UNESA Journal of Chemistry

PENENTUAN AKTIVITAS ASAM ELAGAT SEBAGAI ANTI KANKER PAYUDARA

DETERMINATION OF ELAGIC ACID ACTIVITY AS ANTI-BREAST CANCER
Dicky Dharmawan
Program Studi Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam
Universitas Negeri Surabaya
Jl. Ketintang timur, Surabaya, 60231
Alamat korespodensi: e-mail: dicky.17030234010@mhs.unesa.ac.id

Abstrak, Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui aktivitas senyawa asam elagat sebagai anti kanker prostat. Penelitian
dilakukan melalui Molecular Docking in silico dengan beberapa tahapan seperti optimalisasi struktur senyawa asam elagat
3D dan docking antara senyawa asam ellagic yang dioptimalkan dan protein 5OSD. Molecular Docking dilakukan dengan
menggunakan perangkat lunak Autodock Tools 1.5.6 dan Discovery Studio 2016. Hasil penelitian menunjukkan bahwa
asam elagat berpotensi sebagai senyawa anti kanker payudara berdasarkan energi pengikatannya pada protein -5,73 kkal
/ mol dan konstanta inhibitor protein adalah 63,02 nM.
Kata kunci : Asam elagat, molekular docking, 5OSD, energi ikatan, konstanta inhibitor

Abstract¸ This research was conducted to determine the activity of elagic acid compounds as anti-prostate cancer. The
research was carried out through Molecular Docking in silico with several stages such as the optimization of the structure
of 3D elagic acid compounds and docking between the optimized ellagic acid compound and the 5OSD protein. Molecular
Docking was performed using Autodock Tools 1.5.6 software and Discovery Studio 2016. The results showed that elagic
acid has the potential as an anti-breast cancer compound based on its binding energy to the protein -5.73 kcal / mol and the
protein inhibitor constant is 63.02 nM .
Keywords: Elagic acid, molecular docking, 5OSD, bond energy, inhibitor constants
Asam elagat mempunyai sifat-sifat antiproliferasi
PENDAHULUAN dan antioksidan dalam sejumlah model in vitro dan hewan
Kanker meruapakan penyakit yang ditandai dengan kecil. Sifat-sifat antipoliferasi dari asam elagat berperan
pembelahan sel yang tidak terkendali dan kemampuan sel- atas kemampuannya untuk menghambat pengikatan DNA
sel tersebut untuk menyerang jaringan biologis yang lain. secara langsung dari zat – zat karsinogenik tertentu,
Ilmu biologi dan kedokteran saat ini sudah mengakui peran termasuk nitrosamine dan hidrokarbon aromatik
berbagai senyawa toksik yang menyebabkan terbentuknya polisiklik. Seperti antioksidan polifenol lain, asam elagat
sel kanker pada tubuh makhluk hidup dan perubahan sel- mempunyai efek kemoprotektif (efek perlindungan
sel tersebut menjadi tumor yang lebih ganas1. terhadap kimia berbahaya) pada model-model sel dengan
Kanker payudara merupakan masalah kesehatan mengurangi tekanan oksidasi.
masyarakat yang penting, karena mortalitas dan
morbiditasnya yang tinggi. Jumlah kasus kanker payudara BAHAN DAN ALAT
di dunia menduduki peringkat kedua setelah kanker Bahan yang digunakan dalam simulasi docking
serviks, disamping itu kanker payudara menjadi salah satu teknik in silico ini berupa struktur tiga dimensi dari asam
pembunuh utama wanita di dunia dan adanya elagat sebagai ligan. Sedangkan makromolekul yang
kecenderungan peningkatan kasus baik di dunia maupun di dipilih adalah reseptor androgen (AR) dengan kode 5OSD,
3-4
Indonesia . dapat diunduh di Protein Data Bank (PDB)
Penyebab pasti kanker payudara belum diketahui, (http://www.rscb.org/pdb/). Alat yang digunakan berupa
diperkirakan multifaktorial5. Proses timbulnya kanker perangkat keras dan perangkat lunak. Perangkat keras
payudara merupakan kejadian kompleks yang melibatkan terdiri atas komputer dengan spesifikasi RAM (Random
berbagai faktor. Selain adanya defek pada gen BRCA1 dan Access Memory) empat gigabyte, sistem operasi
BRCA2, masih banyak kelainan yang pada prinsipnya Microsoft Windows 10, dan AutoDock Vina berbantu
meningkatkan aktivitas proliferasi sel serta kelainan yang AutoDock Tools 1.5.6.
menurunkan atau menghilangkan regulasi kematian sel 6.
Asam elagat ialah suatu antioksidan polifenol yang HASIL DAN PEMBAHASAN
dijumpai pada sejumlah buah dan sayuran, Teknik In silico didefinisikan sebagai aplikasi dari
termasuk blackberry, raspberry, alat komputasi yang digunakan dalam analisis dan
strawberry, cranberry, kemiri, kemiri pecan, delima, menginterpretasikan data-data biologi molekul. Komputer
dan wolfberry2. dan program khusus digunakan untuk mengetahui
mekanisme penambatan suatu ligan terhadap target
protein. Berbagai software telah dikembangkan untuk

