LAPORAN

PRAKTIKUM KIMIA FISIK

PERCOBAAN II
PENENTUAN ENERGI INTERAKSI DENGAN KOMPUTASI

Disusun oleh:
Kelompok 1 (Kelas F)

Praktikan (NIM) : Beby Faizatun Nadzira (24030120140040)

Firdaus Shofwan (24030120130069)
Syifa Aida Putri Hanindya (24030120130092)

Jadwal Praktikum : Selasa, 1 Maret 2022

Asisten : Freskha Fauzi

LABORATORIUM KIMIA FISIK

DEPARTEMEN KIMIA
FAKULTAS SAINS DAN MATEMATIKA
UNIVERSITAS DIPONEGORO
SEMARANG
2022
 LEMBAR PENGESAHAN
LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA FISIK
PERCOBAAN II
PENENTUAN ENERGI INTERAKSI DENGAN KOMPUTASI

Semarang, 1 Maret 2022

Praktikan,

Beby Faizatun Nadzira Firdaus Shofwan Syifa Aida Putri

Hanindya
24030120130092 24030120130069 24030120130092

Mengetahui,
Asisten Praktikum

Freskha Fauzi
24030118
ABSTRAK
 PERCOBAAN II
PENENTUAN ENERGI INTERAKSI DENGAN KOMPUTASI

I. TUJUAN PERCOBAAN
1. Mampu memahami dan memprediksi interaksi antarmolekul dan sifat-
sifatnya
2. Mampu memprediksi energi interaksi antarmolekul dimer H 2O…H2O,
CH3-O-CH3…CH3-O-CH3 dan menjelaskan pengaruhnya pada struktur
molekul H2O atau CH3-O-CH3
3. Mampu menjelaskan sifat-sifat air berdasarkan sifat-sifat interaksi
antarmolekul H2O…H2O atau CH3-O-CH3…CH3-O-CH3

II. TINJAUAN PUSTAKA

II.1 Kimia Komputasi
Kimia komputasi adalah sebuah cabang ilmu kimia yang
mengkalkulasi sifat-sifat suatu molekul, transformasinya, dan
melakukan imitasi dalam makromolekul atau sistem dengan banyak
molekul dari sebuah hasil fisika yang memprediksi suatu fenomena
kimia yang diterapkan dalam sebuah program computer. Contoh dari
sifat molekul yang dapat dikalkulasi adalah momen dipol,
kereaktifan, struktur atom atau molekul, dan sebagainya (Lewars,
2016).
II.2 DFT
Density Functional Theory (DFT) merupakan sebuah teori
mekanika kuantum yang digunakan sebagai metode untuk
menghitung suatu senyawa kompleks dengan cepat dan sederhana
sehingga dapat dimanfaatkan untuk memprediksi struktur elektronik,
sifat transisi spin kompleks, energi, karakteristik ikatan, dan
geometri senyawa. DFT memiliki hasil yang sangat mendekati hasil
data eksperimen yang telah dilakukan (Burke dan Wagner, 2012).
II.3 Interaksi Molekul
 Interaksi molekul adalah suatu hubungan yang terjadi antara
atom-atom dalam sebuah molekul atau dengan molekul yang lain
sehingga menciptakan gaya tarik menarik antaratom dengan
kekuatan ikatan yang berbeda beda. Terdapat dua interaksi molekul,
yaitu interaksi intermolekul dan interaksi antarmolekul (Rasyid,
2020).
II.4 Energi Interaksi
Energi interaksi adalah jumlah energi yang dihasilkan dari sebuah
interaksi antara dua benda atau lebih. Perbedaan gugus dalam suatu
molekul atau senyawa dapat mengakibatkan perbedaan besarnya
nilai energi interaksi yang dikarenakan konfigurasi interaksinya
ditentukan oleh muatan parsial atom-atom penyusun interaksi
tersebut (Ciftja, 2019).
II.5 Jenis-Jenis Vibrasi
Dalam vibrasi molekul, terdapat 2 jenis vibrasi yakni vibrasi
regangan atau ulur dan vibrasi tekuk.
1) Vibrasi regangan (stretching vibration)
Vibrasi regangan merupakan suatu peristiwa yang
menyebabkan adanya perubahan jarak akibat pergerakan atom
yang menerus sepanjang ikatan penghubungnya, tetapi tidak
diikuti oleh perubahan sudut ikatan. Vibrasi regangan dibagi
menjadi dua, yaitu regangan simetri dan regangan asimetri.
Dalam rengangan simetri, pergerakan unit struktur dalam satu
bidang datar adalah searah dan terjadi bersamaan. Sedangkan
pada regangan asimetri, pergerakan unit struktur tidak searah dan
terjadi secara bersamaan tetapi tetap di dalam satu bidang datar.
 (Suarsa, 2015)
2) Vibrasi tekuk/bengkok (bending vibration)
Perubahan sudut yang terjadi antara dua ikatan dikenal
sebagai vibrasi bengkok. Vibrasi ini memengaruhi keseluruhan
osilasi molekul. Empat jenis vibrasi bengkok yaitu wagging
(mengibas), rocking (mengayun), scissoring (menggunting), dan
twisting (memutar).

