ISOLASI DNA SECARA SEDERHANA (METODE KITCHEN)

Muthi’ah Amaliyah Ahmad, 2021

Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Makassar
muthiah.amaliyah@gamil.com

Abstrack
DNA isolation is the process of ingesting DNA from where it is located (extraction or llisis is usually done by
homogenization and addition of extraction or lysis to prevent DNA from being damaged. Methods used in
source, age, and sample size. It aims to present separate DNA in the cell nucleus from other cellular
components. DNA isolation usually begins with lysis or damage to cell tissue. Dna extraction can be done by a
simple method (kitchen method) using NaCl, detergent, and ethanol that will produce DNA precipitation in the
solution. The practicum was conducted at the end of March 2021 at the Microbiology Laboratory, Department
of Biology, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Makassar State University. The source of tools and
materials used in this practicum is obtained from shops and markets around Parang Tambung, Kec. Tamalate,
Makassar City, South Sulawesi. The results showed the presence of threads or FILAMENT DNA from
Watermelon Fruit (Citrullus lunatus), Banana Fruit (Musa paradisiaca), Dragon Fruit (Hylocereus polyrhizus)
and Kiwi Fruit (Actinidia deliciosa) that have been isolated and settle hovering at the top of the solution in the
test tube.

Keywords: Isolasi DNA, Metode Kitchen, Ekstraksi, Bioteknologi

1. PENDAHULUAN dalam kromosom. Gen sebagai zarah kompak yang

Ilmu tentang genetika sudah diperhatikan oleh
para peneteliti-peneliti umat manusia sejak berabad-
abad lalu. Bahkan jauh sebelum munculnya teori
yang dikemukakan oleh Mendel, sebagai contohnya
para orang tua sudah tidak memberi restu dengan
adanya pernikahan bersaudara yang merupakan
ajaran dari para leluhur mereka. Dengan adanya
perkembangan teknologi, hal ini menjadi topic
bahasan yang menarik bagi para ilmuwan sehingga
tidak sedikit ilmuan yang mau mendalami ilmu
genetika yang juga mencakup kromosom dan hal
yang berkaitan dengannya.
Gen adalah hal yang mutlak ada dalam setiap
diri makhluk hidup dan juga merupakan syarat
untuk menjadi makhluk hidup. Dalam pandangan
sains, Genetika ialah ilmu yang membahas
mengenai gen, pewarisan sifat dan variasi pada
makhluk hidup. Secara singkat dapat juga genetika
adalah ilmu tentang gen dan segala aspeknya. Istilah
genetika diperkenalkan pertama kali oleh Wiliam
Bateson pada suatu surat pribadi kepada Adam
Chadwick dan ia menggunakannya pada konferensi
Internasional tentang Genetika ke-3 pada tahun
1906.
Gen yang berperan sebagai pembawa faktor
keturunan tersimpan dalam kromosom, yaitu
didalam manik-manik yang disebut kromomer atau
nukleosom dari kromena. Kromomer atau lokus
merupakan adalah lokasi yang diperuntukkan bagi
gen dalam kromosom. Menurut Morgan gen
tersebut tersimpan dalam setiap lokus yang khas
2. KAJIAN PUSTAKA
Asam dioksiribonukleat atau DNA adalah
mengandung suatu informasi genetic dan mengatur
sifat-sifat menurun tertentu memenuhi lokus suatu
kromosom dan dalam setiap kromosom
mengandung banyak gen.
Demi tujuan mendapatkan DNA penyusun gen
ini (Isolasi DNA) dapat dilakukan dengan beberapa
cara, salah satunya dengan cara ekstraksi metode
kitchen. Hartaty & Ferry (2017) menjelaskan isolasi
DNA (Deoxyribonucleic acid) adalah proses
pengeluaran DNA dari tempatnya berada (ekstraksi
atau llisis biasanya dilakukan dengan homogenasi
dan penambahan ekstraksi atau lisis untuk
mencegah DNA rusak. Metode yang digunakan
pada sumber, umur, dan ukuran sampel. Bertujuan
untuk menyajikan DNA terpisah dalam inti sel dari
komponen seluler lainnya. Isolasi DNA biasanya
dimulai dengan lisis atau rusaknya jaringan sel.
