Anda di halaman 1dari 55

2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:06 Halaman S-183 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:

Machine Translated by Google

bab

Siklus Asam Sitrat 16


1. Neraca Siklus Asam Sitrat Siklus asam sitrat memiliki delapan enzim: sitrat sintase, akonitase, isositrat
dehidrogenase, a-ketoglutarat dehidrogenase, suksinil-CoA sintetase, suksinat dehidrogenase, fumarase, dan
malat dehidrogenase. (a) Tuliskan persamaan setimbang untuk
reaksi yang dikatalis oleh masing-masing enzim. (b) Sebutkan kofaktor yang
dibutuhkan oleh setiap reaksi enzim. (c) Untuk setiap enzim, tentukan
yang mana dari berikut ini yang menjelaskan jenis reaksi yang dikatalisis:
kondensasi (pembentukan ikatan karbon-karbon); dehidrasi (kehilangan air); hidrasi (penambahan air);
dekarboksilasi (kehilangan CO2); oksidasi-reduksi; fosforilasi tingkat substrat; isomerisasi.

(d) Tulislah persamaan bersih seimbang untuk katabolisme asetil-KoA menjadi CO2.

Menjawab

Sitrat sintase (a)


Asetil-KoA oksaloasetat H2O 88n sitrat KoA (b) KoA (c) Kondensasi

Aconitase
(a) Sitrat 88n isositrat (b)
Tidak ada kofaktor
(c) Isomerisasi

Isocitrate dehydrogenase (a)


Isocitrate NAD 88n a-ketoglutarate CO2 NADH (b) NAD (c)

Dekarboksilasi oksidatif

a-Ketoglutarate dehydrogenase (a)


a-Ketoglutarate NAD CoA 88n succinyl-CoA CO2 NADH (b) NAD, CoA, tiamina
pirofosfat (c) Dekarboksilasi oksidatif

Suksinil-KoA sintetase (a)


Suksinil-KoA Pi PDB 88n suksinat KoA GTP (b) KoA (c) Fosforilasi
tingkat
substrat dan transfer asil

S-183
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:06 Halaman S-184 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

S-184 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

Suksinat dehidrogenase (a)


Suksinat FAD 88n fumarat FADH2 (b) FAD (c)
Oksidasi

Fumarase
(a) Fumarat H2O 88n malat (b) Tidak
ada kofaktor (c)
Hidrasi
Malat dehidrogenase (a)
Malat NAD 88n oksaloasetat NADH H (b) NAD (c)
Oksidasi
(d) Persamaan
bersih untuk katabolisme asetil-KoA adalah
Asetil-CoA 3NAD FAD PDB Pi 2H2O 88n
2CO2 CoA 3NADH FADH2 GTP 2H

2. Persamaan Bersih Glikolisis dan Siklus Asam Sitrat Tuliskan persamaan bersih biokimia untuk
metabolisme molekul glukosa melalui glikolisis dan siklus asam sitrat, termasuk semua kofaktor.

Menjawab

Glikolisis:
Glukosa 2ADP 2Pi 2NAD 88n 2ATP 2NADH 2 piruvat
Piruvat dehidrogenase:
2 Piruvat 2NAD 2CoASH 88n 2 asetil-KoA 2CO2 2NADH
Siklus asam sitrat:
2 Asetil-KoA 2FAD 6NAD 2ADP 2Pi 88n
2CoASH 2FADH2 6NADH 2ATP 4CO2
Keseluruhan:

Glukosa 4ADP 4Pi 10NAD 2FAD 88n 4ATP 10NADH 2FADH2 6CO2

3. Mengenali Reaksi Oksidasi dan Reduksi Salah satu strategi biokimia banyak makhluk hidup
organisme adalah oksidasi bertahap senyawa organik menjadi CO2 dan H2O dan konservasi sebagian
besar energi yang dihasilkan dalam bentuk ATP. Penting untuk dapat mengenali proses oksidasi-
reduksi dalam metabolisme. Reduksi molekul organik dihasilkan dari hidrogenasi ikatan rangkap
(Persamaan 1, di bawah) atau ikatan tunggal dengan pembelahan yang menyertainya (Persamaan 2).
Sebaliknya, oksidasi dihasilkan dari dehidrogenasi. Dalam reaksi redoks biokimia, koenzim NAD dan FAD
mendehidrogenat/hidrogenat molekul organik dengan adanya enzim yang tepat.

HAI HAI H OH
pengurangan pengurangan
CH3 C H H H CH3 C H CH3 C H (1)
oksidasi oksidasi
H H
Asetaldehida Etanol

HAI HAI HAI


H
pengurangan pengurangan
CH3 C H H H CH3 C CH3 C H HAI (2)
oksidasi oksidasi
HAI HAI
H H
H
Asetat H Asetaldehida
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:06 Halaman S-185 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

Bab 16 Siklus Asam Sitrat S-185

Untuk setiap transformasi metabolik pada (a) sampai (h), tentukan apakah telah terjadi oksidasi atau reduksi. Seimbangkan
setiap transformasi dengan memasukkan HOH dan, bila perlu, H2O.

HAI H
HAI

(A) CH3 OH H C H (F ) C H C H
Metanol Formaldehida HAI
H
HAI HAI Toluena Benzoat

(B) CH H H C H HAI

HAI
HAI HAI
H C
Formaldehida FORMAT
C C C HAI
(G) C CH2 CH2
HAI HAI HAI
HAI C H
HAI
(C) HAI C HAI HC H
Suksinat Fumarat
HAI

Karbon dioksida FORMAT HAI HAI

OH OH OH OH (H) CH3 C CH3 C CO2


HAI HAI
OC HAI
(D) CH2 C C H CH2
HAI

C C
HAI
H HAI
H H
Piruvat Asetat
Gliserat Gliseraldehida

OH OH OH OH O OH

(Dia) CH2 C CH2 CH2 C CH2

Gliserin Dihidroksiaseton

Answer Ingatlah bahwa oksidasi adalah pelepasan elektron dan H yang menyertainya, sedangkan reduksi
adalah perolehan elektron (atau HXH). (a) Oksidasi:
Metanol 88n formaldehida HXH (b) Oksidasi: Formaldehida 88n
format HXH (c) Reduksi: CO2 HXH 88n format H (d) Reduksi:
Gliserat HXH H 88n gliseraldehida H2O (e) Oksidasi:
Gliserol 88n dihidroksiaseton HXH (f ) Oksidasi: Toluena 2H2O 88n benzoat H
3HXH (g) Oksidasi: Suksinat 88n fumarat HXH (h) Oksidasi: Piruvat
H2O 88n asetat CO2 HXH

4. Hubungan antara Pelepasan Energi dan Keadaan Oksidasi Karbon Sel eukariotik
dapat menggunakan glukosa (C6H12O6) dan asam heksanoat (C6H14O2) sebagai bahan bakar untuk respirasi sel.
Berdasarkan rumus strukturnya, zat manakah yang melepaskan lebih banyak energi per gram pada pembakaran sempurna
menjadi CO2 dan H2O?

Answer Dari rumus struktur, kita melihat bahwa rasio H/C yang terikat karbon pada asam heksanoat (11/6)
lebih tinggi daripada rasio glukosa (7/6). Asam heksanoat lebih tereduksi dan menghasilkan lebih banyak
energi setelah pembakaran sempurna menjadi CO2 dan H2O.

5. Koenzim Nikotinamida sebagai Pembawa Redoks Reversibel Koenzim nikotinamid (lihat Gambar 13-24) dapat
menjalani reaksi oksidasi-reduksi reversibel dengan substrat spesifik dengan adanya dehidrogenase yang sesuai.
Dalam reaksi ini, NADHH berfungsi sebagai hidrogen
Machine Translated by Google
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:06 Halaman S-186 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:

S-186 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

sumber, seperti dijelaskan dalam Soal 3. Setiap kali koenzim dioksidasi, substrat harus direduksi secara
bersamaan:

Substrat NADH H y88 88z produk


NAD
Teroksidasi Dikurangi Direduksi Oksidasi

Untuk setiap reaksi dalam (a) sampai (f), tentukan apakah substrat telah teroksidasi atau tereduksi atau
tidak berubah dalam keadaan oksidasi (lihat Soal 3). Jika terjadi perubahan redoks, setarakan reaksi dengan
jumlah NAD, NADH, H, dan H2O yang diperlukan. Tujuannya adalah untuk mengenali kapan koenzim redoks
diperlukan dalam reaksi metabolisme.

HAI

(A) CH3CH2 OH CH3 C


H
Etanol Asetaldehida

OH HAI

(b) 2O3PO CH2 C C


2
H OP3

1,3-Bifosfogliserat

OH
HAI

2
2O3PO CH2 C C HPO4

H H

Gliseraldehida 3-fosfat

HAI HAI HAI

(C) CH3 CC CH3 C CO2


HAI H
Piruvat Asetaldehida

HAI
HAI HAI

(D) CH3 CC CH3 C CO2


HAI HAI

Piruvat Asetat

HAI OH

(Dia) OOC CH2C COO OOC CH2 C MENDEKUT

H
Oksaloasetat Malat

HAI HAI
HAI

(F ) CH3 C CH2 C H CH3 C CH3 CO2


HAI

Acetoacetate Aseton

Jawaban
(a) Teroksidasi: Etanol NAD 88n asetaldehida NADH H (b) Tereduksi:
1,3-Bisfosfogliserat NADH H 88n gliseraldehida 3-fosfat NAD
2
HPO4 (c) Tidak berubah: Piruvat H 88n
asetaldehida CO2 (d) Teroksidasi: Piruvat NAD 88n asetat CO2
NADH H (e) Tereduksi: Oksaloasetat NADH H 88n malat NAD (f) Tidak
berubah: Asetoasetat H 88n aseton CO2
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:06 Halaman S-187 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

Bab 16 Siklus Asam Sitrat S-187

6. Kofaktor dan Mekanisme Piruvat Dehidrogenase Jelaskan peran masing-masing kofaktor yang terlibat dalam reaksi yang
dikatalisis oleh kompleks piruvat dehidrogenase.

Jawab TPP: cincin tiazolium menambah karbon piruvat, kemudian menstabilkan banion mobil yang dihasilkan
dengan bertindak sebagai penyerap elektron. Asam lipoat: mengoksidasi piruvat ke tingkat asetat (asetil KoA),
dan mengaktifkan asetat sebagai tioester. CoA-SH: mengaktifkan asetat sebagai tioester. FAD:
mengoksidasi asam lipoat. NAD: mengoksidasi FAD. (Lihat Gambar 16–6.)

7. Defisiensi Tiamin Individu dengan diet defisiensi tiamin memiliki kadar piruvat yang relatif tinggi dalam darahnya. Jelaskan ini
dalam istilah biokimia.

Answer Tiamin penting untuk pembentukan tiamin pirofosfat (TPP), salah satu kofaktor dalam reaksi piruvat
dehidrogenase. Tanpa TPP, piruvat yang dihasilkan oleh glikolisis terakumulasi dalam sel dan masuk ke dalam
darah.

8. Reaksi Isocitrate Dehydrogenase Apa jenis reaksi kimia yang terlibat dalam konversi
dari isositrat menjadi -ketoglutarat? Sebutkan dan jelaskan peran kofaktor apa saja. Apa reaksi lain dari siklus asam sitrat
yang bertipe sama?

Jawab Dekarboksilasi oksidatif yang melibatkan NADP atau NAD sebagai penerima elektron; Reaksi -ketoglutarat
dehidrogenase juga merupakan dekarboksilasi oksidatif, tetapi mekanismenya berbeda dan melibatkan
kofaktor yang berbeda: TPP, lipoat, FAD, NAD, dan CoA-SH.

9. Stimulasi Konsumsi Oksigen oleh Oksaloasetat dan Malat Pada awal tahun 1930-an, Albert
Szent-Györgyi melaporkan pengamatan menarik bahwa penambahan sejumlah kecil oksaloasetat atau malat ke suspensi
otot dada merpati cincang merangsang konsumsi oksigen dari persiapan. Anehnya, jumlah oksigen yang dikonsumsi sekitar
tujuh kali lebih banyak dari jumlah yang diperlukan untuk oksidasi sempurna (menjadi CO2 dan H2O) dari
oksaloasetat atau malat yang ditambahkan. Mengapa penambahan oksaloasetat atau malat merangsang konsumsi
oksigen? Mengapa jumlah oksigen yang dikonsumsi jauh lebih besar daripada jumlah yang diperlukan untuk mengoksidasi
sempurna oksaloasetat atau malat yang ditambahkan?

Answer Konsumsi oksigen adalah ukuran aktivitas dari dua tahap pertama respirasi sel: glikolisis dan siklus
asam sitrat. Nutrisi awal yang teroksidasi adalah karbohidrat dan lipid. Karena beberapa perantara dari siklus asam
sitrat dapat tersedot ke dalam jalur biosintesis, siklus dapat melambat karena kekurangan oksaloasetat dalam
reaksi sitrat sintase, dan asetil-KoA akan terakumulasi. Penambahan oksaloasetat atau malat (diubah menjadi
oksaloak etat oleh malat dehidrogenase) akan merangsang siklus dan memungkinkan untuk menggunakan
akumulasi asetil-KoA. Ini merangsang pernapasan. Oksaloasetat diregenerasi dalam siklus, jadi penambahan
oksaloasetat (atau malat) merangsang oksidasi asetil-KoA dalam jumlah yang jauh lebih besar.

10. Pembentukan Oksaloasetat dalam Mitokondria Pada reaksi terakhir siklus asam sitrat, malat didehidrogenasi untuk
meregenerasi oksaloasetat yang diperlukan untuk masuknya asetil-KoA ke dalam siklus:

L-Malat NAD 88n oksaloasetat NADH H G 30,0 kJ/mol

(a) Hitung tetapan kesetimbangan untuk reaksi ini pada 25 C. (b) Karena G
mengasumsikan pH standar 7, tetapan kesetimbangan dihitung dalam
(a) sesuai dengan

[oksaloasetat][NADH]
K persamaan

[L-malat][NAD]

Konsentrasi terukur L-malat dalam mitokondria hati tikus adalah sekitar 0,20 mM ketika [NAD]/[NADH]
adalah 10. Hitung konsentrasi oksaloasetat pada pH 7 dalam mitokondria ini.
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:06 Halaman S-188 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

S-188 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

(c) Untuk menghargai besarnya konsentrasi oksaloasetat mitokondria, hitung jumlah molekul oksaloasetat dalam satu
mitokondria hati tikus. Asumsikan mitokondria adalah bola dengan diameter 2,0 mm.

Menjawab

(a) G ln K RT ln K persamaan

persamaan
G/ RT
(30,0 kJ/mol)/(2,48 kJ/mol) 12,1

K persamaan
e12,1 5,6 106

(b) Mengingat itu


K eq ([OAA]eq[NADH]eq)/([malat]eq[NAD]eq)

jika kita memegang nilai [malat], [NADH], dan [NAD] pada nilai yang ada di dalam sel, kita dapat menghitung
berapa [oksaloasetat] yang harus berada pada kesetimbangan untuk memberikan konstanta kesetimbangan
yang dihitung dalam (a) :

[oksaloasetat] K persamaan
[malat][NAD]/[NADH] (5,6
106 )(0,20 mM)(10) 1,1 105 mM
1,1 108 M

Hal ini memprediksi bahwa [oksaloasetat] pada kesetimbangan akan sangat rendah, dan konsentrasi terukur
memang rendah: kurang dari 107 M. (c)
4
Volume bola adalah 103 mm) adalah 3 pr3 , dengan demikian volume mitokondria (r 1.0
(3,14)(1,0 103
4
3
mm)3 4,2 109 mm3 4,2 1015 L

Mengingat konsentrasi oksaloasetat dan bilangan Avogadro, kita dapat menghitung jumlah molekul dalam
mitokondria:

(1,1 108 mol/L)(6,02 1023 molekul/mol)(4,2 1015 L) 28 molekul

11. Kofaktor untuk Siklus Asam Sitrat Misalkan Anda telah menyiapkan ekstrak mitokondria yang mengandung semua
enzim terlarut dari matriks tetapi telah kehilangan (melalui dialisis) semua faktor ko dengan berat molekul rendah. Apa
yang harus ditambahkan ke dalam ekstrak agar sediaan tersebut mengoksidasi asetil-KoA menjadi CO2?

Jawab ADP (atau GDP), Pi , CoA-SH, TPP, NAD; bukan asam lipoat, yang terikat secara kovalen dengan enzim
terisolasi yang menggunakannya (lihat Gambar 16–7).

12. Defisiensi Riboflavin Bagaimana defisiensi riboflavin mempengaruhi fungsi asam sitrat cy
cle? Jelaskan jawabanmu.

Jawaban Nukleotida flavin, FMN dan FAD, tidak akan disintesis. Karena FAD dibutuhkan oleh enzim siklus
asam sitrat suksinat dehidrogenase, defisiensi flavin akan sangat menghambat siklus tersebut.

13. Kumpulan Oksaloasetat Faktor-faktor apa yang dapat menurunkan kumpulan oksaloasetat yang tersedia untuk aktivitas
siklus asam sitrat? Bagaimana kumpulan oksaloasetat dapat diisi ulang?

Answer Oksaloasetat mungkin ditarik untuk sintesis aspartat atau untuk glukoneogenesis. Ox aloacetate diisi
kembali oleh reaksi anaplerotik yang dikatalisis oleh karboksilase PEP, karboksilase PEP, enzim malat, atau
karboksilase piruvat (lihat Gambar 16–15, hal. 632).

14. Hasil Energi dari Siklus Asam Sitrat Reaksi yang dikatalisis oleh suksinil-KoA sintetase
menghasilkan senyawa GTP berenergi tinggi. Bagaimana energi bebas yang terkandung dalam GTP dimasukkan ke
dalam kumpulan ATP seluler?
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:06 Halaman S-189 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

Bab 16 Siklus Asam Sitrat S-189

Answer Gugus fosforil terminal dalam GTP dapat dipindahkan ke ADP dalam reaksi yang dikatalisis oleh
nukleosida difosfat kinase, dengan konstanta kesetimbangan 1,0:

GTP ADP 88n PDB ATP

15. Studi Respirasi pada Mitokondria Terisolasi Respirasi seluler dapat dipelajari pada mitokondria terisolasi dengan mengukur
konsumsi oksigen dalam kondisi yang berbeda. Jika 0,01 M natrium malonat ditambahkan ke mitokondria yang aktif berespirasi
yang menggunakan piruvat sebagai sumber bahan bakar, respirasi segera berhenti dan perantara metabolik terakumulasi. (a)
Bagaimana struktur perantara ini? (b) Jelaskan
mengapa itu terakumulasi. (c) Jelaskan mengapa konsumsi
oksigen berhenti. (d) Selain penghilangan
malonat, bagaimana penghambatan respirasi ini dapat
diatasi? Menjelaskan.

Answer Malonat adalah analog struktur suksinat dan inhibitor kompetitif suksinat dehidrogenase. (a) Suksinat:

OOCOCH2OCH2OCOO (b) Ketika suksinat


dehidrogenase dihambat, suksinat terakumulasi. (c) Penghambatan reaksi apa pun di jalur
menyebabkan substrat reaksi itu terakumulasi terlambat. Karena substrat ini juga merupakan produk dari reaksi
sebelumnya, akumulasinya mengubah G efektif dari reaksi tersebut, dan seterusnya untuk semua langkah
sebelumnya dalam jalur tersebut. Tingkat bersih dari jalur (atau siklus) melambat dan akhirnya menjadi hampir
dapat diabaikan. Dalam kasus siklus asam sitrat, penghentian produksi produk primer, NADH, memiliki efek
penghentian transfer elektron dan konsumsi oksigen, akseptor terakhir elektron yang berasal dari NADH.

(d) Karena malonat merupakan inhibitor kompetitif, penambahan suksinat dalam jumlah besar
akan mengatasi hambatan.

16. Studi Pelabelan pada Mitokondria Terisolasi Jalur metabolisme senyawa organik sering digambarkan dengan menggunakan
substrat berlabel radioaktif dan mengikuti nasib label. (a) Bagaimana Anda dapat menentukan apakah glukosa ditambahkan
ke suspensi mitokondria yang diisolasi
dimetabolisme menjadi CO2 dan H2O?
(b) Misalkan Anda menambahkan pulsa singkat [3-14C] piruvat (diberi label pada posisi metil) ke mito chondria. Setelah satu
putaran siklus asam sitrat, di manakah letak 14C dalam oksaloak etat? Jelaskan dengan menelusuri label 14C melalui
jalur. Berapa putaran siklus yang diperlukan untuk melepaskan semua piruvat [3-14C] sebagai CO2?

Menjawab

(a) Jika Anda menambahkan glukosa berlabel seragam (14C di semua atom karbon), pelepasan CO2 berlabel akan
menunjukkan bahwa glukosa dimetabolisme menjadi CO2 dan H2O. (b) Satu
putaran siklus menghasilkan oksaloasetat dengan label terdistribusi secara merata antara C-2 dan C-3. Rute label
adalah dari C-3 dalam piruvat, ke C-2 dalam asetil-KoA, ke karbon metilena (OCH2O) , C-2 atau C-4 (lihat
Gambar 16–7), dalam intermediet ke suksinat, yang simetris; dari suksinat, labelnya ada di C-2 atau C-3. Putaran
kedua dari siklus melepaskan setengah dari label, dan setiap putaran berikutnya melepaskan setengah dari
yang tersisa, sehingga jumlah putaran yang tak terhingga diperlukan untuk melepaskan semua karbon berlabel.

17. Jalur CO2 dalam Glukoneogenesis Pada langkah pintas pertama glukoneogenesis, konversi piruvat menjadi fosfoenolpiruvat
(PEP), piruvat dikarboksilasi oleh piruvat karboksilase menjadi oksaloak etat, yang selanjutnya didekarboksilasi menjadi PEP
oleh PEP karboksikinase (Bab 14). Karena penambahan CO2 secara langsung diikuti oleh hilangnya CO2, Anda mungkin
berharap bahwa dalam eksperimen perunut, 14C dari 14CO2 tidak akan dimasukkan ke dalam PEP, glukosa, atau perantara apa
pun dalam glukoneogenesis.
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:07 Halaman S-190 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

S-190 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

Namun, para peneliti menemukan bahwa ketika preparat hati mensintesis glukosa dengan adanya 14CO2,
14C perlahan muncul di PEP dan akhirnya di C-3 dan C-4 glukosa. Bagaimana label 14C masuk ke PEP dan
glukosa? (Petunjuk: Selama glukoneogenesis dengan adanya 14CO2, beberapa perantara siklus asam
sitrat berkarbon empat juga diberi label.)

Answer Karena piruvat karboksilase adalah enzim mitokondria, [14C]oksaloasetat (OAA) yang
dibentuk oleh reaksi ini bercampur dengan kumpulan OAA dari siklus asam sitrat. Campuran [1-14C]
dan [4-14C] OAA akhirnya terbentuk dengan pengacakan posisi C-1 dan C-4 dalam konversi
reversibel OAA ÿ malat ÿ suksinat. [1-14C] OAA menyebabkan pembentukan glukosa [3,4-14C].

18. Katabolisme Glukosa [1-14C] Kultur bakteri yang aktif bernapas diinkubasi sebentar dengan glukosa [1-14C] ,
dan intermediet siklus asam glikolitik dan asam sitrat diisolasi. Di manakah 14C di setiap zat antara yang
tercantum di bawah ini? Pertimbangkan hanya penggabungan awal 14C, pada lintasan pertama glukosa
berlabel melalui jalur. (a) Fruktosa 1,6-
bifosfat (b) Gliseraldehida 3-fosfat
(c) Fosfoenolpiruvat (d) Asetil-KoA
(e) Sitrat (f) a-Ketoglutarat
(g) Oksaloasetat

Jawaban Gambar 14–2, 14–6, dan 16–7 dan Kotak 16–3 menguraikan nasib semua atom karbon
glukosa. Dalam satu lintasan melalui jalur, label muncul di: (a) C-1 (b)
C-3 (c)
C-3 (d)
C-2
(gugus metil) (e) C-2 (lihat
Kotak 16 –3) (f) C-4 (g)

Terdistribusi secara merata di C-2 dan C-3

19. Peran Vitamin Tiamin Orang dengan beri-beri, penyakit yang disebabkan oleh kekurangan tiamin, mengalami
peningkatan kadar piruvat darah dan a-ketoglutarat, terutama setelah mengonsumsi makanan yang kaya
akan glukosa. Bagaimana efek ini berhubungan dengan defisiensi tiamin?

Answer Tiamin diperlukan untuk sintesis thiamin pyrophosphate (TPP), sebuah gugus prostetik dalam
kompleks piruvat dehidrogenase dan a-ketoglutarat dehidrogenase. Defisiensi tiamin mengurangi
aktivitas kompleks enzim ini dan menyebabkan akumulasi prekursor yang teramati.

