2a. Mikrobiologi Kedokteran Dasar

Mikrobiologi Kedokteran
Dasar
Prof. Dr. Mochammad Hatta, PhD, SpMK (K)

Bagian Mikrobiologi, Fakultas Kedokteran,
Universitas Hasanuddin, Makassar
mochammad hatta@2015
SEJARAH MIKROBIOLOGI
Konsep dasar mikrobiologi untuk memecahkan
masalah :
 Problem awal mula kehidupan (the origin of
life)
 Pembusukan material organik yang mati
(putrefaction of dead materials)

 Perubahan-perubahan yang dapat menular
pada tubuh manusia dan hewan yang hidup

(communicable change in the bodies of live
men and animals).
Prinsip atau dasar penjangkitan
 Invisible Creatures (makhluk tak terlihat) di rekam
oleh Varro pada abad II B.C. (Sebelum Masehi) --
dikenali oleh penulis-penulis bangsa Yunani, bangsa
Romawi dan bangsa Arab. Roger Bacon, di abad XIII –
seribu tahun kemudian mempostulasikan Invisible
Creatures sebagai penyebab penyakit
 Fracastorius (venesia), di tahun 1546, menulis

berdasarkan pengetahuan tentang syphilis bahwa
Communicable Disease (penyakit menular)
ditransmisikan oleh Living germs (benih atau bibit
hidup) seminaria morbid melalui kontak langsung –
dikenal sebagai The germ theory of disease
Observasi Pertama terhadap Bakteri
 Teleskop diciptakan oleh Galileo di tahun
1608, disusul oleh mikroskop di abad yang sama
 Anton van Leeuwenhoek (1632 – 1723) Delf,

Holland.– Penemu mikroskop -- melukiskan/
menguraikan banyak “animalcules” (microscopic
animals) termasuk tiga bentuk utama dari bakteri
(bacillus, coccus, spiral), berbagai kehidupan
bebas dan protozoa parasitik dari feses manusia
dan hewan, jamur, dan menemukan protozoa
Galileo Galilei was a Italian physicist, mathematician, astronomer, and
philosopher who played a major role in the Scientific Revolution. His
achievements include improvements to the telescope and consequent
astronomical observations.
The Father of
Microbiologist
 Microscopic section through one-

year-old ash tree (Fraxinus) wood,
drawing made by Van Leeuwenhoek
Observasi Pertama terhadap Bakteri
 Robert Hooke, 1678 , UK, yang membuat
mikroskop berlensa majemuk, mengkonfirmasikan
penemuan Leeuwenhoek tersebut. kemudian,
mikroba kadang- kadang dipelajari oleh orang-
orang yang terutama tertarik dalam
pengklasifikasian berbagai bentuk kehidupan yang
dapat diobservasi dengan mikroskop.
 Mikroskop-mikroskop yang baik, pada

umumnya baru tersedia di tahun 1800-an sebagai
konsekuensi revolusi industrial yang memungkinkan
kemajuan- kemajuan teknologi yang cepat
Robert Hooke
microscope
Cell structure of cork by Hook
Generation Spontanea (Abiogenesis)
 Kontroversi (perdebatan) mengenai kemampuan
manusia untuk menciptakan kehidupan bersumber
dari mitologi (mythology, ilmu cerita purbakala)
bangsa Yunani.
 Aristotle (384 – 322 BC) berpendapat bahwa hewan
dapat berasal dari tanah
 Samson, dan kemudian Virgil, kira-kira di tahun 40
BC, menguraikan resep untuk membuat lebah dari
madu.
 Selama berabad-abad terdapat kepercayaan bahwa
ulat-ulat dapat dibuat dengan jalan memaparkan
daging ke suasana hanya di dalam udara. Hal
ini tidak mendapat sanggahan untuk sekian lamanya
Aristoteles (bahasa Yunani: ‘Aριστοτέλης Aristotélēs), (
384 SM – 322 SM) adalah seorang filsuf Yunani, murid
dari Plato dan guru dari Alexander yang Agung.Ia
menulis tentang berbagai subyek yang berbeda,
termasuk fisika, metafisika, puisi, logika, retorika,
politik, pemerintahan, etnis, biologi dan zoologi.
Bersama dengan Socrates dan Plato, ia dianggap
menjadi seorang di antara tiga orang filsuf yang paling
berpengaruh di pemikiran Barat
Mahluk hidup bersal dari tanah
Samson dan Virgil (40 SM), mendukung teorinya

dengan memaparkan temuannya membuat lebah
dari madu
Timbul doktrin generasi spontan yang

menyatakan bahwa ulat merupakan
penjelmaan daging
Doktrin ini bertahan hingga

abad ke 17
Penemuan Peran Mikrobia sebagai
Penyebab Penyakit
 Tahun 1813 dibuktikan jamur tertentu dapat
menyebabkan penyakit pada gandum
 Berkeley (1845) penyakit kentang di Irlandia membawa

malapetaka
 1836, Agustino Bassi de Lodi, jamur mempengaruhi

penyakit khusus serangga. Penyakit ulat sutera
disebabkan oleh jamur Beauveria bassiana
 Sconlein memaparkan penyakit kulit manusia akibat

