Bahan
Myristicin, potassium hydroxide, ethanol, anhydrous Na 2SO4,
chloroform, tween 80, potassium permanganate, dichloromethane,
methyl phenyl keton, sodium hydroxide, all chemical e-Merck dengan
grade pa.
Alat deteksi
Spektometer Agilent NMR 400 Mhz, IR Prestige-21, GC 2010, QP-2010,
Spektrofotometer Shimadzu, Shimadzu.
Langkah Penelitian Prosedur umum sintesis isomiristicin (1)
Myristicin dan 20% KOH dalam ethanol (1:1) direfluks selama 5 jam.
Hasilnya diekstraksi dengan kloroform-air hingga pH netral, dan
kloroform diuapkan untuk mendapatkan hasil reaksi. Metode reaksi
yang diadopsi dari reaksi isomerasi eugenol, anethole, dan safrole.
Metode Docking
Stuktur kimia 4 ligan, dibuat dari database ChemDraw secara manual.
Struktur 3D adalah HSP90 (PDB ID : resolusi 2 VCJ: 2,50 A), DHODH (PDB
ID : resolusi 5IQK : 2,41 A), dan PTGS2 (PDB ID : 2BXV dengan resolusi
2,15 A ). Makromolekul dikumpulkan dari Protein Data Bank (PDB).
Makromolekul disiapkan dengan menggunakan perangkat lunak UCSF
Chimera . investigasi docking dilakukan menggunakan Auto Dock Tools.
Selanjutnya dilakukan binding set study oleh Discovery Studio.