3/15/2016

MIKROBIOLOGI – 5 Pendahuluan
Pengaruh Faktor Lingkungan  Aktivitas mikroorganisme sangat dipengaruhi oleh kondisi fisika
terhadap Pertumbuhan Mikrobia dan kimia lingkungan sekitarnya.
 Pemahaman mengenai pengaruh faktor lingkungan:
– dapat menjelaskan agihan mikrobia di alam
– mendesain metode untuk mengontrol aktivitas mikrobia
– membunuh mikrobia yang tidak diharapkan
 Respon mikrobia terhadap faktor lingkungan tidak sama
ada yang membahayakan bagi mikrobia, tetapi bagi mikrobia
lain mungkin menguntungkan.
 Kondisi lingkungan dapat memengaruhi:
– viabilitas mikrobia
– pertumbuhan, diferensiasi, dan reproduksi
Ekawati Purwijantiningsih

PENGARUH SUHU
TERHADAP PERTUMBUHAN MIKROBIA
Pendahuluan
• Ada 4 faktor lingkungan yg dominan dlm mengontrol  Suhu memengaruhi pertumbuhan dan survival mikrobia
pertumbuhan mikrobia:  Memengaruhi mikrobia dengan 2 cara yg berbeda:
– kenaikan suhu  reaksi kimia dan enzimatik pd sel berjalan lebih
1. Suhu cepat dan pertumbuhan menjadi cepat
2. Ketersediaan air – Di atas suhu tertentu  protein, asam nukleat dan komponen
struktur yg lain akan rusak
3. pH
4. Oksigen  Setiap mikrobia mempunyai: suhu minimum, optimum, dan
maksimum  Cardinal Temperature

 Suhu minimum pertumbuhan  “freezing” membran sitoplasmik

 menghambat transpor nutrien dan pembentukkan gradien
proton  akibat komposisi lipid membran berubah

Temperature
 A most important factor influencing the growth
is the temperature sensitivity of enzyme
catalyzed reactions.
 High temperature:
1. Denature enzymes, transport carries, and other
proteins.
2. Microbial membranes are also disrupted by
temperature extremes.
3. The lipid bilayer melts and disintegrates.

1
 3/15/2016

pH & suhu
memengaruhi
aktivitas enzim

PENGARUH SUHU
TERHADAP PERTUMBUHAN MIKROBIA
Temperature Range
• Berdasarkan suhu optimum:
1. Psikrofil: suhu optimal rendah (0-20°C)
2. Mesofil: suhu optimal sedang (20-50°C)
3. Termofil: suhu optimal tinggi (50-80°C)
4. Hipertermofil: suhu optimal sangat tinggi (>80°C)

• E. coli (mesofil): suhu optimum pada medium kompleks

adalah 39oC, maksimum pada 48oC dan minimum pada 8oC

Bacterium Habitat Min Opt Max

Listeria monocytogenes Animals, soil, rotting vegetation, water 1 30-37 45
Vibrio marinus Open ocean 4 15 30
Stenotrophomonas Soil 4 35 41
maltophilia
Thiobacillus novellus Places where reduced sulfur are present (many 5 25-30 42
habitats)
Staphylococcus aureus Skin 10 30-37 45
Escherichia coli Intestines 10 37 45

Clostridium perfringens Soil, food 15 45 55

Streptococcus pyogenes Mucous membranes 20 37 40

Celah hidrotermal merupakan
Anoxybacillus flavithermus Manure piles (warm) 30 60 72 rekahan permukaan bumi di
Thermus aquaticus Hot springs 40 70-72 79
bawah laut tempat magma
merembes dan memanaskan air
Methanococcus jannaschii Hydrothermal vents 60 85 90

Sulfolobus acidocaldarius Sulfur springs (hot and reduced sulfur compounds) 70 75-85 90

Pyrobacterium brockii Hydrothermal vents 80 102-105 115

Methanopyrus kandleri Hydrothermal vents 85 100 110

2
 3/15/2016

PERTUMBUHAN MIKROBIA
PADA SUHU EKSTRIM (panas/dingin)

 Ekstrim: suhu sangat dingin/sangat panas pd lingkungan.