20. Sintesis Oksaloasetat melalui Siklus Asam Sitrat Oksaloasetat dibentuk pada langkah terakhir siklus asam
sitrat melalui oksidasi L-malat yang bergantung pada NAD. Dapatkah sintesis bersih oksaloasetat dari asetil-
KoA terjadi hanya dengan menggunakan enzim dan kofaktor siklus asam sitrat, tanpa menghabiskan intermediet
siklus? Menjelaskan. Bagaimana oksaloasetat yang hilang dari siklus (untuk reaksi biosintetik) diisi kembali?

Jawab Dalam siklus asam sitrat, asetil-KoA yang masuk bergabung dengan oksaloasetat untuk
membentuk sitrat. Satu putaran siklus meregenerasi oksaloasetat dan menghasilkan dua molekul CO2.
Tidak ada sintesis bersih oksaloasetat dalam siklus. Jika ada intermediet siklus yang disalurkan ke
dalam reaksi biosintetik, penambahan oksaloasetat sangat penting. Empat enzim bisa
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:07 Halaman S-191 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

Bab 16 Siklus Asam Sitrat S-191

menghasilkan oksaloasetat (atau malat) dari piruvat atau fosfoenolpiruvat. Piruvat karboksilase (hati, ginjal) dan PEP
karboksilase (jantung, otot rangka) adalah yang paling penting pada hewan, dan PEP karboksilase paling penting
pada tumbuhan, ragi dan bakteri. Enzim malat menghasilkan malat dari piruvat pada banyak organisme (lihat Tabel
16-2).

21. Penipisan Oksaloasetat Hati mamalia dapat melakukan glukoneogenesis dengan menggunakan oksaloasetat sebagai bahan
awal (Bab 14). Akankah pengoperasian siklus asam sitrat dipengaruhi oleh penggunaan ekstensif oksaloasetat untuk
glukoneogenesis? Jelaskan jawabanmu.

Menipisnya oksaloasetat akan cenderung menghambat siklus asam sitrat. Oksaloasetat hadir pada konsentrasi
yang relatif rendah di mitokondria, dan menghilangkannya untuk glukoneogenesis akan cenderung menggeser
kesetimbangan reaksi sitrat sintase menuju oksaloasetat.
Namun, reaksi anaplerotik (lihat Gambar 16-15) melawan efek ini dengan mengganti oksaloasetat.

22. Cara Aksi Rodentisida Fluoroacetate Fluoroacetate, disiapkan secara komersial untuk pengendalian hewan pengerat, juga
diproduksi oleh tanaman Afrika Selatan. Setelah memasuki sel, fluoroacetate diubah menjadi fluoroacetyl-CoA dalam
reaksi yang dikatalisis oleh enzim asetat thiokinase:

F CH2COO KoA-SH ATP F CH2C S-CoA AMP PPi


HAI

Efek toksik fluoroasetat dipelajari dalam percobaan menggunakan jantung tikus yang diisolasi utuh. Setelah jantung dialiri dengan
0,22 mM fluoroacetate, tingkat penyerapan glukosa dan glikolisis yang diukur menurun, dan glukosa 6-fosfat dan fruktosa 6-fosfat
terakumulasi. Pemeriksaan intermediet siklus asam sitrat mengungkapkan bahwa konsentrasinya di bawah normal, kecuali sitrat,
dengan konsentrasi 10 kali lebih tinggi dari normal. (a) Di manakah blok dalam siklus asam sitrat terjadi? Apa yang menyebabkan
sitrat menumpuk dan

perantara siklus lainnya akan habis?


(b) Fluoroacetyl-CoA ditransformasikan secara enzimatis dalam siklus asam sitrat. Apa struktur dari
produk akhir dari metabolisme fluoroasetat? Mengapa itu memblokir siklus asam sitrat? Bagaimana hambatan itu dapat
diatasi?

(c) Dalam percobaan perfusi jantung, mengapa pengambilan glukosa dan glikolisis menurun? Mengapa heksosa monofosfat
terakumulasi?
(d) Mengapa keracunan fluoroasetat berakibat fatal?

Menjawab

(a) Blok terjadi pada reaksi aconitase, yang biasanya mengubah sitrat menjadi isositrat. (b) Fluoroacetate, analog
asetat, dapat diaktifkan menjadi fluoroacetyl-CoA, yang mengandung
padat dengan oksaloasetat untuk membentuk fluorositrat—produk akhir dari metabolisme fluoroasetat.
Fluorocitrate adalah analog struktural sitrat dan penghambat kompetitif aconitase yang kuat. Penghambatan
dapat diatasi dengan penambahan sitrat dalam jumlah besar. (c) Sitrat dan fluorositrat adalah
penghambat alosterik fosfofruktokinase-1, dan dengan meningkatnya konsentrasinya, glikolisis dan pengambilan
glukosa melambat. Penghambatan PFK-1 menyebabkan akumulasi glukosa 6-fosfat dan fruktosa 6-fosfat.

(d) Efek bersih dari keracunan fluoroasetat adalah mematikan sintesis ATP, aerobik (oksidatif) dan anaerobik
(fermentatif).

23. Sintesis L-Malate dalam Pembuatan Anggur Rasa getir beberapa wine disebabkan oleh konsentrasi L-malat yang tinggi. Tuliskan
urutan reaksi yang menunjukkan bagaimana sel ragi mensintesis L-malat dari glukosa dalam kondisi anaerob dengan adanya
CO2 (HCO3 ) terlarut. Perhatikan bahwa reaksi keseluruhan untuk fermentasi ini tidak dapat melibatkan konsumsi koenzim
nikotinamid atau intermediet siklus asam sitrat.
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:07 Halaman S-192 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

S-192 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

Jawab Reaksi glikolitik


Glukosa 2Pi 2ADP 2NAD 88n 2 piruvat 2ATP 2NADH 2H 2H2O
diikuti oleh reaksi piruvat karboksilase
2 Piruvat 2CO2 2ATP 2H2O 88n 2 oksaloasetat 2ADP 2Pi 4H
Dalam siklus asam sitrat, reaksi dehidrogenase malat
2 Oksaloasetat 2NADH 2H 88n 2 L-malat 2NAD

mendaur ulang koenzim nicotinamide dalam kondisi anaerobik. Reaksi keseluruhannya adalah

Glukosa 2CO2 88n 2 L-malat 4H


yang menghasilkan empat H per glukosa, meningkatkan keasaman dan dengan demikian rasa getir anggur.

24. Sintesis Bersih a-Ketoglutarat a-Ketoglutarat memainkan peran sentral dalam biosintesis beberapa asam
amino. Tuliskan urutan reaksi enzimatik yang dapat menghasilkan sintesis bersih a-ketoglutarat
dari piruvat. Urutan yang Anda usulkan tidak boleh melibatkan konsumsi bersih intermediet siklus asam
sitrat lainnya. Tulis persamaan untuk reaksi keseluruhan dan identifikasi sumber masing-masing reaktan.

Answer Reaksi anaplerotik menggantikan intermediet dalam siklus asam sitrat. Sintesis bersih a-
ketoglutarat dari piruvat terjadi melalui aksi berurutan dari (1) piruvat karboksilase (yang membuat
molekul ekstra oksaloasetat), (2) piruvat dehidrogenase, dan enzim siklus asam sitrat (3) sintase
sitrat, (4) aconitase , dan (5) isositrat dehidrogenase:
(1) Piruvat ATP CO2 H2O 88n oksaloasetat ADP Pi H
(2) Piruvat KoA NAD 88n asetil-KoA CO2 NADH H
(3) Oksaloasetat asetil-KoA 88n sitrat KoA
(4) Sitrat 88n isositrat
(5) Isocitrate NAD 88n a-ketoglutarate CO2 NADH H
Reaksi bersih: 2 Piruvat ATP 2NAD H2O 88n
a-ketoglutarat CO2 ADP Pi 2NADH 3H

25. Jalur Amfibolik Jelaskan dengan memberikan contoh, apa yang dimaksud dengan pernyataan asam sitrat itu
siklus bersifat amfibolik.

Answer Jalur amfibolik dapat berfungsi baik dalam katabolik yang menghasilkan energi atau
energi yang membutuhkan proses biosintetik, tergantung pada keadaan sel. Misalnya, siklus asam
sitrat menghasilkan NADH dan FADH2 saat berfungsi secara katabolik. Tapi itu juga dapat
menyediakan prekursor untuk sintesis produk seperti glutamat dan aspartat (masing-masing
dari -ketoglutarat dan oksaloasetat), yang pada gilirannya berfungsi sebagai prekursor untuk
produk lain, seperti glutamin, prolin, dan asparagin (lihat Gambar 16– 15).

26. Regulasi Kompleks Piruvat Dehidrogenase Pada jaringan hewan, laju konversi piruvat menjadi asetil-KoA
diatur oleh rasio kompleks PDH aktif, terfosforilasi menjadi tidak aktif, tidak terfosforilasi. Tentukan apa
yang terjadi pada laju reaksi ini ketika preparat mitokondria otot kelinci yang mengandung kompleks PDH
diperlakukan dengan (a) piruvat dehidrogenase kinase, ATP, dan NADH; (b) piruvat dehidrogenase fosfatase
dan Ca2; (c) malonat.
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:07 Halaman S-193 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

Bab 16 Siklus Asam Sitrat S-193

Answer Piruvat dehidrogenase diatur oleh modifikasi kovalen dan alosterik pada inhibitor.
Sediaan mitokondria merespons sebagai berikut: (a) Piruvat dehidrogen nase aktif (defosforilasi)
diubah menjadi piruvat dehidrogenase inaktif (terfosforilasi) dan laju konversi piruvat menjadi asetil-
KoA menurun. (b) Gugus fosforil pada piruvat dehidrogenase fosfat dihilangkan secara enzimatis
untuk menghasilkan piruvat dehid drogenase aktif, yang meningkatkan laju konversi piruvat
menjadi asetil-KoA. (c) Malonat dalam menghambat suksinat dehidrogenase, dan sitrat
terakumulasi. Akumulasi sitrat menghambat sintase laju sitrat, dan asetil-KoA terakumulasi. Kadar
asetil-KoA yang tinggi menghambat piruvat dehidrogenase, dan laju konversi piruvat
menjadi asetil-KoA berkurang.

27. Sintesis Komersial Asam Sitrat Asam sitrat digunakan sebagai zat penyedap dalam minuman ringan, buah
jus, dan banyak makanan lainnya. Di seluruh dunia, pasar asam sitrat bernilai ratusan juta dolar per tahun.
Produksi komersial menggunakan kapang Aspergillus niger, yang memetabolisme sukrosa dalam kondisi
yang dikontrol dengan hati-hati. (a)
Hasil asam sitrat sangat bergantung pada konsentrasi FeCl3 dalam biakan
menengah, seperti yang ditunjukkan dalam grafik. Mengapa hasil menurun ketika konsentrasi Fe3 di
atas atau di bawah nilai optimal 0,5 mg/L?

90

80
asam
sitrat
Hasil
(%)

70

60

50
1 2 3 4 5
[FeCl3] (mg/L)

(b) Tuliskan urutan reaksi A. niger mensintesis asam sitrat dari sukrosa. Menulis sebuah
persamaan reaksi keseluruhan.
(c) Apakah proses komersial memerlukan media kultur untuk diangin-anginkan—yaitu, apakah ini proses
fermentasi atau aerobik? Menjelaskan.

Menjawab

(a) Sitrat diproduksi melalui aksi sintase sitrat pada oksaloasetat dan asetil-KoA.
Meskipun siklus asam sitrat biasanya tidak menghasilkan akumulasi intermediet, sintase sitrat
dapat digunakan untuk sintesis bersih sitrat ketika (1) masuknya terus menerus oksaloasetat
baru dan asetil-KoA, dan (2) transformasi sitrat untuk isoci trate diblokir atau setidaknya
dibatasi. A. niger yang ditanam di media kaya sukrosa tetapi rendah Fe3 memenuhi kedua
persyaratan tersebut. Sitrat diubah menjadi isositrat oleh aconitase, enzim yang mengandung
Fe3. Dalam media yang dibatasi Fe3, sintesis aconitase dibatasi dan dengan demikian
penguraian sitrat diblokir sebagian; sitrat terakumulasi dan dapat diisolasi dalam jumlah
komersial. Perhatikan bahwa beberapa aktivitas aconitase diperlukan—jamur
tidak akan berkembang pada [Fe3] di bawah 0,5 mg/L. Namun, pada [Fe3] yang lebih tinggi ,
aconitase disintesis dalam jumlah yang meningkat; ini akan menyebabkan penurunan hasil
sitrat saat siklus melalui siklus asam sitrat.
(b) Sukrosa H2O 88n glukosa fruktosa
Glukosa 2Pi 2ADP 2NAD 88n 2 piruvat 2ATP 2NADH 2H 2H2O
Fruktosa 2Pi 2ADP 2NAD 88n 2 piruvat 2ATP 2NADH 2H 2H2O
2 Piruvat 2NAD 2CoA 88n 2 asetil-KoA 2NADH 2H 2CO2
2 Piruvat 2CO2 2ATP 2H2O 88n 2 oksaloasetat 2ADP 2Pi 4H
2 Asetil-KoA 2 oksaloasetat 2H2O 88n 2 sitrat 2CoA
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:07 Halaman S-194 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

S-194 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

Reaksi keseluruhannya adalah

Sukrosa H2O 2Pi 2ADP 6NAD 88n 2 sitrat 2ATP 6NADH 10H (c) Perhatikan bahwa reaksi
keseluruhan mengkonsumsi NAD. Karena kumpulan seluler koenzim teroksidasi ini terbatas, ia harus didaur
ulang dengan oksidasi NADH melalui rantai transfer elektron, dengan konsumsi oksigen. Akibatnya,
keseluruhan konversi sukrosa menjadi sitrat adalah proses aerobik dan membutuhkan oksigen
molekuler.

28. Regulasi Sintase Sitrat Di hadapan jumlah jenuh oksaloasetat, aktivitas sintase sitrat dari jaringan jantung babi
menunjukkan ketergantungan sigmoid pada konsentrasi asetil KoA, seperti yang ditunjukkan pada grafik. Ketika
suksinil-CoA ditambahkan, kurva bergeser ke kanan dan ketergantungan sigmoid lebih jelas.

100

80
Tidak ada suksinil-CoA

60
Aktivitas
Vmax)
dari
(%

Suksinil-CoA
40 ditambahkan

20

20 40 60 80 100 120
[Asetil-KoA] (M)

Atas dasar pengamatan ini, sarankan bagaimana suksinil-KoA mengatur aktivitas sintase sitrat.
(Petunjuk: lihat Gambar 6–34) Mengapa suksinil-KoA merupakan sinyal yang sesuai untuk pengaturan siklus asam sitrat?
Bagaimana regulasi sintase sitrat mengontrol laju respirasi seluler pada jaringan jantung babi?

Answer Succinyl-CoA adalah zat antara dari siklus asam sitrat—zat antara empat karbon pertama, terbentuk
dalam reaksi a-ketoglutarate dehydrogenase. Sinyal akumulasinya mengurangi fluks melalui siklus, dan
dengan demikian kebutuhan untuk mengurangi masuknya asetil-KoA ke dalam siklus.
Seperti terlihat pada grafik, suksinil-KoA menggeser titik setengah jenuh, [S]0,5 (atau K0,5), untuk
asetil-KoA ke kanan tetapi tidak mengubah Vmaks. Hal ini menunjukkan bahwa suksinil-KoA bertindak
sebagai modulator negatif, baik secara langsung sebagai inhibitor kompetitif dengan asetil-KoA atau dengan
mengikat situs yang terpisah dari situs aktif.
Sitrat sintase mengkatalisasi langkah di mana asetil-KoA memasuki siklus, dan dengan demikian
pengaturan enzim ini mengontrol aktivitas siklus, laju produksi koenzim tereduksi, dan dengan demikian laju
respirasi sel.

29. Regulasi Piruvat Karboksilase Karboksilasi piruvat oleh piruvat karboksilase


terjadi pada tingkat yang sangat rendah kecuali asetil-KoA, modulator alosterik positif, hadir. Jika Anda baru saja makan
makanan yang kaya asam lemak (triasilgliserol) tetapi rendah karbohidrat (glukosa), bagaimana sifat pengatur ini
menghentikan oksidasi glukosa menjadi CO2 dan H2O tetapi meningkatkan oksidasi asetil-KoA yang berasal dari asam
lemak?

Answer Katabolisme asam lemak meningkatkan kadar asetil-KoA, yang merangsang piruvat karboksilase.
Peningkatan konsentrasi oksaloasetat yang dihasilkan merangsang konsumsi asetil-KoA melalui siklus
asam sitrat, menyebabkan konsentrasi sitrat dan ATP meningkat.
Metabolit ini menghambat glikolisis pada PFK-1 dan menghambat piruvat dehidrogenase, secara efektif
memperlambat penggunaan gula dan piruvat.

30. Hubungan antara Respirasi dan Siklus Asam Sitrat Meskipun oksigen tidak berpartisipasi langsung dalam siklus asam
sitrat, siklus ini hanya bekerja jika ada O2 . Mengapa?
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:07 Halaman S-195 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

Bab 16 Siklus Asam Sitrat S-195

Answer Oksigen adalah akseptor elektron terminal dalam fosforilasi oksidatif, dan karenanya
diperlukan untuk mendaur ulang NAD dari NADH. NADH diproduksi dalam jumlah terbesar oleh reaksi
oksidatif dari siklus asam sitrat. Dengan tidak adanya O2, pasokan NAD habis, dan NADH yang
terakumulasi secara alosterik menghambat piruvat dehidrogenase dan a-ketoglutarat
dehidrogenase (lihat Gambar 16-18).

31. Pengaruh [NADH]/[NAD] pada Siklus Asam Sitrat Bagaimana Anda mengharapkan operasi siklus asam
sitrat untuk menanggapi peningkatan rasio [NADH]/[NAD] yang cepat dalam matriks mitokondria?
Mengapa?

Answer Peningkatan [NADH]/[NAD] menghambat siklus asam sitrat dengan aksi massa pada masing-masing
dari tiga langkah yang melibatkan reduksi NAD; [NADH] yang tinggi menggeser kesetimbangan ke arah NAD.
Cara lain untuk melihat efek ini adalah dengan mempertimbangkan bagaimana peningkatan rasio produk (NADH)
terhadap reaktan (NAD) mempengaruhi perubahan energi bebas untuk salah satu dari tiga langkah yang
bergantung pada NAD dari siklus asam sitrat. Lihat, misalnya, Persamaan 13–4 (hal. 493).

32. Termodinamika Reaksi Sintase Sitrat dalam Sel Sitrat terbentuk melalui kondensasi
asetil-KoA dengan oksaloasetat, dikatalisis oleh sintase sitrat:
Oksaloasetat asetil-KoA H2O 88n sitrat KoA H
Dalam mitokondria jantung tikus pada pH 7,0 dan 25 C, konsentrasi reaktan dan produk adalah: ox aloacetate,
1 mM; asetil-KoA, 1 mM; sitrat, 220 mM; dan CoA, 65 mM. Perubahan energi bebas standar untuk reaksi
sintase sitrat adalah 32,2 kJ/mol. Kemanakah arah aliran metabolit melalui reaksi cit rate synthase pada sel
jantung tikus? Menjelaskan.

Answer Perubahan energi bebas dari reaksi sintase sitrat dalam sel adalah
[sitrat][CoA]
GG RT ln
[OAA][asetil-KoA]

(220 106 )(65 106 ) 32,2 kJ/


mol (2,48 kJ/mol) ln (1 106 )(1
106 )
8 kJ/mol

Dengan demikian, reaksi sintase sitrat bersifat eksergonik dan berlanjut ke arah pembentukan
sitrat.

33. Reaksi Kompleks Piruvat Dehidrogenase Dua langkah dalam dekarboksilasi oksidatif piruvat (langkah 4 dan
5 pada Gambar 16-6) tidak melibatkan salah satu dari tiga karbon piruvat namun penting untuk
pengoperasian PDH kompleks. Menjelaskan.

Answer Kompleks piruvat dehidrogenase dapat dianggap melakukan lima reaksi enzimatik. Tiga yang
pertama (lihat Gambar 16-6) mengkatalisasi oksidasi piruvat menjadi asetil-KoA dan reduksi enzim.
Dua reaksi terakhir penting untuk mengoksidasi ulang enzim tereduksi, mereduksi NAD menjadi
NADH H. Bagian enzim yang teroksidasi/direduksi adalah kofaktor lipoamida.

34. Mutan Siklus Asam Sitrat Ada banyak kasus penyakit manusia di mana satu atau beberapa aktivitas enzim
berkurang karena mutasi genetik. Namun, kasus di mana individu kekurangan salah satu enzim dari
siklus asam sitrat sangat jarang terjadi. Mengapa?

Answer Siklus asam sitrat sangat penting untuk metabolisme sehingga kerusakan serius pada enzim
siklus apa pun mungkin akan mematikan embrio.
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:07 Halaman S-196 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

S-196 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

35. Partisi antara Siklus Asam Sitrat dan Glyoxylate Dalam organisme (seperti E. coli)
yang memiliki siklus asam sitrat dan siklus glioksilat, apa yang menentukan jalur mana yang akan dilalui isositrat?

Answer Isocitrate dapat dimetabolisme melalui siklus asam sitrat atau siklus glioksilat. Enzim pertama di
setiap jalur diatur secara alosterik, sehingga akumulasi perantara siklus asam sitrat merangsang siklus itu
sambil menghambat siklus glioksilat. AMP dan ADP, yang menandakan cadangan ATP yang tidak
memadai, menghambat siklus glioksilat, mengalihkan penggunaan isositrat ke siklus asam sitrat
penghasil energi. Regulasi timbal balik dari dua enzim pada titik cabang ini menentukan jalur isositrat
mana yang akan masuk.

Masalah Analisis Data


36. Bagaimana Siklus Asam Sitrat Ditentukan Biokimia terperinci dari siklus asam sitrat ditentukan oleh beberapa
peneliti selama beberapa dekade. Dalam sebuah artikel tahun 1937, Krebs dan Johnson meringkas karya mereka
dan karya orang lain dalam deskripsi terbitan pertama tentang jalur ini.
Metode yang digunakan oleh para peneliti ini sangat berbeda dengan metode biokimia modern.
Pelacak radioaktif tidak tersedia secara umum sampai tahun 1940-an, jadi Krebs dan peneliti lain harus
menggunakan teknik nonpelacak untuk mengetahui jalurnya. Dengan menggunakan sampel otot dada merpati yang
baru disiapkan, mereka menentukan konsumsi oksigen dengan menangguhkan otot cincang dalam penyangga dalam
labu tertutup dan mengukur volume (dalam L) oksigen yang dikonsumsi dalam kondisi yang berbeda. Mereka
mengukur tingkat substrat (perantara) dengan mengolah sampel dengan asam untuk menghilangkan protein yang
mencemari, kemudian menguji jumlah berbagai molekul organik kecil. Dua pengamatan utama yang
mengarahkan Krebs dan rekannya untuk mengusulkan siklus asam sitrat yang bertentangan dengan jalur linier
(seperti glikolisis glikolisis) dibuat dalam percobaan berikut.
Eksperimen I. Mereka menginkubasi 460 mg otot cincang dalam 3 mL buffer pada suhu 40 C selama 150
menit. Penambahan sitrat meningkatkan konsumsi O2 sebesar 893 L dibandingkan dengan sampel tanpa
penambahan sitrat. Mereka menghitung, berdasarkan O2 yang dikonsumsi selama respirasi senyawa lain yang
mengandung karbon, bahwa konsumsi O2 yang diharapkan untuk respirasi lengkap jumlah sitrat ini hanya 302 L.

Eksperimen II. Mereka mengukur konsumsi O2 dengan 460 mg otot cincang dalam 3 mL buffer ketika
diinkubasi dengan sitrat dan/atau dengan 1-fosfogliserol (gliserol 1-fosfat; ini diketahui mudah teroksidasi oleh
respirasi sel) pada 40 C selama 140 menit. Hasilnya ditunjukkan pada tabel.

