METALOENZIM DALAM SIKLUS

NITROGEN DI ALAM
ANDI EKA KARTIKA
H311 13 305

JAHKWHK
JAHKWHK
PENDAHULUAN

cabang ilmu kimia yang mempelajari tentang spesi-spesi logam yang

membentuk senyawa anorganik dan memiliki fungsi tertentu di dalam
tubuh makhluk hidup. Ada banyak sekali reaksi-reaksi kimia yang
melibatkan ion logam pada sistem biologis makhluk hidup.

Bioanorganik

Studi tentang bionaorganik telah memberikan pengetahuan tentang

fungsi dan bagaimana logam Fe bekerja pada Hemoglobin (Hb), logam
Mg pada Klorofil. Selain itu, logam Mo dan Fe juga dapa membentuk
kompleks dengan enzim nitrogenase dalam siklus N 2 di alam.
suatu

Nitrogen
(N2)

senyawa

yang

inert,

semua

organisme

termasuk

manusia

sangat

membutuhkan unsur N. Fiksasi N2 oleh Azotobacter vinelandii adalah proses

biokimia melalui reaksi enzimatis yang melibatkan nitrogenase sebagai enzim.
Nitrogenase adalah enzim yang molekulnya amat kompleks, terdiri dari dua
komponen.

Komponen

hanya

mengandung

unsur

Fe

dan

komponen

II

mengandung Fe dan Mo. Kompleks enzim-logam inilah yang kemudian disebut

metaloenzim yang akan dipelajari.

JAHKWHK
JAHKWHK
PENDAHULUAN

SIKLUS NITROGEN
Nitrogen
(N2)

elemen yang sangat esensial, menyusun bermacammacam persenyawaan penting, baik organik maupun
anorganik menempati porsi 1-2 % dari berat kering
tanaman.
Ketersediaan nitrogen di alam berada dalam
beberapa bentuk persenyawaan, yaitu berupa : N2 (78
% volume udara), N2O, NO, NO2, NO3 dan NH4+
Nitrogen dibutuhkan oleh seluruh organisme untuk
sintesis protein, asam-asam nukleat, dan senyawasenyawa nitrogen lainnya. Untuk proses asimilasi oleh
tumbuhan, nitrogen harus difiksasi yang diambil dan
digabungkan menjadi senyawa-senyawa organik.

JAHKWHK
SIKLUSJAHKWHK
NITROGEN

Protein, asam nukleat, basa purin,

pirimidin, dan asam amino
(glukosamin dan galaktosamin)
merupakan senyawa nitrogen
oraganik yang berasal dari sisa
tanaman atau hewan.

JAHKWHK
SIKLUSJAHKWHK
NITROGEN

Nitrogen berada di alam dalam berbagai bentuk dan keadaan dinamis

mengikuti perubahan fisik dan kimia dalam suatu daur nitrogen.
Sejumlah besar nitrogen dalam atmosfer, namun sukar bagi tumbuhan
untuk memperoleh atom N dari N2dalam bentuk yang dapat digunakan.
Meskipun N2 masuk kedalam sel-sel daun bersama CO2melalaui
stomata, N2 keluar dari sel-sel daun secepat mungkin.
Nitrogen tersedia bagi tumbuhan hanya dalam bentuk dua mineral,
yaitu NH4(amonium) dan NO3-(nitrat).
Sebagian besar N2yang masuk tubuh tumbuhan telah mengalami fiksasi
(reduksi) oleh mikroba prokariotik atau dalam bentuk NH4dan NO3
dalam air hujan atau aktifitas gunung berapi dan pembakaran fosil.

JAHKWHK
SIKLUSJAHKWHK
NITROGEN

Ada tiga proses

biologi dalam siklus
alami nitrogen:
fiksasi, nitrifikasi
dan denitrifikasi,
yang melibatkan
BAKTERI fiksasi
nitrogen, nitrifikasi
dan denitrifikasi.