 Lingkungan yg dingin dan psikrofil
– banyak habitat alami mempunyai suhu yg relatif rendah misal
Samudra (5oC), Laut dalam (1-3oC)
– lingkungan dingin biasanya agak steril
– Psikrofil: organisme yg hidup pada suhu optimal 15oC
(kurang), suhu maksimum di bawah 20oC dan suhu minimum
0oC atau kurang (cepat mati pd suhu kamar/28oC)
– organisme yg dapat tumbuh pada 0oC dan suhu optimum 20-
40oC disebut Psikrotoleran
– Contoh: Chlamydomonas nivalis (alga)  mempunyai spora
yg berwarna merah terang

PERTUMBUHAN MIKROBIA PADA SUHU EKSTRIM

(panas/dingin)

 Psikrotoleran dpt diisolasi dr tanah, air, daging,

susu/produk makanan lain, sayuran, buah-buahan yg
disimpan dlm refrigerator (bbrp genus dr bakteri, fungi,
alga, protozoa)

 Psikrofil dpt beradaptasi karena:

1. Memproduksi enzim yg berfungsi secara optimal pd suhu
dingin dan sering terdenaturasi/inaktivasi pd suhu sedang
2. Transpor aktif terjadi pd suhu rendah.
3. Membran sitoplasmik  terdiri dr banyak asam lemak yg
tidak jenuh  menjaga kondisi membran semifluid pd suhu
rendah

3

PERTUMBUHAN MIKROBIA PADA SUHU EKSTRIM
(panas/dingin)
Pendinginan:
• mencegah pertumbuhan mikrobia tetapi tidak menyebabkan
kematian
• implikasi praktis dlm penyimpanan  kultur + gliserol (10%)
akan mencegah terjadi dehidrasi dan mencegah pembentukkan
kristal es pd suhu –70 sampai –196oC (gliserol berperan sbg
krioprotektan)
PERTUMBUHAN MIKROBIA
PADA SUHU EKSTRIM (panas/dingin)
Adaptasi molekuler terhadap lingkungan dgn suhu
tinggi:
 Enzim dan protein lebih stabil terhadap panas
 Fungsi optimal makromolekul terjadi pd suhu tinggi
 Asam amino kritis pd enzim biasanya terjadi pelipatan sehingga
terhindar dari efek denaturasi akibat panas
 Ada kenaikkan jumlah ikatan garam (ikatan dengan kation, misal
Na+)
 Protein dikemas dalam kondisi hidrofilik
 Lipid membran terdiri dari asam lemak jenuh membran stabil
dan berfungsi pd suhu tinggi
A-helix provides flexibility
3/15/2016
PERTUMBUHAN MIKROBIA PADA SUHU EKSTRIM
(panas/dingin)
 Lingkungan dgn suhu tinggi  termofil serta hipertermofil
• termofil: tumbuh pd suhu optimum di atas 45oC
• hipertermofil: tumbuh pd suhu optimum di atas 80oC
 Aliran air panas (150 - 500oC), celah (cerobong) hidrotermal di
dasar laut (350oC)
 Kebanyakan termofilik dari prokaryot tergolong spesies Archaea
Molecular basis for growing at
extreme temperatures
• Molecular adaptations of enzymes to extreme
temperatures
 Cold-active enzymes are more flexible due to
higher portion of a helix and less amount of b-
sheet
 Heat resistant enzymes have different folding
patterns because of a few different amino acids in
some critical positions from their mesophile
counterpart, more salt bridges and more densely
packed hydrophobic interior
B-sheet causes more rigidity
4
 3/15/2016

More a helixes result in more flexible structure, More b-sheets result in a more rigid
which is cold resistant structure, which is less cold active

