera terekspresi pada turunan.Sebaliknya, jika mutasi
bersifat resesif, maka efek mutasinya tidak terdeteksi karena
kondisiyang heterozigot.

b) Mutasi dari Sudut Pandang Ruang Lingkup Kejadian

Ada mutasi kromosom dan mutasi gen. Mutasi gen terjadi di
lingkup gen. Sedangkanmutasi kromosom ada di lingkup kromosom.
Mutasi gen dapat berupa perubahan urutanDNA, termasuk substitusi

10
 pasangan basa, adisi atau delesi satu atau lebih pasangan basa.Efek
mutasi gen hanya menimpa satu nukleotida. Mutasi titik adalah mutasi
yang hanyamenimpa satu pasang nukleotida dalam gen.

B. Overproduksi

Overproduksi dari Mutan Menurut Stanbury dan Whitaker (1984) kemampuan

metabolisme suatu organisme dikendalikan oleh genom, sehingga peningkatan kapasitas bakteri
dapat dilakukan melalui induksi mutasi genom salah satunya adalah dengan induksi mutasi
menggunakan sinar ultra violet (UV). Adanya mutasi, diharapkan terjadi perubahan genetik ke
arah yang lebih baik dalam melakukan metabolisme substrat, karena mikroba liar atau wildtype
seringkali memiliki beragam jalur metabolisme, sehingga melalui mutasi dapat lebih mudah
diarahkan untuk dapat memproduksi satu komponen utama atau mengarahkan mikroba untuk
menghasilkan metabolit yang betul-betul baru.

Peningkatan kapasitas mikroba dengan induksi mutagenesis UV telah dilakukan sejak

tahun 1976, yaitu pada isolat Streptomyces viridifaciens yang bertujuan untuk meningkatkan
kapasitas isolat tersebut dalam menghasilkan antibiotik, kemudian berkembang mikroba mutan
yang diadaptasikan secara khusus dalam proses fermentasi untuk menghasilkan enzim, asam
amino, dan subtansi aktif lainnya.

Penggunaan mutan memiliki kelebihan karena berlangsung lebih efektif dan murah bila
diterapkan dalam skala besar, mikroba mutan yang dipergunakan sebagai bahan inokulum perlu
memiliki sifat-sifat unggul tertentu, seperti pertumbuhan lebih cepat, mikroba mutan juga tidak
menghasilkan senyawa metabolit yang tidak diperlukan, kebutuhan akan oksigen relatif sedikit,
dan tidak menghasilkan buih jika diterapkan dalam fermentasi.

Secara umum, tujuan utama peningkatan kapasitas mikroba adalah terkait dengan
efisiensi. Diketahui biak mikroba liar melakukan metabolisme sangat rendah, sehingga kurang
menguntungkan bila dipakai dalam suatu proses. Tapi dengan program pemuliaan mikroba
melalui induksi mutasi, mikroba dapat ditingkatkan kapasitasnya sehingga dapat menghasilkan
produk metabolisme beberapa kali lipat dibandingkan dengan mikroba aslinya.

Strategi keseluruhan untuk mencapai kelebihan produksi asam amino melibatkan:

a. meningkatkan aktivitas enzim anabolik;

b. manipulasi regulasi untuk menghilangkan mekanisme kontrol umpan balik;
c. memblokir jalur yang mengarah ke produk sampingan yang tidak diinginkan;
d. menghalangi jalur yang mengakibatkan degradasi produk target; dan
e. membatasi kemampuan untuk memproses prekursor langsung asam glutamat, yaitu asam

11
 oksoglutarat, ke intermediet berikutnya dari siklus asam trikarboksilat (TCA), suksinil
koenzim A (CoA), yaitu penggunaan mutan yang kekurangan asam oksoglutarat
dehidrogenase. Selama fase pertumbuhan mutan ini menghasilkan zat antara esensial dari
isositrat melalui siklus glioksilat

