PROTEIN

1. Perhatikan gambar struktur asam amino di bawah ini.

a. Apakah ada gugus fungsi khas yang dimiliki keempat contoh asam amino di atas?
Sebutkan.
b. Tentukan perbedaan antara asam amino satu dengan yang lain.
c. Simpulkan dasar pengelompokan senyawa asam amino.

2. Bandingkan keasamaan dari tiga semyawa asam amino di bawah ini.

Apakah semua asam amino bersifat asam, basa, atau netral?

3. Ada 20 jenis asam amino yang diperlukan oleh makhluk hidup.

a. Gambarkan struktur semua asam amino yang mengandung gugus alkil.
b. Gambarkan struktur semua asam amino yang mengandung gugus – OH.
c. Gambarkan struktur semua asam amino yang mengandung gugus sulfur.
d. Gambarkan struktur semua asam amino yang mengandung gugus nitrogen yang tidak
bersifat basa.
e. Gambarkan struktur semua asam amino yang mengandung gugus karboksilat
f. Gambarkan struktur semua asam amino yang mengandung gugus basa amina.

4. Apakah tubuh manusia dapat mensintesis seluruh jenis asam amino yang diperlukan? Jika
tidak, sebutkan asam amino yang dapat disintesis oleh tubuh manusia.

5. Apakah kedua puluh asam amino pada No. 3 memiliki atom karbon kiral? Jika tidak, sebutkan
asam amino yang tidak memiliki atom karbon kiral.

6. Apakah ada asam amino yang memiliki dua atom karbon kiral? Sebutkan.
7. Gambarkan semua stereoisomer dari tirosina, glutamina, dan valina menggunakan proyeksi
Fisher.

8. Apakah semua stereoisomer asam amino di No. 6 ditemukan secara alami pada tubuh makhluk
hidup? Jika tidak, sebutkan stereoisomer yang ditemukan pada tubuh makhluk hidup.

9. Berdasarkan hasil penelitian menunjukkan bahwa:

a. Asam amino memiliki titik lebur yang tinggi (lebih dari 200oC) dan berbentuk kristal.
b. Asam amino mudah larut dalam air daripada pelarut organik.
c. Asam amino memiliki momen dipol yang lebih besar daripada asam karboksilat dan amina.
Jelaskan mengapa demikian?

10. Gambarkan struktur asam amino: alanina, asam glutamat, dan serina pada:
a. pH = 1 b. pH = 7 c. pH = 12

11. Titik isoelektrik asparagina pada pH = 5,4, gambarkan struktur asparagina pada pH tersebut.
Apakah yang dimaksud dengan titik isoelektrik?

12. Gambarkan struktur triptofan pada titik isoelektriknya. Bagaimana struktur triptofan jika
dilarutkan dalam suasana asam dan basa.

13. Bagaimana cara menentukan titik isoelektrik lisina dan asam glutamat?

14. Jelaskan prinsip elektroforesis untuk memisahkan campuran asam amino.

15. Gambarkan pemisahan campuran alanina, lisina, dan asam aspartat menggunakan elektroforesis
pada pH = 9,7.

16. Gambarkan pemisahan campuran triptofan, sistein, dan histidin menggunakan elektroforesis
pada pH = 6.

17. Reaksi antara alanina dan asparagine menghasilkan produk A. Selanjutnya produk A
direaksikan dengan sisteina menghasilkan produk B. Kemudian produk B direaksikan dengan
glutamina menghasilkan produk C. Gambarkan struktur ketiga produk tersebut.
18. Sarankan metode sintesis asam amino alanina jika tersedia senyawa asam 2-oksopropanoat
(CH3COCOOH) di laboratorium.

19. Sarankan metode sintesis asam amino isoleusina jika tersedia senyawa asam 3-metilpentanoat
di laboratorium.

20. Sarankan metode sintesis asam amino sistein jika tersedia senyawa N—ftalimidamalonat ester (

) di laboratorium.

21. Sarankan metode sintesis asam amino treonina jika tersedia senyawa 2-hidroksibutanal di
laboratorium.

22. Sarankan metode sintesis asam amino lisina jika tersedia senyawa dietil asetamidamalonat di
laboratorium.

23. Bagaimana cara mengubah bahan-bahan di bawah ini menjadi asam amino? Jelaskan.

24. Bagaimana cara membuat (a) valina; (b) tirosina; dan (c) leusina menggunakan sintesis
Strecker? Jelaskan.

25. Bagaimana cara membuat (a) asam glutamate; (b) metionina; (c) serina menggunakan sintesis
Gabriel – malonat ester? Jelaskan.