Sampel Substrat ditambahkan L O2 diserap

1 tidak ekstra 342


2 0,3 mL 0,2 M
1-fosfogliserol 0,15 757
3 mL 0,02 M sitrat 431
4 0,3 mL 0,2 M
1-fosfogliserol dan 0,15
mL 0,02 M sitrat 1.385

(a) Mengapa konsumsi O2 merupakan ukuran yang baik untuk respirasi


seluler? (b) Mengapa sampel 1 (jaringan otot yang tidak diberi suplemen) mengonsumsi
sedikit oksigen? (c) Berdasarkan hasil untuk sampel 2 dan 3, dapatkah Anda menyimpulkan bahwa 1-fosfogliserol
dan sitrat berfungsi sebagai substrat untuk respirasi sel dalam sistem ini? Jelaskan alasan
Anda. (d) Krebs dan rekannya menggunakan hasil dari percobaan ini untuk menyatakan bahwa sitrat
bersifat "katalitik"—bahwa sitrat membantu sampel jaringan otot memetabolisme 1-fosfogliserol lebih
sempurna. Bagaimana Anda akan menggunakan data mereka untuk membuat argumen ini?
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:07 Halaman S-197 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

Bab 16 Siklus Asam Sitrat S-197

(e) Krebs dan rekan lebih lanjut berpendapat bahwa sitrat tidak hanya dikonsumsi oleh reaksi ini, tetapi harus diregenerasi.
Oleh karena itu, reaksi harus berupa siklus , bukan jalur linier. Bagaimana Anda membuat argumen ini?

Peneliti lain telah menemukan bahwa arsenat (AsO4 3–) menghambat -ketoglutarat dehidrogenase dan
bahwa malonat menghambat suksinat dehidrogenase. (f)
Krebs dan rekan kerja menemukan bahwa sampel jaringan otot yang diobati dengan arsenat dan sitrat akan mengkonsumsi
sitrat hanya jika ada oksigen; dan dalam kondisi ini, oksigen dikonsumsi. Berdasarkan jalur pada Gambar 16-7, sitrat
diubah menjadi apa dalam percobaan ini, dan mengapa sampel mengonsumsi oksigen?

Dalam artikel mereka, Krebs dan Johnson selanjutnya melaporkan hal berikut. (1) Dengan adanya arsenat, 5,48 mmol sitrat
diubah menjadi 5,07 mmol -ketoglutarat. (2) Dengan adanya malonat, sitrat secara kuantitatif diubah menjadi suksinat dalam jumlah
besar dan -ketoglutarat dalam jumlah kecil.
(3) Penambahan oksaloasetat tanpa adanya oksigen menyebabkan produksi sitrat dalam jumlah besar; jumlahnya meningkat jika
glukosa juga ditambahkan.
Pekerja lain telah menemukan jalur berikut dalam persiapan jaringan otot yang serupa:

Suksinat 88n fumarat 88n malat 88n oksaloasetat 88n piruvat

(g) Hanya berdasarkan data yang disajikan dalam soal ini, bagaimanakah urutan zat antara dalam siklus asam sitrat? Bagaimana
hal ini dibandingkan dengan Gambar 16–7? Jelaskan alasan Anda. (h) Mengapa penting untuk
menunjukkan konversi kuantitatif sitrat menjadi -ketoglutarat?
Artikel Krebs dan Johnson juga memuat data lain yang mengisi sebagian besar komponen siklus yang hilang. Satu-satunya
komponen yang belum terselesaikan adalah molekul yang bereaksi dengan oksaloasetat untuk membentuk sitrat.

Menjawab

(a) Satu-satunya reaksi dalam jaringan otot yang mengkonsumsi oksigen dalam jumlah yang signifikan adalah respirasi
sel, sehingga konsumsi O2 merupakan proksi yang baik untuk respirasi. (b) Jaringan
otot yang baru disiapkan mengandung sedikit sisa glukosa; Konsumsi O2 adalah karena
oksidasi glukosa ini.
(c) Ya. Karena jumlah O2 yang dikonsumsi meningkat ketika sitrat atau 1-fosfogliserol
ditambahkan, keduanya dapat berfungsi sebagai substrat untuk respirasi sel dalam sistem ini.
(d) Eksperimen I: sitrat menyebabkan konsumsi O2 jauh lebih banyak daripada yang diharapkan dari oksidasi
sempurnanya. Setiap molekul sitrat tampaknya bertindak seolah-olah lebih dari satu molekul. Satu-satunya
penjelasan yang mungkin adalah bahwa setiap molekul sitrat berfungsi lebih dari satu kali dalam reaksi—
begitulah cara kerja katalis.
Eksperimen II: kuncinya adalah menghitung kelebihan O2 yang dikonsumsi oleh masing-masing sampel
dibandingkan dengan kontrol (sampel 1).

Kelebihan L
Sampel Substrat ditambahkan L O2 diserap O2 dikonsumsi

1 tidak ekstra 342 0


2 0,3 mL 0,2 M 1-fosfogliserol 0,15 mL 757 415
3 0,02 M sitrat 431 89
4 0,3 mL 0,2 M 1-fosfogliserol 0,15 mL
0,02 M sitrat 1.385 1.043
2608T_ch16sm_S183-S198 22/02/2008 15:07 Halaman S-198 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-16:
Machine Translated by Google

S-198 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

Jika baik sitrat dan 1-fosfogliserol hanyalah substrat untuk reaksi, Anda akan mengharapkan
konsumsi O2 berlebih oleh sampel 4 menjadi jumlah dari konsumsi berlebih individu oleh
sampel 2 dan 3 (415 L + 89 L 504 L). Namun, konsumsi berlebih saat kedua substrat ada kira-
kira dua kali lipat dari jumlah ini (1.043 L).
Jadi sitrat meningkatkan kemampuan jaringan untuk memetabolisme 1-fosfogliserol. Perilaku
ini khas dari katalis. Kedua percobaan (I dan II) diperlukan untuk membuat kasus ini
meyakinkan. Berdasarkan percobaan I saja, sitrat entah bagaimana mempercepat reaksi,
tetapi tidak jelas apakah sitrat bekerja dengan membantu metabolisme substrat atau
dengan mekanisme lain. Berdasarkan percobaan II saja, tidak jelas molekul mana yang
merupakan katalis, sitrat atau 1-fosfogliserol. Bersama-sama, percobaan menunjukkan
bahwa sitrat bertindak sebagai "katalis" untuk oksidasi 1-fosfogliserol.
(e) Mengingat bahwa jalur dapat mengkonsumsi sitrat (lihat sampel 3), jika sitrat bertindak sebagai
katalis, sitrat harus diregenerasi. Jika rangkaian reaksi pertama-tama mengkonsumsi
kemudian menghasilkan kembali laju sit, itu harus berupa
jalur melingkar daripada jalur linier. (f) Ketika jalur diblokir di -ketoglutarat dehidrogenase, sitrat
diubah menjadi -ketoglutarat tetapi jalur tidak berlanjut. Oksigen dikonsumsi oleh reoksidasi
NADH yang dihasilkan oleh isocitrate dehydrogenase.
(G) Garam sitrat

-Ketoglutarat
Glukosa ? ? ?

Suksinat

Oksaloasetat
Fumarat

Malonat

Ini berbeda dari Gambar 16-7 karena tidak termasuk cis-aconitate dan isocitrate (antara
sitrat dan -ketoglutarat), atau suksinil-KoA, atau asetil-KoA. (h) Menetapkan
konversi kuantitatif sangat penting untuk mengesampingkan jalur bercabang atau jalur lain
yang lebih kompleks.

Referensi
Krebs, HA & Johnson, WA (1937) Peran asam sitrat dalam metabolisme perantara dalam jaringan hewan. Enzimologia 4, 148–156.
[Dicetak ulang (1980) dalam FEBS Lett. 117 (Suppl.), K2–K10.]
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-199 puncak 111:WHQY028:Solusi Manual:Ch-17:
Machine Translated by Google

bab

Katabolisme Asam Lemak 17


1. Energi dalam Triasilgliserol Pada basis per-karbon, di manakah jumlah terbesar secara biologis
energi yang tersedia dalam triasilgliserol berada: di bagian asam lemak atau bagian gliserol? Tunjukkan bagaimana pengetahuan
tentang struktur kimia triasilgliserol memberikan jawabannya.

Answer Asam lemak triasilgliserol adalah hidrokarbon, dengan satu gugus karboksil.
Gliserol, di sisi lain, memiliki gugus OOH pada setiap karbon dan dengan demikian jauh lebih teroksidasi daripada asam
lemak. Pada oksidasi, asam lemak menghasilkan jauh lebih banyak energi per karbon daripada gliserol.
Triasilgliserol memiliki energi oksidasi lebih dari dua kali lipat dari berat karbohidrat atau protein yang sama.

2. Cadangan Bahan Bakar di Jaringan Adiposa Triasilgliserol, dengan asam lemak mirip hidrokarbonnya, memiliki kandungan energi
tertinggi dari nutrisi utama. (a) Jika 15% massa tubuh
orang dewasa dengan berat 70,0 kg terdiri dari triasilgliserol, berapa jumlah total yang tersedia?
cadangan bahan bakar, dalam kilojoule dan kilokalori, dalam bentuk triasilgliserol? Ingat bahwa 1,00 kkal
4,18 kJ.

(b) Jika kebutuhan energi basal kira-kira 8.400 kJ/hari (2.000 kkal/hari), berapa lama orang tersebut dapat bertahan hidup jika
oksidasi asam lemak yang disimpan sebagai triasilgliserol merupakan satu-satunya sumber energi?

(c) Berapa penurunan berat badan dalam pound per hari dalam kondisi kelaparan seperti itu (1 lb
0,454 kg)?

Menjawab

(a) Diberikan (dalam teks) bahwa nilai energi dari triasilgliserol yang disimpan adalah 38 kJ/g, tersedia
cadangan bahan bakar adalah

(0,15)(70,0 103 g)(38 kJ/g) 4,0 105 kJ

9,6 104 kkal

(b) Pada laju 8,4 103 kJ/hari, persediaan bahan bakar akan habis

(4,0 105 kJ)/(8,4 103 kJ/hari) 48 hari

(c) Jika semua triasilgliserol digunakan selama periode 48 hari, ini menunjukkan tingkat penurunan berat badan sebesar

(0,15)(70,0 kg) 48
0,22 kg/hari
hari

atau (0,22 kg/hari)/(0,454 kg/lb) 0,48 lb/hari

3. Langkah Reaksi Umum dalam Siklus Oksidasi Asam Lemak dan Siklus Asam Sitrat Sel sering menggunakan pola reaksi enzim
yang sama untuk konversi metabolisme analog. Misalnya, langkah-langkah oksidasi piruvat menjadi asetil-KoA dan a-ketoglutarat
menjadi suksinil-KoA, meskipun dikatalisis oleh

S-199
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-200 puncak 111:WHQY028:Solusi Manual:Ch-17:
Machine Translated by Google

S-200 Bab 17 Katabolisme Asam Lemak

enzim yang berbeda, sangat mirip. Tahap pertama oksidasi asam lemak mengikuti urutan reaksi yang sangat
mirip dengan urutan dalam siklus asam sitrat. Gunakan persamaan untuk menunjukkan urutan reaksi
analog di dua jalur.

Answer Tiga reaksi pertama dalam oksidasi b molekul lemak asil-KoA analog dengan tiga
reaksi siklus asam sitrat.
Reaksi lemak asil-CoA dehidrogenase analog dengan suksinat dehidrogenase
reaksi; keduanya adalah oksidasi yang membutuhkan FAD:

Suksinat FAD 88n fumarat FADH2


Fatty acyl–CoA FAD 88n trans-2 -enoyl-CoA FADH2
Reaksi enoyl-CoA hydratase analog dengan reaksi fumarase; keduanya menambahkan air ke ikatan
olefin:

Fumarat H2O 88n malat trans-2


-Enoyl-CoA H2O 88n Lb-hidroksiasil-CoA
Reaksi b-hidroksiasil-CoA dehidrogenase analog dengan reaksi dehidrogenase malat; keduanya
membutuhkan NAD dan bekerja pada senyawa b-hidroksiasil:
Malat NAD 88n oksaloasetat NADH

Lb-Hydroxyacyl-CoA NAD 88n b-ketoacyl-CoA NADH

4. Oksidasi: Berapa Banyak Siklus? Berapa siklus oksidasi yang diperlukan untuk oksidasi lengkap asam
oleat aktif, 18:1(9 )?

Jawab 7 siklus; rilis terakhir 2 asetil-KoA.

5. Kimia Reaksi Asil-KoA Sintetase Asam lemak diubah menjadi koenzim A


ester dalam reaksi reversibel yang dikatalisis oleh asil-KoA sintetase:

HAI

R MENDEKUT ATP KoA R C CoA AMP PPi

(a) Zat antara yang terikat enzim dalam reaksi ini telah diidentifikasi sebagai anhidrida campuran dari
asam lemak dan adenosin monofosfat (AMP), asil-AMP:

HAI HAI

R P Adenin
BERSAMA HAI CH2 HAI

HAI HH
H H

OH OH

Tulis dua persamaan yang sesuai dengan dua langkah reaksi yang dikatalisis oleh asil-KoA
sintetase.
(b) Reaksi asil-KoA sintetase mudah dibalik, dengan tetapan kesetimbangan mendekati 1. Bagaimana
dapatkah reaksi ini dibuat untuk mendukung pembentukan lemak asil-KoA?

Answer Aktivasi gugus karboksil oleh ATP secara teori dapat dilakukan dengan tiga jenis reaksi:
pembentukan ADP asil-fosfat; dari asil-ADP Pi ; atau asil-AMP PPi .
Semua reaksi ini mudah dibalik. Untuk membuat reaksi aktivasi dengan G yang sangat negatif
(secara efektif ireversibel), jenis ketiga dari reaksi dapat digabungkan dengan reaksi pyrophos
phatase, seperti dalam sintesis molekul lemak asil-CoA.
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-201 puncak 111:WHQY028:Solusi Manual:Ch-17:
Machine Translated by Google

Bab 17 Katabolisme Asam Lemak S-201

(a) ROCOO ATP 88n asil-AMP PPi

Asil-AMP CoA 88n asil-KoA AMP


(b) Hidrolisis PPi oleh pirofosfatase anorganik menarik reaksi ke arah
pembentukan lemak asil-CoA.

6. Perantara dalam Oksidasi Asam Oleat Bagaimana struktur gugus asil lemak yang teroksidasi sebagian yang
terbentuk ketika asam oleat, 18:1(9 ), mengalami tiga siklus oksidasi? Apa dua langkah selanjutnya dalam oksidasi
lanjutan zat antara ini?

Answer Setelah tiga putaran oksidasi, lemak asil-KoA telah disingkat menjadi enam karbon dengan
penghilangan tiga asetil-KoA. Zat antara 12-karbon yang dihasilkan adalah cis-3 -dodecanoyl-CoA,
dengan ikatan rangkap antara karbon ketiga dan keempat dari ujung karboksil rantai. Sebelum putaran
oksidasi lain dapat terjadi, ikatan rangkap 3 ,2 -enoyl isomerase (lihat Gambar 17–9). harus dipindahkan
3 ke 2
ditambahkan ke ikatan rangkap untuk
, membentuk turunan dari yang dikatalisis oleh Air kemudian
-hidroksidodekanoil-CoA, yang dapat mengalami oksidasi lebih lanjut.

7. Oksidasi Asam Lemak Rantai Ganjil Apa produk langsung dari oksidasi sepenuhnya
jenuh, asam lemak rantai lurus dari 11 karbon?

Jawab 4 asetil-KoA dan 1 propionil-KoA

8. Oksidasi Tritiated Palmitate Palmitat yang diberi label seragam dengan tritium (3 H) untuk aktivitas spesifik 2,48 108
hitungan per menit (cpm) per mikromol palmitat ditambahkan ke persiapan mitokondria yang mengoksidasi asetil-
KoA. Asetil-KoA diisolasi dan dihidrolisis menjadi asetat. Aktivitas spesifik asetat yang diisolasi adalah 1,00 107 cpm/
mmol. Apakah hasil ini konsisten dengan jalur b-oksidasi? Menjelaskan. Apa nasib akhir dari tritium yang
dihilangkan?

Answer Jalur b-oksidasi mencakup dua enzim dehidrogenase yang menghilangkan hidrogen (H–H)
dari rantai lemak asil–KoA, pertama di OCH2OCH2O dan kemudian di OCH2OCH(OH)O. Hasil bersih
dari kedua reaksi tersebut adalah penghilangan salah satu dari dua hidrogen pada titik pembentukan zat
antara enoyl-CoA. Dua hidrogen lain dalam gugus metil asetil-KoA berasal dari air.

Palmitat mengandung 16 karbon, dengan (14 2) 3 31 hidrogen, sehingga setiap unit dua karbon H ada.
berisi sekitar 4/31 atau sekitar 1/8 dari total 3
Jadi, hitungan per menit yang diharapkan per asetil-KoA,
dengan dua dari empat hidrogen asetil berlabel (dua lainnya muncul dari air yang tidak diberi label), adalah
(2/4)(2,48 108 cpm/mmol)(1/8) 1,6 107 cpm/mmol, agak lebih tinggi dari yang diamati. Pertukaran antara
3 H.
b-ketoasil-CoA dan air pelarut dapat menyebabkan hilangnya
Nasib terakhir dari tritium yang dihilangkan dari palmitat adalah kemunculannya di dalam air, sebagai tereduksi
pembawa (FADH2, NADH) direoksidasi oleh mitokondria.

9. Kompartemen dalam b Oksidasi Palmitat bebas diaktifkan menjadi turunan koenzim A (palmitoyl-CoA) di
sitosol sebelum dapat dioksidasi di mitokondria. Jika palmitat dan [ 14C] koenzim A ditambahkan ke homogenat
hati, palmitoyl-CoA yang diisolasi dari fraksi sitosol bersifat radioaktif, tetapi yang diisolasi dari fraksi mitokondria tidak.
Menjelaskan.

Answer Pengangkutan molekul asam lemak ke dalam mitokondria memerlukan sistem antar-jemput untuk
melepaskan perantara lemak asil-karnitin. Asam lemak pertama-tama diubah menjadi molekul asil-KoA
lemak di sitosol (melalui aksi asil-KoA sintetase) kemudian, pada membran luar mitokondria, gugus asil
lemak dipindahkan ke karnitin (oleh aksi karnitin asil transferase I ). Setelah pengangkutan lemak asil-karnitin
melalui membran dalam, gugus asil lemak dipindahkan ke mitokondria CoA. Dengan demikian, kolam
sitosol dan mitokondria dari CoA dipisahkan, dan tidak ada CoA berlabel dari kolam sitosolik yang memasuki
mitokondria.
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-202 puncak 111:WHQY028:Solusi Manual:Ch-17:
Machine Translated by Google

S-202 Bab 17 Katabolisme Asam Lemak

10. Biokimia Komparatif: Jalur Pembangkit Energi pada Burung Salah satu indikasi rela
Hal yang paling penting dari berbagai jalur penghasil ATP adalah Vmax enzim tertentu dari jalur ini.
Nilai Vmax beberapa enzim dari otot dada (otot dada yang digunakan untuk terbang) merpati dan burung pegar tercantum di
bawah ini.

Vmax (substrat mmol/mnt/g jaringan)


Enzim Merpati Pegar

Heksokinase 3.0 2.3


Glikogen fosforilase 18.0 120.0
Fosfofruktokinase-1 24.0 143.0
Sintase sitrat 100,0 15,0
triasilgliserol lipase 0,07 0,01

(a) Diskusikan kepentingan relatif dari metabolisme glikogen dan metabolisme lemak dalam menghasilkan ATP
otot dada burung-burung ini.
(b) Bandingkan konsumsi oksigen pada kedua burung. (c) Dilihat
dari data pada tabel, burung mana yang merupakan penerbang jarak jauh? Benarkan jawaban Anda. (d) Mengapa enzim
khusus ini dipilih untuk perbandingan? Apakah aktivitas triose phosphate isomerase dan malate dehydrogenase menjadi basa
yang sama baiknya untuk perbandingan? Menjelaskan.

Menjawab

(a) Pada merpati, oksidasi asam lemak secara aerobik—oksidasi b dan fosforilasi oksidatif—mendominasi; di burung
pegar, glikolisis glikogen anaerob mendominasi. Perhatikan aktivitas sintase sitrat yang tinggi pada merpati, dan
aktivitas glikogen fosforilase dan PFK-1 yang tinggi pada burung pegar.

(b) Menggunakan oksidasi aerobik, otot merpati mengkonsumsi lebih banyak oksigen selama
penerbangan. (c) Energi yang tersedia per gram lebih tinggi untuk lemak daripada untuk glikogen. Selain itu,
pemecahan glikogen anaerobik dibatasi oleh toleransi terhadap penumpukan laktat. Jadi merpati, yang
menggunakan katabolisme oksidatif lemak, adalah penerbang jarak jauh. (d) Enzim yang
tercantum dalam tabel (tidak seperti isomerase triosa fosfat dan dehidro malat
genase) adalah enzim pengatur jalur masing-masing dan dengan demikian membatasi tingkat produksi
ATP.

11. Mutant Carnitine Acyltransferase Perubahan pola metabolisme apa yang akan dihasilkan dari mutasi pada otot carnitine
acyltransferase I di mana protein mutan telah kehilangan afinitasnya terhadap malonyl-CoA tetapi bukan aktivitas
katalitiknya?

Answer Malonyl-CoA tidak lagi menghambat masuknya asam lemak ke dalam mitokondria dan
oksidasi, jadi mungkin ada siklus sintesis asam lemak simultan yang sia-sia di sitosol
dan pemecahan asam lemak di mitokondria. (Lihat Gambar 17–12.)

12. Pengaruh Defisiensi Carnitine Seorang individu mengembangkan suatu kondisi yang ditandai dengan kelemahan otot progresif
dan kram otot yang sakit. Gejalanya diperparah dengan puasa, olahraga, dan diet tinggi lemak. Homogenat spesimen otot
rangka dari pasien teroksidasi menambahkan oleat lebih lambat daripada homogenat kontrol, yang terdiri dari spesimen otot
dari individu sehat. Ketika karnitin ditambahkan ke homogenat otot pasien, laju oksidasi oleat sama dengan homogenat kontrol.
Pasien didiagnosis memiliki defisiensi karnitin. (a) Mengapa menambahkan karnitin meningkatkan laju oksidasi oleat pada
homogenat otot pasien?
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-203 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-17:
Machine Translated by Google

Bab 17 Katabolisme Asam Lemak S-203

(b) Mengapa gejala pasien diperparah dengan puasa, olahraga, dan diet tinggi lemak? (c) Kemukakan dua
kemungkinan alasan defisiensi karnitin otot pada individu ini.

Menjawab

(a) Pengangkutan asam lemak yang dimediasi karnitin ke dalam mitokondria adalah pembatas laju
langkah dalam oksidasi b (lihat Gambar 17–6). Defisiensi karnitin menurunkan laju transpor asam lemak ke
dalam mitokondria dan dengan demikian laju oksidasi b, sehingga penambahan karnitin akan meningkatkan laju
oksidasi.

(b) Puasa, olah raga, dan diet tinggi lemak semuanya menyebabkan peningkatan kebutuhan b oksidasi asam lemak
dan dengan demikian meningkatkan permintaan aktivitas ulang karnitin. Oleh karena itu, gejala defisiensi
karnitin akan menjadi lebih parah dalam kondisi ini.
(c) Defisiensi karnitin dapat diakibatkan oleh defisiensi prekursor lisin dalam makanan, atau dari defek pada salah
satu enzim yang mensintesis karnitin dari prekursor ini.

13. Asam Lemak sebagai Sumber Air Berlawanan dengan legenda, unta tidak menyimpan air di punuknya, yang sebenarnya terdiri
dari timbunan lemak yang besar. Bagaimana timbunan lemak ini bisa berfungsi sebagai sumber air?
Hitung jumlah air (dalam liter) yang dapat dihasilkan unta dari 1,0 kg lemak. Asumsikan untuk kesederhanaan bahwa lemak
seluruhnya terdiri dari tripalmitoylglycerol.

Answer Oksidasi asam lemak menghasilkan air dalam jumlah yang banyak. Dari Persamaan 17–6

Palmitoyl-CoA 23O2 108Pi 108ADP 88n CoA 16CO2 108ATP 23H2O

kita tahu bahwa oksidasi 1 mol palmitoyl-CoA menghasilkan 23 mol air.


Tripalmitoin (gliserol ditambah tiga palmitat dalam ikatan ester) memiliki berat molekul 885, jadi 1 kg tripalmitoin
mengandung (1,0 kg)(1.000 g/kg)/(885 g/mol) 1,1 mol. Oksidasi sempurna dari ketiga gugus palmitoil akan dihasilkan

(1,1 mol tripalmitoin)(3 mol palmitat/mol tripalmitoin)(23 mol H2O/mol palmitat) 76 mol H2O

Jadi, volume air yang dihasilkan (dengan mengabaikan kontribusi oksidasi gliserol) adalah

(76 mol)(18 g/mol)(1 kg/1.000 g)(1 L/kg) 1,4 L

Catatan: pada kenyataannya, ini mungkin perkiraan yang terlalu tinggi. Gugus asil lemak dari triasilgliserol dalam
lemak unta mungkin kurang tereduksi dibandingkan palmitat.