Proses ini sangat penting untuk penghancuran
struktur protein dan memungkinkan untuk
pelepasan asam nukleat dari inti
Berdasarkan penjelasan singkat diatas maka
diketahui bahwa pentingnya ilmu pengetahuan akan
keanekaragaman makhluk hidup membuat kita
perlu untuk mengetahui langkah-langkah yang
diperlukan dalam mempelajarinya. Salah satu
tahapan yang dapat dilakukan adalah dengan
melakukan isolasi DNA terhadap organisme yang
akan dikaji. Praktikum ini dilakukan dengan tujuan
untuk mengetahui langkah-langkah isolasi DNA
dengan cara yang sederhana dan untuk mengetahui
macam-macam bentuk DNA.
materi herediter pada manusia dan hampir semua
organisme lain. hampir setiap sel dalam tubuh
seseorang memiliki DNA (Deoxyribonucleic acid)
yang sama. Kebanyakan DNA terletak dalam inti
sel, tetapi sejumlah kecil DNA juga ditemukan
dalam mitokondria. Informasi dalam DNA disimpan
sebagai kode yang terdiri dari empat basa kimia
yaitu adenin (A), guanin (G), sitosin (C) dan timin
(T). urutan basa ini menentukan informasi yang
tersedia untuk membangun dan memelihara suatu
organisme (Murakami, 2012).
Isolasi DNA adalah proses pengeluaran DNA
dari tempatnya berada (ekstraksi atau llisis biasanya
dilakukan dengan homogenasi dan penambahan
ekstraksi atau lisis untuk mencegah DNA rusak.
Metode yang digunakan pada sumber, umur, dan
ukuran sampel. Bertujuan untuk menyajikan DNA
terpisah dalam inti sel dari komponen seluler
lainnya. Isolasi DNA biasanya dimulai dengan lisis
atau rusaknya jaringan sel. Proses ini sangat penting
untuk penghancuran struktur protein dan
memungkinkan untuk pelepasan asam nukleat dari
inti (Hartaty & Ferry, 2017).
Isolasi DNA (Deoxyribonucleic acid) dapat
dilakukan melalui tahapan-tahapan antara lain:
preparasi ekstrak sel, pemurnian DNA
(Deoxyribonucleic acid) dari ekstrsk sel dan
presipitasi DNA. Meskipun isolasi DNA
(Deoxyribonucleic acid) dapat dilakukan dengan
berbagai cara, akan tetapi pada setiap jenis atau
bagian tanaman dapat memberikan hasil yang
berbeda, hal ini dikarenakan adanya senyawa
polifenol dan polisakarida dalam konsentrasi tinggi
yang dapat menghambat pemurnian DNA. Jika
isolasi DNA dilakukan dengan sample buah, maka
kadar air pada masing-masing buah berbeda, dapat
memberi hasil yang berbeda-beda pula. Semakin
tinggi kadar air, maka sel yang terlarut di dalam
ekstrak akan semakin sedikit, sehingga DNA yang
terpretisipasi juga akan sedikit (Kirsman, 2010).
