Decho44 silde

Decho44 silde

PENDEKATAN KOMPUTASI UNTUK

DESAIN STRUKTUR OBAT
BERDASARKAN SENYAWA
ANTIVIRAL DARI ALAM UNTUK
HERPESVIRIDAE
 Decho44 silde

PENDAHULUAN

 Struktur tiga dimensi dari suatu target

bimolekular dapat mengalami perubahan
secara dramatis karena adanya perbedaan
sifat struktural dan elektronik tentang ligan.
Hal ini telah menginspirasi perkembangan
pesat dari desain obat berbasis struktur.
 Desain obat berbasis struktur adalah dasar
statistik dari struktur 3-D dari suatu target
biologis
 Decho44 silde

 Desain obat berbasis struktur dibagi menjadi

dua yaitu berbasis ligan dan berbasis reseptor
 Desain obat berdasarkan struktur memiliki lima
tahapan yaitu
 Langkah pertama, mengidentifikasi target obat
atau reseptor yang merupakan makromolekul
penting untuk penyakit yang menyebabkan
melalui materi genetik atau proteomik.
 Langkah kedua melibatkan informasi struktural
akurat biomolekul untuk memahami fungsi dan
aktivitas target obat.
 Decho44 silde

 Langkah ketiga adalah identifikasi situs

mengikat di mana ligan dapat memasang
dan menghambat protein penyebab
penyakit.
 Langkah keempat, studi komputasi
digunakan untuk mengevaluasi kompleks
yang mengikat inhibitor.
 Langkah terakhir berlaku untuk evaluasi
potensi senyawa timbal sebelum
melanjutkan ke uji praklinik.
 Decho44 silde

 Pemodelan homologi protein digunakan untuk

desain ligan
 Identifikasi dan visualisasi protein adalah titik awal
untuk desain struktur obat berbasis aplikasi (SBDD)
 Ukuran dan bentuk protein menentukan geometri
tiga dimensi ligan
 Auto Dock adalah alat docking otomatis yang
dirancang untuk memprediksi bagaimana molekul
kecil mengikat reseptor dengan struktur 3D
 Selain itu juga digunakan sebagai parameter dalam
pengikatan ligan dengan sejumlah konformasi yang
berbeda, serta untuk menentukan energi minimum
yang digunakan untuk mengikat ligan
 Decho44 silde

SENYAWA ANTIVIRUS
Bahan alam yang digunakan untuk mendapatkan 21 senyawa antivirus, yaitu:

 Bawang putih (Allium sativum)

 Daun Mimba (Azadirachta indica)

 Echinacea
 Jahe (Zingiber officinale)

 Goldenseal
 Kelabat (Methika /Fenugreek)

 Peganum harmala
 Kembang Telang (Clitorea ternatea)

 Ruku- ruku (Ocimum sanctum)

 Scrophularia frutescens
 Decho44 silde

TINJAUAN PUSTAKA

 Metode yang paling populer untuk

mengidentifikasi obat adalah dengan studi
penyakit berdasarkan pengamatan dan
identifikasi gen yang terkait dengan penyakit
tersebut
 Sebagian besar data biologis digunakan untuk
identifikasi dan karakterisasi faktor virulen
dalam patogen
 Decho44 silde

METODOLOGI
Metode desain obat ini
bioinformatikamelibatkan,
proteomik, biokimia, dan
pemodelan komputer dari
struktur protein 3-dimensi.

Metode desain obat ini

bioinformatikamelibatkan,
proteomik, biokimia, dan
pemodelan komputer dari
struktur protein 3-dimensi.
Metode desain obat ini
bioinformatikamelibatkan,
proteomik, biokimia, dan
pemodelan komputer dari
struktur protein 3-dimensi.