14. Minyak Bumi sebagai Sumber Makanan Mikroba Beberapa mikroorganisme dari genus Nocardia dan
Pseudomonas dapat tumbuh di lingkungan di mana hidrokarbon adalah satu-satunya sumber makanan. Bakteri ini
mengoksidasi hidrokarbon alifatik rantai lurus, seperti oktan, menjadi asam karboksilat yang sesuai:

CH3(CH2)6CH3 NAD O2 y88 88z CH3(CH2)6COOH NADH H

Bagaimana bakteri ini dapat digunakan untuk membersihkan tumpahan minyak? Apa yang akan menjadi beberapa faktor pembatas
efisiensi proses ini?

Answer Dengan mengoksidasi hidrokarbon menjadi asam lemak yang sesuai, mikroba ini dapat memperoleh semua
energinya dari oksidasi b dan fosforilasi oksidatif, mengubah hidrokarbon menjadi CO2 dan H2O. Secara teoritis,
tumpahan minyak dapat diurai dengan pengobatan dengan mikroba ini.

Karena hidrofobisitas hidrokarbon yang ekstrim, kontak dekat antara substrat


dan enzim bakteri mungkin sulit dicapai; di bawah kondisi lapangan (misalnya tumpahan minyak), deterjen sering
ditambahkan untuk memperbaiki kontak ini. Selain itu, nutrisi lain, seperti nitrogen gen atau fosfor, mungkin membatasi
populasi bakteri, dan elemen ini sering ditambahkan untuk mendorong pertumbuhan pengoksidasi hidrokarbon.
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-204 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-17:
Machine Translated by Google

S-204 Bab 17 Katabolisme Asam Lemak

15. Metabolisme Asam Lemak Fenil Rantai Lurus Sebuah metabolit kristal diisolasi dari urin kelinci yang diberi makan asam lemak
rantai lurus yang mengandung gugus fenil terminal:

CH2 (CH2)n MENDEKUT

Sampel 302 mg metabolit dalam larutan air dinetralkan seluruhnya dengan 22,2 mL NaOH 0,100 M.

(a) Berapa berat molekul dan struktur metabolit yang mungkin? (b) Apakah asam lemak rantai
lurus mengandung gugus metilena (OCH2O) dalam jumlah genap atau ganjil (yakni, apakah n genap atau ganjil)?
Menjelaskan.

Menjawab

(a) 22,2 mL NaOH 0,1 M setara dengan (22,2 103 L) (0,100 mol/L) 22,2 104 mol metabolit yang tidak diketahui (dengan
asumsi hanya mengandung satu gugus karboksil) dalam sampel 302 mg. Jadi, Mr dari metabolitnya adalah

302 103 g 22,2


136
104 mol

Ini adalah Mr asam fenilasetat. (b) Karena b


oksidasi menghilangkan unit dua karbon, dan produk akhirnya adalah dua karbon
unit, rantai asil lemak asli pasti memiliki gugus metilen dalam jumlah genap (dengan gugus fenil dihitung
setara dengan gugus metil terminal). Asam lemak bernomor ganjil akan menghasilkan fenilpropionat.

16. Oksidasi Asam Lemak pada Diabetes yang Tidak Terkontrol Ketika asetil-KoA yang diproduksi selama oksidasi-b di hati
melebihi kapasitas siklus asam sitrat, kelebihan asetil-KoA membentuk badan keton—aseton, asetoasetat, dan Db-
hidroksibutirat . Ini terjadi pada diabetes yang parah dan tidak terkontrol: karena jaringan tidak dapat menggunakan glukosa,
mereka malah mengoksidasi asam lemak dalam jumlah besar. Meskipun asetil-KoA tidak beracun, mitokondria harus
mengalihkan asetil-KoA ke badan keton. Masalah apa yang akan muncul jika asetil-KoA tidak diubah menjadi badan keton?
Bagaimana pengalihan ke badan keton memecahkan masalah?

Answer Individu dengan diabetes yang tidak terkontrol mengoksidasi lemak dalam jumlah besar karena mereka
tidak dapat menggunakan glukosa secara efisien. Hal ini menyebabkan penurunan aktivitas siklus asam sitrat (lihat
Soal 17) dan peningkatan kumpulan asetil-KoA. Jika asetil-KoA tidak diubah menjadi badan keton, kumpulan CoA
akan habis. Karena kumpulan CoA mitokondria kecil, mitokondria hati mendaur ulang CoA dengan memadatkan
dua molekul asetil-KoA untuk membentuk asetoasetil-KoA KoA (lihat Gambar 17–18). Acetoacetyl-CoA diubah
menjadi keton lain, dan CoA didaur ulang untuk digunakan dalam jalur b-oksidasi dan produksi energi.

17. Konsekuensi Diet Tinggi Lemak Tanpa Karbohidrat Misalkan Anda harus menjalani diet lemak ikan paus dan lemak anjing laut,
dengan sedikit atau tanpa karbohidrat. (a) Apa efek kekurangan karbohidrat
terhadap pemanfaatan lemak untuk energi? (b) Jika diet Anda benar-benar tanpa karbohidrat, apakah lebih baik
mengonsumsi ganjil atau genap
nomor asam lemak? Menjelaskan.

Menjawab

(a) Piruvat, terbentuk dari glukosa melalui glikolisis, merupakan sumber utama oksaloasetat
diperlukan untuk mengisi intermediet siklus asam sitrat (lihat Tabel 16–2). Dengan tidak adanya karbohidrat
dalam makanan, tingkat oksaloasetat turun dan siklus asam sitrat melambat.
Hal ini meningkatkan laju b oksidasi asam lemak dan menyebabkan ketosis.
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-205 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-17:
Machine Translated by Google

Bab 17 Katabolisme Asam Lemak S-205

(b) Siklus terakhir oksidasi b menghasilkan dua molekul asetil-KoA dari suatu genap
asam lemak bernomor, atau propionil-KoA asetil-KoA dari asam lemak bernomor ganjil.
Propionil-KoA dapat diubah menjadi suksinil-KoA (lihat Gambar 17-11), yang bila diubah menjadi
oksaloasetat merangsang siklus asam sitrat dan mengurangi kondisi yang menyebabkan ketosis.
Dengan demikian, akan lebih baik mengonsumsi asam lemak bernomor ganjil.

18. Asam Lemak Rantai Genap dan Ganjil dalam Makanan Dalam percobaan laboratorium, dua kelompok tikus diberi
makan dua asam lemak berbeda sebagai satu-satunya sumber karbon mereka selama sebulan. Kelompok pertama
mendapat asam heptanoat (7:0), dan kelompok kedua mendapat asam oktanoat (8:0). Setelah percobaan, perbedaan
yang mencolok terlihat antara kedua kelompok. Kelompok pertama sehat dan mengalami kenaikan berat badan,
sedangkan kelompok kedua lemah dan mengalami penurunan berat badan akibat kehilangan massa otot. Apa
dasar biokimia untuk perbedaan ini?

Answer Oksidasi asam heptanoat (yang memiliki jumlah karbon ganjil) menghasilkan zat antara tiga
karbon propionil-KoA, yang dapat diubah oleh propionil-KoA mobil boxilase menjadi metilmalonil-KoA,
kemudian menjadi suksinil-KoA. Produk empat karbon dari oksidasi asam lemak ini kemudian dapat diubah
menjadi oksaloasetat dalam siklus asam sitrat, dan oksaloasetat dapat digunakan untuk glukoneogenesis
—sehingga menyediakan karbohidrat serta energi dari oksidasi asam lemak pada hewan. Hewan yang
diberi asam oktanoat (dengan jumlah karbon genap) menurunkannya sepenuhnya menjadi asetil-KoA
melalui tiga putaran oksidasi. Ini menyediakan energi melalui siklus asam sitrat tetapi tidak menyediakan
bahan awal untuk glukoneogenesis. Oleh karena itu, hewan-hewan ini kekurangan glukosa, bahan bakar
utama untuk otak dan perantara dalam banyak jalur biosintetik.

19. Konsekuensi Metabolik Menelan q-Fluorooleat Toksisarium semak Dichapetalum, asli Sierra Leone, menghasilkan
q-fluorooleat, yang sangat beracun bagi hewan berdarah panas.

HH

F CH2 (CH2)7 CC (CH2)7 MENDEKUT

-Fluorooleat

Zat ini telah digunakan sebagai racun panah, dan buah bubuk dari tanaman kadang-kadang digunakan sebagai racun
tikus (maka nama umum tanaman itu adalah ratsbane). Mengapa zat ini sangat beracun? (Petunjuk: lihat kembali Bab
16, Soal 22.)

Jawaban Oksidasi q-fluorooleat pada jalur oksidasi-b membentuk fluoroasetil-KoA pada urutan terakhir.
Masuknya fluoroacetyl-CoA ke dalam siklus asam sitrat menghasilkan fluorocitrate, penghambat kuat
enzim aconitase. Sebagai akibat dari penghambatan ini, siklus asam sitrat terhenti dan aliran ekuivalen
pereduksi ke fosforilasi oksidatif terganggu secara fatal.

20. Mutant Acetyl-CoA Carboxylase Apa akibatnya bagi metabolisme lemak suatu muta
tion dalam acetyl-CoA carboxylase yang menggantikan residu Ser yang biasanya difosforilasi oleh AMPK menjadi
residu Ala? Apa yang mungkin terjadi jika Ser yang sama diganti dengan Asp? (Petunjuk: Lihat Gambar 17–12.)

Answer Perubahan Ser-ke-Ala akan menghasilkan enzim yang tidak dapat dihambat oleh fosforilasi
oleh AMPK. Langkah pertama dalam sintesis asam lemak akan terus dihidupkan, dan malonil-KoA yang
diproduksi oleh asetil-KoA karboksilase akan menghambat masuknya asam lemak ke dalam mitokondria,
menghentikan oksidasi. Mutasi Ser-ke-Asp akan menempatkan residu Asp bermuatan negatif pada
posisi yang ditempati oleh P -Ser dalam enzim tipe liar yang dihambat. Ini mungkin meniru efek residu Ser
terfosforilasi, mematikan asetil-KoA karboksilase, menghambat sintesis asam lemak, dan
merangsang oksidasi.
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-206 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-17:
Machine Translated by Google

S-206 Bab 17 Katabolisme Asam Lemak

21. Efek Inhibitor PDE pada Adiposit Bagaimana respon adiposit terhadap epinefrin dipengaruhi oleh penambahan
inhibitor cAMP phosphodiesterase (PDE)? (Petunjuk: Lihat Gambar 12–4.)

Answer Respons terhadap glukagon atau epinefrin akan diperpanjang karena cAMP, setelah terbentuk,
akan bertahan, merangsang protein kinase A untuk waktu yang lebih lama dan menyebabkan mobilisasi asam
lemak dalam adiposit yang lebih tahan lama.

22. Peran FAD sebagai Penerima Elektron Asil-KoA dehidrogenase menggunakan FAD yang terikat enzim sebagai pro
gugus tetik untuk mendehidrogenasi karbon a dan b dari asil lemak-KoA. Apa keuntungan menggunakan FAD sebagai
akseptor elektron daripada NAD? Jelaskan dalam kaitannya dengan potensial reduksi standar untuk setengah reaksi Enz-
FAD/FADH2 (E 0,320 V). 0,219 V) dan NAD/NADH (E

Jawab Enz-FAD, memiliki potensi reduksi standar yang lebih positif, merupakan akseptor elektron yang lebih
baik daripada NAD, dan reaksinya diarahkan ke arah oksidasi asil-KoA lemak (perubahan energi bebas negatif).
Perubahan energi bebas yang lebih menguntungkan ini diperoleh dengan mengorbankan 1 ATP; hanya 1,5
molekul ATP yang terbentuk per FADH2 teroksidasi dalam rantai pernapasan, dibandingkan dengan 2,5
ATP per NADH.

23. b Oksidasi Asam Arachidic Berapa putaran siklus oksidasi asam lemak yang diperlukan
oksidasi lengkap asam arakidat (lihat Tabel 10–1) menjadi asetil-KoA?

Jawaban Asam arakidat adalah asam lemak jenuh 20-karbon. Sembilan siklus jalur b-oksidasi diperlukan
untuk oksidasinya, menghasilkan 10 molekul asetil-KoA, dua yang terakhir pada putaran kesembilan.

24. Nasib Propionat Berlabel Jika [3-14C]propionat (14C dalam gugus metil) ditambahkan ke ho mogenat hati, oksaloasetat
berlabel 14C diproduksi dengan cepat. Gambarlah diagram alur untuk jalur di mana propionat diubah menjadi
oksaloasetat, dan tunjukkan lokasi 14C dalam oksaloasetat.

Answer Propionat pertama kali dikonversi menjadi turunan CoA. Gambar 17-11 menunjukkan jalur tiga
langkah yang mengubah propionil-KoA menjadi suksinil-KoA, yang dapat diringkas sebagai berikut. Gunakan
deskripsi ini untuk menyiapkan diagram alir Anda sendiri.

1. Propionil-KoA karboksilase menggunakan CO2 dan ATP untuk membentuk D-metilmalonil-KoA melalui ikatan
karboksi pada C-2 gugus propionil.
2. Methylmalonyl-CoA epimerase menggeser CoA thioester dari C-1 (gugus propionil asli) ke karboksilat yang
baru ditambahkan, membuat produk L-methylmalonyl-CoA.
3. Methylmalonyl-CoA mutase memindahkan gugus karboksi-KoA dari C-2 ke C-3 di dalam
unit propionil asli, membentuk suksinil-KoA.
4. Setelah suksinil-KoA terbentuk, siklus asam sitrat dapat mengubahnya menjadi oksaloasetat.
Mengingat stereokimia dari reaksi ini, label [14C] diseimbangkan pada C-2 dan
C-3 dari oksaloasetat.

25. Metabolisme Asam Fitanat Ketika asam fitanat yang diberi label seragam dengan 14C diumpankan ke tikus,
radioaktifitas radioaktif dapat dideteksi dalam malat, perantara siklus asam sitrat, dalam beberapa menit. Gambarkan
jalur metabolisme yang dapat menjelaskan hal ini. Manakah dari atom karbon dalam malat yang mengandung 14C
label?

Answer Asam fitanat terdegradasi menjadi asam pristanat melalui jalur yang ditunjukkan pada Gambar 17–17.
Asam pristanat mengalami oksidasi, dengan setiap putaran menghasilkan propionil-KoA (bukan asetil-KoA,
seperti asam lemak rantai lurus). Degradasi asam phytanic berlabel seragam menghasilkan
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-207 puncak 111:WHQY028:Solusi Manual:Ch-17:
Machine Translated by Google

Bab 17 Katabolisme Asam Lemak S-207

propionyl-CoA berlabel di ketiga karbon propionat. Propionil-CoA diubah menjadi succinyl-CoA melalui
rangkaian reaksi yang ditunjukkan pada Gambar 17–11. C-2 dan C-3 dari bagian suksinil diberi label, dan
juga C-1 atau C-4. Ketika suksinat ini diubah menjadi malat dalam siklus asam sitrat, malat diberi label pada
C-2 dan C-3, dan diberi label setengahnya pada C-1 dan C-4.

26. Sumber H2O Dihasilkan pada b Oksidasi Oksidasi lengkap palmitoyl-CoA menjadi karbon
dioksida dan air diwakili oleh persamaan keseluruhan

Palmitoyl-CoA 23O2 108Pi 108ADP 88n CoA 16CO2 108ATP 23H2O

Air juga diproduksi dalam reaksi

ADP Pi 88n ATP H2O

tetapi tidak dimasukkan sebagai produk dalam persamaan keseluruhan. Mengapa?

Jawaban hidrolisis ATP dalam reaksi yang membutuhkan energi sel menggunakan air, dalam reaksi

ATP H2O 88n ADPPi

Dalam sel pada keadaan tunak, untuk setiap mol ATP yang dihidrolisis, satu mol ATP dibentuk oleh
kondensasi ADP Pi . Tidak ada perubahan bersih dalam [ATP] dan dengan demikian tidak ada produksi bersih H2O.

27. Pentingnya Biologi Kobalt Pada sapi, rusa, domba, dan hewan ruminansia lainnya, sejumlah besar propionat diproduksi
di dalam rumen melalui fermentasi bakteri dari bahan tanaman yang tertelan.
Propionat adalah sumber utama glukosa untuk hewan ini, melalui jalur propionat n oksaloak etat n glukosa. Di
beberapa wilayah di dunia, terutama Australia, hewan ruminansia terkadang menunjukkan gejala anemia disertai
hilangnya nafsu makan dan pertumbuhan yang terhambat, akibat ketidakmampuan untuk mengubah propionat menjadi
oksaloasetat. Kondisi ini disebabkan oleh defisiensi kobalt yang disebabkan oleh kadar kobalt yang sangat rendah di
tanah dan juga di tanaman. Menjelaskan.

Answer Salah satu enzim yang diperlukan untuk konversi propionat menjadi oksaloasetat adalah mutase
metilmalonil-KoA (lihat Gambar 17–11). Enzim ini membutuhkan sebagai kofaktor esensial koenzim B12
yang mengandung kobalt, yang disintesis dari vitamin B12. Defisiensi kobalt pada hewan akan
menyebabkan defisiensi koenzim B12 .

Kehilangan Lemak selama Hibernasi Beruang mengeluarkan sekitar 25 106 J/hari selama periode hibernasi, 28.
yang dapat berlangsung selama tujuh bulan. Energi yang dibutuhkan untuk mempertahankan hidup diperoleh dari oksidasi
asam lemak. Berapa penurunan berat badan (dalam kilogram) yang terjadi setelah tujuh bulan? Bagaimana ketosis dapat
diminimalkan selama hibernasi? (Asumsikan oksidasi lemak menghasilkan 38 kJ/g.)

Jawab Jika katabolisme lemak menghasilkan 38 kJ/g, atau 3,8 104 kJ/kg, dan beruang mengeluarkan
25 106 J/hari, atau 2,5 104 kJ/hari, maka beruang akan kehilangan

(2,5 104 kJ/hari)/(3,8 104 kJ/kg) 0,66 kg/hari

dan dalam 7 bulan, atau 210 hari, akan kalah

0,66 kg/hari 210 hari 140 kg

Untuk meminimalkan ketosis, degradasi protein nonesensial yang lambat namun stabil akan menghasilkan
produk karbon tiga, empat, dan lima yang penting untuk pembentukan glukosa oleh glukoneogen sis. Ini akan
menghindari penghambatan siklus asam sitrat yang terjadi ketika oksaloasetat ditarik dari siklus untuk
digunakan untuk glukoneogenesis. Siklus asam sitrat dapat terus menurunkan asetil-KoA, daripada
mengubahnya menjadi pembentukan badan keton.
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-208 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-17:
Machine Translated by Google

S-208 Bab 17 Katabolisme Asam Lemak

Masalah Analisis Data


29. Oksidasi Lemak Trans Lemak tak jenuh dengan ikatan rangkap trans biasanya disebut sebagai “lemak
trans.” Ada banyak diskusi tentang efek lemak trans diet pada kesehatan. Dalam penyelidikan mereka
tentang efek metabolisme asam lemak trans pada kesehatan, Yu dan rekan (2004) menunjukkan bahwa
model asam lemak trans diproses secara berbeda dari isomer cisnya. Mereka menggunakan tiga asam
lemak 18-karbon terkait untuk mengeksplorasi perbedaan oksidasi antara isomer cis dan trans dari
asam lemak berukuran sama.

HAI

OH
Asam stearat
(asam oktadekenoat)

HAI

OH
Asam oleat
(asam cis-9 -oktadekenoat)

HAI

OH
Asam elaidat
( asam trans-9 -oktadekenoat)

Para peneliti menginkubasi turunan koenzim A dari setiap asam dengan mitokondria hati tikus selama
5 menit, kemudian memisahkan turunan CoA yang tersisa di setiap campuran dengan HPLC (kromatografi
cair kinerja tinggi). Hasilnya ditunjukkan di bawah ini, dengan panel terpisah untuk tiga percobaan.

Stearoyl-CoA Oleoyl-CoA Elaidoyl-CoA +


+ mitokondria + mitokondria mitokondria

cÿ9C18-CoA
tÿ9C18-CoA

C18-CoA tÿ5C14-CoA

ADALAH

ADALAH

ADALAH

Absorbansi
pada
254
nm

cÿ5C14-CoA

12 21 30 12 21 30 12 21 30
jam (menit)

Pada gambar, IS menunjukkan standar internal (pentadecanoyl-CoA) yang ditambahkan ke dalam


campuran, setelah reaksi, sebagai penanda molekuler. Para peneliti menyingkat turunan CoA sebagai
berikut: stearoyl-CoA, C18-CoA; cis-5 -tetradecenoyl-CoA, c5 C14-CoA; oleoyl-CoA, c9 C18-
CoA; trans-5 -tetradecenoyl-CoA, t5 C14-CoA; dan elaidoyl-CoA, t9 C18- CoA.
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-209 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-17:
Machine Translated by Google

Bab 17 Katabolisme Asam Lemak S-209

HAI

S-CoA
cis-5 -Tetradecenoyl-CoA

HAI

S-CoA
trans-5 -Tetradecenoyl-CoA

(a) Mengapa Yu dan rekannya perlu menggunakan turunan CoA daripada asam lemak bebas di dalamnya
percobaan?
(b) Mengapa tidak ada turunan CoA dengan berat molekul lebih rendah yang ditemukan dalam reaksi
dengan stearoyl-CoA? (c) Berapa putaran oksidasi yang diperlukan untuk mengubah oleoyl-CoA dan
elaidoyl CoA menjadi cis-5 -tetradecenoyl-CoA dan trans-5 -tetradecenoyl-CoA?
Ada dua bentuk enzim asil-KoA dehidrogenase (lihat Gambar 17–8a): asil-KoA dehidrogenase
rantai panjang (LCAD) dan asil-KoA dehidrogenase rantai sangat panjang (VLCAD). Yu dan rekan
kerjanya mengukur parameter kinetik kedua enzim. Mereka menggunakan turunan CoA dari tiga asam
lemak: tetradecanoyl-CoA (C14-CoA), cis-5 -tetradecenoyl-CoA (c5 C14-CoA), dan trans-5
-tetradecenoyl-CoA (t5 C14-CoA). Hasilnya ditunjukkan di bawah ini. (Lihat Bab 6 untuk definisi
parameter kinetik.)

LCAD VLCAD

C14- c5 C14- t5 C14- C14- c5 C14- t5 C14-


Dengan Dengan Dengan Dengan Dengan Dengan

Vmaks 3.3 3.0 2.9 1.4 0,32 0,88


Km 0,41 0,40 1.6 0,57 0,44 0,97
kcat 9.9 8.9 8.5 2.0 0,42 1.12
kcat/Km 24 22 5 4 1 1

(d) Untuk LCAD, Km berbeda secara dramatis untuk substrat cis dan trans. Berikan penjelasan yang masuk
akal untuk pengamatan ini dalam kaitannya dengan struktur molekul substrat. (Petunjuk: Anda mungkin
ingin merujuk ke Gambar 10–
2.) (e) Parameter kinetik dari kedua enzim relevan dengan pemrosesan diferensial asam lemak ini hanya
jika reaksi LCAD atau VLCAD (atau keduanya) adalah laju -membatasi langkah di jalur jalan. Bukti
apa yang ada untuk mendukung asumsi ini?
(f) Bagaimana parameter kinetik yang berbeda ini menjelaskan tingkat turunan CoA yang berbeda
ditemukan setelah inkubasi mitokondria hati tikus dengan stearoyl-CoA, oleoyl-CoA, dan elaidoyl-CoA
(ditunjukkan pada gambar tiga panel)?
Yu dan rekan kerja mengukur spesifisitas substrat thioesterase mitokondria hati tikus, yang
menghidrolisis asil-CoA menjadi CoA dan asam lemak bebas (lihat Bab 21). Enzim ini kira-kira dua kali
lebih aktif dengan tioester C14-CoA dibandingkan dengan tioester C18-
CoA. (g) Penelitian lain menunjukkan bahwa asam lemak bebas dapat melewati membran. Dalam percobaan
mereka, Yu dan rekannya menemukan asam trans-5 -tetradecenoic di luar mitokondria (yaitu, di
dalam medium) yang telah diinkubasi dengan elaidoyl-CoA. Jelaskan jalur yang menyebabkan asam
trans-5 -tetradecenoic ex tramitokondria ini. Pastikan untuk menunjukkan di mana di dalam sel
berbagai transformasi terjadi, serta enzim yang mengkatalisis transformasi tersebut.
2608T_ch17sm_S199-S210 22/02/2008 14:07 Halaman S-210 puncak 111:WHQY028:Solusi Manual:Ch-17:
Machine Translated by Google

S-210 Bab 17 Katabolisme Asam Lemak

(h) Sering dikatakan dalam pers populer bahwa "lemak trans tidak dipecah oleh sel-sel Anda dan malah menumpuk di tubuh Anda."
Dalam arti apa pernyataan ini benar dan dalam arti apa penyederhanaan yang berlebihan?

