Diagnosis Rabies dari Sampel yang Membusuk Penulis Tessy D.L., Arun G., Julie B., Sabore P.I , Rayne J., Sunanda C. dan Prejit N. Kata Kunci Rabies, Teknik Antibodi Fluoresen, Pembusukan, Diagnosis. Tahun 2018 Volume dan Halaman Volume 06 dan Halaman 01-04 Tanggal 14 September 2018 Abstrak Seringkali, sampel untuk diagnosis rabies akan dikirimkan ke laboratorium setelah berbagai tingkat pembusukan. Batasan dalam hal logistik dan transportasi, jarak dan akses ke laboratorium adalah hal biasa dalam alasan keterlambatan pengiriman sampel. Tes positif dianggap sebagai infeksi rabies yang sebenarnya, tetapi hasil tes negatif tidak dianggap dapat diandalkan. Penelitian ini dirancang dengan tujuan untuk mempelajari stabilitas antigen virus rabies dalam penguraian sampel otak anjing untuk diagnosis berdasarkan FAT. Saat sampel otak positif rabies yang terjadi pembusukan selama penyimpanan di laboratorium pada suhu kamar menjadi sasaran FAT, tujuh dari delapan sampel positif diuji memberikan hasil positif pada hari ke-8. Pada hari ke-16, antigen virus rabies hanya dapat dideteksi dalam enam sampel. Semua enam sampel negatif pada FAT. Pada hari ke-40 terjadi pembusukan. FAT bisa menjadi alat yang andal, saat bangkai dikirim segar atau pada tahap awal pembusukan. Pembusukan hingga satu minggu tidak akan mempengaruhi hasil tes ketika sampel otak dikenai FAT untuk diagnosis rabies. Tujuan Penelitian Tujuan penelitian ini adalah untuk mempelajari stabilitas antigen virus rabies dalam penguraian sampel otak anjing untuk diagnosis berdasarkan FAT. Population Sample/Problem Studi evaluasi FAT untuk diagnosis rabies dari sampel otak yang membusuk dilakukan selama bulan Juli 2015 hingga November 2015. Bangkai anjing yang diterima di Institut Negara untuk Penyakit Hewan di Palode di Thiruvananthapuram distrik untuk diagnosis post-mortem digunakan untuk penelitian ini. Sampel otak yang dinyatakan positif virus rabies digunakan untuk studi eksperimental ini. Delapan sampel anjing segar dibawa ke laboratorium dan dinyatakan positif rabies pada FAT dipilih untuk penelitian ini. Satu sampel negatif juga dimasukkan sebagai kontrol negatif. Porsi otak besar dikumpulkan dari sampel dan disimpan pada suhu kamar yang berada dalam kisaran 25 °C hingga 32 °C. Sampel diuji oleh FAT pada hari ke-0 (hari presentasi di laboratorium), kemudian pada hari ke-4. Teknik Antibodi Fluoresen dulu dilakukan dengan konjugat anti-nukleokapsid rabies diproduksi oleh BIORAD, Prancis dan hasilnya adalah dinilai berdasarkan skor evaluasi standar yang digunakan sebelumnya (Tepsumethanon et al., 1997). Hasilnya menjadi sasaran analisis dengan prosedur statistic standar. Metode Penelitian Menggunakan metode eksperimen Pendahuluan Rabies adalah penyakit mengerikan yang menyerang zoonosis manusia dan hewan yang disebabkan oleh virus RNA. Diagnosa penyakit ini sangat relevan untuk mengadopsi penting tindakan pencegahan untuk bertahan hidup dalam kehidupan kontak terkena infeksi. Virus Rabies seharusnya sangat tidak stabil dan pengiriman sampel segar ke laboratorium dianggap penting untuk diagnosis yang tepat. Tetapi antigen virus dapat dideteksi dalam pembusukan bangkai terinfeksi yang disimpan dalam rantai dingin. Tes standar emas untuk diagnosis rabies adalah Fluorescent Antibody Test (FAT) (Meslin et al., 1996; OIE manual, 2012). Oleh karena itu, dalam penelitian ini, keandalan FAT untuk diagnosis rabies dari sampel yang telah mengalami beberapa derajat pembusukan dievaluasi. India sangat endemik untuk rabies dan kesehatan masyarakat