Edit SKRIPSI-SITI KHOIRUN NISA-L1B017002R3hdd-cek NVHMHMKNNJN

SKRIPSI
ISOLASI DAN PENAPISAN BAKTERI AMILOLITIK DARI AIR

DAN SEDIMEN TAMBAK UDANG VANAME (Litopenaeus
vannamei) DI DESA BUNTON, KECAMATAN ADIPALA,
KABUPATEN CILACAP
Dilaksanakan dan disusun guna memperoleh gelar Sarjana Perikanan di Univer

sitas Jenderal Soedirman
oleh:
Siti Khoirun Nisa
NIM. L1B017002
FAKULTAS PERIKANAN DAN ILMU KELAUTAN

UNIVERSITAS JENDERAL SOEDIRMAN
PURWOKERTO
2021
SKRIPSI
ISOLASI DAN PENAPISAN BAKTERI AMILOLITIK DARI AIR

DAN SEDIMEN TAMBAK UDANG VANAME (Litopenaeus
vannamei) DI DESA BUNTON, KECAMATAN ADIPALA,
KABUPATEN CILACAP
oleh:
Siti Khoirun Nisa
NIM. L1B017002
disetujui tanggal
………………..
Pembimbing Utama Pembimbing Anggota
Dr. rer. nat Hamdan Syakuri, S.Pi.M. Si. Dr. Nuning Vita Hidayati,S.Pi,M.Si.
NIP. 19771216 200112 1 001 NIP. 19780729 200501 2 002
Mengetahui,
Dekan Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan
Dr. Ir. H. Isdy Sulistyo, DEA.

NIP. 19600307 198601 1 003
ii
ABSTRAK
Lingkungan tambak udang vaname umumnya mengandung banyak bahan

organik yang menyebabkan berkembangnya komunitas bakteri, khususnya
yang mampu mendegradasi bahan organik seperti karbohidrat. Tujuan
penelitian ini adalah mengetahui keberadaan dan indeks aktivitas bakteri
amilolitik pada air dan sedimen tambak udang vaname di Bunton, Adipala,
Cilacap. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode observasi
dengan teknik pengambilan sampel dilakukan dengan cara purposive sampling.
Bakteri amilolitik dapat ditemukan pada air dan sedimen tambak udang
vaname dengan proporsi berturut-turut yaitu 43% dan 27%. Didapatkan 14
isolat terpilih dngan indeks tinggi. Isolat bakteri amilolitik yang didapatkan
memiliki indeks aktivitas berkisar antara 0,3–3,8 (air), dan 0,2-4,3 (sedimen).
Indeks aktivitas bakteri amilolitik tertinggi pada air yaitu 3,8, sedangkan pada
sedimen 4,3. Hasil tersebut menunjukkan bahwa isolat bakteri tersebut
berpotensi untuk dapat dikembangkan lebih lanjut menjadi bakteri probiotik.
Kata kunci : Udang vanname, Bakteri amilolitik, proporsi dan indeks aktivitas bakteri
amilolitik, probiotik.
iii
ABSTRACT
iv
PERNYATAAN ORIGINALITAS
Saya yang bertanda tangan di bawah ini :
Nama : Siti Khoirun Nisa
Nim : L1B017002
Judul : Isolasi dan Penapisan Bakteri Amilolitik dari Air dan Sedimen
Tambak Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) di Desa Bunton,
Kecamatan Adipala, Kabupaten Cilacap
Menyatakan dengan sebenarnya bahwa skripsi ini merupakan hasil
penelitian, pemikiran, dan pemaparan asli dari saya sendiri, bukan merupakan
pengambilan atau pikiran orang lain yang saya akui sebagai tulisan saya,
kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam
daftar pustaka. Demikian pernyataan ini saya buat dalam keadaan sadar tanpa
paksaan dari pihak manapun.
Purwokerto, Febuari 2022
Siti Khoirun Nisa

L1B017002
v
KATA PENGANTAR
Puji Syukur kehadirat Allah SWT yang telah memberikan rahmat
kepada penulis sehingga penulis mendapatkan kesempatan untuk
menyelesaikan skripsi dengan judul “Isolasi dan Penapisan Bakteri Amilolitik d
ari Air dan Sedimen Tambak Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) di Desa
Bunton, Kecamatan Adipala, Kabupaten Cilacap”. Kegiatan budidaya udang
vaname yang dikelola secara intensif pada umumnya menghasilkan limbah
baik yang berasal dari sisa pakan, feses maupun sisa metabolisme. Limbah
bahan organik ini akan menyebabkan penurunan kualitas air sehingga akan me
ngganggu proses budidaya udang vaname. Oleh karena itu, perlu dilakukan
upaya untuk mengurangi kandungan bahan organik pada tambak yaitu denga
n proses biodegradasi oleh mikroorganisme, salah satunya bakteri amilolitik.
Penulis menyadari bahwa masih banyak kekurangan dari skripsi ini,
baik dari segi materi maupun teknik penyajiannya. Oleh karena itu, kritik dan
saran yang membangun sangat berarti dan sangat penulis harapkan, agar
kedepannya menjadi pembelajaran. Akhir kata penulis mengharapkan semoga
skripsi ini dapat bermanfaat bagi pembaca.
Purwokerto, Febuari 2022
Penulis
vi
DAFTAR ISI
Halaman
HALAMAN JUDUL........................................................................................................i
LEMBAR PENGESAHAN............................................................................................II
ABSTRAK......................................................................................................................III
ABSTRACT....................................................................................................................IV
PERNYATAAN ORIGINALITAS...............................................................................V
KATA PENGANTAR..................................................................................................VI
DAFTAR ISI.................................................................................................................VII
DAFRAR TABEL..........................................................................................................IX
DAFTAR GAMBAR.......................................................................................................X
DAFTAR LAMPIRAN.................................................................................................XI
I. PENDAHULUAN..............................................................................................1
1.1. Latar Belakang....................................................................................................1
1.2. Perumusan Masalah...........................................................................................3
1.3. Tujuan...................................................................................................................4
1.4. Manfaat.................................................................................................................4
II. TINJAUAN PUSTAKA......................................................................................5

2.1. Udang Vaname (Litopenaeus Vannamei)...........................................................5
2.2. Morfologi Udang Vaname (L. Vannamei)........................................................5
2.3. Budidaya Udang Vaname Secara Intensif......................................................6
2.4. Pakan Udang Vaname (L. Vannamei)...............................................................7
2.5. Probiotik...............................................................................................................8
2.6. Bakteri Amilolitik.............................................................................................10
2.7. Air dan Sedimen Sebagai Sumber Bakteri Amilolitik.................................11
2.8. Budidaya Udang Vaname Di Kabupaten Cilacap.......................................12
III. MATERI DAN METODE.................................................................................14

3.1. Materi Penelitian...............................................................................................14
3.2 Metode Penelitian.............................................................................................14
3.3 Prosedur Penelitian..........................................................................................15
3.4 Waktu Dan Tempat..........................................................................................21
3.5 Analisis Data......................................................................................................21
IV. HASIL DAN PEMBAHASAN........................................................................22

4.1 Kelimpahan Bakteri Pada Air dan Sedimen Tambak Udang Vaname.....22
4.2 Pengamatan Morfologi Koloni Bakteri Pada Air dan Sedimen Tambak..24
4.3 Proporsi Bakteri Berdasarkan Sifat Gram.....................................................28
4.4 Hasil Penapisan Bakteri Amilolitik................................................................30
V. KESIMPULAN DAN SARAN........................................................................35

5.1 Kesimpulan........................................................................................................35
vii
5.2 Saran...................................................................................................................35
DAFTAR PUSTAKA....................................................................................................36
LAMPIRAN...................................................................................................................42
UCAPAN TERIMA KASIH.........................................................................................55
RIWAYAT HIDUP SINGKAT....................................................................................55
viii
DAFTAR TABEL
Tabel halaman
Tabel 1. Kelimpahan bakteri pada air dan sedimen tambak udang vaname......22
Tabel 2. Pengamatan Morfologi Koloni pada Air Tambak Udang Vaname........25
Tabel 3. Pengamatan Morfologi Koloni pada Sedimen Tambak Udang..............26
Tabel 4. Proporsi Bakteri Amilolitik..........................................................................32
Tabel 5. Pengamatan Indeks Amilolitik pada Air dan Sedimen Tambak...........32
Tabel 6. Isolat-isolat amilolitik yang memiliki indeks ≥ 2.5...................................32
ix
DAFTAR GAMBAR
Gambar halaman
Gambar 1. Udang Vaname (L. vannamei)..................................................................6
Gambar 2 Tambak Udang Vaname di Desa Bunton...............................................13
Gambar 3 Prosedur Penelitian....................................................................................15
Gambar 4. Proporsi Gram pada Air dan Sedimen Tambak Udang Vaname......29
Gambar 5. Bakteri Amilolitik dari Lingkungan Tambak Udang Vaname yang
Ditumbuhkan pada Media TSA yang mengandung pati 1%........................31
x
DAFTAR LAMPIRAN
1. Data Kelimpahan Bakteri........................................................................................42

2. Data Pengamatan Morfologi Koloni......................................................................44
3. Data Pengamatan Bakteri Gram Positif dan Gram Negatif...............................47
4. Data Indeks Aktivitas Bakteri Amilolitik..............................................................52
5. Dokumentasi.............................................................................................................56
xi
I. PENDAHULUAN
1.1. Latar Belakang
Udang vaname merupakan salah satu komoditas utama budidaya tamba
k di Indonesia. Budidaya udang vaname yang dikelola secara intensif dapat me
ningkatan produksi udang vaname akan tetapi mempunyai permasalahan yang
cukup serius terkait kemungkinan terjadinya degradasi kualitas air (Gunarto et
al., 2012). Kepadatan penebaran dan input pakan yang tinggi menyebabkan
tingginya limbah yang dihasilkan, baik yang tersuspensi maupun mengendap
di dasar kolam (Supono, 2017). Degradasi kualitas air selama proses budidaya
udang vaname disebabkan oleh penumpukan bahan organik berupa sisa pakan
dan kotoran udang (feses) pada substrat dasar tambak (Komarawidjaja, 2003).
Limbah tambak berupa bahan organik pada umumnya terdiri dari protein,
karbohidrat, dan lemak yang berasal dari kotoran udang dan sisa pakan yang
sebagian akan larut dan sebagian lagi mengendap di dasar (Suwoyo et al., 2014)
Dampak lanjut yang terjadi akibat dari penumpukan bahan organik pada tam
bak adalah kegagalan budidaya udang yang disebabkan karena penyakit. Oleh
karena itu, perlu adanya penerapan teknologi yang diharapkan dapat
mengurangi kandungan bahan organik pada budidaya udang vaname. Salah
satu teknologi yang dapat diaplikasikan adalah melalui penggunaan probiotik.
Probiotik merupakan mikroorganisme yang mampu mendukung
pertumbuhan dan produktivitas udang. Aplikasi probiotik pada budidaya uda
ng vaname dapat meningkatkan nilai kualitas air, menguraikan senyawa sisa
metabolisme dan mengurangi bahan organik total melalui biodegradasi (Fuady
et al., 2013; Ali et al., 2020). Lestari (2016) mengatakan biodegradasi merupakan
penguraian atau perombakan bahan organik secara biologis dan prosesnya

1
berlangsung secara enzimatis. Bakteri probiotik membantu proses dekomposisi
dengan mengurai bahan organik yang ada di tambak (Pitrianingsih et al., 2014).
Aktivitas bakteri probiotik dalam mendegradasi limbah organik yaitu mereduk
si kandungan bahan pencemar yang bersifat racun dengan mengubah struktur
kimia bahan pencemar tersebut menjadi lebih sederhana sehingga tidak beracu
n dan berbahaya bagi kehidupan udang (Pratiwi et al., 2019).
Isolasi dan seleksi bakteri kandidat probiotik merupakan faktor
penting dalam menentukan keberhasilan aplikasi probiotik di bidang
akuakultur (Marlida & Elrifadah, 2017). Bakteri yang dapat digunakan sebagai
kandidat probiotik salah satunya adalah jenis bakteri amilolitik. Bakteri
amilolitik merupakan salah satu bakteri kandidat probiotik yang mampu
menghasilkan enzim ekstraselular yaitu amilase (Anggorowati et al., 2019). Men
ururt Zhou et al. (2018), bakteri amilolitik adalah bakteri yang menghasilkan
enzim amilase yang mampu menghidrolisis ikatan glikosidik pada pati dan
memecahnya menjadi polimer glukosa. Enzim ini dibutuhkan untuk merombak
amilum yang terdapat dalam sisa pakan. Enzim amilase dari kandidat probiotik
mampu mengurai karbohidrat yang ditandai dengan terbentuknya zona bening
di sekitar area koloni (Gana et al., 2014).
Bakteri amilolitik sebagai kandidat probiotik dapat diisolasi dari
lingkungan tambak udang, yaitu air dan sedimen. Penelitian terkait studi
keberadaan bakteri amilolitik sudah dilakukan Ayuningrum et al. (2021) yang
berhasil menapis Actinobacteria dari sedimen tambak udang vaname dengan
indeks amilolitik tertinggi pada isolat SC 3.3 memiliki kemiripan 98,3% dengan
Streptomyces atacamensis dengan zona hidrolisis amilum 3,77. Kurniawati (2015)
2
juga melaporkan bahwa dari sedimen tambak udang vaname intensif ditemuka
n bakteri amilolitik Genus Flavobacterium dengan zona hidrolisis amilum 34,1
mm, Pseudomonas dengan zona hidrolis amilum 22,14 mm, Corybacterium me
miliki zona hidrolisis amilum 28,16 mm, dan Bacillus memiliki zona hidrolisis 1
1,77 mm. Berdasarkan penelitian Jamilah et al. (2009) bakteri amilolitik dari Gen
us Bacillus berhasil ditemukan pada air budidaya tambak udang vaname deng
an rata-rata indeks aktivitas 3,6. Banyaknya penelitian yang telah berhasil men
gisolasi bakteri amilolitik dari tambak udang vaname sehingga membuka pelua
ng untuk ditemukannya bakteri amilolitik pada air dan sedimen tambak udang
vaname. Hal tersebut menjadi dasar dilakukannya penelitian terkait penapisan
bakteri amilolitik dari air dan sedimen tambak udang vaname di Desa Bunton,
Kecamatan Adipala, Kabupaten Cilacap.
1.2. Perumusan Masalah