ENZIM

JAHKWHK
JAHKWHK
NITROGENASE

Perubahan nitrogen organik menjadi NH4oleh mikroba tanah disebut

amonifikasi atau fiksasi

NH4dioksidasi lebih lanjut oleh bakteri menjadi NO3-yang disebut

nitrifikasi.
Sedangkan proses terbentuknya N2, NO, N2O, dan NO2dari NO3 oleh
bakteri anaerob adalah denitrifikasi.

JAHKWHK

ENZIM
SIKLUS
NITROGENASE
NITROGEN
Perubahan nitrogen organik menjadi NH4+oleh mikroba tanah disebut
amonifikasi atau fiksasi

dikatalisis oleh suatu kompleks enzim, yaitu sistem nitrogenase,

yang aktivitasnya masih belum dipahami sepenuhnya.

Enzim Nitrogenase

1
dinitrogen

reduktase

memiliki molekul protein Fe

2
yang

dinitrogenase
molekul

protein

dengan O2.

yang
Mo-Fe

memiliki
sensitif

ENZIM

JAHKWHK
JAHKWHK
NITROGENASE

Nitrogenase disusun oleh dua komponen yang saling menunjang yaitu protein Fe
(komponen I) dan protein Mo-Fe (komponen II).

Protein Fe mempunyai dua sub-unit serupa

berukuran masing-masing 30 sampai
dengan
72
kDa,
tergantung
pada
organisma. Setiap subunit berisi satu
kluster besi-belerang (4 Fe dan 4 S2) yang
turut ambil bagian dalam reaksi redox
terlibat dalam konversi N2 menjadi NH3.

Protein MoFe mempunyai empat subunit, dengan masa total satu molekul
sekitar 180 sampai dengan 235 kDa,
tergantung pada spesies organisme.
Setiap subunit mempunyai dua kluster
MoFeS

ENZIM

JAHKWHK
JAHKWHK
NITROGENASE

Nitrogenase merupakan enzim yang digunakan oleh mikroorganisme untuk

mengkatalisis pemecahan ikatan rangkap tiga pada senyawa nitrogen dan
berperan untuk mengikat 3 atom hidrogen ke nitrogen sehingga menghasilkan
senyawa amonia.
Mikroorganisme yang menambat N2, menggunakan enzim nitrogenase sebagai
pengikat N bebas sehingga bakteri ini

mempunyai pengaruh terhadap sifat

fisik dan kimia tanah dalam meningkatkan kesuburan tanah

KOMPLEKS SENYAWA
NITROGENASE
DAN PERANANYA
ENZIM NITROGENASE
protein Fe mengandung 4 atom besi di

Protein Fe-Mo mempunyai 2 atom

kelompok Fe4S4

molibdenum dan 28 atom besi

Baik molibdenum maupun besi menjadi tereduksi dan kemudian dioksidasi saat
nitrogenase menerima elektron dari feredoksin dan mengangkutnya ke N2 untuk
membentuk NH3
Adenosine Triphosphate (ATP) adalah bentuk energi yang diperlukan dalam
proses penambatan N2.
Protein Fe mengangkut elektron ke protein Fe-Mo, disertai dengan hidrolisis ATP
menjadi Adenosine Diphosphate (ADP).
Protein Fe-Mo kemudian menyumbangkan elektron ke N2 , memproduksi
HN = NH . Dalam dua siklus lanjut dari proses ini (elektron masing-masing
membutuhkan disumbangkan oleh ferredoxin) HN = NH direduksi menjadi
H2N - NH2, dan ini pada gilirannya dikurangi menjadi 2NH3

KOMPLEKS SENYAWA
NITROGENASE DAN PERANANYA
Selama proses fiksasi nitrogen secara biologis, gas nitrogen (N2) direduksi menjadi
ammonia (NH3) oleh enzim nitrogenase. Proses tersebut dapat dijelaskan sebagai
berikut:
Protein Fe (nitrogenase reduktase) menerima elektron
dari

feridoksin

(NADPH)

membentuk

protein

Fe

tereduksi.

