PENGANTAR BIOKIMIA Semester V

Worksheet - Asam amino Tahun ajaran

UNIVERSITAS NEGERI SEMARANG 2015-2016

Worksheet Asam amino

• L-α-asam amino amino memiliki gugus fungsi _________________ dan _________________

• asam amino memiliki pusat C kiral sehingga memiliki _____________
• di alam stereoisomer asam amino terdapat dalam bentuk_________

klasifikasi asam amino

• terdapat sebanyak ______ asam amino
• klasifikasi asam amino berdasarkan rantai samping

Rantai samping alifatik (V,I,P,G,A,L)

Glisin- (Gly) - [G] Alanin - (Ala) - [A] Valin- (Val) - [V]

• Polar /hidrofilik • Non Polar /hidrofobik • Non Polar /hidrofobik
• tidak bermuatan • tidak bermuatan • tidak bermuatan

Leusin- (Ala) - [A] isoleusin- (Ile) - [I] Prolin - (Pro) - [P]

• Non Polar /hidrofobik • Non Polar /hidrofobik • non Polar /hidrofobik
• tidak bermuatan • tidak bermuatan • tidak bermuatan
• struktur rigid
• lekukan protein

1
 PENGANTAR BIOKIMIA Semester V
Worksheet - Asam amino Tahun ajaran
UNIVERSITAS NEGERI SEMARANG 2015-2016

Rantai samping aromatik

Fenilalanin - (Phe) - [F] Tirosin - (Tyr) - [Y] Triptophan - (Trp) - [W]

• Non Polar /hidrofobik • Polar /hidrofilik • Non Polar /hidrofobik
• tidak bermuatan • bermuatan • bermuatan
• paling hidrofobik • serapan UV 280nm • serapan UV 250-300 nm
• serapan UV 250-300 nm

rantai samping mengandung gugus hidroksi dan sulfur

Serin - (Ser) - [S]
• Polar /hidrofilik
• Tidak bermuatan
• dapat berikatan
dengan gula 
glycoproteins
Treonin - (Thr) - [T]
• Polar /hidrofilik
• Tidak bermuatan
Sistein - (Cys) - [C] Metionin - (Met) - [M]
• Polar /hidrofilik • non Polar
• Tidak bermuatan /hidrofobik
• dapat membentuk • Tidak bermuatan
ikatan disulfida • dapat mengikat ion
logam

rantai samping basa

Lisin - (Lys) - [K] Arginin - (Arg) - [R] Histidin - (His) - [H]

• Polar /hidrofilik • Polar /hidrofilik • Polar /hidrofilik
• bermuatan • bermuatan • tidak bermuatan
• basa yang paling lemah

2
 PENGANTAR BIOKIMIA Semester V
Worksheet - Asam amino Tahun ajaran
UNIVERSITAS NEGERI SEMARANG 2015-2016

rantai samping asam dan amidanya

Asam Aspartat-(Asp)- Asam glutamat- (Glu) - Asparagin - (Asn) - [N] Glutamin- (Gln) - [Q]
[D] [E]
• Polar /hidrofilik • Polar /hidrofilik • Polar /hidrofilik • Polar /hidrofilik
• bermuatan • bermuatan • tidak bermuatan • tidak bermuatan
• dapat berikatan
dengan gula 
glycoproteins

• 2 molekul asam amino sistein dapat

saling berikatan membentuk
____________

sifat kimia asam amino

• gugus amino asam amino bereaksi dengan ninhidrin menghasilkan warna biru
• asam amino dapat membentuk muatan positif dan negatif dalam satu molekul disebut dengan zwitter ion
• gugus asam karboksilat (COOH) terdeprotonasi menjadi COO- yang bermuatan negatif :
R-COOH _________ + _________ pKa 1
+
• gugus amina (NH2) terprotonasi menjadi NH3 yang bermuatan positif
R-NH3+ _________+_________ pKa 2

bentuk molekul glisin pada berbagai rentang pH

net charge____ net charge____ net charge____

3
 PENGANTAR BIOKIMIA Semester V
Worksheet - Asam amino Tahun ajaran
UNIVERSITAS NEGERI SEMARANG 2015-2016

Bentuk molekul asam aspartat pada berbagai rentang pH

• pH ketika asam amino mengemban muatan positif dan negatif yang sama besar ini disebut dengan pH
_________ (pI). rumus pI adalah :

• Pemisahan asam amino dengan memanfaatkan perbedaan muatan total (net charge) pada pH tertentu
disebut metode ____________________ dan kromatografi penukar ion

Peptida

Antar asam amino dapat terikat secara kovalen melalui reaksi antara gugus asam karboksilat dengan amina
membentuk ikatan ________ (– CO – NH –) atau disebut dengan ikatan _______

4
 PENGANTAR BIOKIMIA Semester V
Worksheet - Asam amino Tahun ajaran
UNIVERSITAS NEGERI SEMARANG 2015-2016

• Atom-atom C, O, N, and H dalam Ikatan peptida

berbentuk _______
• Ikatan peptida tidak dapat berotasi bebas hal ini
dikarenakan adanya karakter _______________.
• Ikatan -C=O and -N-H paralel (_____) kecuali X-Prolin
• Ikatan peptida tidak bermuatan pada pH berapapun.
• ikatan bersifat metastabil

Aturan penulisan

• Struktur peptida digambarkan dimana residu α-amino berada di ujung sebelah kiri dan residu asam
karboksilat di ujung sebelah kanan.
contoh :
lysyl-leucyl- glutamine
Lys - Leu - Gln (K L G)

5
 PENGANTAR BIOKIMIA Semester V
Worksheet - Asam amino Tahun ajaran
UNIVERSITAS NEGERI SEMARANG 2015-2016

SOAL

1. Which of the following amino acids is the largest of all the amino acids? Jawab :
a. Tryptophan c. Histidine
b. Tyrosine d. Glutamic acid

2. Which of the following amino acids is NOT positively charged? Jawab :

a. Histidine c. Aspartic acid
b. Lysine d. Arginine
3 amino acids abbreviated "Lys", "Glu", "Trp", and "Gln", which is a basic Jawab :
amino acid with a positive charge?
a. Glutamic acid and Valine c. Aspartic acid and Lysine
b. Arginine and Glutamine d. Proline and Glycine
4 Which of the following amino acid(s) are polar? Jawab :
a. Arginine c. Tyrosine
b. Serine d. All of these

5 Which two of the following amino acids could form a ionic bond? Jawab :
a. Glutamic acid and Valine c. Aspartic acid and Lysine
b. Arginine and Glutamine d. Proline and Glycine

6 Degradasi edman merujuk pada Jawab :

a. jalur metbolisme dari katabolisme protein
b. metode kimia untuk menentukan urutan ujung amino dari
rangkaian protein
c. metode kimia untuk menentukan urutan ujung karboksil dari
rangkaian protein
7 jelaskan mengapa subtitusi Leu  Val dan Arg  Lys dalam protein Jawab :
tidak menyebabkan penurunan aktivitas biologis dari enzim!

8 jelaskan mengapa subtitusi Ala  Pro dan Gly  Val dalam protein Jawab :
tidak menyebabkan penurunan aktivitas biologis dari enzim!

9 Dalam pemisahan lisin dengan histidin menggunakan kolom polistirena Jawab :

tersulfonasi akan lebih mudah dipisahkan pada pH 4 atau pH 8?
jelaskan!
10 Suatu peptida dengan urutan Glx-Ala-Gly-Arg terikat pada kolom Jawab :
polistirena tersulfonasi pada pH netal. apakah Glx adalah Glu atau Gln?
jelaskan!