C. Rekayasa Genetika

Genetika adalah kata yang dipinjam dari bahasa Belanda “genetica” adaptasi dari bahasa
inggris ”genetic” dibentuk dari kata bahasa yunani “genno” yang berarti “melahirkan”

Genetika merupakan cabang biologi yang mempelajari pewarisan sifat pada organisme
maupun suborganisme (seperti virus dan prion). Makadapat juga dikatakan bahwa genetika
adalah ilmu tentang gen dan segala aspeknya

Bidang dang kajian genetika dimulai dari wilayah subselular (molekular) hingga populasi
dan secara lebih rinci genetika berusaha menjelaskan tentang :

a. material pembawa informasi untuk diwariskan (bahan genetik)

b. bagaimana informasi itu diekspresikan (ekspresi genetik), dan
c. bagaimana informasi itu dipindahkan dari satu individu ke individu yang lain
(pewarisan genetik)

Rekayasa atau biasa juga disebut dengan teknik adalah penerapan ilmu dan teknologi
untuk menyelesaikan permasalahan manusia, hal ini diselesaikan lewat pengetahuan ataupun
pengalaman dari trial dan error. Dan rekayasa juga mengalami perkembangan layaknya lomba
lari estapet yang meneruskan teknologi generasi sebelumnya.

Maka Rekayasa genetika dalam arti luas adalah teknologi dalam penerapan genetika
untuk membantu masalah dan kepentingan apapun dari manusia. Dengan segala pengetahuan
dan pengalaman dari trial dan error tersebut manusia dapat mengembangkan produk-produk
yang bermanfaat bagi manusia itu sendiri.

Prinsip dasar teknologi rekayasa genetika adalah memanipulasi atau melakukan

perubahan susunan asam nukleat dari DNA (gen) atau menyelipkan gen baru ke dalam struktur
DNA organisme penerima. Gen yang diselipkan danorganisme penerima dapat berasal dari
organisme apa saja. Misalnya gen dari bakteri bisa diselipkan di kromosom tanaman, sebaliknya
gen tanaman dapatdiselipkan pada kromosom bakteri.

Rekayasa Genetika pada mikroba bertujuan untuk meningkatkan efektivitas kerja

mikroba tersebut (misalnya mikroba untuk fermentasi, pengikat nitrogen udara, meningkatkan

12
kesuburan tanah, mempercepat proses kompos dan pembuatan makanan ternak, mikroba
prebiotik untuk makanan olahan), dan untuk menghasilkan bahan obat-obatan dan kosmetika.

Manfaat Rekayasa Genetika Bakteri adalah sebagai berikut

a. Pembuatan insulin manusia dari bakteri ( Sel pancreas yang mempu mensekresi
Insulin digunting , potongan DNA itu disisipkan ke dalam Plasmid bakteri ) DNA
rekombinan yang terbentuk menyatu dengan Plasmid diinjeksikan lagi ke vektor , jika
hidup segera dikembangbiakkan.
b. Terapi gen
c. Pembuatan antibiotik, vaksin
d. Pembuatan serum
e. Kloning

Teknologi ini menimbulkan beberapa kekhawatiran diantara para ahli :

a. Kekhawatiran bahwa produksi molekul-molekul DNA rekombinan yang

fungsional in vivo dapat terbukti berbahaya secara biologis. Sebagai contoh : bila
bakteri tersebut dibawa ke mikroba seperti Escherichia coli yang merupakan
bakteri komensal di usus manusia dan dapat mempertukarkan informasi genetis
dengan tipe-tipe bakteri yang lain dan dapat menyebar luas diantara manusia,
hewan, tumbuhan, dan yang lainnya.
b. Kekhawatiran terbentuknya palsmid-plasmid bakteri baru yang dapat bereplikasi
secara swantantra yang bila tidak diawasi secara ketat, dapat memasukkan
determinan genetis untuk resistensi antibiotik atau pembentukan toksin bakteri ke
dalam galur-galur bakteri yang pada waktu tersebut tidak membawa determinan
semacam itu.
c. Percobaan untuk menghubungkan semua segmen DNA virus onkogenik ataupun
virus hewani yang lain menjadi unsur-unsur DNA yang melangsungkan replikasi
secara swantantra, seperti plasmid bakteri atau DNA viral lainnya, sebab
penyebaran molekul DNA dengan cara seperti itu mungkin meningkatkan
terjadinya kanker ataupun penyakit yang lain.