serta signifikansi ekonomi penyakit tersebut sangat relevan (Alakes et al., 2014; Sajna dan Roshni, 2014). Penting untuk menyerahkan bangkai yang dicurigai di bawah 'rantai dingin' ke laboratorium diagnostik untuk mendapatkan diagnosis yang andal. Namun, hal ini tidak selalu memungkinkan karena kendala logistik dan transportasi. Jadi, bangkai dapat diterima di laboratorium diagnostik dalam berbagai tahap pembusukan. Padahal seharusnya virus rabies menjadi sangat tidak stabil, antigen virus dapat dideteksi pada bangkai yang terinfeksi disimpan dalam rantai dingin. Namun, ada variasi yang signifikan dalam temuan para sarjana yang berbeda sehubungan dengan durasi penelitian dan hewan yang digunakan untuk penelitian juga berbeda (Beltrán et al., 2014; Rojas et al., 2006; Lewis dan Thacker, 1974) . Hasil Penelitian Studi tersebut mempresentasikan bahwa, delapan sampel yang menjalani uji antibodi fluoresen, pertama atau hari ke-0, tujuh sampel positif dengan skor evaluasi 3+ dan sampel sisanya memberikan skor 2+. Pada hari ke-4, semua sampel tetap positif kecuali pada sampel 2. Pada hari ke-8, derajat kepositifan tetap sama pada 2 sampel dan menurun 1 skor pada 5 sampel. Satu sampel yang pada awalnya memberikan skor 2+ memberikan hasil negatif. Pada hari ke 12, skor tetap sama seperti pada hari ke-8 dalam tiga sampel dan menurun satu skor di semua 4 sampel positif lainnya. Sampel yang memberikan hasil negatif pada hari ke-8 juga diuji ulang dan ditemukan negatif. Pada hari ke-16, skor tetap sama seperti pada hari ke-12 dalam 3 sampel, menurun 1 skor pada 2 sampel dan satu sampel memberikan hasil negatif. Menariknya, skor tersebut meningkat 2 dalam satu sampel. Tes tidak dapat diulang karena jaringan yang tersedia tidak mencukupi pada beberapa sampel. Namun, pada pengulangan tes dengan jaringan yang tersedia pada sampel lain, hasil positif dapat diperoleh dalam satu sampel bahkan pada hari ke-32. Persentase positif tetap 100% hingga hari ke-4, menurun menjadi 87,5% dalam hari ke-12 dan hari ke-16 itu diturunkan menjadi 75%. Satu sampel kontrol negatif, yang dimasukkan dalam penelitian, tetap negatif selama periode penelitian. Jadi, dalam semua delapan kasus, ada penurunan umum dalam hal positif hasil tes yang ditunjukkan dengan penurunan bertahap dalam nilai evaluasi dari hasil tes sebelumnya. Namun, terdapat beberapa pengecualian dimana skor tes memberikan peningkatan positif dibandingkan hasil tes sebelumnya. Teknik Antibodi Fluoresen mendeteksi keenam kasus rabies dengan akurasi persen pada hari ke-0 dan pada hari ke-4. Setelah itu pengujian dilakukan pada hari ke-8 pasca- pembusukan di mana salah satu sampel otak berubah menjadi negatif. Kesimpulan Kesimpulan dalam penelitian ini adalah bahwa antigen nukleokapsid virus rabies relatif stabil dalam sampel otak yang membusuk untuk didiagnosis dengan FAT. Temuan penelitian menunjukkan bahwa, FAT dapat digunakan sebagai tes standar emas ketika sampel otak diterima segar atau dalam beberapa hari pertama pembusukan. Bahkan bangkai yang digali dapat dijadikan subjek pengambilan sampel untuk diagnosis rabies oleh FAT yang dapat memberikan hasil yang terdepan. Jurnal 2
Judul Penggunaan Metode Enzim Linked
