10.1007@978 1 4939 9601 82
10.1007@978 1 4939 9601 82
Bab 2
Abstrak
Proteus mirabilis umumnya mudah dibudidayakan, tetapi kecenderungannya untuk berkerumun di berbagai
media dapat mengganggu isolasi satu koloni atau identifikasi spesies lain dalam sampel. Oleh karena itu,
media khusus mungkin diperlukan untuk mengendalikan gerombolan atau untuk mempelajari bakteri dalam
kondisi yang ditentukan secara kimiawi. Di sini, metode dijelaskan untuk kultur rutin P. mirabilis, isolasi P.
mirabilis dari kultur campuran, dan kultur P. mirabilis pada media yang relevan secara fisiologis.
Kata kunci Proteus mirabilis, Kultur, Pengerumunan, Antipengerapan, Pencegahan Pengerumunan, Urin
buatan, Urine agar
1. Perkenalan
Melanie M. Pearson (ed.), Proteus mirabilis: Metode dan Protokol, Metode dalam Biologi Molekuler, vol. 2021,
https://doi.org/10.1007/978-1-4939-9601-8_2, © Springer Science+Business Media, LLC, bagian dari Springer Nature 2019
5
Machine Translated by Google
6 Melanie M. Pearson
koloni tunggal P. mirabilis pada agar, atau untuk membiakkan spesies ini
dalam kondisi fisiologis yang relevan.
2 Budaya Rutin
Media yang disajikan pada bagian ini direkomendasikan untuk kultur rutin
P. mirabilis di lokasi penelitian. Semua media ini akan memungkinkan
kultur P. mirabilis tanpa berkerumun, yang merupakan persyaratan untuk
banyak aplikasi biologi molekuler dan mikrobiologi rutin (lihat Catatan 1).
Untuk semua jenis agar-agar, autoklaf untuk mensterilkan, dinginkan
hingga 55 C (tambahkan komponen yang tidak cocok dengan autoklaf
pada titik ini), dan tuang ke piring agar. Biarkan piring duduk pada suhu
kamar semalaman, lalu masukkan ke dalam kantong plastik dan simpan pada suhu 4 C
Gambar 1 Koloni P. mirabilis pada agar. (a) LB rendah garam. (b) Campuran P. mirabilis (putih) dan E. coli (merah muda)
pada agar MacConkey. (c, d) Campuran P. mirabilis dan E. coli pada agar darah. Apa yang tampak sebagai koloni
terisolasi di panel c sebenarnya ditutupi dengan P. mirabilis yang berkerumun, yang menjadi jelas ketika sebuah lingkaran
digambar melintasi latar belakang (d). Di semua panel, strain P. mirabilis adalah HI4320. Pada panel b – d, galur E. coli
uropatogenik adalah CFT073
yang akan membentuk koloni dengan warna pink cerah; P. mirabilis tidak
memfermentasi laktosa dan tetap tidak berwarna (Gbr. 1b). Agar ini juga
menghambat pertumbuhan sebagian besar bakteri Gram-positif. Garam
empedu adalah komponen MacConkey yang menghambat swarming (lihat
Catatan 10). Beberapa strain P. mirabilis masih dapat berkerumun pada
media ini [5]; mengurangi atau menghilangkan NaCl dapat membantu.
2. Agar sistein, laktosa, dan kekurangan elektrolit (CLED) [6, 7]. Per liter: 10 g
laktosa, 4 g gelatin digest pankreas, 4 g kasein digest pankreas, 3 g ekstrak
daging sapi, 0,128 g L-cystine, 0,02 g bromothymol blue, dan 15 g agar-
agar, akhir pH 7,1–7,5; juga tersedia secara komersial. Agar CLED sangat
berguna untuk membedakan beberapa spesies yang biasa ditemukan
selama ISK, berdasarkan warna koloni, ukuran, dan opasitas (P. mirabilis
akan menghasilkan koloni biru bening). Tidak seperti MacConkey, agar
CLED mendukung pertumbuhan bakteri Gram-positif.
8 Melanie M. Pearson
(b) Banyak bahan tambahan lain yang telah dilaporkan selama bertahun-tahun.
Ini termasuk hidrat kloral 1:500, asam borat 1:100, sulfonamida, arang
1%, etanol, triklosan, asam lemak, dan natrium azida 0,01%. Ini umumnya
tidak umum digunakan untuk kultur P. mirabilis, tetapi mungkin berguna
dalam pengaturan tertentu. Azide khususnya adalah racun yang kuat,
dan konsentrasi ini juga menghambat pertumbuhan (lihat Catatan 13).