Sejauh ini, protokol isolasi DNA sangat
banyak tersedia. Protokol isolasi DNA tanaman
memanfaatkan nitrogen cair untuk mudah
menggiling jaringan tanaman tanpa degradasi DNA
utuh oleh enzim asli tumbuhan. Namun, nitrogen
cair telah dikeluhkan berbahaya, sulit untuk
ditangani dan mahal. Di Selain itu, meskipun
beberapa ekstraksi DNA genom tanaman kit
komersial tersedia, biayanya sangat mahal untuk
laboratorium kecil. Selain itu, mengadopsi atau
mengembangkan DNA yang efektif biaya metode
Ekstraksi DNA (Deoxyribonucleic acid)
merupakan tahap yang sangat penting dan
menentukan tahap selanjutnya. Diperlukan DNA
isolasi yang dapat menghilangkan kebutuhan
nitrogen cair atau kit isolasi DNA yang sangat
mahal bisa menjanjikan dan ekonomis bagi para
ilmuwan berkembang dunia. Oleh karena itu,
penelitian mulai untuk mengembangkan /
mengadopsi isolasi DNA genom yang ekonomis
protokol dari sampel tanpa cairan nitrogen untuk
penelitian molekuler hilir (Mekonnen dkk, 2017).
DNA (Deoxyribonucleic acid) pada makhluk
hidup dapat diisolasi secara sederhana.
Pengisolasian DNA secara sederhana dapat
dilakukan dengan memecahkan dinding sel,
membran plasma dan membran inti baik secara
mekanik maupun secara kimiawi. Isolasi DNA
(Deoxyribonucleic acid) merupakan suatu teknik
yang digunakan untuk memperoleh DNA murni,
yaitu tanpa protein dan RNA dari suatu sel dalam
jaringan. Pemecahan dinding sel secara mekanik
dapat diakukan dengan pemblenderan atau
penggerus menggunakan mortar dan pistil.
Sedangkan secara kimiawi dapat dilakukan dengan
pemberian detergen. Penambahan sabun cair dan
garam dapur adalah untuk melisiskan membran inti
dalam rangka mengeluarkan isi inti sel yang berisi
DNA (Gusrina, 2012).
Ekstraksi DNA (Deoxyribonucleic acid)
merupakan proses pemisahan DNA
(Deoxyribonucleic acid) dari komponen sel lainnya
seperti protein, karbohidrat, lemak dan lain-lain.
Ekstraksi DNA terdiri dari tiga tahap utama, yakni
perusakan dinding sel (lisis), pemisahan DNA dari
komponen lainnya serta pemurnian DNA.
Pemecahan sel atau lisis pada proses ekstraksi sel
bertujuan untuk menghancurkan membrane dan
dinding sel sehingga bagian dalam sel dapat keluar.
Selanjutnya tahap pemisahan DNA dari
makromolekul lain seperti protein, sebagian kecil
RNA, lipid dan polisakarida. Tahap terakhir ialah
pemurnian DNA. Tahap ini bertujuan untuk
menghilangkan residu dari zat yang digunakan pada
tahap lisis dan pemisahan DNA. Metode
konvensional dalam ekstraksi DNA diantaranya
adalah metode ekstraksi menggunakan
phenolchoroform. Metode ini memerlukan sejumlah
tahapan penambahan bahan-bahan kimia dan
membutuhkan waktu pengerjaan yang cukup lama.
Seiring dengan berkembangnya teknologi, proses
ekstraksi DNA telah mengalami pengembangan dan
modifikasi sehingga lebih efisien. Salah satu bentuk
modifikasi proses ekstraksi DNA ialah penggunaan
kit ekstraksi komersial yang dibutuhkan untuk
proses ekstraksi dengan waktu pengerjaan yang
cukup singkat (Hutami, 2018).
(Deoxyribonucleic acid) dengan kualitas dan kuantitas
yang memadai untuk kegiatan berbasis molekuler
seperti Polymerase Chain Reaction (PCR), Southern
blotting, konstruksi pustaka genomik, hingga
sekuensing. Kehadiran senyawa kontaminan seperti
polisakarida dan polifenolyang ikut terekstraksi dan
menghambat kerja enzim tertentu sehingga harus
dihindari. Oleh karena itu dibutuhkan metode
ekstraksi yang mampu menghasilkan DNA
(Deoxyribonucleic acid) dengan kuantitas dan
kualitas yang baik. Umumnya digunakan nitrogen
cair untuk menghancurkan dinding sel tanaman
(Nugroho, 2017).
