BAB 1

Keanekaragaman Jamur

Pohon filogenetik

Hubungan evolusi antara jamur direpresentasikan dalam bentuk filogenetik pohon. Ujung ranting
pohon-pohon ini ditempati oleh jamur hidup dan cabang internal. Pohon filogenetik dapat dibangun
menggunakan apa saja ukuran kekerabatan, termasuk data morfologis, urutan protein, gen tunggal,
kelompok gen, atau, yang paling dapat diandalkan, dengan membandingkan seluruh genom.

Pohon filogenetik di mana panjang cabang diskalakan hingga waktu evolusi disebut kronogram. Ini sulit
dibangun jamur karena catatan fosil sangat jarang. Namun demikian, waktu asal-usul beberapa
pengelompokan yang lebih besar telah diperkirakan. Setelah urutan genetik yang diperlukan telah
dikompilasi dan disejajarkan satu sama lain, pohon filogenetik dapat dibangun menggunakan sejumlah
metode alternatif.

Metode jarak ods mengatur urutan berdasarkan kesamaan keseluruhannya, menghitung jumlah
pergantian nukleotida antara pasangan sekuens. Bergabung dengan tetangga adalah yang paling
populer metode jarak dan tidak membuat asumsi tentang proses evolusi. Metode berbasis karakter juga
digunakan secara luas. Ini melihat nukleotida spesifik dan menghitung penyisipan dan penghapusan di
setiap situs. Keuntungan dari metode ini dibandingkan dengan bergabung dengan tetangga adalah
bahwa mereka dapat menimbang pentingnya perubahan urutan nukleotida secara berbeda. Ini adalah
berguna karena beberapa perubahan dalam urutan tunggal, relatif terhadap urutan perbandingannya,
tidak informatif. Tetangga tetangga menggabungkan perubahan ini ke dalam pohonnya; metode
berbasis karakter ods dapat mengabaikan perubahan yang tidak informatif ini dan fokus pada yang lebih
sering dan informatif perubahan.

Implikasi dari Filogeni Molekuler

Klasifikasi jamur didorong oleh tujuan menghasilkan skema yang benar-benar alami yang
mencerminkan hubungan evolusi antara spesies. Perlu mempertimbangkan mengapa ini dilihat sebagai
tujuan penting. Dengan mengenali kedekatan evolusi spesies, kami segera memperoleh informasi yang
berguna tentang biologi jamur tertentu dengan merujuk pada apa diketahui tentang kerabatnya. Fitur
menarik dari ekologi, fisiologi, biologi sel, dan metabolisme sering dibagi oleh spesies terkait, dan
pengetahuan tentang taksonomi yang lebih besar kelompok dapat menginformasikan penelitian tentang
spesies tertentu.

Pertimbangan penting dalam berpikir tentang klasifikasi jamur adalah spesies dengan yang kami bagikan
hidup kami mewakili sebagian kecil dari semua jamur yang ada selama ini ratusan juta tahun sejarah
mikologis. Ini artinya kerabat terdekat dari banyak spesies masa kini yang menyimpang dari nenek
moyang mereka yang sama sejak dahulu kala. Dalam campur tangan waktu berabad-abad, sejumlah
besar kepunahan telah menyingkirkan sebagian besar spesies, meninggalkan celah besar di pohon
evolusi.

PHYLA Jamur

Enam filum diakui dalam pengaturan taksonomi jamur saat ini:

Kingdom Fungi

1. Filum Basidiomycota

2. Filum Ascomycota

3. Filum Glomeromycota

4. Filum Blastocladiomycota

5.Filum Chytridiomycota

6. Filum Neocallimastigomycota

Data genetik menunjukkan bahwa beberapa jamur tidak cocok dengan salah satu dari enam filum, tetapi
kami tidak memiliki informasi yang cukup untuk menggambarkan filum tambahan. Ini termasuk 900 atau
lebih spesies zygomycete, termasuk Mucor mucedo yang digunakan untuk menggambarkan siklus
kehidupan seksual yang sederhana di kelas laboratorium. Organisme ini diidentifikasi sebagai
Zygomycota Phylum sebelumnya klasifikasi, tetapi karena jamur ini tampaknya tidak mewakili asas
filogenetik kohesif semblage, kami akan menyebutnya sebagai zygomycetes dalam buku ini. Jamur lain
yang dikelompokkan sebelumnya klasifikasi dalam Zygomycota telah ditugaskan ke filum lain. Selain itu
filum yang terdaftar di atas, ada lebih dari 1000 spesies parasit hewan yang disebut microsporidians
yang oleh banyak ahli taksonomi dianggap sebagai bagian dari Kingdom Fungi. Mereka diperlakukan
secara terpisah filum disebut Microspora dalam beberapa klasifikasi, tetapi hubungan evolusi mereka ke
filum jamur lainnya tidak dipahami.

Filum Basidiomycota

30.000 spesies Basidiomycota yang dijelaskan termasuk jamur-jamur pembentuk, jeli jamur, ragi, karat,
dan jamur api. Jamur ini memainkan banyak peran ekologis. Banyak spesies jamur yang mendukung
ekologi hutan melalui pembentukan mikoriza simbiosis orrhizal dengan pohon dan semak belukar dan
lainnya dengan membusuk kayu dan serasah daun.

Basidiomycetes bermitra dengan rayap dan semut pemotong daun di kompleks simbiosis di mana jamur
dibudidayakan oleh serangga, dan basidiomycetes lainnya memberi makan skala serangga yang mereka
lindungi di bawah kerak. Basidiomycetes juga menyebabkan penyakit pada hewan, termasuk infeksi
yang berpotensi mematikan pada manusia dan karat dan jamur api adalah yang paling banyak patogen
penting tanaman.

Analisis filogenetik molekuler efektif untuk memisahkan sebagian besar Basidiomycota dari jamur lain
dan perbedaan genetik ini tercermin dalam beberapa struktur bersama dan karakteristik perkembangan.
Basidiomycota menghasilkan spora yang disebut basidiospora. Basidiospora terbentuk di bagian luar sel
yang disebut basidia.

Siklus Hidup Basidiomycete

Basidiome tunggal Agaricus campestris dapat mengeluarkan 2,7 miliar spora mikroskopis per hari, atau
31.000 spora per detik; 2 juta tabung di bawah braket Ganoderma basidiomycete yang membusuk kayu
applanatum dapat menumpahkan 30 miliar spora per hari, atau lebih dari 5 triliun dalam 6 bulan itu
braket abadi aktif setiap tahun!
Grup Taksonomi Dalam Basidiomycota

SUBPHYLUM: AGARICOMYCOTINA (JAMUR, JELLY FUNGI, DAN YEASTS)

Agaricomycotina mencakup semua Basidiomycota yang membentuk tubuh buah makroskopik, termasuk
jamur dan jamur jelly, bersama dengan berbagai ragi basidiomycete. Ada tiga kelas: Agaricomycetes,
Dacrymycetes, dan Tremellomycetes.