infeksi jamur
Sanggahan teori generatio
spontaneous/abiogenesis
 Frencesca Redi (1626– 1697) membuktikan bahwa gauze
(rem kawat) yang diletakkan di atas sebuah stoples (jar), yang
mengandung daging, mencegah pembentukan ulat- ulat
(maggots) dari daging tersebut
 Redi juga mengamati bahwa lalat, yang tertarik oleh bau daging
melalui rem kawat tersebut, bukan dari daging
 Dengan percobaan Redi ini, maka kepercayaan terhadap

teori/konsep generatio spontances/ abiogenesis tersebut sudah
memudar
 Namun hal ini bangkit kembali ketika mikroba ditemukan dalam

keterkaitannya dengan pembusukan (putrefaction) dan fermentasi
 Francesco Redi (1626 – 1697) was an Italian
physician, naturalist, and poet.
 He was the first scientists to challenge the theory
of spontaneous generation by demonstrating that
maggots come from eggs of flies.
 He was also the first to recognise and correctly
describe details of many important parasites, and
for this reason, as many historians and scientists
claim, he may rightly be called the father of
modern parasitology, and also regarded as the
founder of experimental biology
 John Needham (salah seorang propenent atau penganut teori
generatio spontanea) di tahun 1749, mengamati timbulnya
mikroorganisme pada daging yang membusuk dan
menginterpretasikannya sebagai generatio spontanea atau
abiogenesis
 Spallanzani (salah seorang penantang teori generatio spontanea)

memasak kaldu daging selama 1 jam, menutup mulut kontainer
kaldu daging tersebut, dan mengamati tidak adanya pembentukan
mikroba pada kaldu daging tersebut
 John Needham, dan 100 tahun kemudian, Pouchet (1859)

menyangga hasil percobaan Spallanzani tersebut dengan alasan
udara berlebihan adalah dibutuhkan untuk generatio spontanea
dari makhluk hidup mikroskopik
John Needham
English microscopist who performed
experiments on spontaneous generation in
mutton broth and hay infusions.
To see if organisms came from outside or

were generated in the fluid, he heated
flasks of broth and corked them tightly.
After a short time, he again found
microorganisms.
This result was, however, an indication that

he had not boiled his solutions for long
enough, rather than a proof of spontaneous
generation.
Spallanzani refuted Needham's results in

more careful experiments.
Lazzaro Spallanzani, also an Italian
scientist, reviewed both Redi's and
Needham's data and experimental design
and concluded that perhaps Needham's
heating of the bottle did not kill everything
inside
Spallanzani membuka jalan untuk

penelitian oleh Louis Pasteur, yang
mengalahkan teori generasi spontan
hampir satu abad kemudian.
Sanggahan teori generatio spontaneous/abiogenesis
 Franz Schulze (1815 – 1873) dan Theodor Schwan (1810 – 1882):

dengan menggunakan satu set alat percobaan, Franz melewatkan udara
melalui larutan asam kuat dan kemudian di dalam air kaldu daging
steril (sesudah dimasak selama 1 jam), sedang Theodor melewatkan
udara melalui tube panas dan melihat tak ada pertumbuhan.
 Kalau udara tidak diperlakukan seperti tersebut di atas, maka terjadi

nampak adanya pertumbuhan dalam kaldu daging tersebut.
 Kedua mereka ini berkesimpulan bahwa mikroorganisme berada di

udara dan bukan berasal dari kaldu daging tersebut.
Akan tetapi, proponen (extremist) teori generatio spontanea masih

belum puas, dan mereka yakin bahwa asam kuat dan flaming
tersebut telah merubah udara sehingga menghambat tumbuhnya
mikroorganisme.

Percobaan dari Franz Schulze
(1815 – 1873) dan Theodor
Schwan (1810 – 1882)
Sanggahan teori generatio spontaneous/abiogenesis
 von Dusch & Schroeder (1850) melakukan

percobaan untuk membuktikan bahwa
mikroorganisme terdapat di udara dengan jalan
melewatkan udara melalui saringan kapas dan
kemudian masuk ke dalam kaldu daging yang steril
(telah dimasak sebelumnya).
 Hasil percobaan menunjukkan tidak ada

pertumbuhan dalam kaldu daging tersebut. mereka
berkesimpulan bahwa mikroorganisme berada di
udara dan kapas itu menahannya masuk ke dalam
kaldu daging itu.
Percobaan von Dusch & Schroeder (1850)
 Louis Pasteur sanggup menyaring mikroorganisme
dari udara dan berkesimpulan bahwa inilah sumber konstaminasi. Dia
menggambarkan suatu teknik aseptik, dengan menggunakan panas
(heat), agar dapat mentransfer dan mengerjakan mikrobanya, dan pada
akhirnya,
 Tahun 1859, di dalam perdebatan umum dengan Peuchet, dia memasak

kaldu daging di dalam beberapa flask dengan tube panjang dan sempit
yang berbentuk leher angsa, yang terbuka terhadap udara. Udara dapat
liwat secara bebas tanpa dihalang-halangi, tetapi mikroorganisme
mengendap pada bagian tube yang berbentuk leher angsa, dan tidak ada
pertumbuhan terjadi di dalam flask-flask tersebut.
 Dengan percobaan Pasteur ini berakhirlah sudah

teori generatio spontanea atau abiogenesis.
Percobaan Louis Pasteur
(1822 – 1895) was a French chemist and microbiologist who was one of the most
important founders of medical microbiology.
1. Kontaminant
tertinggal
2. Steril broth
Akhir dari teori generatio
 John Tyndall (1820 – 1893) seorang ahli fisika

bangsa Inggris membuktikan bahwa partikel-
partikel debulah yang membawa bibit/ benih
(germs) tersebut.
 Tyndall juga menemukan bahwa spora bakteri

dapat dibunuh dengan cara pemanasan berturut-
turut dengan interval waktu tertentu, suatu
proses yang sekarang dikenal sebagai
tyndallization.
Percobaan John Tyndall
(1820 – 1893) was a prominent 19th century physicist
and chemistrist.
1. Tabung pengenalan debu

