Bagaimana Sel-Sel
Menghasilkan Energi Kimia
Tujuan Pembelajaran :
1. Mahasiswa mampu menjelaskan hubungan antara
respirasi seluler dengan produksi energi.
2. Menjelaskan perbedaan respirasi aerobik dengan
anaerobik
3. Mampu menjelaskan tentang proses Glikolisis
4. Mampu menjelaskan tentang siklus Krebs dan
identifikasi molekul yang terlibat
5. Menjelaskan tentang rantai transpor elektron
6. Mahasiswa mampu menuliskan seluruh
persamaan reaksi untuk respirasi seluler dan
mengidentifikasi antara reaktan dan hasil reaksi.
Defenisi Respirasi Seluler
• Proses metabolisme biomolekul dari makanan
untuk menghasilkan energi kimia yang terkandung
dalam ikatan kimia molekul tersebut.
• Perlu diperhatikan bahwa makanan bukan sumber
energi utama secara langsung.
• Energi yang dilepaskan dari ikatan kimia selama
respirasi seluler akan disimpan dalam molekul
ATP
Metabolisme dan Produksi Energi
Reaksi Katabolisme :
Reaksi Anabolisme :
Molekul sederhana + Energy (in cell) Molekul Kompleks
Pasangan Reaksi (Coupled Reactions)
Energi dilepaskan oleh satu reaksi dan sebaliknya akan diserap oleh
reaksi lainnya.
energy dilepaskan
(exothermic reaction)
e
Carbohydrates Glukosa Citric
Polysaccharides Fruktosa Glucose Pyruvate Acetyl CoA Acid e
Galaktosa cycle
Glycerol
Lipids
Asam Lemak
Nucleus
Membrane
Mitochondria
Cytoplasm
(Cytosol)
Struktur Sel
Nucleus: mengandung gen yang mengatur replikasi DNA dan sintesis
protein dari sel.
O O O
- - -
O-P-O-P-O-AMP + H2 O O-P-O-AMP + H2 PO4 + 7.3 kcal/mol
-
O O- -
O
ATP ADP Pi
(adenosine triphosphate) (adenosine diphosphate) (phosphate inorganik)
- 1-2 juta molekul ATP dapat dihidrolisis dalam 1 detik (1 gram dalam sel).
Fosforilasi adalah reaksi kebalikan dari hidrolisis ATP, dimana sebuah gugus
phosphate ditambahkan ke molekul ADP.
What Does ATP Do for You?
Lambung pH = 2 (acidic)
Dinding Usus
Monoacylglycerols + 2 Fatty acids → Triacylglycerols
Protein
Lipoproteins
Chylomicrons
Sistem Limfe
Aliran Darah
Proteins Polypeptides
denaturation + hydrolysis
Usus Halus
Typsin
Chymotrypsin
Dinding Usus
Aliran Darah
Sel
We metabolize more than sugars!!
Oksidasi, Reduksi dan Transfer Elektron
• Oksidasi adalah suatu proses/peristiwa dilepaskan satu
atau lebih elektron
e- (elektron)
Fe2+ Fe3+ + 1 e-
• Reduksi adalah suatu proses/peristiwa dimana ditangkap
satu atau lebih elektron
Cu2+ + 1 e- Cu+
Transfer Elektron dan Koenzim
NAD+
Coenzymes FAD
Coenzyme A
Koenzim NAD+
Nicotinamide adenine dinucleotide
+
The plus sign on NAD
represents the positive O Nicotinamide;
charge on this nitrogen CNH2 derived
O from niacin (vitamin)
(Vitamin B3)
-
O-P-O-CH2 N+
O
O H H a -N-glycosidic Ikan, kacang
AMP H H bond
ADP HO OH
Ribose
Koenzim NAD+
O
CH3-CH2-OH + NAD+ CH3-C-H + NADH + H+
H O H H O
C C
NH2 + H+ + 2 e - NH2
+
:
N N
Ad Ad Reduced
NAD+ NADH
Koenzim FAD
Flavin adenine dinucleotide
O
N H
H3 C N Flavin
H3 C N N O
Riboflavin CH2
(Vitamin B2) H C OH
H C OH Ribitol (sugar alcohol)
Kedelai, kenari, hati
H C OH
CH2
O
O=P-O-AMP
-
O
ADP
Koenzim FAD
H H
R-C-C-R + FAD R-C=C-H + FADH2
HH H H
O H O
H3 C N H3 C N
NH NH
+ 2 H+ + 2 e -
H3 C N N O H3 C N N O
Ad Ad H
FAD FAD H2
Reduced
NADH and FADH2
• NAD+ menangkap
electrons dari glukosa
untuk membuat NADH
(energy stored)
Coenzyme A
Aminoethanethiol
( vitamin B5)
Padi-padian, telur
Koenzim A (CoA)
O O
- Mengaktifkan gugus acyl (RC-), khususnya gugus Acetyl (CH3C-).