Immunosorbent Assay (ELISA) dan Direct Fluorescent Antibody (DFA) untuk Diagnosis Giardia intestinalis Penulis Funda Dogruman Al, Semra Kustimur, Tuncer Ozekinci, Neriman Balaban, dan Mustafa Necmi Ilhan Kata Kunci Giardia intestinalis, ELISA, Metode Antibodi Fluoresen Langsung Tahun 2006 Volume dan Halaman Volume 30 dan Halaman 275-278 Tanggal 25 Desember 2006 Abstrak Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengevaluasi nilai teknik direct fluorescent antibody (DFA) yang dilaporkan memiliki sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi serta uji enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) yang digunakan untuk menentukan antigen dalam sampel tinja dalam diagnosis rutin Giardia intestinalis. Ketika 44 sampel feses di mana kista G. intestinalis dan / atau trofozoit telah terlihat selama pemeriksaan Lugol asli diselidiki, kepositifan terdeteksi dengan metode pewarnaan trikrom, metode ELISA dan metode DFA monoklonal ditemukan menjadi 37 (84,0%), 39 (88,6%) dan 35 (79,5%) masing-masing. DFA mendeteksi Crytosporidium parvum kista selain G. intestinalis dalam satu sampel. 27 (61,4%) sampel positif dengan ketiga metode tersebut. Jika dibandingkan dengan metode DFA, metode ELISA memiliki sensitivitas 88,6%, spesifisitas 88,8%, nilai prediksi positif 79,5%, dan nilai prediksi negatif 20,0% sedangkan metode pewarnaan trichrome memiliki sensitivitas 85,7%, spesifisitas 77,8%, nilai prediksi positif 81,1% dan nilai prediksi negatif 22,2%. Tidak ada perbedaan yang signifikan secara statistik antara tes DFA dan ELISA dan antara tes DFA dan metode pewarnaan trichrome untuk mendiagnosis G. intestinalis (p> 0,05). Tujuan Penelitian Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengevaluasi nilai teknik direct fluorescent antibody (DFA) yang dilaporkan memiliki sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi serta uji enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) yang digunakan untuk menentukan antigen dalam sampel tinja dalam diagnosis rutin Giardia intestinalis. Population Sample/Problem Giardiasis terlihat di seluruh dunia dan pada semua kelompok umur meskipun lebih sering ditemukan pada anak-anak. Beberapa penelitian dari Turki pada waktu yang berbeda telah melaporkan kejadian faktor penyebab sebesar 1,9-37,7%. Infeksi asimtomatik atau diare akut dalam waktu yang singkat dapat terjadi. Sebagian besar kasus mengeluhkan tinja lunak berminyak, perut kembung, gas, kram perut, dan nyeri tekan epigastrium. Perubahan kualitas dan jumlah lendir di jejunum terlihat pada pasien yang terinfeksi G. intestinalis. Perubahan patologis bersamaan yang disebabkan oleh parasit di mukosa usus menyebabkan gambaran klinis malabsorpsi. Pasien yang diagnosisnya belum dibuat dan pengobatan yang tidak tepat diberikan menyebabkan menderita diare intermiten dengan periode buang air besar normal selama berbulan- bulan. Kasus yang sembuh secara spontan terus mengeluarkan kista dan menjadi sumber infeksi. Teknik diagnostik pertama yang digunakan adalah pemeriksaan mikroskopis tetapi metode ini mungkin tidak memadai karena ekskresi bentuk kista parasit bersifat intermiten. Enterotest, biopsi duodenum dan evaluasi sampel sikat merupakan metode invasif dan sulit digunakan, terutama pada anak-anak. Metode Penelitian Menggunakan metode analisis perbandingan Pendahuluan Diagnosis Giardia intestinalis (G.intestinalis) pada orang yang terinfeksi dilakukan dengan mengamati kista atau trofozoit. Secara mikroskopis pada tinja atau cairan duodenum atau dengan pemeriksaan sampel usus kecil dan biopsi. Metode tradisional seperti itu membutuhkan banyak tenaga dan staf berpengalaman. Metode ini juga menyebabkan hasil yang salah pada 10-50% kasus ketika sampel tinja tunggal diperiksa karena kista dapat dikeluarkan dalam tinja dan jumlah kista dalam tinja rendah. Ketika infeksi diketahui ada, tidak mungkin untuk mendeteksi