MAKALAH

BIOKIMIA UMUM

ASAM AMINO DAN PEPTIDA

Dosen Pengampuh :

apt.Dr. Abd. Rahman Razak, M.Si

Dr. Hardi Ys, S.Si., M.Si

Pasjan Satrimafitrah, S.Si., M.Si., Ph.D

DISUSUN OLEH:

MAURA MAQNALIA
G30120004

KELAS B

PROGRAM STUDI KIMIA JURUSAN KIMIA

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS TADULAKO

PALU, 2021
 ASAM AMINO DAN PEPTIDA

A. Klasifikasi Dan Analisis Asam Amino

1. Anatomi Asam Amino
Nama asam amino menunjukkan bahwa senyawa ini memiliki dua gugus fungsi,
gugus asam karboksilat, COOH, dan gugus amino - NH2, yang bersifat basa. Asam
amino yang terdapat dalam protein adalah asam α-saminokarboksilat.

 Asam amino yang paling sederhana adalah asam aminoasetat

(H2NCH2CO2H) yang disebut glisin (glisin). Glisin tidak memiliki rantai
samping dan karena itu tidak mengandung karbon asimetris tunggal.
 Asam amino lain memiliki rantai samping, sehingga karbonnya asimetris.
Asam amino yang diturunkan dari protein termasuk dalam rantai L, yang
berarti bahwa gugus di sekitar karbon memiliki konfigurasi seperti
gliseraldehida.

Dalam keadaan zwitter ionik, gugus umumnya dalam keadaan - NH4+ dan - COO-
. Kecuali prolin, 20 asam amino pembentuk protein yang memiliki gugus karboksil
bebas dan gugus amino bebas tidak terikat pada atom karbon, sehingga disebut
asam amino. Berdasarkan strukturnya, terdapat 20 jenis asam amino pembentuk
protein, 19 di antaranya adalah amina primer dan 1 amina sekunder (prolin). Selain
itu, 19 asam amino memiliki kiral C dan 1 akiral (glisin).

Berdasarkan jumlah asam amino penyusunnya, rantai asam amino dibagi menjadi:
1) Peptida. Terdiri dari asam amino yang jumlahnya kurang dari 50.
a) Dipeptida. Terdiri dari 2 asam amino.
b) Tripeptida. Terdiri dari 3 asam amino.
c) Polipeptida. Terdiri lebih dari 10 asam amino.
2) Protein. Terdiri dari asam amino yang jumlahnya lebih dari 50. Biasanya protein
terdiri dari 100 – 10000 asam amino.

Untuk membentuk peptida dan protein, asam amino membentuk ikatan peptida
dengan molekul asam amino lainnya. Karena ikatan antara amida pada gugus amino
dan gugus hidroksil pada molekul lain, peptida terbentuk melalui proses
kondensasi. Di sisi lain, pemutusan ikatan peptida disebut hidrolisis.
 Dalam proses pembentukan protein, asam amino berperan sebagai N-terminus dan
C-terminus. Asam amino yang masih memiliki gugus amino dalam rantai protein
disebut N-terminus, dan asam amino yang masih memiliki gugus karboksil disebut
C-terminus. Secara umum, representasi peptida dan protein selalu dimulai dengan
N-terminus dan diakhiri dengan C-terminus.

2. Rantai Samping Asam Amino

Berdasarkan rantai samping penyusunnya, asam amino diklasifikasikan menjadi 4
kelas yaitu:
a) Gugus R nonpolar atau hidrofobik
b) Gugus R netral (tidak bermuatan) polar
c) Gugus R bermuatan positif
d) Gugus R bermuatan negatif

Nama Asam Amino Simbol Struktur

Nonpolar, alifatik

Gugus R

Glisin Gly G

Alanin Ala A

Prolin Pro P
Valin Val V

Leusin Leu L

Isoleusin Ile I

Metionin Met M

Gugus R Aromatik

Fenilalanin Phe F

Tirosin Tyr Y

Triptofan Trp W

Polar, Tidak Bermuatan

Gugus R

Serin Ser S

Treonin Thr T

Sistein Cys C
 Asparagin Asn N

Glutamin Glu Q

Bermuatan Positif

Gugus R

Lisin Lys K

Histidin His H

Arginin Arg R

Bermuatan Negatif

Gugus R

Aspartat Asp D

Glutamat Glu E

3. Stereoisomer
Kecuali glisin, karbon asam amino adalah C kiral. Oleh karena itu, struktur
tetrahedral asam amino memiliki dua bentuk, yang disebut enansiomer pada
bayangan cermin. Semua molekul dengan kiral C aktif secara optik dan dapat
memutar bidang cahaya terpolarisasi untuk membentuk sistem D dan L. L dan D
dirancang untuk menggambarkan belok kiri (lampu belok kiri) dan belok kanan
(lampu belok kanan). Asam amino yang menyusun molekul protein adalah asam
amino dengan L-stereoisomer. Asam amino dapat ditemukan dalam peptida rantai
 pendek yang membentuk dinding sel bakteri dan peptida yang bertindak sebagai
antibiotik.

