Degradasi Peptida

Pendahuluan
Ikatan
Primer kovalen
kuat
Ikatan
Sekunder
hidrogen
Pentida
Interaksi
Tertier
Hidrofobik

Ikatan
Quartener
Disulfida
Degradasi Fisika
• Degradasi fisik peptida dan protein melibatkan perubahan pada
struktur sekunder, tersier, atau kuaterner
• Denaturasi dapat disebabkan oleh peningkatan suhu, perubahan
pH.
• Denaturasi mengarah pada hilangnya aktivitas biologis spesifik
• Agregasi dapat disebabkan oleh penataan ulang gugus protein
hidrofobik sehingga dua atau lebih molekul protein bergabung
untuk membentuk suatu agregat yang menyebabkan
pengendapan.
Degradasi Kimia
• Degradasi kimia mengacu pada perubahan ikatan kovalen
dalam molekul polipeptida atau protein.
• Dipengaruhi oleh suhu dan pH
• dipengaruhi oleh komposisi asam amino, urutan, dan
konformasi
• Ketidakstabilan kimiawi molekul polipeptida termasuk
deamidasi, oksidasi, dan cystine destruction/disulfide
exchange.
Deamidasi
• Deamidasi nonenzimatik merupakan sumber utama degradasi
spontan dan hilangnya urutan homogenitas asam amino.
• Reaksi deamidasi pada pH netral ke basa bersifat intramolekul
dan terjadi pada cincin suksinimida.
• Cincin suksinimida labil pada kondisi basa dan mudah
terhidrolisis
• Deamidasi dapat menyebabkan protein lebih rentan terhadap
protease dan denaturasi.
• Meningkatkan kerentanan terhadap protease diinduksi oleh
deamidasi dapat mengurangi paruh in vivo dari molekul.
Oksidasi
• Oksidasi diinduksi oleh paparan udara, cahaya, atau kandungan
peroksida residu, menghasilkan konversi thioether menjadi
sulfoksida.
Cysteine destruction/disulfide exchange
• Residu sistein mengandung gugus tiol yang dapat dioksidasi
untuk membentuk ikatan disulfida (residu sistin)
• Disulfida dapat dibentuk baik dengan oksidasi langsung sistein
atau melalui pertukaran tiol-disulfida dan sering dikatalisis
oleh tembaga dan besi, stabilitas relatif dari sistein tereduksi
tergantung pada potensi redoks dari lingkungan protein.
Fotolisis
• Radiasi pengion dan nonionisasi dapat menyebabkan inaktivasi
protein
• Penyerapan foton mengarah ke photoionization
danpembentukan produk fotodegradasi melalui interaksi
langsung dengan asam amino atau secara tidak langsung
melalui berbagai zat pemeka, seperti oksigen.
Insulin
• Molekul insulin manusia (MW 5808 g / mol) terdiri dari 52
residu asam amino dalam dua rantai polipeptida, rantai A (21
residu) dan B (31 residu),yang dihubungkan oleh dua ikatan
disulfida dan satu disulfida loop dalam rantai A
• Ketika larutan insulin bersentuhan dengan permukaan
hidrofobik (mis., interphases air udara atau air plastik), struktur
insulin tiga dimensi cenderung terbuka, menghasilkan interaksi
hidrofobik (mis., agregasi) dari sebagian rantai insulin yang
tidak terlipat dengan pengendapan akibat fibril insulin.
• mekanisme degradasi kimia utama adalah hidrolisis (mis.,
deamidasi dan pembelahan rantai)