parasit pada 20-50% kasus bahkan ketika metode konsentrasi digunakan selain metode pemeriksaan tinja rutin. Ini telah mengarah pada pengembangan metode yang cepat dan andal untuk diagnosis giardiasis. Metode ELISA di mana antibodi monoklonal yang dimurnikan digunakan untuk mendeteksi G. intestinalis antigen kista dalam tinja (sensitivitas 88-99%, spesifisitas 100%) dan antibodi fluoresen langsung (DFA) di mana antibodi monoklonal fluoresen mengikat khusus pada G. intestinalis kista digunakan (sensitivitas 100%, spesifisitas 100%) adalah tes yang telah digunakan baru-baru ini untuk diagnosis. Hasil Penelitian Dari 44 sampel feses yang diduga terdapat G. intestinalis kista atau trofozoit pada pemeriksaan lugol native, 37 (84%) positif dengan metode pewarnaan Trichrome, 39 (88,6%) dengan metode ELISA monoklonal dan 35 (79,5%) dengan tes DFA monoklona. DFA menunjukkan Crytosporidium parvum kista bersama dengan G. intestinalis dalam satu sampel. Hanya 27 (61,4%) sampel positif pada ketiga metode. Jika dibandingkan dengan metode DFA dimana fluorescent monoclonal antibodies mengikat khusus pada G. intestinalis kista maka metode ELISA mempunyai sensitivitas 88,6%, spesifisitas 88,8%, nilai prediksi positif 79,5% dan nilai prediksi negatif 20% sedangkan metode pewarnaan Trichrome memiliki sensitivitas 85,7%, spesifisitas 77,8%, nilai prediksi positif 81,1% dan nilai prediksi negatif 22,2%. Tidak ada perbedaan yang signifikan secara statistik antara tes DFA dan ELISA dan antara tes DFA dan metode pewarnaan Trichrome untuk mendiagnosis G. intestinalis (p>0,05) Pembahasan Metode ELISA dan DFA telah digunakan untuk diagnosis giardiasis Di berbagai studi di Turki telah melaporkan 136 (96,4%) dari 141 sampel feses mereka telah mendeteksi kista G. intestinalis dan / atau trofozoit dengan mikroskop langsung sebagai positif dengan metode ELISA. Metode ELISA memiliki sensitivitas 96,4% dan spesifisitas 80,8% pada penelitian ini. Ada perbedaan yang signifikan secara statistik antara kedua metode tersebut. Gödekmerdan et al. telah menemukan G.intestinalis kista dan / atau trofozoit pada 20% sampel tinja dari 260 pasien dengan berbagai keluhan gastrointestinal melalui mikroskop langsung. Mereka mencari G.intestinalis antigen dengan metode ELISA pada sampel tersebut dan menemukan antigen pada 25,4%. Metode ELISA memiliki sensitivitas 100% dan spesifisitas 93% tetapi tidak ada perbedaan yang signifikan secara statistik antara kedua metode tersebut. Yılbaz dkk. telah melaporkan sensitivitas 92,5% dan spesifisitas 97,7% untuk metode ELISA sedangkan tingkat yang sama masing-masing adalah 98% dan 92% dalam studi oleh Değerli dan Özçelik. Di antara studi asing, Schunk et al. menemukan 22 dari 276 sampel feses positif dengan metode ELISA dan ditemukan kista parasit / trofozoit pada 21 sampel dengan pemeriksaan mikroskopis. Mengambil pemeriksaan mikroskopis sebagai metode referensi, mereka melaporkan sensitivitas 100% dan spesifisitas 99,6% untuk metode ELISA. Aldeen dkk. mengevaluasi sembilan yang diperoleh dari pasien yang diduga menderita giardiasis dan melaporkan sensitivitas 88,6-100% dan spesifisitas 99,3-100%. Hanya ada sedikit penelitian Turki tentang penggunaan metode DFA untuk mendiagnosis giardiasis. Taylan Özkan dkk. telah mendeteksi G.intestinalis kista dan trofozoit pada 11% dari 272 sampel pasien yang diduga menderita G.intestinalis dengan metode DFA dan pada 9% dengan metode pewarnaan Trichrome. Di antara penelitian asing, Alles et al. telah menemukan kista parasit / trofozoit pada 4,4% dari 