Kondisi lingkungan tambak terkait erat dengan tingkat kualitas air yang b
uruk atau belum sesuai kriteria untuk budidaya udang yang maksimal. Hal ini
yang dapat menyebakan tingkat kematian udang sangat besar dan berdampak
gagal panen. Melihat dari permasalahan yang ada maka perlu dilakukan upaya
untuk memperbaiki kualitas air dengan pengaplikasian bakteri probiotik salah
satunya bakteri amilolitik. Kandidat bakteri probiotik yang memiliki sifat
amilolitik dapat diperoleh dari tambak udang vaname diperlukan penapisan.
Berdasarkan uraian tersebut, rumusan masalah yang dapat diambil adalah :
1. Apakah bakteri amilolitik dapat ditemukan di air dan sedimen tambak ud
ang vaname?
3
2. Berapa indeks aktivitas amiolitik bakteri dari air dan sedimen tambak uda
ng vaname?
1.3. Tujuan
Penelitian ini bertujuan untuk :
1. Mengetahui keberadaan isolat bakteri amilolitik dari air dan sedimen tambak
udang vaname.
2. Mengetahui indeks aktivitas amilolitik isolat bakteri dari air dan sedimen ta
mbak udang vaname.
1.4. Manfaat
Penelitian ini diharapkan dapat memberikan informasi bagi civitas
akademik dan masyarakat mengenai isolat bakteri amilolitik yang berpotensi se
bagai kandidat probiotik yang diisolasi dari air dan sedimen tambak udang
vaname di Desa Bunton, Kecamatan Adipala, Kabupaten Cilacap.
4
II. TINJAUAN PUSTAKA
2.1. Udang Vaname (Litopenaeus vannamei)
Udang vaname adalah krustasea yang berasal dari daerah subtropis pant
ai barat Amerika, mulai dari Teluk California di Mexico bagian utara sampai ke
pantai barat Guatemala, El Salvador, Nicaragua, Kostarika di Amerika Tengah
hingga ke Peru di Amerika Selatan (WWF Indonesia, 2014). Di Indonesia udang
vaname telah dijadikan produk unggulan sektor perikanan sejak tahun 2001. Di
dunia udang vaname mempunyai berbagai nama yaitu Pacific white shrimp, Wes
t coast white shrimp, Penaeus vannamei, Camaron blanco Langostino, White leg shrim
p, Crevette pattes blanches, Camaron pati blanco (Wahyudewantoro, 2011).
Klasifikasi udang vaname (L. vannamei) adalah sebagai berikut :
Kingdom : Animalia
Filum : Anthropoda
Kelas : Crustacea
Ordo : Decapoda
Famili : Penaidae
Genus : Litopenaeus
Spesies : L. vannamei (Boone, 1931)
5
2.2. Morfologi Udang Vaname (L. vannamei)
Gambar 1. Udang Vaname (L. vannamei)
(Sumber : Dugassa dan Gaetan, 2018)
Bagian tubuh udang vaname terdiri atas kepala dan perut (abdomen). Ba
gian kepala terdiri dari antenula, antenna, mandibula dan sepasang maxilla. Pa
da kepala terdapat 5 pasang kaki jalan (periopod), yang dilengkapi 2 pasang m
axillae dan 3 pasang maxilliped. Sedangkan pada perut terdiri atas 6 ruas dan 5
pasang kaki renang (pleopod). Bagian terakhir adalah ekor. Ekor terdiri dari 2
pasang uropoda dan telson yang berfungsi sebagai pengatur keseimbangan ren
ang dan membantu udang untuk melompat mundur dengan cepat jika terjadi b
ahaya (Haliman & Adijaya, 2006; FAO, 2011; Dugassa & Gaetan, 2018).
2.3. Budidaya Udang Vaname Secara Intensif

Budidaya udang vaname dengan teknologi intensif adalah budidaya udan
g dengan padat tebar yang tinggi berkisar 100-300 ekor/m 2 (Nababan et al., 201
5). Tambak intensif adalah tambak yang dilengkapi dengan plastik mulsa yang
6
menutupi semua bagian, pompa air, kincir air, aerator, tingkat penebaran tinggi
dan pakan 100% pellet (Purnamasari et al., 2017). Masalah utama yang sering di
temukan dalam kegagalan produksi udang vaname adalah kualitas air yang bu
ruk selama masa pemeliharaan, terutama di tambak intensif. Aplikasi padat pe
nebaran dan input pakan yang tinggi pada budidaya sistem intensif dapat
menyebabkan terjadinya penurunan kualitas air. Hal ini disebabkan oleh akum
ulasi bahan organik, karena udang menyimpan sekitar 16.3 - 40.87 % protein p
akan, sisanya dikeluarkan sebagai sisa pakan, serta feses (Arsad et al., 2017). Sis
a pakan akan menghasilkan limbah sedimen yang komposisinya terdiri atas ba
han organik dan anorganik. Bahan organik terdiri atas protein, karbohidrat, da
n lemak. Kandungan bahan organik terlarut yang tinggi dapat menurunkan
kandungan oksigen terlarut dalam air sehingga menurunkan daya tahan tubuh
udang yang pada akhirnya dapat mengakibatkan timbulnya penyakit (Suwoyo
et al., 2016).
2.4. Pakan Udang Vaname (L. vannamei)

Budidaya udang dan budidaya perikanan lainnya merupakan kegiatan y
ang potensial menghasilkan limbah organik yang tinggi (Nimrat et al., 2008). Li
mbah ini berasal terutama dari sisa pakan dan hasil ekskreta hewan budidaya y
ang menyebabkan peningkatan sedimentasi pada dasar tambak (Andriani et al.,
2019). Sisa pakan dan feses memiliki karakteristik yang mirip dengan komposis
i pakan yang digunakan. Pakan udang kaya akan nitrogen, selain itu pakan uda
ng juga mengandung karbohidrat (Ari, 2012). Menurut Zainuddin et al. (2018)
pakan udang yang berkualitas memiliki komponen protein, lemak, karbohidrat,
vitamin, dan mineral.
7
Pakan yang digunakan pada budidaya intensif udang vaname di tamba
k Desa Bunton adalah pakan udang merek “irawan” yang diproduksi oleh PT C
entral Proteina Prima. Kandungannya adalah tepung ikan, tepung hati cumi, mi
nyak ikan, tepung terigu, bungkil kedelai, soya lechitin, vitamin, dan mineral. P
akan udang yang menggunakan komponen nabati sebagai bahan baku pakan s
eperti tepung terigu mengandung karbohidrat dalam jumlah yang cukup besar.
Komponen karbohidrat ini diantaranya adalah pati/amilum (Ari, 2012).
Menurut Borght et al. (2005), tepung terigu sebagian besar terdiri dari pati,
yaitu karbohidrat kompleks yang tidak larut dalam air. Tepung terigu memiliki
sekitar 68-78% pati.
2.5. Probiotik
Probiotik berasal dari bahasa Yunani pro bios yang berarti “untuk
kehidupan” (Firmansyah, 2016). Fuller (1992) mendefinisikan probiotik sebagai
konsep pemberian pakan suplemen mikroba hidup yang menguntungkan bagi
keseimbangan kualitas air. Gatesoupe (1999) mengemukakan bahwa probiotik
adalah mikroba yang dimasukkan ke dalam saluran pencernaan dengan
berbagai cara dan menjaga agar mikroba tersebut tetap dalam keadaan hidup
untuk meningkatkan kesehatan inangnya. Menurut FAO (2001) probiotik
adalah suatu mikroorganisme hidup yang bermanfaat bagi kesehatan inang
(baik itu hewan maupun manusia). Verschuere et al. (2000) menyatakan
probiotik dalam akuakultur adalah mikroba yang ditambahkan pada saluran
usus inang dan media budidaya yang dapat mencegah perkembangbiakkan
patogen, meningkatkan efesiensi penggunaan pakan. Cruz et al. (2012) menamb
ahkan bahwa probiotik dapat meningkatkan pertumbuhan organisme budiday
8
a, mencegah penyakit, meningkatkan toleransi terhadap stres, meningkatkan
performa reproduksi induk ikan, dan meningkatkan kualitas air. Mikroba yang
digunakan sebagai probiotik adalah bakteri, dan khamir.
Isolasi dan seleksi bakteri kandidat probiotik merupakan faktor
penting dalam menentukan keberhasilan aplikasi probiotik di bidang
akuakultur (Marlida dan Elrifadah, 2017). Mikroba bisa dikatakan mempunyai
karakteristik dan kriteria yang aman dari seleksi kandidat probiotik yaitu
non-toksik dan non-patogen, memiliki kemampuan untuk bertahan hidup di
saluran pencernaan inang (misalnya resistensi terhadap garam empedu, pH
rendah, dan protease), kemampuan mikroorganisme untuk berkoloni
menempel terhadap sel epitel usus untuk mengurangi atau mencegah
kolonisasi patogen (Vine et al., 2004). Probiotik potensial harus memberikan
efek menguntungkan (peningkatan nutrisi dan peningkatan respon imun
inang) serta dapat disimpan dalam jangka panjang dalam kondisi lapangan.
Menurut Gomez-Gil et al. (2000) tahapan proses seleksi kandidat probiotik
adalah mengetahui informasi latar belakang asal isolat, memperoleh kandidat
probiotik, mengevaluasi kemampuan kandidat probiotik untuk
mengalahkan/menghambat bakteri patogen, menguji patogenisitas kandidat
probiotik, mengevaluasi pengaruh potensial probiotik terhadap inang,
menganalisis biaya dan manfaat ekonomi.
Prinsip kerja probiotik dalam akuakultur yaitu : 1) memproduksi
senyawa antimikroba sebagai inhibator, seperti bakteriosin, siderofer, lisozim,
protease, hidrogen peroksida, 2) bersaing dengan patogen untuk mendapatkan
substrat bahan makanan di permukaan epitel usus untuk difermentasi,
9
3) kompetisi mendapatkan tempat adhesi pada dinding usus, 4) mengurangi
populasi bakteri patogen dalam saluran pencernaan organisme akuatik yang
dibudidayakan, 5) sumber nutrisi dan menghasilkan enzim pencernaan seperti
amilase, protease, dan lipase, 6) meningkatkan respon imun C non-spesifik pad
a inang sehingga tahan terhadap serangan virus, bakteri, jamur maupun parasit
7) membantu memperbaiki kualitas air tambak karena bakteri probiotik
memiliki kemampuan mendegradasi limbah organik (Sahu et al., 2008).
Probiotik sebagai kontrol biologis dalam budidaya adalah bakteri asam
laktat (Lactobacillus, Carnobacterium, Streptococcus, dan lain-lain), Genus
Vibrio (Vibrio alginolyticus, dan lain-lain), Bacillus, Pseudomonas, Nitrosomona
s, Aerobacter, Nitrobacter dan Flavobacterium (Balcazar et al., 2006; Umasugi et
al., 2018; Mustafa et al., 2019). Ada dua macam cara aplikasi probiotik yaitu: 1)
melalui lingkungan (air dan dasar tambak) dan 2) melalui oral (dicampurkan ke
dalam pakan). Aplikasi cara kedua dapat meningkatkan kualitas pakan dengan
menambahkan bahan aditif berupa probiotik yang berisi mikroba pengurai ke
dalam pakan yang dapat berfungsi untuk memperbaiki kualitas pakan dengan
cara penguraian sehingga dapat meningkatkan kecernaan pakan (Mansyur &
Tangko, 2008).
2.6. Bakteri Amilolitik

Bakteri amilolitik adalah jenis bakteri yang dapat memproduksi enzim a
milase dan mampu memecah pati (Turker & Ozcan, 2015). Bakteri ini menghasi
lkan enzim amilase, yang merupakan produk metabolisme primer dari bakteri t
ersebut, yang digunakan untuk memecah amilum (Sa’id, 1987). Enzim ini dibut
uhkan untuk merombak amilum yang terdapat dalam sisa pakan.
10
Pati dapat dipecah menjadi unit-unit yang lebih kecil yaitu dengan
memotong ikatan-ikatan glikosidiknya. Salah satu enzim yang dapat
memotong ikatan tersebut adalah enzim amilase (Koswara, 2009). Amilase
dapat diperoleh dari beberapa sumber, seperti tumbuhan, hewan, bakteri, dan
jamur (Saranraj & Naidu, 2013). Amilase merupakan salah satu enzim hidrolitik
yang memiliki kemampuan untuk memutus ikatan glikosidik molekul pati baik
pada amilosa maupun pada amilopektin (Haryani et al., 2014). Mekanisme kerja
enzim amilase dalam menghidrolisis pati yaitu degradasi amilosa terurai
menjadi saltosa dan maltotriosa. Pada tahap selanjutnya maltotriosa terurai
kembali menjadi maltosa dan glukosa (Fogarty, 1983). Kerja amilase pada
amilopektin akan menghasilkan glukosa, maltosa, dan berbagai jenis α - limit
dekstrin, yaitu oligosakarida (Winarno, 1983). Hasil hidrolisis akhir berupa
molekul-molekul yang lebih kecil seperti glukosa, maltosa, maltotriosa, dan
dekstrin (Susilawati et al., 2015).
Enzim amilase mampu mendegradasi bahan organik pada tambak sehin
gga tidak berbahaya bagi kehidupan udang. Komponen penyusun pakan udan
g salah satunya adalah karbohidrat. Genus bakteri amilolitik adalah Bacillus, Ba
cteriods, Lactobacillus, Clostridium, Micrococcus, Thermus, dan Actinomycetes
(Silaban & Simamora, 2018).
2.7. Air dan Sedimen sebagai Sumber Bakteri Amilolitik

Padat penebaran udang yang tinggi memberikan konsekuensi peningkat
an bahan organik yang diakibatkan oleh sisa pakan yang tidak habis dimakan d
an kotoran udang sebagian akan larut dalam air tambak dan sebagian lagi men
gendap di dasar tambak (Andriani et al., 2019). Bahan organik dari sisa pakan, f
11
eses yang mengendap di dasar tambak digunakan sebagai substrat untuk pertu
mbuhan mikroorganisme. Bahan organik yang melimpah di sedimen tambak u
dang vaname, menyebabkan pertumbuhan mikroorganisme sangat pesat
(Suwoyo et al., 2014). Menurut Jeanua et al. (2014), semakin besar nilai bahan
organik pada tambak udang vaname semakin besar juga nilai total bakterinya.
Menurut penelitian Jamilah et al. (2009) bakteri amilolitik dari Genus Bac
illus berhasil ditemukan pada air budidaya tambak udang vaname di Karawan
g, Jawa Barat. Berdasarkan penelitian Kurniawati (2015) dari sedimen tambak i
ntensif udang vaname di Banyuwangi ditemukan bakteri amilolitik Genus Flav
obacterium, Pseudomonas, Corybacterium, dan Bacillus.
2.8. Budidaya Udang Vaname di Kabupaten Cilacap