4. Titik Isoelektrik
Asam amino yang terlarut dalam air dapat membentuk ion dengan dua kutub (dipol)
kutub, biasanya disebut zwitterion. Dalam bahasa Jerman, zwitterion berarti
menyeberang. Zwitterion dapat bertindak sebagai asam (donor proton) atau basa
(akseptor proton). Karena sifat dipolar dan fungsinya sebagai asam dan basa, asam
amino sering disebut sebagai amfoter atau amfoter (elektrolit amfoter). Ion
amonium (- NH3+) bertindak sebagai asam dan ion karboksilat (- COO-) bertindak
sebagai basa.

Titrasi asam-basa dapat digunakan untuk menentukan titik isoelektrik asam amino.
Titik isoelektrik (pI) adalah pH di mana asam amino netral atau memiliki muatan
nol (bentuk zwitterion).

5. Asam Amino Esensial dan Nonesensial

Berdasarkan kemampuan tubuh mensintesis, asam amino dibagi menjadi asam
amino essensial, nonesensial dan kondisional.
a) Asam amino esensial adalah asam amino yang tidak dapat disintesis oleh tubuh
sehingga harus diperoleh dari makanan yang dikonsumsi.
b) Asam amino nonesensial adalah asam amino yang dapat disintesis oleh tubuh.
c) Asam amino esensial kondisional adalah asam amino yang tidak dapat disintesis
oleh tubuh karena pada keadaan sakit atau kurangnya prekursor. Contohnya
adalah bayi yang lahir prematur enzim yang digunakan untuk mensintesis
arginin belum berkembang dengan baik.

Asam amino esensial Asam amino nonesensial

Histidin Alanin

Isoleusin Arginin
 Leusin Asparagin

Lisin Asam aspartat

Metionin Sistein

Fenilalanin Asam glutamic

Treonin Glutamin

Triptofan Glisin

Valin Prolin

Serin

Tirosin

6. Sifat-sifat asam amino

 Larut dalam air dan pelarut polar lain tetapi tidak larut dalam pelarut nonpolar
seperti dietil eter atau benzena.
 Momen dipol yang besar
 Kurang bersifat asam dibandingkan sebagian besar asam karboksilat
 Kurang basa dibandingkan sebagian besar amina.

B. PEPTIDA : SIFAT DAN SENYAWA YANG PENTING

Ketika ikatan amida terbentuk antara gugus -NH2 dari satu asam amino dan gugus -
COOH dari asam amino lain, dipeptida terbentuk. Setiap asam amino dalam molekul
peptida disebut unit atau residu.

 Alanilglisina memiliki dua residu: residu alanin dan residu glisin.

 Polipeptida adalah peptida dengan sejumlah besar residu asam amino. Ketika ikatan
amida terbentuk antara gugus -NH2 dari satu asam amino dan gugus -COOH dari
asam amino lain, dipeptida terbentuk.
 Secara konsisten, poliamida dengan residu asam amino kurang dari 50
diklasifikasikan sebagai peptida, sedangkan poliamida yang lebih besar
diklasifikasikan sebagai protein.
 Alanin dan glisin dapat digabungkan menjadi glisin alanin dengan cara lain, di mana
glisin memiliki gugus amino bebas dan alanin memiliki gugus karboksil bebas.

Dua dipeptida berlainan dari alanina dan glisina :

 Asam amino dengan gugus amino bebas biasanya terletak di ujung kiri struktur.
Asam amino ini disebut asam amino N-ujung.
 Asam amino dengan gugus karboksil bebas di ujung kanan disebut asam amino C-
ujung.

1. Ikatan Peptida
Peptida adalah molekul yang terdiri dari dua atau lebih asam amino. Jika jumlah
asam amino masih kurang dari 50 molekul disebut peptida, jika lebih dari 50 disebut
protein. Asam amino dihubungkan oleh ikatan peptida. Ikatan peptida terjadi ketika
nitrogen dari satu asam amino terikat pada gugus karboksil dari asam amino lain.

