Oleh : Muhammad Arif M. S.

Pi

GENETIKA
BAKTERI
(MATERI GENETIK)

GENOM
KROMOSOM KROMOSOM
GEN
D N A

D N A

GEN
D N A

GEN
D N A

GEN
D N A

D N A

keragaman ......................... biodiversity

kemiripan .......................... similarity
kekhasan ............................. speciality
PENGONTROL ???

Unit-unit hereditas yang diwariskan dari generasi ke

generasi disebut GEN.
Gen-gen tersebut berada di dalam suatu molekul panjang yang disebut dengan asam deoksiribonukleat
(deoxyribose nucleic acid) atau populer disebut DNA
Setiap gen menempati posisi yang spesifik di
kromosom yang disebut lokus.

materi genetik ada di

mana ???
(> 99%)

(<1%)

kromosom

struktur dan dimensi materi

genetik ?

organisasi materi
genetik .......
...................... genom

gen 1, 2, 3, 4, ....., n
(total genom ikan 50.000 gen)

500-1500 pasang basa

......................
kromosom

...................... gen

...................... DNA

Struktur kromosom
Kromosom berbentuk seperti untaian yang
mengandung unit pewarisan sifat yang
disebut DNA. Kromosom memiliki bagian
sentral yang disebut dengan sentromer dan
lengan kromosom yang disebut dengan
kromatid. Kromatid memiliki diameter
kurang lebih 600 nm yang terdiri atas serat
kromatid berdiameter 30 nm dan nukleosom
berdiameter 10 nm. Selain itu kromosom
terdapat protein histon dan DNA

Berdasarkan posisi sentromernya, kromosom digolongkan

kedalam empat macam, yaitu :
Metasentrik adalah sentromer terletak di tengah-tengah
kromosom.
Sub-metasentrik adalah sentromer terletak agar mengarah
ke pinggir kromsom.
Akrosentrik adalah sentromer terletak didekat ujung
kromosom.
Telosentrik adalah sentromer terletak di ujung kromosom

(A) Metasentrik
(D) Telosentrik

(B) Sub-metasentrik (C) Akrosentrik

Struktur DNA dan RNA

Gen disusun oleh suatu substansi yang

disebut dengan deoxyribonucleic acid
(DNA). DNA terdiri atas dua untaian
panjang terpilin yang membentuk heliks
ganda (double helix). Setiap urutan DNA
disusun oleh unit-unit nukleotida yang
teridiri atas
1.Basa nitrogen,
2. Gula dioksiribosa dan
3.Asam fosfat.

Basa
Dua

macam basa
Purin
Adenine
Guanine

A
G

DNA RNA
DNA RNA

C
T

DNA RNA
DNA
U
RNA

Pyrimidines
Cytosine
Thymine
Uracil

Struktur nukleotida
Nukleotida terdiri dari:
Gula pentosa
Yaitu gula dengan 5
karbon
Pada DNA gula ini
adalah deoksiribosa.
Pada RNA gula
berupa gula ribosa.

 Sebuah

group fosfat
Fosfat ini
menghubungkan gula
pada satu nukleotida ke
fosfat pada nukleotida
berikutnya untuk
membentuk
polinukleotida

Basa nitrogen

DNA :

Timin (T)
Adenine (A)
Sitosin (C)
Guanin (G)

RNA :

Urasil (U)
Adenin (A)
Sitosin (C)
Guanin (G)

Pasangan basa

Karena ada 4 jenis basa Ada 4 jenis

Nukleotida dari DNA
Antar Nukleotida yg menjadi Polinukleotida DNA
dihubungkan dgn ikatan Fosfodiester setiap
gugusan P menghubungkan atom C no.3 dari
deoksiribose sebuah nukleotida dengn atom C no.5
dari deoksiribose nukleotida berikutnya dst, dgn
gugusan P terletak di luar rantai (Gambar).

Ikatan-ikatan lemah, yg dikenal dengan Ikatan

Hidrogen, menghubungkan basa dari satu rantai dgn
basa dari rantai yg lain.

Perbedaan DNA dan RNA

Karakteristik

DNA

RNA

Untai

Ganda

Tunggal

Gula

Deoksiribosa Ribosa

Basa

Timin

Urasil

REPLIKASI DNA

Replikasi DNA pada cetakan 3

5 terjadi seutas demi seutas
dengan arah 5 3.
Utas-utas
pendek
tersebut
dihubungkan oleh enzim ligase
DNA.

RNA & SINTESA PROTEIN

TRANSKRIPSI

DNA

TRANSLASI

RNA

PROTEIN

TRANSKRIPSI : sintesa mRNA dng menggunakan bagian tertentu

dari DNA sebagai cetakan
A
T
G
C
A
T
Template DNA mRNA

U
A
C
G
U
A

Hanya 1 untai DNA yg bertindak sebagai template SENSE STRAND

Untai DNA pasangannya ANTI SENSE STRAND
Enzim yg berperan : RNA-polymerase
Titik Awal Transkripsi Promoter Site
Titik Akhir Transkripsi Terminator Site

PROSES TRANSKRIPSI

TRANSLASI
Proses menggunakan informasi urutan nirogenous base dari mRNA untuk menyusun
asam amino suatu protein

mRNA berhubungan dng RIBOSOME (terdiri atas rRNA & protein)

Asam amino tertentu melekat pada tRNA
Pada bag tertentu dari tRNA tdp 3 nukleotida ANTICODON
Segmen 3 nukleotida pada mRNA CODON
Ribosome bergerak sepanjang rantai mRNA, setiap kali asam-asam amino berikatan
membentuk polypeptides
Bila beberapa ribosome melekat pada satu rantai mRNA disebut
POLYRIBOSOMES