Growth at low Temperatures

Homoviscous adaptation = adjustment of membrane fluidity
Termofilik biasanya memiliki lipid kaya asam - More cis-double bonds - Few cis double bonds
lemak jenuh. - Reduced hydrophobic interactions - optimal hydrophobic interactions

Hal tersebut memungkinkan membrane untuk

tetap stabil dan fungsional pada suhu tinggi.
Asam lemak jenuh membentuk lingkungan - mesophiles - thermophiles
hidrofobik kuat daripada asam lemak tak Fatty acid composition of plasma membrane as % total fatty acids
jenuh , yang membantu menjelaskan stabilitas E. coli grown at: 10°C 43°C
C16 saturated (palmitic) 18 % 48 %
membrane C16 cis-9-unsat. (palmitoleic) 26 % 10 %
C18 cis-11-unsat. (cis-vaccinic) 38 % 12 %

Psychrophilic vs Psychrotolerant Growth at high temperatures

Sierra Nevada Psychrotolerant
Psychrophiles Maximum: >20°C
Optimum: 20-40°C Thermophilic:
Maximum: <20°C
Minimum: <0-4°C optimum > 45°C
Optimum: <15°C
Habitats: much more abundant Soil in sun often 50°C
Minimum: <0°C
than psychrophiles Fermentation: 60-65°C
Habitats:
- soil in temperate climate
- deep sea
- foods <65°C
- glaciers
- grow slowly even in fridge!
Hyperthermophilic:
optimum > 80°C
Limit: Freezing Only in few areas:
- Inhibits bacterial growth Hot springs: 100°C
- freezing: often liquid pockets Steam vents 150-500°C
- many bacteria survive Deep sea hydrothermal vents
Chlamydomonas nivalis
- cryoprotectants (DMSO, glycerol)
red spores The snow algae

5
 3/15/2016

Growth at high temperatures Hyperthermophiles have cell membrane

as lipid monolayer
Molecular adaptations in thermophilic bacteria
Proteins
- Protein sequence very similar to mesophils
- more salt bridges
- densely packed hydrophobic cores

Lipids
- more saturated fatty acids
- hyperthermophilic Archaea: C40 lipid monolyer

DNA
- sometimes GC-rich
- reverse DNA gyrase
- archaeal histones (increase Tm) Bacteria Archaea

PERTUMBUHAN MIKROBIA PADA SUHU EKSTRIM Thermophile and Biotechnology

(panas/dingin)
 Mengapa ekaryot absen pd lingkungan dgn suhu di atas 60oC?
 stabilitas membran organel yg bersifat porous (utk aliran
molekul besar spt ATP dan RNA)  lebih labil thdp suhu
 Kajian ekologi thdp organisme yg hidup di aliran air panas 
mempunyai doubling time kira-kira 1 jam
 Suhu optimum pertumbuhan bbrp hipertermofil lebih dari
1000C  tumbuh pd saluran-saluran bertekanan dan mencegah
pendidihan, misal pd water heater (thermofilik Thermus
aquaticus)
 Keuntungan: proses bioteknologi biasanya dilakukan scr cepat
dan efisien pd suhu tinggi  perlu enzim yg tahan thdp suhu
tinggi, misal: Taq polimerase  enzim yg digunakan utk
memperbanyak DNA dgn metode Polymerase Chain Reaction
(PCR)
• Enzymes from thermophiles are capable of
catalyzing biochemical reactions at high
temperature, they are more stable;
• DNA polymerase, Taq polymerase, has been
isolated from thermophile-Thermus aquaticus, for
PCR application;
• DNA polymerase, pfu polymerase, isolated from
hyperthermophile-Pyrocuccus furiosus, is more
stable and useful for PCR application, it also less
prone to errors;
• Microbial process carried out at high T also
eliminate or greatly reduce cooling costs.