Dalam proses pengeluaran DNA
(Deoxyribonucleic acid) dari sel maka teknik
pemurnian DNA (Deoxyribonucleic acid) secara
biokimia dapat dilakukan dengan cara merusak
dinding sel menggunakan larutan buffer tertentu dan
campuran berbagai jenis detergen. Dengan
terbukanya lapisan membrane sel maka DNA dapat
dikeluarkan dan diendapkan dengan penambahan
alkohol. Ketidakefisien dari beberapa isolasi
metode, yang dikembangkan untuk mengekstrak
integritas tinggi DNA genomic dari sel darah atau
virion, bukan fragmen DNA yang lebih kecil.
Efisiensi isolasi cfDNA yang paling umum
digunakan yaitu kit asam nukleat (Sourber, 2017).
Kualitas DNA yang baik yang diperoleh dari
hasil ekstraksi merupakan syarat dasar yang harus
dipenuhi dalam studi molekuler, terutama dalam
penandaan sidik jari DNA. Cetyl Trimethyl
Ammonium Bromide (CTAB) merupakan metode
yang umum digunakan dalam ekstraksi DNA
tanaman yang banyak mengandung polisakarida dan
senyawa. Ada tiga langkah utama dalam ekstraksi
DNA, yaitu perusakan dinding sel (lisis), pemisahan
DNA dari bahan padat seperti selulosa dan protein,
serta pemurnian DNA (Syafaruddin dkk, 2011).
Semua sifat yang dimiliki oleh organisme
ditentukan oleh gen-gen yang dimilikinya. Gen
merupakan bagian-bagian dari urutan asam nukleat
yang terdapat pada DNA. Penemuan struktur double
heliks DNA oleh James Watson dan Crick. Telah
membuka pengertian tentang replikasi, transkripsi
dan translasi dari gen. Sejak saat itu terdapat
perkembangan yang spektakuler tentang interaksi
kompleks yang dibutuhkan untuk mengekspresikan
kode informasi kimia dalam molekul DNA menjadi
komponen sel dan organisme. Perubahan molekul
DNA akan menyebabkan organisme berevolusi dan
Isolasi DNA (Deoxyribonucleic acid)
merupakan serangkaian proses yang dilakukan
untuk memisahkan DNA dari komponen-komponen
beradaptasi dengan lingkungan baru. Secara alami,
perubahan molekul DNA dari organisme dapat
terjadi melalui dua cara, yaitu: melalui mutasi,
dimana terjadi penggantian (substitusi),
penghapusan (delesi) atau penambahan (adisi) satu
atau lebih bagian dari molekul DNA, dan melalui
pertukaran informasi genetik atau DNA antar
organisme sejenis melalui peristiwa reproduksi
seksual (Morihito dkk, 2017).
Kromosom tersusun dari DNA yang
berasosiasi dengan berbagai protein. Kompleks
DNA dan protein tersebut sering dapat terlihat
dalam sel sebagai kromatin. Anggota- anggota
sebuah kelompok protein, disebut histon.membantu
mengorganisasi untaian Panjang DNA menjadi
sebuah struktur yang dikenal sebagai nukleosom.
Setiap kromosom dapat dibedakan secara umum
dari kromosom-kromosom lainnya berkat kriteria
yang dimiliki (Elrod, 2006).