Kabupaten Cilacap adalah Kabupaten di Provinsi Jawa Tengah yang
paling luas wilayah lautnya dengan garis pantai sepanjang kurang lebih 2
01,9 kilometer (Cahyandi et al., 2020). Pada wilayah sepanjang pesisir pantai Ka
bupaten Cilacap berpotensi sebagai tempat perikanan budidaya. Cilacap adalah
salah satu sentra perikanan di Indonesia dengan salah satu produk utamanya a
dalah udang (Pangesti et al., 2016). Hal ini merupakan peluang yang sangat be
sar untuk mendukung kegiatan budidaya air payau terutama udang vaname.
Komoditas perikanan yang dominan dibudidayakan di Kabupaten Cilac
ap salah satunya adalah udang vaname (Nugroho et al., 2020). Kecamatan Adip
ala merupakan salah satu kecamatan di Kabupaten Cilacap yang membudidaya
kan udang vaname. Menurut Purnomo et al. (2004), Kecamatan Adipala merupa
kan kecamatan dengan lahan yang potensial untuk budidaya tambak. Luas tam
12
bak di Kecamatan Adipala menurut data statistik Kabupaten Cilacap pada tahu
n 2018 yaitu seluas 58,62 ha.
Gambar 2 Tambak Udang Vaname di Desa Bunton
(Dokumentasi pribadi)
13
III. MATERI DAN METODE
3.1. Materi Penelitian

3.1.1 Objek
Objek yang digunakan untuk penelitian ini adalah air dan
sedimen yang berasal dari dari tambak intensif udang vaname di Desa
Bunton, Kecamatan Adipala, Kabupaten Cilacap.
3.1.2 Alat
Alat yang digunakan dalam penelitian ini adalah cawan petri,
gelas ukur, spatula, alat tulis, tabung reaksi, rak tabung, plastik,
inkubator, rotary shaking inkubator, microtube 1,5 mL, labu erlenmeyer,
aluminium foil, plastik wrap, objek glass, glove, cooler box, plastik ziplock,
kertas bekas, timbangan analitik, tip, mikropipet, pipet tetes, jarum ose,
bunsen, korek api, vortex, microwave, dan autoklaf.
3.1.3 Bahan
Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah larutan fisiologis
(NaCl 0,9%), pati (tepung tapioka), marine agar (Difco BD), agar (M), mari
ne broth (Difco BD), gliserol, akuades, KOH 3%, spirtus, alkohol 70%, dan
tissue.
3.2 Metode Penelitian

Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode
observasi dengan teknik pengambilan sampel dilakukan dengan cara
purposive sampling. Variabel dalam penelitian yaitu keberadaan, indeks
aktivitas, dan proporsi bakteri amilolitik dari air dan sedimen tambak
udang vaname.
14
3.3 Prosedur Penelitian
Prosedur penelitian isolasi dan penapisan bakteri amilolitik dari air dan
sedimen di tambak udang vaname secara garis besar dapat dilihat pada Gam
bar 3.
Gambar 3 Prosedur Penelitian
3.3.1 Pengambilan Sampel
Pengambilan sampel air dan sedimen dilakukan pada tiga petak
tambak yaitu tambak 6, tambak 7, tambak 8, beserta bagian inlet dan
outlet tambak intensif udang vaname di Desa Bunton, Kecamatan Adipal
a, Kabupaten Cilacap. Pengambilan sampel air dilakukan dengan menga
mbil air dari tambak dan dimasukkan ke dalam botol sampel. Setelah itu
sampel dimasukkan ke dalam cooler box. Pengambilan sampel sedimen di
15
lakukan sampai kedalaman sekitar 5 cm dengan menggunakan kayu
kemudian sampel sedimen dimasukkan ke dalam plastik ziplock. Untuk
menghindari kontaminasi, maka sedimen yang diambil di bagian yang ti
dak menempel pada kayu. Sampel disimpan dalam coolerbox untuk diba
wa ke laboratorium. Di laboratorium sampel air dan sedimen disimpan
dalam kulkas pada suhu 4 oC.
3.3.2 Persiapan Alat
Erlenmeyer, cawan petri, tabung reaksi, dan spatula dibersihkan
dengan cara direbus di dalam air sabun hingga mendidih. Setelah itu alat-
alat tersebut dibilas dan dicuci dengan spons. Alat-alat dikeringkan
dengan menggunakan lap atau tisu. Kemudian alat-alat tersebut
disterilkan menggunakan autoklaf dengan suhu 121 oC selama 15 menit
(Istini, 2020).
3.3.3 Pembuatan Media Kultur
a. Media Marine Agar
Media marine agar dibuat dengan melarutkan 5,51 gram marine
agar bersama 1 gram agar dalam wadah erlenmeyer berisi 100 mL akuad
es, selanjutnya disterilkan menggunakan autoklaf pada suhu 121°C sela
ma 15 menit.
b. Media Marine Broth
Media marine broth dengan sebanyak 3,74 gram marine broth
dimasukkan ke dalam erlenmeyer berisi akuades sebanyak 100 ml.
Kemudian media marine broth dimasak di microwave. Media marine broth
dimasukkan ke dalam mikrotube 1,5 ml sebanyak 850 μl menggunakan
16
mikropipet. Setelah itu media marine broth disterilkan menggunakan
auktoklaf dengan suhu 121 oC selama 15 menit.
c. Media TSA yang mengandung pati 1%
Uji aktivitas amilolitik dilakukan pada media agar dengan 1%
amilum atau pati (Suciati et al., 2019). Media amilolitik dibuat dengan
cara, pati (tepung tapioka) dengan berat 1% dari total volume media
yang akan dibuat ditimbang menggunakan timbangan digital. Sebanyak
1 gram pati dimasukkan ke dalam Erlenmeyer kemudian ditambahkan
5,51 gram marine agar + 1 gram agar dan ditambahkan akuades 100 mL.
Penambahan agar sebanyak 1 gram untuk membuat media agak padat
dan tidak mudah robek. Larutan media amilolitik dimasak di
microwave. Media amilolitik yang telah homogen, kemudian disterilkan
menggunakan auktoclave dengan suhu 1210C selama 15 menit. Setelah
steril, media amilolitik dituangkan ke dalam cawan petri.
3.3.4 Isolasi Bakteri dari Sampel Air dan Sedimen
Sampel sedimen sebanyak 1 gram dimasukkan ke dalam mikrotub
e kemudian ditambahkan larutan fisiologis steril sebanyak 1 ml dan diho
mogenkan menggunakan vortex. Sedangkan sampel air diambil langsung
dari botol sampel yang telah dihomogenkan terlebih dahulu. Suspensi sa
mpel sedimen dan sampel air masing-masing diambil sebanyak 0,5 mL da
n dimasukkan ke dalam tabung reaksi berisi larutan fisiologis steril seban
yak 4,5 mL dan dihomogenkan untuk menghasilkan pengenceran 10 -1.
Selanjutnya dari pengenceran 10-1 diambil 0,5 mL dimasukkan ke dalam
tabung pengenceran 10-2 yang berisi larutan fisiologis steril sebanyak 4,5
17
mL, kemudian dihomogenkan menggunakan vortex. Selanjutnya
dilakukan pengenceran bertingkat hingga 10-4. Hasil dari pengenceran 10-2
hingga 10-4 diambil masing-masing 0,5 mL larutan sampel dengan
menggunakan mikropipet dan dilakukan penanaman menggunakan
metode pour plate. Selanjutnya dituang media marine agar, kemudian
dihomogenkan dengan memutar cawan petri mengikuti pola angka
delapan dan inkubasi pada suhu 28οC selama 18-24 jam.
3.3.5 Perhitungan Jumlah Koloni Bakteri
Perhitungan jumlah koloni bakteri yang tumbuh dilakukan dengan
menggunakan metode Total Plate Count (TPC). Hasil perhitungan jumlah
koloni bakteri kemudian dimasukkan ke dalam rumus:
Sampel sedimen :
Kelimpahan bakteri (CFU/g) = ∑ koloni x
1
pengenceran x volume ditanam ( mL ) x bobot sampel ( g)
Sampel air :
1
Kelimpahan bakteri (CFU/g) = ∑ koloni x
pengenceran x volume ditanam ( mL )
3.3.6 Pemurnian
Pemurnian (purification) bertujuan agar diperoleh biakan murni yang
diinginkan tanpa ada kontaminan dari mikroba lain. Pemilihan koloni mikroba
yang dimurnikan berdasarkan perbedaan kenampakan morfologi koloni, baik
dari segi warna, elevasi, tepian, ukuran, dan bentuk koloni sehingga diperoleh
isolat murni (Ed-har et al., 2017). Pemurnian isolat bakteri dari koloni media
marine agar dilakukan dengan cara memindahkan bakteri menggunakan
18
metode streak atau gores pada media marine agar. Jumlah koloni yang
dimurnikan sebanyak 32 dari setiap sampel. Setelah isolat dimurnikan, isolat
kemudian di uji gram dan dilakukan penyimpanan.
3.3.7 Uji Gram dengan KOH 3%
Uji Gram bertujuan untuk menentukan apakah bakteri tersebut termasuk
di dalam kelompok bakteri Gram positif atau kelompok bakteri Gram negatif.
Uji Gram dengan KOH ini dilakukan dengan mengambil 1 ose bakteri yang
berumur 18-24 jam dan meletakkannya di atas gelas preparat yang telah ditetesi
KOH 3% sebanyak 1-2 tetes dan dicampur-ratakan. Setelah itu, ose diangkat
secara perlahan. Apabila terbentuk benang lendir yang tidak terputus, maka
bakteri yang dikultur merupakan bakteri gram negatif, namun jika tidak
terbentuk benang lendir, maka bakteri tersebut termasuk bakteri gram positif
(Yuka et al., 2021). Kemudian hasil persentase gram positif dan gram negatif
dihitung dengan menggunakan rumus:
jumlah seluruh koloni Gram positif

Persentase Gram positif (%) = x 100
jumlah seluruh koloni yang diamati
jumlah seluruh koloni Gram negatif

Persentase Gram negatif (%) = x 100
jumlah seluruh koloni yang diamati
3.3.8 Penyimpanan Isolat Bakteri
Penyimpanan bakteri dilakukan dengan menyimpan isolat murni yang
telah diperoleh ke dalam media gliserol yang terdiri atas media marine broth
dan gliserol 15% yang selanjutnya disebut stok kultur (Badjoeri, 2010). Penyimp
anan dilakukan dengan mengambil satu ose bakteri dari isolat bakteri hasil
pemurnian, dimasukkan ke mikrotube 1,5 mL steril yang berisi media marine
broth steril sebanyak 850 µL. Isolat bakteri pada media marine broth
19
diinkubasi di rotary shaking inkubator pada suhu 28oC dengan 125 rpm selama 48
jam. Kemudian ditambahkan gliserol steril sebanyak 15% dari volume media
kultur yaitu sebanyak 150 µL. Sampel bakteri dihomogenkan menggunakan
vorteks kemudian disimpan dalam kulkas dengan suhu -20 oC.
3.3.9 Peremajaan Isolat Bakteri dari Stok
Peremajaan isolat dilakukan dengan memindahkan isolat sebanyak 25
isolat setiap sampel dari gliserol stock ke dalam media Marine Agar. Kemudian
ditumbuhkan dan diinkubasi selama 24 jam pada suhu 28 oC.
3.3.10 Uji Aktivitas Amilolitik
Isolat yang akan diuji diinokulasi ke atas media amilolitik sebanyak 25
isolat setiap sampel. Uji aktivitas dilakukan dengan cara menginokulasikan
sebanyak satu ose isolat bakteri pada satu titik diatas permukaan media pati.
Selanjutnya diinkubasi pada suhu 28 oC selama 24, 36, dan 48 jam. Pengamatan
zona bening dilakukan dengan memberikan beberapa tetes larutan lugol iodine
di atas permukaan media agar kemudian posisi cawan dibalik dengan media
berada di posisi atas. Bakteri yang positif bersifat amilolitik akan membentuk z
ona bening di sekitar koloni, sedangkan bakteri yang tidak bersifat amilolitik ti
dak membentuk zona bening pada sekitar koloni (Susilawati et al., 2015).
Diameter zona bening kemudian diukur.
3.3.11 Pengukuran Indeks Aktivitas Amilolitik
Pengukuran indeks aktivitas amilolitik (IA) dilakukan dengan cara meng
ukur diameter zona bening yang terbentuk di sekitar koloni kemudian dibagi d
engan diameter koloni bakteri yang tumbuh. Isolat dengan indeks aktivitas
20
amilolitik terbesar memiliki tingkat aktivitas enzim yang tinggi. Isolat amilolitik
diujikan kemampuannya berdasarkan indeks amilolitik (Goldbeck, 2012) :
diameter zona bening (cm )

Indeks aktivitas amilolitik =
diameter koloni(cm)
Adapun proporsi bakteri amilolitik dihitung dengan menggunakan rumus :
jumla h koloni bakteri amilolitik yang diperole h

Proporsi bakteri amilolitik (%) = X
jumla h seluru h koloni yang diamati
100
3.4 Waktu dan Tempat

Waktu pelaksanaan penelitian dimulai pada bulan September-November
2020, Maret-April 2021. Tempat pelaksanaan penelitian di Laboratorium Riset
Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan Universitas Jenderal Soedirman.
3.5 Analisis Data