Agarical

Agaricales meliputi spesies dengan tubuh buah clavarioid (berbentuk silinder atau berbentuk klub),
puffballs, dan sarang burung jamur dengan tubuh buah bergalur yang luar biasa dari mana peridiol yang
mengandung spora terlontar oleh tetesan air hujan.

Boletales

Jamur ini membentuk ectomycorrhizas dengan akar hutan pohon. Boletus edulis, yang dikenal sebagai
jamur raja, cep atau porcini, adalah makanan yang sangat penting untuk dimakan jamur liar. Ini dipanen
di Italia, Eropa Timur, Cina, Afrika Selatan, dan Utara Amerika. Jamur busuk kering, Serpula lacrymans,
adalah anggota saprotrofik dari Boletales.

Jamur ini sangat penting sebagai penyebab dekomposisi kayu pada bangunan dan diperkirakan telah
berevolusi dari leluhur mikoriza. Jamur ruang bawah tanah, Coniophora puteana, adalah anggota
Boletales lain yang merusak bangunan. Ada beberapa perbedaan morfologi dalam urutan, termasuk
bola bumi yang menghasilkan tubuh buah bulat menyerupai puffballs, dan tubuh buah S. lacrymans dan
C. puteana yang berbentuk kerak pada permukaan kayu yang membusuk.

Russulales

Spesies membentuk semua jenis tubuh buah dalam urutan ini, termasuk jamur dengan insang (Russula
dan Lactarius [tutup susu]), gigi (Auriscalpium), dan tabung (Bondarzewia), lainnya membentuk tablet
hisap kecil dan kerak pipih (Peniophora dan Aleurodiscus), dan masih banyak lagi lainnya ducing bentuk
karang yang rumit (Clavicorona). Ada mikoriza, saprotrofik, dan beberapa parasit Russulales.

Poliporal

Aktivitas mereka sebagai pengurai kayu sangat penting bagi kesehatan ekosistem hutan. Banyak spesies
saprotrof dan tumbuh secara eksklusif di atas kayu mati, kayu gelondongan, dan lainnya puing kayu.
Lainnya, termasuk spesies Ganoderma dan Fomes, menyerang jaringan hidup dan terus membusuk kayu
inang mati mereka. Ganoderma lucidum (reishi) dan lainnya Polyporales telah digunakan sebagai obat
alami dalam pengobatan tradisional Tiongkok. Dimurnikan polisakarida dinding sel dari jamur ini
memiliki berbagai kegiatan farmakologis. Mayoritas braket jamur yang menumpahkan spora dari tabung
di bawah topi mereka adalah Polyporales, tetapi urutannya juga termasuk ratusan spesies kortikioid
yang tubuh buahnya kerak rata pada permukaan kayu.

Phallales

Stinkhorns dan kerabat mereka termasuk di antara minoritas Basidiomycota yang telah kehilangan
mekanisme ketapel debit spora (ballistospory) dan berinteraksi dengan hewan yang gigit spora mereka.
Stinkhorn yang umum, Phallus impudicus, memperluas epigeous (di atas tanah) tubuh buah dengan
kepala tertutup lendir di mana spora tertanam. Berbagai senyawa volatil berdifusi dari lendir (gleba) dan
menarik lalat bangkai dan invertebrata lainnya. Hewan-hewan ini bertindak sebagai vektor untuk
penyebaran stinkhorn ketika mereka membawa basidiospora pada tubuh mereka serta mengkonsumsi
dan buang air besar mereka agak jauh dari orang tua tubuh buah. Urutan termasuk spesies lain yang
terkena lendir glebal busuk permukaan jaringan tubuh buah yang mengembang menjadi kandang
(Clathrus) dan bentuk bintang (Anthurus).

Auriculariales

Jamur kuping Yudas yang dapat dimakan, Auricularia auricula-judae, adalah jamur paling terkenal di
dunia. memesan. Tubuh buahnya yang berbentuk telinga berkembang dari miselia pada tetua
(Sambucus) dan kayu lainnya tanaman. Basidiospora terbentuk pada basidia memanjang yang dipartisi
menjadi empat kompartemen dengan septa transversal. Ini terbentuk di permukaan bawah 'telinga' dan
spora terlempar ke udara di bawah tubuh buah. Badan buah memiliki tekstur yang kenyal dan kenyal
telah dibudidayakan selama berabad-abad di Asia.

Jamur Jelly: Dacrymycetes dan Tremellomycetes

Seperti Auriculariales, jamur jelly dalam pasangan kelas taksonomi ini membentuk basidia. Basidium dari
Dacrymycetales dibentuk seperti garpu tala dan membentuk satu spora di ujung masing-masing dua
cabangnya (epibasidia).

Dalam Tremellomycetes, basidium adalah dibagi menjadi empat kompartemen terpisah oleh septa yang
berjalan melalui sel secara longitudinal. Basidiospora berkembang di ujung epibasidia yang memanjang
dari masing-masing kompartemen. Tubuh buah dari beberapa spesies dari kedua kelas jamur jelly
berwarna cerah.

Subphylum: Ustilaginomycotina (Smuts)

Terkait Jamur dalam Ustilaginomycotina termasuk ragi Malassezia globosa yang merupakan bagian dari
komunitas mikroba alami pada kulit kepala manusia dan dikaitkan dengan ketombe. U. maydis telah
dipelajari secara lebih rinci daripada smuts lainnya.

Subphylum Pucciniomycotina (Karat dan Sekutu)

Sebagian besar dari lebih dari 7000 spesies dalam subphylum ini adalah jamur karat yang terlupakan.
Pucciniomycotina yang lebih jauh terkait termasuk patogen tanaman yang awalnya diklasifikasikan
sebagai api kecil.

Filum Ascomycota

Gambaran Umum dan Karakteristik Pemersatu

Filum termasuk ragi dan berserabut jamur, jamur yang bermitra dengan ganggang dan cyanobacteria
untuk membentuk simbiosis liken, mikoriza spesies, saprotrof, dan patogen tanaman dan hewan.
Ascomycetes digunakan dalam aplikasi industri, dalam produksi dan penyedap makanan, dan tubuh
buah morels dan truffle adalah jamur yang bisa dimakan.

Siklus Hidup Ascomycete

Sel ini meluas untuk membentuk ascus. Sepasang nukleusnya menyatu, dan kemudian membelah
dengan meiosis untuk menghasilkan empat inti haploid. Pada N. crassa, masing-masing nukleus ini
terbagi berdasarkan mitosis dan masing-masing dari delapan inti yang dihasilkan dikemas ke dalam
ascospore yang terpisah.