2. Tabung melingkar
terbuka ke udara
3. Cahaya untuk mengamati
debu
4. Broth steril
Teori Bibit Penyakit
(The Germ Theory of Disease)
a. Observasi empiris
 Dasar yang kuat bagi sifat kausal daripada
penyakit infeksius baru bisa ditentukan pada

akhir pertengahan abad XIX. Salah satu dari
bukti-bukti pertama datang dari Agostino
Bassi, yang di awal tahun 1800-an,
membuktikan bahwa suatu fungus atau jamur
(yang kemudian dinamai Batrytis bassiana)
menyebabkan penyakit ulat sutra (silkworm)
yang disebut “muserdine” di Prancis dan “mal
segno” di Italia
Agostino Bassi, sometimes
called de Lodi (1773 -1856,
in Lodi), was an Italian
entomologist.
He preceded Louis Pasteur

in the discovery that
microorganisms can be the
cause of disease (the
germ theory of disease)
“Father of Insect Pathology”,
founder silk worm disease
 Di tahun 1840-an, Oliver Wendell Holmes (dokter penyakit
bangsa Amerika) menulis tentang “The Contagiousness of
Puerpural Fever”, dimana dia menyarankan bahwa penyakit itu
disebabkan oleh benih atau bibit (germs) yang di bawah dari
suatu ibu yang baru ke ibu yang lain
 Di tahun 1861, Ignaz Senmelweis, yang secara drastis

menurunkan jumlah kematian persalinan dengan teknik-teknik
dan praktek antiseptik, mempublikasikan tulisan yang sangat
penting, yaitu “The Cause, Concept and Prophylaxis of Childbed
Fever”. Akan tetapi, pentingnya antiseptika dalam mengurangi
penyakit menular belum disadari benar hingga akhir tahun
1870-an, ketikan Joseph Lister mendemonstrasikan nilai
penyemprotan kamar-kamar operasi dengan larutan fenol
b. Pelajaran Yang Didapat dari Fermentasi
 Pengungkapan lebih lanjut terhadap aktivitas mikroba adalah melalui
pekerjaan/kegiatan Louis Pasteur dari tahun 1850-an sampai 1880-an. Di

dalam studi mengenai penyakit anggur, Pasteur mendemonstrasikan
bahwa fermentasi alkoholik daripada anggur, buah-buahan dan biji-bijian
adalah disebabkan oleh mikroba, yang kemudian disebut “ferment”.
 Dalam kelompok atau partai anggur yang baik maka jenis-jenis “ferment”
yang jelek dari perahan air buah segar dengan jalan memanaskan pada
suhu 63°C 1 ½ jam, kemudian didinginkan dan diinokluasi kembali
dengan biakan dari yang baik.
 Kesuksesan Pasteur dalam mengatasi problem industri anggur

menyebabkan pemerintah Prancis. Pasteur menggeluti problem ini selama
beberapa tahun sebelum dua dapat mengisolasi organisme kausatif dan
menunjukkan bahwa para petani dapat mengeliminasi/mengatasi
problem ini dengan jalan menggunakan breeding stock yang sehat dan
tidak terinfeksi.
c. Observasi dan Eksperimen Dengan Hewan
Percobaan
 Di tahun 1850, Rayer dan Davaine mengamati mikroorganisme
yang berbentuk batang (bacillus) pada daerah hewan-hewan yang
mati karena penyakit anthrax. Rayer mengulangi kembali
eksperimen-eksperimen di tahun 1825 oleh Barthelemy yang telah
menunjukkan bahwa anthrax dapat ditransmisikan dengan inokulasi
berseri pada domba-domba,
 Pada tahun 1863 Davaine mentransmisikan hasil-hasil anthrax

tetapi penyakit anthrax tidak terjadi dengan darah normal.
 Di tahun 1872, Obermeir menemukan hubungan spirillum dengan

relapsing fever dan mendemonstrasikan untuk pertama kalinya
adanya mikroorganisme patogenik di dalam darah manusia.
d. Teknik Biakan Murni
 Teknik kultur yang pertama dikembangkan oleh Joseph Lister di tahun 1878. Lister
menggunakan semprit untuk membuat pengenceran-pengenceran serial di dalam