Matheamatics and Science_State University of Surabaya Page 1

UNESA Journal of Chemistry
membantu penelitian di bidang farmakologi khususnya
metode komputasi melalui proses docking. Docking
merupakan interaksi penambatan antara ligan dan protein
yang digunakankan untuk prediksi posisi dan orientasi
ligan ketika terikat pada reseptor protein. Hasil dari
molecular docking berupa energi ikatan dan interaksi yang
terjadi antara ligan dan protein.
Proses Molecular Docking
Pada penelitian ini digunakan senyawa asam elagat
sebagai ligan dan protein kanker payudara.
Gambar 1. Senyawa Asam Elagat
Gambar 2. Reseptor Androgen (5OSD)
DAFTAR PUSTAKA
1 4
Donaldson MS. 2004. Nutrition and cancer: A review of
the evidence for an anticancer diet. Nut Jour. 3:1-19.
2
Ansarikimia. 2014. ASAM ELLAGAT,
ANTIOKSIDAN POLIFENOL DENGAN SIFAT
ANTIPROLIFERASI. Retrieved from Wawasan Ilmu
Kimia:
https://wawasanilmukimia.wordpress.com/2014/01/30/
asam-ellagat-antioksidan-polifenol-dengan-sifat-
antiproliferasi/
Matheamatics and Science_State University of Surabaya
Gambar 3. Hasil Molecular Docking
Pada hasil molecular docking, terbentuk ikatan
antara ligan dengan residu A273, D256, E181, F275,
G276, H254, I257, K258, dan L262. Ikatan ini berupa
ikatan hidrogen, interaksi hidrofobik, dan interaksi
elektrosatik. Selain itu juga diketahui besarnya konstanta
inhibitor pada protein, yaitu 63,02 nM.
Energi Ikatan (ΔG)
Dari proses docking diperoleh energi ikatan yang
merupakan parameter kestabilan konformasi antara ligan
dengan reseptor androgen. Energi yang diperoleh adalah -
5,73 kkal/mol.
Kesimpulan dan Saran
Kesimpulan
Penelitian ini dapat disimpulkan bahwa interaksi
yang terjadi antara ligan dan residu-residu asam amino
pada reseptor androgen terbentuk sebagai ikatan hidrogen
dan interaksi hidrofobik. Energi ikatan yang dihasilkan
pada protein 5OSD -5,73 kkal / mol dan konstanta
inhibitor protein adalah 63,02 nM.
Saran
Simulasi molecular docking merupakan tahap awal
dalam perancangan suatu kandidat obat sehingga
diperlukan tahapan analisis lebih lanjut baik secara in vitro
maupun in vivo untuk lebih meyakinkan data hasil
simulasi secara in silico. Selanjutnya, komponen bioaktif
dari asam elagat dapat dikembangkan ke dalam suatu
formulasi obat bagi pengobatan kanker prostat.
3
Kelsey, Gammon, Breast Cancer, American Cancer
Society, 2003.
Sarjadi, Padmi T, Ika Pawitra, Insiden Kanker Penduduk
Semarang Tahun 1990 – 1999, Media Medika
Indonesiana, 2001, Vol : 36 : 15 – 21.
5 Ramli, Muchlis, Epidemiological Review Of Breast
Cancer In Indonesia, dalam Proceeding Jakarta
International Cancer Conference, FKUI, 1997.
6
Meister Kathleen, Morgan John, Risk Factor For Breast
Cancer, American Council On Science And Health,
2000.
Page 2