Grup Taksonomi Dalam Ascomycota

SUBPHYLUM: PEZIZOMYCOTINA

Subphylum termasuk saprotrof yang tumbuh pada jaringan tanaman berkayu dan non-kayu, dan pada
kotoran herbivora, parasit tanaman dan hewan (terutama invertebrata), dan pasangan dalam lumut dan
mik simbiosis orrhizal. Variasi tubuh buah di Pezizomycotina luar biasa. Jamur ini ada di mana-mana di
habitat hutan di mana koloni mereka menghitamkan kayu yang membusuk dan stromata mereka
berkembang sebagai proyeksi seperti jari dari tanah, dan tanduk kecil, bola tunggal atau ganda, dan
kerak pada permukaan log.

SUBPHYLUM: SACCHAROMYCOTINA

Jamur dalam kelompok ini menghasilkan sel ragi yang mulai tumbuh. Keragaman morfologis terbatas,
tetapi pseudohyphae, yang terdiri dari filamen penghasil kuncup pendek, terbentuk dalam kondisi
tertentu, dan beberapa spesies menghasilkan hifa yang tumbuh ujung dan asci memanjang. Di alam,
Saccharomyces cerevisiae ragi tumbuh subur dengan diet kaya gula yang tersedia dalam buah-buahan
matang. kemampuan untuk memetabolisme glukosa dalam kondisi ketersediaan oksigen rendah dan
menghasilkan karbon dioksida dan alkohol telah memungkinkan manusia untuk membuat bir, membuat
roti, dan memfermentasi anggur dan minuman beralkohol lainnya selama ribuan tahun.

SUBPHYLUM: TAPHRINOMYCOTINA

Subphylum ini berisi lima kelas: Schizosaccharomycetes, Pneumocystidiomycetes, Neolectomycetes,

Taphrinomycetes, dan Archaeorhizomycetes. Kelas Schizosac- charomycetes hanya mengandung tiga
spesies ragi fisi, termasuk Schizosaccharomyces pombe. Ragi fisi berbeda dari ragi yang sedang tumbuh
dalam mekanisme pembelahan selnya.

Filum Glomeromycota

Sembilan puluh persen dari semua tanaman membentuk asosiasi mikoriza dengan jamur. Penyebaran
yang paling luas adalah mikoriza arbuskular yang diproduksi oleh kurang dari 200 spesies jamur dalam
Phylum Glomeromycota. Reproduksi seksual tidak terjadi dalam jamur ini tetapi populasi campuran dari
nuklei yang berbeda secara genetik hidup berdampingan dalam spora individu.

Geosiphon pyriforme adalah satu-satunya contoh spesies non-mikoriza di dalam Glomeromycota. Ini
menghasilkan sel-sel kandung kemih yang meningkat yang mengandung cyanobacteria pengikat
nitrogen endosimbiotik (Nostoc punctiforme). Geosiphon mungkin anggota kelompok leluhur dalam
filum tempat spesies mikoriza berevolusi.

Filum Blastocladiomycota

Blastocladiomycota, bersama dengan Chytridiomycota dan Neocallimastigomycota, adalah jamur

akuatik yang menghasilkan zoospora flagel. Blastocladiomycota hidup di habitat air tawar, lumpur, dan
tanah tempat mereka beroperasi saprotrof, pembusukan puing-puing tanaman dan hewan, atau parasit
arthropoda. Kurang dari 200 spesies telah dideskripsikan.

Filum Chytridiomycota

Chytridiomycota (chytrids sejati) adalah jamur zoospora aerob yang beroperasi sebagai saprotrof dan
patogen di habitat air tawar, payau, dan laut, dan juga berlimpah di tanah. Ragam inang chytrid patogen
meliputi jamur, alga, tanaman, dan amfibi lainnya. Spesies patogen termasuk Synchytrium
endobioticum, yang menyebabkan penyakit kutil pada kentang,

Filum Neocallimastigomycota

20 spesies dalam filum yang sangat terspesialisasi ini adalah jamur anaerob yang tumbuh di saluran
pencernaan herbivora. Metabolisme mereka didorong oleh dekomposisi polisakarida dalam serat
makanan inang untuk menghasilkan gula: Neocallimastigomycota bersifat fibrolitik. Jamur ini tidak
memiliki mitokondria. Dengan tidak adanya oksigen, oksidasi piruvat dikatalisis oleh piruvat: ferredoksin
oksidoreduktase dalam hidrogenosom dengan sumbangan elektron ke [Fe] - hidrogenase yang
menghasilkan hidrogen. Zoospora uniflagellate diproduksi oleh jamur ini tetapi spora multiflagellate juga
dijelaskan pada beberapa spesies.

Zygomycetes

Zygomycetes yang paling dikenal adalah mikroorganisme pembusukan makanan yang berkembang biak
pada buah dan sisa makanan, menghasilkan pertumbuhan lembut sporangiofor udara putih yang
mengembangkan ujung bulat yang disebut sporangia diisi dengan spora. Sporangia dari beberapa
spesies mengandung puluhan ribu di antaranya spora, yang disebut sporangiospora, yang tersebar
dalam aliran udara. Zygomycetes juga umum pada zat yang kurang bergula termasuk kotoran herbivora,
membentuk fase pertama suksesi jamur yang menguraikan zat yang berbeda dalam bahan berlimpah ini.

Kerusakan makanan jamur dan spesies coprophilous disebut sebagai saprotrof primer karena mereka
berasimilasi dengan senyawa berbobot molekul rendah, termasuk gula, daripada memecah selulosa.
dan makromolekul lain yang lebih kompleks seperti basidiomycetes. Sifat metabolik dari Mucorales
telah digunakan dalam produksi makanan Asia termasuk Indonesia (Javan) tempe pokok, di mana
Rhizopus oligosporus digunakan untuk memfermentasi kedelai untuk menghasilkan kue kaya protein
padat. Sejumlah spesies Mucorales lain digunakan untuk menghasilkan fermentasi dadih dari tahu
kering dalam masakan Asia Timur.

BAB 2

Organell, Sel, Organ

Jamur adalah eukariota dan sebagian besar biologi selnya dibagi dengan hewan, tumbuhan, dan
protista. Sel-sel jamur dibangun dari jenis organel yang sama dengan eukariota lainnya. Mereka punya
membran plasma, inti, dan sistem endomembran yang rumit. Sebagian besar spesies memiliki
mitokondria. Beberapa organel tidak ditemukan di kerajaan lain. Ini termasuk perakitan padat vesikel
sekretorik disebut Spitzenkörper yang terletak di ujung hifa, dan tubuh Woronin. Ascomycota yang
berfungsi sebagai perangkat plugging intraseluler yang menghentikan kebocoran sitoplasma. Dinding sel
chitinous adalah fitur khas lain dari sel jamur.