Menjawab

(a) Asam lemak diubah menjadi turunan CoA oleh enzim di dalam sitoplasma; itu
asil-KoA kemudian diimpor ke mitokondria untuk oksidasi. Mengingat bahwa para peneliti menggunakan
mitokondria terisolasi, mereka harus menggunakan turunan CoA. (b) Stearoyl-CoA
dengan cepat diubah menjadi 9 asetil-KoA melalui jalur -oksidasi. Semua termediat bereaksi dengan cepat dan tidak
ada yang terdeteksi pada tingkat yang signifikan. (c) Dua putaran. Setiap putaran menghilangkan
dua atom karbon, sehingga dua putaran mengubah
18-karbon menjadi asam lemak 14-karbon dan 2 asetil-KoA. (d) Km
lebih tinggi untuk isomer trans daripada cis, sehingga konsentrasi isomer trans yang lebih tinggi diperlukan untuk laju
penguraian yang sama . Secara kasar, trans isomer mengikat kurang baik dari cis, mungkin karena perbedaan
dalam bentuk, meskipun tidak pada situs target enzim, mempengaruhi pengikatan substrat ke enzim. (e)
Substrat untuk LCAD/VLCAD dibuat secara berbeda, tergantung pada sub tertentu

strata; ini diharapkan untuk langkah pembatas laju di jalur.


(f) Parameter kinetik menunjukkan bahwa isomer trans adalah substrat yang lebih buruk daripada cis untuk LCAD,
tetapi ada sedikit perbedaan untuk VLCAD. Karena merupakan substrat yang lebih buruk, isomer trans
terakumulasi ke tingkat yang lebih tinggi daripada cis. (g) Satu jalur
yang mungkin ditunjukkan di bawah ini (menunjukkan mitokondria "di dalam" dan "di luar").

karnitin karnitin 2 putaran


Elaidoyl-CoA asiltransferase I elaidoyl-carnitine (di mengangkut elaidoyl-carnitine (di asiltransferase II elaidoyl-CoA oksidasi

(di luar) luar) dalam) (di dalam)

5-trans-tetradecenoyl-CoA (di thioesterase Asam 5-trans-tetradecanoic difusi Asam 5-trans-tetradecanoic


dalam) (di dalam) (di luar)

(h) Itu benar sejauh lemak trans dipecah kurang efisien daripada lemak cis, dan dengan demikian lemak trans dapat
"bocor" keluar dari mitokondria. Tidak benar mengatakan bahwa lemak trans tidak dipecah oleh sel; mereka
dipecah, tetapi pada tingkat yang lebih lambat dari lemak cis.

Referensi
Yu, W., Liang, X., Ensenauer, R., Vockley, J., Sweetman, L., & Schultz, H. (2004) Oksidasi bocor dari asam lemak trans.
J.Biol. kimia 279, 52.160–52.167.
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-211 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

bab
Oksidasi Asam
Amino dan
Produksi Urea 18
1. Produk Transaminasi Asam Amino Sebutkan dan gambarkan struktur asam a-keto
dihasilkan ketika masing-masing asam amino berikut mengalami transaminasi dengan a-ketoglutarat: (a) aspartat, (b)
glutamat, (c) alanin, (d) fenilalanin.

Menjawab

HAI

(A) OOC CH2 C MENDEKUT Oksaloasetat

HAI

(B) OOC CH2 CH2 COO C -Ketoglutarat

HAI

(C) CH3 C MENDEKUT Piruvat

HAI

(D ) CH2 C MENDEKUT Fenilpiruvat

2. Pengukuran Aktivitas Alanin Aminotransferase Aktivitas (laju reaksi) alanin


aminotransferase biasanya diukur dengan memasukkan dehidrogenase laktat murni dan NADH berlebih dalam sistem reaksi. Laju
hilangnya alanin sama dengan laju hilangnya NADH yang diukur secara spektrofotometri. Jelaskan cara kerja pengujian ini.

Answer Pengukuran aktivitas alanine aminotransferase dengan mengukur reaksi produknya dengan laktat dehidrogenase
adalah contoh uji “coupled”. Produk transaminasi (piruvat) dengan cepat dikonsumsi dalam “reaksi indikator” berikutnya,
yang dikatalisis oleh laktat dehidrogenase berlebih. Dehidrogenase menggunakan kofaktor NADH, yang penghilangannya
mudah diukur dengan mengamati laju penurunan penyerapan NADH pada 340 nm. Jadi, laju hilangnya NADH adalah
ukuran laju reaksi aminotransferase, jika NADH dan laktat dehidrogenase ditambahkan secara berlebihan.

3. Alanin dan Glutamin dalam Darah Plasma darah manusia normal mengandung semua asam amino yang dibutuhkan untuk sintesis
protein tubuh, tetapi tidak dalam konsentrasi yang sama. Alanin dan glutamin hadir dalam konsentrasi yang jauh lebih tinggi
daripada asam amino lainnya. Sarankan mengapa.

Answer Jaringan otot dapat mengubah asam amino menjadi asam keto ditambah amonia, kemudian mengoksidasi asam
keto untuk menghasilkan ATP untuk kontraksi otot. Namun, urea tidak dapat dibentuk

S-211
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-212 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

S-212 Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea

otot. Alanin dan glutamin mengangkut gugus amino dalam aliran darah ke hati (lihat Gambar 18-2) dari otot dan
jaringan nonhepatik lainnya. Di otot, gugus amino dari semua asam amino ditransfer ke piruvat atau glutamat untuk
membentuk alanin atau glutamin, dan asam amino yang terakhir ini diangkut ke hati.

4. Distribusi Nitrogen Amino Jika makanan Anda kaya akan alanin tetapi kekurangan aspartat, apakah Anda akan menunjukkan
tanda-tanda kekurangan aspartat? Menjelaskan.

Jawaban Tidak; aspartat mudah dibentuk oleh transfer gugus amino alanin ke ox aloacetate. Tingkat seluler
aminotransferase cukup untuk menyediakan semua asam amino dengan cara ini, jika asam a-keto tersedia.

5. Laktat versus Alanin sebagai Bahan Bakar Metabolik: Biaya Pembuangan Nitrogen Ketiga karbon dalam laktat dan alanin
memiliki tingkat oksidasi yang identik, dan hewan dapat menggunakan salah satu sumber karbon sebagai bahan bakar
metabolisme. Bandingkan hasil ATP bersih (mol ATP per mol substrat) untuk oksidasi lengkap (menjadi CO2 dan H2O) laktat
versus alanin ketika biaya ekskresi nitrogen sebagai urea disertakan.

MENDEKUT MENDEKUT

A A

saya OH
HAI

C H3NHAI

C OH
A A

HH C
HAI HAI

HH C
HAI HAI

A A

H H
Laktat Alanin

Answer Laktat dan alanin diubah menjadi piruvat oleh masing-masing dehidrogenase, laktat dehidrogenase dan
alanin dehidrogenase, menghasilkan piruvat dan NADH + H+ dan, dalam kasus alanin, NH4 12,5 mol ATP melalui
+
siklus asam sitrat dan fosforilasi . Oksidasi sempurna 1 mol piruvat menjadi CO2 dan H2O menghasilkan
oksidatif (lihat Tabel 16 –1). Selain itu, NADH dari setiap reaksi dehidrogenase menghasilkan 2,5 mol ATP per mol
NADH yang direoksidasi. Jadi oksidasi menghasilkan 15 mol ATP per mol laktat. Pembentukan urea menggunakan
ekuivalen 4 mol ATP per mol urea yang terbentuk (Gbr. 18-10), atau 2 mol ATP per mol NH4 per mol alanin teroksidasi.

+
. Mengurangkan nilai ini dari hasil energi alanin menghasilkan 13 mol ATP

6. Toksisitas Amoniak Akibat Diet Kekurangan Arginine Dalam sebuah penelitian yang dilakukan beberapa tahun yang lalu, kucing
dipuasakan semalaman kemudian diberi makan tunggal lengkap dengan semua asam amino kecuali arginine.
Dalam waktu 2 jam, kadar amonia darah meningkat dari tingkat normal 18 mg/L menjadi 140 mg/L, dan kucing menunjukkan gejala
klinis keracunan amonia. Kelompok kontrol yang diberi diet asam amino lengkap atau diet asam amino di mana arginin
digantikan oleh ornitin tidak menunjukkan gejala klinis yang tidak biasa. (a) Apa peran puasa dalam percobaan? (b) Apa yang
menyebabkan kadar amonia meningkat pada kelompok eksperimen?
Mengapa tidak adanya argi sembilan menyebabkan keracunan amonia? Apakah arginin merupakan asam amino esensial pada
kucing? Mengapa atau mengapa tidak? (c) Mengapa ornitin dapat diganti dengan arginin?

Menjawab

(a) Puasa mengakibatkan penurunan kadar glukosa darah. Pemberian makan selanjutnya dari diet bebas arginin
menyebabkan katabolisme cepat dari semua asam amino yang dicerna, terutama asam glukogenik.
Katabolisme ini diperburuk oleh kurangnya asam amino esensial, yang mencegah sintesis protein. (b)
Deaminasi oksidatif asam amino
menyebabkan peningkatan kadar amonia. Selain itu, kekurangan arginin (zat antara dalam siklus urea) memperlambat
konversi amonia menjadi urea. Sintesis arginin (atau ornitin) pada kucing tidak cukup untuk memenuhi
kebutuhan yang dipaksakan oleh tekanan percobaan ini, menunjukkan bahwa arginin adalah asam amino
esensial.
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-213 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea S-213

(c) Ornitin (atau sitrulin) dapat menggantikan arginin karena ia juga merupakan zat antara dalam siklus
urea.

7. Oksidasi Glutamat Tuliskan serangkaian persamaan setimbang, dan persamaan keseluruhan untuk jaringannya
reaksi, menggambarkan oksidasi 2 mol glutamat menjadi 2 mol a-ketoglutarat dan 1 mol urea.

Menjawab

H2O glutamat NAD 88n a-ketoglutarat NH4 NADH H


NH4 2ATP H2O CO2 88n karbamoil fosfat 2ADP Pi 3H
Carbamoyl phosphate ornithine 88n citrulline Pi H
Citrulline aspartate ATP 88n argininosuccinate AMP PPi H
Argininosuksinat 88n arginin fumarat
Fumarat H2O 88n malat
Malat NAD 88n oksaloasetat NADH H
Oksaloasetat glutamat 88n aspartat a-ketoglutarat
Arginin H2O 88n urea ornitin
Jumlah dari reaksi tersebut adalah

2 Glutamat CO2 4H2O 2NAD 3ATP 88n 2 a-ketoglutarat


2NADH 7H urea 2ADP AMP PPi 2Pi (1)
Tiga reaksi tambahan perlu dipertimbangkan:

AMP ATP 88n 2ADP (2)


O2 8H 2NADH 6ADP 6Pi 88n 2NAD 6ATP 8H2O (3)
H2O PPi 88n 2Pi H (4)

Menjumlahkan empat persamaan terakhir:

2 Glutamat CO2 O2 2ADP 2Pi 88n 2 a-ketoglutarat urea 3H2O 2ATP

8. Transaminasi dan Siklus Urea Aspartate aminotransferase memiliki aktivitas tertinggi dari semua
aminotransferase hati mamalia. Mengapa?

Answer Gugus amino kedua yang dimasukkan ke dalam urea ditransfer dari aspartat. Asam amino
ini dihasilkan dalam jumlah besar melalui transaminasi antara oksaloasetat dan gluta mate (dan banyak
asam amino lainnya), dikatalisis oleh aspartat aminotransferase. Kira-kira setengah dari semua gugus
amino yang diekskresikan sebagai urea harus melewati reaksi aspartat aminotransferase, dan hati
mengandung kadar aminotransferase ini lebih tinggi daripada yang lain.

9. Kasus terhadap Diet Protein Cair Diet penurunan berat badan gencar dipromosikan beberapa tahun
lalu membutuhkan asupan harian "protein cair" (sup gelatin terhidrolisis), air, dan bermacam-macam vitamin. Semua
makanan dan minuman lainnya harus dihindari. Orang yang menjalani diet ini biasanya kehilangan 10 hingga 14 lb
pada minggu pertama.
(a) Lawan berpendapat bahwa penurunan berat badan hampir seluruhnya karena kehilangan air dan akan segera
kembali setelah diet normal dilanjutkan. Apa dasar biokimia untuk argumen ini? (b) Sejumlah orang
yang menjalani diet ini meninggal. Apa saja bahaya yang melekat pada diet dan bagaimana caranya
dapatkah mereka menyebabkan kematian?

Menjawab

(a) Seseorang yang dietnya hanya terdiri dari protein harus menggunakan asam amino sebagai prinsipal
sumber bahan bakar metabolisme. Karena katabolisme asam amino memerlukan penghapusan
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-214 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

S-214 Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea

nitrogen sebagai urea, proses ini menghabiskan air dalam jumlah besar untuk mengencerkan dan
mengeluarkan urea dalam urin. Selanjutnya, elektrolit dalam "protein cair" harus diencerkan dengan air dan
dikeluarkan. Jika kehilangan air harian yang sangat besar melalui ginjal ini tidak diimbangi dengan asupan air
yang cukup, maka terjadilah kehilangan air tubuh. (b) Saat mempertimbangkan manfaat gizi
dari protein, ingatlah jumlah total asam amino yang dibutuhkan untuk sintesis protein dan distribusi asam amino
dalam protein makanan. Gelatin mengandung distribusi asam amino yang tidak seimbang secara nutrisi.

Karena sejumlah besar gelatin dicerna dan kelebihan asam amino dikatabolisme, kapasitas siklus urea dapat
terlampaui, menyebabkan toksisitas amonia. Hal ini semakin diperumit oleh dehidrasi yang mungkin terjadi
akibat ekskresi urea dalam jumlah besar. Kombinasi dari kedua faktor ini dapat menyebabkan koma dan
kematian.

10. Asam Amino Ketogenik Asam amino mana yang secara eksklusif bersifat ketogenik?

Jawab Lisin dan leusin secara eksklusif bersifat ketogenik. Asam amino ini terdegradasi sepenuhnya menjadi asetil-
KoA dan asetoasetil-KoA, dan tidak ada bagian kerangka karbonnya yang dapat digunakan untuk sintesis glukosa.
Leusin sangat umum dalam protein. Degradasinya memberikan kontribusi substansial terhadap ketosis dalam kondisi
kelaparan.

11. Cacat Genetik pada Metabolisme Asam Amino: Riwayat Kasus Seorang anak berusia dua tahun dibawa ke rumah sakit. Ibunya
mengatakan bahwa dia sering muntah, terutama setelah menyusu. Berat badan dan perkembangan fisik anak di bawah normal.
Rambutnya, meskipun gelap, terdapat bercak-bercak putih. Sampel urin yang diberi perlakuan dengan besi klorida (FeCl3)
memberikan warna hijau yang merupakan ciri adanya fenilpiruvat. Analisis kuantitatif sampel urin memberikan hasil yang
ditunjukkan pada tabel.

Konsentrasi (mM)
Zat urin pasien Urin biasa

Fenilalanin 7.0 0,01

Fenilpiruvat 4.8 0

Fenilaktat 10.3 0

(a) Sarankan enzim mana yang mungkin kurang pada anak ini. Usulkan pengobatan. (b) Mengapa
fenilalanin muncul dalam urin dalam jumlah besar? (c) Apa sumber fenilpiruvat dan
fenilaktat? Mengapa jalur ini (biasanya tidak berfungsi) berperan saat konsentrasi fenilalanin meningkat?

(d) Mengapa rambut anak laki-laki itu terdapat bercak-bercak putih?

Menjawab

(a) Karena fenilalanin (dan fenilketon terkaitnya) terakumulasi pada pasien ini,
kemungkinan bahwa enzim pertama dalam katabolisme fenilalanin, fenilalanin hidroksilase (juga disebut
fenilalanin-4-monooksigenase), rusak atau hilang (lihat Gambar 18–23). Perawatan yang paling tepat untuk
pasien dengan penyakit ini, yang dikenal sebagai fenilketonuria (PKU), adalah dengan menetapkan diet
rendah fenilalanin yang menyediakan cukup asam amino untuk memenuhi kebutuhan sintesis protein.

(b) Fenilalanin muncul dalam urin karena tingginya kadar asam amino ini terakumulasi dalam aliran darah dan tubuh
berusaha untuk membuangnya.
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-215 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea S-215

(c) Fenilalanin diubah menjadi fenilpiruvat melalui transaminasi, suatu reaksi yang memiliki konstanta
kesetimbangan sekitar 1,0. Fenilaktat dibentuk dari fenilpiruvat melalui reduksi (lihat Gambar 18–
25). Jalur ini penting hanya ketika fenilalanin hidroksilase rusak. (d) Jalur katabolik normal
fenilalanin adalah melalui
tirosin, prekursor
melanin, pigmen gelap yang biasanya terdapat pada rambut. Penurunan kadar tirosin pada pasien
dengan fenilketonuria mengakibatkan berbagai tingkat kehilangan pigmen.

12. Peran Cobalamin dalam Katabolisme Asam Amino Anemia pernisiosa disebabkan oleh gangguan penyerapan
vitamin B12. Apa efek gangguan ini pada katabolisme asam amino? Apakah semua asam amino sama-sama
terpengaruh? (Petunjuk: lihat Kotak 17–2.)

Answer Katabolisme kerangka karbon valin, isoleusin, dan metionin berpasangan karena tidak adanya
mutase metilmalonil-KoA fungsional. Enzim ini membutuhkan koenzim B12 sebagai kofaktor, dan
kekurangan vitamin ini menyebabkan peningkatan kadar asam metil malonat (asidemia metilmalonik).
Gejala dan efek defisiensi ini parah (lihat Tabel 18–2 dan Kotak 18–2).

13. Diet Vegetarian Diet vegetarian dapat memberikan antioksidan tingkat tinggi dan profil lipid yang dapat membantu
mencegah penyakit koroner. Namun, mungkin ada beberapa masalah terkait. Sampel darah diambil dari sekelompok
besar subyek sukarelawan yang vegan (vegetarian ketat: tidak ada produk hewani), lactovegetarian (vegetarian
yang mengonsumsi produk susu), atau omnivora (individu dengan pola makan normal dan bervariasi termasuk
daging). Dalam setiap kasus, para relawan telah mengikuti diet tersebut selama beberapa tahun. Tingkat darah
baik homosistein dan metilmalonat meningkat pada kelompok vegan, agak lebih rendah pada kelompok
laktovegetarian, dan jauh lebih rendah pada kelompok omnivora. Menjelaskan.

Jawaban Pola makan vegan kekurangan vitamin B12, menyebabkan peningkatan homosistein dan
metilmalonat (masing-masing mencerminkan defisiensi metionin sintase dan asam metilmalonik mutase)
pada individu yang menjalani diet selama beberapa tahun. Produk susu menyediakan beberapa vitamin
B12 dalam diet laktovegetarian.

14. Anemia Pernicious Kekurangan vitamin B12 dapat timbul dari beberapa penyakit genetik langka yang
menyebabkan kadar B12 rendah meskipun diet normal termasuk sumber daging dan susu kaya B12. Kondisi ini
tidak dapat diobati dengan suplemen diet B12 . Menjelaskan.

Answer Bentuk genetik dari anemia pernisiosa umumnya muncul sebagai akibat dari kerusakan pada
jalur yang memediasi penyerapan vitamin B12 makanan (lihat Kotak 17–2, hal. 658). Karena suplemen
diet tidak terserap di usus, kondisi ini diobati dengan menyuntikkan suplemen B12 langsung ke aliran
darah.

15. Mekanisme Reaksi Piridoksal Fosfat Treonin dapat dipecah oleh enzim threo sembilan dehidratase, yang
mengkatalisis konversi treonin menjadi -ketobutirat dan amonia. Enzim menggunakan PLP sebagai kofaktor.
Sarankan mekanisme untuk reaksi ini, berdasarkan mekanisme pada Gambar 18-6. Perhatikan bahwa reaksi ini
mencakup eliminasi pada karbon treonin.

OH NH3 HAI

A A

PLP
HAI

CH3 CHOCHO MENDEKUT


CH3OCH2O _ C MENDEKUT
NH3 H2O
treonin
Treonina dehidratase
-Ketobutirat

Answer Mekanismenya identik dengan mekanisme serin dehidratase (lihat Gambar 18–20a, hlm. 693)
kecuali bahwa gugus ekstra metil dari treonin dipertahankan, menghasilkan -ketobutirat, bukan piruvat.
Machine Translated by Google
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-216 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:

S-216 Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea

CH 3 CH 3
L-Treonina CH 3
KE CH H CH 3 CH NH3
H CH
HC MENDEKUT
KE CH HCH Lampu
HCH
NH3 NH
:
COO BHC dll. :NH2
CH CH 3 CH 3
NH 2OH 2OH
KE CH 2 CH 2
H CH H
P
N N C MENDEKUT C MENDEKUT
KE C
Lys CH CH3 N Lys CH NH3
P NH 2 HAI
KE H KE
dll.
P CH3 N dll.
P b-Ketobutirat
H
CH3 N Perantara CH3 N
H H
dasar Schiff

16. Jalur Karbon dan Nitrogen dalam Metabolisme Glutamat Ketika [2-14C, 15N] glutamat mengalami degradasi oksidatif di hati
tikus, di mana atom-atom dari metabolit berikut akan ditemukan masing-masing isotop: ( a) urea, ( b) suksinat, (c) arginin, (d)
sitrulin, (e) ornitin, (f) aspartat?

H MENDEKUT

15 14
H N C H

H CH2

CH2

MENDEKUT

glutamat berlabel

Menjawab

(a) Gugus amino pada urea mengandung 15N, hasil dari produksi glutamat dehidrogenase
15NH4 + atau dari transaminase yang menghasilkan aspartat berlabel 15N.

15NH2 CO15NH2 _

(b) Setelah kehilangan gugus amino, [2-14C] a-ketoglutarat dimetabolisme dalam asam sitrat
siklus. Suksinat yang terbentuk diberi label pada gugus karboksil.

CH2 OO14C CH2 14COO

(c) Arginin yang terbentuk dalam siklus urea mengandung 15N di kedua nitrogen guanidino.

15 KECIL

R C. KECIL 15NH2

(d) Citrulline yang terbentuk pada siklus urea mengandung 15N pada gugus karboksamida.

HAI

15
R C. KECIL NH2
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-217 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea S-217

(e) Tidak ada N berlabel ditemukan di


ornithine. (f) Aspartat mengandung 15N dalam gugus aminonya sebagai hasil transaminasi dari glutamat.
Ini juga mengandung 14C dalam gugus karboksilnya sebagai hasil konversi suksinat menjadi oksaloak
etat (seperti pada (b)).

15NH2
OO14C C CH2 14COO

Catatan: pada (c), (d), dan (e), intermediet siklus urea ini akan mengandung kadar 14C yang
rendah sebagai hasil sintesis ornitin dari glutamat yang sangat lemah.

17. Strategi Kimia Katabolisme Isoleusin Isoleusin didegradasi dalam enam langkah menjadi propionil-KoA
dan asetil-KoA.

OO HAI S-CoA
C C

H3N C H CH2
6 langkah
H C CH3 CH3 Propionil-CoA

CH2
HAI S-CoA
CH3 C
Isoleusin
CH3 Asetil-KoA

(a) Proses kimia degradasi isoleusin mencakup strategi yang analog dengan yang digunakan dalam
siklus asam sitrat dan b oksidasi asam lemak. Perantara degradasi isoleusin (I ke V) yang ditunjukkan di
bawah ini tidak dalam urutan yang benar. Gunakan pengetahuan dan pemahaman Anda tentang siklus
asam sitrat dan jalur oksidasi-b untuk mengatur perantara dalam urutan metabolisme yang tepat untuk
degradasi isoleusin.

HAI S-CoA OO S-CoA S-CoA HAI S-CoA


C C C C C H

CCH3 BERSAMA H CCH3 H C CH3 H C


H C C KE C CH3
HCH3 C HAI CH2
CH3 CH2 CH3 CH3 CH3
IV
CH3
AKU AKU AKU DI DALAM

SAYA II

(b) Untuk setiap langkah yang Anda usulkan, jelaskan proses kimianya, berikan contoh analog dari siklus
asam sitrat atau jalur b-oksidasi (jika memungkinkan), dan tunjukkan kofaktor yang diperlukan.