2696 sampel tinja oleh DFA dan pada 2,9% dengan pemeriksaan mikroskopis rutin dan telah melaporkan sensitivitas tes masing-masing 99,2% dan 66,4% dan spesifisitas 100% untuk kedua tes. Mereka menyatakan bahwa ada perbedaan yang signifikan secara statistik untuk diagnosis antara DFA dan pemeriksaan mikroskopis. Garcia dan Shimizu telah menggunakan berbagai kit ELISA dan DFA komersial dan melaporkan sensitivitas metode ELISA dalam diagnosis giardiasis sebesar 94-100% dan spesifisitas 100% sedangkan kedua angka tersebut 100% untuk DFA. Kesimpulan Kesimpulan dalam penelitian ini, 44 sampel tinja di mana Giardia intestinalis kista dan / atau trofozoit dicurigai dengan pemeriksaan lugol asli diperiksa, metode pewarnaan Trichrome, metode ELISA monoklonal dan DFA monoklonal (dilaporkan memiliki sensitivitas tinggi dan metode spesifisitas) ditemukan 37 ( 84%), 39 (88.6%) dan 35 (79.5%) sebagai positif masing- masing. Jurnal 3
Judul Perbandingan Real-Time PCR, Kultur
Bakteriologis dan Tes Antibodi Fluoresen untuk Deteksi Leptospira borgpetersenii dalam Urine Sapi yang Terinfeksi Secara Alami Penulis Jarlath E.Nally, Ahmed AA Ahmed, Ellie J. Putz, Debra E. Palmquist dan Marga GA Goris Kata Kunci Penyakit ternak; Leptospira; leptospirosis; urine Tahun 2020 Volume dan Halaman Volume 7, 66 dan Halaman 1-6 Tanggal 15 Mei 2020 Abstrak Sapi rentan terhadap infeksi multi serovar leptospira patogen, mengakibatkan abortus, lahir mati, lahir prematur, gagal reproduksi dan sindrom penurunan susu. Sapi juga berperan sebagai inang reservoir L. borgpetersenii serovar Hardjo yang diekskresikan dari ginjal tubulus melalui urin ke lingkungan di mana ia bertahan dalam kondisi lembab yang sesuai dengan yang sebelumnya. Ini menunjukkan bahwa 7% sampel urin dari sapi potong positif L. borgpetersenii serovar Hardjo dengan kultur dan / atau uji antibodi fluoresen (FAT). Dalam studi ini, uji real-time PCR (rtPCR) diterapkan untuk menentukan kinerja relatif deteksi berbasis rtPCR L. borgpetersenii serovar Hardjo dibandingkan dengan teknik kultur dan FAT yang dilaporkan sebelumnya. Dari 42 sampel urin sapi yang positif leptospira melalui kultur dan / atau FAT, 60% (25/42) positif oleh rtPCR. Dari 22 sampel kultur-positif, 91% (20/22) adalah rtPCR-positif. Dari 32 positif FAT sampel, 50% (16/32) positif rtPCR. Untuk 10 sampel yang kultur-positif tetapi FAT-negatif, 90% (9/10) adalah rtPCR-positif. Untuk 20 sampel yang FAT-positif tetapi budaya-negatif, 25% (5/20) adalah rtPCR-positif. Secara kolektif, hasil ini menunjukkan bahwa tidak ada uji tunggal yang optimal, dan penggunaan lebih dari satu uji untuk mendeteksi leptospira dalam urin dari sapi yang terinfeksi secara alami direkomendasikan. Tujuan Penelitian Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui Perbandingan Real-Time PCR, Kultur Bakteriologis dan Tes Antibodi Fluoresen untuk Deteksi Leptospira borgpetersenii dalam Urine Sapi yang Terinfeksi Secara Alami Population Sample/Problem Patogen Leptospira menjajah tubulus ginjal dari inang reservoir infeksi, termasuk spesies hewan domestik dan liar, dari mana mereka diekskresikan melalui urin ke lingkungan dan bertahan dalam kondisi lembab yang sesuai. Kontak dengan sumber lingkungan yang terkontaminasi, atau langsung dengan urin dari hewan yang terinfeksi, dapat mengakibatkan infeksi akut pada inang insidental, karena patogen Leptospira dapat menembus permukaan mukosa atau kerusakan kulit. Lebih dari 1 juta kasus penyakit manusia diperkirakan terjadi setiap tahun, dengan hampir 60.000 kematian. Pasien hewan