Dinding sel jamur adalah komposit makromolekul berpori berkumpul di permukaan membran plasma.
Ini mengandung mikrofibril yang menahan stres dari kitin, linier polimer glukosa, atau glukan, dan
berbagai protein dinding sel. Rantai kitin yang berdekatan berkumpul menjadi susunan antiparalel yang
berikatan hidrogen, menghasilkan mikrofibril yang dapat mencapai panjang lebih dari 1 μm. Mikrofibril
kitin memiliki kekuatan tarik yang luar biasa; ketika chitin terganggu, sel kehilangan stabilitas
osmotiknya dan dapat pecah. Meskipun kitin adalah komponen penahan stres dalam matriks
ekstraseluler kebanyakan Jamur, pepatah bahwa 'jamur memiliki dinding chitinous' bisa menyesatkan.
Proporsi relatif dari kitin, glukan, dan glikoprotein bervariasi sesuai dengan spesies jamur. Kitin adalah
konstituen minor dari dinding sel ragi, Saccharomyces cerevisiae, dan disintesis ketika sel induk
menghasilkan tunas. Molekul sterol, ergosterol adalah komponen yang membedakan membran plasma
jamur. Ergosterol melakukan fungsi yang sama dengan kolesterol pada membran hewan, yaitu
memodulasi fluiditas dan permeabilitas membran melalui interaksinya. Tidak adanya ergosterol pada
hewan memungkinkan pengobatan berbagai infeksi jamur (mikosis) menggunakan agen antijamur yang
menghambat sintesisnya.

Sistem Endomembran. Sitoplasma sel hifa dan ragi dikemas dengan kompartemen yang terikat
membran dari sistem endomembran. Organel-organel ini berfungsi dalam sekretori (ekspor) dan jalur
(impor) endositik yang menopang pertumbuhan dan perkembangan. Sistem endomembran meliputi
retikulum endoplasma, aparatus Golgi, vakuola, dan vesikel. Retikulum endoplasma adalah sistem
membran yang saling berhubungan dari mana sebagian besar membran lainnya berasal. Dalam
Saccharomyces cerevisiae, retikulum endoplasma diatur sebagai susunan lembaran dan tubulus yang
berdekatan yang terhubung ke membran plasma. Dalam jamur berfilamen, retikulum endoplasma diatur
sebagai tumpukan kantung yang terikat membrane atau cisternae.

BAB 3

Produksi Spora, Pembuangan, dan Pembubaran

Tidak mungkin untuk memahami keanekaragaman spesies dalam Kingdom Fungi dengan mempelajari
koloni vegatif mereka. Jamur zoosporik memiliki struktur makan paling rumit, dengan banyak chytrids,
misalnya, menghasilkan tidak lebih kompleks daripada thallus bola yang menyerap makanan dari sel
tanaman tunggal di mana ia berkembang. Miselia filum non-zoospora jauh lebih rumit dalam hal
struktur dan perkembangannya, tetapi sangat mungkin untuk mengidentifikasi jamur di luar filumnya
dengan melihat hifanya. Kehadiran dolipone septa adalah diagnosis basidiomycete, tetapi sedikit, jika
ada, ahli biologi jamur bisa mengatakan apakah hifa dilihat pada slide mikroskop milik bola puff raksasa
atau jamur jelly. Morfologi spora adalah salah satu fitur paling penting yang digunakan untuk identifikasi
visual jamur dan kisaran tipe spora yang menakjubkan adalah cerminan yang kuat dari keanekaragaman
evolusi mereka. Tanpa menilai perbedaan antara spora dan tubuh buah, upaya untuk mengembangkan
taksonomi jamur akan menjadi sia-sia. Studi spora adalah studi evolusi.

Spora aseksual diproduksi pada tangkai, atau konidiofor, disebut konidia (konidium singular). Bagi siapa
pun selain seorang ahli, perbedaan antara banyak jenis spora ini cukup buram. Definisi Kamus jamur dari
annel-lospore (atau annelloconidium), misalnya, merujuk pada konidiogenesis holoblastik di mana sel
konidiogen dengan proliferasi berulang saat enteroblastik menghasilkan urutan basipetal konidia.
Dekonstruksi deskripsi ini akan memerlukan bab terpisah tentang penelitian taksonomi tentang
pembentukan konidia (spora aseksual) dan kami telah memilih, sebaliknya, untuk merujuk pembaca ke
literatur khusus ini. Variasi bentuk konidial dan proses perkembangan memiliki sedikit nilai taksonomi di
luar penggunaannya dalam menggambarkan spesies. Banyak genus yang tidak terkait memiliki cara yang
sama dalam pembentukan spora dan spesies yang berkaitan erat dapat menunjukkan mekanisme
konidiogenesis yang sepenuhnya berbeda. Kebanyakan konidia terbentuk pada batang yang disebut
konidiofor. Mereka berkembang di ujung conidiophore, atau pada cabang dari sumbu utama
conidiophore, sebagai spora tunggal, atau dalam rantai. Segmentasi conidiophore oleh pengembangan
septa multi-jarak dekat menciptakan spora dari struktur conidiophore yang ada. Jamur lainnya
membentuk rantai dari ujung konidiofor dan cabang konidiofor yang bebas. Spora dapat mengembang
sebelum dipisahkan dari sel lain dengan pembentukan septum (digambarkan sebagai perkembangan
blastik), atau terpisah tanpa ekspansi sebelumnya (thallic). Rantai dapat berkembang dengan spora
termuda di pangkalan (pengaturan basipetal) atau termuda di ujung (acropetal). Variasi dapat tampak
tanpa batas.

Spora Seksual. Jamur menghasilkan tiga jenis pori seksual: basidiospora (Basidiomycota), ancospora
(Ascomycota), dan zygospore (zygomycetes). Karena suku cadang ini adalah salah satu ciri utama filum
utama. Spora berfungsi sebagai kendaraan untuk mentransmisikan jamur melalui ruang dan waktu.
Spora aseksual membawa salinan yang identik dari gen koloni induk. Spora seksual mengirimkan versi
yang dikombinasi ulang dari strain orangtua. Spora sering terbentuk sebagai respons terhadap
pembatasan nutrisi. Ketika sebuah koloni bersentuhan dengan banyak nutrisi, ia berinvestasi dalam
pertumbuhan dan percabangan hifa, yang memiliki efek menangkap energi dari bidang aktivitas yang
berkembang. Ketika makanan habis, lebih masuk akal untuk melarikan diri dari kelaparan yang akan
datang dan mencari sumber nutrisi baru. Hal ini dapat dilakukan dengan menjauh dari miksi induk, atau
dengan tetap diam dan menunggu nadi nutrisi baru tersedia di tempat yang sama. Untuk tujuan ini,
banyak tempat diadaptasi untuk dispersal, untuk membawa genom strain individu melalui udara atau
air. Spora ectomycorhizal basidio-mycetes dapat bertahan selama setidaknya 4 tahun mengikis berbagai
kondisi penyimpanan. Dalam sol, spone-spone ini menciptakan bank pori yang diprioritaskan untuk
membangun simbion dengan bibit pohon baru. Telimpor karat tidak akan berkecambah sampai mereka
mengalami periode dormansi yang lama dan, di luar dormansi yang diperlukan, belpes dan bertahan di
tanah. setidaknya selama 4 tahun.