Lihat [5, 14–18] untuk daftar detail zat aditif ini.
4 Media Fisiologis
P. mirabilis dapat diisolasi dari saluran kemih, feses, darah, dan luka. Oleh karena
itu mungkin berguna untuk membiakkan organisme ini pada media yang menangkap
aspek relung fisiologis ini. Berikut adalah beberapa opsi untuk dipertimbangkan.
1. Urine agar [19] (lihat Catatan 14 dan 15). Kumpulkan dan kumpulkan urin dari
3–5 sukarelawan (lihat Catatan 16). Sterilkan urin menggunakan filter vakum
pori 0,2 ÿm. Setengah dari urin, tambahkan 3% agar; autoklaf lalu dinginkan
hingga 55 C (lihat Catatan 17). Hangatkan sisa air seni hingga 37 C, dan
campurkan 1:1 dengan agar-agar.
Tuang ke dalam cawan petri (Gbr. 2).
2. Urin buatan (lihat Catatan 14). Urin manusia dapat sangat bervariasi, tergantung
pada asupan cairan inang, pola makan, waktu, dan kesehatan. Oleh karena
itu, media urin buatan telah dikembangkan untuk memungkinkan eksperimen
yang dapat direproduksi. Kedua formulasi yang ditampilkan di sini mendukung
pertumbuhan P. mirabilis. (a) Metode 1, oleh Stickler et al.
(lihat Catatan 18) [20, 21]. Per liter: 0,49 g kalsium klorida, 0,65 g magnesium
Machine Translated by Google
10 Melanie M. Pearson
5 Catatan
1. Secara umum, kadar elektrolit yang rendah menyebabkan tidak ada atau
berkurangnya gerombolan [6, 18]. Namun, strain P. mirabilis sangat
bervariasi dalam karakteristik berkerumun, dan beberapa strain lebih
mudah dihambat daripada yang lain. Beberapa strain akan berkerumun
pada media penghambat yang berkerumun, terutama di lingkungan yang lembab.
2. Formulasi ini juga dikenal sebagai LB-Luria, berlawanan dengan LB-Lennox
atau LB-Miller, yang masing-masing memiliki 5 atau 10 g NaCl per liter.
Mengurangi garam adalah kunci untuk mencegah P. mirabilis berkerumun.
Koloni P. mirabilis tipe HI4320 yang sudah tumbuh akan mulai berkerumun
pada cawan LB yang dibiarkan pada suhu kamar, tetapi tidak pada cawan
yang diinkubasi pada suhu 37 C atau disimpan pada suhu 4 C.
3. P. mirabilis yang dibiakkan pada agar LB dapat disimpan pada suhu 4 C hingga satu
bulan. Bungkus piring dalam film penyegel parafin atau tempatkan dalam kantong
plastik untuk mencegah agar agar tidak mengering. Sebagian besar galur P. mirabilis
secara perlahan akan mengubah warna agar menjadi jingga lebih dalam selama
penyimpanan pada suhu 4 C.
9. Ini adalah modifikasi dari formulasi asli MacConkey [26], tetapi modifikasi ini
adalah versi yang paling umum digunakan saat ini [27].
10. Lihat Lominski dan Lendrum [5] untuk pembahasan rinci tentang empedu
garam dan agen antiswarming lainnya.
Machine Translated by Google
11. Hayward dan Miles [28] menemukan bahwa 6-8% agar cukup untuk
mencegah swarming oleh semua isolat Proteus, tetapi konsentrasi agar ini
sulit untuk dikerjakan.
12. Hasil serupa telah dilaporkan untuk 60 ÿg/mL resveratrol (3,5,4-trihidroksi-
trans-stilbene) [29].
13. Penambahan 0,005% NaN3 juga telah dilaporkan menghambat pertumbuhan
P. mirabilis, namun swarming masih terjadi pada konsentrasi ini [30].
14. Dengan adanya urea, P. mirabilis akan dengan cepat membuat media
menjadi basa karena aktivitas urease dan pelepasan amonia (lihat Bab 9
dari volume ini untuk informasi lebih lanjut tentang urease). Dalam urin, ini
menyebabkan pengendapan mineral dan pembentukan kristal struvite
(Gbr. 2). Urease juga menyebabkan peningkatan pH yang dapat dengan
cepat menjadi racun di lingkungan tertutup, seperti cawan petri atau tabung
biakan. Dua pilihan untuk menghindari masalah pH ini adalah
menghilangkan urea dari urin sintetik, atau melakukan percobaan
menggunakan mutan urease [19, 31].