O O
CH3-C- + HS-CoA CH3-C-S-CoA
Acetyl group Coenzyme A Acetyl CoA
O
R-C-S-R’ A Thioester
• Memiliki 2 membrane
• Membran luarnya halus
• Membran dalamnya
terlipat2
• Lipatan membran
dalam disebut Kristae
• Ruang disebelah dalam
dari kristae disebut
Matrix
Tahap 1 : Glikolisis
1. Glikolisis berarti “memecah glukosa”
2. Terjadi di dalam sitosol sel
3. Oksidasi glukosa (6C) menjadi 2 molekul asam
piruvat (3C).
4. Dapat terjadi dengan atau tanpa kehadiran oksigen.
5. Suatu proses eksergonik, (energi dilepaskan)
umumnya pemanfaatan energi disimpan dalam
elektron berenergi tinggi dalam koenzim NADH
dan dalam ikatan phosphate molekul ATP
Ringkasan Glikolisis
• Terjadi di sitoplasma
• Bersifat Anaerobic (tdk menggunakan
oksigen)
• Membutuhkan investasi 2 molekul ATP
• Memecah glukosa menjadi 2 molekul asam
piruvat
• Juga menghasilkan 2 NADH dan 4 ATP
Ringkasan Glikolisis
Tahap Reaktan Produk Enzim Detail
1 Glukosa Glukosa-6-Phosphate hexokinase Cost 1 ATP
• Fungsi utama :
1. Oksidasi asetil KoA menjadi CO2, H2O dan energi
(1 mol asetil KoA menghasilkan 12 mol ATP
oleh karena daur ini banyak melepas H+ dan elek-
tron yg akan masuk rantai respirasi)
O
Acetyl CoA CH3-C-S-CoA
+ COO-
CH2
COO -
H2O
HO C COO- + CoA-SH
C=O Citrate
Synthase
Oxaloacetate CH2
CH2
COO-
COO-
Citrate Coenzyme A
Reaksi 2
Isomerisasi Isositrat : dehidrasi menjadi cis-akonitat
kemudian terjadi rehidrasi menjadi isositrat
COO- COO-
CH2 CH2
Isomerization
HO C COO- H C COO-
Aconitase
CH2 HO C H
COO- COO-
Citrate Isocitrate
Reaction 3
COO- COO-
CH2 Co A -S H CH2
CHCH
2 -COO
2
- N AD + N AD H CH2 -
CH2 -COO
O CHC O
CH C + CO
2 2 + CO 2 2
-ketoglutarate
α-Ketoglutrate
COO
O C-COO --
dehydrogenase O C S Co S-CoA
A
dehydrogenase
α-Ketoglutrate complex Succinyl CoA
Succinyl-CoA
-Ketoglutarate (a Thioester)
Reaction 5
Hidrolisis Suksinil KoA
- Energi yg berasal dari hidrolisis suksinil KoA digunakan untuk menambahkan
satu gugus phosphate (Pi) menjadi GDP (guanosine diphosphate).
- Reaksi ini memerlukan ADP atau GDP yang dengan Pi akan membentuk
ATP atau GTP
Dehidrogenasi Suksinat
COO- COO-
CH2 FAD FAD H2 H CH -
COO
CH2 -COO - C
CHCH -COO - C CH
2
2 succinate
Succinate -
OOC H
COO - dehydrogenase
dehydrogenase
COO-
Succinate Fumarate
Succinate Fumarate
Reaksi 7
Hidrasi
COO-
COO-
CH H 2O
HO C H
CH
CH2
COO-
COO-
Fumarate Malate
Reaksi 8
Dehidrogenasi membentuk
Oksaloasetat
COO- COO-
HO
HO C CH-HCOO - N AD + N AD H + HO+ C-COO
C=O
-
Malate Oxaloacetate
Produk reaksi [8] adalah bahan awal untuk reaksi [1].
Ringkasan
Citric Acid
Cycle
Ringkasan
Ringkasan
Ringkasan
Kecepatan siklus asam sitrat tergantung pada kebutuhan tubuh akan energi.
Ketika kebutuhan energi tinggi dan ATP kurang → siklus Krebs teraktivasi.
Fe-S clusters
Electron carriers
Coenzyme Q (CoQ)
Cytochrome (cyt)
FMN (Flavin Mononucleotide)
H
O O
N H N H
H3 C N H3 C N
Flavin Flavin
H3 C N N O H3 C N N O
CH2
2H+ + 2e- CH2 H
Riboflavin Riboflavin
(Vitamin B2) H C OH H C OH
H C OH Ribitol H C OH Ribitol
H C OH (sugar alcohol) H C OH
CH2 CH2
O O
- -
O=P-O-AMP O= P-O-AMP
- -
O O
Fe3+ + 1 e- Fe2+
Cys S S Cys Cys S S Cys
Reduced
Koenzim Q (CoQ)
OH
2H+ + 2e-
OH
Complex I
Oxidized
NADH + H+ + FMN → NAD+ + FMNH2
Complex II
Complex III
Complex IV
Aerobic
ATP synthase
ATP Synthase
• Protein yg terletak pada membran dalam mitokondria.