26. Prediksikan asam amino yang terbentuk dari reaksi dietil asetamidamalonat dengan beberapa
alkil halida (a) metiliodida; (b) 1-kloro-3-metilpropana; (c) 2-bromobutana dalam suasana basa
kemudian dihidrolisis dan dekarboksilasi.
27. Prediksikan produk reaksi – reaksi di bawah ini.

28. Prediksikan produk reaksi – reaksi di bawah ini.

29. Suatu tripeptida dapat disintesis dari tiga jenis asam amino misalnya serina, leusina, dan
fenilalanina.
a. Ada berapa produk reaksi (tripeptida) yang dihasilkan dari reaksi antara serina, leusina,
dan fenilalanina? Gambarkan struktur masing – masing produk tersebut.
b. Tandai N-terminal dan C-terminal pada masing – masing produk reaksi tersebut.
c. Beri nama masing – masing produk tersebut.

30. Gambarkan masing – masing struktur senyawa dipeptida di bawah ini dan tentukan apakah
dipeptida tersebut bersifat asam, basa, atau netral?
a. Metionilthreonina (b) Serinilglutamilvalina (c) Aspraginilglutaminillisina
(d) Histidinilproliniltriptofan

31. Jika terdapat dua molekul tripeptida isoleusinilsisteinilfenilalanina mangalami oksidasi,

prediksikan produk reaksi yang terbentuk.

32. Perhatikan gambar struktur peptida di bawah ini.

a. Tandai N-terminal dan C-terminal pada peptida di atas. (b) Tandai ikatan peptida pada
peptida di atas. (c) Identifikasi dan tandai asam amino penyusunnya. (d) Beri nama
peptida di atas.
33. Suatu dekapeptida direaksikan dengan pereaksi Edman menghasilkan PTH-Gly. Hidrolisis
parsial terhadap dekapeptida menghasilkan beberapa fragmen sebagai berikut.
a. Ala, Trp c. Pro, Val e. Trp, Ala, Arg g. Glu, Ala, Leu
b. Val, Pro, Asp d. Ala, Glu f. Arg, Gly h. Met, Pro, Leu, Glu
Tentukan urutan asam amino dekapeptida tersebut.

34. Reaksi antara polipeptida dengan enzim karbopeptidase A menghasilkan Met. Hidrolisis parsial
terhadap dekapeptida menghasilkan beberapa fragmen sebagai berikut.
a. Met, Ala, Gly e. Lys, Ser h. Gly, His, Ala
b. Ser, Lys, Val f. Glu, His, Val i. Glu, Val, Ser
c. Glu, His g. Ser, Lys, Trp j. Leu, Lys, Trp
d. Ala, Met
Tentukan urutan asam amino polipeptida tersebut.

35. Tentukan urutan asam amino pada masing – masing polipeptida di bawah ini jika diketahui
fragmen – fragmen yang dihasilkan dari hidrolisis parsial polipeptida dengan asam.
a. Tetrapeptida yang mengandung Ala, Gly, His, dan Tyr, jika dihidrolisis menghasilkan His-
Tyr, Gly-Ala, dan Ala-His.
b. Pentapeptida yang mengandung Glu, Gly, His, Lys, dan Phe, jika dihidrolisis menghasilkan
His-Gly-Glu, Gly-Glu-Phe, dan Lys-His.
c. Oktapeptida yang mengandung Arg (2 ekuivalen), His, Ile, Phe, Pro, Tyr, dan Val, jika
dihidrolisis menghasilkan Ile-His-Pro-Phe, Arg-Arg-Val, Tyr-Ile-His, dan Val-Tyr.

36. Sarankan metode sintesis Ala-Val-Phe-Gly-Leu jika tersedia Ala-Val-Phe di laboratorium.

37. Tuliskan perbedaan protein globular dan protein serat.

38. Diantara asam amino berikut: valina, asam aspartat, fenilalanina, dan lisina; manakah asam
amino yang ditemukan di sisi luar protein globular dan yang di sisi dalam protein globular?

39. Gambarkan struktur polipeptida Ala-Cys-Ser-Asp-Lys-Val; dan identifikasi gaya antar molekul
apa saja yang terjadi antar polipeptida tersebut.

40. Tuliskan perbedaan struktur primer, sekunder, tersier, dan kuartener protein.

41. Apa yang dimaksud dengan denaturasi protein?

42. Jelaskan faktor – faktor yang mempengaruhi denaturasi protein.