medium cair guna memperoleh kultur-kultur murni daripada tipe organisme yang
simpel yang dia namakan Bacterium (Lactobacillus) Lactis. Sementara itu,
 Koch, seorang mahasiswa dari Henle yang berpegang teguh pada pembuktian bahwa
organisme menyebabkan penyakit, juga mengembangkan dan menyempurnakan teknik-
teknik untuk pengasingan kultur murni. Dari hasil pekerjaan orang-orang lain,
teristimewa Ehrlich, Koch menggunakan substansi cair yang steril dari mata hewan-
hewan sebagai medium pertumbuhan. Karena medium ini banyak kendalanya, maka
Koch beralih di pengembangan medium ini banyak kendalanya, maka Koch beralih ke
pengembangan medium pertumbuhan yang padat yang transparan, dengan jalan
mencampurkan gelatin dengan larutan Pepton Loffler. Campuran gelatin tersebut
mencair pada pemanasan, dapat disterilisasi panas dan tuang ke dalam plate (misalnya
lempeng petri), dan terhadap pendinginan, medium memadat (menjadi padat).
 Mikroorganisme yang ditanam pada permukaannya bertumbuh menjadi koloni- koloni

makroskopik dimana mereka itu dideposit sebagai hasil pertumbuhan dari sel tunggal
yang tak terlihat (single invisible cell) karena medium gelatin ini mencair relatif pada
suhu rendah (26°C), maka Koch kemudian beralih ke agar yang memadat pada suhu di
bawah 43°C
Koch’s postulate (Pustulat Koch) yang terdiri
dari empat kriteria
1. Organisme harus selalu ditemukan di tubuh hewan
yang sakit tetapi tidak di dalam tubuh hewan yang
sehat.
2. Organisme tersebut harus dapat diisolasi dari hewan

yang sakit itu dan ditumbuhkan dalam biakan murni.
3. Organisme yang diasingkan dalam biakan murni itu

harus bisa menimbulkan penyakit bila diinokulasi
kan kembali ke dalam hewan- hewan yang
susceptible.
4. Organisme tersebut hendaknya bisa diisolasi lagi dari

hewan-hewan yang dinfeksi secara eksperimental.
Postulat Koch itu memberikan dorongan dan
jalan untuk pembuktian The germ theory of
disease.
Periode 20 tahun sesudah upaya Koch (Germany) tersebut adalah merupakan tahun
Golden Age of Bacteriology (masa/periode emas) dari bakteriologi. Sampai pada
tahun 1900 hampir semua organisme- organisme dari penyakit bacterial yang
penting telah diuraikan, termasuk anthrax ( Bacillus anthracis), diphtheria
(Corynebacterium diphtheriae), typhoid fever (Salmonella typhi), gonorrhea
(Neisseria gonorrhoeae), gasgangrene (Clostridium perfringens), tetanus atau
lockjaw (Clostridium tetani), dysentery (Shigella dysenteriae), syphilis (Treponema
pallidum), dan lain-lain mochammad hatta@2015
STRUKTUR DAN
MORFOLOGI BAKTERI
Struktur Bakteri
FLAGELLA
FIMBRIAE
CAPSULE
CELL WALL
PLASMA
MEMBRANE
CYTOPLASMA
NUCLEAR BODY
CONTAINING DNA
NUCLEAR BODIES
• STAINING AND UNSTAINING - SAME BY USUAL METHODS
• REACT POSITIVE TO “FEULGEN TEST” FOR DNA
• GENETIC FUNCTIONS -- GENE EXPRESSIONS
CYTOPLASMA
• NUMEROUS SMALL GRANULES CALLED “RIBOSOMES’
• DIAMETER OF RIBOSOMES IS 10 - 30 uM
• SOME BACTERIA CONTAINING INCLUSION GRANULES
• CELL METABOLISM FUNCTIONS ---- NUTRIENT RESERVE ----
UNDER CONDITIONS OF ENERGY-SOURCE STARVATION
• VOLUTIN GRANULES (SYN. METACHROMATIC OR BABES
ERNEST GRANULES) -- CORYNEBACTERIUM DIPHTERIAE
• SPECIAL METHODS FOR STAINING -- “NEISSER” STAINING
CYTOPLASMIC MEMBRANE
• CONSIST MAINLY LIPO-PROTEIN --- 5- 10 uM THICK
• EXAMINED BY ELECTRON MICROSCOPE -ULTRATHIN
SECTION
• CONTAIN RESPIRATORY ENZYMES & PIGMENTS
(CYTOCHROME SYSTEM)
• ENZYME OF TRICARBOCYLIC CYCLE & POLYMERASE ENZYME
CELL WALL
• 10 - 25 uM THICK --- 1 um DIAMETER --- < 10.000 MOLECULAR
WEIGHT
• LYSIS BACTERIA --- LETHAL DISINTEGRATION & DISSOLUTION
• PLAYS AN IMPORTANT PART IN BACTERIAL DIVISION
• BASAL COMPONENTS ; MUCOPEPTIDE, TEICHOIC ACID, LPS
(ENDOTOXIN)
CAPSULES
• SOLID MATERIAL : POLYSACCHARIDE, POLYPEPTIDE, PROTEIN
• DEMONTRATION BY “NEGATIVE STAINING” --- INDIA INK
• ENTEROBACTERIACEAE : CAPSULAR ANTIGEN (K ANTIGEN)
• FUNCTION : PROTECTIVE AGAINST BACTERIOPHAGES, COLICINES,
LYSOZYME, LYTIC ENZYMES
FLAGELLA
• ACT AS ORGAN LOCOMOTION (MOTILITY)
• 0.02 uM THICK --- 1- 20 FLAGELLA/ BACTERIA -- PERITRICHOUS,
LATERAL, POLAR
• FLAGELLINE ANTIGEN (SALMONELLA TYPHI) -- Vi ANTIGEN
FIMBRIAE
• CERTAIN GRAM NEGATIIVE BACILLI --- ENTEROBCTERIACEAE
• FUNCTION AS ORGANS OF ADHESION
Schematic Representation of Bacterial Cell Walls
GROWTH OF BACTERIA
STATIONER PHASE
TOTAL BACTERIA
LOG OF COUNT
DECLINE PHASE
LOG PHASE VIABLE BACTERIA
LAG PHASE
TIME
BIOLOGICAL CLASSIFICATION
• CLASS SCHIZOMYCETES :
1. ORDER PSEUDOMONADALES : FAMILY PSEUDOMONADACEAE
--- GENERA PSEUDOMONAS -- SPECIES P.AERUGINOSA
2. ORDER EUBACTERIALES : FAMILY ENTEROBACTERIACEAE