Dalam buku ini, kami menggunakan istilah spora discharge untuk merujuk pada - pemisahan spora jamur
dari koloni induk dan tubuh buahnya, dan penyebaran spora untuk pergerakan selanjutnya. Pelepasan
sering meluncurkan spora dalam jarak pendek, sedangkan penyebaran dapat melibatkan perjalanan
jarak jauh melalui atmosfer. Spora dari banyak jamur dipindahkan dari koloni induknya oleh gangguan
fisik yang disebabkan oleh aliran udara, hujan, getaran permukaan yang mendukung koloni, atau oleh
aktivitas hewan. Ini disebut sebagai mekanisme pelepasan pasif. Mekanisme pelepasan aktif didukung
oleh tekanan hidrostatik, gerakan cepat yang diinduksi oleh dehidrasi sitoplasma, dan oleh pemanfaatan
gaya tegangan permukaan.

Penyebaran spores dan aeromologi. Epidemiologi Penyakit Tumbuhan. Konsentrasi spora jamur udara
menurun secara proporsional dengan jarak dari titik asal mereka. Untuk spora yang tersebar dari pohon
yang terinfeksi, misalnya, jumlah spora per meter kubik udara paling dekat dengan permukaan tanaman
dan berkurang ke arah aliran udara. Pola penyebaran sangat penting bagi ahli patologi tanaman yang
mencoba memprediksi penyebaran penyakit epidemi dan pemodelan awan spora adalah bagian dari
bidang penelitian khusus yang disebut epidemiologi penyakit tanaman. Model penyebaran dan
penyebaran penyakit cenderung sangat rumit karena sejumlah besar variabel mempengaruhi
pergerakan spora.

Spora Jamur dan Kimia Atmosfer. Eksperimen pada jamur telah menunjukkan bahwa sebagian besar
spora yang dilepaskan dari tutup disimpan cukup dekat dengan basidiome. Dalam sebuah studi tentang
jamur ectomycorrhizal, 95% dari spora jatuh dalam 1 m dari basidiome. Ini tampaknya sangat boros,
mengingat kemungkinan premium pada jarak penyebaran yang jauh dari koloni induk, dan dapat
berbicara dengan alasan bahwa jamur menghasilkan spora dalam jumlah besar.

Penyebaran olahraga oleh hewan. Hewan adalah vektor penting untuk penyebaran spora jamur.
Mengingat banyaknya keanekaragaman jamur dan banyaknya invertebrata di habitat tempat jamur
tumbuh, kita mungkin menyadari hanya sebagian kecil dari mekanisme penyebaran ini. Mech-anisme
buangan yang telah berevolusi di banyak jamur coprophilous, termasuk jamur sarang burung, beragam
ascomycetes, dan zygomycete Pilobolus, menyimpan spora pada vegetasi yang dimakan oleh herbivora.
Setelah melewati sistem pencernaan hewan, spora dilepaskan pada jarak yang bervariasi dari miselium
induk ketika hewan buang air besar. Vektor tidak mendapat manfaat apa pun dari interaksi ini. Jamur
hanya mengeksploitasi sumber mobilitas yang tersedia dalam strategi reproduksinya. Paling tidak dalam
satu kasus vektor ini dirugikan oleh interaksinya dengan jamur coprophilous. Nematoda parasit dapat
menghalangi tumpangan Pilobolus sporangium ketika disemprotkan ke udara dan menyebabkan
penyakit paru-paru pada mamalia. Selain pengangkutan spora di dalam hewan (endozoochory), jamur
tersebar di permukaan vektor mereka (ectozoochory). Ascospora yang keluar dari ASCI mereka untuk
membentuk cirrhi lengket yang dioleskan pada tubuh serangga. Dalam beberapa kasus, ascomycete
dapat mengeluarkan zat kimia tertentu; pada yang lain, kontak antara jamur dan vektor tidak spesifik.

BAB 4

Genetika - Variasi, Seksualitas, dan Evolusi

Ada tiga konsep penting untuk genetika populasi, ekologi, dan konservasi - the individu, populasi, dan
spesies.Apa itu Individu? Definisi, Pengakuan, dan Konsekuensi Mendefinisikan Individu Untuk hewan
dan tumbuhan multiseluler, identifikasi apa yang individu sering kali mudah - satu singa adalah individu.
Jamur uniseluler dan mereka yang pertumbuhan miseliumnya sangat terbatas cukup dianggap sebagai
individu, tetapi apa yang merupakan individu dengan jamur miselia lebih besar lebih sulit untuk
didefinisikan, seperti dengan tanaman yang membentuk stolon atau pengisap dan dengan klon binatang
seperti karang.

Beberapa jamur cenderung membentuk miselia tidak tumbuh lebih dari beberapa cm radius, seberapa
besar sumber daya atau waktu yang diberikan (mis. Penicillium spp.). Sebaliknya, beberapa
basidiomycetes dapat membentuk gen dan umur panjang yang luas ramet di tanah dan serasah daun.
Organisme terbesar di planet ini mungkin spesies Armillaria dengan gen yang menempati hingga 8 atau
lebihhektar di lantai hutan Amerika Utara, dengan perkiraan usia seribu atau lebih tahun.

Evolusi Gen Tipe Perkawinan dan Fungsinya dalam Siklus Hidup Jamur Gen tipe perkawinan adalah pusat
dari operasi siklus hidup jamur yang dijelaskan di atas. Sementara Penekanan secara tradisional telah
ditempatkan pada perbedaan dalam sistem pemuliaan antara filum, lebih analisis terbaru dari daerah
penentu jenis kelamin genom di zygomycetes, ascomycetes, dan basidiomycetes telah mengungkapkan
beberapa homologi yang mendasari gen yang terlibat. Perkawinan lokus jenis jamur beroperasi seperti
kromosom seks pada eukariota yang lebih kompleks, untuk mengontrol kompatibilitas antara pasangan
seksual, memungkinkan sel haploid yang kompatibel secara seksual untuk mengenali dan saling menarik,
dan mempersiapkan sel untuk perkembangan seksual setelah pembuahan. Kompatibilitas kawin yang
dikontrol secara genetik - heterothallism - pertama kali ditemukan di Internet zygomycetes garis dasar,
dalam Phycomyces blakesleeanus, dinamai dari Albert Blakeslee, Penemu Amerika heterothallism jamur.