KODE GENETIK

Codon mRNA dan Asam Amino yang disandinya

Terdapat kemungkinan 64 codons, tetapi Asam Amino hanya 20
1 Asam Amino bisa disandi oleh beberapa codons
keadaan ini disebut : DEGENERACY OF THE CODE
61 mrpk SENSE CODONS menyandi Asam Amino
3 mrpk NONSENSE CODONS mengakhiri sintesa protein
(TERMINATOR CODONS) :
UAA, UAG, UGA
INITIATOR CODON AUG utk Methionine memulai sintesa
protein

GENETIC CODES

BEBERAPA ISTILAH
GENOM

seluruh gen yg tdp dlm suatu organisme

GENOTYPE

komposisi genetik suatu organisme

gen normal/mutasi membawa sifat ttt

PHENOTYPE

ekspresi gen sifat morfologi/biokimia

yg dpt dilihat

PROTOTROPH

strain bakteri normal yg baru diisolir

AUXOTROPH

strain yang mengalami mutasi

Ukuran Genom
Genom

E. Coli berukuran sebesar 4.6

Mb(4.600kbp), sedangkan genom prokariot
umumnya berukuran antara 5- 10 Mb.
Ukuran genom merupakan ciri spesifik
spesies.

MUTASI DAN REKOMBINASI

Mutasi

= Perubahan basa nukleotida pada

genom yang dapat diwariskan dan dapat
berakibat baik atau buruk pada organisme
yang bersangkutan., . Perubahan yang
terjadi adalah akibat adanya rekombinasi
genetika.

MUTASI DAN MUTAN

Mutan

adalah Galur yang menunjukkan adanya

perubahan, yang mempunyai perbedaan genotip
atau sekuen nukleotida genom, dengan galur
induk.
Contoh : Gen his C Escherichia coli
menyandikan protein HisC yang terlibat dalam
biosintesis asam amino histidin.
( Mutan His C : HisC1, HisC2 kode His menyebabkan galur tidak mampu mensintesis
histidin)

MUTASI BAKTERI
Perubahan pada gen morfologi/biokimia
Melindungi thd seleksi alam
Dapat terjadi secara spontan
Dapat diturunkan ke generasi berikutnya
Dapat kembali ke bentuk semula BACK MUTATION
KECEPATAN MUTASI relatif konstan
dalam 1 generation time
Rumus : a =

a
M
N0
N1

M
N1 N 0

: kecepatan mutasi
: jumlah mutasi
: jml sel mula-mula
: jml sel setelah doubling

MORPHOLOGIC MUTANTS
Normal bakteria
Agar plate + mutagen
Observasi koloni bakteri yang tumbuh
Bandingkan dengan koloni kuman normal
MUTASI dapat dipercepat 10 100 x dng bahan MUTAGEN
Fisis sinar x, sinar uv, sinar ,
Kemis nitrat, acridine, N-mustard

AKIBAT MUTASI
Mutant strain memiliki daya resistensi
Misalnya terhadap : - antibiotika ,UV light, Bacteriophage
Dapat juga terjadi DRUG DEPENDENCE, mis. thd
sulfa(sulfaquinoxalin)
Bakteri kebal dpt mensintesa PABA
(para amino benzoic acid)
dlm jumlah banyak

PEMINDAHAN MATERI GENETIK

HARUS ADA SEL DONOR & SEL RESIPIEN

MACAM :
1.TRANSFORMATION (transformasi)
2.TRANSDUCTION ( Transduksi)
3. CONJUGATION ( Konjugasi)

Rekombinasi genetik pemindahan secara langsung

bahan genetik (DNA) di antara dua sel bakteri melalui
proses berikut:
1. Transformasi perpindahan materi genetik berupa
DNA dari sel bakteri yang satu ke sel bakteri yang
lain.
2. Transduksi pemindahan materi genetik bakteri ke
bakteri lain dengan perantaraan virus.
3. Konjugasi transfer DNA (berupa plasmid) karena
adanya kontak sel dengan membentuk jembatan
untuk pemindahan materi genetik.

TRANSFORMASI

- Kali pertama diamati oleh Frederick Griffith (1928)

pada bakteri Streptococcus pneumoniae
- Sel Donor lisis mengeluarkan DNA
- Sel Resipien mengambil DNA terlarut yang
dilepaskan
oleh sel Donor

Percobaan Griffith

TRANSFORMATION

TRANSDUCTION

Pemindahan materi genetik dari suatu bakteri ke bakteri yang

lain dengan perantara bacteriophage (virus)

1. Generalized Transduction
2. Restricted Transduction

TRANSDUCTION

CONJUGATION

Pada proses ini perlu kontak antara 2 sel SEX PILI

Sel donor adalah F+, sel resipen FF+ ( F factor ) merupakan Plasmid dapat ditransfer
Jika F factor integrasi ke dlm khromosom HFr
( High Frequency of Recombination)

Konjugasi

Pili sex

PLASMID

Plasmid adalah molekul DNA sirkuler yang terpisah dari

DNA kromosomal dan bisa membelah sendiri. Ini
berbentuk melingkar and double-stranded.

Ukuran dari plasmid beragam dari 1 sampai lebih dari 250

kb, sehingga hanya sebagian kecil dari plasmid alami yang
dapat bermanfaat sebagai vektor kloning

Plasmid terdiri dari plasmid F untuk konjugasi, plasmid R

untuk memberikan sifat resisten terhadap antibiotik, col
plasmid, plasmid virulensi dan plasmid degradatif.

Plasmid

Terimakasih.......Selamat Belajar