--- GENERA SALMONELLA -- SPECIES S. TYPHII
3. ORDER ACTINOMYCETALES : FAMILY MYCOBACTERIACEAE

--- GENERA MYCOBACTERIUM -- SPECIES M. TUBERCULOSIS
4. ORDER SPIROCHAETALES : FAMILY SPIROCHAETES

--- GENERA LEPTOSPIRA --- SPECIES L. ICTEROHAEMORRHAGIAE
5. ORDER MYCOPLASMATALES : FAMILY MYCOPLASMATALES

--- GENERA MYCOPLASMA --- SPECIES M. MYCOIDES
• CLASS MICROTATOBIOTES
1. ORDER RICKETTSIALES : FAMILY RICKETTSIALES
--- GENERA RICKETTSIA -- SPECIES R. PROWAZEKII
2. ORDER VIRALES
BACTERIAL NUTRITION
n THE CARBON SOURCE FOR GROWTH
-- CHEMO-SYNTHETIC AUTOTROPS OR PHOTOSYNTHETIC
AUTOTROPS
n THE NITROGEN SOURCE OF GROWTH
-- AMINO ACIDS AND NUCLEOTIDES
n THE REQUIREMENTS FOR GROWTH FACTORS

-- THIAMINE, RIBOFLAVIN, NICOTINIC ACID, PYRIDOXINE,
FOLIC ACID, BIOTIN, ETC
) INORGANIC SALTS FOR GROWTH

-- POTASSIUM, MAGNESIUM, SODIUM, IRON AND CALCIUM
NUTRITIONAL EVOLUTION
• ESCHERICHIA COLI CAN GROW ON A ‘ SIMPLE SYNTHETIC
MEDIUM’ WHICH CONTAINS ONLY GLUCOSE ( CARBON AND

ENERGY SOURCE ), AMMONIUM SULPHATE ( NITROGEN AND
SULPHUR SOURCE ) PHOSPHATE BUFFER, POTASSIUM CHLORIDE,
MAGNESIUM CHLORIDE AND TRACES OF OTHER INORGANIC
SALTS.
THE PHYSICAL CONDITIONS REQUIRED FOR GROWTH

• THE INFLUENCE OF OXYGEN AND REDOX POTENTIAL
THE MAJORITY OF BACTERIA ARE DESCRIBED AS
FACULTATIVE ANAEROBS.
• THE INFLUENCE OF CARBON DIOXIDE
SOME BACTERIA, HOWEVER, REQUIRED A MUCH HIGGER

CONCENTRATION OF CARBON DIOXIDE ( 5 - 10 % ).
• THE INFLUENCE OF TEMPERATURE

1. ON GROWTH --- THESE, AND MANY SAPROPHYTES OF SOIL
AND WATER , WHICH GROW BEST AT BETWEEN 25 o AND 40 o
CELCIUS.
2. ON VIABILITY --- THE THERMAL DEATH POINT OF A
PARTICULAR ORGANISM MAY BE DEFINED AS THE
LOWEST TEMPERATURE THAT KILL IT UNDER
STANDARD CONDITIONS, WITHIN A GIVEN TIME,
e.g. TEN MINUTES.
( e.g. ABOUT 105 o C . FOR CL. TETANI AND 115 o C. FOR CL.
BOTULINUM )
Effect Neurotoxin of
clostrodium tetani
THE INFLUENCE OF MOISTURE AND OF DESICCATION
FOUR-FIFTHS BY WEIGHT OF THE BACTERIAL CELL CONSISTS
OF WATER AND AS, IN THE CASE OF OTHER ORGANISM,
MOSITURE IS ABSOLUTELY NECESSARY FOR GROWTH
THE INFLUENCE OF HIDROGEN -ION CONCENTRATION

THE MAJORITY OF COMMENSAL AND PATHOGENIC BACTERIA
GROW BEST AT A NEUTRAL OR VERY SLIGHTLY ALKALINE
REACTION ( PH 7.2 TO 7.6 )
THE INFLUENCE OF LIGHT AND OTHER RADIATIONS
ULTRA VIOLET RAYS RAPIDLY BACTERICIDAL, e.g. DIRECT
SUNLIGHT OR RADIATION FROM A MERCURY VAPOUR LAMP
THE INFLUENCE OF OSMOTIC PRESSURE

