RESUME

NUTRIGENOMIKA DAN NUTRIGENETIK

Untuk memenuhi tugas matakuliah:

Biologi Molekuler
Yang diampu oleh:
dr. Dian Nugrahenny, M.Biomed.

Oleh:

Elma Natalia Anggraeni

(P17112215011)

KEMENTERIAN KESEHATAN REPUBLIK INDONESIA

POLITEKNIK KESEHATAN KEMENKES MALANG
JURUSAN GIZI
PRODI PROFESI DIETISIEN
2021
 RESUME NUTRIGENOMIKA DAN NUTRIGENETIK

A. Nutrigenomika
 Pengertian:
Gen berinteraksi dengan nutrisi.
 Tujuan:
- Mengidentifikasi gen yang mempengaruhi risiko penyakit terkait diet, dan
membantu memecahkan mekanisme yang mendasari kecenderungan
genetik ini.
- Membantu menentukan diet yang dipersonalisasi
- Membantu mengetahui gen yang terlibat dalam interaksi diet-gen serta
mendeteksi polimorfisme, yang mungkin memiliki konsekuensi nutrisi
yang signifikan dan pengaruh factor lingkungan pada ekspresi genetik
1. Penyakit Nutrigenomi: Dasar Genetik
 Nutrisi  rangsangan lingkungan yang paling berpengaruh.
 Genom terkena berbagai jenis rangsangan lingkungan selama
hidup, termasuk nutrisi  sangat bergantung dan diatur oleh
nutrisi dan fitokimia yang ada dalam makanan.
 Diet yang tidak seimbang  mengubah interaksi nutrisi-gen 
meningkatkan risiko penyakit kronis.
 Bahan kimia makanan  mengubah ekspresi genomik secara
langsung atau tidak langsung.
 Pada tingkat sel, nutrisi dapat bertindak dengan cara yang
berbeda seperti:
1) Bertindak langsung sebagai ligan untuk transkripsi reseptor
faktor;
2) Dimetabolisme oleh jalur metabolisme primer atau sekunder,
sehingga konsentrasi substrat yang terlibat dalam regulasi gen
atau pensinyalan sel dapat diubah;
3) Mengubah jalur transduksi sinyal.
4) Faktor transkripsi  agen utama di mana nutrisi
mempengaruhi ekspresi gen.
2. Polimorfisme Nukleotida Tunggal (SNP)
 Pada tingkat sekuens gen, 99,9% sekuens genomik identik
ditemukan pada semua manusia
 0,1% variasi dalam urutan genom bertanggung jawab untuk 
perbedaan fenotipik (tinggi, berat dll) dan kerentanan individu
terhadap kondisi penyakit dan status kesehatan.
 Sebagian besar, gen memiliki perbedaan dalam urutan kecil yang
 polimorfisme yang bervariasi di antara individu yang berbeda.
 Polimorfisme nukleotida tunggal (SNP)
Variasi genetik yang paling umum.
Membentuk sekitar 90% dari semua variasi genetik
manusia.
SNP dalam populasi manusia mengubah metabolisme
makanan
 Polimorfisme genetik
Mempengaruhi penyerapan dan metabolisme komponen
makanan.
Variasi epigenetik dapat menginduksi perubahan pola
metilasi DNA  mempengaruhi ekspresi genetik secara
keseluruhan.
 Contoh:
1) Hubungan antara folat dan gen untuk MTHFR – 5, 10-
methylenetetrahydrofolate reductase
- MTHFR memiliki peran dalam memasok 5-MTHF 
penting untuk remetilasi homosistein untuk produksi
metionin.
- Metionin sangat penting  banyak jalur metabolisme
termasuk produksi neurotransmiter dan regulasi
ekspresi genetik.
- Folat  fungsi efisien MTHFR. Ketika timin
menggantikan sitosin pada pasangan basa 677 pada
gen MTHFR, hal itu menyebabkan dua bentuk protein:
tipe liar (C), yang berfungsi normal, dan versi labil
termal (T), yang aktivitasnya berkurang secara
signifikan.
- Individu dengan dua salinan gen wildtype (CC) atau
satu salinan masing- masing (CT) akan memiliki
metabolisme folat yang normal.
 - Orang-orang dengan versi tidak stabil dari kedua
salinan (TT) dan asupan folat rendah, akan memiliki
kadar homosistein plasma yang lebih tinggi, yang
meningkatkan risiko penyakit kardiovaskular dan
gangguan kognitif dini. Jika dilengkapi dengan asam
folat atau peningkatan asupan folat, orang- orang ini
dapat mengembalikan kadar metionin normal mereka
melalui metabolisme homosistein.
- Efek menguntungkan dari suplementasi asam folat (1
mg/hari selama 3 bulan) terhadap kadar homosistein
plasma
2) Keterkaitan antara SNP dan komponen makanan spesifik
yang terkait juga mencakup
- Apolipoprotein E (apo E) di mana tiga isoform
ditemukan E2, E3 dan E4.
- Individu dengan apo E4 (sekitar 25% dari populasi)
memiliki risiko CVD yang lebih tinggi dan biasanya
kadar kolesterol LDL yang lebih tinggi, dan orang-
orang ini merespon lebih baik terhadap diet rendah
lemak.