Protein Fe + 6e

Protein Fe tereduksi

Protein Fe tereduksi bereaksi dengan 12 molekul

MgATP

membentuk

suatu

kompleks

protein

Fe

tereduksi-MgATP (kompleks RFP-MA1) Dalam hal ini

ion Mg akan mengaktifkan protein Fe.
2+

Protein Fe tereduksi + 12MgATP

Kompleks RFP-MA

KOMPLEKS SENYAWA
NITROGENASE DAN PERANANYA
Protein Fe-Mo (nitrogenase) bereaksi dengan satu
molekul

N2

membentuk

kompleks

nitrogen

nitrogenase (NNC2)
Nitrogenase + N2

Kompleks nitrogen nitrogenase

Dengan adanya ion Na+, kompleks RFP-MA akan

mengikat

kompleks

nitrogen

nitrogenase

membentuk kompleks nitrogenase aktif. Elektronelektron pada kompleks RFP-MA ditransfer ke dalam
nitrogenase untuk mereduksi nitrogen. Selama
proses transfer elektron ini, dua molekul ion H+
direduksi menjadi H2.
Kompleks RFP-MA + NNC

Kompleks nitrogenase

KOMPLEKS SENYAWA
NITROGENASE DAN PERANANYA
Nitrogenase tereduksi dalam kompleks nitrogenase menerima enam molekul ion
H+ dari sitoplasma dan mereduksi N2 menjadi ammonia dengan menggunakan
enam elektron. Elektron-elektron yang ada pada atom Fe dari nitrogenase
digunakan untuk tujuan ini. Reduksi nitrogen melalui tiga tahap:

Tahap pertama, nitrogen bereaksi dengan 2H+ menggunakan dua

elektron menghasilkan diamida. NN + 2H+

HN=NH

Tahap kedua, diamida bereaksi dengan 2H+ menggunakan dua elektron

menghasilkan hidrazin. HN=NH + 2H+

H2N-NH2

Tahap ketiga, hidrazin bereaksi dengan 2H+ menggunakan dua elektron

menghasilkan dua molekul ammonia.
H2N-NH2 + 2H+

2NH3

KOMPLEKS SENYAWA
NITROGENASE DAN PERANANYA
Setelah reduksi N2 menjadi NH3,
kompleks

nitrogenase

terurai

menjadi protein Fe, nitrogenase,

Mg2+, dan ADP. Begitu juga dengan
NH3 yang dihasilkan, dilepaskan ke
dalam

sitoplasma.

Dengan

demikian enzim nitrogenase dapat

mereduksi

kembali

molekul

nitrogen yang lain (NIIR Board,

2004).
oleh

Reaksi

reduksi

nitrogenase

nitrogen
menjadi

ammonia dapat dituliskan sebagai

berikut:
N2 + 8H+ + 8e- + 16MgATP

2NH3 + H2 + 16MgADP + 16Pi.

KOMPLEKS SENYAWA
NITROGENASE DAN PERANANYA

Reaksi katalisis oleh enzim nitrogenase membutuhkan energi dalam bentuk ATP
dan reduktan. Kebutuhan ATP dan reduktan dipenuhi dari hasil fotosintesis yang
ditranslokasikan

dari

daun

ke

bintil

akar.

Pasangan

enzim

nitrogenase

menghidrolisis ATP menjadi ADP dengan memindahkan elektron darireduktan

untuk mereduksi N2 menjadi NH3

KESIMPULAN
1. Nitrogenase adalah enzim yang dapat mereduksi gas nitrogendi udara
menjadi amoniaEnzimnitrogenasedimiliki oleh bakteri penambat nitrogen.
2. Enzim nitrogenase disusun oleh dua komponen yang saling menunjang
yaitu protein Fe (komponen I) dan protein Mo-Fe (komponen II).
3. Pada metabolisme tumbuhan akan mengalami fiksasi nitrogen dimana
suatu tahapan yang sangat penting dalam siklus nitrogen, sehingga
menghasilkan nitrogen yang dapat digunakan sebagai nutrisi tumbuhan.

SEKIAN DAN
TERIMA KASIH