Marka DNA lebih disukai dibanding marka
genetic lainnya karena tingkat polimorfismenya
sangat tinggi, jumlahnya banyak, tidak dipengaruhi
oleh lingkungan, analisis sampel dapat dilakukan
pada stadia awal pertumbuhan tanaman, dan tingkat
heritabilitasnya 100%. Berdasarkan metode
deteksinya, marka DNA dapat dibedakan menjadi
tiga kelompok, yaitu marka DNA berbasis teknik
hibridisasi, polymerase chain reaction (PCR), dan
berbasis sekuen DNA atau sekuensing DNA
Kemajuan yang pesat dalam bidang teknologi marka
DNA dapat mengatasi keterbatasan yang selama ini
ditemui pada marka morfologi, sitologi, dan
biokimia. Melalui penggunaan marka DNA,
pencapaian tujuan suatu program penelitian untuk
penelitian dasar maupun penelitian yang bersifat
aplikatif dapat dipercepat dan dipermudah. Pada
penelitian dasar, penggunaan marka DNA lebih
diarahkan sebagai alat bantu dalam analisis
hubungan kekerabatan antar individu dan pencarian
gen-gen potensial pada suatu spesies untuk sifat
atau karakter suatu individu tanaman (Reflinur dan
Puji, 2015).
Molekul AND dari sel-sel dengan nukleus
sejati mempuyai bentuk sebagai benang lurus dan
tak bercabang, sedangkan pada sel-sel tanpa nukleus
sejati, mitokondria dan plastid molekul AND
berbentuk lingkaran. Ukuran molekul AND
berbeda-beda dari satu spesies ke spesies lainnya.
Pada mitokondria, molekul AND tunggal pada sel
bakteri berukuran 1,4 mm. Dalam sel-sel yang
berinti sejati, beberapa orang peneliti menemukan
molekul AND dari berbagai ukuran, yaitu 50-60 u,
500 u dan 1,6-1,8 mm ( Suryo, 2012).
sel seperti lipid, protein, dan RNA. Prinsip kerja
isolasi dan purifikasi DNA terdiri dari atas 5 tahap
yaitu : pemecahan membrane sel, penghilangan
protein, penghilangan RNA, prespitasi DNA,
pengukuran kemurnian dan kuantitas DNA. (Hylocereus undatus) detik
Pemecahan membrane sel merupakan proses 2. Buah Kiwi Awan 9 Menit 3
pertama dalam melakukan isolasi DNA. Proses (Actinida deliciosa) Detik
pemecahan membrane sel yang paling terbaik
dilakukan dengan menggunakan bahan-bahan kimia 3. Buah Semangka Cincin 13 Menit
seperti detergen atau dengan menggunakan enzim. (Citrulus lanatus) 14 Detik
Salah satu tahapan dalam isolasi DNA adalah
presipitasi DNA. Pada tahap ini digunakan dua jenis 4. Buah Pisang (Musa Awan 11 Menit
alcohol yaitu isopropanol dan etanol. Prinsip paradisiaca L.) 12 Detik
presipitasi DNA (Deoxyribonucleic acid) oleh
alcohol yaitu molekul air bersifat polar (bermuatan Gambar 4.1 Hasil Pengamatan Isolasi DNA
positif) sehingga dapat berikatan kuat dengan DNA
yang juga bersifat polar (negaif) karena adanya
fosfodiester pada tulang punggung DNA
(Puspitaningrum, 2018).
3. METODE PENELITIAN
3.1 Waktu dan Tempat
Praktikum kali ini dilakukan pada Jum’at, 23
April 2021, bertempat di Laboratorium Botani
Lantai III Jurusan Biologi Fakultas Matematika dan
Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri
Makassar.
3.2 Alat dan Bahan
Adapun alat yang digunakan dalam praktikm
kali ini adalah tabung reaksi, pisau, mortar, alu,
gelas beaker, kertas saring, penjepit tabung, rak
tabung, spoit, stop watch dan gelas ukur. Sedangkan
bahan yang digunakan adalah buah naga, buah kiwi, Gambar 4.1 DNA Buah naga (Hylocereus undatus)
buah semangka, buah pisang, NaCl, detergen cair,
dan ethanol dingin.