Menjawab
1 2 34 5 6
(a) Isoleusin ÿ II ÿ IV ÿ I ÿ V ÿ III ÿ asetil-KoA + propionil-KoA
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-218 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

S-218 Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea

(b) Langkah 1 adalah transaminasi yang tidak memiliki reaksi analog; itu membutuhkan PLP. Langkah 2
adalah dekarboksilasi oksidatif yang mirip dengan reaksi piruvat dehidrogenase; itu membutuhkan
NAD, TPP, lipoate, FAD. Langkah 3 adalah oksidasi yang mirip dengan reaksi suksinat dehidrogenase;
itu membutuhkan FAD. Langkah 4 adalah hidrasi yang analog dengan reaksi fumarase; tidak
diperlukan kofaktor. Langkah 5 adalah oksidasi yang analog dengan reaksi malat dehirogenase dari
siklus asam sitrat; itu membutuhkan NAD+ . Langkah 6 adalah tiolisis yang analog dengan langkah
pembelahan akhir oksidasi b yang dikatalisis oleh tiolase; itu membutuhkan CoA.

18. Peran Pyridoxal Phosphate dalam Metabolisme Glycine Enzim serin hidroksimetiltrans
ferase membutuhkan piridoksal fosfat sebagai kofaktor. Usulkan mekanisme reaksi yang dikatalisis oleh enzim ini, ke
arah degradasi serin (produksi glisin). (Petunjuk: lihat Gambar 18–19 dan 18–20b.)

Jawaban Lihat mekanisme di bawah ini. Formaldehida yang dihasilkan pada langkah kedua bereaksi
cepat dengan tetrahidrofolat pada sisi aktif enzim untuk menghasilkan N5 ,N10-metilena tetrahy drofolat
(lihat Gambar 18–17).

dll.

H Lampu
N
H OH
Lampu CH NH3
OOC C C H KE
P
NH3 H dll.
Serin CH3 N
H
PLP

H B Enz
H HAI H
OOC C HC OOC C
NH H HAI
NH HB dll.
C H
CH CH
H
KE C KE C
P P

CH3 N CH3 N
H H

H
Glisin
dll.
OOC CH H

OOC CH H
NH Lampu
N
CH NH3 NH3 Lampu CH
KE KE
P P
dll.
CH3 N CH3 N
H H
PLP
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-219 puncak 111:WHQY028:Solusi Manual:Ch-18:
Machine Translated by Google

Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea S-219

19. Jalur Paralel untuk Degradasi Asam Amino dan Asam Lemak Kerangka karbon leusin terdegradasi
oleh serangkaian reaksi analog dengan siklus asam sitrat dan oksidasi b.
Untuk setiap reaksi, (a) sampai (f), tunjukkan jenisnya, berikan contoh analog dari siklus asam sitrat
atau jalur b-oksidasi (jika memungkinkan), dan catat kofaktor yang diperlukan.

H NH3
CH3 C CH2 C MENDEKUT

CH3 H
Leusin

(A)

H HAI

CH3 C CH2 C MENDEKUT

CH3
-Ketoisokaproat
CoA-SH
(B)

CO2

H HAI

CH3 C CH2 C S-CoA

CH3
isovaleril-CoA
(C)

HAI

CH3 C CC S-CoA

H3C H
-Methylcrotonyl-CoA

(D)
HCO3

HAI

OOC CH2 C C C S-CoA

H3C H
-Methylglutaconyl-CoA

(Dia)
H2O

OH HAI

OOC CH2 C CH2 C S-CoA

CH3
-Hidroksi-metilglutaril-KoA
(F )

HAI HAI

OOC CH2 C CH3 CH3 C S-CoA


Acetoacetate Asetil-KoA
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman Puncak S-220 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

S-220 Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea

Menjawab

(a) Transaminasi; tidak ada analogi di kedua jalur; membutuhkan PLP. (b)
dekarboksilasi oksidatif; analog dengan dekarboksilasi oksidatif piruvat menjadi asetil KoA sebelum masuk ke dalam
siklus asam sitrat, dan a-ketoglutarat menjadi suksinil-KoA dalam siklus asam sitrat; membutuhkan NAD+ ,
FAD, lipoat, tiamina pirofosfat. (c) Dehidrogenasi (oksidasi); analog dengan dehidrogenasi
suksinat menjadi fumarat dalam siklus asam sitrat dan asil lemak-KoA menjadi enoil-KoA dalam oksidasi b; membutuhkan
FAD. (d) Karboksilasi; tidak ada reaksi analog dalam siklus asam sitrat atau b oksidasi; membutuhkan ATP

dan biotin.

(e) Hidrasi; analog dengan hidrasi fumarat menjadi malat dalam siklus asam sitrat dan
enoyl-CoA menjadi 3-hydroxyacyl-CoA dalam b oksidasi; tidak ada kofaktor.
(f) Membalikkan reaksi aldol; analog dengan kebalikan reaksi sintase sitrat dalam siklus asam sitrat dan identik dengan
pembelahan b-hidroksi-b-metilglutaril-KoA dalam pembentukan badan keton; tidak ada kofaktor.

Masalah Analisis Data


20. Penyakit Urine Sirup Maple Gambar 18–28 menunjukkan jalur degradasi asam amino rantai cabang dan lokasi cacat biokimia yang
menyebabkan penyakit urine sirup maple. Temuan awal yang akhirnya mengarah pada penemuan cacat pada penyakit ini
disajikan dalam tiga makalah yang diterbitkan pada akhir 1950-an dan awal 1960-an. Masalah ini menelusuri sejarah temuan
dari pengamatan klinis awal hingga usulan mekanisme biokimia.

Menkes, Hurst, dan Craig (1954) mempresentasikan kasus empat saudara kandung, yang semuanya meninggal mengikuti
gejala yang sama. Dalam keempat kasus tersebut, kehamilan dan kelahiran ibu berjalan normal.
3 sampai 5 hari pertama kehidupan setiap anak juga normal. Namun segera setelah itu setiap anak mulai mengalami kejang-
kejang, dan anak-anak tersebut meninggal antara usia 11 hari dan 3 bulan. Otopsi menunjukkan pembengkakan otak yang cukup
besar pada semua kasus. Urine anak-anak berbau "sirup maple" yang kuat dan tidak biasa, mulai sekitar hari ketiga kehidupan.

Menkes (1959) melaporkan data yang dikumpulkan dari enam anak lagi. Semua menunjukkan gejala yang mirip
dengan yang dijelaskan di atas, dan meninggal dalam waktu 15 hari hingga 20 bulan setelah lahir. Dalam satu kasus, Menkes
dapat memperoleh sampel urin selama bulan-bulan terakhir kehidupan bayi. Ketika dia mengolah urin dengan 2,4-
dinitrophenylhydrazone, yang membentuk endapan berwarna dengan senyawa keto, dia menemukan tiga asam -keto dalam
jumlah yang luar biasa besar:

MENDEKUT MENDEKUT MENDEKUT

BERSAMA BERSAMA BERSAMA

CH2 CH3 CH CH3 CH

CH3 CH CH3 CH2

CH3 CH3
-Ketoisokaproat -Ketoisovalerat -Keto--metil-n-valerat

(a) Asam-keto ini dihasilkan oleh deaminasi asam amino. Untuk masing-masing asam -keto
di atas, gambar dan beri nama asam amino asalnya.
Dancis, Levitz, dan Westall (1960) mengumpulkan data lebih lanjut yang mengarahkan mereka untuk mengajukan biokimia
cacat yang ditunjukkan pada Gambar 18–28. Dalam satu kasus, mereka memeriksa seorang pasien yang urinnya pertama
kali menunjukkan bau sirup maple saat dia berusia 4 bulan. Pada usia 10 bulan (Maret 1956), anak tersebut dirawat di rumah
sakit karena demam, dan perkembangan motoriknya sangat terbelakang.
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-221 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea S-221

Pada usia 20 bulan (Januari 1957), dia diterima kembali dan ditemukan memiliki gejala neurologis degeneratif yang terlihat
pada kasus penyakit urin sirup mapel sebelumnya; dia meninggal segera setelah itu.
Hasil analisis darah dan urinnya ditunjukkan pada tabel di bawah ini, bersama dengan nilai normal untuk setiap komponen.

Urin (mg/24 jam) Plasma (mg/ml)


Normal Sabar Normal Sabar

Asam amino) Maret 1956 Januari 1957 Januari 1957

Alanin 5–15 0,2 0,4 3.0–4.8 0,6


Asparagin dan glutamin 5–15 0,4 0 3.0–5.0 2.0
Asam aspartat 1–2 0,2 1.5 0,1–0,2 0,04
Arginin 1,5–3 0,3 0,7 0,8–1,4 0,8
Sistin 2–4 0,5 0,3 1.0–1.5 0
Asam glutamat 1,5–3 0,7 1.6 1.0–1.5 0,9
Glisin 20–40 4.6 20.7 1.0–2.0 1.5
Histidin 8–15 0,3 4.7 1.0–1.7 0,7
Isoleusin 2–5 2.0 13.5 0,8–1,5 2.2
Leusin 3–8 2.7 39.4 1.7–2.4 14.5
Lisin 2–12 1.6 4.3 1.5–2.7 1.1
Metionin 2–5 1.4 1.4 0,3–0,6 2.7
Ornitin 1–2 0 1.3 0,6–0,8 0,5
Fenilalanin 2–4 0,4 2.6 1.0–1.7 0,8
Prolin 2–4 0,5 0,3 1.5–3.0 0,9
Serin 5–15 1.2 0 1.3–2.2 0,9
Taurin 1–10 0,2 18.7 0,9–1,8 0,4
Treonina 5–10 0,6 0 1.2–1.6 0,3
Triptofan 3–8 0,9 2.3 Tidak diukur 0
Tirosin 4–8 0,3 3.7 1.5–2.3 0,7
Valin 2–4 1.6 15.4 2.0–3.0 13.1

(b) Tabel tersebut mencakup taurin, asam amino yang biasanya tidak ditemukan dalam protein. Taurin sering pro
sebagai produk sampingan dari kerusakan sel. Strukturnya adalah:

HAI

H3N CH2 CH2 JADI

HAI

Berdasarkan strukturnya dan informasi pada bab ini, kemungkinan besar asam amino pre
kursor taurin? Jelaskan alasan Anda. (c)
Dibandingkan dengan nilai normal yang diberikan dalam tabel, asam amino mana yang menunjukkan peningkatan kadar yang
signifikan dalam darah pasien pada Januari 1957? Manakah yang ada dalam urin pasien?
Berdasarkan hasil dan pengetahuan mereka tentang jalur yang ditunjukkan pada Gambar 18-28, Dancis dan rekan
penulis menyimpulkan: “walaupun tampaknya bagi penulis kemungkinan besar blok utama berada di jalur degradatif
metabolik asam amino rantai cabang, ini tidak dapat dianggap sudah pasti.”
2608T_ch18sm_S211-S222 22/02/2008 14:46 Halaman S-222 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-18:
Machine Translated by Google

S-222 Bab 18 Oksidasi Asam Amino dan Produksi Urea

(d) Bagaimana data yang disajikan di sini mendukung kesimpulan ini? (e) Data
manakah yang disajikan di sini yang tidak cocok dengan model penyakit urin sirup mapel ini? Bagaimana Anda menjelaskan
data yang tampaknya bertentangan ini?
(f) Data apa yang perlu Anda kumpulkan agar lebih aman dalam kesimpulan Anda?

Menjawab

(a) Leusin; valin; isoleusin (b) Sistein


(berasal dari sistin). Jika sistein didekarboksilasi seperti yang ditunjukkan pada
Gambar 18–6, akan menghasilkan H3NOCH2OCH2OSH, yang dapat dioksidasi menjadi taurin.
(c) Darah Januari 1957 menunjukkan kadar isoleusin, leusin,
metionin, dan valin; urin Januari 1957, isoleusin, leusin, taurin, dan valin meningkat secara signifikan.

(d) Semua pasien memiliki kadar isoleusin, leusin, dan valin yang tinggi dalam darah dan urin, yang menunjukkan
kerusakan pada pemecahan asam amino ini. Mengingat bahwa urin juga mengandung bentuk keto yang
tinggi dari ketiga asam amino ini, blok pada jalur harus terjadi setelah deaminasi tetapi sebelum dehidrogenasi
(seperti yang ditunjukkan pada Gambar 18-28).
(e) Model tidak menjelaskan tingginya kadar metionin dalam darah dan taurin dalam urin.
Tingkat taurin yang tinggi mungkin disebabkan oleh kematian sel-sel otak selama tahap akhir penyakit. Namun,
alasan tingginya kadar metionin dalam darah tidak jelas; jalur degradasi metionin tidak terkait dengan degradasi
asam amino rantai cabang. Peningkatan metionin bisa menjadi efek sekunder dari penumpukan asam
amino lainnya. Penting untuk diingat bahwa sampel Januari 1957 berasal dari individu yang sedang sekarat,
jadi membandingkan hasil darah dan urine dengan individu yang sehat mungkin tidak tepat. (f) Informasi berikut
diperlukan (dan akhirnya diperoleh oleh pekerja lain): (1) Aktivitas dehidrogenase berkurang atau hilang secara
signifikan pada individu dengan penyakit
urin sirup mapel. (2) Penyakit ini diwariskan sebagai cacat gen tunggal. (3) Cacat terjadi pada gen yang mengkode
seluruh atau sebagian dehidrogenase. (4) Cacat genetik menyebabkan produksi enzim tidak aktif.

Referensi
Dancis, J., Levitz, M., & Westall, R. (1960) Penyakit urine sirup maple: keto-aciduria rantai cabang. Pediatri 25, 72–79.
Menkes, JH (1959) Penyakit sirup maple: isolasi dan identifikasi asam organik dalam urin. Pediatri 23, 348–353.
Menkes, JH, Hurst, PL, & Craig JM (1954) Sindrom baru: disfungsi serebral kekanak-kanakan familial progresif yang terkait dengan zat
urin yang tidak biasa. Pediatri 14, 462-466.
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 223 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

bab
Oksidatif
Fosforilasi dan
Fotofosforilasi 19
1. Reaksi Oksidasi-Reduksi Kompleks dehidrogenase NADH dari rantai respirasi mitokondria mendorong
serangkaian reaksi reduksi oksidasi berikut, di mana Fe3 dan Fe2 mewakili besi di pusat besi-sulfur, Q
adalah ubikuinon, QH2 adalah ubikuinol, dan E adalah enzim:
(1) NADH H E-FMN 88n NAD E-FMNH2
(2) E-FMNH2 2Fe3 88n E-FMN 2Fe2 2H
(3) 2Fe2 2H Q 88n 2Fe3 QH2
Jumlahkan: NADH HQ 88n NAD QH2
Untuk masing-masing dari tiga reaksi yang dikatalisis oleh kompleks NADH dehydrogenase, tentukan
(a) donor elektron, (b) akseptor elektron, (c) pasangan redoks konjugasi, (d) zat pereduksi, dan (e) zat
pengoksidasi .

Jawab Reaksi oksidasi-reduksi membutuhkan donor elektron dan akseptor elektron.


Ingatlah bahwa donor elektron adalah agen pereduksi; akseptor elektron adalah oksidator.

(1) NADH adalah donor elektron (a) dan zat pereduksi (d); E-FMN adalah penerima elektron (b)
dan zat pengoksidasi (e); NAD/NADH dan E-FMN/E-FMNH2 adalah pasangan re dox konjugasi (c).

(2) E-FMNH2 adalah donor elektron (a) dan zat pereduksi (d); Fe3 adalah akseptor elektron (b) dan
oksidator (e); E-FMN/E-FMNH2 dan Fe3/Fe2 adalah pasangan redoks (c).

(3) Fe2 adalah donor elektron (a) dan zat pereduksi (d); Q adalah akseptor elektron (b) dan
oksidator (e); dan Fe3/Fe2 dan Q/QH2 adalah pasangan redoks (c).

2. Semua Bagian Ubiquinone Memiliki Fungsi Dalam transfer elektron, hanya bagian kuinon saja
ubiquinone mengalami oksidasi-reduksi; rantai samping isoprenoid tetap tidak berubah. Apa fungsi rantai
ini?

Answer Rantai samping isoprenoid yang panjang membuat ubiquinone sangat larut dalam lipid
dan memungkinkannya berdifusi dalam membran semicair. Ini penting karena ubiquinone
mentransfer elektron dari Kompleks I dan II ke Kompleks III, yang semuanya tertanam di
membran mitochondrial bagian dalam.

S-223
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 224 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

S-224 Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi

3. Penggunaan FAD daripada NAD dalam Oksidasi Suksinat Semua dehidrogenase glikolisis dan siklus asam sitrat menggunakan NAD
(E untuk NAD/NADH adalah 0,32 V) sebagai akseptor elektron kecuali suksinat dehidrogenase, yang menggunakan FAD yang terikat
secara kovalen (E untuk FAD/ FADH2 dalam enzim ini adalah 0,050 V).
Sarankan mengapa FAD adalah akseptor elektron yang lebih tepat daripada NAD dalam dehidrogenasi suksinat, berdasarkan nilai E
dari fumarat/suksinat (E dehydrogenase FAD/FADH2. 0,031), NAD/NADH, dan suksinat

Answer Dari perbedaan potensial reduksi standar (E) untuk setiap pasangan setengah reaksi, kita dapat menghitung
nilai G untuk oksidasi suksinat menggunakan NAD dan oksidasi menggunakan E-FAD.

Untuk NAD:

G nE
2(96,5 kJ/V mol)(0,32 V 0,031 V ) 68 kJ/mol

Untuk E-FAD:

G 2(96,5 kJ/V mol)(0,050 V 0,031 V ) 3,7 kJ/mol

Oksidasi suksinat oleh E-FAD didukung oleh perubahan energi bebas standar negatif, yang konsisten dengan K eq
dari 1. Oksidasi oleh NAD akan membutuhkan besar, positif, mendukung
perubahan energi bebas standar dan memiliki K persamaan
sintesis suksinat.

4. Tingkat Pengurangan Pembawa Elektron dalam Rantai Pernafasan Tingkat pengurangan masing-masing pembawa dalam rantai
pernafasan ditentukan oleh kondisi di mitokondria. Sebagai contoh, ketika NADH dan O2 berlimpah, tingkat reduksi kondisi tunak
dari pembawa berkurang ketika elektron berpindah dari substrat ke O2. Ketika transfer elektron diblokir, pembawa sebelum blok
menjadi lebih tereduksi dan yang berada di luar blok menjadi lebih teroksidasi (lihat Gambar 19–6). Untuk setiap kondisi di bawah
ini, prediksikan keadaan oksidasi ubikuinon dan sitokrom b, c1, c, dan a a3. (a) NADH dan O2 berlimpah, tetapi ditambahkan sianida
(b) NADH berlimpah, tetapi O2 habis (c) O2 berlimpah , tetapi NADH habis (d) NADH dan O2 berlimpah

Answer Seperti ditunjukkan pada Gambar 19–6, keadaan oksidasi-reduksi dari pembawa dalam sistem transfer
elektron bervariasi dengan kondisi. (a) Sianida menghambat
sitokrom oksidase (a a3); semua operator menjadi berkurang. (b) Dengan tidak adanya O2, tidak ada
akseptor elektron terminal; semua operator menjadi
berkurang.

(c) Dengan tidak adanya NADH, tidak ada pembawa yang dapat direduksi; semua pembawa menjadi teroksidasi.
(d) Ini adalah kondisi biasa untuk sel aerobik yang aktif bermetabolisme; pembawa awal (misalnya, Q) agak berkurang,
sedangkan yang terlambat (misalnya, sitokrom c) teroksidasi.

5. Pengaruh Rotenone dan Antimycin A pada Transfer Elektron Rotenone, produk alami beracun dari tanaman, sangat menghambat
dehidrogenase NADH dari mitokondria serangga dan ikan. Antimycin A, antibiotik toksik, sangat menghambat oksidasi ubiquinol.
(a) Jelaskan mengapa menelan rotenone mematikan bagi beberapa spesies
serangga dan ikan. (b) Jelaskan mengapa antimycin A adalah racun. (c) Mengingat bahwa rotenone
dan antimycin A sama-sama efektif dalam memblokir
situs masing-masing dalam rantai transfer elektron, manakah yang merupakan racun yang lebih kuat? Menjelaskan.
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 225 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi S-225

Menjawab

(a) Penghambatan NADH dehydrogenase oleh rotenone menurunkan laju aliran elektron
melalui rantai pernapasan, yang pada gilirannya menurunkan tingkat produksi ATP. Jika laju penurunan ini tidak
dapat memenuhi kebutuhan ATP-nya, organisme akan mati. (b) Antimisin A sangat
menghambat oksidasi Q tereduksi dalam rantai pernapasan, sangat membatasi laju transfer elektron dan produksi
ATP. (c) Elektron mengalir ke dalam sistem di Kompleks I dari reaksi terkait NAD
dan di
Kompleks II dari suksinat dan lemak asil-CoA melalui FAD (lihat Gambar 19–8 dan 19–16).
Antimisin A menghambat aliran elektron (melalui Q) dari semua sumber ini, sedangkan rotenon menghambat aliran
hanya melalui Kompleks I. Jadi, antimisin A adalah racun yang lebih kuat.

6. Pemisah Fosforilasi Oksidatif Pada mitokondria normal, laju transfer elektron sangat erat kaitannya dengan kebutuhan ATP. Ketika
tingkat penggunaan ATP relatif rendah, tingkat transfer elektron rendah; ketika permintaan ATP meningkat, laju transfer
elektron meningkat. Di bawah kondisi kopling ketat ini, jumlah molekul ATP yang dihasilkan per atom oksigen yang dikonsumsi ketika
NADH adalah donor elektron—rasio P/O—sekitar 2,5.

(a) Memprediksi efek dari agen pelepasan sambungan yang relatif rendah dan konsentrasi yang relatif tinggi
laju transfer elektron dan rasio P/O.

(b) Menelan uncouplers menyebabkan banyak berkeringat dan peningkatan suhu tubuh. Jelaskan fenomena ini dalam istilah
molekuler. Apa yang terjadi pada rasio P/O dengan adanya uncoupler?

(c) Uncoupler 2,4-dinitrophenol pernah diresepkan sebagai obat penurun berat badan. Bagaimana agen ini, pada prinsipnya,
berfungsi sebagai bantuan penurun berat badan? Agen uncoupling tidak lagi diresepkan karena beberapa kematian terjadi
setelah penggunaannya. Mengapa menelan uncoupler dapat menyebabkan kematian?

Answer Pelepas dari fosforilasi oksidatif merangsang laju aliran elektron tetapi tidak merangsang sintesis ATP. (a) Pada
tingkat agen
pemutus yang relatif rendah, rasio P/O sedikit turun, tetapi sel dapat mengkompensasi hal ini dengan meningkatkan
laju aliran elektron; Tingkat ATP dapat dipertahankan relatif normal. Pada level uncoupler yang tinggi, rasio P/O
mendekati nol dan sel tidak dapat mempertahankan level ATP.

(b) Saat jumlah uncoupler meningkat, rasio P/O menurun dan tubuh berjuang untuk membuat ATP yang cukup dengan
mengoksidasi lebih banyak bahan bakar. Panas yang dihasilkan oleh peningkatan laju oksidasi ini meningkatkan
suhu tubuh. Rasio P/O dipengaruhi seperti yang tercantum dalam (a). (c) Peningkatan aktivitas rantai
pernapasan dengan adanya uncoupler membutuhkan degradasi simpanan energi tambahan (glikogen dan lemak).
Dengan mengoksidasi lebih banyak bahan bakar dalam upaya menghasilkan jumlah ATP yang sama, organisme
kehilangan berat badan. Jika rasio P/O mendekati nol, kekurangan ATP akan mematikan.

7. Efek Valinomisin pada Fosforilasi Oksidatif Ketika antibiotik valinomisin ditambahkan ke mitokondria yang aktif bernapas, beberapa
hal terjadi: hasil ATP menurun, laju konsumsi O2 meningkat, panas dilepaskan, dan gradien pH melintasi membran mitokondria
bagian dalam. meningkat. Apakah valinomycin bertindak sebagai uncoupler atau penghambat fosforilasi oksidatif?

Jelaskan pengamatan eksperimental dalam kaitannya dengan kemampuan antibiotik untuk mentransfer ion K melintasi membran
dalam mitokondria.
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 226 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

S-226 Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi

Answer Efek yang diamati konsisten dengan aksi uncoupler—yaitu, agen yang menyebabkan energi bebas yang
dilepaskan dalam transfer elektron tampak sebagai panas daripada ATP. Dalam mitokondria yang bernafas, ion H
ditranslokasi keluar dari matriks selama transfer elektron, menciptakan gradien proton dan potensial listrik melintasi
membran. Sebagian besar energi bebas yang digunakan untuk mensintesis ATP berasal dari potensial listrik ini.