- Beberapa variasi gen reseptor vitamin D (VDR) SNP
dapat mempengaruhi respons terhadap diet dan
mungkin meningkatkan risiko penyakit.
3) Kafein, faktor risiko keropos tulang pada wanita dengan
varian VDR  perlu mengurangi asupan kafein
4) SNP pada gen angiotensinogen  mempengaruhi respon
tekanan darah individu terhadap komponen serat pangan.
3. NUTRIGENOMI DAN PENYAKIT KRONIS
 Teknologi high-throughput- omics (genomic, transcriptomic, proteomc,
dan metabolomic)
 Tujuan perkembangan teknologi:
- Membantu identifikasi dan pengukuran banyak molekul dari
setiap jenis pada satu titik waktu
- Mengukur variasi DNA yang tak terhitung banyaknya, termasuk
puluhan ribu SNP serta banyak molekul RNA
 Obesitas
- Gangguan multifaktorial paling umum
- Dipengaruhi oleh beberapa factor  lingkungan dan genetik.
- Nutrigenomik,  mengarahkan pengembangan diet fungsional
baru untuk pengendalian obesitas.
- Merupakan elemen utama dari kelompok sindrom metabolik
yang  gangguan toleransi glukosa, resistensi insulin,
hipertensi dan diabetes mellitus yang tidak tergantung insulin.
- Obesitas dan kelainan metabolik  meningkatkan risiko
perkembangan berbagai penyakit kronis yang mencakup CVD
dan kanker.
- Regulasi asupan makanan dapat dipengaruhi oleh SNP dalam
gen yang mengkode reseptor rasa dan berbagai peptida
pensinyalan perifer seperti kolesistokinin, insulin, ghrelin, leptin,
dll.
- Pengatur pusat asupan energi termasuk protein terkait agouti,
neuropeptida Y hipotalamus, jalur melanokortin faktor dan
reseptornya
 CVD
- Penyakit kronis primer yang berhubungan dengan nutrisi. CVD
- Dapat dilabeli sebagai sekelompok kondisi multifaktorial dan
dikaitkan dengan obesitas, hipertensi, trombosis, dan
aterosklerosis.
- Hubungan yang kuat antara komposisi makanan dan risiko CVD
didokumentasikan dengan baik.
- Variasi genetik pada gen yang mengkode apolipoprotein dan
beberapa hormon dapat mengubah kerentanan individu untuk
CVD.
- Individu dengan alel E4 pada gen apolipoprotein E menunjukkan
kolesterol LDL yang lebih tinggi.
- Polimorfisme spesifik dalam gen yang mengkode enzim
pemroses lipid, protein transpor lipid, reseptor, dan protein yang
terkait dengan peradangan dikaitkan dengan perubahan luar
biasa dalam kadar lipid darah
- Hpertensi  elemen penting pathogenesis CVD
- Penurunan berat badan pada individu hipertensi obesitas
menyebabkan penurunan BP
 - Gen polimorfik bertanggung jawab dalam regulasi BP termasuk
yang mengkode angiotensinogen (AGT), aldosteron sintetase
(CYP11B2) dan enzim pengubah angiotensin (ACE).
- Gen yang berhubungan dengan transportasi natrium 
mengkodekan subunit saluran natrium epitel (ENaC), 11B-
hidroksisteroid dehidrogenase dan adduksi juga ditemukan
bertanggung jawab  nutrigenomik dapat menjawab pertanyaan
pengontrolan tekanan darah dengan rekomendasi diet,
- Peningkatan kadar homosistein dianggap sebagai faktor risiko
independen dalam perkembangan penyakit serebrovaskular dan
jantung coroner
 Sindrom koroner dan serebrovaskular akut.
- Disebabkan oleh thrombosis arteri
- Perubahan kadar beberapa faktor koagulasi menghasilkan
keadaan hiperkoagulasi. Asupan lemak yang berlebihan dapat
meningkatkan keadaan hiperkoagulasi postprandial. Gen yang
mengkode glikoprotein permukaan trombosit, dan faktor
koagulasi dapat mempengaruhi hemostasis. Koagulasi darah
dilawan oleh sistem antikoagulan dan fibrinolitik. Variasi
polimorfik juga dapat mempengaruhi antikoagulasi dan
fibrinolysis
4. NUTRIGENOMI DAN KANKER
 Kanker  proses kompleks yang terdiri dari beberapa tahap ekspresi
gen yang dioperasikan secara menyimpang, dan fungsi protein dan
metabolit
 Kebiasaan diet berkontribusi 35% dari semua kanker manusia dan
untuk beberapa kanker
 Asosiasi  sekitar 70% dengan tidak adanya paparan genotoksin,
biomarker kerusakan genom dan epigenom merupakan indikator
sensitif defisiensi nutrisi yang diperlukan sebagai kofaktor enzim
perbaikan DNA, pencegahan oksidasi DNA dan/ atau penggabungan
urasil ke dalam DNA dan untuk metilasi pemeliharaan urutan CpG
 Polimorfisme yang mempengaruhi metabolisme karsinogen
mungkin mengubah kemungkinan kontak antara karsinogen dan