Beberapa vektor yang dapat digunakan yaitu

1. Plasmid
Plasmid adalah suatu molekul DNA sirkular (BM 106 – 2 x 108) dari bakteri,
yang membawa 1‐3% genom sel dan mengkode suatu sifat genetik penting yang
tidak dikode secara normal oleh kromosom bakteri tersebut. Sifat yang banyak
digunakan dari plasmid yaitu resistensi antibiotik, produksi antibiotik, degradasi
senyawa aromatik, dll.

2. Faga (bakteriofaga)
Suatu sub‐kelompok virus yang menginfeksi bakteri dengan cara menyisipkan

13
 asam nukleat nya ke dalam bakteri host nya. Faga terkecil hanya mengandung 3
gen pengkode ss RNA. T4, suatu faga bakteri yang mengandung lebih kurang 60
gen pengkode ds genom DNA faga tersebut

3. Cosmid
Cosmid adalah partikel sintetik yang dapat bereplikasi sendiri. Berasal dari
plasmid yang mengandung fragmen lambda‐DNA (DNA‐λ) yang mengkode
urutan cos site (situs pengenalan) untuk sistem λ yang akan membentuk struktur
sirkular. DNA λ faga ini bereplikasi melalui suatu mekanisme khusus yaitu rolling
circle yang yang selanjutnya membentuk struktur concatemer (berulang secara
linear) setelah disisipkan DNA asing. Bentuk linear ini merupakan substrat untuk
reaksi packaging secara in‐vitro membentuk partikel. Selanjutnya partikel tersebut
digunakan untuk menginfeksi sel inang, dan bentuk linear cosmid akan
membentuk sirkular kembali pada sisi cos site.

14
 BAB III

PENUTUP

Kesimpulan
strain adalah Kultur murni dari suatu mikroorganisme yang terdiri dari isolate sel yang
sama. Proses mutasi dipengaruhi oleh faktor intrinsic dan ekstrinsik. Faktor ekstrinsik dapat
berupa agen kimiawi, fisik, maupun agen biologis. Sedangkan faktor intrinsik dapat berupa
kesalahan urutan DNA.

Rekayasa genetika adalah upaya pencangkokan gen dengan teknik rekombinan DNA
pada mikroorganisme tertentu. Dengan rekayasa genetika manusia dapat membuat organisme
yang tidak dapat menghasilkan bahan tertentumenjadi mampu menghasilkan bahan tertentu yang
dibutuhkan manusia.

Perkembangan baru dalam bidang rekayasa genetika menghasilkan produkproduk baru

untuk proses industri, terutama dalam bidang kedokteran dan farmasi, seperti produksi hormon,
antibodi, zat antikanker dan sebaginya.

15
 DAFTAR PUSTAKA

Black, Jacquelyn G. 2002. Microbiology. John Wiley & Sons. Inc

Kusnadi, dkk. 2003. Mikrobiologi. Biologi FPMIPA UPI : IMSTEP.

Tortora Gerard J. 1992. Microbiology an Introduction. Fourth Ed. The Benjamin Cummings
Publishing Company, Inc.

S Parekh, Dow AgroSciences. 2009. Strain Improvement. Elsevier Inc. All rights Reserved.

Wibowo, M, S. 2015. Strain Improvement (Pemuliaan Galur) Mikroorganisme Produktif.

https://adoc.tips/pengertian-strain-improvement-tujuan strain-improvement-pros.html.

16