Data yang diperoleh dari hasil penelitian berupa data jumlah kelimpahan
bakteri, morfologi koloni,proporsi sifat gram, indeks aktivitas bakteri amilolitik,
dan proporsi bakteri amilolitik. Data tersebut disajikan dalam bentuk gambar,
tabel, dan grafik, lalu dianalisa secara deskriptif dan dibandingkan dengan
literatur.
21
IV. HASIL DAN PEMBAHASAN
4.1 Kelimpahan Bakteri pada Air dan Sedimen Tambak Udang Vaname
Kelimpahan bakteri pada air dan sedimen tambak udang vaname di Bunton,
Adipala, Cilacap pada usia pemeliharaan 45 hari berhasil diamati dengan
menggunakan metode Total Plate Count (TPC). Kelimpahan bakteri yang didapa
tkan pada penelitian ini bervariasi pada setiap tambak yang dapat dilihat pada
Tabel 1.
Tabel 1. Kelimpahan bakteri pada air dan sedimen tambak udang vaname
Kelimpahan bakteri
Tambak
Air (104 ) (CFU/mL) Sedimen (106 ) (CFU/g)
Inlet 10 x 104 1,7 x 106
7.4 x 10 4
4,0 x 106
T6
0.14 x 104 Rata-rata 9,0 x 106 Rata-rata
T7
8.7 x104 5.7 x106
T8 18.6 x 104 4,1 x 106
Outlet 18 x 104 15,4 x106
Rata-rata 14 x 104 6,84 x 106
Keterangan : Inlet: tambak inlet; T6 : tambak 6 ; T7 : tambak 7; T8 : tambak 8;
Outlet : tambak outlet.
Berdasarkan Tabel 1, kelimpahan bakteri yang didapatkan pada air berkisar
antara 0,14-18,6 x 104 CFU/g. Kelimpahan bakteri tertinggi ditemukan di
tambak outlet (18 x 104 CFU/mL), diikuti pada tambak inlet (10 x 104 CFU/mL),
dan terendah pada tambak pembesaran (8.7 x104 CFU/mL). Hasil penelitian ini
sesuai dengan penelitian Nurbaya et al. (2013) kelimpahan bakteri pada air
tambak pembesaran udang vaname berkisar antara 104 – 105 CFU/mL. Rahayu
juga (2020) melaporkan kelimpahan bakteri pada air tambak pembesaran
udang vaname yaitu berkisar antara 1,5 x 104–3,9 x 104 CFU/mL. Pada kegiatan
penelitian ini diperoleh hasil bahwa kelimpahan bakteri di air tambak tersebut
22
masih tergolong dalam kondisi aman karena belum melewati ambang batas bak
teri umum yang diperbolehkan dalam perairan budidaya. Menurut Taslihan et
al. (2004) ambang batas minimal bakteri umum di perairan adalah 106 CFU/mL.
Sedangkan pada penelitian ini diperoleh hasil 10 4 CFU/mL hal tersebut menunj
ukkan bahwa total bakteri umum yang terdapat pada tambak masih dalam
jumlah yang wajar, sehingga tidak rentan terhadap serangan penyakit.
Kelimpahan bakteri pada sedimen berkisar antara 1,7-15,4 x 106 CFU/g.
Kelimpahan bakteri tertinggi ditemukan di sedimen tambak outlet (15,4 x 106 C
FU/g), diikuti di sedimen tambak pembesaran (5.7 x106 CFU/g ), dan terendah
pada sedimen tambak inlet (1,7x106 CFU/g). Hasil penelitian ini sesuai dengan
penelitian sebelumnya yang telah dilakukan oleh Maia et al. (2013) melaporkan
kelimpahan bakteri dari sedimen tambak udang vaname intensif berkisar
antara 4,56x104-5.6x104 CFU/g. Sabu et al. (2020) juga melaporkan kelimpahan
bakteri pada sedimen tambak udang vaname sebesar 1,0 × 1010 CFU g-1.
Rata-rata kelimpahan bakteri lebih tinggi di sedimen dibandingkan di air
(Tabel 1). Nilai rata-rata ini sesuai dengan penelitian sebelumnya bahwa total b
akteri pada sedimen (5,3 x109 CFU/ml) lebih tinggi dibandingkan dengan air (0
29 x 105 CFU/ml) (Shakibazadeh et al.,2009). Tingginya nilai kelimpahan bakteri
pada sedimen tambak menunjukkan bahwa komunitas bakteri lebih banyak di
sedimen daripada di air. Hal ini diduga disebabkan oleh tingginya nilai bahan
organik pada dasar tambak. Hasil penelitian sebelumnya yang telah dilakukan
oleh Kristiawan et al. (2014), menyatakan bahwa konsentrasi bahan organik
berkaitan erat dengan kelimpahan bakteri, dengan semakin tinggi konsentrasi
bahan organik maka semakin tinggi pula kelimpahan bakteri pada perairan
23
tersebut. Menurut Widiyanto (2006) populasi bakteri pada sedimen tambak um
umnya jauh lebih banyak daripada di air tambak karena lebih banyak bahan or
ganik di sedimen tambak yang disebabkan oleh akumulasi sisa pakan dan koto
ran ikan/udang. Disamping itu air tambak lebih sering diganti dan mendapatk
an kualitas air yang lebih baik melalui pertukaran air secara berkala.
Avnimelech dan Ritvo (2003) menyatakan bahwa, sedimen tambak yang kaya a
kan bahan organik dapat mengakibatkan pertumbuhan mikroorganisme menja
di sangat pesat. Sebagaimana yang disebutkan oleh Kunarso (2011), bahwa
perbedaan terhadap banyaknya jumlah bakteri sangat erat kaitannya dengan
konsentrasi kandungan bahan organik yang tersedia dalam kolom air yang
merupakan sumber nutrisi bagi bakteri. Keberadaan bahan organik diperlukan
dalam proses metabolisme mikroorganisme seperti bakteri sebagai sumber
energi dalam perkembangan dan pertumbuhannya (Kristiawan et al., 2014).
4.2 Pengamatan Morfologi Koloni pada Air dan Sedimen Tambak Udang Van
ame
Berdasarkan hasil pengamatan morfologi koloni bakteri secara
makroskopis diperoleh 14 tipe koloni bakteri pada air dan 31 tipe koloni bakteri
pada sedimen. menunjukkan 108 isolat bakteri yang diperoleh dari air tambak
24
udang vaname dapat dikelompokkan menjadi 14 tipe berdasarkan karakteristik
Gram dan morfologi koloni yang meliputi warna, bentuk, elevasi, tepi, dan
ukuran koloni bakteri. Tipe yang mendominasi adalah tipe 7 sebanyak 17
koloni yang mempunyai karakteristik bentuk circular, warna putih keruh,
elevasi convex ,tepi entire, ukuran sedang, dan bersifat Gram negatif.
Tabel 2. Pengamatan Morfologi Koloni pada Air Tambak Udang Vaname
Tipe Bentuk Warna Elevasi Tepian Ukuran Gram Total

Tipe 1 Irregular Putih Keruh Convex Entire Besar - 11
Tipe 2 Irregular Putih Keruh Convex Entire Besar + 5
Tipe 3 Irregular Putih Keruh Convex Entire Sedang - 12
Tipe 4 Irregular Putih Keruh Convex Entire Sedang + 4
Tipe 5 Circular Putih Keruh Convex Entire Besar - 10
Tipe 6 Circular Putih Keruh Convex Entire Besar + 3
Tipe 7 Circular Putih Keruh Convex Entire Sedang - 17
Tipe 8 Circular Putih Keruh Convex Entire Sedang + 5
Tipe 9 Circular Putih Keruh Convex Entire Kecil + 9
Tipe 10 Circular Putih Keruh Convex Entire Kecil - 16
Tipe 11 Circular Kuning Convex Undulate Sedang - 1
Tipe 12 Circular Putih Keruh Pulvinate Entire Besar - 6
Tipe 13 Circular Putih Keruh Pulvinate Entire Besar + 5
Tipe 14 Circular Putih Keruh Pulvinate Entire Sedang - 4
Total 108
Secara umum koloni bakteri yang ditemukan pada air memiliki bentuk
circular atau irregular, berwarna kuning atau putih keruh, berelevasi convex atau
pulvinate, bertepi entire atau undulate, memiliki ukuran bervariasi, dan bersifat
Gram negatif atau positif.
Hasil pengamatan karakteristik Gram dan morfologi koloni menunjukka
n adanya 31 tipe bakteri di sedimen tambak (Tabel 3). yang mendominasi
adalah tipe 4 sebanyak 20 koloni yang mempunyai bentuk irregular, warna
putih keruh, elevasi convex, tepi entire, ukuran besar, dan bersifat gram negatif.
25
Tabel 3. Pengamatan Morfologi Koloni pada Sedimen Tambak Udang Vaname
Tipe Bentuk Warna Elevasi Tepian Ukuran Gram Total
Tipe 1 Irregular Putih Keruh Pulvinate Entire Besar + 3
Tipe 2 Irregular Putih Keruh Pulvinate Entire Besar - 1
Tipe 3 Irregular Putih Keruh Pulvinate Entire Sedang + 2
Tipe 4 Irregular Putih Keruh Convex Entire Besar - 20
Tipe 5 Irregular Putih Keruh Convex Entire Besar + 4
Tipe 6 Irregular Putih Keruh Convex Entire Sedang - 7
Tipe 7 Irregular Putih Keruh Convex Entire Kecil + 2
Tipe 8 Irregular Putih Keruh Convex Undulate Kecil - 2
Tipe 9 Irregular Putih Keruh Convex Undulate Kecil + 1
Tipe 10 Irregular Putih Keruh Convex Undulate Besar - 3
Tipe 11 Irregular Putih Keruh Convex Undulate Sedang - 4
Tipe 12 Irregular Kuning Convex Entire Besar - 2
Tipe 13 Irregular Kuning Convex Entire Besar + 1
Tipe 14 Irregular Kuning Convex Undulate Kecil - 1
Tipe 15 Circular Putih Keruh Convex Entire Besar + 7
Tipe 16 Circular Putih Keruh Convex Entire Besar - 14
Tipe 17 Circular Putih Keruh Convex Entire Sedang - 6
Tipe 18 Circular Putih Keruh Convex Entire Sedang + 2
Tipe 19 Circular Putih Keruh Convex Entire Kecil - 14
Tipe 20 Circular Putih Keruh Convex Entire Kecil + 5
Tipe 21 Circular Putih Keruh Pulvinate Entire Besar - 4
Tipe 22 Circular Putih Keruh Pulvinate Undulate Besar - 4
Tipe 23 Circular Putih Keruh Pulvinate Entire Sedang + 1
Tipe 24 Circular Putih Keruh Pulvinate Entire Kecil + 2
Tipe 25 Circular Kuning Convex Entire Sedang + 5
Tipe 26 Circular Kuning Convex Entire Sedang - 2
Tipe 27 Circular Kuning Convex Entire Besar - 1
Tipe 28 Circular Kuning Convex Entire Kecil + 1
Tipe 29 Spindle Putih Keruh Convex Entire Sedang - 1
Tipe 30 Spindle Putih Keruh Convex Entire Besar - 2
Tipe 31 Spindle Putih Keruh Convex Entire Besar + 1
Total 125
Secara umum koloni bakteri yang ditemukan pada sedimen memiliki
bentuk yang bervariasi yaitu circular, irregular, dan spindle, berwarna kuning ata
u putih keruh, berelevasi convex atau pulvinate, bertepi entire atau undulate.
Ukuran koloni bakteri terdiri dari kecil, sedang, dan besar. Gram bakteri yaitu
positif dan negatif.
Hasil pengamatan morfologi koloni isolat bakteri yang ditemukan pada
penelitian ini sesuai dengan pernyataan Cappuccino dan Sherman (1987)
bahwa pada umumnya bentuk koloni bakteri berbentuk circular, irregular,
filamentous, rhizoid. Elevasi berbentuk raised, convex, flat, umbonate, crateriform.
26
Tepian yang berbentuk entire, undulate, filiform, curled dan lobate. Setiawati (2008)
melaporkan bakteri yang diisolasi dari tambak pembesaran udang vaname dite
mukan beberapa tipe bakteri yang berwarna putih atau kuning. Warna koloni
bakteri yang berbeda-beda menunjukkan berbedanya pigmen yang dikandung.
Pigmen yang terdapat pada bakteri dapat memberikan warna yang berbeda-
beda seperti warna merah dan kuning apabila bakteri mengandung karatenoid.
Dibuktikan oleh penelitian Arlita et al. (2013) yang berhasil mengisolasi bakteri
dari Perairan Teluk Awur Jepara ditemukan 2 bakteri yang mengandung
pigmen karotenoid yaitu Brevibacterium maris dan Paracoccus alcaliphilus.
Berdasarkan pengamatan makroskopis yang telah dilakukan diperoleh
hasil yang bervariasi. Hal ini menunjukkan setiap koloni yang ditemukan pada
air dan sedimen memiliki ciri-ciri morfologi yang berbeda. Perbedaan penam
pakan morfologi koloni mengindikasikan bahwa setiap isolat berasal dari spesi
es yang berbeda. Safrida et al. (2012) mengemukakan bahwa perbedaan bentuk
bakteri dipengaruhi oleh beberapa faktor meliputi faktor lingkungan (biotik da
n abiotik), faktor makanan (medium pertumbuhan), dan suhu. Hasyimuddin et
al. (2016) juga mengemukakan bahwa adaptasi bakteri terhadap lingkungannya
akan mempengaruhi bentuk morfologi dan struktur anatomi bakteri untuk bert
ahan hidup. Menurut Cappucino dan Sherman (2005) keragaman bentuk morf
ologi koloni dapat mengindikasikan bahwa masing-masing koloni memiliki
karakter yang berbeda. Namun, perbedaan pada kenampakan morfologi belum
cukup untuk digunakan sebagai parameter identifikasi sehingga perlu melakuk
an pengamatan mikroskopis dan sifat biokimia dari setiap isolat tersebut. Sifat
27
biokimia yang diamati merupakan ciri yang penting untuk proses identifikasi
(Lay, 1994).
4.3 Proporsi Bakteri Berdasarkan Sifat Gram