FOR MOST SPECIES THE UPPER LIMIT OF SODIUM CHLORIDE
CONCENTRATION PERMITTING GROWTH LIES BETWEEN 5 - 15 %,
HALOPHILIC (OSMOPHILIC)
METABOLIC FUNCTIONS OF THE VITAMIN B GROUP
B VITAMIN ORGANISM REQUIRING
• THIAMINE STAPH. AUREUS

• NICOTINIC ACID L. ARABINOSUS
• RIBOFLAVIN L. CASEI
• PYRIDOXAL CL. WELCHII
• PANTHOTHENIC ACID BRUCELLA ABORTUS
• P AMINOBENZOIC ACID CL. ACETOBULYTICUM
• FOLIC ACID CL. TETANI
• BIOTIN CL. TETANI
• VITAMIN B 12 L. LACTIS
1. Fermentasi asam homolaktat (beberapa streptococcus dan
lactobacillus
NADH NAD
asam piruvat asam laktat
2. Fermentasi beralkohol (khamir)
NADH NAD
Asam piruvat asetildehide etil alkohol
CO2
3. Fermentasi asam campuran (E.coli dan beberapa bakteri saluran
pencernaan yang lain
NADH NAD
Asam piruvat Asam laktat
CO2
Asetil oksalat Asetil-CoA + Asam format
NADH NADH
NAD NAD
Asam suksinat Etil alkohol Asam asetat H2 +
CO2 mochammad hatta@2015
4. Fermentasi glikol-butelin (Enterobacter, Bacillus,
Pseudomonas) Fermentasi ini menghasilkan sejumlah kecil
produk akhir yang sama dengan fermentasi campuran asam,
tetapi sebagai tambahan, sebagian besar asam piruvat diubah
menjadi 2,3-glikol butilen seperti terlihat di bawah.
2CH2COCOOH CH2COHCOOH + CO2

Asam piruvat C O
CH3
Asam asetolaktat
NAD NADH CO2

CH3CHOHCHOHCH3 CH3CHOHCOCH3
2,3-Glikol butilen Asetoin
5. Fermentasi asam propionat (Propionibacterium dan
Veillonella
3-Asam piruvat Asam asetat +CO2
2-Asam oksaloasetat
2CO2
(terikat enzim) 2- Asam suksinat
2-Propionil-CoA CoA
2-Asam propionat 2-
Suksinil-CoA
2- Metil malonil-CoA
6. Asam butirat, butanol, fermentasi aseton
(Clostridium) 4CO2
4-Asam piruvat 4-Asetil-CoA Asam
asetat
NADH
CO2
NAD
Aseton 2-Asetoasetil-CoA Etil
alkohol
NADH
NAD
Isopropil alkohol 2-Krotonil-CoA
NADH
NAD
2-Butiril-CoA
NADH
Klasifikasi berdasarkan energi dan sumber karbon
SUMBER
KELOMPOK SUMBER ENERGI
KARBON
Oksidasi senyawa
Kemoheterotrof Organik
organik
Oksidasi senyawa
anorganik :
Kemoautotrof seperti Amoniak, CO2
sulfida dan seyawa
besi
Fotoheterotrof Cahaya Organik
Fotoautotrof Cahaya CO2
Transport elektron dan fosforilasi oksidatif
berdasarkan model kemiosmosis Mitchell.
Membran bakteri NADH +
H +
NADH dehidrogenase
H
H + Flavop S t+ein
FerH
o
CoQ e
H +
CoQ-H
Sit CoQ-H H+
.b
H +
CoQ-H2 H+
FeS
sit c O2 + H+
e
sit a a3
H2O
ADP ATPase
Saluran protein
2H+ +
Pi ATP
Fotosintesis tumbuhan hijau
NADP
Freedoksin
NADPH
Sitokrom b
ADP e-
ATP
Sitokrom f e- Sitokrom e- Quinom
ADP H2O 2e - +
H+ +1/2Oe2
ATP
Cahaya Klorofil Cahaya Klorofil
Fotosistem I
Fotosistem II
Pembentukan ATP dan NADH ole Nitrosomonas
yang autotrof
2NH4+ + 3O2 2NO2 - + 2H2O + 4H+ + 4e-

ATP ADP ATP ADP
2e + Cyt a1 Cit C Cit b
Flavoprotein
ATP
Cyt a3
NADP + H+
ADP
ADP
ATP
H2O
NADPH
Jalur Embden-Meyerhof untuk disimilasi glukosa
Glukosa (enam karbon)
ATP
ADP
Glukosa 6-fosfat
Fruktosa 6-fosfat
ATP
ADP
Fruktosa 1,6-difosfat
Dihidroksiaseton Gliserildehide 3-fosfat (tiga karbon)
fosfat 2NAD
penerima H terkahir 2NADH
(2) 1,3-Asam difosfogliserin
2 ADP
2 ATP
(2) 3-Asam fosfogliserin
(2) 2-Asam fosfogliserin