Variasi Spesies Jamur di Alam dan Laboratorium Seperti halnya tanaman dan hewan, termasuk manusia,
ada banyak variasi di dalamnya spesies jamur. Variasi semacam itu dapat mempengaruhi semua aspek
biologi jamur. Strain yang terisolasi dari alam sering berbeda dalam morfologi dan fisiologi. Aspergillus
nidulans, misalnya, berbeda dalam bentuk pertumbuhan koloni, dalam jumlah sporulasi seksual dan
aseksual, dalam tingkat ekstensi dan jumlah produk metabolisme. Banyak grup VC berbeda terjadi di
Aspergillus nidulans dan ascomycetes lainnya. Strain patogen tanaman bervariasi dalam kemampuannya
untuk menyerang strain / varietas berbeda spesies inang (Bab 8), yang sangat penting secara praktis
dalam pemuliaan tanaman dan pertanian. Strain dari spesies patogen yang dapat dibedakan dari
anggota lainnya spesies yang sama karena kemampuannya untuk menjadi patogen pada spesies inang
tertentu, varietas inang, atau, sekelompok inang (mis. memiliki kombinasi gen virulensi yang sama),
disebut dengan beragam pathotype, biotype, atau ras. Strain juga mungkin berbeda dalam jumlah
kromosom.
Drift Genetik dan Efek Pendiri. Genetik drift adalah perubahan frekuensi alel dalam suatu populasi
karena kebetulan. Jika sebuah populasi kecil maka kesempatan dapat menentukan apakah alel netral
menjadi punah atau meningkatkan frekuensi fiksasi. Jika suatu populasi sangat kecil maka genetik
tersebut bersifat acak drift dapat menentukan nasib alel bahkan di hadapan alam yang cukup kuat
pilihan. Namun, di alam, mungkin tidak biasa bagi populasi untuk tinggal cukup lama agar terjadi drift -
populasi dapat punah, tumbuh, atau bergabung dengan populasi lain. Kecenderungan penyimpangan
genetik akan ditentang oleh aliran gen. Karenanya jika jamur berlimpah dan tersebar luas dengan spora
berlebihan yang mampu menyebar jarak jauh, aliran gen mungkin terjadi menangkal kecenderungan
penyimpangan genetik. Ada bukti untuk ini dalam kosmopolitan dan jamur berlimpah Neurospora
crassa, Puccinia graminis f. sp. tritici, dan Schizophyllum commune.
BAB 5
Akuisisi Nutrien, Uptake, dan Asimilasi
Semua jamur membutuhkan sumber karbon dan energi organik, serta nitrogen kombinasi, fosfor dan
sulfur, kation kalium, kalsium dan magnesium, dan banyak unsur lainnya ements dalam jumlah jejak.
Kebanyakan jamur saprotrofik yang dapat dibudidayakan akan tumbuh pada desain sintetis.

Sumber Karbon dan Energi

Jamur Gula sangat dilengkapi dengan baik untuk penyerapan gula, baik aktif maupun pasif sistem
pengambilan. Protein transport dapat bersifat konstitutif atau diinduksi. Secara umum, gula diambil
secara istimewa dari campuran adalah mereka yang membutuhkan sedikit energi untuk berasimilasi dan
paling tersebar luas di lingkungan. Misalnya, tanah ascomycete Chaetomium mengambil glukosa segera
setelah diberikan dalam media kultur, tetapi fruktosa yang relatif langka, diberikan sebagai sumber
karbon tunggal, diambil hanya setelah periode induksi beberapa jam. Kebanyakan jamur yang dapat
dibiakkan akan dengan cepat mengasimilasi monosakarida dan disakarida yang umum dari solusi.

Sumber Nitrogen
Jamur berbagi jalur metabolisme asam amino dan biosintesis protein dengan yang lain eukariota,
termasuk hewan. Namun, tidak seperti hewan, jamur tidak membutuhkan asam amino dari lingkungan
mereka untuk mensintesis protein, tetapi dapat mengasimilasi senyawa anorganik secara luas tersedia
di tanah. Kemampuan untuk membuat asam amino mereka sendiri menggunakan nitrat tanah dan
amonia, asalkan mereka memiliki sumber karbon, memungkinkan jamur saprotrophic mengubah kayu
mati dan sisa nitrogen-miskin, kaya karbohidrat lainnya tetap menjadi protein. Ini memberi jamur peran
utama di jaring trofik ekosistem terestrial dan juga merupakan dasar dari berbagai proses untuk
memverifikasi limbah pertanian menjadi pakan ternak dan makanan manusia. Jamur, tidak seperti
banyak prokariota, tidak dapat memanfaatkan nitrogen molekuler dan karenanya harus mengais elemen
dari berbagai sumber lingkungan yang dapat larut dan tidak dapat diprediksi, bersaing dengan tanaman
dan semua mikroba lainnya di habitatnya.

Nitrat

Penyerapan nitrat dalam jamur terjadi melalui protein transpor yang dikodekan oleh gen NRT1 dan
NRT2 keluarga. Protein membran ini memediasi transportasi NO3- Bersama dengan proton (H +) di
suatu hubungan yang didorong oleh gradien pH melintasi membrane. Analisis filogenetik menunjukkan
bahwa cluster adalah yang pertama berkumpul dalam garis keturunan yang mengarah ke oomycetes
dan kemudian ditransfer secara horizontal ke nenek moyang awal jamur.

ADAPTASI PEMBANGUNAN UNTUK GIZI AKUISISI

Ragi dimorfik. Dimorf ragi dapat beralih dari unisel ke hifa berfilamen untuk penetrate bahan padat
dengan cara pertumbuhan ujung. Candida albicans menyebabkan ragi ascomycete sariawan,
mempengaruhi selaput lendir.

Basidiomisetes pembentuk kabel. Basidiomycetes pembentuk tali pusat, berbeda dengan ragi, termasuk
yang terbesar dan paling lama hidup individu jamur dikenal. Jamur madu milik genus Armillaria sudah
terkenal untuk tukang kebun dan rimbawan karena membunuh tanaman dengan menjajah dan
membunuh akar kayu. Ini adalah- Lium dapat menyebar lebih dari beberapa meter dengan tumbuh
melalui tanah untuk menyerang dan menghancurkan yang berdekatan tanaman. Perumah tangga akrab
dengan jamur busuk kering, Serpula lacrymans, yang menginfeksi kayu lunak lembab di gedung-gedung,
dan seperti Armillaria dapat tumbuh tanpa campur tangan zat gizi ruang untuk menjajah dan membusuk
kayu berturut-turut. Kedua jamur tersebut memberikan contoh modus pertumbuhan di antara
basidiomycetes hutan yang memanfaatkan akar hidup atau jatuh pohon sebagai sumber karbon besar.