(Suarsa, 2015)

II.6 Spektra IR
Spektra IR atau inframerah merupakan plot antara transmittans
dengan frekuensi atau wave number. Spektrum ini juga
menunjukkan jumlah puncak serapan (pita) pada frekuensi
karakteristik atau bilangan gelombang. Daerah bilangan gelombang
yang sering digunakan dalam spektrum inframerah berkisar antara
4000-670 cm-1 (Suarsa, 2016).

II.7 NWChem
Aplikasi kimia kuantum NWChem adalah salah satu aplikasi
kimia komputasi yang paling banyak digunakan dan menawarkan
kemampuan ekstensif untuk simulasi skala besar sistem kimia dan
biologi. Aplikasi ini dikembangkan berdasarkan model Global
Arrays (GA) karena besarnya kebutuhan memori yang terbagi secara
menyeluruh di beberapa node (Si dkk., 2015).

II.8 Avogadro
 Avogadro adalah sebuah software atau perangkat aplikasi pada
komputer yang dapat digunakan untuk mengedit bentuk molekul
yang rumit, umumnya digunakan dalam kimia komputasi,
bioinformatika, dan model molekular. Avogadro digunakan oleh
ilmuwan dan pelajar untuk menggambarkan molekul dalam bentuk
tiga dimensi dan dapat digunakan untuk melihat molekul dari
berbagai sudut (Ali et al., 2018). 

II.9 Chemcraft
Chemcraft adalah sebuah program berbasis grafik yang digunakan
untuk mengerjakan komputasi pada kimia kuantum. Chemcraft
biasanya digunakan untuk memvisualisasi hasil komputasi dan
kalkulasi serta dapat memberikan gambar tiga dimensi dari suatu
molekul dengan memasukkan koordinat atom serta dapat
memodifikasi parameter geometrik dalam molekul seperti jarak dan
sudut molekul (Andrienko, 2019).

II.11 Analisis Bahan

II.6.1 Aquades
Sifat Fisik : Berbentuk cairan jernih tak berwarna. Memiliki
titik didih 100°C, titik beku 0°C dengan densitas 1 g/mL.
Aquades merupakan air yang diolah melalui tahap destilasi
atau penyulingan.
Sifat Kimia : Memiliki rumus molekul H2O dan massa molar
18 g/mol. Aquades digunakan sebagai pelarut senyawa-
senyawa polar. Hampir tidak mengandung mineral karena
diolah dengan penyulingan.
(Anindya, 2016)

II.6.2 Li
 Sifat Fisik : Berbentuk padatan putih yang tidak berbau.
Memiliki titik leleh 180,5°C dan titik didih 1336,5°C.
Memiliki densitas relatif sebesar 0,534 g/mL.
Sifat Kimia : Memiliki massa molar sebesar 25,94 g/mol.
Bereaksi sangat kuat dengan air dan dapat meledak jika
terkena uap air. Umumnya disimpan dalam minyak tanah agar
tidak terkena uap air dan oksigen.
(Global Safety Management, 2012)

II.6.3 Na
Sifat Fisik : Berbentuk padatan putih yang tidak berbau.
Memiliki pH 9. Memiliki titik leleh 306°C dan titik didih
380°C. Memiliki densitas relatif sebesar 2,261 g/mL.
Sifat Kimia : Memiliki massa molar sebesar 23 g/mol.
Bereaksi sangat kuat dengan air dan dapat meledak jika
terkena uap air. Umumnya disimpan dalam minyak tanah agar
tidak terkena uap air dan oksigen.
(Identification et al., 2016)

II.6.4 CH3OCH3
Sifat Fisik : Berbentuk larutan tidak berwarna dan berbau
manis seperti eter pada umumnya. Memiliki titik leleh sebesar
-116°C dan titik didih sebesar 34,6°C. Memiliki densitas
sebesar 0,71 g/mL dan dapat larut dalam air setiap 65 g/L pada
20°C.
Sifat Kimia : Memiliki rumus molekul C2H6O dengan massa
molar sebesar 46,07 g/mol. Uapnya dapat membentuk
campuran yang mudah meledak di udara. Mudah terbakar
namun bersifat stabil pada suhu ruang.
(Sigma-Aldrich, 2021)
III. METODOLOGI PERCOBAAN
III.1. Alat
 Seperangkat komputer
 Software Notepad++
 Software Avogadro
 Software Nwchem
 Software Chemcraft

III.2. Skema Kerja

III.2.1 Pembuatan dan Perhitungan File Input Li-H2O

Matriks Z

- Membuat struktur dengan Avogadro

- Membuat file input dengan format file.nw

- Membuka terminal Linux Ubuntu

- Mencari file input dengan perintah “cd” untuk membuka

folder dan “ls” untuk melihat isi folder

- Melakukan perhitungan optimasi dengan perintah “nwchem

H2O-Li.nw >& H2O-Li.out&”