3.3 Prosedur kerja
Langkah awal yang dilakukan adalah kupas
buah anggur lalu haluskan daging buahnya dengan
mortar dan alu. Garam dapur/NaCl ditambahkan
kedalam daging buah yang telah dilumatkan.
Kemudian dicampurkan dengan detergen cair lalu
dihomogenkan dan disaring. Hasil saringan
dipindahkan ketabung reaksi kemudian
ditambahkan ethanol dingin. Diamkan beberapa saat
hingga DNA terangkat ke permukaan tabung reaksi.
4. HASIL DAN PEMBAHASAN
4.1 Hasil Pengamatan
Tabel 4.1 Hasil Pengamatan Isolasi DNA
No. Nama Buah Bentuk Waktu
DNA
1. Buah Naga Awan 8 Menit 13
Detik
Gambar 4.2 DNA Kiwi (Actinidia deliciosa)

Gambar 4.3 DNA Semangka (Citrulus lanatus)
Gambar 4.4 DNA Pisang (Musa paradisiaca L.)
4.2 Pembahasan
Secara struktural, DNA merupakan polimer
nukleotida, di mana setiap nukelotida tersusun atas
gula deoksiribosa, fosfat, dan basa. Polimer tersebut
membentuk struktur dua untai heliks ganda yang
disatukan oleh ikatan hydrogen antara basa-basa
yang ada. Terdapat empat basa dalam DNA, yaitu
A, C, G, T. kumpulan DNA inilah yang nantinya
akan menyusut dan berduplikasi membentuk sebuah
kromosom. Letak DNA pada organisme eukariotik
seperti tumbuhan sebagian besar terdapat didalam
inti sel atau nukleusnya dan pada beberapa organ
lain dalam sel seperti mitokondria dan kloroplas.
Isolasi DNA merupakan metode untuk
mendapatkan DNA dari suatu makhluk hidup. Pada
praktium kali ini digunakan strawberry untuk
diamati DNA nya. Proses awal dari isolasi DNA
adalah dengan pemecahan sel (lisis) yang bertujuan
untuk mengeluarkan isi sel. Proses lisis dapat
berfungsi untuk menghilangkan protein dan
karbohidrat karena garam dapat menyebabkan
keduanya terpresipitasi. Dapat melarutkan DNA
dilakukan secara fisik dan kimiawi. Secara fisik
dengan menggerus sampel menggunakan mortar
dan pestle . Secara kimiawi dengan penambahan
detergen yang dapat melarutkan lipid pada
membrane sel sehingga terjadi destabilisasi
membrane sel juda dapat berperan dalam
mengurangi aktivitas enzim nuclease yang
merupakan enzim pendegradasi DNA. Hal ini telah
dijelaskan dalam Gusrina (2012). DNA
(Deoxyribonucleic acid) pada makhluk hidup dapat
diisolasi secara sederhana. Pengisolasian DNA
secara sederhana dapat dilakukan dengan
memecahkan dinding sel, membran plasma dan
membran inti baik secara mekanik maupun secara
kimiawi.
Puspitaningrum, (2018) menjelaskan Isolasi
DNA (Deoxyribonucleic acid) merupakan
serangkaian proses yang dilakukan untuk
memisahkan DNA dari komponen-komponen sel
seperti lipid, protein, dan RNA. Prinsip kerja isolasi
dan purifikasi DNA terdiri dari atas 5 tahap yaitu :
pemecahan membrane sel, penghilangan protein,
penghilangan RNA, prespitasi DNA, pengukuran
kemurnian dan kuantitas DNA. Pemecahan
membrane sel merupakan proses pertama dalam
melakukan isolasi DNA. Proses pemecahan
membrane sel yang paling terbaik dilakukan dengan
menggunakan bahan-bahan kimia seperti detergen
atau dengan menggunakan enzim. Salah satu
tahapan dalam isolasi DNA adalah presipitasi DNA.
