Isomer adalah senyawa dengan komposisi unsur yang sama, oleh karena itu bobot
molekul relatif dan rumus umumnya identik, tetapi strukturnya berbeda (termasuk dalam
bentuk 3 dimensi). senyawa dapat memiliki banyak sekali isomer, atau bahkan tidak memiliki
isomer sama sekali. Misalnya, metana (hidrokarbon jenuh linier) adalah senyawa tunggal
tanpa isomer, sedangkan pentana memiliki 3 isomer, hidrokarbon jenuh linier dengan 40
karbon memiliki lebih dari 62 triliun isomer.
1. Isomer Struktural
Isomer struktural adalah senyawa dengan konektivitas yang berbeda. Sebagai contoh :
butana memiliki rantai linier, sedangkan isobutan adalah isomer bercabang. Contoh
lainnya adalah ethanol dan dimetil eter. Kedua senyawa tersebut memiliki komposisi yang
sama namun dengan gugus fungsi yang berbeda. Hal tersebut membuat kedua senyawa
tersebut memiliki sifat yang sangat berbeda pula walaupun komposisinya sama.
2. Isomer Rotasi
Beberapa bagian dari molekul dapat berotasi terhadap bagian lain dari molekul
tersebut, terutama di sekitar ikatan tunggal. Sebagai contoh, suatu gugus metil dalam
molekul etana dapat berotasi pada ikatan C-C. Struktur ruang yang diterima oleh rotasi
tersebut disebut sebagai konformasi, dan molekul tersebut disebut isomer konformasional
atau rotasi (konformer atau rotamers). Energi internal molekul berubah selama rotasi di
sekitar ikatan karbon-karbon dengan derajat tertentu.
Dalam kimia, senyawa rantai terbuka atau senyawa asiklik adalah senyawa
dengan struktur linier, bukan senyawa siklik. Senyawa rantai terbuka yang tidak
memiliki rantai samping disebut senyawa rantai lurus (juga dieja sebagai senyawa
rantai lurus).
Molekul dimana salah satu atom hidrogen yang menempel pada atom karbon
tepat berada di belakang atom karbon lainnya disebut sebagai eclipse position.
Sedangkan saat salah satu atom hidrogen di belakang atom karbon terletak di antara
atom hidrogen di depan atom karbon disebut sebagai staggered position. Staggered
postion memiliki energi internal yang lebih tinggi dibandingkan eclipse position.
3. Isomer Geometri
Ada dua sistem notasi isomer geometri.
1. Jika dua atom atau gugus yang sama melekat pada karbon yang berbeda dari
ikatan rangkap, maka digunakan konfigurasi cis atau trans untuk ikatan rangkap
sesuai dengan posisi relatif dari atom atau kelompok yang identik. Sebagai
contoh, dua hidrogen terikat pada karbon berbeda dari ikatan rangkap dalam asam
cis crotonic di sisi yang sama dari ikatan rangkap, sementara dua hidrogen ini
berada di sisi berlawanan dari asam trans crotonic.
5. Isomer
Senyawa
Siklik Lainnya
a. Asam siklopropanedikarboksilat
Asam siklopropanedikarboksilat memiliki dua isomer, memiliki dua
gugus karboksil dalam posisi cis atau trans. Substituen yang sama terletak di
satu sisi siklus untuk konfigurasi cis, sedangkan dua gugus karboksil dapat
ditemukan pada sisi yang berlawanan dari siklus untuk konfigurasi trans.
Sistem notasi, yang digunakan untuk steroid, juga dapat diterapkan di sini.
Jika substituen terletak di bawah bidang sistem cincin senyawa, maka dapat
ditandai dengan garis putus-putus, jika di atasnya, maka ditandai dengan
garis padat tunggal. Isomer-isomer ini dapat dengan mudah dibedakan satu
sama lain dengan metode kimia. Asam cis-dicarboxylic mudah membentuk
anhidrida karena posisi menguntungkan dari gugus karboksil. Namun, isomer
trans tidak menghasilkan anhidrida, karena substituen asimetrisnya.
b. Cyclohexanehexol
Ada 9 isomer, 4 isomer (meso, scyllo, d- dan l-inosite) dapat
ditemukan pada tanaman, sementara 3 isomer lainnya adalah produk
buatan.
c. Sikloheksana disubsitusi