Valinomycin bergabung dengan ion K untuk membentuk kompleks yang melewati membran mitochondrial bagian
dalam. Jadi, ketika proton ditranslokasikan oleh transfer elektron, ion K masuk, dan potensial melintasi membran hilang. Ini
mengurangi hasil ATP per mol proton yang mengalir melalui ATP sintase (FoF1). Dengan kata lain, transfer elektron dan
fosforilasi menjadi tidak berpasangan. Menanggapi penurunan efisiensi sintesis ATP, laju transfer elektron meningkat tajam.
Hal ini menyebabkan peningkatan gradien H, konsumsi oksigen, dan jumlah panas yang dilepaskan.

8. Cara Kerja Disikloheksilkarbodiimida (DCCD) Ketika DCCD ditambahkan ke dalam suspensi mitokondria yang aktif dan terkopel erat,
laju transfer elektron (diukur dengan konsumsi O2 ) dan laju produksi ATP menurun drastis. Jika larutan 2,4-dinitrofenol sekarang
ditambahkan ke dalam sediaan, konsumsi O2 kembali normal tetapi produksi ATP tetap terhambat. (a) Proses apa dalam transfer
elektron atau fosforilasi oksidatif yang dipengaruhi oleh DCCD? (b) Mengapa DCCD mempengaruhi konsumsi O2 mitokondria?
Jelaskan efek 2,4-dinitro

fenol pada persiapan mitokondria terhambat.


(c) Manakah dari inhibitor berikut yang paling mirip DCCD dalam aksinya: antimisin A, rotenone,
atau oligomisin?

Menjawab

(a) DCCD menghambat sintesis ATP. Dalam mitokondria yang berpasangan erat, penghambatan ini menyebabkan masuknya
penghambatan transfer elektron juga.

(b) Penurunan transfer elektron menyebabkan penurunan konsumsi O2 . 2,4-Dinitrofenol


melepaskan transfer elektron dari sintesis ATP, memungkinkan respirasi meningkat. Tidak ada ATP yang disintesis
dan rasio P/O menurun. (c) DCCD dan oligomisin
menghambat sintesis ATP (lihat Tabel 19–4).

9. Kompartementalisasi Komponen Siklus Asam Sitrat Isocitrate dehydrogenase hanya ditemukan di mitokondria, tetapi malate
dehydrogenase ditemukan di sitosol dan mitokondria. Apa peran sitosolik malat dehidrogenase?

Answer Malat dehidrogenase mengkatalisasi konversi malat menjadi oksaloasetat dalam siklus asam sitrat, yang terjadi di
mitokondria, dan juga memainkan peran kunci dalam pengangkutan ekuivalen pereduksi melintasi membran mitokondria
bagian dalam melalui antar-jemput malat-aspartat (Gbr. 19 –29). Pesawat ulang-alik ini membutuhkan kehadiran malat
dehidrogenase dalam sitosol dan matriks mitokondria.

10. Sistem Transportasi Malat–a-Ketoglutarat Sistem transportasi yang membawa malat dan -ketoglutarat melintasi membran
dalam mitokondria (lihat Gambar 19–29) dihambat oleh n butylmalonate. Misalkan n-butylmalonate ditambahkan ke suspensi
aerobik sel ginjal menggunakan glukosa secara eksklusif sebagai bahan bakar. Prediksikan efek penghambat ini pada (a) glikolisis, (b)
konsumsi oksigen, (c) pembentukan laktat, dan (d) sintesis ATP.

Answer NADH yang diproduksi di sitosol tidak dapat melewati membran dalam mitokondria, tetapi harus dioksidasi jika
glikolisis ingin dilanjutkan. Mengurangi ekuivalen dari NADH memasuki mito chondrion melalui antar-jemput malate-
aspartate. NADH mereduksi oksaloasetat untuk membentuk malat dan NAD, dan malat diangkut ke mitokondria. Oksidasi
sitosol dari glu cose dapat berlanjut, dan malat diubah kembali menjadi oksaloasetat dan NADH di mito chondrion (lihat
Gambar 19-29).
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 227 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi S-227

(a) Jika n-butylmalonate, penghambat transporter malat-ketoglutarat, ditambahkan ke sel, NADH


terakumulasi dalam sitosol. Ini memaksa glikolisis untuk beroperasi secara anaerob, dengan
reoksidasi NADH dalam reaksi laktat dehidrogenase. (b) Karena ekuivalen
pereduksi dari reaksi oksidasi glikolisis tidak memasuki mitokondria, konsumsi oksigen melambat dan
akhirnya berhenti.
(c) Produk akhir glikolisis anaerobik, laktat, terakumulasi. (d) ATP tidak
terbentuk secara aerobik karena sel telah diubah menjadi glikolisis anaerobik.
Secara keseluruhan, sintesis ATP menurun drastis, menjadi 2 ATP per molekul glukosa.

11. Konsentrasi ADP Seluler Mengontrol Pembentukan ATP Meskipun ADP dan Pi diperlukan untuk sintesis ATP, laju
sintesis tergantung terutama pada konsentrasi ADP, bukan Pi . Mengapa?

Answer Konsentrasi tunak Pi dalam sel jauh lebih tinggi daripada ADP. Ketika konsentrasi ADP meningkat
sebagai akibat dari konsumsi ATP, terjadi sedikit perubahan pada [Pi ], sehingga Pi tidak dapat berfungsi
sebagai regulator.

12. Skala Waktu Kejadian Regulasi di Mitokondria Bandingkan kemungkinan skala waktu untuk penyesuaian laju
pernapasan yang disebabkan oleh (a) peningkatan [ADP] dan (b) penurunan pO2. Apa penyebab perbedaannya?

Jawaban Dalam (a), kontrol pernapasan oleh ADP, peningkatan laju pernapasan dibatasi oleh laju difusi
ADP, dan respons diharapkan terjadi dalam sepersekian milidetik. Penyesuaian terhadap (b), hipoksia
yang dimediasi oleh HIF-1, membutuhkan perubahan konsentrasi beberapa protein, hasil dari peningkatan
sintesis atau degradasi. Skala waktu untuk sintesis atau degradasi protein biasanya beberapa detik hingga
berjam-jam—jauh lebih lama daripada waktu yang diperlukan untuk perubahan konsentrasi substrat.

13. Efek Pasteur Ketika O2 ditambahkan ke dalam suspensi anaerob sel yang mengkonsumsi glukosa pada a
tingkat tinggi, tingkat konsumsi glukosa sangat menurun karena O2 habis , dan akumulasi laktat berhenti. Efek ini,
pertama kali diamati oleh Louis Pasteur pada tahun 1860-an, merupakan karakteristik sebagian besar sel yang
mampu melakukan katabolisme glukosa aerobik dan
anaerobik. (a) Mengapa akumulasi laktat berhenti setelah O2 ditambahkan?
(b) Mengapa keberadaan O2 menurunkan laju konsumsi glukosa? (c) Bagaimana
permulaan konsumsi O2 memperlambat laju konsumsi glukosa? Jelaskan dari segi enzim spesifik.

Answer Penambahan oksigen ke suspensi anaerob memungkinkan sel untuk mengubah dari fermentasi
menjadi fosforilasi oksidatif sebagai mekanisme untuk mengoksidasi ulang NADH dan membuat ATP.
Karena sintesis ATP jauh lebih efisien dalam kondisi aerobik, jumlah glukosa yang dibutuhkan akan berkurang
(efek Pasteur). Pemanfaatan glukosa yang menurun ini dengan adanya oksigen dapat ditunjukkan pada
setiap jaringan yang mampu melakukan glikolisis aerobik dan anaerobik. (a) Oksigen memungkinkan jaringan
untuk mengubah dari fermentasi asam laktat menjadi elektron pernapasan
transfer dan fosforilasi oksidatif sebagai mekanisme oksidasi NADH.
(b) Sel menghasilkan lebih banyak ATP per molekul glukosa yang dioksidasi secara aerobik, sehingga lebih sedikit glukosa
dibutuhkan.
(c) Saat [ATP] meningkat, fosfofruktokinase-1 dihambat, sehingga memperlambat laju masuknya glukosa
ke dalam jalur glikolisis.
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 228 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

S-228 Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi

14. Mutan Ragi yang Defisiensi Respirasi dan Produksi Etanol Ragi yang Defisiensi Respirasi Mu
tant (p; “mungil”) dapat diproduksi dari tetua tipe liar melalui pengobatan dengan agen mutagenik. Mutan kekurangan
sitokrom oksidase, defisit yang sangat mempengaruhi perilaku metabolisme mereka. Salah satu efek yang mencolok
adalah fermentasi tidak ditekan oleh O2—yaitu, mutan tidak memiliki efek Pasteur (lihat Soal 13). Beberapa
perusahaan sangat tertarik menggunakan mutan ini untuk memfermentasi serpihan kayu menjadi etanol untuk
penggunaan energi. Jelaskan keuntungan menggunakan mutan ini daripada ragi tipe liar untuk produksi etanol
skala besar. Mengapa tidak adanya sitokrom oksidase menghilangkan efek Pasteur?

Answer Ketiadaan sitokrom oksidase mencegah mutan ini mengoksidasi produk fermentasi (etanol,
asetat, laktat, atau gliserol) melalui jalur pernapasan normal.
Mutan ini tidak memiliki siklus asam sitrat yang berfungsi karena mereka tidak dapat mengoksidasi
ulang NADH melalui rantai transfer elektron yang bergantung pada O2. Dengan demikian, katabolisme
glukosa berhenti pada tahap etanol, bahkan dengan adanya oksigen. Kemampuan untuk melakukan
fermentasi ini dengan adanya oksigen merupakan keuntungan praktis utama karena kondisi anaerobik
sepenuhnya sulit dipertahankan. Efek Pasteur—penurunan konsumsi glukosa yang terjadi saat oksigen
dimasukkan—tidak teramati tanpa adanya siklus asam sitrat aktif dan rantai transfer elektron.

15. Keuntungan Superkompleks untuk Transfer Elektron Ada bukti yang berkembang bahwa mitokondria Kompleks
I, II, III, dan IV adalah bagian dari superkompleks yang lebih besar. Apa keuntungan memiliki keempat
kompleks di dalam superkompleks?

Answer Ketika kompleks pembawa elektron terikat bersama dalam superkompleks, aliran elektron
antar kompleks terjadi dalam keadaan padat; gerakan elektron ini lebih disukai secara kinetik
dibandingkan dengan situasi di mana aliran elektron bergantung pada setiap kompleks yang berdifusi ke
dan bertabrakan dengan kompleks berikutnya dalam rantai.

16. Berapa Banyak Proton dalam Mitokondria? Transfer elektron mentranslokasi proton dari matriks mitochondrial
ke media eksternal, membentuk gradien pH melintasi membran dalam (di luar lebih asam daripada di
dalam). Kecenderungan proton untuk berdifusi kembali ke dalam matriks merupakan kekuatan pendorong untuk
sintesis ATP oleh ATP sintase. Selama fosforilasi oksidatif oleh suspensi mito chondria dalam media pH 7,4,
pH matriks telah diukur sebagai 7,7. (a) Hitung [H] dalam media eksternal dan matriks
dalam kondisi ini. (b) Berapa rasio luar-ke-dalam dari [H]? Komentari energi yang melekat dalam
perbedaan konsentrasi ini. (Petunjuk: lihat Persamaan 11–4, hlm. 396) (c) Hitung jumlah proton dalam mitokondria
hati yang bernapas, anggaplah kompartemen
matriks dalamnya berbentuk bola berdiameter 1,5 mm.

(d) Dari data ini, apakah gradien pH saja sudah cukup untuk menghasilkan ATP?
(e) Jika tidak, usulkan bagaimana energi yang diperlukan untuk sintesis ATP muncul.

Menjawab

(a) Dengan menggunakan persamaan pH log [H], kita dapat menghitung [H] eksternal 107,4 4,0
108 M; dan internal [H] 107,7 2,0 108 M.
(b) Dari (a), rasionya adalah 2:1. Kita dapat menghitung energi bebas yang melekat pada perbedaan
konsentrasi melintasi membran. Asumsikan suhu 25 C:

G RT ln (C2/C1)
(2,48 kJ/mol) ln 2
1,7 kJ/mol
4
(c) Mengingat bahwa volume mitokondria 3 (0,75 103 mm)3 dan [H] 2.0
108 M, jumlah proton adalah

(1,33)(3,14)(0,75 103 mm)3 (2,0 108 mol/L)(6,02 1023 proton/mol) (106 mm3 /L)
21 proton
2608T_ch19sm_S223-S237 2/23/08 2:11AM Halaman 229 ntt 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi S-229

(d) Tidak; energi yang tersedia dari gradien konsentrasi H, 2.3pH RT 2.3(0.3) (2.48 kJ/mol) 1.7 kJ/mol,
tidak cukup untuk mensintesis 1 mol ATP. (e) Energi total yang melekat pada
gradien pH adalah jumlah energi akibat gradien konsentrasi dan energi akibat pemisahan muatan. Potensi
listrik transmembran keseluruhan adalah faktor utama dalam menghasilkan Gt yang cukup besar (lihat
Persamaan 19–8 dan 19–9).

17. Kecepatan Pergantian ATP pada Otot Jantung Tikus Otot jantung tikus yang beroperasi secara aerobik memenuhi
lebih dari 90% kebutuhan ATP-nya melalui fosforilasi oksidatif. Setiap gram jaringan mengkonsumsi O2 dengan
kecepatan 10,0 mmol/menit, dengan glukosa sebagai
sumber bahan bakar. (a) Hitung kecepatan otot jantung mengkonsumsi glukosa dan menghasilkan
ATP. (b) Untuk konsentrasi ATP yang stabil sebesar 5,0 mmol/g jaringan otot jantung, hitung waktu yang diperlukan
(dalam detik) untuk sepenuhnya menyerahkan kumpulan seluler ATP. Apa yang ditunjukkan oleh hasil ini
tentang perlunya pengaturan produksi ATP yang ketat? (Catatan: Konsentrasi dinyatakan sebagai mikromol per
gram jaringan otot karena sebagian besar jaringannya adalah air.)

Jawaban ATP berubah sangat cepat di semua jenis jaringan dan sel. (a)
Oksidasi glukosa membutuhkan 6 mol O2 per mol glukosa. Oleh karena itu, glukosa adalah con
dijumlahkan dengan laju (10,0 mmol/mnt g)/6 1,7 mmol/mnt g jaringan. Jika setiap glukosa
menghasilkan 32 ATP (lihat Tabel 19–5), otot menghasilkan ATP dengan laju (1,7 mmol glukosa/
menit g)(32 ATP/glukosa) 54 mmol/menit g, atau 0,91 mmol/s g. (b) Dibutuhkan
(5,0 mmol/g)/(0,91 mmol/sg) 5,5 detik untuk menghasilkan 5,0 mmol ATP per gram, sehingga seluruh
kumpulan ATP harus dibuat ulang (dibalik) setiap 5,5 detik. Untuk melakukan ini, sel harus
mengatur sintesis ATP dengan tepat.

18. Laju Pemecahan ATP pada Otot Terbang Produksi ATP pada otot terbang lalat Lucilia sericata dihasilkan hampir
secara eksklusif dari fosforilasi oksidatif. Selama terbang, 187 mL O2/jam g berat badan diperlukan untuk
mempertahankan konsentrasi ATP sebesar 7,0 mol/g otot terbang. Asumsikan bahwa otot terbang merupakan 20%
dari berat lalat, hitung laju pergantian kumpulan ATP otot terbang. Berapa lama reservoir ATP bertahan tanpa adanya
fosforilasi oksidatif? Asumsikan bahwa ekuivalen pereduksi ditransfer oleh shuttle gliserol 3-fosfat dan O2 berada
pada 25 C dan 101,3 kPa (1 atm).

Answer Menggunakan hukum gas (PV nRT), kita dapat menghitung bahwa 187 mL O2 mengandung

n PV/ RT (1 atm)(0,187 L)/(0,08205 L atm/mol K)(298 K) 7650 mmol O2

Dengan demikian, laju konsumsi oksigen oleh otot terbang adalah

(7650 mmol/jam)/(1 g)(0,2)(3600 detik/jam) 10,6 mmol/detik

Dengan asumsi menghasilkan 30 ATP per glukosa (lihat Tabel 19–5; asumsikan penggunaan shuttle
gliserol 3-fosfat), dan mengingat 6 O2 yang dikonsumsi per glukosa, jumlah ATP yang terbentuk adalah

[(30 ATP/glukosa)/(6 O2/glukosa)](10,6 mmol O2/sg) 53 mmol/sg

Jadi, reservoir 7,0 mmol/g akan bertahan (7,0 mmol/g)/(53 mmol/sg) 0,13 detik.

19. Penyakit Mitokondria dan Kanker Mutasi pada gen yang menyandi protein mitokondria tertentu berhubungan dengan
tingginya insiden beberapa jenis kanker. Bagaimana mungkin mitokondria yang rusak menyebabkan kanker?

Jawaban Spesies oksigen reaktif bereaksi dengan makromolekul, termasuk DNA. Jika cacat mitokondria
menyebabkan peningkatan produksi ROS, gen inti yang menyandikan proto-onkogen (hlm. 473, 474) dapat
rusak, menghasilkan onkogen dan menyebabkan pembelahan sel yang tidak teratur dan kanker.
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 230 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

S-230 Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi

20. Variabel Keparahan Penyakit Mitokondria Individu dengan penyakit yang disebabkan oleh cacat spesifik pada genom
mitokondria mungkin memiliki gejala mulai dari ringan sampai berat. Jelaskan mengapa.

Jawaban Penjelasannya mungkin heteroplasmy. Pada beberapa individu, mutasi mitokondria hanya dapat
mempengaruhi sebagian kecil sel dan jaringan, karena sebagian besar mitokondria dalam sel dan jaringan ini
memiliki genom normal dan beberapa mitokondria mutan tidak secara signifikan membahayakan kemampuan untuk
menghasilkan ATP. Pada individu lain, kemungkinan distribusi genom mitokondria selama pembelahan sel telah
menyebabkan heteroplasmi tingkat tinggi di mana banyak sel memiliki mayoritas mitokondria yang rusak, mengakibatkan
gejala yang lebih parah.

21. Pergerakan Transmembran Setara Reduksi Dalam kondisi aerob, NADH ekstramitokondria harus dioksidasi oleh rantai transfer
elektron mitokondria. Pertimbangkan persiapan hepatosit tikus yang mengandung mitokondria dan semua enzim sitosol. Jika
[4-3 H]NADH diperkenalkan, radioaktivitas segera muncul dalam matriks mitokondria. Namun, jika [7-14C]NADH dimasukkan,
tidak ada radioaktivitas yang muncul dalam matriks. Apa yang diungkapkan pengamatan ini tentang oksidasi NADH extramito
chondrial oleh rantai transfer elektron?

HAI HAI
3 3
H H H H
C 14C

NH2 NH2
N N
R R
[4-3 H]NADH [7-14C]NADH

Answer Pesawat ulang-alik malat-aspartat mentransfer elektron dan proton dari sitoplasma ke dalam mitokondria. Baik
NAD maupun NADH tidak melewati membran dalam, sehingga gugus NAD yang telah diberi label dari [7-14C] NADH
3
tetap berada di sitosol. H pada [4-3 H]NADH memasuki mitokondria melalui antar-jemput malat-aspartat (lihat Gambar
19–29). Di dalam sitosol, [4-3 H]NADH
3 mentransfernya H ke oksaloasetat untuk membentuk [3 H] malat, yang memasuki mitokondria melalui transporter
3
malat–ketoglutarat, kemudian menyumbangkan matriks. H ke NAD untuk membentuk [4-3 H]NADH dalam

22. Tingkat Alanin Darah Tinggi Terkait dengan Cacat pada Fosforilasi Oksidatif Kebanyakan individu dengan cacat genetik
pada fosforilasi oksidatif ditemukan memiliki konsentrasi alanin yang relatif tinggi dalam darah mereka. Jelaskan ini dalam
istilah biokimia.

Answer Pada orang-orang ini, jalur biasa untuk metabolisme piruvat—konversi menjadi asetil KoA dan masuk ke
dalam siklus asam sitrat—diperlambat oleh penurunan kapasitas untuk membawa elektron dari NADH ke oksigen.
Akumulasi piruvat dalam jaringan menggeser kesetimbangan untuk piruvat-alanin transaminase, mengakibatkan
peningkatan konsentrasi alanin dalam jaringan dan darah.

23. Kolam NAD dan Aktivitas Dehidrogenase Meskipun piruvat dehidrogenase dan gliseralde hyde 3-fosfat dehidrogenase
menggunakan NAD sebagai akseptor elektronnya, kedua enzim tidak bersaing untuk kolam NAD seluler yang sama. Mengapa?

Answer Piruvat dehidrogenase terletak di mitokondria, dan gliseraldehida 3-fosfat dehidrogenase di sitosol.
Karena kumpulan NAD mitokondria dan sitosolik dipisahkan oleh membran mitokondria bagian dalam, enzim tidak
bersaing untuk kumpulan NAD yang sama. Namun, ekuivalen pereduksi dipindahkan dari satu pool koenzim
nicotinamide ke pool lainnya melalui mekanisme shuttle (lihat Soal 21).
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 231 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi S-231

24. Diabetes Akibat Cacat Mitokondria Glukokinase sangat penting dalam metabolisme glukosa di sel pankreas. Manusia
dengan dua salinan gen glukokinase yang rusak menunjukkan diabetes neonatal yang parah, sedangkan mereka
yang hanya memiliki satu salinan gen yang rusak memiliki bentuk penyakit yang jauh lebih ringan (diabetes onset
dewasa pada anak muda, MODY2). Jelaskan perbedaan ini dalam kaitannya dengan biologi sel.

Answer Pada sel yang kedua salinan glukokinasenya rusak, laju produksi glikolitik ATP tidak meningkat
ketika glukosa darah meningkat, dan dengan demikian sel ini tidak dapat menghasilkan konsentrasi ATP
yang cukup tinggi untuk mempengaruhi saluran K yang bergantung pada ATP yang secara tidak
langsung mengatur sekresi insulin. Dengan satu salinan fungsional glukokinase, sel dapat merespons
konsentrasi glukosa yang sangat tinggi dengan menghasilkan konsentrasi ATP yang melebihi ambang
batas, memicu pelepasan insulin.

25. Efek Mutasi pada Kompleks Mitokondria II Perubahan nukleotida tunggal pada gen suksinat dehidrogenase
(Kompleks II) berhubungan dengan tumor karsinoid midgut. Sarankan mekanisme untuk menjelaskan pengamatan
ini.

Answer Cacat pada Kompleks II mengakibatkan peningkatan produksi ROS, kerusakan DNA, dan mutasi
yang menyebabkan pembelahan sel yang tidak teratur (kanker). Tidak jelas mengapa kanker cenderung
terjadi di midgut.

26. Efisiensi Fotokimia Cahaya pada Panjang Gelombang Berbeda Laju fotosintesis, yang diukur dengan produksi
O2 , lebih tinggi ketika tumbuhan hijau disinari dengan cahaya dengan panjang gelombang 680 nm dibandingkan
dengan cahaya 700 nm. Namun, iluminasi dengan kombinasi cahaya 680 nm dan 700 nm memberikan laju fotosintesis
yang lebih tinggi daripada cahaya dengan salah satu panjang gelombang saja. Menjelaskan.

Jawaban Tumbuhan memiliki dua fotosistem. Fotosistem I menyerap cahaya secara maksimal pada 700
nm dan mengkatalisasi fotofosforilasi siklik dan reduksi NADP (lihat Gambar 19–56). Fotosistem II menyerap
cahaya secara maksimal pada 680 nm, membagi H2O menjadi O2 dan H, serta menyumbangkan elektron
dan H ke PSI. Oleh karena itu, cahaya 680 nm lebih baik dalam mendorong produksi O2 , tetapi laju
fotosintesis maksimum diamati hanya ketika tumbuhan disinari dengan cahaya dari kedua panjang gelombang.

27. Neraca Fotosintesis Pada tahun 1804 Theodore de Saussure mengamati bahwa berat total oksigen dan bahan organik
kering yang dihasilkan tumbuhan lebih besar daripada berat karbon dioksida yang dikonsumsi selama fotosintesis.
Dari mana datangnya bobot ekstra?

Jawab Karena reaksi umum fotosintesis tumbuhan adalah

CO2 H2O 88n O2 bahan organik

berat ekstra harus berasal dari air yang dikonsumsi dalam reaksi keseluruhan.

28. Peran H2S dalam Beberapa Bakteri Fotosintetik Bakteri belerang ungu terang melakukan sintesis foto dengan
adanya H2O dan 14CO2, tetapi hanya jika H2S ditambahkan dan O2 tidak ada. Selama proses fotosintesis,
diukur dengan pembentukan [14C]karbohidrat, H2S diubah menjadi unsur belerang, tetapi tidak ada O2 yang
dilepaskan. Apa peran konversi H2S menjadi belerang? Mengapa tidak ada O2 yang berevolusi?