dan manusia yang menderita akut leptospirosis dapat terus mengeluarkan leptospira dalam urin meskipun gejala klinisnya sudah sembuh. Pada hewan peliharaan, kerugian ekonomi terbesar timbul dari infeksi kronis, menyebabkan reproduksi pemborosan. Penularan penyakit dari semua patogen Leptospira dipertahankan oleh reservoir asimtomatik inang dimana terdapat keseimbangan biologis yang unik antara inang hewan dan serovar spesifik Leptospira, dan seperti yang dicontohkan oleh Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo pada sapi di populasi seluruh dunia. Metode Penelitian Menggunakan metode eksperimen Pendahuluan Leptospirosis adalah penyakit zoonosis global. Leptospirosis merupakan penyebab morbiditas dan mortalitas yang signifikan pada hewan peliharaan, termasuk sapi, anjing, domba, babi dan kuda, yang dapat menjadi insidental dan reservoir inang, tergantung pada spesies dan serovar Leptospira yang terlibat. Gejala klinis berkisar dari demam ringan hingga penyakit ikterik yang lebih parah dan perdarahan paru masif, yang mencerminkan sistemik penyebaran dari serovar yang berbeda ke seluruh inang. Leptospirosis sapi dapat menyebabkan aborsi, lahir mati, kelahiran prematur, kegagalan reproduksi dan sindrom penurunan susu. Sapi rentan terhadap infeksi beberapa Leptospira spesies dan serovar termasuk L. borgpetersenii serovar Hardjo, L. interrogans serovar Pomona, L. kirschneri serovar Grippotyphosa dan L. noguchii. Namun, serovar paling menonjol yang terkait dengan sapi adalah Hardjo, yang menyebabkan kegagalan reproduksi. Pada sapi seropositif untuk Hardjo, rata-rata waktu dari beranak hingga konsepsi (132,6 hari) secara signifikan lebih lama dari pada waktu untuk sapi seronegatif (95,4 hari). Sapi yang seropositif terhadap serovar Hardjo dua kali lebih mungkin gagal untuk hamil dari pada sapi yang seronegatif. Studi seroprevalensi menunjukkan bahwa hingga 49% ternak terkena patogen serovar. Hewan seronegatif juga dapat mengeluarkan Leptospira. Tes definitif untuk mengidentifikasi sapi yang mengeluarkan leptospira dalam urin adalah kultur, yang menghasilkan isolat Leptospira yang dapat sepenuhnya dikarakterisasi pada tingkat genetik dan serovar, dan tersedia untuk digunakan dalam panel diagnostik uji aglutinasi mikroskopis (MAT) atau dimasukkan dalam vaksin berbasis bakteri. Namun, budaya bisa memakan waktu berminggu-minggu hingga berbulan-bulan, dan membutuhkan sangat khusus media sebagai alternatif, tes antibodi fluoresen (FAT) dapat dilakukan relatif cepat dengan menggunakan antibodi yang memberikan spesifisitas untuk mendeteksi leptospira patogen sertavisual konfirmasi dari morfologi leptospira utuh yang secara aktif diekskresikan dalam urin. Namun, FAT tidak memberikan identifikasi serovar atau spesies. Tes molekuler seperti PCR dapat dilakukan secara relatif cepat dan digunakan untuk menyimpulkan adanya leptospira dalam sampel urin; keuntungan termasuk sensitivitas, kuantifikasi, dan kemampuan untuk mengurutkan produk yang diperkuat yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi spesies patogen yang terlibat. Berbagai faktor dapat mempengaruhi pilihan pengujian yang digunakan untuk mendeteksi keberadaan leptospira dalam sampel urin, termasuk ketersediaan sumber daya, keahlian, waktu, tujuan diagnostik, dan aplikasi hilir. Sebelumnya telah dilaporkan bahwa penggunaan setidaknya dua teknik deteksi diperlukan untuk mendeteksi L. borgpetersenii serovar Hardjo dalam urin ternak yang terinfeksi secara eksperimental. Penelitian ini menunjukkan bahwa 7% (43/600) kasus