15. Urin juga dapat digunakan sebagai media biakan cair [31]. Dalam hal ini,
kumpulkan urin dari sukarelawan dan sterilkan filter. Urin dapat digunakan
segera, disimpan pada suhu 4 C untuk jangka pendek, atau dibekukan
pada suhu 20 C untuk penyimpanan jangka panjang. Penyimpanan dan
pembekuan dapat menyebabkan degradasi komponen labil; namun,
pengumpulan dan penyimpanan alikuot dapat meningkatkan reproduktifitas hasil.
16. Pengumpulan urin manusia mungkin memerlukan persetujuan dari dewan
peninjau kelembagaan yang sesuai. Relawan seharusnya tidak minum
antibiotik baru-baru ini, karena banyak antibiotik akan dikeluarkan melalui
urin dan akan mempengaruhi pertumbuhan bakteri.
17. Urin yang diautoklaf menghasilkan bau menyengat, seperti halnya agar urin
ketika diinokulasi dengan P. mirabilis. Bekerja di area yang berventilasi
baik dan/atau jauh dari orang lain sangat dianjurkan.
18. Versi modifikasi dari media ini dijelaskan di Bab 14
dari volume ini.
Terima kasih
Terima kasih kepada Stephanie Himpsl untuk diskusi konstruktif dan Chelsie
Armbruster untuk menyempurnakan metode agar urin.
Referensi
1. Drzewiecka D (2016) Signifikansi dan Peran 2. O'Hara CM, Brenner FW, Miller JM (2000)
Proteus spp. bakteri di lingkungan alami. Klasifikasi, identifikasi, dan signifikansi klinis
Mikrob Ecol 72(4):741–758. https://doi.org/ Proteus, Providencia, dan Morganella.
10.1007/s00248-015-0720-6 Klinik Microbiol Rev 13(4):534–546
Machine Translated by Google
12 Melanie M. Pearson
3. Lane MC, Li X, Pearson MM, Simms AN, Mobley vulgaris oleh triklosan. J Clin Microbiol 25
HLT (2009) Kondisi yang membatasi oksigen (7):1312–1313
memperkaya sel fimbriat dari Proteus mirabilis 17. Liaw SJ, Lai HC, Wang WB (2004) Modulasi
dan Escherichia coli uropathogenic. swarming dan virulensi oleh asam lemak melalui
J Bacteriol 191(5):1382–1392 4. protein RsbA dalam Proteus mirabilis.
Belas R, Erskine D, Flaherty D (1991) Trans poson Infect Immun 72(12):6836–6845 18.
mutagenesis di Proteus mirabilis. J Bac teriol Naylor PGD (1964) Pengaruh elektrolit atau
173(19):6289–6293 karbohidrat dalam medium kekurangan natrium
5. Lominski I, Lendrum AC (1942) Pengaruh agen klorida terhadap pembentukan koloni diskrit
aktif permukaan pada B. proteus. J Pathol Proteus dan pengaruh zat ini terhadap
Bacteriol 54(4):421–433. https://doi.org/ 10.1002/ pertumbuhan dalam kultur cair. J Appl Bakteriol
path.1700540403 6. Sandys 27 (3):422–431. https://doi.org/10.1111/j.
GH (1960) Sebuah metode baru untuk mencegah 1365-2672.1964.tb05050.x
swarming Proteus sp. dengan deskripsi media 19. Armbruster CE, Hodges SA, Mobley HLT (2013)
baru yang cocok untuk digunakan dalam praktek Inisiasi motilitas berkerumun oleh Pro teus
laboratorium rutin. J Med Lab Technol 17:224– mirabilis terjadi sebagai respons terhadap isyarat
233 spesifik yang ada dalam urin dan membutuhkan
7. Mackey JP, Sandys GH (1966) Diagnosis infeksi kelebihan L-glutamin. J Bakteriol 195(6):1305–
saluran kemih. Brit Med J 1(5496):1173. https:// 1319. https://doi.org/10.1128/JB.02136-12
doi.org/10.1136/bmj.1.5496.1173 8. Rauprich 20. Stickler DJ, Morris NS, Winters C (1999) Model
O, Matsushita M, Weijer CJ, Siegert F, Esipov SE, fisik sederhana untuk mempelajari pembentukan
Shapiro JA (1996) Fenomena peri odik dalam dan fisiologi biofilm pada kateter uretra.
perkembangan koloni kawanan Proteus mirabilis. Metode Enzymol 310:494–501 21.