Pada tahap ini digunakan dua jenis alcohol yaitu
isopropanol dan etanol. Prinsip presipitasi DNA
(Deoxyribonucleic acid) oleh alcohol yaitu molekul
air bersifat polar (bermuatan positif) sehingga dapat
berikatan kuat dengan DNA yang juga bersifat polar
(negaif) karena adanya fosfodiester pada tulang
punggung DNA
Isolasi DNA (Deoxyribonucleic acid)
merupakan suatu teknik yang digunakan untuk
memperoleh DNA murni, yaitu tanpa protein dan
RNA dari suatu sel dalam jaringan. Pemecahan
dinding sel secara mekanik dapat diakukan dengan
pemblenderan atau penggerus menggunakan mortar
dan pistil. Sedangkan secara kimiawi dapat
dilakukan dengan pemberian detergen. Penambahan
sabun cair dan garam dapur adalah untuk melisiskan
membran inti untuk mengeluarkan isi inti sel yang
berisi DNA.
Proses memblender buah bertujuan untuk
merusak dinding sel, membrane sel, dan membrane
inti secara mekanik. Penambahan garam berfungsi
untuk memberikan kondisi ionik, sehingga reaksi
berjalan lebih stabil. Selain itu, garam juga
karena ion Na+ yang dikandung oleh garam mampu
memblokir kutub negatif fosfat DNA yaitu kutub yang
dapat menyebabkan molekul-molekul saling tolak
menolak, sehingga pada saat ion Na + membentuk
ikatan dengan kutub negative fosfat DNA, DNA
akan terkumpul.
Penambahan etanol berfungsi untuk pengikatan
strand atau pita DNA yang telah mengendap karena
pemekatan oleh garam. Pemekatan dilakukan
dengan penambahan etanol pada sampel sehingga
terjadi presipitasi DNA pda perbatasan kedua
larutan. Kerapatan partikel etanol lebih kecil
dibandingkan kerapatan partikel air sehingga etanol
akan berada dibagian atas dari larutan dalam tabung
reaksi. DNA yang terikat akan membentuk benang-
benang yang halus. Etanol yang ditambahkan harus
dalam kondisi dingin agar DNA yang terpresipitasi
semakin pekat sehingga DNA yang terisolasi dapat
terlihat dengan jelas.
Hasil pengamatan menunjukkan adanya
benang-benang atau filament DNA dari buah
semangka (Citrullus lunatus), buah pisang (Musa
paradisiaca), buah naga (Hylocereus undatus) dan
buah kiwi (Actinidia deliciosa) yang telah terisolasi
dan mengendap melayang-layang pada bagian atas
larutan dalam tabung reaksi.
Molekul AND dari sel-sel dengan nukleus
sejati mempuyai bentuk sebagai benang lurus dan
tak bercabang, sedangkan pada sel-sel tanpa nukleus
sejati, mitokondria dan plastid molekul AND
berbentuk lingkaran. Ukuran molekul AND
berbeda-beda dari satu spesies ke spesies lainnya.
Pada mitokondria, molekul AND tunggal pada sel
bakteri berukuran 1,4 mm. Dalam sel-sel yang
berinti sejati, beberapa orang peneliti menemukan
molekul AND dari berbagai ukuran, yaitu 50-60 u,
500 u dan 1,6-1,8 mm (Suryo, 2012).
5. KESIMPULAN
Isolasi DNA adalah proses pengeluaran DNA
dari tempatnya berada (ekstraksi atau llisis biasanya
dilakukan dengan homogenasi dan penambahan
ekstraksi atau lisis untuk mencegah DNA rusak.