Pengamatan sifat Gram menggunakan KOH 3% menunjukkan adanya bakte
ri Gram negatif dan positif melalui ada tidaknya suspensi kental seperti lendir.
Bakteri Gram positif tidak menghasilkan lendir, sedangkan sel bakteri Gram ne
gatif berlendir karena penambahan KOH 3% dapat mendestruksi dinding sel
(Hardiansyah et al., 2020). Bakteri Gram positif memiliki struktur dinding sel
dengan kandungan peptidoglikan yang tebal, sedangkan bakteri Gram negatif
memiliki struktur dinding sel dengan kandungan lipid yang tinggi (Devita,
2016). Proporsi bakteri Gram positif dan Gram negatif pada air dan sedimen
tambak udang vaname dapat dilihat pada Gambar 4.
100
80
68 64
Proporsi (%)
60 80 75 72
40 Gram -
Gram +
20 32 36
20 25 28
0
Inlet T6 T7 T8 Outlet
A Tambak
28
100
80
60 52
64
Proporsi (%)
60 80
96
40 Gram -
48 Gram +
20 40 36
20
0 4
Inlet T6 T7 T8 Outlet
B Tambak
Keterangan : A : Air tambak, B : Sedimen tambak; Inlet: tambak inlet; T6 : tambak 6 ; T7 :

tambak 7; T8 : tambak 8; Outlet : tambak outlet.
Gambar 4. Proporsi Gram pada Air dan Sedimen Tambak Udang Vaname
Berdasarkan Gambar 4, hasil pengamatan menunjukkan komunitas
bakteri di air dan sedimen tambak didominasi oleh bakteri Gram negatif.
Proporsi bakteri Gram negatif di air berkisar antara 64-80%, sedangkan pada
sedimen berkisar antara 52-96%. Dalam penelitian ini sebagian besar dari isolat
yang diperoleh adalah Gram negatif. Hal ini didukung dengan pendapat
Rheinheimer (1991) sebagian besar bakteri perairan laut dan pantai adalah
bersifat Gram negatif. Hasil ini sesuai dengan hasil penelitian Naim Uddin dan
Al-Harbi (2005) yang menunjukkan komunitas bakteri pada tambak udang
galah di Arab Saudi didominasi oleh bakteri Gram negatif (80%). Shakibazadeh
et al. (2009) melaporkan komunitas bakteri pada tambak udang windu di
Malaysia didominasi oleh bakteri Gram negatif (72%). Menurut Ampou et al.
(2015) spesies bakteri Gram negatif pada umumnya bersifat patogen karena
membran luar pada dinding selnya mengandung lapisan polisakarida atau
endotoksin yang bersifat toksik bagi inang. Hal ini serupa dengan penelitian
Rahmaningsih et al. (2012) yang mendapatkan 4 bakteri Gram negatif dari total
29
7 isolat yang diisolasi dari perairan pantai dan kawasan tambak di Kabupaten
Tuban diantaranya bakteri yang bersifat patogen yaitu Enterobacter aglomerans,
Vibrio cholera, Pseudomonas aeruginosa, dan P. pseudomallei.
4.4 Hasil Penapisan Bakteri Amilolitik

Penapisan bakteri amilolitik dari 3 tambak udang vaname beserta bagian inl
et dan outletnya di daerah Adipala, Cilacap berhasil dilakukan menggunakan
media TSA yang mengandung pati 1% (Gambar 5). Bakteri amilolitik merupaka
n bakteri yang mampu mendegradasi pati. Kemampuan hidrolisis bakteri amilo
litik dapat dilihat dari terbentuknya zona bening yang telah diinokulasikan pad
a media pati. Zona bening di sekitar koloni menunjukkan pati telah didegradasi
menjadi dekstrin, glukosa, dan maltosa. Hasil pengujian indeks amilolitik
digunakan untuk mengukur tingkat kemampuan bakteri dalam menghidrolisis
substrat pati melalui rasio zona bening yang dihasilkan selama 48 jam inkubasi.
Koloni Bakteri
Media Pati
Zona Bening
Gambar 5. Bakteri Amilolitik dari Lingkungan Tambak Udang Vaname yang

Ditumbuhkan pada Media TSA yang mengandung pati 1%
Isolat amilolitik ditemukan pada sampel air dan sedimen di area tambak.
Pada Tabel 4 menggambarkan proporsi isolat amilolitik yang ditemukan pada a
ir (43%), sedangkan pada sedimen (27%). Hal ini menunjukkan lingkungan
tambak mendukung pertumbuhan bakteri amilolitik. Bakteri amilolitik adalah
30
salah satu dari bakteri heterotrofik yang mampu mendegradasi bahan organik.
Pertumbuhan bakteri heterotrofik di perairan didukung oleh faktor lingkungan,
diantaranya yaitu kadar oksigen terlarut (DO), pH, salinitas, dan suhu
(Winarni, 2016).
Sebanyak 80 isolat amilolitik diperoleh dari sampel air dan sedimen (). P
enapisan bakteri amilolitik dari semua sampel diperoleh hasil sebagai berikut: d
ari air diperoleh 46 isolat, sampel sedimen 34 isolat. Indeks amilolitik (IA) pada
air berkisar antara 0,3–3,8, pada sedimen berkisar antara 0,2-4,3 (Tabel 5). Isolat
diseleksi berdasarkan indeks amilolitik terbesar yang dihasilkan masing-
masing isolat. Jamilah (2011) melaporkan Isolat-isolat amilolitik yang memiliki i
ndeks tinggi yaitu memiliki indeks ≥2.5 sehingga dalam penelitian ini diseleksi
beberapa isolat yang memiliki indeks ≥2.5 (Error: Reference source not found).
Tabel 4. Proporsi Bakteri Amilolitik
Sumber Isolat Total Isolat Diuji Amilolitik Proporsi (%)

Air 108 46 43
Sedimen 125 34 27
Tabel 5. Pengamatan Indeks Amilolitik pada Air dan Sedimen Tambak Udang
Vaname
Sumber Isolat Total Isolat Kisaran Rata-rata

Air 46 0,3–3,8 0,63 ± 1,04
Sedimen 34 0,2-4,3 0,80 ± 1,04
Tabel 6. Isolat-isolat amilolitik yang memiliki indeks ≥ 2.5
Kode Isolat Indeks Amilolitik