J Bacteriol 178 (22):6525–6538 9. Stok I (2003) Griffith DP, Musher DM, Itin C (1976) Ure ase.
Kerentanan Penyebab utama batu kemih akibat infeksi.
antibiotik alami Proteus spp., dengan referensi Menyelidiki Urol 13(5):346–350 22. Brooks T,
khusus untuk strain P. mirabilis dan P. penneri. J Keevil CW (1997) Urin buatan sederhana untuk
Terapi kemoterapi 15(1):12–26. https://doi.org/ pertumbuhan patogen saluran kemih. Lett Appl
10. 1179/joc.2003.15.1.12 Microbiol 24(3):203–206 23.
Smibert RM, Krieg NR (1994) Karakterisasi fenotipik.
10. Russell FE (1963) Sinergi antara obat sulfo Dalam: Gerhardt P (ed) Metode bakteriologi
namid dan antibiotik golongan polimiksin terhadap umum dan molekuler. Ameri can Society for
Proteus sp. in vitro. J Clin Pathol 16(4):362. https:// Microbiology, Washington, DC, pp 642–647 24.
doi.org/10.1136/jcp.16. 4.362 Fildes P (1938)
Pertumbuhan Proteus pada amonium laktat ditambah
11. Sud IJ, Feingold DS (1970) Mekanisme resistensi asam nikotinat. Br J Exp Pathol 19(4):239–244
polimiksin B pada Proteus mirabilis. 25. Neidhardt FC, Bloch PL,
J Bakteriol 104(1):289–294 Smith DF (1974)
12. Liaw SJ, Lai HC, Ho SW, Luh KT, Wang WB Media kultur untuk enterobacteria. J Bacteriol
(2000) Penghambatan ekspresi faktor virulensi 119(3):736–747
dan diferensiasi berkerumun pada Proteus 26. MacConkey AT (1908) Media garam empedu dan
mirabilis oleh p-nitrofenilgliserol. J Med Mikrobiol keuntungannya dalam beberapa pemeriksaan
49(8):725–731 bakteriologis. J Hyg (Lond) 8(3):322–
13. Senior BW (1978) p-nitrophenylglycerol - agen 334 27. Holt JG, Krieg NR (1994) Pengayaan dan
antiswarming unggul untuk mengisolasi dan isolasi. Dalam: Gerhardt P (ed) Metode bakteriologi
mengidentifikasi patogen dari bahan klinis. umum dan molekuler. Masyarakat Mikrobiologi
J Med Microbiol 11(1):59–61 14. Amerika, Washington, DC, hal 205
Alwen J, Smith DG (1967) Media untuk menekan
kerumunan spesies Proteus. J Appl Bac teriol 28. Hayward NJ, Miles AA (1943) Penghambatan
30(2):389–394. https://doi.org/10. 1111/ Proteus dalam kultur dari luka. Lancet 2:116–117
j.1365-2672.1967.tb00313.x 15.
Hernandez E, Ramisse F, Cavallo JD (1999) 29. Wang WB, Lai HC, Hsueh PR, Chiou RY, Lin SB,
Penghapusan kerumunan Proteus. J Clin Liaw SJ (2006) Penghambatan ekspresi faktor
Microbiol 37(10):3435–3435 swarming dan virulensi pada Proteus mirabilis
16. Firehammer BD (1987) Penghambatan oleh resveratrol. J Med Microbiol 55 (Hal 10):1313–
pertumbuhan dan gerombolan Proteus mirabilis dan Proteus 1321. https://doi.org/10. 1099/jmm.0.46661-0
Machine Translated by Google
30. Alteri CJ, Himpsl SD, Engstrom MD, Mobley ekspresi gen asimilasi nitrogen. Menginfeksi
HLT (2012) Respirasi anaerob menggunakan Imun 79(7):2619–2631. https://doi.org/ 10.1128/
siklus TCA oksidatif lengkap mendorong IAI.05152-11
multisel lular berkerumun di Proteus mirabilis. 32. Mobley HLT (2000) Virulensi dari dua
mBio 3(6). https://doi.org/10.1128/ uropatogen utama - Escherichia coli dan Pro
mBio.00365-12 31. Pearson MM, Yep A, Smith SN, teus mirabilis menunjukkan mekanisme
Mobley HLT (2011) Transkriptom Proteus patogenesis yang berbeda ketika menyebabkan
mirabilis di saluran kemih murine: virulensi dan infeksi saluran kemih. Berita ASM 66(7):403–410