BAB 6

Ekologi Molekuler

APLIKASI TEKNOLOGI DNA DALAM EKOLOGI FUNGI

Metode molekuler yang didasarkan pada teknologi DNA yang mengubah pemahaman tentang
keanekaragaman dan aktivitas jamur di lingkungan. Karena sebagian besar mikroskopis dan sering
tumbuh di dalam substrat yang buram atau jaringan hidup organisme lain, jamur sulit diamati di habitat
alami mereka, kecuali ketika berspekulasi mencolok.
Menggunakan sekuens DNA untuk mengidentifikasi spesies jamur memiliki beberapa keunggulan
dibandingkan identifikasi berdasarkan fitur morfologis. Basis dalam DNA menyediakan sejumlah besar
karakter non-adaptif. Urutan lingkungan dapat ditempatkan dalam clade tetangga dekat, memberikan
nilai prediksi klasifikasi alami. Dengan menganalisis asam nukleat jamur dalam sampel lingkungan, kita
dapat menemukan jenis jamur apa yang ada, di mana mereka berada, dan zat apa yang mereka
konsumsi dan ubah. Perkembangan teknis yang cepat dalam beberapa tahun terakhir berarti bahwa
banyak proses dalam sekuensing dan bioinformatika dapat diotomatisasi. Primer generik untuk
memperkuat sekuens di wilayah internal transkrip spacer (ITS) dari DNA ribosom pertama kali
dikembangkan pada pertengahan 1990-an. Sekuens mengapit ribosom yang sangat terkonservasi
memfasilitasi desain primer.

DIVERSITAS Jamur DI LINGKUNGAN

Keragaman keseluruhan jamur yang ada dalam sampel lingkungan sekarang dapat ditangkap dengan
mengurutkan seluruh jajaran bahan genetik yang dikandungnya, suatu pendekatan yang disebut
metagenomics. Untuk mendapatkan metagenom sampel, DNA dapat disampel, atau sebagai alternatif
RNA (yang kemudian disalin ke DNA yang lebih stabil untuk penyimpanan dan pengurutan). RNA
memiliki keuntungan hanya dengan mencerminkan keragaman dan aktivitas jamur yang aktif tumbuh
dan mensintesis ribosom dan protein baru, karena RNA dihasilkan hanya dari gen yang ditranskripsi
secara aktif. Dalam lingkungan alami, metatranskriptome, yang terdiri dari semua RNA yang ada,
mengungkapkan gen jamur yang diekspresikan pada saat pengambilan sampel. Sistem sekuensing
seperti 454-pyrosequencing, Illumina, dan Ion Torrent menghasilkan sekuens semua asam nukleat yang
ada, dalam bentuk sekuens pendek hingga 400 bp. Massa data sekuens dianalisis dan ditafsirkan
menggunakan alat komputasi khusus yang terus dikembangkan dan disempurnakan. Metagenome dan
metatranscriptome dapat mengungkapkan keanekaragaman komunitas mikroba dan pola ekspresi gen.
Bahkan tanpa penugasan kepada kelompok taksonomi yang disebutkan, metagenome memberikan
gambaran keragaman yang dapat menunjukkan pola-pola dalam komunitas jamur.

Mengidentifikasi Spesies, Klon, dan Genetika Cryptic

Penentuan filogenetik individu dari sekuens lingkungan telah menyebabkan pengakuan bahwa banyak
jamur yang ditugaskan untuk spesies bernama tunggal pada fitur morfologi, ada di alam sebagai
beberapa jenis dengan perbedaan penting dalam fungsi ekologis. Sebagai contoh, jamur mikoriza yang
tidak dapat dibedakan atas dasar morfologi dapat terdiri dari kelopak berbeda secara filogenetik yang
berbeda dalam spesifisitas tanaman inang, jenis tanah yang disukai, atau dalam aspek fungsional lainnya
dari symbiosis, jenis ini disebut spesies samar. Sampel lingkungan dapat ditugaskan ke klon individu
menggunakan urutan hiper-variabel seperti DNA mikrosatelit atau single nucleotide polymorphisms
(SNPs) sebagai sidik jari.

Metode Diagnostik untuk Spesies yang Diketahui

Spesies atau strain jamur yang diketahui dapat dikuantifikasi dari sampel lingkungan dengan PCR
kuantitatif, di mana level transkrip dari sekuens spesifik spesies diuji secara fluorimetri. Baik DNA dan
RNA (ditranskrip mundur menjadi cDNA) dapat ditentukan. Ini adalah metode diagnostik yang berharga
dalam kedokteran dan pertanian, karena sangat sensitif dan spesifik, dan mampu diotomatisasi untuk
analisis serentak dari ratusan sampel. Mesin PCR portabel memungkinkan deteksi di tempat. PCR
kuantitatif memiliki banyak aplikasi di bidang pertanian, termasuk mendeteksi dan mengukur jamur
yang ada di tingkat yang sangat rendah. Yang digunakan untuk mendeteksi patogen tanaman dan
manusia, strain yang tahan fungisida, dan strain yang membawa sifat yang diperkenalkan secara
bioteknologi. Metode pencitraan digunakan untuk mendiagnosis dan memvisualisasikan spesies yang
dikenal aktif di situ.

Klasifikasi dan Nomenklatur Urutan Jamur Lingkungan

Saat ini, ketika spesies jamur yang berpotensi baru ditemukan, dijelaskan dan diberi nama sesuai dengan
Kode Nomenklatur Internasional untuk ganggang, jamur, dan tanaman. Nama itu kemudian
ditambahkan ke Index Fungorum, daftar berkelanjutan yang berasal dari literatur mikologi dunia. Sistem
ini menyediakan daftar penemuan taksonomi baru, dan nomenklatur standar untuk spesies jamur,
penting untuk komunikasi ilmiah dalam biologi. Sistem identifikasi dan nomenklatur saat ini berdasarkan
spesimen - koleksi herbarium dan kultur yang dikuratori oleh ahli taksonomi - memungkinkan untuk
mengidentifikasi spesies dan menguji hipotesis taksonomi sebelumnya. Namun, sebagian besar spesies
jamur atau OTU yang ditemukan sebagai sekuens lingkungan tidak memiliki tubuh buah yang dikenal,
dan belum dibudidayakan sehingga tidak dapat disimpan sebagai spesimen voucher di herbaria, atau
kultur dalam koleksi budaya. Taksonomi jamur sedang mengeksplorasi cara mengintegrasikan taksonomi
jamur berdasarkan urutan dan spesimen ke dalam sistem tunggal yang diakui secara internasional.
Diperkirakan bahwa penamaan dan pengklasifikasian diperkirakan lima juta atau lebih spesies jamur
yang tidak terdeskripsi menggunakan metode berbasis spesimen tradisional akan memakan waktu lebih
dari seribu tahun. Oleh karena itu beberapa ahli mikologi mengusulkan bahwa sekuens lingkungan yang
ditunjukkan sebagai indikasi yang valid dari keberadaan taksa jamur baru harus dinamai dan diterima ke
dalam sistem taksonomi modern. Oleh karena itu beberapa ahli mikologi mengusulkan bahwa sekuens
lingkungan yang ditunjukkan sebagai indikasi yang valid dari keberadaan taksa jamur baru harus dinamai
dan diterima ke dalam sistem taksonomi modern. Untuk ini, perlu mengembangkan sistem nomenklatur
yang akan menghubungkan sekuens jamur di GenBank dengan taksonomi herbarium jamur berbasis
spesimen.