6
 3/15/2016

ASIDITAS & ALKALINITAS (pH) ASIDITAS & ALKALINITAS (pH)

• pH di bawah 7  asam, di atas 7  basa/alkali

• pH adalah fungsi log  perubahan 1 unit pH berarti perubahan
10x konsentrasi ion hidrogen. Contoh: cuka (pH= 2) dan amonia
(pH= 11)  perbedaan [H] adalah 1 billion kali!
• Lingkungan alami  pH 5-9
 Pd batch culture  tjd perubahan pH slm pertumbuhan sbg
akibat dr reaksi metabolik yg mengkonsumsi /memproduksi
senyawa asam/basa  menjaga pH perlu buffer
 Buffer dgn kisaran pH netral (pH 6-7,5) biasanya memakai
KH2PO4 (ditambah pd medium pertumbuhan atau utk penelitian
enzim yg berasal dr sel mikrobia)
1. ACIDOFIL
 pH rendah (di bawah 5)
 fungi, bbrp bakteri (obligat asidofilik, contoh Thiobacillus
dan Sulfolobus  mengoksidasi mineral sulfid dan
memproduksi asam sulfurat
 faktor kritis pd asidofil obligat adalah membran sitoplasmik
yaitu apabila pH ke arah netral  membran sitoplasmik
biasanya larut dan lisis sel  menandakan [H]↑ dibutuhkan
utk stabilisasi membran.

ASIDITAS & ALKALINITAS (pH)

2. ALKALOFIL
 pH alkali (10-11)
 ditemukan pd Soda lakes, tanah dengan karbonat tinggi
 Prokaryot alkalofil  Bacillus sp dan biasanya halofolik (suka
garam)
 digunakan di industri krn menghasilkan enzim hidrolitik (protease,
pd deterjen)
 pH optimal pertumbuhan adalah pH ekstraseluler sedang pH
intraseluler harus mendekati netral (mencegah makromolekul yg
labil thdp asam-basa dr kerusakan), kecuali pd ekstrim
asidofil/alkalofil, pH intraseluler adalah 1-1,5 dr pH netral (netral
6-8  neutrofil)
 Pada batch culture  tjd perubahan pH selama pertumbuhan sbg
akibat dr reaksi metabolik yg mengkonsumsi/memproduksi
senyawa asam/basa  menjaga pH perlu buffer

Most bacteria like to grow at a Neutral pH

Hydrogen ion concentration (pH)

• Optimal pH for growth
– Acidophiles
– Neutrophiles
neutral
– Alkalophiles

The growth ranges of bacteria based on pH

A graph showing growth rates of acidophiles, neutrophiles and
alkalophiles as a function of pH.

7
 3/15/2016

Min Opt Max

Organism Habitat pH pH pH
Thiobacillus Areas rich in sulfur, often acidic 0.5 2.0-2.8 4.0-6.0
thiooxidans
Sulfolobus
acidocaldarius
Acidic sulfur springs 1.0 2.0-3.0 5.0 Growth at low pH
Bacillus acidocaldarius Acidic hot springs 2.0 4.0 6.0
Fungi: often more acid tolerant than bacteria (opt. pH 5)
Zymomonas lindneri High sugar environments (sugar cane, 3.5 5.5-6.0 7.5
wine, honey)
Lactobacillus Animals, plants, decaying matter 4.0-4.6 5.8-6.6 6.8 Obligate acidophilic bacteria: Thiobacillus ferrooxidans
acidophilus
Staphylococcus aureus Surfaces of animals, nasal cavity, skin 4.2 7.0-7.5 9.3 Obligate acidophilic Archaea: Sulfolobus, Thermoplasma
Escherichia coli Intestines of animals 4.4 6.0-7.0 9.0
Clostridium sporogenes Soils and sediments that are anaerobic 5.0-5.8 6.0-7.6 8.5-9.0 Most critical: cytoplasmic membrane dissolves at more
Erwinia caratovora Plant pathogen 5.6 7.1 9.3 neutral pH
Pseudomonas Ubiquitous 5.6 6.6-7.0 8.0
aeruginosa
Streptococcus Pathogen of animals 6.5 7.8 8.3
pneumoniae
Nitrobacter spp. Ubiquitous 6.6 7.6-8.6 10.0