Ikatan peptida adalah ikatan kovalen yang terbentuk antara dua molekul asam
amino ketika gugus karboksil dari asam amino bereaksi dengan gugus amino dari
asam amino lain untuk melepaskan molekul air. Ikatan ini terjadi ketika gugus
karboksil dari satu molekul asam amino bereaksi dengan gugus amino dari molekul
asam amino lain, melepaskan molekul air (H2O).

Ikatan peptida adalah ikatan yang kuat dan tidak mudah putus dengan pemanasan
atau konsentrasi garam yang tinggi, tetapi dapat diputus dengan pemanasan yang
lama dalam asam atau basa kuat atau dengan enzim. Ikatan peptida memiliki ikatan
rangkap parsial, sehingga bersifat kaku, datar dan dapat berputar.

2. Jenis-Jenis Peptida dan fungsinya

Peptida terpendek adalah dipeptida yang terdiri dari 2 asam amino yang
dihubungkan oleh ikatan peptida tunggal. Ada juga tripeptida, tetrapeptida,
pentapeptida, dll. Peptida memiliki ujung amino dan ujung karboksil. Polipeptida
adalah rantai linier sederhana asam amino. Asam dihubungkan oleh ikatan peptida.
Protein terdiri dari satu atau lebih polipeptida komposit yang umumnya berfungsi
 secara biologis dan kadang-kadang memiliki gugus non-peptida yang melekat yang
dapat disebut sebagai gugus prostetik atau kofaktor.

Banyak peptida diproduksi selama proses mencerna protein. Peptida bertindak

sebagai pembawa pesan biologis dan merangsang reaksi fisiologis. Peptida
diperoleh dari protein makanan yang membantu menjaga kesehatan dan mencegah
penyakit jantung, saraf, kekebalan dan nutrisi dan merupakan sumber energi dan
asam amino.

3. Jenis - jenis peptida yang terdapat pada bahan pangan dan tubuh :
 Peptida susu: terbentuk dari protein susu melalui reaksi enzimatik yang dipecah
oleh enzim pencernaan atau proteinase yang dihasilkan oleh laktobasilus selama
fermentasi susu. Beberapa peptida susu memiliki efek antihipertensi pada hewan
dan dalam uji klinis.
 Peptida ribosom: disintesis melalui translasi mRNA. Biasanya bekerja pada
organisme yang lebih tinggi seperti hormon dan molekul pemberi sinyal.
Beberapa organisme menghasilkan peptida antibiotik.
 Peptida non-ribosom: dipanen oleh enzim yang spesifik untuk setiap peptida dan
bukan oleh ribosom. Peptida non-ribosom yang paling umum adalah glutathione,
yang merupakan bagian dari pertahanan antioksidan sebagian besar organisme
aerobik.
 Pepton: Pepton terjadi karena bentuk susu atau daging dibagi dengan pencernaan
proteolitik.
 Fragmen peptida: Fragmen peptida mengacu pada fragmen protein yang
digunakan untuk mengidentifikasi atau mengidentifikasi protein induk.
 Hormon, salah satu klasifikasi peptida yang paling umum dalam tubuh manusia,
adalah molekul pembawa pesan khusus yang digunakan dalam komunikasi
seluler. Misalnya, hormon peptida glukagon dan insulin memiliki reseptor
spesifik di hati yang membantu mereka mengontrol gula darah.
 Neuropeptida tersebar luas di sistem saraf pusat dan perifer tubuh dan memiliki
fungsi penghambatan dan rangsang spesifik. Neuropeptida bekerja dengan cara
yang sama seperti neurotransmiter seperti serotonin dan dopamin.
 Alkaloid adalah peptida yang biasa digunakan dalam pengembangan mekanisme
pertahanan pada jamur, tumbuhan dan hewan kecil seperti krustasea.
Ergotamine, pandamine, dan dynorphin adalah jenis alkaloid peptida.
 Antibiotik adalah peptida yang menghambat pertumbuhan mikroorganisme
dalam tubuh. Mereka sering digunakan secara medis untuk membunuh bakteri
patogen.

Tubuh kita juga dilengkapi untuk memecah dan menggunakan kembali peptida.
peptida yang dapat dicerna atau dikeluarkan, tergantung pada kebutuhan tubuh.
 DAFTAR PUSTAKA

Rosana, D. (2013).Asam Amino Dan Protein. Yogyakarta : UNY.

Karnila, R. (2019). Protein dan Peptida. Riau : UNRI.

Tatang. (2018). Modul Asam Amino, Peptida dan Protein Jilid 1. Yogyakarta : UII.