MENGHUBUNGKAN DIVERSITAS DAN PROSES ECOSYSTEM

Metode molekuler menyediakan kunci untuk apa yang disebut sebagai 'kotak hitam' dari proses
ekosistem mikroba. Peran jamur dalam pemeliharaan hutan boreal, bioma yang didominasi oleh konifer
belahan bumi utara yang merupakan penyerap karbon utama dalam siklus karbon global. Hutan-hutan
sub-Arktik ini tumbuh di daerah-daerah dengan sinar matahari rendah dan curah hujan tinggi, dan
tanah-tanah yang sangat terlindi ini kurang dalam ketersedian nitrogen dan mineral. Miselium dari
jamur ektomikoriza dan saprotrofik menumpuk dan mendistribusikan kembali nitrogen dan mineral
yang langka, dan dengan demikian memainkan peran sentral dalam nutrisi tanaman, dan dalam
pergantian karbon dan nitrogen. Gen tertentu atau gen mungkin memiliki peran kunci dalam ekologi
suatu spesies, misalnya, strain ganas dari jamur patogen dapat berbeda dari yang avirulen dengan
memiliki satu gen.

GENETIK SEQUENCING SELURUH GENEN DAN GENOMIK PERBANDINGAN

Genom dan Transkriptome. Data sekuens genom sendiri menunjukkan gen yang dimiliki suatu spesies,
tetapi tidak membuktikan bahwa mereka fungsional. DNA dari semua gen yang dijelaskan dalam genom,
atau bagian yang dipilih, disusun pada slide mikroskop, dan transkrip masing-masing gen diidentifikasi
dan dikuantifikasi dengan hibridisasi ke templat DNA-nya. Perubahan transkriptom dapat menunjukkan
pola spasial dan temporal dari ekspresi gen yang terkait dengan adaptasi fungsional organisme, seperti
interaksi dengan lingkungan dan organisme lain, perubahan perkembangan atau akuisisi nutrisi. Dengan
cara ini, genom urutan penuh menjadi sumber luas informasi yang diperoleh secara objektif tentang
aspek seluler dan metabolisme adaptasi niche.

BAB 7
Simbiosis Mutualistik Antara Jamur dan Autotroph
MYCORRHIZA
Modus nutrisi mikoriza, di mana pengembangan dan fisiologi jamur Diintegrasikan dengan akar tanaman
untuk membentuk struktur penyerap nutrisi bersama, telah berevolusi secara terpisah di berbagai
clades dari kerajaan jamur. Dalam semua kasus, mutualisme didasarkan pada pertukaran fotosintat dari
tanaman dengan nutrisi yang diambil dari tanah oleh miselium jamur. (Zea mays), poplar (Populus spp.),
dan kedelai (Glycine max) adalah mikoriza, dan symbiosis dengan jamur AM sekarang diakui sebagai
strategi pengadaan mineral hara mineral default tanah tanaman.
Dalam ekosistem alami dan semi-alami, jamur AMF berperan penting, tetapi masih kurang dipahami
bagian dalam produktivitas tanaman dan keanekaragaman masyarakat serta menjadikannya penting
kontribusi pada struktur tanah dan penyerapan karbon. Kemampuan untuk terhubung ke AMF jaringan
dapat mempengaruhi penangkapan nutrisi oleh akar. Tanaman yang dijajah oleh AMF mungkin lebih
efisien pada ekstraksi fosfat tanah dan / atau nitrogen dari tanaman yang tumbuh di tanah steril. Akar
biasanya membentuk asosiasi mikoriza di bawah batasan nutrisi. Akar tanaman mengandung banyak
fosfat menghambat pembentukan arbuscules AMF, sehingga tanaman menghindari yang tidak perlu
menguras sumber karbonnya. Mineral tanah yang terakumulasi oleh hifa ekstraradikal adalah dipartisi
antara jamur dan tanaman. Hifa AMF mentranslokasi nutrisi tidak hanya dari tanah ke akar, tetapi juga
antara akar yang berdekatan tanaman.
Di cakrawala tanah permukaan sebagian besar hutan beriklim sedang, rootlets ectomycorrhizal halus
akan ditemukan mengalir melalui lapisan permukaan tanah yang kaya akan tanaman yang membusuk
sampah. Cabang lateral yang pendek, sekitar satu milimeter atau kurang, berbeda dalam warna dan
permukaan karakteristik dari sumbu induknya, dan biasanya lebih tebal. Penampilan mereka yang khas
disebabkan lapisan permukaan jaringan jamur mereka, mantel atau selubung ectomycorrhizal. Dalam
akar, sel-sel akar hidup berinteraksi dengan hifa jamur yang menembus di antara mereka membentuk
jaring Hartig, dinamai menurut ahli biologi hutan Jerman Robert Hartig.
Jaringan Mikoriza Umum. Miselium dari jamur mikoriza yang dapat meluas ke tanah di luar akar inang
menjajah tanaman inang yang berdekatan. Pabrik individu yang terpisah dengan demikian dapat
dihubungkan ke dalam jaringan mikoriza bawah tanah - yang disebut jaring kayu-lebar. Pertukaran
nutrisi bisa terjadi antara tanaman dari berbagai spesies yang dihubungkan oleh jaringan miselium di
mana tanaman dan jamur mitra kompatibel. Jamur yang membentuk tali miselium telah ditemukan
untuk didistribusikan kembali sejumlah besar nutrisi di antara tanaman. Di alam, beberapa spesies
tanaman terjadi secara teratur bersama di beberapa habitat, mendorong spekulasi bahwa mereka
mungkin saling mendukung cara ini. Koneksi jamur dalam jaringan mikoriza umum bersifat dinamis dan
variabel. Tata ruang tingkat dan durasi konektivitas dapat bervariasi sesuai dengan koneksi hyphal terus-
menerus dibuat dan dipatahkan di bawah pengaruh perubahan fisik dan interaksi biotik. Memetakan
area distribusi bawah tanah jamur ECM dari beberapa spesies umum di Indonesia hutan menunjukkan
bahwa ukuran relatif area yang ditempati oleh masing-masing spesies berubah. Beberapa, tetapi tidak
semua, spesies jamur ECM terdistribusi secara merata, dan ukuran tambalan berbeda spesies dan
musim.