Bacterial growth: high pH

pH
- Few alkalophiles (pH 10-11)
- Bacteria: Bacillus spp. Effects of acids on organisms
- Archaea
- often also halophilic
• energy required to maintain cell's internal pH
- Sometimes: H+ gradient replaced by Na+ gradient (motility, • enzyme activity affected
energy)
- industrial applications (especially „exoenzymes“): • proteins, DNA, other molecules denatured
Proteases/lipases for detergents (Bacillus • longer lag, less rapid growth
licheniformis)
pH optimum of these enzymes: 9-10

Faktor-faktor yang mempengaruhi nilai pH

intrasel

 Kapasitas bufer sitoplasma

 Metabolisme produksi asam dan basa.
 Homeostasis pH adalah mengatur keluar-masuknya
proton. Ketika nilai pH intrasel menjadi sangat asam
(akibat perubahan nilai pH eksternal menjadi asam),
maka proton akan dipompa keluar

8
 3/15/2016

KETERSEDIAAN AIR
Buffers in Bacterial Culture Media (WATER AVAIBILITY)
pH range buffer system
1.1 - 3.5 glycine/HCl  Air adalah pelarut dlm jasad hidup  semua organisme
2.2 - 4.0 KH-phtalate/HCl membutuhkan air dan ketersediaan air adalah faktor
3.6 - 5.6 Na-acetate/acetic acid penting yg memengaruhi pertumbuhan mikroorganisme
5.0 - 8.0 KH2PO4/Na2HPO4 di alam.
5.0 - 6.6 Na-citrate/NaOH
7.2 - 9.0 TRIS/HCl
 Ketersediaan air tergantung dari:
8.5 - 12.9 glycine/NaOH  air yang terdapat di lingkungan
9.2 - 10.7 Na2CO3/NaHCO3  konsentrasi solut (garam, gula, senyawa lain) yg terlarut
10.9 - 12.0 Na2HPO4/NaOH Sambrook et al., 1989, Molecular cloning, 2nd ed. dalam air
 Senyawa terlarut mempunyai afinitas thdp air
menyebabkan air berasosiasi dgn solut sehingga tidak
tersedia bagi organisme

Aktivitas Air & Osmosis

 Water activity (aw) = nisbah tekanan uap air di udara dlm
keseimbangan dgn senyawa/larutan dgn tekanan uap air. Air
murni pd suhu yg sama  nilainya bervariasi antara 0-1 water
activity dr tanah pertanian: 0,9 –1,0
 Air akan berdifusi dr konsentrasi air yg tinggi (konsentrasi solut
rendah) ke konsentrasi air yg rendah (konsentrasi solut tinggi) dlm
proses osmosis
 Pd sitoplasma sel, [solut] lebih tinggi drpd lingkungan sehingga air
akan berdifusi ke dalam sel dan sel dpt dikatakan dlm “positive
water balance”.
 Pd saat sel berada pd lingkungan yg aktivitas airnya rendah  air
cenderung ke luar dr sel dan tjd plasmolisis (misal sel diinkubasi
pd larutan garam/gula)  larutan gula atau garam efeknya dpt
dianalogkan dgn lingkungan kering
 Air laut  3% NaCl + mineral + unsur

Physical Requirements: Osmotic Pressure

Bacterial growth: Osmosis

Soil: water activity = 0.9 – 1.0

In general: bacteria normally have higher osmotic pressure than environment
= „positive water balance“
• Hypertonic environments, increase salt or sugar, cause plasmolysis
Osmophiles - grow in presence of high sugar concentration
Xerophiles - grow in „dehydrated“ environments • Extreme or obligate halophiles require high osmotic pressure
• Facultative halophiles tolerate high osmotic pressure