sampel sapi potong secara aktif mengeluarkan leptospira dalam urin seperti yang dideteksi oleh kultur dan / atau FAT . Dari 43 sampel tes-positif, 13 positif dengan kultur dan FAT, sedangkan 10 positif hanya dengan kultur, dan 20 positif hanya oleh FAT. Dalam studi saat ini menilai manfaat penerapan waktu nyata molekuler alternatif uji PCR (rtPCR) untuk mendeteksi leptospira di 42 sampel urin sapi positif uji untuk menentukan kinerja relatif dari setiap pengujian dalam sampel dari sapi yang terinfeksi secara alami. Hasil Penelitian Dari 42 sampel urin sapi yang diketahui positif Leptospira melalui kultur dan / atau FAT, 60% (25/42) positif oleh rtPCR. Dari 22 sampel kultur-positif, 91% (20/22) adalah rtPCR-positif dan dari 32 sampel FAT-positif, 50% (16/32) adalah rtPCR-positif. Hanya 26% (11/42) dari semua sampel yang positif kultur, FAT dan rtPCR. Semua kontrol negatif, negatif dengan rtPCR. Persentase yang diamati untuk gabungan hasil positif dan negatif antara rtPCR dan kultur hasil adalah 86,5% dan 51,9% untuk rtPCR dan FAT, masing-masing. Kappa Cohen dilakukan untuk mengevaluasi tingkat kesepakatan antara metode rtPCR dan kultur yang dilaporkan sebelumnya dan deteksi FAT. Nilai Kappa Cohen 0,74 menunjukkan kesepakatan substansial antara rtPCR dan budaya, sementara nilai Kappa Cohen 0,04 antara rtPCR dan FAT menunjukkan hanya sedikit kesepakatan, hampir setara dengan peluang acak. Pembahasan Secara kolektif, hasil penelitian ini menunjukkan bahwa tidak ada uji tunggal untuk mendeteksi leptospira dalam sampel urin sapi yang optimal. Dalam studi ini, kami menganggap pengumpulan dan pemprosesan sampel sedekat mungkin dalam pengaturan non-eksperimental: urin dikumpulkan langsung dari kandung kemih dengan jarum dan spuit pada saat penyembelihan dan segera digunakan untuk kultur. Selain itu, sampel urin dibawa ke laboratorium pada suhu kamar dan diproses untuk FAT dan rtPCR dalam waktu 3 jam setelah pengambilan. Ada banyak kemungkinan alasan untuk variabilitas dalam hasil positif yang diamati untuk setiap pengujian, termasuk variabilitas dalam komposisi urin dari hewan turunan, serta jumlah leptospira yang ditumpahkan per mL urin, seperti yang diharapkan dengan sampel lapangan. Namun demikian, perbandingan berdampingan dari masing-masing teknik dengan sampel lapangan yang identik menyoroti adanya variabel melekat dan faktor yang dapat mempengaruhi hasil tes- positif untuk mendeteksi leptospira dalam sampel urin sapi. Pada beberapa sampel, rtPCR positif sedangkan FAT negatif, sebaliknya ketika rtPCR negatif FAT positif. Hasil tersebut menekankan kesulitan dalam menentukan benar uji referensi untuk sampel lapangan. Dalam penelitian sebelumnya, tujuan utama adalah untuk mendapatkan dan mengidentifikasi isolat sapi Leptospira, yang semuanya diklasifikasikan sebagai L. borgpetersenii. Identifikasi spesies dimungkinkan dengan isolat yang dibudidayakan tetapi tidak dengan FAT. Dalam studi ini, penggunaan rtPCR memberikan nilai yang identik di semua sampel positif rtPCR, dan yang sebelumnya ditetapkan untuk L. borgpetersenii. Meskipun kultur dianggap sebagai tes diagnostik standar emas untuk deteksi langsung Leptospira, pada dasarnya sulit, dan hanya dilakukan oleh laboratorium spesialis. Jadi, penerapannya terbatas pada studi lapangan dianjurkan untuk menggunakan lebih dari satu alat tes untuk mendiagnosis pelepasan leptospira melalui urin pada sapi. Kesimpulan Penggunaan lebih dari satu uji diagnostik direkomendasikan untuk mendeteksi dan mendiagnosis L. borgpetersenii dalam urin sapi.