1
PENGANTAR BIOKIMIA Semester V
Worksheet - Asam amino Tahun ajaran
UNIVERSITAS NEGERI SEMARANG 2015-2016
Serin - (Ser) - [S] Treonin - (Thr) - [T] Sistein - (Cys) - [C] Metionin - (Met) - [M]
Polar /hidrofilik Polar /hidrofilik Polar /hidrofilik non Polar
Tidak bermuatan Tidak bermuatan Tidak bermuatan /hidrofobik
dapat berikatan dapat membentuk Tidak bermuatan
dengan gula ikatan disulfida dapat mengikat ion
glycoproteins logam
Asam Aspartat-(Asp)- Asam glutamat- (Glu) - Asparagin - (Asn) - [N] Glutamin- (Gln) - [Q]
[D] [E]
Polar /hidrofilik Polar /hidrofilik Polar /hidrofilik Polar /hidrofilik
bermuatan bermuatan tidak bermuatan tidak bermuatan
dapat berikatan
dengan gula
glycoproteins
• gugus amino asam amino bereaksi dengan ninhidrin menghasilkan warna biru
• asam amino dapat membentuk muatan positif dan negatif dalam satu molekul disebut dengan zwitter ion
• gugus asam karboksilat (COOH) terdeprotonasi menjadi COO- yang bermuatan negatif :
R-COOH pKa 1
+
• gugus amina (NH2) terprotonasi menjadi NH 3+ yang bermuatan positif
pKa 2
R-NH3+
+
pH ketika asam amino mengemban muatan positif dan negatif yang sama besar ini disebut dengan pH
(pI). rumus pI adalah :
Pemisahan asam amino dengan memanfaatkan perbedaan muatan total (net charge) pada pH tertentu
disebut metode dan kromatografi penukar ion
Peptida
Antar asam amino dapat terikat secara kovalen melalui reaksi antara gugus asam karboksilat dengan amina
membentuk ikatan amida (– CO – NH –) atau disebut dengan ikatan peptida
PENGANTAR BIOKIMIA Semester V
Worksheet - Asam amino Tahun ajaran
UNIVERSITAS NEGERI SEMARANG 2015-2016
Atom-atom
• C, O, N, and H dalam Ikatan peptida
berbentuk planar
• Ikatan peptida tidak dapat berotasi bebas hal ini
dikarenakan adanya karakter ikatan ganda
parsial.
• Ikatan -C=O and -N-H paralel (trans) kecuali X-Prolin
• Ikatan peptida tidak bermuatan pada pH berapapun.
• ikatan bersifat metastabil
Aturan penulisan
• Struktur peptida digambarkan dimana residu α-amino berada di ujung sebelah kiri dan residu asam
karboksilat di ujung sebelah kanan.
contoh :
lysyl-leucyl- glutamine
Lys - Leu - Gln (K L G)
PENGANTAR BIOKIMIA Semester V
Worksheet - Asam amino Tahun ajaran
UNIVERSITAS NEGERI SEMARANG 2015-2016
SOAL
1. Which of the following amino acids is the largest of all the amino acids? Jawab :
a. Tryptophan c. Histidine
b. Tyrosine d. Glutamic acid
5 Which two of the following amino acids could form a ionic bond? Jawab :
a. Glutamic acid and Valine c. Aspartic acid and Lysine
b. Arginine and Glutamine d. Proline and Glycine
8 jelaskan mengapa subtitusi Ala Pro dan Gly Val dalam protein Jawab :
tidak menyebabkan penurunan aktivitas biologis dari enzim!