9
 3/15/2016

Bacterial growth:
Halophiles Bacterial growth at low aw: compatible
Halophiles: - requirement for Na+
- grow optimally in media with low water activity solutes
- Mild: 1-6 % NaCl Strategy: increase internal solute concentration
- Moderate: 6-15 % NaCl most other organisms
would be dehydrated a. Pump inorganic ions Solute must be „compatible“
- extreme: 15 – 30% NaCl b. Synthesize organic solutes with cellular processes

Adaptasi Mikrobia
Minimum water  Mikroorganisme yg hidup di laut biasanya membutuhkan ion Na
Organism Habitat activity for utk pertumbuhan optimal  disebut Halofil, digolongkan:
growth  Mild halofil: 1-6% NaCl
 Moderate halofil: 6-15% NaCl
Caulobacter Dilute fresh and sea water 1.00
 Ekstrim halofil: 15-30% NaCl
Pseudomonas Ubiquitous low salt 0.91  Halotoleran: organisme yg toleran thdp lingkungan dgn aw rendah
environments ttp umumnya tumbuh baik pd absennya penambahan solut
Salmonella/E. coli Animals 0.91  Organisme yg mampu hidup pd aw rendah  sangat menarik
- aplikasi utk bidang industri  garam/sukrosa umum digunakan
Lactobacillus Animals and plants 0.90 sbg food additive utk menghambat pertumbuhan mikrobia
Bacillus Soil 0.90  Osmofil, Ekstrem osmofil: organisme yg mampu hidup pd
lingkungan gula tinggi
Staphylococcus Animals 0.85
 Xerofil: organisme yg mampu hidup pd lingkungan yg sangat kering
Halobacterium High salt lakes such as 0.75
Great Salt Lake or the Dead
Sea

Mekanisme Osmoregulasi

Pada aw rendah ----------------- mikrobia yang tahan beberapa jam

kemudian

sel plasmolisis Konsentrasi asam amino dalam

sitoplasma meningkat
pertumbuhan terhenti

contoh:
Bacillus subtilis --- prolin
Mikrobia lain ------ prolin, asam gama-amino butirat, K+ dan glukosa

Meningkatkan tekanan osmotik utk menyesuaikan

dengan tek osmotik di luar sel
Air tdk terserap keluar sel
Sel tumbuh
Growth as a function of water activity
The majority of known microbes require high water activity to be able to grow.
Natural environments having low water activity include, salt lakes, soda lakes
and deserts. Microbes in these environments have special molecular
adaptations that allow them to grow.

10
 3/15/2016

Halophiles

Moisture  Microbes usually survive the problem of high salt by

accumulating counter solutes in their cytoplasm that balance
• Effects of low water levels the external osmotic pressure  Compatible solutes, do not
– longer lag, slower growth interfere with metabolism and are either pumped in from the
– impaired transport environments by active transport or synthesized de novo.
– loss of membrane fluidity
 Halotolerant and moderate halophiles use amino acids and
sugars as their compatible solutes, including proline, betaine,
glycerrol, trehalose, ribitol, sorbitol, and mannitol.
 Extreme halophiles pump in potassium (K) ions and most of
their enzymes only function in the presence of very high
concentrations of potassium chloride.

COMPATIBLE SOLUTE
 adalah molekul yg diakumulasi dlm sitoplasma sel utk
penyesuaian diri thdp aktivitas air, tp tidak menghambat
proses biokimiawi
 Organisme yg mampu tumbuh pd lingkungan dgn
aktivitas air rendah mampu meningkatkan [solut]
internalnya  cara:
• pemompaan ion anorganik dari lingkungan ke dalam
sel
• sintesis solut organik
 Contoh: gula, gula alkohol, alkohol lain, asam amino atau
derivatifnya, ion potassium (pd bakteri halofilik)
 kompatibel solut : jumlah yg diakumulasi dlm sel
tergantung dr konsentrasi solut eksternal  jumlah
maksimum yg diakumulasi tergantung dr masing-
masing organisme  tergantung dr kapasitas
genetis utk memproduksi/mengakumulasi
kompatibel solut  non-halotoleran, halotoleran,
halofilik dan ekstrim halofilik
 Contoh: Staphylococcus  halotoleran bakteri (prolin
sbg kompatibel solut), bakteri halofilik dan
sianobakteria (glisin betain), Ectothiorhodospira
(ectoin/derivat prolin), yeast yg xerofilik/pd
lingkungan garam tinggi (gliserol)