AI19 3,0
A619 2,5
A623 3,8
AO1 3,8
31
AO5 3,6
SI4 3,0
SI5 2,6
SI13 3,6
S62 2,5
S612 3,2
S618 2,6
S620 2,7
S624 3,0
S86 4,3
Keterangan : AI 19 : Air tambak inlet isolat 19, dst; A6 19 : Air tambak 6 isolat 19, dst; AO1: Air
tambak outlet isolat 1, dst; SI 4 : sedimen tambak inlet isolat 4, dst; S6 2 :
sedimen tambak 6 isolat 2, dst; S8 6 : sedimen tambak 8 isolat 6.
Pada penelitian ini diperoleh 14 isolat terpilih yang memiliki indeks amilo
litik tinggi yaitu ≥ 2,5 (Error: Reference source not found) yang berpotensi seba
gai penghasil enzim amilase. Wang et al. (2007), dan Dajanta (2009) menyeleksi i
solat penghasil enzim potensial berdasarkan indeks aktivitas yang tertinggi dar
i isolat yang didapatkan. Dari sampel air diperoleh 5 dari 46 isolat memiliki ind
eks amilolitik ≥2.5 yang terdiri atas isolat AI19, A619, A623, AO1 dan AO5, seda
ngkan dari sedimen didapatkan 9 dari 34 isolat yang menghasilkan zona hidroli
sis ≥2.5 yaitu isolat SI14, SI15,SI13, S62,S612, S618, S620, S624, dan S86. Dari hasi
l perhitungan indeks amilolitik pada sampel sedimen diperoleh isolat S86
dengan indeks amilolitik tertinggi yaitu 4.3, sedangkan isolat S61 menunjukkan
indeks amilolitik terendah yaitu 0,2. Sedangkan pada sampel air nilai indeks a
milolitik tertinggi dihasilkan oleh isolat A623 dan AO1 yaitu masing-masing 3,8,
sedangkan nilai indeks amilolitik terendah dihasilkan oleh AI16 yaitu 0,3.
Dalam penelitian Sundari et al., (2019) indeks amilolitik tertinggi yang
didapatkan dari sedimen mangrove di Wonorejo, Surabaya yaitu sebesar 1,00, s
edangkan pada penelitian Anggorowati et al. (2019) indeks amilolitik tertinggi
yang diperoleh dari sedimen pantai Medana yaitu sebesar 6,6. Jamilah (2011) m
32
elaporkan indeks amilolitik tertinggi yang didapatkan dari tambak udang vana
me di Karawang, Jawa Barat pada sedimen sebesar 6,2 sedangkan pada air
sebesar 2,6.
Pada penelitian ini isolat asal sedimen memiliki indeks amilolitik yang leb
ih tinggi daripada isolat asal air. Hal ini diduga karena bakteri amilolitik pada
sedimen memperoleh substrat pati/amilum lebih tinggi daripada badan air yan
g berasal dari akumulasi bahan organik dari sisa pakan dan metabolisme udang
pada dasar tambak. Sukenda et al. (2006) melaporkan penambahan sukrosa seb
agai sumber karbon pada media budidaya udang vaname dapat meningkatkan
jumlah populasi total bakteri heterotropik hingga mencapai 107 cfu/mL. Krishn
an et al., (2014) membuktikan bahwa produksi amilase menjadi maksimum den
gan adanya pati sebagai sumber karbon dari Bacillus sp yang diisolasi dari sedi
men laut.
Sebanyak 80 isolat amilolitik diperoleh dari sampel air dan sedimen deng
an isolat terpilih dengan indeks amilolitik tinggi sebanyak 14 isolat. Isolat
terpilih tersebut berpotensi dimanfaatkan sebagai kandidat konsorsium probiot
ik untuk bioremidiasi limbah organik pada tambak. Menurut Anggorowati et al.,
(2019) 12 isolat bakteri amilolitik yang diisolasi dari sedimen Pantai Medana m
emiliki potensi besar untuk dijadikan sebagai kandidat probiotik. Pengujian akt
ivitas amilolitik pada identifikasi bakteri sebagai kandidat probiotik penting dil
akukan untuk mengetahui kemampuan bakteri dalam menghasilkan enzim ami
lase yang digunakan dalam hidrolisis amilum. Kandidat bakteri probiotik yang
diperoleh dari hasil penelitian ini dapat digunakan untuk uji lanjutan dengan d
33
iaplikasikan pada fase pemeliharaan udang vaname yang merupakan salah sat
u tahapan kegiatan budidaya.
34
V. KESIMPULAN DAN SARAN
5.1 Kesimpulan
Berdasarkan penelitian yang telah dilakukan dapat disimpulkan bahwa :
1. Bakteri amilolitik ditemukan pada lingkungan tambak dengan proporsi p
ada air (43%), sedangkan pada sedimen (27%).
2. Indeks aktivitas bakteri amilolitik pada air berkisar antara 0,3–3,8.
Sedangkan pada sedimen berkisar 0,2-4,3. Indeks aktivitas bakteri ami
lolitik tertinggi pada air yaitu 3,8, sedangkan pada sedimen 4,3. Sebanyak
14 isolat bakteri amilolitik memiliki indeks aktivitas yang tinggi (≥2,5).
5.2 Saran
Penelitian lebih lanjut perlu dilakukan untuk mengetahui potensi dari isol
at bakteri amilolitik dengan indeks amilolitik tinggi sebagai kandidat konsorsiu
m probiotik untuk meningkatkan produksi akuakultur.
35
DAFTAR PUSTAKA
Ali, F. H. M., Samadan, G. M., dan Malan, S. 2020. Peranan Probiotik dalam
Budidaya Ikan dan Udang Sistem Bioflok. Zona Akuatik Banggai Journal, 2(2):
17–29.
Ampou, E. E., Triyulianti, I., dan Nugroho, S. C. 2015. Bakteri Asosiasi pada
Karang Scleractinia Kaitannya dengan Fenomena La-Nina di Pulau
Bunaken. Jurnal Kelautan Nasional, 10(2), 55–63.
Andriani, Y., Hermawati, A., Sari, W., dan Yudha, I. 2019. Tingkat Dekomposisi
Bahan Organik Pada Substrat Dasar Tambak Udang Vannamei (Litopenaeus
vannamei) di Desa Patas Bagian Timur , Buleleng , Bali. Aquatic Science II,
86, 79–86.
Anggorowati, D. A., Munandar, H., dan Indriana, L. F. 2019. Isolasi Dan
Penapisan Bakteri Penghasil Enzim Protease,Selulase,Dan Amilase Dari
Sedimen Dan Saluran Pencernaan Teripang Hitam (Holothuria atra). Jurnal
Ilmu Dan Teknologi Kelautan Tropis, 11(2), 377–386.
Ari, W. 2012. Isolasi dan Seleksi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler
(proteolitik, amilolitik, lipolitik dan selulolitik) yang Berasal dari Sedimen
Kawasan Mangrove (Isolation and Selection of Extracellular Enzyme
Producing Bacteria Originating from Mangrove Sedimen. Ilmu Kelautan:
Indonesian Journal of Marine Sciences, 17(3), 164–169.
Arlita, N. R., Radjasa, O. K., dan Santoso, A. 2013. Identifikasi Pigmen
Karetonoid Pada Bakteri Simbion Rumput Laut (Kappahycus alvarezii).
Diponegoro Journal of Marine Research, 2(3), 58–67.
Arsad, S., Afandy, A., Purwadhi, A. P., Maya V, B., Saputra, D. K., dan Buwono,
N. R. 2017. Studi Kegiatan Budidaya Pembesaran Udang Vaname
(Litopenaeus vannamei) dengan Penerapan Sistem Pemeliharaan Berbeda
Jurnal Ilmiah Perikanan Dan Kelautan, 9(1), 1.
Avnimelech, Y., dan Ritvo, G. 2003. Shrimp and fish pond soils: Processes and
management. Aquaculture, 220(1–4), 549–567.
Ayuningrum, D., Sabdaningsih, A., dan Eko Jati, O. 2021. Screening of
actinobacteria-producing amylolytic enzyme in sediment from litopenaeus
vannamei (Boone, 1931) ponds in Rembang district, Central Java,
Indonesia. Biodiversitas, 22(4), 1819–1828.
Balcázar, J. L., Blas, I. de, Ruiz-Zarzuela, I., Cunningham, D., Vendrell, D., dan
Múzquiz, J. L. 2006. The role of probiotics in aquaculture. Veterinary
Microbiology, 114(3–4), 173–186.
Borght, V. Der, Anne, Goesaert, H., Veraverbeke, W. S., dan Delcour, J. A. 2005.
Fractionation of wheat and wheat flour into starch and gluten: Overview of
the main processes and the factors involved. Journal of Cereal Science, 41(3),
221–237.
Cahyandi, K., Academy, M., dan Cilacap, N. 2020. Reformasi Sektor
Kemaritiman Bagi Pembangunan Ekonomi. Cilacap National Conference On
Maritime And Multidisciplinary Study, November 2018, 1–24.
Cappuccino, JG.& Sherman, N. 1987. Microbiology: A Laboratory Manual. The
Benjamin/Cummings Publishing Company,Inc.
Cappucino, J.G. dan Sherman, N. 2005. Microbiology A Laboratory Manual. Ne
36
w York: Benjamin Cummings
de Paiva-Maia, E., Alves-Modesto, G., Otavio-Brito, L., Olivera, A., dan
Vasconcelos-Gesteira, T. C. 2013. Effect of a commercial probiotic on
bacterial and phytoplankton concentration in intensive shrimp farming
(Litopenaeus vannamei) recirculation systems. Latin American Journal of
Aquatic Research, 41(1), 126–137.
Devita Fitriani. 2016. Isolasi, Seleksi, dan Identifikasi Bakteri Kitinolitik pada 12
Cairan Tanaman Kantong Semar (Nepenthes Spp.) sebagai Agen Biokontrol.
Skripsi. Bogor : Institut Pertanian Bogor.
Dugassa, H., dan Gaetan, D. G. 2018. Biology of White Leg Shrimp, Penaeus
vannamei: Review. World Journal of Fish and Marine Sciences, 10(2), 5–17.
Ed-har, A. A., Widyastuti, R., dan Djajakirana, G. 2017. Isolasi Dan Identifikasi
Mikroba Tanah Pendegradasi Selulosa Dan Pektin Dari. Buletin Tanah Dan
Lahan, 1(1), 58–64.
F.J. Gatesoupe. 1999. The use of probiotics in aquaculture. 180(1), 147–165.
FAO. 2001. Through the Microbial Looking Glass: Premature Labor,
Preeclampsia, and Gestational Diabetes: A Scoping Review. RqJournal of
Perinatal and Neonatal Nursing, 33(1), 35–51.
Firmansyah, A. 2016. Terapi Probiotik dan Prebiotik pada Penyakit Saluran
Cerna Anak. Sari Pediatri, 2(4), 210.
Fuady, M. F., Supardjo, M. N., dan Haeruddin. 2013. Pengaruh Pengelolaan
Kualitas Air Terhadap Tingkat Kelulushidupan Dan Laju Pertumbuhan
Udang Vaname. Jurnal Maquares, 2, 155–162.
Gunarto, G., Suwoyo, H. S., dan Tampangallo, B. R. 2012. Budidaya Udang
Vaname Pola Intensif Dengan Sistem Bioflok Di Tambak. Jurnal Riset
Akuakultur, 7(3), 393.
Haliman, R. ., & Adijaya, D. 2006. Udang Vannamei. Penebar Swadaya.
Hardiansyah, M. Y., Musa, Y., dan Jaya, A. M. 2020. Identifikasi Plant Growth
Promoting Rhizobacteria pada Rizosfer Bambu Duri dengan Gram KOH
3%. Agrotechnology Research Journal, 4(1), 41–46.
Haryani, K., Samsudin, A. M., & Satriadi, H. 2014. Pembuatan Dekstrin Dari Pati
Sorgum Secara Hidrolisis Menggunakan Enzim Α -Amilase.
Hasyimuddin, H., Natsir Djide, M., dan Farid Samawi, M. 2016. Isolasi Bakteri
Pendegradasi Minyak Solar Dari Perairan Teluk Pare-Pare. Biogenesis:
Jurnal Ilmiah Biologi, 4(1), 41–46.
Istini, I. 2020. Pemanfaatan Plastik Polipropilen Standing Pouch Sebagai Salah
Satu Kemasan Sterilisasi Peralatan Laboratorium. Indonesian Journal of
Laboratory, 2(3), 41.
Jamilah, It. 2011. Pada Budi Daya Udang It Jamilah Sekolah Pasca Sarjana.
Screening.
Jamilah, IT, Meryandini, A., Rusmana, I., Suwanto, A., dan Rachmania
Mubarik, N. 2009. Activity of Proteolytic and Amylolytic Enzymes from
Bacillus spp. Isolated from Shrimp Ponds. MIcrobiology Indonesia, 3(2), 67–
71.
Jeanua, S., Putra, W., Nitisupardjo, M., dan Widyorini, N. 2014. Analisis
Hubungan Bahan Organik Dengan Total Bakteri Pada Tambak Udang
Intensif Sistem Semibioflok Di BBPBAP Jepara. Diponegoro Journal of
Maquares, 3(3), 121–129.
37
Komarawidjaja, W. 2003. Pengaruh Aplikasi Konsorsium Mikroba Penitrifikasi
Terhadap Konsentrasi Amonia(NH3) Pada Air Tambak. Jurnal Teknik
Lingkungan, 4(2), 62-67.
Koswara, S. 2009. Teknologi modifikasi pati. EbookPangan, 1–32.
http://tekpan.unimus.ac.id/wp-content/uploads/2013/07/TEKNOLOGI-
MODIFIKASI-PATI.pdf
Krishnan, A., Kumar, G., dan Rao, B. 2014. Optimization, production and partial
purification of extracellular α-amylase from Bacillus sp. Marini Book-Recent
trends and future prospects of Environmental Biotechnology View project
CRISPR View project. May 2014.
Kristiawan, D., Widyorini, N., dan Haeruddin. 2014. Hubungan Total Bakteri
Dengan Kandungan Bahan Organik Total Di Muara Kali Wiso, Jepara.
Diponegoro Journal of Maquares, 3(4), 24–33.
Kunarso, D. H. 2011. Kajian kesuburan ekosistem perairan laut Sulawesi
Tenggara berdasarkan aspek bakteriologi. Jurnal Ilmu Dan Teknologi
Kelautan Tropis, 3(2), 32–47.
Kurniawati, A. 2015. Isolasi, Seleksi dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim
Ekstraseluler dari Saluran Pencernaan dan Sedimen Tambak Budidaya
Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) [Universitas Airlangga]. In
Universitas Airlangga, Surabaya (Issue September).
Lay, B. W. 1994. Analisa Mikroba Di Laboratorium. Edisi 1. Cetakan 1. Raja Graf
indo Persada. Jakarta
Lestari, P. B. 2016. Biodegradasi Limbah Cair Tahu Dari Mikroorganisme
Indigen Sebagai Bahan Ajar Mikrobiologi Lingkungan Di Perguruan
Tinggi. Jurnal Edukasi Matematika Dan Sains, 2(1), 84.
Mansyur, A., dan Tangko, A. M. 2008. Probiotik: Pemanfaatannya Untuk Pakan
Ikan Berkualitas Rendah. Media Akuakultur, 3(2), 145.
Marlida, R., dan Elrifadah, E. 2017. Isolation and Enzymatic Activity Test of
Probiotic Candidate From Danau Panggang Swamp Economical Fishes
Digestive Tract. Fish Scientiae, 7(2), 133.
Martínez Cruz, P., Ibáñez, A. L., Monroy Hermosillo, O. A., dan Ramírez Saad,
H. C. 2012. Use of Probiotics in Aquaculture. ISRN Microbiology, 2012, 1–13.
Murti Pratiwi, N. T., Hariyadi, S., Ayu, I. P., Apriadi, T., Iswantari, A., dan
Wulandari, D. Y. 2019. Pengelolaan Kandungan Bahan Organik pada
Limbah Cair Laboratorium Proling MSP-IPB dengan Berbagai Kombinasi
Agen Bioremediasi. Jurnal Biologi Indonesia, 15(1), 89–95.
Mustafa, M. F., Bunga, M., dan Achmad, M. 2019. Use of Probiotics to Fight
Bacterial Populations of Vibrio sp. on Vaname Shrimp Cultivation
(Litopenaeus vannamei). Torani : Journal of Fisheries and Marine Science, 2(2),
69–76.
Nababan, E., Putra, I., dan Rusliadi. 2015. Pemeliharaan Udang Vaname
(Litopenaeus vannamei) Dengan Persentase Pemberian Pakan Yang Berbeda.
Jurnal Ilmiah Perikanan Dan Kelautan, 3(2).
Naim Uddin, M., dan Al-Harbi, A. H. 2005. Quantitative and qualitative
bacterial flora of giant freshwater prawn Macrobrachium rosenbergii
cultured in earthen ponds in Saudi Arabia. Journal of Aquatic Animal Health,
17(3), 244–250.
Nimrat, S., Suksawat, S., Maleeweach, P., dan Vuthiphandchai, V. 2008. Effect
38
of different shrimp pond bottom soil treatments on the change of physical
characteristics and pathogenic bacteria in pond bottom soil. Aquaculture,
285(1–4), 123–129.
Nugroho, A. D., Rifani, A., Winaryo, W., Masduqi, E., Tyas, D. W., Widayanti,
R., Masithah, R. A., Romadon, R. D., Sulissetiyo, T., Reiningsih, R., dan
Topo, A. H. 2020. Penguatan Strategi Untuk Pengembangan Minapolitan
Kabupaten Cilacap. Jurnal Sosial Ekonomi Kelautan Dan Perikanan, 15(2), 145.
Nurbaya, Mansyur, A., dan Kadriah, I. A. K. 2013. Dinamika Kelimpahan
Bakteri pada Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Intensif
dengan Penambahan Molase dan Pergiliran Pakan. Prosiding Forum Inovasi
Teknologi Akuakultur, 381–388.
Pangesti, T. P., Wiyono, E. S., Baskoro, M. S., Nurani, T. W., dan Wiryawan, B.
2016. Status Bio-Ekonomi Sumberdaya Udang Di Kabupaten Cilacap.
Jurnal Sosial Ekonomi Kelautan Dan Perikanan, 10(2), 149.
Pitrianingsih, C., Suminto, dan Sarjito. 2014. Pengaruh Bakteri Kandidat
Probiotik Terhadap Perubahan Kandungan Nutrien C,N,P dan K Media
Kultur Lele Dumbo (Clarias gariepinus). Journal of Aquaculture Management
and Technology, 3(4), 247–256.
Purnamasari, I., Purnama, D., dan Utami, M. A. F. 2017. Pertumbuhan Udang
Vaname (Litopenaeus vannamei) Di Tambak Intensif. Jurnal Enggano, 2(1),
58–67.
Purnomo, A. H., Reswati, E., dan Hikmah, H. 2004. Pengembangan Industri
Perikanan Di Sekitar Kawasan Ekologis Penting: Studi Kasus Cilacap.
Jurnal Penelitian Perikanan Indonesia, 10(7), 13.
R. Goldbeck,. 2012. Screening and identification of cellulase producing yeast-
like microorganisms from Brazilian biomes. African Journal of Biotechnology,
11(53), 11595–11603.
Rahayu, A. M. 2020. SKRIPSI Agustina Meilinda_165080100111012 - AGUSTINA
MEILINDA RAHAYU.pdf.
Rahmaningsih, S., Wilis, S., & Achmad, M. 2012. Bakteri Patogen di Perairan
Pantai dan Kawasan Tambak di kecamatan Jenu Kabupaten Tuban.
Ekologia, 12(1), 1–5.
Sabu, E. A., Gonsalves, M. J., Nazareth, D., dan Sreepada, R. A. 2022. Influence
of environmental variables on methane related microbial activities in a
tropical bio-secured zero-exchange shrimp culture system. Aquaculture
Reports, 22(December 2020), 100950.
Safrida, Y. D., Yulvizar, C., dan Devira, C. N. 2012. Isolasi dan karakterisasi
bakteri berpotensi probiotik pada ikan kembung (Rastrelliger sp.). Depik
Jurnal, 1(3), 200–203.
Sahu, M. K., Swarnakumar, N. S., Sivakumar, K., Thangaradjou, T., dan
Kannan, L. 2008. Probiotics in aquaculture: Importance and future
perspectives. Indian Journal of Microbiology, 48(3), 299–308.
Saranraj, D. P., & Naidu, M. A. 2013. Bacterial Amylase: A Review. International
Journal of Pharmaceutical & Biological Archives, 4(2), 274–287.
Setiawati, M. 2008. Bakteri Probiotik Dalam Budidaya Udang: Seleksi,
Mekanisme Aksi, Karakterisasi, Dan Aplikasinya Sebagai Agen Biokontrol.
Jurnal Ilmu Pertanian Indonesia, 13(2), 80–89.
Shakibazadeh, S., Saad, C. R., Christianus, A., Kamarudin, M. S., Sijam, K.,
39
Shamsudin, M. N., dan Neela, V. K. 2009. Bacteria flora associated with
different body parts of hatchery reared juvenile Penaeus monodon, tanks
water and sediment. Annals of Microbiology, 59(3), 425–430.
Silaban, S., dan Simamora, P. 2018. Isolasi dan Karakterisasi Bakteri Penghasil
Amilase dari Sampel Air Tawar Danau Toba. EduChemia (Jurnal Kimia Dan
Pendidikan), 3(2), 222.
Suciati, P., Tjahjaningsih, W., Dewi Masithah, E., dan Pramono, H. 2019.
Aktivitas Enzimatis Isolat Bakteri Asam Laktat dari Saluran Pencernaan
Kepiting Bakau (Scylla spp.) Sebagai Kandidat Probiotik. Jurnal Ilmiah
Perikanan Dan Kelautan, 8(2), 94.
Sukenda, Hadi, H. 2006. Pengaruh Pemberian Sukrosa Sebagai Sumber Karbon
Dan Probiotik Terhadap Dinamika Populasi Bakteri dan Kualitas Air
Media Budidaya Udang Vaname, (Litopenaeus vannamei). Akuakultur
Indonesia, 5(2), 179–190.
Sundari, A. S., Purwani, N. N., dan Kurniati, A. 2019. Isolasi Dan Penentuan
Indekshidrolisis Bakteri Amilolitik Dari Tanah Sediment Mangrove Di
Wonorejo, Surabaya. Quantum: Jurnal Inovasi Pendidikan Sains, 10(1), 38.
Supono. 2017. Teknologi produksi udang. In Teknologi Produksi Udang.
Universitas Lampung.
http://repository.lppm.unila.ac.id/27132/2/DOKUMEN Teknologi
Produksi Udang.pdf
Susilawati, I. O., Batubara, U. M., dan Riany, H. 2015. Analisis Aktivitas Enzim
Amilase yang Berasal Dari Bakteri Tanah di Kawasan Universitas Jambi.
Semirata, 4(1), 359–367.
Suwoyo, H. S., Fahrur, M., Makmur, M., dan Syah, R. 2016. Pemanfaatan
Limbah Tambak Udang Super-Intensif Sebagai Pupuk Organik Untuk
Pertumbuhan Biomassa Kelekap Dan Nener Bandeng. Media Akuakultur,
11(2), 97–110.
Suwoyo, H. S., Undu, M. C., dan Makmur. 2014. Laju Sedimentasi Dan
Karakterisasi Sedimen Tambak Super Intensif Udang Vaname (Litopenaeus
vannamei). Proceeding, 1992, 343–355.
Tan Gana, N. H., Mendoza, B. C., dan Monsalud, R. G. 2014. Isolation, screening
and characterization of yeasts with amyloytic, lipolytic, and proteolytic
activities from the surface of Philippine bananas (Musa spp.). Philippine
Journal of Science, 143(1), 81–87.
Taslihan, A, Ani W, Retna H, S.M. Astuti. 2004. Pengendalian Penyakit Pada Bu
didaya Ikan Air Payau, Direktorat Jenderal Perikanan Balai Besar Budidaya
Air Payau Jepara.
Umasugi, A., Tumbol, R. A., Kreckhoff, R. L., Manoppo, H., Pangemanan, N. P.
L., dan Ginting, E. L. 2018. Penggunaan bakteri probiotik untuk
pencegahan infeksi bakteri Streptococcus agalactiae pada ikan Nila,
Oreochromis niloticus. E-Journal BUDIDAYA PERAIRAN, 6(2), 39–44.
Verschuere, L., Rombaut, G., Sorgeloos, P., dan Verstraete, W. 2000. Probiotic
Bacteria as Biological Control Agents in Aquaculture. Microbiology and
Molecular Biology Reviews, 64(4), 655–671.
Wahyudewantoro, G. 2011. Catatan Biologi Udang Putih Litopenaeus
vannamei. Fauna Indonesia, Vol 10(2), 28–31.
Widiyanto, T. 2006. Selection of nitrifying and denitrifying bacteria of bioremed
40
iation agents in shrimppond. Disertasi. Sekolah Pascasarjana. Institut Pertan
ian Bogor. (In Indonesian).
Winarni, I. 2016. Peran Mikroba sebagai Biomonitoring Kualitas Perairan Tawar
pada Beberapa Situ. Peran MST Dalam Mendukung Urban Lifestyle Yang
Berkualitas, 143–176.
WWF Indonesia. 2014. BMP Budidaya Udang Vannamei Tambak Semi Intensif
dengan Instalasi Pengolahan Air LImbah (IPAL). In Jurnal Akuakultur
Indonesia (Vol. 22).
Yuka, R. A., Setyawan, A., dan Supono, S. 2021. Identifikasi Bakteri
Bioremediasi Pendegradasi Total Ammonia Nitrogen (Tan). Jurnal
Kelautan: Indonesian Journal of Marine Science and Technology, 14(1), 20–29.
Zainuddin, Z., Aslamyah, S., dan Hadijah, H. 2018. Efek dari perbedaan sumber
karbohidrat pakan terhadap kualitas air, komposisi proksimat dan
kandungan glikogen juvenil udang vannamei (Litopenaeus vannamei)
(Boone, 1931). Jurnal Ilmiah Samudra Akuatika, 2(1), 1–8.
Zhou, S., Xia, Y., Zhu, C., dan Chu, W. 2018. Isolation of marine bacillus sp.
With antagonistic and organic-substances-degrading activities and its
potential application as a fish probiotic. Marine Drugs, 16(6).
41
LAMPIRAN
Lampiran 1. Data Kelimpahan Bakteri
Pengenceran Total Bakteri