Answer Bakteri belerang ungu menggunakan H2S sebagai sumber elektron dan proton:

H2S 88n S 2H 2e

Elektron “diaktifkan” oleh sistem foto penangkap energi cahaya. Sel-sel ini menghasilkan ATP mereka
melalui fotofosforilasi dan NADPH mereka dari oksidasi H2S . Karena H2O tidak terpecah, O2 tidak
berevolusi (fotosistem II tidak ada).
2608T_ch19sm_S223-S237 2/27/08 8:29AM Halaman 232 ntt SSEN 19:Folder Desktop:27/02:WHQY028/111:
Machine Translated by Google

S-232 Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi

29. Meningkatkan Daya Reduksi Fotosistem I dengan Penyerapan Cahaya Saat Fotosistem I
menyerap lampu merah pada 700 nm, potensi reduksi standar P700 berubah dari 0,40 V menjadi sekitar
1.2 V. Berapa fraksi cahaya yang diserap yang terperangkap dalam bentuk daya pereduksi?

Jawab Untuk perubahan potensial reduksi standar, E, sebesar 0,4 V (1,2 V), perubahan energi
bebas per elektron adalah
GnE
(96,48 kJ/V mol)(1,6 V) 150
kJ/mol

Dua foton diserap per elektron yang diangkat ke tingkat energi yang lebih tinggi, yang untuk cahaya
700 nm setara dengan 2(170 kJ/mol) 340 kJ/mol (lihat Gambar 19–46). Jadi, fraksi energi cahaya yang
terperangkap sebagai daya pereduksi adalah

(150 kJ/mol)/(340 kJ/mol) 0,44, atau 44%

30. Aliran Elektron melalui Fotosistem I dan II Memprediksi bagaimana suatu penghambat lewatnya elektron
melalui pheophytin akan mempengaruhi aliran elektron melalui (a) fotosistem II dan (b) fotosistem I.
Jelaskan alasan Anda.

Menjawab

(a) Aliran elektron melalui PSII akan berhenti, karena tidak ada cara bagi elektron untuk berpindah dari
PSII ke kompleks sitokrom b6f dan semua akseptor elektron di PSII akan sangat cepat berkurang.
(b) Aliran elektron melalui
PSI mungkin akan melambat. Pasokan elektron dari PSII akan diblokir, tetapi dengan pengoperasian jalur
siklik, beberapa aliran elektron melalui PSI dapat berlanjut.

31. Sintesis ATP Terbatas dalam Gelap Dalam percobaan laboratorium, kloroplas bayam adalah illumi
tanpa adanya ADP dan Pi berukuran , kemudian lampu dimatikan dan ADP dan Pi ditambahkan. ATP adalah sin
untuk waktu yang singkat dalam gelap. Jelaskan temuan ini.

Answer Iluminasi kloroplas tanpa adanya ADP dan Pi membuat gradien proton melintasi membran
tilakoid. Ketika ADP dan Pi ditambahkan, sintesis ATP didorong oleh gradien. Dengan tidak adanya
penerangan terus menerus, gradien segera menjadi habis dan sintesis ATP berhenti.

32. Cara Aksi Herbisida DCMU Ketika kloroplas diperlakukan dengan 3-(3,4-diklorofenil)-1,1-dimethylurea (DCMU,
atau diuron), herbisida kuat, evolusi O2 dan fotofosforilasi berhenti. Evolusi oksigen, tetapi bukan fotofosforilasi,
dapat dipulihkan dengan penambahan akseptor elektron eksternal, atau reagen Hill. Bagaimana DCMU
bertindak sebagai pembunuh gulma? Sarankan lokasi untuk tindakan penghambatan herbisida ini dalam skema
yang ditunjukkan pada Gambar 19–56. Menjelaskan.

Jawab DCMU harus menghambat sistem transfer elektron yang menghubungkan fotosistem II dan
fotosistem I pada posisi di depan lokasi pertama produksi ATP. DCMU bersaing dengan PQB untuk
mendapatkan elektron dari PQA (Tabel 19–4). Penambahan pereaksi Hill memungkinkan H2O untuk
dipecah dan O2 dilepaskan, tetapi elektron ditarik keluar dari sistem sebelum titik sintesis ATP dan
sebelum produksi NADPH. DCMU membunuh tanaman dengan menghambat produksi ATP.
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 233 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi S-233

33. Pengaruh Venturicidin pada Evolusi Oksigen Venturicidin adalah penghambat kuat sintase ATP kloroplas, berinteraksi dengan
bagian CFo dari enzim dan menghalangi jalan proton melalui kompleks CFoCF1 . Bagaimana venturicidin mempengaruhi
evolusi oksigen dalam suspensi kloroplas yang diterangi dengan baik? Apakah jawaban Anda akan berubah jika percobaan
dilakukan dengan adanya reagen uncoupling seperti 2,4-dinitrophenol (DNP)? Menjelaskan.

Jawaban Evolusi oksigen membutuhkan aliran elektron yang terus menerus melalui PSII. Elektron akan terus mengalir
melalui PSII dan kompleks sitokrom b6f sampai biaya energi untuk memompa proton melintasi membran tilakoid melebihi
energi yang tersedia dari penyerapan foton . Titik ini segera tercapai ketika aliran proton melalui CFoCF1 diblokir oleh
venturicidin, dan evolusi oksigen berhenti. Penambahan agen uncoupling menyediakan rute bagi proton untuk
bergerak melalui membran tilakoid, menghamburkan energi gradien proton. Elektron sekarang dapat terus bergerak
melalui PSII dan kompleks sitokrom b6 f , dan oksigen dihasilkan dalam reaksi pemisahan air.

34. Bioenergetika Fotofosforilasi Konsentrasi ATP, ADP, dan Pi dalam keadaan tunak
kloroplas bayam terisolasi di bawah pencahayaan penuh pada pH 7,0 masing-masing adalah 120,0, 6,0, dan 700,0 mM . (a)
Berapa kebutuhan energi bebas untuk sintesis 1 mol ATP pada kondisi ini? (b) Energi untuk sintesis ATP disediakan oleh
transfer elektron yang diinduksi oleh cahaya dalam kloroplas.
Berapa penurunan tegangan minimum yang diperlukan (selama transfer sepasang elektron) untuk mensintesis ukuran
ATP dalam kondisi ini? (Anda mungkin perlu merujuk ke Persamaan 13–7, hal. 515.)

Menjawab

[A T
P ] (a) GG RT ln
[A D P ] [ Pi ]
1,2 104 (6,0
30,5 kJ/mol (2,48 kJ/mol) ln
106 ) (7,0 104 )
30,5 kJ/mol 25,4 kJ/mol 55,9 kJ/mol 56 kJ/mol (dua
angka penting) (b) G n E G/n

DAN

56 kJ/mol
2(96,48 kJ/V mol-1)
0,29 V

35. Energi Cahaya untuk Reaksi Redoks Misalkan Anda telah mengisolasi mikroorganisme fotosintetik baru yang mengoksidasi H2S
dan meneruskan elektron ke NAD. Berapa panjang gelombang cahaya yang akan memberikan energi yang cukup bagi H2S
untuk mereduksi NAD dalam kondisi standar? Asumsikan efisiensi 100% dalam peristiwa fotokimia, dan gunakan E sebesar
243 mV untuk H2S dan 320 mV untuk NAD. Lihat Gambar 19–46 untuk energi yang setara dengan panjang gelombang cahaya.

Jawab Pertama, hitung perubahan energi bebas standar (G) dari reaksi redoks

NAD H2S 88n NADH SH

Karena E 320 mV (243 mV) 77 mV,

G juga tidak

(2)(96,48 kJ/V mol)(0,077 V) 15 kJ/mol

Ini adalah energi minimum yang dibutuhkan untuk mendorong reduksi NAD oleh H2S. Pemeriksaan Gambar 19–
46 menunjukkan bahwa energi dalam “mol” foton (einstein) di bagian spektrum tampak berkisar antara 170 hingga 300
kJ. Setiap cahaya tampak harus memiliki energi yang cukup untuk mendorong reduksi NADH oleh H2S. Pada
prinsipnya, dan dengan asumsi efisiensi 100%, cahaya inframerah pun harus memiliki energi yang cukup untuk
menggerakkan reaksi ini.
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 234 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

S-234 Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi

36. Konstanta Kesetimbangan untuk Reaksi Pemecahan Air Koenzim NADP adalah elektron terminal
akseptor tron dalam kloroplas, menurut reaksi

2H2O 2NADP 88n 2NADPH 2H O2


Gunakan informasi pada Tabel 19–2 untuk menghitung tetapan kesetimbangan untuk reaksi ini pada 25 C. (Hubungan
antara K dan G dibahas di halaman 492.) Bagaimana kloroplas mengatasi kesetimbangan yang tidak menguntungkan
persamaan

ini?

Jawab Menggunakan potensial reduksi standar dari Tabel 19–2, E untuk reaksi adalah
0,324 V0,816 V 1,140 V.
G nE
4(96,48 kJ/V mol)(1,140 V) 440 kJ/
mol

(Perhatikan bahwa n 4 karena 4 elektron diperlukan untuk menghasilkan 1 mol O2.)


G RT ln K eq ln K G/
RT eq (440 kJ/mol)/
(2,48 kJ/mol)
177
K eq e177 1,35 1077

Ekuilibrium jelas sangat tidak menguntungkan. Dalam kloroplas, input energi cahaya melewati penghalang
ini.

37. Energi Fototransduksi Selama fotosintesis, delapan foton harus diserap (empat oleh
setiap fotosistem) untuk setiap molekul O2 yang dihasilkan:

2H2O 2NADP 8 foton 88n 2NADPH 2H O2


Asumsikan bahwa foton ini memiliki panjang gelombang 700 nm (merah) dan penyerapan dan penggunaan energi
cahaya 100% efisien, hitung perubahan energi bebas untuk proses tersebut.

Jawaban Dari Soal 36, G untuk produksi 1 mol O2 dalam reaksi ini adalah 440 kJ/mol. Input cahaya
8 foton (700 nm) setara dengan (8)(170 kJ/einstein) 1360 kJ/einstein (lihat Gambar 19–46). (Einstein adalah
"mol" foton.) Perubahan energi bebas standar keseluruhan dari reaksi tersebut adalah

G (440 1360) kJ/mol 920 kJ/mol

38. Perpindahan Elektron ke Pereaksi Bukit Kloroplas bayam yang diisolasi menghasilkan O2 ketika disinari dengan
adanya kalium ferisianida (pereaksi Bukit), menurut persamaan

2H2O 4Fe3 88n O2 4H 4Fe2

di mana Fe3 mewakili ferisianida dan Fe2, ferosianida. Apakah NADPH diproduksi dalam proses ini?
Menjelaskan.

Jawab Tidak ada NADPH yang dihasilkan. Akseptor elektron buatan dapat menghilangkan elektron dari
sistem fotosintesis dan merangsang produksi O2 . Ferricyanide bersaing dengan kompleks
sitokrom b6 f untuk mendapatkan elektron dan menghilangkannya dari sistem. Akibatnya, P700 (dari fotosistem
I) tidak menerima elektron apa pun yang dapat diaktifkan untuk reduksi NADP.
Namun, O2 berevolusi karena semua komponen fotosistem II teroksidasi (lihat Gambar 19–56).
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 235 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi S-235

39. Seberapa Sering Molekul Klorofil Menyerap Foton? Jumlah klorofil a (Mr 892) pada daun bayam adalah sekitar 20
mg/cm2 daun. Pada siang hari sinar matahari (energi rata-rata yang mencapai daun adalah 5,4 J/cm2 menit),
daun menyerap sekitar 50% radiasi. Seberapa sering satu molekul klorofil menyerap foton? Mengingat bahwa masa
hidup rata-rata molekul klorofil yang tereksitasi secara in vivo adalah 1 ns, berapa fraksi molekul klorofil yang
tereksitasi pada satu waktu?

Answer Daun menyerap cahaya dalam satuan foton yang energinya bervariasi dari 170 hingga 300 kJ/
einstein, bergantung pada panjang gelombang (lihat Gambar 19–46). Daun menyerap energi
cahaya dengan laju 0,5(5,4 J/cm2 menit) 2,7 J/cm2 menit. Dengan asumsi energi rata-rata 270 kJ/
einstein, tingkat penyerapan cahaya ini adalah

(2,7 103 kJ/cm2 mnt)/(270 kJ/einstein) 1 105 einstein/cm2 mnt

Konsentrasi klorofil pada daun adalah (20 106 g/

cm2 )/(892 g/mol) 2 108 mol/cm2

Jadi, 1 mol klorofil menyerap 1 einstein foton setiap

(2 108 mol/cm2 )/(1 105 einstein/cm2 mnt) 2 103 mnt 0,1 detik

Karena eksitasi berlangsung sekitar 1 ns 1 109 s, fraksi klorofil yang tereksitasi pada satu waktu adalah
,
(1 109 s)/(0,1 s) 1 108 atau satu dari setiap 108 molekul.

40. Pengaruh Cahaya Monokromatik pada Aliran Elektron Sejauh mana pembawa elektron dioksidasi atau direduksi
selama transfer elektron fotosintesis kadang-kadang dapat diamati secara langsung dengan spektrofotometer.
Ketika kloroplas disinari dengan cahaya 700 nm, sitokrom f, plastosianin, dan plastokuinon teroksidasi. Namun,
ketika kloroplas disinari dengan cahaya 680 nm, pembawa elektron ini berkurang. Menjelaskan.

Answer Light pada 700 nm mengaktifkan elektron di P700 dan NADP berkurang (lihat Gambar 19–56).
Ini menguras semua elektron dari sistem transfer elektron antara fotosistem II dan I, karena cahaya pada
680 nm tidak tersedia untuk menggantikan elektron dengan mengaktifkan PSII. Ketika cahaya pada 680
nm mengaktifkan PSII (tetapi bukan PSI), semua pembawa di antara kedua sistem menjadi tereduksi karena
tidak ada elektron yang tereksitasi di PSI.

41. Fungsi Fotofosforilasi Siklik Ketika rasio [NADPH]/[NADP] dalam kloroplas tinggi, fotofosforilasi didominasi oleh siklik
(lihat Gambar 19–56). Apakah O2 berevolusi selama fosforilasi fotofos siklik? Apakah NADPH diproduksi?
Menjelaskan. Apa fungsi utama fotofosforilasi siklik?

Jawab Baik O2 maupun NADPH tidak dihasilkan. Pada rasio [NADPH]/[NADP] yang tinggi, transfer
elektron dari ferredoxin tereduksi ke NADP dihambat dan elektron dialihkan ke kompleks sitokrom b6f .
Elektron ini kembali ke P700 dan ATP disintesis oleh fotofosforilasi. Karena elektron tidak hilang dari
P700, tidak ada yang dibutuhkan dari PSII.
Dengan demikian, H2O tidak terpecah dan O2 tidak dihasilkan. Selain itu, NADPH tidak terbentuk karena
elektron kembali ke P700. Fungsi fotofosforilasi siklik adalah untuk menghasilkan ATP.

Masalah Analisis Data


42. Fotofosforilasi: Penemuan, Penolakan, dan Penemuan Kembali Pada tahun 1930-an dan 1940-an, kembali
para pencari mulai membuat kemajuan untuk memahami mekanisme fotosintesis.
Pada saat itu, peran "ikatan fosfat kaya energi" (hari ini, "ATP") dalam glikolisis dan respirasi seluler baru diketahui.
Ada banyak teori tentang mekanisme fotosintesis, terutama tentang peranan cahaya. Masalah ini berfokus pada
apa yang kemudian disebut "proses kimia foto primer" —yaitu, pada apa sebenarnya energi dari cahaya yang
ditangkap dihasilkan dalam sel fotosintetik. Menariknya, satu bagian penting dari model fotosintesis modern diajukan
sejak awal, hanya untuk ditolak, diabaikan selama beberapa tahun, lalu akhirnya dihidupkan kembali dan diterima.
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 236 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

S-236 Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi

Pada tahun 1944, Emerson, Stauffer, dan Umbreit mengusulkan bahwa “fungsi energi cahaya dalam fotosintesis
tesisnya adalah pembentukan ikatan fosfat yang 'kaya energi'” (hlm. 107). Dalam model mereka (selanjutnya
disebut "model Emerson"), energi bebas yang diperlukan untuk mendorong fiksasi dan reduksi CO2 berasal dari
"ikatan fosfat kaya energi" ini (yaitu, ATP), yang dihasilkan sebagai hasil penyerapan cahaya oleh kloro protein yang
mengandung filum.
Model ini secara tegas ditolak oleh Rabinowitch (1945). Setelah meringkas temuan Emerson dan coau thors,
Rabinowitch menyatakan: “Hingga lebih banyak bukti positif diberikan, kami cenderung menganggap argumen umum
yang lebih meyakinkan melawan hipotesis ini, yang dapat diturunkan dari pertimbangan energi. Fotosintesis adalah
masalah akumulasi energi. Lalu, manfaat apa yang dapat diperoleh dengan mengubah kuanta cahaya (bahkan kuanta
cahaya merah, yang berjumlah sekitar 43 kkal per Einstein) menjadi 'kuanta fosfat' yang hanya 10 kkal per mol? Ini
tampaknya merupakan awal yang salah arah—ke arah pemborosan daripada ke arah akumulasi energi” (Vol. I,
hal. 228). Argumen ini, bersama dengan bukti lainnya, menyebabkan model Emerson ditinggalkan sampai tahun 1950-
an, ketika ditemukan benar-meskipun dalam bentuk yang dimodifikasi.

Untuk setiap informasi dari artikel Emerson dan rekan penulis yang disajikan dalam (a) sampai (d)
di bawah ini, jawablah tiga pertanyaan berikut:

1. Bagaimana informasi ini mendukung model Emerson, di mana energi cahaya digunakan langsung oleh klorofil
untuk membuat ATP, dan ATP kemudian menyediakan energi untuk menggerakkan fiksasi dan reduksi
CO2?
2. Bagaimana Rabinowitch menjelaskan informasi ini, berdasarkan modelnya (dan sebagian besar model lain pada
masa itu), di mana energi cahaya digunakan secara langsung oleh klorofil untuk membuat senyawa pereduksi?
Rabinowitch menulis: “Secara teoritis, tidak ada alasan mengapa semua energi elektronik yang terkandung
dalam molekul yang tereksitasi oleh penyerapan cahaya tidak tersedia untuk oksidasi-reduksi” (Vol. I, hal. 152).
Dalam model ini, senyawa pereduksi kemudian digunakan untuk memfiksasi dan mereduksi CO2, dan energi
untuk reaksi ini berasal dari sejumlah besar energi bebas yang dilepaskan oleh reaksi reduksi.

3. Bagaimana informasi ini dijelaskan oleh pemahaman modern kita tentang fotosintesis? (a) Klorofil

mengandung ion Mg2, yang dikenal sebagai kofaktor penting bagi banyak enzim
yang mengkatalisis reaksi fosforilasi dan defosforilasi.
(b) Suatu “protein klorofil” mentah yang diisolasi dari sel fotosintesis menunjukkan aktivitas fosforilasi. (c) Aktivitas
fosforilasi dari "protein klorofil" dihambat oleh cahaya. (d) Tingkat beberapa senyawa terfosforilasi
yang berbeda dalam sel fotosintesis berubah secara dramatis sebagai respons terhadap paparan cahaya. (Emerson
dan rekan kerja tidak dapat mengidentifikasi senyawa spesifik yang terlibat.)

Ternyata, model Emerson dan Rabinowitch sebagian benar dan sebagian lagi
salah.
(e) Jelaskan bagaimana kedua model tersebut berhubungan dengan model fotosintesis kita saat ini.
Dalam penolakannya terhadap model Emerson, Rabinowitch melanjutkan dengan mengatakan: “Kesulitan
teori penyimpanan fosfat tampak paling jelas ketika seseorang mempertimbangkan fakta bahwa, dalam cahaya lemah,
delapan atau sepuluh kuanta cahaya cukup untuk mereduksi satu molekul karbon dioksida. Jika setiap kuantum
harus menghasilkan satu molekul fosfat berenergi tinggi, akumulasi energi hanya akan menjadi 80-100 kkal per
Einstein—sementara fotosintesis membutuhkan setidaknya 112 kkal per mol, dan mungkin lebih, karena kehilangan
dalam reaksi parsial yang tidak dapat diubah” ( Vol.1, hal.228).
(f) Bagaimana nilai Rabinowitch dari 8 sampai 10 foton per molekul CO2 berkurang dibandingkan dengan nilai yang
diterima saat ini? Anda perlu membaca Bab 20 untuk beberapa informasi yang diperlukan di sini. (g) Bagaimana
Anda membantah argumen Rabinowitch, berdasarkan pengetahuan kita saat ini tentang fotosintesis
tesis?
2608T_ch19sm_S223-S237 22/02/2008 14:47 Halaman 237 puncak 111:WHQY028:Panduan Solusi:Ch-19:
Machine Translated by Google

Bab 19 Fosforilasi Oksidatif dan Fotofosforilasi S-237

Menjawab

(a) (1) Keberadaan Mg2 mendukung hipotesis bahwa klorofil terlibat langsung dalam katalisis reaksi fosforilasi: ADP
Pi n ATP. (2) Banyak enzim (atau protein lain) yang mengandung Mg2 bukanlah enzim fosforilasi, sehingga
keberadaan Mg2 dalam klorofil tidak membuktikan perannya dalam reaksi fosforilasi. (3) Adanya transfer
elektron Mg.
2
sangat penting untuk sifat fotokimia klorofil: penyerapan cahaya dan

(b) (1) Enzim mengkatalisasi reaksi reversibel, sehingga enzim terisolasi yang dapat, di bawah kondisi laboratorium
tertentu, mengkatalisis penghilangan gugus fosforil mungkin dapat, di bawah kondisi yang berbeda (seperti
dalam sel), mengkatalisasi penambahan gugus fosforil. Jadi masuk akal bahwa klorofil dapat terlibat dalam
fosforilasi ADP. (2) Ada dua penjelasan yang mungkin: protein klorofil adalah fosfatase saja dan tidak
mengkatalisasi fosforilasi ADP dalam kondisi seluler, atau sediaan mentah mengandung aktivitas fosfatase
yang mencemari yang tidak berhubungan dengan reaksi fotosintesis. (3) Kemungkinan preparat terkontaminasi
dengan aktivitas fosfatase nonfotosintetik.

(c) (1) Penghambatan cahaya ini adalah apa yang diharapkan jika protein klorofil dikatalisasi
reaksi ADP Pi cahaya n ATP. Tanpa cahaya, reaksi kebalikannya, defosforilasi, akan disukai. Di hadapan
cahaya, energi disediakan dan kesetimbangan akan bergeser ke kanan, mengurangi aktivitas fosfatase. (2)
Penghambatan ini harus merupakan artefak dari metode isolasi atau pengujian. (3) Tidak mungkin metode
preparasi kasar yang digunakan pada saat membran kloroplas diawetkan utuh, sehingga inhibisi harus berupa
artefak.

(d) (1) Dengan adanya cahaya, ATP disintesis dan intermediet terfosforilasi lainnya dikonsumsi. (2) Di hadapan cahaya,
glukosa diproduksi dan dimetabolisme oleh respirasi seluler untuk menghasilkan ATP, dengan perubahan
tingkat perantara terfosforilasi. (3) Di hadapan cahaya, ATP diproduksi dan perantara fosforilasi lainnya
dikonsumsi.

(e) Energi cahaya digunakan untuk menghasilkan ATP (seperti dalam model Emerson) dan digunakan untuk menghasilkan
mengurangi daya (seperti pada model Rabinowitch).
(f) Perkiraan stoikiometri untuk fotofosforilasi (Bab 19) adalah bahwa 8 foton menghasilkan 2 NADPH dan sekitar 3 ATP.
Dibutuhkan dua NADPH dan 3 ATP untuk mereduksi 1 CO2 (Bab 20). Jadi, minimal 8 foton diperlukan per
molekul CO2 yang berkurang.
Ini sesuai dengan nilai Rabinowitch.
(g) Karena energi cahaya digunakan untuk menghasilkan ATP dan NADPH, setiap foton yang diserap menyumbang
lebih dari 1 ATP untuk fotosintesis. Proses ekstraksi energi dari cahaya lebih efisien daripada yang diperkirakan
Rabinowitch, dan banyak energi tersedia untuk proses ini—bahkan dengan lampu merah.

Referensi
Emerson, RL, Stauffer, JF, & Umbreit, WW (1944) Hubungan antara fosforilasi dan fotosintesis di Chlorella.
Saya. J. Botani 31, 107–120.
Rabinowitch, EI (1945) Fotosintesis dan Proses Terkait, Interscience Publishers, New York.

Anda mungkin juga menyukai