11
 3/15/2016

Oxygen
OKSIGEN
Penggolongan mikrobia berdasar kebutuhan oksigen:
can support or hinder growth
1. Aerob: spesies yg mampu tumbuh pd tekanan oksigen penuh (21% • Aerobic bacteria
oksigen udara)  enzim utk dekomposisi produk oksigen toksik – Require oxygen for growth
2. Microaerofilik: organisme aerob yg dpt menggunakan oksigen
hanya ketika oksigen udara sedikit. Organisme mikroaerofil  • Anaerobic bacteria
kapasitas respirasi rendah dan mengandung bbrp enzim/molekul yg
lebih thdp oksigen – Don’t require oxygen for growth
3. Anaerob: – May be killed by oxygen
a. Aerotoleran anaerob: organisme yg toleran thdp oksigen dan dpt – May be aerotolerant
tumbuh bila ada, namun tidak dapat menggunakannya • Facultative bacteria
b. Obligat anaerob (mikroorganisme mati kalau ada O2) – Can grow with or without oxygen
• tidak mampu mendetoksifikasi bbrp produk dr metabolisme – Aerotolerant
oksigen, misal H2O2, superoksida (O2-) atau radikal hidrogen
(OH) • Capnophilic bacteria
• mengandung banyak enzim flavin yg dpt bereaksi scr spontan – Requires low O2 + high CO2
dengan O2 dan menghasilkan produk yg toksik

12
 3/15/2016

Aerobic and Anaerobic Growth

Bacterial growth:
Anaerobes Microaerophilic Bacteria
Methods to exclude/reduce oxygen: A. Candle Jar
- Closed vessels
- reducing agents (i.e. thioglycolate broth)
air
air
air
air
air

- anaerobic jar (H2-generation + Pd catalyst)

- glove box (oxygen free gas)

16 % O2
microaerophile
obl. aerobe

aerotolerant
fac. aerobe
obl. anaerobe

anaerobe

4% CO2

Organisms Habitat Oxygen relatioship

Sulfolobus acidocaldarius Hot sulfur springs Strict aerobe

Acinetobacter calcoaceticus Skin Strict aerobe Mikroba Habitat Ketergantungan akan
oksigen

Bifidobacterium bifidum Human intestines Strict anaerobe Sulfolobus acidocaldarius

Acinetobacter calcoaceticus
Mata air sulfur panas
Kulit
Aerob obligat
Aerob obligat
Bifidobacterium bifidum Usus manusia Anaerob obligat
Methanosarcina barkeri Fresh water and marine sediments, Strict anaerobe Methanosarcina barkeri Air tawar, sedimen laut, digestor limbah Anaerob obligat
Magnetospirillum magnetotacticum anaerob Mikroaerofil
anaerobic sewage digestors Campylobacter jejuni Air tawar dan laut Mikroaerofil
Bacillus licheniformis Permukaan mukosa hewan & burung Fakultatif anaerob
Magnetospirillum Fresh and marine water Microaerophile Enterobacter aerogenes
Vibrio fischeri
Ubiquitous
Usus hewan berdarah panas, air tawar
Fakultatif anaerob
Fakultatif anaerob
magnetotacticum Lactobacillus acidophilus Air laut, organ ringan species laut Aerotoleran anaerob
Hewan, tanaman, makanan
terfermentasi
Campylobacter jejuni Mucosal surfaces of animals and Microaerophile
birds
Bacillus licheniformis Ubiquitous Facultative
anaerobe
Enterobacter aerogenes Intestines of warm-blooded Facultative
animals, fresh water anaerobe
Vibrio fischeri Marine water, light organ of Facultative
several marine species anaerobe
Lactobacillus acidophilus Animals plants, fermented foods. Aerotolerant
anaerobe