H2O
(2) Asam fosfoenolpiruvat
2 ADP
2 ATP
(2) Asam piruvat
Produk akhir
Ikatan Peptida mengkaitkan asam amino menjadi satu untuk
membentuk protein besar
CH3CHCOOH + CH2 CH COOH
NH2 OH NH2
Alanin serin
CH3CHCOOH + H2O
NH
ikatan peptida
C O
CH NH2
CH2OH
Dipeptida
alanin dan serin
CH2 OOC4H7
lipase
CH OOC4H7 + 3H2O
CH2 OOC4H7
tributrin
CH2OH
CHOH + 3CH3(CH2) 2COOH
CH2OH asam butirat
Gliserol yang dibebeskan kemudian dapat dimetabolisme

melalui jalur Embden- Meyerhof, dan asam lemaknya dapat
diuraiakan memlaui asetat pada daur asam citrat.
Thiobacillus (oksidasi belerang)
2S + 3O2 + 2H2O 2H2SO4
Nitrosomonas (oksidasi amoniak)

2NH4Cl + 3O2 2HNO2 + 2HCl + 2H2O
Nitrobacter (oksidasi nitrit)

2NaNO3 + O2 2NaNO3
Berbagai marga (oksidasi hidrogen)

2H2 + O2 2H2O
Siderocapsa (oksidasi senyawa-senyawa besi)

4FeCO3 + O2 + 6H2O 4Fe(OH) 3 + 4CO2
Daur asam sitrat
CH3 CoA CH3
Metabolisme karbohisrat C O C O + CO2
CH3 S CoA
Asam piruvat Asetil CoA
COOH COOH
COOH CH2 CH2
C O HO C COOH C COOH
CH2 CH2 CH
COOH COOH COOH
Asam oksaloasetat Asam sitrat Asam cis-akonitat
NADH + H 2O
NAD
COOH COOH
HCOH CH2
CH2 HC COOH
COOH HOCH
COOH
Asam malat Asam isositrat
Asam Malat Asam isositrat
NAD
CO2
NADH
ADP ATP
COOH
COOH COOH COOH
FADH2 FAD GTP GDP CoA CH 2
CH CH2 CH2
CH2
CH CH2 CH2 CO2
CoA NADH NAD C 0
COOH COOH CO SCoA
COOH
Asam
keto- fumarat Asam suksinat Suksinil-CoA Asam -
glutamat
MICROBIAL VIRULENCE
• LOSS OF VIRULENCE : WHEN KEPT IN ARTIFICIAL MEDIUM
--- MEASUREMENT OF VIRULENCE CONSISTS OF TESTING FOR
ABILITY TO INFECT, WITH OBSERVABLE CONSEQUENCES,
“NORMAL” ANIMALS SUCH AS A STANDARD STRAIN MICE
• THE ED50 : THE POINT ON DOSE SCALE AT WHICH THIS LINE

INTERSECT THE 50 PERCENT POINT IN THE CUMULATIVE EFFECT
IN HALF THE ANIMALS INOCULATED WITH BACTERIA.
• TEST VIRULENCE : TO KNOW TOXIN EFFECT FROM INFECTION

OF CORYBACTERIUM DIPTHERIAE
Tes virulensi
 Untuk mengetahui strain toxigenik
(menghasilkan toksin) dan non-toxigenik
(tidak menghasilkan toksin).
 Tes ELEK (invitro) :
- Kertas saring direndam antitoksin dalam

agar --- Diatas ditanam basil difteri –
inkubasi 24 jam.
- Hasil : (+) hasilkan toksin : tampak garis
presipitasi.
(-) tidak hasilkan toksin : tidak
ada garis presipitasi.
• Tes in-vivo
4 hari
Tetap hidup
250 ug antitoksin
(s.c.)
2 jam Basil difteri pasien (s.c.)
Marmot Mati
4 hari
Kesimpulan :
Basil difteri penderita mengandung toksin
• Tissue culture (Biakan jaringan)
Biakan
Lihat dibawah mikroskop
18 jam
* jaringan mati :
Jaringan dalam medium basil menghasilkan
RPMI 1640 + HBSS + PBS toksin
( Complete medium) * jaringan hidup :
Basil tidak menghasil
kan toksin
Masukkan basil difteri
pasien
Gram positive (blue) and Gram negative (red) cocci
Staphylococcus
epidermidis
(novobiocin
susceptible,
upper)
Staphylococcus
saprophyticus
(novobiocin
resistant, lower)
Staphylococcus
aureus culture on
blood agar
Streptococcus
pyogenes (group A)
shows β-hemolysis
on blood agar
(upper left)
Streptococcus
pneumoniae shows
α-hemolysis (right)
Enterococcus not
produce hemolysin
(lower left)
Enteric bacteria
on MacConkey
agar
Lactose-positive
bacteria show
pink colonies
(upper left)
Lactose-negative
bacteria have
colorless
colonies (lower
right)
Biochemical reactions for identification of a fresh
enteric bacterial isolate by the API 20E procedure
Black
colonies of
Salmonella
after growth
on bismuth
sulfite agar
Clostridium
perfringens
Shows double
zones of
hemolysis
surrounding
colonies after
incubation
anaerobically on
blood agar
Respiratory syncytial infection of cells in nasopharyngeal aspirate
is revealed by immunoflourescence
Powassan virus antigen surrounding infected cells of mouse brain is revealed by immunoperoxidase staining
Contagious Pustular
Dermatitis (ORF)
a. ORF lesion on
forefinger
b. Electron micrograph
of ORF virion
Microsporum
canis colony on
Sabouraud’s
agar
Microsporum canis macroconidia (spore)
Dermatophyte hyphae in KOH preparation of skin
scraping
Microsporium gypseum macroconidia (spore)
Histoplasma
capsulatum
macroconidia
Trichopyton rubrum colony on Sabouraud’s agar
Coccidioides immitis. Arthrospores after culture
Coccidioidomycosis. Lung section shows sporangiospore
Aspergillus fumigatus colony on Sabouraud’s agar
Cryptococcus neoformans. Budding yeast surrounded by the large
mucoid capsule is demonstrated by negative staining with nigrosin
Aspergillus fumigatus conidiosphores
Ziehl Neelsen staining from sputa
before decontamination
Ziehl Neelsen staining from sputa after
decontamination