Cara ekstraksi DNA dapat dilakukan dengan metode
sederhana menggunakan NaCl, deterjen, dan etanol
hingga terlihat presipitasi DNA pada praktikum
yang dilakukan. Bentuk benang adalah bentuk DNA
yang terlihat pada buah pisang. Hasil pengamatan
menunjukkan adanya benang-benang atau filament
DNA dari Buah Semangka (Citrullus lunatus), Buah
Pisang (Musa paradisiaca), Buah Naga (Hylocereus
undatus) dan Buah Kiwi (Actinidia deliciosa) yang
telah terisolasi dan mengendap melayang-layang
pada bagian atas larutan dalam tabung reaksi.
6. REFERENSI
Elrod .S, Stainsflied .W. 2002. Genetika Edisi
Keempat. Penerbit Erlangga.
Ferniah, Rejeki Siti. Sri Pujiyanto. 2013. Optimasi
Isolasi DNA Cabai (Capsicum annuum L.)
Berdasarkan Perbedaan Kualitas dan Kuantita
Daun serta Teknik Penggerusan. Jurnal
Bioma. Vol. 156 No.1
Gusrina. 2012. Genetika dan Reproduksi Ikan.
Yogyakarta : Deep Publisher.
Hartati, Ferry. I. 2017. Modul Genetika Berbasis
Pendekatan Saintifik. Penerbit Jurusan
Biologi FMIPA UNM.
Hutami, Rosy, dkk. 2018. Ekstraksi DNA dari
Daging Segar untuk Analisis dengan Metode
Loop-Mediated Isothermal Amplification
(LAMP) DNA Extraction from Raw Meat for
Analysis with the Loop-MediatedIsothermal
Amplification (LAMP) Method. Jurnal
Agriindustri Halal. 4 (2).
Kirsman, N., Rerenstradika., Habib., Puji Lestari.
2016. Metode Ekstraksi DNA Tanaman Jarak
tanpa Menggunakan Nitrogen Cair. Jurnal
Littri. 22 (4)
Mekonnen, Tilahun. Krishnamurthy Sathelly.
Manju Sharma. Kassahun Tesfaye. Tanushri
kaul. 2017. Genomic DNA Isolation From
Fresh Wheat Leaf Samples Without Liquid
Nitrogen. Journal of Biotechnology. Vol. 16
Vol.20.
Morihito .R, Chungdinata .S, Nazareth .T,
Pulukadang .M, Makalew .R, Pinontoan .B.
2017. Identifikasi Perubahan Struktur DNA
Terhadap Pembentukan Sel Kanker
Menggunakan Dekomposisi Graf. Jurnal
Ilmiah Sains. Vol. 17 No. 2
Mukarami, Kazuo. 2012. Misteri DNA .Jakarta:
Penerbit Gramedia Pustaka Utama.
Puspitaningrum, Rini, Chris Adhiyanto dan Solihin.
2018. Genetika Molekuler dan aplikasinya.
Yogyakarta : Deepublish.
Nugroho, Kristianto, Rerenstradika Terryana dan
Puji Lestari. 2017. Metode Ekstraksi DNA
Cabai (Capsicum amnuum L.) Menggunakan
Modifikasi Bufer CTAB (Cethyl Trimethy
Ammonium Bromide) Tanpa Nitrogen Cair.
Scripta Biologica. 4 (2).
Reflinur, Lestari Puji. 2015. Penentuan Lokus Gen
Dalam Kromosom Tanaman Dengan Bantuan
 Marka DNA. Jurnal Litbang Pert. Vol. 34
No. 4
Sourber, Laure, dkk. 2017. A comparison of Cell-
Free DNA Isolation Kits Isolation and
Quantification of Cell-Free DNA in Plasma.
The Journal of Molecular Diagnostics. 19
(1).
Suryo. 2012. Genetika untuk Strata 1. Yogyakarta:
Gadjah Mada University Press.
Syafaruddin, Randriani .E, Santoso T. J. 2011.
Efektivitas dan Efisiensi Teknik Isolasi dan
Purifikasi Dnapada Jambu Mete. Jurnal
Buletin RISTRI. Vol.2 No.2