13
 3/15/2016

 Mikroba yang memerlukan (mutlak) oksigen bagi

pertumbuhannya disebut aerob obligat.
 Mikroba yang tidak memerlukan (mutlak) oksigen bagi
pertumbuhannya disebut anaerob obligat.
 Mikroba aerob yang dapat tumbuh tanpa oksigen disebut
fakultatif anaerob.
 Mikroba yang dapat tumbuh dengan atau tanpa adanya
oksigen (meskipun dia tidak memerlukan oksigen) disebut
aerotoleran anaerob.
 Sedangkan mikroba yang hanya dapat tumbuh di lingkungan
dengan kandungan oksigen rendah ( di bawah kandungan
oksigen atmosfer) disebut mikroaerofil

Sediaan Mikrobia & Efek Oksigen

 Utk aerob: perlu aerasi pada sediaan, krn O2 sangat sedikit larut
dlm air, dpt di-agitasi (shaker) atau menghembuskan udara steril
ke medium

 Utk anaerob: tabung diisi penuh dgn medium dan ditutup rapat
atau ditambah agen pereduksi yg bereaksi dgn oksigen menjadi
Pengaruh oksigen pada pola pertumbuhan mikroba. Media thioglikolat agar
H2O, misal: tioglikolat agar dgn indikator redox resazurin mampu membatasi difusi oksigen hanya sampai ¼ bagian agar.
(ditambahkan ke medium) dan akan mengubah warna apabila Tabung #1 menunjukkan pertumbuhan mikroba aerob. Tabung #2 dan #3
terdapat oksigen  indikator tingkat penetrasi oksigen ke medium menunjukkan pertumbuhan mikroba fakultatif anaerob, dan tabung #4
menunjukkan pertumbuhan mikroba anaerob

BENTUK TOKSIK OKSIGEN

• Oksigen adlh oksidan yg baik dan aseptor elektron yg baik utk respirasi
Obligate Faultative Obligate Aerotolerant
Microaerophiles • Mikroorganisme yg dpt mengubah bentuk toksik O2 menjadi non- toksik
aerobes anaerobes anaerobes anaerobes adalah mempunyai pigmen karotenoid
• Oksigen toksik (aktivitas enzim peroksidase) merupakan hasil samping dr
reduksi O2 mjd H2O pd respirasi terdiri:
1. Superoksida anion (O2-)
2. Hidrogen peroksida H2O2
3. Radikal hidroksil (OH.)
• Flavoprotein, quinon, protein iron-sulfur: dpt mereduksi O2 mjd O2-
• Semua oksigen toksik akan mengoksidasi senyawa organik dlm sel
• Enzim yg dpt menghancurkan produk oksigen adalah katalase dan
peroksidase  utk H2O2
• Superoksida akan dihancurkan oleh enzim superoksida dismutase (SOD)
biasanya berkombinasi dgn katalase  mjadi O2
• Aerob dan fakultatif aerob  umum mengandung SOD dan katalase
Thyoglycollate binds molecular oxygen, reducing it and removing it: R-SH + O2 
R-SO2

14
 3/15/2016

85

MIKROORGANISME ANAEROB
Anoxic jar
• Contoh bakteri anaerob obligat adalah
Clostridium (Gram +, pembentuk spora dan
batang pendek)  habitat pd tanah, sedimen,
intestinum, dan bertanggung jawab dlm
pembusukkan makanan kaleng

Anaerobic chamber
Bacterial growth: Oxygen detoxification
Catalase assay

15