2a. Mikrobiologi Kedokteran Dasar

Diunggah oleh

Informasi Dokumen

Hak Cipta

Format Tersedia

Bagikan dokumen Ini

Bagikan atau Tanam Dokumen

Opsi Berbagi

Apakah menurut Anda dokumen ini bermanfaat?

Apakah konten ini tidak pantas?

Hak Cipta:

Format Tersedia

2a. Mikrobiologi Kedokteran Dasar

Diunggah oleh

Hak Cipta:

Format Tersedia

Mikrobiologi Kedokteran

Prof. Dr. Mochammad Hatta, PhD, SpMK (K)

(putrefaction of dead materials)

pada tubuh manusia dan hewan yang hidup

 Fracastorius (venesia), di tahun 1546, menulis

 Anton van Leeuwenhoek (1632 – 1723) Delf,

 Microscopic section through one-

 Mikroskop-mikroskop yang baik, pada

Cell structure of cork by Hook

Samson dan Virgil (40 SM), mendukung teorinya

Timbul doktrin generasi spontan yang

Doktrin ini bertahan hingga

 Berkeley (1845) penyakit kentang di Irlandia membawa

 1836, Agustino Bassi de Lodi, jamur mempengaruhi

 Sconlein memaparkan penyakit kulit manusia akibat

 Dengan percobaan Redi ini, maka kepercayaan terhadap

 Namun hal ini bangkit kembali ketika mikroba ditemukan dalam

 Spallanzani (salah seorang penantang teori generatio spontanea)

 John Needham, dan 100 tahun kemudian, Pouchet (1859)

To see if organisms came from outside or

This result was, however, an indication that

Spallanzani refuted Needham's results in

Spallanzani membuka jalan untuk

 Franz Schulze (1815 – 1873) dan Theodor Schwan (1810 – 1882):

 Kalau udara tidak diperlakukan seperti tersebut di atas, maka terjadi

 Kedua mereka ini berkesimpulan bahwa mikroorganisme berada di

Akan tetapi, proponen (extremist) teori generatio spontanea masih

 von Dusch & Schroeder (1850) melakukan

 Hasil percobaan menunjukkan tidak ada

 Tahun 1859, di dalam perdebatan umum dengan Peuchet, dia memasak

 Dengan percobaan Pasteur ini berakhirlah sudah

 John Tyndall (1820 – 1893) seorang ahli fisika

 Tyndall juga menemukan bahwa spora bakteri

1. Tabung pengenalan debu

penyakit infeksius baru bisa ditentukan pada

He preceded Louis Pasteur

 Di tahun 1861, Ignaz Senmelweis, yang secara drastis

pekerjaan/kegiatan Louis Pasteur dari tahun 1850-an sampai 1880-an. Di

 Kesuksesan Pasteur dalam mengatasi problem industri anggur

 Pada tahun 1863 Davaine mentransmisikan hasil-hasil anthrax

 Di tahun 1872, Obermeir menemukan hubungan spirillum dengan

menggunakan semprit untuk membuat pengenceran-pengenceran serial di dalam

 Mikroorganisme yang ditanam pada permukaannya bertumbuh menjadi koloni- koloni

2. Organisme tersebut harus dapat diisolasi dari hewan

3. Organisme yang diasingkan dalam biakan murni itu

4. Organisme tersebut hendaknya bisa diisolasi lagi dari

LOG PHASE VIABLE BACTERIA

2. ORDER EUBACTERIALES : FAMILY ENTEROBACTERIACEAE

3. ORDER ACTINOMYCETALES : FAMILY MYCOBACTERIACEAE

4. ORDER SPIROCHAETALES : FAMILY SPIROCHAETES

5. ORDER MYCOPLASMATALES : FAMILY MYCOPLASMATALES

n THE REQUIREMENTS FOR GROWTH FACTORS

) INORGANIC SALTS FOR GROWTH

• ESCHERICHIA COLI CAN GROW ON A ‘ SIMPLE SYNTHETIC

MEDIUM’ WHICH CONTAINS ONLY GLUCOSE ( CARBON AND

THE PHYSICAL CONDITIONS REQUIRED FOR GROWTH

SOME BACTERIA, HOWEVER, REQUIRED A MUCH HIGGER

• THE INFLUENCE OF TEMPERATURE

THE INFLUENCE OF HIDROGEN -ION CONCENTRATION

THE INFLUENCE OF OSMOTIC PRESSURE

B VITAMIN ORGANISM REQUIRING

• THIAMINE STAPH. AUREUS

2CH2COCOOH CH2COHCOOH + CO2

NAD NADH CO2