sel target, sehingga bertindak pada tahap inisiasi kanker.
 Pengaruh polimorfisme  perubahan faktor pengkodean gen
yang terlibat dalam regulasi hormonal yang paling kuat terkait
pada tumor tergantung hormon seperti payudara, ovarium,
endometrium dan kanker prostat. SNP dalam gen reseptor
hormon seks yang mengkode reseptor estrogen, progesteron dan
androgen telah dikaitkan dengan modifikasi risiko kanker.
 Konsumsi daging merah yang berlebihan  peningkatan risiko
kanker kolorektal.
 Beberapa polimorfisme ada untuk enzim N-Acetyl transferase
(NAT) yang ada dalam dua bentuk: NAT1 dan NAT2. NAT 
ditemukan dalam daging merah yang dimasak dengan baik,
terlibat dalam asetilasi amina aromatik heterosiklik  selama
pemasakan daging pada suhu tinggi, amina aromatik heterosiklik
(HAA) dihasilkan melalui reaksi beberapa asam amino dengan
kreatinin. Asetilasi HAA dapat membentuk metabolit reaktif yang
dapat mengikat DNA dan menghasilkan kanker. Hanya asetilator
cepat NAT2 yang dapat melakukan aktivitas ini. Oleh karena itu,
genotipe asetilator cepat NAT rentan terhadap risiko lebih tinggi
terkena kanker usus besar.
 Kelebihan berat badan dikombinasikan dengan gaya hidup
menetap  penyebab seperlima sampai sepertiga kanker
 Komponen makanan tertentu seperti garam dan pengawet telah
disarankan sebagai kemungkinan karsinogen untuk kanker
lambung.
 Pencegahan kanker  semua jalur sinyal utama yang
dideregulasi pada kanker yang berbeda, dipengaruhi oleh asupan
makanan tertentu
 Asam lemak tak jenuh ganda rantai panjang (LC-PUFA)
menunjukkan efek menguntungkan dalam pencegahan kanker 
mempengaruhi proses fisiologis tubuh termasuk pertumbuhan,
pertambahan massa lemak dan lemak, reproduksi,
perkembangan neurologis, kekebalan bawaan dan didapat dan
mempengaruhi kejadian dan tingkat keparahan semua penyakit
kronis dan degeneratif seperti kanker, stroke, arthritis,
aterosklerosis, diabetes, neurodegenerative, inflamasi,
osteoporosis  Asam lemak omega-3 menghambat pertumbuhan
 tumor kolon baik dalam sistem invitro maupun invivo. Buah dan
sayuran yang mengandung berbagai komponen bioaktif dapat
mencegah karsinogenesis melalui peningkatan proses
detoksifikasi.
B. NUTRIGENETIK
 Pengertian
variasi genetik pada interaksi antara diet dan penyakit atau pada
rekomendasi nutrisi diet yang tidak efektif
1. Interaksi Penyakit – Diet
- Berguna baik dalam pencegahan dan pengobatan penyakit kronis
dengan
- Menyesuaikan intervensi diet dengan susunan genetik unik subjek
2. Penyakit Nutrigenetik: Dasar Genetik
- Hampir 1000 gen telah dikaitkan dengan penyakit manusia, 97% kali
ini menyebabkan penyakit monogenik, satu gen disfungsional dalam
skala genomik
- Contoh:
a. Intoleransi Laktosa
 Terjadi perubahan genetik pada gen laktase  produksi
laktase tidak memadai
 Tidak dapat memecah laktosa (gula susu primer) yang
diperoleh dari produk susu.
 Harus membatasi makanan yang mengandung laktosa
atau menggunakan produk susu bebas laktosa 
membantu mencegah gangguan gastrointestinal.
b. Galaktosemia
 Fenilketonuria  kelainan genetik metabolik
 Ditandai mutasi pada gen untuk enzim hati fenilalanin
hidroksilase (PAH)  membuatnya tidak berfungsi. Enzim
ini
 Perlu memetabolisme asam amino fenilalanin menjadi
asam amino tirosin.
 Pada fenilketonuria (PKU), makanan yang mengandung
asam amino fenilalanin seperti telur, ikan, ayam, susu, keju
dll harus dihindari.
  Pasien galaktosemia  harus menghindari diet yang
mengandung laktosa atau galaktosa, termasuk semua
produk susu.
C. PERTIMBANGAN ETIKA
 Genetika  pencegahan timbulnya dan perkembangan penyakit kronis yang
berguna untuk individu yang berisiko dan individu yang sehat.
 Informasi Nutrigenetik  harus relevan untuk promosi kesehatan,
pencegahan penyakit kronis dan pengobatan.
 Aliran ilmu genetika nutrisi yang berkembang pesat  menjanjikan untuk
mendeteksi kerentanan terhadap penyakit dan untuk promosi dan
pencegahan kesehatan yang menghubungkan gen dengan nutrisi; itu masih
merupakan ilmu baru yang tidak memiliki bukti yang diperlukan untuk
memvalidasi hasil klaim manfaat kesehatan dan pencegahan penyakit.