- Melakukan pengecekan dengan perintah “ps”

- Perhitungan selesai ditandai dengan “done”

- Mencatat energi dari file output (file.out)

Hasil
III.2.2 Pembuatan dan Perhitungan File Input Na-H2O

Matriks Z

- Membuat struktur dengan Avogadro

- Membuat file input dengan format file.nw

- Membuka terminal Linux Ubuntu

- Mencari file input dengan perintah “cd” untuk membuka

folder dan “ls” untuk melihat isi folder

- Melakukan perhitungan optimasi dengan perintah “nwchem

H2O-Na.nw >& H2O-Na.out&”

- Melakukan pengecekan dengan perintah “ps”

- Perhitungan selesai ditandai dengan “done”

- Mencatat energi dari file output (file.out)

Hasil

III.2.3 Pembuatan dan Perhitungan File Input K-H2O

Matriks Z

- Membuat struktur dengan Avogadro

- Membuat file input dengan format file.nw

- Membuka terminal Linux Ubuntu

- Mencari file input dengan perintah “cd” untuk membuka

folder dan “ls” untuk melihat isi folder

- Melakukan perhitungan optimasi dengan perintah “nwchem

H2O-K.nw >& H2O-K.out&”

- Melakukan pengecekan dengan perintah “ps”

- Perhitungan selesai ditandai dengan “done”

- Mencatat energi dari file output (file.out)

Hasil
IV. DATA PENGAMATAN
 HIPOTESIS

Dalam praktikum ini, akan dilakukan percobaan dengan judul “Penentuan Energi
Interaksi dengan Komputasi” yang bertujuan untuk memahami dan memprediksi
interaksi antarmolekul dan sifat-sifatnya, memprediksi energi interaksi
antarmolekul dimer H2O…H2O, CH3-O-CH3…CH3-O-CH3 dan menjelaskan
pengaruhnya pada struktur molekul H2O atau CH3-O-CH3, dan menjelaskan sifat-
sifat air berdasarkan sifat-sifat interaksi antarmolekul H2O…H2O atau CH3-O-
CH3…CH3-O-CH3. Prinsip yang digunakan adalah persamaan Schrodinger dan
metode yang digunakan adalah DFT.
V. PEMBAHASAN
VI. PENUTUP
 DAFTAR PUSTAKA

Ali, S., Banck, M., & Etc. (2018). Avogadro.

Andrienko, G. (2019). Chemcraft.
Anindya, K. (2016). Pengaruh Sand Filter Berteknologi Reverse Osmosis Dalam
Proses Pengolahan Aquadest Menggunakan Bahan Baku Air Sumur
Terhadap Parameter Fisika. Universitas Diponegoro.
Burke, K. and Wagner L.O. (2012). DFT in a Nutshell. International Journal of
Quantum Chemistry. 113 (2): 96-101. https://doi.org/10.1002/qua.24259
Ciftja, O. (2019). Electrostatic Interaction Energy between Two Coaxial Parallel
Uniformly Charged Disks. Result in Physics. 15: 102684. Texas:
ScienceDirect. https://doi.org/10.1016/j.rinp.2019.102684
Global Safety Management. (2012). Safety Data Sheet : Lithium Metal. Material
Safety Data Sheet, 4(2), 7.
https://beta-static.fishersci.com/content/dam/fishersci/en_US/documents/
programs/education/regulatory-documents/sds/chemicals/chemicals-l/
S25391.pdf
Identification, C., Weight, M., Formula, C., Code, P., & Statements, S. H. (2016).
MATERIAL SAFETY DATA SHEET : SODIUM METAL. 1–8.
Lewars, E.G. (2016). Computational Chemistry: Introduction to the Theory and
Applications of Molecular and Quantum Mechanics, 3rd ed. Peterborough:
Springer, Cham. https://doi-org.proxy.undip.ac.id/10.1007/978-3-319-
30916-3
Rasyid, M.F. (2020). Interaksi Antar Molekul Kimia Kelas X. Tanjung Pinang:
SMAN 7 Tanjung Pinang
Si, M., Pena, A. J., Hammond, J., Balaji, P., & Ishikawa, Y. (2015). Scaling
NWChem with efficient and portable asynchronous communication in MPI
RMA. Proceedings - 2015 IEEE/ACM 15th International Symposium on
Cluster, Cloud, and Grid Computing, CCGrid 2015, 811–816.
https://doi.org/10.1109/CCGrid.2015.48
Sigma-Aldrich. (2021). Dimethyl Ether. In Sigma-Aldrich Inc. Sigma-Aldrich Inc.
https://doi.org/10.1097/00000441-196209000-00051
Suarsa, I. W. (2015). Spektroskopi. Jurusan Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu
Pengetahuan Alam, Universitas Udayana. https://doi.org/10.1007/978-3-662-
34555-9_3
Suarsa, I. W. (2016). Analisis Gugus Fungsi Pada Bensin Dengan
Spektrofotometri Inframerah. 1–36.