Tambak Sampel Berat Sampel (g)
10-2 10-3 10-4 (CFU/g)
Air - 145 90 19 10 x 104

Inlet
Sedimen 1,25 8016 536 105 1,7 x 106
Air - 220 52 5 7,4 x 104

T6
Sedimen 0,90 2096 424 178 4,0 x 106
Air - 7 1 0 0,14 x 104

T7
Sedimen 0,75 4320 3680 336 9,0 x 106
Air - 1898 93 10 18,6 x 104

T8
Sedimen 1,05 35100 1251 215 4,1 x 106
Air - 318 90 21 18 x 104

Outlet
Sedimen 0,85 3888 848 656 15,4 x 106
 Data TPC
Jumlah Total Bakteri
Tambak
Air (104 ) (CFU/mL) Sedimen (106 ) (CFU/g)
Inlet 10 x 104 1,7 x 106
T6 7,4 x 104 4,0 x 106
T7 0,14 x 104 9,0 x 106
T8 18,6 x 104 4,1 x 106
Outlet 18 x 104 15,4 x 106
 Perhitungan TPC
Sampel air :
1 1
1. AI -2 = 145 x x = 2,9 x 104
10−2 0,5
1 1
AI -3 = 90 x x = 18 x 104
10−3 0,5
42
(2 , 9 x 10 4)+(18 x 104)
A6 = = 10 x 104
2
1 1
2. A6 (10-2) = 220 x x = 4,4 x 104
10−2 0,5
1 1
A6 (10-3) = 52 x x = 1,04 x 105
10−3 0,5
( 4,4 x 10 4 )+(1,04 x 10 5)
A6 = = 7,4 x 104
2
1 1
3. A7 =7x x = 0,14 x 104
10−2 0,5
1 1
4. A8 = 93 x x = 18,6 x 104
10−3 0,5
1 1
5. AO = 90 x x = 18 x 104
10−3 0,5
Sampel sedimen :
1 1 1
1. SI = 105 x x x = 1,7 x 106
10−4 0,5 1,25
1 1 1
2. S6 = 178 x x x = 4,0 x 106
10−4 0,5 0,9
1 1 1
3. S7 = 336 x x x = 9,0 x 106
10−4 0,5 0,75
1 1 1
4. S8 = 215 x x x = 4,1 x 106
10−4 0,5 1,05
1 1 1
5. SO = 656 x x x = 15,4 x 106
10−4 0,5 0,85
43
Lampiran 2. Data Pengamatan Morfologi Koloni
-
+
+
+
-
-
+
-
+
+
-
-
-
+
-
-
-
-
+
+
-
-
-
-
+
-
+
+
+
+
+
+
44
A619 Circular Putih Keruh Convex Entire
A622 Irregular Putih Keruh Convex Entire
S61 Irregular Kuning Convex Entire
S63 Circular Kuning Convex Entire
S66 Circular Putih Keruh Convex Entire
S69 Spindle Putih Keruh Convex Entire
S610 Circular Putih Keruh Pulvinate Entire
S614 Irregular Putih Keruh Pulvinate Entire
S618 Circular Putih Keruh Pulvinate Undulate
S623 Irregular Putih Keruh Convex Entire
S624 Irregular Putih Keruh Convex Entire
45
S69 Spindle Putih Keruh Convex Entire
46
S710 Circular Putih Keruh Convex Entire Kecil
S715 Circular Putih Keruh Convex Entire Besar
S716 Irregular Putih Keruh Convex Entire Besar
S723 Irregular Putih Keruh Convex Entire Sedang
47
Convex Entire Kecil + 0.3 0.8 0.5 1.67 0.4
Convex Entire Kecil + 0.5 1 0.5 1.00 0.6
Convex Entire Kecil +
Convex Entire Kecil + 0.5
Convex Entire Besar -
Convex Entire Sedang +
Convex Entire Sedang -
Convex Entire Sedang +
Convex Entire Besar +
Convex Entire Besar +
Convex Entire Kecil -
48
Lampiran 3. Data Pengamatan Bakteri Gram Positif dan Gram Negatif
Isolat Gram Isolat Gram Isolat Gram Isolat Gram Isolat Gram
AI 1 - A6 1 - A7 1 - A8 1 - AO 1 -
AI 2 - A6 2 - A7 2 - A8 2 - AO 2 -
AI 3 - A6 3 - A7 3 - A8 3 - AO 3 -
AI 4 - A6 4 - A7 4 - A8 4 - AO 4 -
AI 5 - A6 5 - A7 5 - A8 5 - AO 5 +
AI 6 - A6 6 - A7 6 + A8 6 - AO 6 -
AI 7 - A6 7 - A7 7 - A8 7 - AO 7 -
AI 8 - A6 8 - A7 8 + A8 8 - AO 8 -
AI 9 - A6 9 + S7 1 - A8 9 + AO 9 -
AI 10 - A6 10 + S7 2 + A8 10 + AO 10 -
AI 11 - A6 11 + S7 3 - A8 11 + AO 11 +
AI 12 - A6 12 - S7 4 - A8 12 - AO 12 -
AI 13 - A6 13 - S7 5 - A8 13 - AO 13 -
AI 14 + A6 14 - S7 6 - A8 14 - AO 14 +
AI 15 + A6 15 - S7 7 - A8 15 - AO 15 -
AI 16 - A6 16 - S7 8 - A8 16 - AO 16 -
AI 17 - A6 17 - S7 9 - A8 17 - AO 17 -
AI 18 - A6 18 + S7 10 - A8 18 + AO 18 -
AI 19 - A6 19 - S7 11 - A8 19 - AO 19 +
AI 20 + A6 20 + S7 12 - A8 20 + AO 20 -
AI 21 + A6 21 - S7 13 - A8 21 - AO 21 +
AI 22 + A6 22 - S7 14 - A8 22 - AO 22 -
AI 23 + A6 23 - S7 15 - A8 23 - AO 23 -
AI 24 + A6 24 - S7 16 - A8 24 - AO 24 +
AI 25 + A6 25 - S7 17 - A8 25 - AO 25 +
SI 1 - S6 1 - S7 18 - S8 1 - SO 1 -
SI 2 - S6 2 + S7 19 - S8 2 + SO 2 -
SI 3 + S6 3 + S7 20 - S8 3 + SO 3 -
SI 4 - S6 4 + S7 21 - S8 4 - SO 4 -
SI 5 + S6 5 + S7 22 - S8 5 - SO 5 -
SI 6 - S6 6 + S7 23 - S8 6 - SO 6 +
SI 7 - S6 7 - S7 24 - S8 7 + SO 7 -
SI 8 - S6 8 - S7 25 - S8 8 - SO 8 -
SI 9 + S6 9 - S8 9 - SO 9 -
SI 10 + S6 10 - S8 10 - SO 10 -
SI 11 - S6 11 - S8 11 - SO 11 -
SI 12 - S6 12 - S8 12 + SO 12 -
SI 13 - S6 13 - S8 13 + SO 13 -
SI 14 - S6 14 + S8 14 - SO 14 +
SI 15 - S6 15 + S8 15 - SO 15 +
SI 16 + S6 16 - S8 16 - SO 16 -
SI 17 - S6 17 + S8 17 - SO 17 -
SI 18 + S6 18 - S8 18 + SO 18 -
SI 19 - S6 19 - S8 19 - SO 19 +
SI 20 - S6 20 - S8 20 + SO 20 -
SI 21 - S6 21 - S8 21 + SO 21 +
SI 22 + S6 22 - S8 22 + SO 22 -
SI 23 + S6 23 - S8 23 + SO 23 -
SI 24 + S6 24 - S8 24 + SO 24 -
 Data Proporsi Bakteri Gram Positif dan Gram Negatif
49
Jumlah Isolat Jumlah Isolat
Air Sedimen
Tambak
Gram Proporsi Gram Proporsi Gram Proporsi Gra Proporsi
+ (%) - (%) + (%) m- (%)
Inlet 8 32 17 68 10 40 15 60
T6 5 20 20 80 9 36 16 64
T7 2 25 6 75 1 4 24 96
T8 9 36 16 64 12 48 13 52
Outlet 7 28 18 72 5 20 20 80
 Perhitungan Proporsi Bakteri Gram Positif dan Gram Negatif

Sampel air :
8
1. AI Gram positif = x 100 = 32%
25
17
2. AI Gram negatif = x 100 = 68%
25
5
3. A6 Gram positif = x 100 = 20%
25
20
4. A6 Gram negatif= x 100 = 80%
25
2
8
6
8
9
25
16
25
7
9. AO Gram positif= x 100 = 28%
25
18
10. AO Gram negatif= x 100 = 72%
25
Sampel sedimen :
10
1. SI Gram positif = x 100 = 40%
25
15
2. SI Gram negatif = x 100 = 60%
25
9
3. S6 Gram positif = x 100 = 36%
25
50
16
4. S6 Gram negatif= x 100 = 64%
25
1
25
24
25
12
25
13
25
5
9. SO Gram positif= x 100 = 20%
25
20
10. SO Gram negatif= x 100 = 80%
25
51
Lampiran 4. Data Indeks Aktivitas Bakteri Amilolitik
SI7 1.43 S71
SI8 0.78 S74
SI10 0.56 S77
SI13 3.60 S717
SI20 2.00 S718
S61 0.24 S719
S62 2.53 S720
S63 1.09 S86
S64 1.10 S89
S69 2.33 S814
S610 1.71 S815
S611 1.45 S816
AI2 SI2 0.7 1.4 0.7 1.00

AI3 SI3
AI4 SI4 0.6 2.4 1.8 3.00
AI5 SI5 0.7 2.5 1.8 2.57
AI6 SI6
AI7 SI7 0.7 1.7 1 1.43
AI8 SI8 0.9 1.6 0.7 0.78
AI9 SI9
AI10 SI10 1.6 2.5 0.9 0.56
AI11 SI11
AI12 0.2 0.5 0.3 1.50 SI12
AI13 0.5 0.7 0.2 0.40 SI13 0.5 2.3 1.8 3.60
AI14 0.5 1.6 1.1 2.20 SI14
AI15 0.5 1.6 1.1 2.20 SI15
AI16 0.8 1 0.2 0.25 SI16
AI17 0.8 1.3 0.5 0.63 SI17
AI18 0.4 0.6 0.2 0.50 SI18
AI19 0.4 1.6 1.2 3.00 SI19
AI20 0.6 2 1.4 2.33 SI20 0.6 1.8 1.2 2.00
AI21 0.4 1.6 1.2 3.00 SI21
AI22 0.6 1.8 1.2 2.00 SI22
AI23 SI23
AI24 SI24
AI25 0.5 1.4 0.9 1.80 SI25
52
48 48
Isolat Isolat
DKB DT DZB IA DKB DT DZB IA
A61 0.9 1.8 0.9 1.000 S61 1.7 2.1 0.4 0.24
A62 0.7 1.6 0.9 1.286 S62 0.85 3 2.15 2.53
A63 0.6 1.6 1 1.667 S63 1.1 2.3 1.2 1.09
A64 0.7 1.7 1 1.429 S64 1 2.1 1.1 1.10
A65 S65
A66 1 2.6 1.6 1.600 S66
A67 0.8 1.7 0.9 1.125 S67
A68 0.8 1.6 0.8 1.000 S68
A69 0.8 1.8 1 1.250 S69 0.6 2 1.4 2.33
A610 S610 0.7 1.9 1.2 1.71
A611 0.8 2.2 1.4 1.750 S611 1.1 2.7 1.6 1.45
A612 0.7 1.4 0.7 1.000 S612 0.5 2.1 1.6 3.20
A613 S613
A614 S614
A615 S615
A616 0.7 2.1 1.4 2.000 S616
A617 S617 0.7 2.2 1.5 2.14
A618 0.9 1.6 0.7 0.778 S618 0.7 2.5 1.8 2.57
A619 0.6 2.1 1.5 2.500 S619
A620 0.6 1.2 0.6 1.000 S620 0.7 2.6 1.9 2.71
A621 1 1.5 0.5 0.500 S621
A622 0.7 1.2 0.5 0.714 S622
A623 0.4 1.9 1.5 3.750 S623
A624 0.6 1.9 1.3 2.167 S624 0.6 2.4 1.8 3.00
A625 S625 0.8 1.8 1 1.25
A71 0.5 1 0.5 1.00 S71 0.8 1.4 0.6 0.75
A72 S72
A73 S73
A74 S74 0.5 1.4 0.9 1.80
A75 S75
A76 S76
A77 S77 0.8 1.5 0.7 0.88
A78 S78
S79
S710
S711
S712
S713
S714
S715
S716
S717 0.7 1.4 0.7 1.00
S718 0.6 1.3 0.7 1.17
S719 0.5 1.1 0.6 1.20
S720 0.6 1.3 0.7 1.17
S721
S722
S723
53
S72
S73
S74 0.5 1.4 0.9 1.80
S75
S76
S77 0.8 1.5 0.7 0.88
S78
S79
S710
S711
S712
S713
S714
S715
S716
S717 0.7 1.4 0.7 1.00
S718 0.6 1.3 0.7 1.17
S719 0.5 1.1 0.6 1.20
S720 0.6 1.3 0.7 1.17
S721
S722
S723
S724
S725
0.3 1.3 1 3.33 SI1 0.8 1.5 0.7 0.88

SI2 0.7 1.4 0.7 1.00
SI3
SI4 0.6 2.4 1.8 3.00
SI5 0.7 2.5 1.8 2.57
SI6
SI7 0.7 1.7 1 1.43
SI8 0.9 1.6 0.7 0.78
SI9
SI10 1.6 2.5 0.9 0.56
SI11
0.2 0.5 0.3 1.50 SI12
0.5 0.7 0.2 0.40 SI13 0.5 2.3 1.8 3.60
0.5 1.6 1.1 2.20 SI14
0.5 1.6 1.1 2.20 SI15
0.8 1 0.2 0.25 SI16
0.8 1.3 0.5 0.63 SI17
0.4 0.6 0.2 0.50 SI18
0.4 1.6 1.2 3.00 SI19
0.6 2 1.4 2.33 SI20 0.6 1.8 1.2 2.00
0.4 1.6 1.2 3.00 SI21
0.6 1.8 1.2 2.00 SI22
SI23
SI24
0.5 1.4 0.9 1.80 SI25
54
 Data Kisaran Indeks Aktivitas Bakteri Amilolitik
Tamba Indeks Aktivitas Bakteri Amilolitik

k Air Sedimen
Inlet 0,25 - 3,33 0,56 - 3,6
T6 0,5 - 3,7 0,24 - 3,20
T7 1 0,88 - 1,8
T8 0 1,83 - 4,33
Outlet 1,4 - 3,75 0
 Data Proporsi Bakteri Amilolitik

Air Sedimen
Proporsi
Tambak Total Amilolitik (%) Total Amilolitik Proporsi (%)
Inlet 25 12 48 25 9 36
T6 25 18 72 25 13 52
T7 8 1 12,5 25 7 28
T8 25 0 0 25 5 20
Outlet 25 15 60 25 0 0
 Perhitungan Proporsi Bakteri Amilolitik

Sampel sedimen :
Sampel air :
12
1. AI = x 100 = 48%
25
18
2. A6 = x 100 = 72%
25
1
3. A7 = x 100 = 12,5%
8
0
4. A8 = x 100 = 0%
25
15
5. AO = x 100 = 60%
25
Sampel Sedimen
9
1. SI = x 100 = 36%
25
13
2. S6 = x 100 = 52%
25
7
3. S7 = x 100 = 28%
25
55
5
4. S8 = x 100 = 20%
25
0
5. SO = x 100 = 0%
25
Lampiran 5. Dokumentasi
Kelimpahan Bakteri pada media Marine Agar
Bakteri amilolitik pada media pati
56
UCAPAN TERIMA KASIH
Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT atas segala limpahan
rahmat dan hidayah-Nya, sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi
dengan baik. Oleh karena itu penulis mengucapkan terima kasih kepada :
1. Orang tua Bapak Jakirmanto, Ibu Siti Nurkayati, Adik-adik yaitu Ahmad
Umar Syaid, Shofa Zahrotun Auliya, Abidzar Arshad Tsaqif dan keluarga
yang selalu mendukung baik secara moral maupun material, memberikan
motivasi, doa, kasih sayang, serta semangat untuk segera menyelesaikan
masa studi.
2. Dr. Ir. H. Isdy Sulistyo, DEA selaku Dekan Fakultas Perikanan dan Ilmu
Kelautan yang telah mengesahkan skripsi.
3. DR. Ir. P. Hary Tjahja. S., MS selaku pembimbing akademik yang selalu
memberikan dukungan dan arahan akademik.
4. Dr. rer.nat. Hamdan Syakuri, S.Pi., M.Si selaku pembimbing utama yang
telah memberikan arahan, bimbingan, dan selalu sabar dalam
membimbing pelaksanaan penelitian serta penyusunan skripsi.
5. Dr. Nuning Vita Hidayati, S.Pi., M.Si. selaku pembimbing anggota yang
telah memberikan arahan, bimbingan, dan selalu sabar dalam
membimbing pelaksanaan penelitian serta penyusunan skripsi.
6. Dr. Kasprijo, M. Si. selaku penelaah skripsi yang telah memberikan kritik
dan saran dalam penyusunan skripsi.
7. Agung Cahyo Setyawan, S.Pi., M.Si selaku penelaah skripsi yang telah
memberikan kritik dan saran dalam penyusunan skripsi.
57
8. Anggota tim penelitian yaitu Annisa Fathiatun Nabilah, Istikhomah, dan
Tuti Dwi Cahyani yang telah berkerja sama dalam pelaksanaan penelitian,
bertukar informasi, dan saling memotivasi.
9. Sahabat-sahabat tercinta yang tidak dapat disebutkan satu persatu yang
telah membantu, mendukung, dan memotivasi dalam penyusunan
skripsi.
10. Teman-teman Akuakultur 2017 yang saling mendukung dan membantu
satu sama lain.
Demikian ucapan terima kasih yang dapat penulis tuliskan. Semoga Allah
SWT membalas kebaikan kepada semua pihak yang telah terlibat dalam
penyusunan skripsi ini. Semoga skripsi ini dapat memberikan manfaat
pengetahuan dan informasi.
58
RIWAYAT HIDUP SINGKAT
Penulis bernama Siti Khoirun Nisa lahir di Pati pada tanggal 07 Oktober
1999, merupakan anak pertama dari empat bersaudara. Penulis lahir dari
pasangan suami istri Bapak Jakirmanto dan Ibu Siti Nurkayati. Penulis
bertempat tinggal di Dukuh Dukoh, Desa Danyangmulyo RT 5 RW 1,
Kecamatan Winong, Kabupaten Pati, Provinsi Jawa Tengah. Penulis
menyelesaikan pendidikan di SD N 2 Danyangmulyo (2005-2011), SMP N 2 Wi
nong (2011-2014), MAS PPKP Darul Ma’la (2014-2017), dan mulai tahun 2017
penulis terdaftar sebagai mahasiswa S1 Akuakultur, Fakultas Perikanan dan
Ilmu Kelautan, Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto. Penulis juga meru
pakan Founder Bimbel Pena Ilmu dan Nisafarm. Selama kuliah penulis pernah
mengikuti unit kegiatan mahasiswa yaitu Uki Al Fatih (2018), HIMAKUA (201
8), UKKI (Unit Kerohanian Kampus Islam) (2020), dan Racana Soedirman (201
8). Penulis juga menjadi aktif menjadi panitia dibeberapa kegiatan ditingkat
fakultas maupun universitas. Penulis juga lolos pendanaan Program
Mahasiswa Wirausaha (PMW) UNSOED tahun 2019 dan 2021. Penulis memiliki
pengalaman kerja praktek di Balai Pengembangan Budidaya Air Tawar Banyu
mas Unit Kerja Pandak pada tahun 2020.
59

Edit SKRIPSI-SITI KHOIRUN NISA-L1B017002R3hdd-cek NVHMHMKNNJN

Diunggah oleh

Informasi Dokumen

Deskripsi Asli:

Judul Asli

Hak Cipta

Format Tersedia

Bagikan dokumen Ini

Bagikan atau Tanam Dokumen

Opsi Berbagi

Apakah menurut Anda dokumen ini bermanfaat?

Apakah konten ini tidak pantas?

Hak Cipta:

Format Tersedia

Edit SKRIPSI-SITI KHOIRUN NISA-L1B017002R3hdd-cek NVHMHMKNNJN

Diunggah oleh

Hak Cipta:

Format Tersedia

SKRIPSI

ISOLASI DAN PENAPISAN BAKTERI AMILOLITIK DARI AIR

Dilaksanakan dan disusun guna memperoleh gelar Sarjana Perikanan di Univer

FAKULTAS PERIKANAN DAN ILMU KELAUTAN

ISOLASI DAN PENAPISAN BAKTERI AMILOLITIK DARI AIR

Pembimbing Utama Pembimbing Anggota

Dr. Ir. H. Isdy Sulistyo, DEA.

Lingkungan tambak udang vaname umumnya mengandung banyak bahan

Saya yang bertanda tangan di bawah ini :

Nama : Siti Khoirun Nisa

Tambak Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) di Desa Bunton,

Kecamatan Adipala, Kabupaten Cilacap

Menyatakan dengan sebenarnya bahwa skripsi ini merupakan hasil

paksaan dari pihak manapun.

Purwokerto, Febuari 2022

Siti Khoirun Nisa

Puji Syukur kehadirat Allah SWT yang telah memberikan rahmat

kepada penulis sehingga penulis mendapatkan kesempatan untuk

menyelesaikan skripsi dengan judul “Isolasi dan Penapisan Bakteri Amilolitik d

Bunton, Kecamatan Adipala, Kabupaten Cilacap”. Kegiatan budidaya udang

vaname yang dikelola secara intensif pada umumnya menghasilkan limbah

n proses biodegradasi oleh mikroorganisme, salah satunya bakteri amilolitik.

Penulis menyadari bahwa masih banyak kekurangan dari skripsi ini,

kedepannya menjadi pembelajaran. Akhir kata penulis mengharapkan semoga

skripsi ini dapat bermanfaat bagi pembaca.

Purwokerto, Febuari 2022

II. TINJAUAN PUSTAKA......................................................................................5

III. MATERI DAN METODE.................................................................................14

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN........................................................................22

V. KESIMPULAN DAN SARAN........................................................................35

1. Data Kelimpahan Bakteri........................................................................................42

k di Indonesia. Budidaya udang vaname yang dikelola secara intensif dapat me

ningkatan produksi udang vaname akan tetapi mempunyai permasalahan yang

cukup serius terkait kemungkinan terjadinya degradasi kualitas air (Gunarto et

tingginya limbah yang dihasilkan, baik yang tersuspensi maupun mengendap

karena itu, perlu adanya penerapan teknologi yang diharapkan dapat

mengurangi kandungan bahan organik pada budidaya udang vaname. Salah

satu teknologi yang dapat diaplikasikan adalah melalui penggunaan probiotik.

Probiotik merupakan mikroorganisme yang mampu mendukung

pertumbuhan dan produktivitas udang. Aplikasi probiotik pada budidaya uda

ng vaname dapat meningkatkan nilai kualitas air, menguraikan senyawa sisa

metabolisme dan mengurangi bahan organik total melalui biodegradasi (Fuady

penguraian atau perombakan bahan organik secara biologis dan prosesnya

Aktivitas bakteri probiotik dalam mendegradasi limbah organik yaitu mereduk

si kandungan bahan pencemar yang bersifat racun dengan mengubah struktur

n dan berbahaya bagi kehidupan udang (Pratiwi et al., 2019).

Isolasi dan seleksi bakteri kandidat probiotik merupakan faktor

penting dalam menentukan keberhasilan aplikasi probiotik di bidang

kandidat probiotik salah satunya adalah jenis bakteri amilolitik. Bakteri

amilolitik merupakan salah satu bakteri kandidat probiotik yang mampu

menghasilkan enzim ekstraselular yaitu amilase (Anggorowati et al., 2019). Men

memecahnya menjadi polimer glukosa. Enzim ini dibutuhkan untuk merombak

mampu mengurai karbohidrat yang ditandai dengan terbentuknya zona bening

di sekitar area koloni (Gana et al., 2014).

Bakteri amilolitik sebagai kandidat probiotik dapat diisolasi dari

keberadaan bakteri amilolitik sudah dilakukan Ayuningrum et al. (2021) yang

berhasil menapis Actinobacteria dari sedimen tambak udang vaname dengan

Streptomyces atacamensis dengan zona hidrolisis amilum 3,77. Kurniawati (2015)

n bakteri amilolitik Genus Flavobacterium dengan zona hidrolisis amilum 34,1

mm, Pseudomonas dengan zona hidrolis amilum 22,14 mm, Corybacterium me

vaname. Hal tersebut menjadi dasar dilakukannya penelitian terkait penapisan

Kecamatan Adipala, Kabupaten Cilacap.